多能性干細(xì)胞中l(wèi)ncRNAs及可變起始外顯子事件的系統(tǒng)鑒定和功能分析的開題報(bào)告

多能性干細(xì)胞中l(wèi)ncRNAs及可變起始外顯子事件的系統(tǒng)鑒定和功能分析的開題報(bào)告題目：多能性干細(xì)胞中l(wèi)ncRNAs及可變起始外顯子事件的系統(tǒng)鑒定和功能分析一、研究背景及意義目前，多能性干細(xì)胞（Embryonicstemcells,ESCs）的應(yīng)用已經(jīng)擴(kuò)展到了許多領(lǐng)域，例如干細(xì)胞治療、組織再生、生物醫(yī)學(xué)研究等。然而，ESC生長、分化和自我更新等機(jī)制仍然不清楚。因此，探究多能性干細(xì)胞分化和自我更新的基礎(chǔ)分子機(jī)制，對于促進(jìn)干細(xì)胞應(yīng)用的發(fā)展具有重要意義。長鏈非編碼RNA（longnoncodingRNA,lncRNA）是一類長度超過200個堿基的非編碼RNA，其在細(xì)胞中發(fā)揮著重要的調(diào)節(jié)功能，參與了細(xì)胞分化、增殖和凋亡等生物學(xué)過程。有研究表明，lncRNA在多能性干細(xì)胞發(fā)育過程中具有重要的調(diào)節(jié)作用，然而，目前對多能性干細(xì)胞中大多數(shù)lncRNA的功能還未知。可變起始外顯子（alternativestartsite,AS）是指具有多個外顯子的基因在轉(zhuǎn)錄過程中通過不同的起始外顯子產(chǎn)生多個轉(zhuǎn)錄本的現(xiàn)象。AS事件是一種常見的基因表達(dá)調(diào)節(jié)方式，其在多能性干細(xì)胞分化過程中也具有重要的調(diào)節(jié)作用。因此，對多能性干細(xì)胞中AS事件的鑒定及其在調(diào)節(jié)細(xì)胞分化和自我更新中的作用進(jìn)行深入研究也具有重要意義。二、研究目的本研究旨在通過系統(tǒng)性的鑒定和分析多能性干細(xì)胞中的lncRNA和AS事件，并深入研究其在調(diào)節(jié)細(xì)胞分化和自我更新中的作用，探討多能性干細(xì)胞分化和自我更新的基礎(chǔ)分子機(jī)制。三、研究內(nèi)容及技術(shù)路線1.鑒定多能性干細(xì)胞中的lncRNA通過對多能性干細(xì)胞和成熟細(xì)胞進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序，采用CPC2、CPAT等軟件和STRING數(shù)據(jù)庫等工具，篩選出具有l(wèi)ncRNA特征的多能性干細(xì)胞中新發(fā)現(xiàn)的lncRNA。2.鑒定多能性干細(xì)胞中AS事件采用對多能性干細(xì)胞和成熟細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)進(jìn)行比較分析，在生物統(tǒng)計(jì)學(xué)上檢測差異外顯子，然后對差異外顯子進(jìn)行篩選，最終得到和多能性干細(xì)胞分化和自我更新相關(guān)的可變起始外顯子事件。3.篩選多能性干細(xì)胞特異性的lncRNA和AS事件利用RT-qPCR等方法對鑒定出的lncRNA和AS事件進(jìn)行驗(yàn)證，并篩選出多能性干細(xì)胞特異性的lncRNA和AS事件。4.功能分析采用沉默和過表達(dá)等方法對篩選出的具有差異表達(dá)的lncRNA和AS事件進(jìn)行功能驗(yàn)證，并進(jìn)行生物信息學(xué)分析，以深入研究多能性干細(xì)胞分化及自我更新機(jī)制。四、研究預(yù)期結(jié)果本研究旨在通過系統(tǒng)性地鑒定和分析多能性干細(xì)胞中的lncRNA和AS事件，并深入研究其在調(diào)節(jié)細(xì)胞分化和自我更新中的作用，探討多能性干細(xì)胞分化和自我更新的基礎(chǔ)分子機(jī)制，預(yù)計(jì)可以獲得以下研究結(jié)果：1.鑒定出多能性干細(xì)胞中新發(fā)現(xiàn)的lncRNA，并分析其在調(diào)節(jié)細(xì)胞分化和自我更新中的作用。2.發(fā)現(xiàn)多能性干細(xì)胞中的AS事件特異性，進(jìn)一步說明AS事件在多能性干細(xì)胞分化和自我更新機(jī)制中的調(diào)控作用。3.對具有差異表達(dá)的lncRNA和AS事件進(jìn)行功能驗(yàn)證，并深入探究其在調(diào)控多能性干細(xì)胞分化和自我更新過程中的具體作用。五、研究意義本研究將從系統(tǒng)性的角度深入研究多能性干細(xì)胞中的lncRNA和AS事件，并揭示其在調(diào)節(jié)多能性干細(xì)胞