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MCCC1/LAMP3降低了中國大陸

漢族人群散發(fā)性帕金森病的發(fā)病風險

背景帕金森?。≒arkinson’sdisease,PD)是中老年人常見的神經系統(tǒng)變性疾病,可能是在老齡化的背景下遺傳因素和環(huán)境因素共同作用的結果。

全基因組關聯分析(genome-wideassociationstudies,GWAS)在揭示復雜性疾病的遺傳背景方面,是目前最為強大和有效的實驗設計。背景17項PDGWAS及其meta分析肯定了之前發(fā)現的PD相關基因:SNCA,MAPT。發(fā)現了許多新的PD相關基因及位點:PARK16,GAK/DGKQ,HLA,BST1,

12q24:rs4964469,(ACMSD,STK39,SYT11,MCCC1/LAMP3,CCDC62/HIP1R)1,STX1B,FGF20,STBD1,GPNMB,RIT2等。1.Nalls,M.A.,etal.ImputationofsequencevariantsforidentificationofgeneticrisksforParkinson'sdisease:ameta-analysisofgenome-wideassociationstudies.Lancet377,641-649(2011)目的

探討MCCC1/LAMP3rs11711441多態(tài)性與中國大陸漢族人群散發(fā)性帕金森病發(fā)病的關系。

甲基巴豆酰輔酶A羧化酶1/溶酶體相關膜蛋白3(methylcrotonoyl-CoAcarboxylase1/lysosomeassociatedmembraneprotein3

,MCCC1/LAMP3)基因位于3q27。PD組對照組

757例來自華西醫(yī)院神經內科門診就診并登記的PD患者,診斷符合英國PD協會腦庫的臨床診斷標準,無PD家族史。

671例來自我院的健康志愿者,并且與PD組患者在地區(qū)、種族、性別、年齡均相匹配。研究對象所有1428例研究對象均簽署知情同意書,并留取外周靜脈血5ml試驗流程提?。模危练勇确路ɑ蚍中徒y(tǒng)計分析基質輔助激光解析/電離飛行時間質譜(MALDI-TOF-MS)

SPSS16.0結果

1.

MCCC1/LAMP3rs11711441基因分型圖譜MCCC1/LAMP3rs11711441結果SNP病例組MAF對照組MAFOR95%(CI)P值rs1171144117.24%20.19%0.82(0.68,0.99)0.0432.MCCC1/LAMP3rs11711441病例組及對照組基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡3.MCCC1/LAMP3rs11711441(G>A)病例組及對照組最小等位基因頻率(minorallelefrequency,

MAF)

分布結果4.MCCC1/LAMP3rs11711441病例組及對照組最小等位基因攜帶者與非攜帶者頻率分布比較

n基因型(%)OR95%(CI)P值MCCC1/LAMP3rs11711441GGGA+AAPD組757511(67.5)246(32.5)0.78

(0.62,0.96)0.022EOPD259163(65.5)86

(34.5)0.91(0.62,1.34)0.641LOPD508348(68.5)160(31.5)0.72(0.55,0.93)0.014對照組671414(61.7)257(38.3)--對照組

<50歲226135(63.4)78(36.6)--對照組

≥50歲458279(60.9)179(39.1)--結果5.MCCC1/LAMP3rs11711441GA+AA基因型與GG基因型PD患者的臨床特征GGGA+

AAP值性別

(%)女299(58.5)134(54.5)0.293男212(41.5)112(45.5)發(fā)病年齡(歲)a

所有患者54.23±10.5254.45±10.780.785EOPD42.20±4.6142.74±5.140.392LOPD59.86±7.2860.74±7.130.202首發(fā)癥狀靜止性震顫

(%)264(51.7)120(48.8)0.378運動遲緩-強直

173(33.9)95(38.6)混合癥狀28(5.5)8(3.3)其他a46(9.0)23(9.3)a

包括疼痛、乏力、自主神經功能紊亂等癥狀討論Nalls一項包括不同種族的更大范圍的重復研究發(fā)現:MCCC1/LAMP3rs11711441亞洲人群(OR=0.81)高加索人群(OR=0.86)在2011年完成的一項包括5項PDGWAS及獨立重復驗證首次發(fā)現了5個新的PD相關基因包括:MCCC1/LAMP3rs11711441Lill基于PDGene數據庫完成的meta分析(包括3項GWAS)也肯定了以前鑒定的11個PD相關基因包括:MCCC1/LAMP3rs11711441

(OR=0.86)一項在相對同質的斯堪的納維亞人群(挪威、瑞典)的病例-對照研究也發(fā)現:MCCC1/LAMP3Rs11711441(OR=0.84)SharmaPihlstr?m1.

M.A.Nallsetal.,Lancet377,641(Feb19,2011).2.

C.M.Lilletal.,PLoSGenet8,e1002548(Mar,2012).3.

M.Sharmaetal.,Neurology79,659(2012).4.

L.Pihlstrometal.,NeurobiolAging34,1708e7(Jun,2013).討論本研究MCCC1/LAMP3rs11711441降低了中國大陸漢族人群散發(fā)性PD發(fā)病風險(1428例研究對象,OR=0.82,P=0.043),這種相關性僅發(fā)生在晚發(fā)組(P=0.014)。近期研究近期的一項中國大陸漢族人群的研究(993例研究對象)表明:MCCC1/LAMP3rs11711441(早發(fā)性PD組,晚發(fā)性PD組,性別分層)1。Do等完成的一項PDGWAS表明:

MCCC1/LAMP3

rs10513789(P=2.67×10?10,OR=0.803)2在一項德系猶太人群的研究表明:MCCC1/LAMP3

rs12493053

(P=0.005,OR=0.64)31.

Y.-q.Wangetal.,Neuroscienceletters566,206(2014).2.

C.B.Doetal.,PLoSGenetics7,e1002141(2011).3.

X.Liuetal.,BMCmedicalgenetics12,104(2011).討論結果略不一致標簽位點不同連鎖不平衡遺傳異質性樣本量討論

MCCC1編碼3-甲基巴豆酰輔酶A羧化酶,該

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