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第六章基因的表達(dá)與調(diào)控(上)
——原核基因表達(dá)調(diào)控模式Contents5.1原核基因表達(dá)調(diào)控總論5.2乳糖操縱子與負(fù)控誘導(dǎo)系統(tǒng)5.3色氨酸操縱子與負(fù)控阻遏系統(tǒng)5.4轉(zhuǎn)錄后調(diào)控原核生物和單細(xì)胞真核生物:環(huán)境影響蛋白質(zhì)合成高等真核生物出現(xiàn)細(xì)胞分化:不同細(xì)胞所合成蛋白質(zhì)在質(zhì)和量上均有差異因此,不論真核還是原核細(xì)胞都有一套準(zhǔn)確地調(diào)節(jié)基因表達(dá)和蛋白質(zhì)合成的機制如果每個基因等同翻譯,每一個多肽應(yīng)有相同的拷貝數(shù)。
結(jié)論是否定的,基因的表達(dá)是被控制的。組成型合成蛋白質(zhì)適應(yīng)型或調(diào)節(jié)型合成蛋白質(zhì)如DNA合成酶,RNA聚合酶等如β-半乳糖苷酶及參與糖代謝的酶,氨基酸、核苷酸合成系統(tǒng)的酶類等一個系統(tǒng)處于“off”狀態(tài)時可能是本底水平的基因表達(dá),常常是每世代每個細(xì)胞合成1~2個mRNA分子和極少量的蛋白質(zhì)分子。必須明白所謂“關(guān)”實際的意思是基因表達(dá)量特別低,或者無法檢測。細(xì)菌中的基本調(diào)控機制有如下規(guī)律:一個體系在需要時被打開,不需要時被關(guān)閉。這種“開-關(guān)”(on-off)活性是通過調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄來建立的。即通過調(diào)節(jié)mRNA的合成來實現(xiàn)的5.1原核基因表達(dá)調(diào)控總論生物信息DNARNAProtein執(zhí)行生命活動調(diào)節(jié)基因表達(dá)調(diào)控基因表達(dá)調(diào)控在兩個水平上體現(xiàn)
(1)轉(zhuǎn)錄水平上的調(diào)控(transcriptionalregulation);(2)轉(zhuǎn)錄后水平上的調(diào)控(post-transcriptionalregulation)①mRNA加工成熟水平上的調(diào)控(differentialprocessingofRNAtranscript)②翻譯水平上的調(diào)控(differentialtranslationofmRNA)指揮基因調(diào)控的信號不同
Prok中,營養(yǎng)狀況和環(huán)境因素——主要
Euk中,激素水平和發(fā)育階段——主要在轉(zhuǎn)錄水平上對基因表達(dá)調(diào)控取決于DNA的結(jié)構(gòu)、RNA聚合酶的功能、蛋白因子及其他小分子配基的相互作用。5.1.1原核基因調(diào)控機制的類型與特點原核生物的基因調(diào)控主要發(fā)生在轉(zhuǎn)錄水平上,根據(jù)調(diào)控機制的不同可分為:負(fù)轉(zhuǎn)錄調(diào)控(negativetranscriptionregulation)正轉(zhuǎn)錄調(diào)控(Positivetranscriptionregulation)負(fù)轉(zhuǎn)錄調(diào)控系統(tǒng)在負(fù)轉(zhuǎn)錄調(diào)控系統(tǒng)中,調(diào)節(jié)基因的物質(zhì)是阻遏蛋白(repressor)--阻止結(jié)構(gòu)基因轉(zhuǎn)錄。其作用部位是操縱區(qū)。它與操縱區(qū)結(jié)合,轉(zhuǎn)錄受阻。調(diào)節(jié)基因操縱基因結(jié)構(gòu)基因阻遏蛋白激活蛋白正轉(zhuǎn)錄調(diào)控負(fù)轉(zhuǎn)錄調(diào)控負(fù)轉(zhuǎn)錄調(diào)控在沒有調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)存在時基因是表達(dá)的,加入這種調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)后基因表達(dá)活性便被關(guān)閉,這樣的調(diào)控負(fù)轉(zhuǎn)錄調(diào)控。負(fù)控誘導(dǎo)系統(tǒng)--阻遏蛋白不與誘導(dǎo)物結(jié)合時,阻遏蛋白與操縱區(qū)相結(jié)合,結(jié)構(gòu)基因不轉(zhuǎn)錄,阻遏蛋白結(jié)合上誘導(dǎo)物時,阻遏蛋白與操縱區(qū)分離,結(jié)構(gòu)基因轉(zhuǎn)錄。
負(fù)控阻遏系統(tǒng)--阻遏蛋白與效應(yīng)物結(jié)合時,結(jié)構(gòu)基因不轉(zhuǎn)錄。正轉(zhuǎn)錄調(diào)控系統(tǒng)在正轉(zhuǎn)錄調(diào)控系統(tǒng)中,調(diào)節(jié)基因的產(chǎn)物是激活蛋白(activator),激活蛋白結(jié)合與DNA的啟動子及RNA聚合酶后,轉(zhuǎn)錄才會進行。調(diào)節(jié)基因操縱基因結(jié)構(gòu)基因阻遏蛋白激活蛋白正轉(zhuǎn)錄調(diào)控負(fù)轉(zhuǎn)錄調(diào)控正轉(zhuǎn)錄調(diào)控如果在沒有調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)存在時基因是關(guān)閉的,加入這種調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)后基因活性就被開啟,這樣的調(diào)控正轉(zhuǎn)錄調(diào)控。在正控誘導(dǎo)系統(tǒng)中,誘導(dǎo)物的存在使激活蛋白處于活性狀態(tài),轉(zhuǎn)錄進行。在正控阻遏系統(tǒng)中,效應(yīng)物分子的存在使激活蛋白處于非活性狀態(tài),轉(zhuǎn)錄不進行??烧T導(dǎo)調(diào)節(jié):指一些基因在特殊的代謝物或化合物的作用下,由原來關(guān)閉的狀態(tài)轉(zhuǎn)變?yōu)楣ぷ鳡顟B(tài),即在某些物質(zhì)的誘導(dǎo)下使基因活化。例:大腸桿菌的乳糖操縱子分解代謝蛋白的基因2、根據(jù)操縱子對某些能調(diào)節(jié)它們的小分子的應(yīng)答,可分為可誘導(dǎo)調(diào)節(jié)和可阻遏調(diào)節(jié)兩大類:調(diào)節(jié)基因操縱基因結(jié)構(gòu)基因阻遏蛋白調(diào)節(jié)基因操縱基因結(jié)構(gòu)基因阻遏蛋白誘導(dǎo)物mRNA酶蛋白酶合成的誘導(dǎo)操縱子模型誘導(dǎo)物如果某種物質(zhì)能夠促使細(xì)菌產(chǎn)生酶來分解它,這種物質(zhì)就是誘導(dǎo)物。可阻遏調(diào)節(jié):基因平時是開啟的,處在產(chǎn)生蛋白質(zhì)或酶的工作過程中,由于一些特殊代謝物或化合物的積累而將其關(guān)閉,阻遏了基因的表達(dá)。例:色氨酸操縱子合成代謝蛋白的基因酶合成的阻遏操縱子模型調(diào)節(jié)基因操縱基因結(jié)構(gòu)基因mRNA酶蛋白調(diào)節(jié)基因操縱基因結(jié)構(gòu)基因輔阻遏物輻阻遏物如果某種物質(zhì)能夠阻止細(xì)菌產(chǎn)生合成這種物質(zhì)的酶,這種物質(zhì)就是輔阻遏物。一般規(guī)律
可誘導(dǎo)的操縱子是一些編碼分解代謝糖和氨基酸的蛋白的基因。這些操縱子常常是關(guān)閉的。一旦生存條件發(fā)生變化,如葡萄糖缺乏而必須利用乳糖作為能源時,就要打開這些基因。可阻遏基因是一些合成各種細(xì)胞代謝過程中所必須的小分子物質(zhì)(如氨基酸、嘌呤和嘧啶等的基因),這些基因總是打開著的。只有當(dāng)細(xì)菌生活環(huán)境中有充分供應(yīng)時,才關(guān)閉這些基因,停止其合成。弱化子對基因活性的影響在這種調(diào)節(jié)方式中,起信號作用的是有特殊負(fù)載的氨酰-tRNA的濃度。當(dāng)操縱子被阻遏,RNA合成被終止時,起終止轉(zhuǎn)錄信號作用的那一段DNA序列被稱為弱化子。當(dāng)基因轉(zhuǎn)錄使轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物(RNA)到不同長度時,核糖體會在對應(yīng)的DNA位置上;此時RNA可以形成某種形式的二級結(jié)構(gòu);由此決定延伸復(fù)合物的結(jié)合能力,從而決定基因能否繼續(xù)轉(zhuǎn)錄。細(xì)菌的應(yīng)急反應(yīng)細(xì)菌有時會碰到緊急狀況,比如氨基酸饑餓--氨基酸的全面匱乏。為了緊縮開支,渡過難關(guān),細(xì)菌會產(chǎn)生一個應(yīng)急反應(yīng)--停止包括生產(chǎn)各種RNA、糖、脂肪和蛋白質(zhì)的幾乎全部生物化學(xué)反應(yīng)過程。實施這一應(yīng)急反應(yīng)的信號是鳥苷四磷酸(ppGpp)和鳥苷五磷酸(pppGpp)。產(chǎn)生這兩種物質(zhì)的誘導(dǎo)物是空載tRNA。當(dāng)氨基酸饑餓時,細(xì)胞中便存在大量的不帶氨基酸的tRNA,這種空載的tRNA會激活焦磷酸轉(zhuǎn)移酶,使ppGpp大量合成。ppGpp的出現(xiàn)會關(guān)閉許多基因,以應(yīng)付這種緊急狀況。ppGpp影響RNA聚合酶與這些基因轉(zhuǎn)錄起始位點的結(jié)合,使基因被關(guān)閉。ppGpp與pppGpp的作用范圍十分廣泛,它們影響一大批操縱子而被稱為超級調(diào)控因子。5.2乳糖操縱子--負(fù)控誘導(dǎo)系統(tǒng)1、操縱子模型的提出
1961年,Monod和Jacob提出獲1965年諾貝爾生理學(xué)和醫(yī)學(xué)獎JacobandMonod2、操縱子的定義操縱子:是基因表達(dá)的協(xié)調(diào)單位,由啟動子、操縱基因及其所控制的一組功能上相關(guān)的結(jié)構(gòu)基因所組成。操縱基因受調(diào)節(jié)基因產(chǎn)物的控制。操縱序列O啟動序列P——上游含CAP(分解代謝物基因激活蛋白)調(diào)控區(qū)調(diào)節(jié)基因I——編碼一種阻遏蛋白結(jié)構(gòu)基因Z——-半乳糖苷酶Y——透酶A——乙?;D(zhuǎn)移酶乙酰基轉(zhuǎn)移酶半乳糖苷透性酶?-半乳糖苷酶操作位點3乳糖操縱子結(jié)構(gòu)調(diào)節(jié)基因一、乳糖操縱子的結(jié)構(gòu)Z編碼β-半乳糖苷酶:將乳糖水解成葡萄糖和半乳糖Y編碼β-半乳糖苷透過酶:使外界的β-半乳糖苷(如乳糖)能透過大腸桿菌細(xì)胞壁和原生質(zhì)膜進入細(xì)胞內(nèi)。A編碼β-半乳糖苷乙?;D(zhuǎn)移酶:乙酰輔酶A上的乙酰基轉(zhuǎn)到β-半乳糖苷上,形成乙酰半乳糖。操縱子是一種完整的具有特定功能的細(xì)菌基因表達(dá)和調(diào)節(jié)的單位,包括調(diào)節(jié)基因,操縱位點,結(jié)構(gòu)基因,組成一個控制單元結(jié)構(gòu)基因:產(chǎn)生mRNA,合成蛋白質(zhì)操縱位點promotor,operator:啟動子結(jié)合位點調(diào)節(jié)基因:產(chǎn)生調(diào)節(jié)蛋白(與操縱位點結(jié)合)→結(jié)構(gòu)基因不轉(zhuǎn)錄誘導(dǎo)物存在時,可與阻遏蛋白結(jié)合→結(jié)構(gòu)基因轉(zhuǎn)錄ControlelementStructuralgenes5.2.2酶的誘導(dǎo)現(xiàn)象B-半乳糖苷酶二、酶的誘導(dǎo)——lac體系受調(diào)控的證據(jù)分解底物的酶只有在底物存在時才出現(xiàn)!無乳糖時,幾個β-gal/cell加入乳糖時,5000個再去掉乳糖,lacmRNA下降
乳糖能激發(fā)lacmRNA的合成
乳糖的誘導(dǎo)作用是由酶前體轉(zhuǎn)化而來,還是誘導(dǎo)新酶合成?培養(yǎng)基(35S-aa,無乳糖)→E.coli繁殖→培養(yǎng)基(無35S-aa,加入乳糖)→β-gal(無35S)安慰誘導(dǎo)物:
如果某種物質(zhì)能夠促使細(xì)菌產(chǎn)生酶而本身又不被分解,這種物質(zhì)被稱為安慰誘導(dǎo)物,如IPTG(異丙基-β–D-硫代半乳糖苷)。gratuitousinducer
安慰誘導(dǎo)物
義務(wù)誘導(dǎo)物可誘導(dǎo)半乳糖苷酶產(chǎn)生,但不是其底物IPTG,異丙基巰基半乳糖苷TMG,巰甲基半乳糖苷ONPG,O-硝基半乳糖苷在研究誘導(dǎo)作用時,很少使用乳糖5.2.3調(diào)控機理1調(diào)控區(qū)結(jié)構(gòu)lacI,1045bp,獨立PiP,82bp,-82~+1O,35bp,-7~+28lacZYA體外結(jié)合競爭實驗:
阻遏物+RNApol,off
RNApol+阻遏物,on2.阻遏狀態(tài)3誘導(dǎo)狀態(tài)誘導(dǎo)物誘導(dǎo)作用:在可誘導(dǎo)的操縱元中,加入對基因表達(dá)有調(diào)節(jié)作用的小分子后,開啟基因的轉(zhuǎn)錄活性4誘導(dǎo)物不是乳糖生成lac誘導(dǎo)物乳糖代謝Allolctose異構(gòu)乳糖別乳糖細(xì)胞內(nèi)β-半乳糖苷酶來源?5.2.4阻遏蛋白的作用機制1阻遏蛋白結(jié)構(gòu)38KD,4聚體,一個亞基結(jié)合一個IPTG分子lacI
組成型轉(zhuǎn)錄Pi弱啟動子,5-10個/cell具有二重性阻止轉(zhuǎn)錄(與lacO結(jié)合)開始轉(zhuǎn)錄(與誘導(dǎo)物結(jié)合)阻遏蛋白單體的結(jié)構(gòu)阻遏蛋白的結(jié)構(gòu)域頭段,-NH2端,lacO結(jié)合區(qū)絞鏈區(qū)
核心段,-COOH,誘導(dǎo)物結(jié)合區(qū)4個亞基的核心片段接觸形成四聚體對稱軸,+11對稱序列,6bp阻遏蛋白的結(jié)合位點--lacO的結(jié)構(gòu)誘導(dǎo)物
和阻遏
蛋白結(jié)合的模型阻遏能發(fā)生在多個位點上3阻遏蛋白對RNApol功能的影響阻遏蛋白和RNApol可同時與DNA結(jié)合RNApol與啟動子結(jié)合的平衡常數(shù)1.9×107有阻遏蛋白時,2.5×109結(jié)合著的RNApol不能轉(zhuǎn)錄.但加入誘導(dǎo)物后,釋放出阻遏蛋白,變?yōu)殚_放型啟動子復(fù)合物.阻遏蛋白實際上使RNApol貯存在啟動子上。這一模式是否存在于其它操縱元系統(tǒng)中?5.2.5乳糖操縱子調(diào)控模型主要內(nèi)容:①Z、Y、A基因的產(chǎn)物由同一條多順反子的mRNA分子所編碼
②這個mRNA分子的啟動子緊接著O區(qū),而位于I與O之間的啟動子區(qū)(P),不能單獨起動合成β-半乳糖苷酶和透過酶的生理過程。③操縱基因是DNA上的一小段序列(僅為26bp),是阻遏物的結(jié)合位點。RNA聚合酶結(jié)合部位阻遏物結(jié)合部位操縱位點的回文序列
④當(dāng)阻遏物與操縱基因結(jié)合時,lacmRNA的轉(zhuǎn)錄起始受到抑制。
阻遏蛋白的負(fù)性調(diào)節(jié)
沒有乳糖存在時⑤誘導(dǎo)物通過與阻遏物結(jié)合,改變它的三維構(gòu)象,使之不能與操縱基因結(jié)合,從而激發(fā)lacmRNA的合成。當(dāng)有誘導(dǎo)物存在時,操縱基因區(qū)沒有被阻遏物占據(jù),所以啟動子能夠順利起始mRNA的合成。
有乳糖存在時2.2操縱子突變-操縱子的發(fā)現(xiàn)(1)Oc操縱基因的組成型突變(順式顯性)
順式顯性突變(cis-dominance):操縱基因只控制臨近基因,對其他等位基因無作用,或者顯性效應(yīng)只對處于同一染色體上它所調(diào)控的結(jié)構(gòu)基因才起作用的現(xiàn)象。
(2)lacIS
阻遏蛋白不可誘導(dǎo)性突變,阻遏蛋白失去誘導(dǎo)物結(jié)合位點;(3)lacI-
阻遏蛋白不能形成寡聚物(4)lacI-d
阻遏蛋白不能和DNA結(jié)合,且呈負(fù)互補(反式顯性)
等位基因間的互補(interalleliccomplementation)。
負(fù)的互補(negativecomplementation):lacI-d的產(chǎn)物和lacI+的產(chǎn)物組成多聚體時,阻遏蛋白無活性。也稱為反式顯性(trans-dominant)。阻遏蛋白不能與突變的操縱基因結(jié)合,結(jié)構(gòu)基因組成型表達(dá)(1)操縱基因突變(O+
Oc),結(jié)構(gòu)基因組成型表達(dá)組成型突變:lacOc
(2)操縱子不可誘導(dǎo)型突變阻遏蛋白失去結(jié)合誘導(dǎo)物位點的突變lacIs,結(jié)構(gòu)基因組成型表達(dá)(3)阻抑蛋白基因的I-突變阻遏蛋白失活或者缺乏,不能和操縱基因結(jié)合,結(jié)構(gòu)基因組成型表達(dá)組成型突變:
lacI-二倍體中,lacI+比lacI-占優(yōu)勢,表現(xiàn)為基因關(guān)閉,lacI-為隱性突變當(dāng)野生型lacI+和突變型I-在同一細(xì)胞中不可誘導(dǎo)突變(超阻遏):四、影響因子1、lac操縱子的本底水平表達(dá)有兩個矛盾是操縱子理論所不能解釋的:①誘導(dǎo)物需要穿過細(xì)胞膜才能與阻遏物結(jié)合,而轉(zhuǎn)運誘導(dǎo)物需要透過酶,后者的合成有需要誘導(dǎo)。解釋:一些誘導(dǎo)物可以在透過酶不存在時進入細(xì)胞?一些透過酶可以在沒有誘導(dǎo)物的情況下合成?√②真正的誘導(dǎo)物是異構(gòu)乳糖而非乳糖,前者是在β-半乳糖甘酶的催化下由乳糖形成的,因此,需要有β-半乳糖甘酶的預(yù)先存在。解釋:本底水平的組成型合成:非誘導(dǎo)狀態(tài)下有少量的lacmRNA合成。2、大腸桿菌對乳糖的反應(yīng)培養(yǎng)基:甘油按照lac操縱子本底水平的表達(dá),每個細(xì)胞內(nèi)有幾個分子的β-半乳糖苷酶和β-半乳糖苷透過酶;培養(yǎng)基:加入乳糖少量乳糖透過酶進入細(xì)胞β-半乳糖苷酶異構(gòu)乳糖誘導(dǎo)物誘導(dǎo)lacmRNA的生物合成大量乳糖進入細(xì)胞多數(shù)被降解為葡萄糖和半乳糖(碳源和能源)異構(gòu)乳糖乳糖3、阻遏物lacI基因產(chǎn)物及功能Lac操縱子阻遏物mRNA是由弱啟動子控制下組成型合成的,每個細(xì)胞中有5-10個阻遏物分子。當(dāng)I基因由弱啟動子突變成強啟動子,細(xì)胞內(nèi)就不可能產(chǎn)生足夠的誘導(dǎo)物來克服阻遏狀態(tài),整個lac操縱子在這些突變體中就不可誘導(dǎo)。4、葡萄糖對lac操縱子的影響如果將葡萄糖和乳糖同時加入培養(yǎng)基中,lac操縱子處于阻遏狀態(tài),不能被誘導(dǎo);一旦耗盡外源葡萄糖,乳糖就會誘導(dǎo)lac操縱子表達(dá)分解乳糖所需的三種酶。代謝物阻遏效應(yīng)mRNA無乳糖時有乳糖時無葡萄糖cAMP濃度高有葡萄糖cAMP濃度低RNA-polOOOOlac操縱子基因表達(dá)既需要乳糖又需缺乏葡萄糖5、cAMP與代謝物激活蛋白代謝物激活蛋白(CAP)/環(huán)腺甘酸受體蛋白(CRP)
葡萄糖對lac操縱元表達(dá)的抑制是間接的
葡萄糖的降解是通過cAMP與CAP結(jié)合起作用的cAMP:環(huán)化腺苷酸CAP,cataboliteactivatorprotein由crp編碼CRP,catabolitereceptorproteinZYAOPDNA調(diào)控區(qū)CAP結(jié)合位點啟動序列操縱序列結(jié)構(gòu)基因Z:β-半乳糖苷酶Y:透酶A:乙?;D(zhuǎn)移酶cAMP—CAP復(fù)合物CAP的結(jié)合對DNA構(gòu)型的影響DNA彎曲彎曲點位于CAP結(jié)合位點二重對稱的中心彎曲使CAP能與啟動子上的RNApol接觸ATP腺甘酸環(huán)化酶cAMP(環(huán)腺甘酸)
大腸桿菌中:無葡萄糖,cAMP濃度高;
有葡萄糖,cAMP濃度低++++轉(zhuǎn)錄無葡萄糖,cAMP濃度高時促進轉(zhuǎn)錄有葡萄糖,cAMP濃度低時不促進轉(zhuǎn)錄ZYAOPDNACAPCAPCAPCAPCAPCAPCAP的正調(diào)控
CAP的正性調(diào)節(jié)
當(dāng)阻遏蛋白封閉轉(zhuǎn)錄時,CAP對該系統(tǒng)不能發(fā)揮作用如無CAP存在,即使沒有阻遏蛋白與操縱序列結(jié)合,操縱子仍無轉(zhuǎn)錄活性。cAMP—CAP復(fù)合物與啟動子區(qū)的結(jié)合是轉(zhuǎn)錄起始所必需的。協(xié)調(diào)調(diào)節(jié)葡萄糖對lac操縱子的阻遏作用稱分解代謝阻遏(catabolicrepression)。
單純?nèi)樘谴嬖跁r,細(xì)菌利用乳糖作碳源;若有葡萄糖或葡萄糖/乳糖共同存在時,細(xì)菌首先利用葡萄糖。
協(xié)調(diào)調(diào)節(jié)TheLacOperon:
WhenGlucoseIsPresentButNotLactoseRepressorPromoterLacYLacALacZOperatorCAPBindingRNAPol.RepressorRepressorRepressormRNAHeyman,I’mconstitutiveComeon,letmethroughNowayJose!CAPTheLacOperon:
WhenLactoseIsPresentButNotGlucoseRepressorPromoterLacYLacALacZOperatorCAPBindingRepressorRepressormRNAHeyman,I’mconstitutiveCAPcAMPLacRepressorRepressorXThislactosehasbentmeoutofshapeCAPcAMPCAPcAMPBindtomePolymeraseRNAPol.RNAPol.Yipee…!TheLacOperon:
WhenNeitherLactoseNorGlucoseIsPresentRepressorPromoterLacYLacALacZOperatorCAPBindingCAPcAMPCAPcAMPCAPcAMPBindtomePolymeraseRNAPol.RepressorRepressormRNAHeyman,I’mconstitutiveRepressorSTOPRighttherePolymeraseAlright,I’mofftotheraces...Comeon,letmethrough!五、Lac操縱子中的其他問題1、A基因及其生理功能半乳糖甘分子(IPTG)β-半乳糖甘酶分解產(chǎn)物(體內(nèi)積累)β-半乳糖甘乙?;D(zhuǎn)移酶半乳糖甘分子(IPTG)乙?;?、lac基因產(chǎn)物數(shù)量上的比較β-半乳糖苷酶:透過酶:乙?;D(zhuǎn)移酶=1:0.5:0.2翻譯水平上受到調(diào)節(jié):(1)lacmRNA可能與翻譯過程中的核糖體相脫離,從而終止蛋白質(zhì)鏈的翻譯;(2)在lacmRNA分子內(nèi)部,A基因比Z基因更容易受內(nèi)切酶作用發(fā)生降解。3、操縱子的融合與基因工程POZYAtsxPOpur結(jié)構(gòu)基因缺失lacoperonpuroperonSummarySummaryoflacoperonregulationGlucose(葡萄糖)cAMPLactose(乳糖)TranscriptionoflacmRNAHighLowPresentlowrateofexpressionHighLowAbsentessentiallynoneLowHighAbsent(停止)essentiallynoneLowHighPresenthighrateofexpression
(一)乳糖操縱子的結(jié)構(gòu)R
(二)阻遏蛋白的負(fù)性調(diào)節(jié)
沒有乳糖存在時
有乳糖存在時
(三)CAP的正性調(diào)節(jié)
(四)協(xié)調(diào)調(diào)節(jié)lac操縱子小結(jié)通常情況(葡萄糖供應(yīng)正常)阻遏蛋白與操縱序列結(jié)合,基因不轉(zhuǎn)錄。細(xì)胞外的乳糖通過透性酶吸收到細(xì)胞內(nèi);細(xì)胞內(nèi)的β-半乳糖苷酶將乳糖轉(zhuǎn)變?yōu)楫惾樘?。異乳糖結(jié)合到乳糖阻抑物上使之從操縱序列上脫離,聚合酶迅速開始lacZYA基因的轉(zhuǎn)錄。這就是負(fù)控誘導(dǎo)。然而,還需要細(xì)菌生長系統(tǒng)中缺少葡萄糖,使cAMP含量增加,才有足夠量的cAMP與CRP結(jié)合形成CRP-cAMP復(fù)合物結(jié)合于Plac上游。使DNA雙螺旋發(fā)生彎曲,轉(zhuǎn)錄才可以有效地進行。5.3色氨酸操縱子(trpoperon)內(nèi)容提要:色氨酸操縱子的結(jié)構(gòu)色氨酸操縱子的阻遏系統(tǒng)色氨酸操縱子的弱化機制Trpoperon生物細(xì)胞中的氨基酸合成,也受操縱元的調(diào)節(jié)。細(xì)胞需要某種氨基酸時,其基因即表達(dá),不需要時基因關(guān)閉,達(dá)到經(jīng)濟的原則。一、色氨酸操縱子的結(jié)構(gòu)
調(diào)控基因結(jié)構(gòu)基因
催化分枝酸轉(zhuǎn)變?yōu)樯彼?/p>
的酶
trpRtrptrpR,阻遏蛋白P:
-40~+18O:-21~+1L:
+1~+162結(jié)構(gòu)基因t:
A下游36bp,不依賴pt′:t下游250bp,依賴p基因組成特點:(1)trpR和trpABCDE不連鎖;(2)操縱基因在啟動子內(nèi)(3)有衰減子(attenuator)/弱化子(4)啟動子和結(jié)構(gòu)基因不直接相連,二者被前導(dǎo)序列(Leader)所隔開二、trp操縱子的阻遏系統(tǒng)低Trp時:阻遏物不結(jié)合操縱基因;高Trp時:阻遏物+Trp結(jié)合操縱基因1TrpR四聚體阻遏蛋白+trp
→
有活性的阻遏物SNE299+trpO→不轉(zhuǎn)錄2阻遏蛋白的結(jié)合位點trpO-21~+1,反向重復(fù)序列trpP-40~+18活性阻遏物與trpO的結(jié)合與RNApol與啟動子的結(jié)合發(fā)生競爭SNE2993阻遏系統(tǒng)主管轉(zhuǎn)錄是否啟動,在缺乏Trp時,mRNA起始合成,但不能自動延伸,一般在trpE之前終止轉(zhuǎn)錄粗調(diào)開關(guān)Trp有Trp無TrpmRNAOPtrpR調(diào)節(jié)區(qū)結(jié)構(gòu)基因
RNA聚合酶
RNA聚合酶高低?色氨酸操縱子三、trp操縱子的弱化機制衰減子(attenuator)/弱化子前導(dǎo)序列(leadersequence)1、弱化子:DNA中可導(dǎo)致轉(zhuǎn)錄過早終止的一段核甘酸序列(123-150區(qū))。123~150
研究引起終止的mRNA堿基序列,發(fā)現(xiàn)該區(qū)mRNA通過自我配對可以形成莖-環(huán)結(jié)構(gòu),有典型的終止子特點。2、前導(dǎo)序列:在trpmRNA5'端trpE基因的起始密碼前一個長162bp的mRNA片段。
S312POE4321LDNARNAATGTGA2trpcodons1432前導(dǎo)肽14aa3、弱化機制
前導(dǎo)肽轉(zhuǎn)錄終止結(jié)構(gòu)
轉(zhuǎn)錄衰減(attenuation):
是指轉(zhuǎn)錄可正常起動,但在轉(zhuǎn)錄進入
第一個結(jié)構(gòu)基因前即突然停止的過程。 由于這一終止作用并不能使正在進行的 結(jié)構(gòu)基因轉(zhuǎn)錄中途停止,而僅是部分中 途停止轉(zhuǎn)錄,所以稱為轉(zhuǎn)錄衰減。
衰減子(attenuator):
操縱子前導(dǎo)區(qū)內(nèi)類似于終止子結(jié)構(gòu)的一段DNA序列,稱為衰減子。其作用是減弱操縱子的轉(zhuǎn)錄。
.轉(zhuǎn)錄衰減UUUU……34UUUU3’34核糖體前導(dǎo)肽前導(dǎo)mRNA1.當(dāng)色氨酸濃度高時轉(zhuǎn)錄衰減機制125’trp密碼子衰減子結(jié)構(gòu)就是終止子可使轉(zhuǎn)錄前導(dǎo)DNAUUUU3’
RNA聚合酶終止UUUU……342423UUUU……核糖體
前導(dǎo)肽
前導(dǎo)mRNA
15’trp密碼子
結(jié)構(gòu)基因前導(dǎo)DNA
RNA聚合酶2.當(dāng)色氨酸濃度低時Trp合成酶系相關(guān)結(jié)構(gòu)基因被轉(zhuǎn)錄
序列3、4不能形成衰減子結(jié)構(gòu)LowTrpHighTrp轉(zhuǎn)錄、翻譯偶聯(lián),產(chǎn)生前導(dǎo)肽Trp-tRNATrp存在核糖體通過片段1(2個Trp密碼子)封閉片段2片段3,4形成發(fā)夾結(jié)構(gòu)類似于不依賴ρ因子的轉(zhuǎn)錄終止序列RNA聚合酶停止轉(zhuǎn)錄,產(chǎn)生衰減子轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物高Trp時:RNA聚合酶繼續(xù)轉(zhuǎn)錄Trp-tRNATrp沒有供應(yīng)核糖體翻譯停止在片段1(2個Trp密碼子)片段2,3形成發(fā)夾結(jié)構(gòu)轉(zhuǎn)錄不終止低Trp時:弱化子對轉(zhuǎn)錄調(diào)控的關(guān)鍵空間結(jié)構(gòu),10thand11thcodonsencodetrpresidues(rareAA)時間,核糖體停頓在2個Trp密碼子上時,產(chǎn)生延宕,此時4區(qū)未轉(zhuǎn)錄出來Theleaderpeptideistodeterminertrpavailabilityandtoregulatetranscriptiontermination14–amino-acid(encodedby27-68oftheleaderRNAsummary5.3.4阻遏作用與弱化作用的協(xié)調(diào)
阻遏效率啟動子的轉(zhuǎn)錄起始頻率在R+和R-相差70倍弱化作用trp存在時,約有10%的RNApol僥幸轉(zhuǎn)錄
-trp
活性阻遏物----→無活性阻遏物
←----
+trptrp操縱子具有雙重調(diào)節(jié)體系?Negative—repressibleoperon可以被最終合成產(chǎn)物所阻遏RPOleadingseq.EDCBAtrp+為什么需要阻遏體系?當(dāng)大量Trp存在時,阻遏系統(tǒng)起作用。阻遏物與之結(jié)合,阻止先導(dǎo)mRNA合成。
經(jīng)濟僅有少量trp時,RNApol啟動,但在L.S.處脫落,轉(zhuǎn)錄中斷RPOleadingseq.EDCBA少量trp+不足以結(jié)合O位點為什么需要弱化系統(tǒng)?當(dāng)trp濃度低時,阻遏物從有活性變?yōu)闊o活性,速度極慢,不能很快引發(fā)trp合成。因此需要一個能快速作出反應(yīng)的系統(tǒng),以保持培養(yǎng)基中適當(dāng)?shù)腡rp水平。5.3.5細(xì)菌演化出弱化系統(tǒng)的生物學(xué)意義通過tRNA荷載與否進行調(diào)控,更為靈敏氨基酸的主要用途是合成蛋白質(zhì),因而tRNA荷載為標(biāo)準(zhǔn)進行調(diào)控更為恰當(dāng)兩個調(diào)控系統(tǒng),避免浪費提高效率阻遏系統(tǒng)高水平trp時,不轉(zhuǎn)錄低水平trp時,轉(zhuǎn)錄至LS弱化系統(tǒng)細(xì)調(diào)原核生物細(xì)致的精細(xì)調(diào)控機制增強原核生物對環(huán)境的適應(yīng)性細(xì)菌通過弱化作用彌補阻遏作用的不足,因為阻遏作用只能使轉(zhuǎn)錄不起始,對于已經(jīng)起始的轉(zhuǎn)錄,只能通過弱化作用使之中途停下來。阻遏作用的信號是細(xì)胞內(nèi)色氨酸的多少;弱化作用的信號則是細(xì)胞內(nèi)載有色氨酸的tRNA的多少。它通過前導(dǎo)肽的翻譯來控制轉(zhuǎn)錄的進行,在細(xì)菌細(xì)胞內(nèi)這兩種作用相輔相成,體現(xiàn)著生物體內(nèi)周密的調(diào)控作用。一、翻譯起始的調(diào)控
RBS(核糖體結(jié)合位點):mRNA鏈上起始密碼子AUG上游的一段非翻譯區(qū)。RBS的結(jié)合強度取決于SD序列的結(jié)構(gòu)及其與起始密碼子AUG之間的距離。
SD-4-10(9)-AUG5.4轉(zhuǎn)錄后水平上的調(diào)控二、稀有密碼子對翻譯的影響dnaG(引物酶)RNA引物dnaG、rpoD和rpsU屬于大腸桿菌基因組上的同一個操縱子50個拷貝的dnaG蛋白、2800個拷貝的rpoD和40000個拷貝的rpsU幾種蛋白質(zhì)中異亮氨酸密碼子使用頻率比較蛋白質(zhì)AUU/%AUC%AUA%結(jié)構(gòu)蛋白37621σ亞基26740DnaG蛋白363232細(xì)胞內(nèi)對應(yīng)于稀有密碼子的tRNA較少,高頻率使用這些密碼子的基因翻譯過程容易受阻,影響了蛋白
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