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實驗質(zhì)粒的限制性內(nèi)切酶反應(yīng)分析實驗結(jié)果與討論實驗步驟實驗儀器與試劑實驗原理實驗?zāi)康姆肿由飳W(xué)實驗實驗?zāi)康?、掌握限制性內(nèi)切酶的工作原理,掌握酶切體系建立原則2、熟悉基因工程所用的限制酶的特點分子生物學(xué)實驗實驗原理
限制性內(nèi)切酶能特異地結(jié)合于一段被稱為限制性酶識別序列的DNA序列之內(nèi)或其附近的特異位點上,并切割雙鏈DNA。
由于這種切割作用是在DNA分子內(nèi)部進行的,故名限制性內(nèi)切酶(簡稱限制酶)
。分子生物學(xué)實驗限制性內(nèi)切酶可分為三類限制性內(nèi)切酶酶分子識別位點切割位點限制作用是否需用ATPⅠ類三亞基雙功能酶二分非對稱至少在識別位點外1000
bpYesⅡ類(93%)內(nèi)切酶與甲基化酶分子不在一起4-6
bp,大多數(shù)為回文對稱結(jié)構(gòu)
在識別位點中或靠近識別位點無特異性NoⅢ類二亞基雙功能酶5-7
bp非對稱在識別位點下游24-26bpYes分子生物學(xué)實驗Ⅱ類限制性內(nèi)切酶分子克隆中常用的為II類限制酶,其識別位點長度為4、5或6個核苷酸的反向重復(fù)序列。限制酶的切割點因酶而異,有些產(chǎn)生帶平端的DNA片段,而另一些產(chǎn)生帶有粘性末端的DNA。如EcoRⅠ切割識別序列后產(chǎn)生兩個互補的粘性末端:
5'…GAATTC…3‘→5'…GAATTC…3'3'…CTTAAG…5'→3'…CTTAAG…5'分子生物學(xué)實驗HindIII:AAGCTTTTCGAAEcoRV:GATAGCCTATAGSmaI(30℃)CCCGGGGGGCCC分子生物學(xué)實驗限制酶的命名是根據(jù)細(xì)菌種類而定,一般是以微生物屬名的第一個字母和種名的前兩個字母組成,第四個字母表示菌株(品系)。
分子生物學(xué)實驗實驗儀器與試劑儀器:恒溫水浴鍋、離心管、移液器、槍頭、離心機、電泳設(shè)備等。試劑:
pUC19質(zhì)粒,EcoRI酶,酶切緩沖液,瓊脂糖,電泳緩沖液,EB,10x上樣緩沖液,無菌水等。分子生物學(xué)實驗實驗步驟1、在一個潔凈的0.5ml離心管中混勻下列反應(yīng)物反應(yīng)物體積(μl)ddH2O510×Buffer1.5質(zhì)粒DNA(1μg)8EcoRI(10U)0.5最終至15μl6000rpm/min稍離15s,將反應(yīng)物置于37℃水浴中溫浴1~2hr。分子生物學(xué)實驗實驗步驟2、6000rpm/min稍離15s,將反應(yīng)物置于37℃水浴中溫浴1~2hr。3、配膠:稱取1.4g瓊脂糖粉末,加入160ml1xTAE(配2瓶)
,反復(fù)煮沸三次后,待冷卻至約60℃后,倒膠,等待凝固(約30min),得到1%凝膠。4、酶切完成后,稍離,加入2μl10x上樣緩沖液混勻,然后上樣。另上樣20μlMarker,以及1份10μl質(zhì)粒(混合2μl10x上樣緩沖液)作為對照,120V電泳1hr。5、在紫外分析儀(凝膠成像系統(tǒng))上觀察酶切的結(jié)果。分子生物學(xué)實驗電泳檢測示例分子生物學(xué)實驗注意事項
1、內(nèi)切酶要保持在冰浴上,避免長時間置于高溫中。2、加樣時槍頭直接垂直伸入EP管底部,避免碰到管壁,每加完一個樣要更換槍頭。同時要記住加樣的順序,以免漏加或錯加。3、加樣時酶最后加,并且加完酶后要用槍頭充分混勻。4、注意酶的用量、消化反應(yīng)溫度和時間。限制性內(nèi)切酶用量可按標(biāo)準(zhǔn)體系1μgDNA加1單位酶,消化1~2hr。過少酶切不完全,過多會產(chǎn)生“星號活性”。分子生物學(xué)實驗星號活性:在非理想的條件下,內(nèi)切酶切割與識別位點相似但不完全相同的序列,這一現(xiàn)象稱星號活性。-----非特異性酶量過大:≧25U/μgDNA(較高的甘油濃度
)低鹽濃度(<25mM)高pH值(
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