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基因檢測(cè)與臨床腫瘤個(gè)體化治療目錄遺傳性腫瘤基因檢測(cè)Oseq?-T腫瘤個(gè)體化診療基因檢測(cè)Oseq?-TLungCancer肺癌個(gè)體化診療Oseq?-ctDNA無創(chuàng)腫瘤個(gè)體化診療基因檢測(cè)遺傳性腫瘤基因檢測(cè)
預(yù)防篇76.39%前10名癌癥每10萬人發(fā)病數(shù)2002-2050中國(guó)癌癥發(fā)生和死亡預(yù)測(cè)(萬人)我國(guó)腫瘤發(fā)病和死亡的總體情況-“癌情告急”腫瘤現(xiàn)狀癌癥分為散發(fā)性癌,家族性癌和遺傳性癌。約5-10%的癌癥是遺傳的,也就是說特定的基因上發(fā)生的突變會(huì)在家族中遺傳,遺傳到這些突變的個(gè)體發(fā)生腫瘤的風(fēng)險(xiǎn)會(huì)極大地增加。華大可通過對(duì)受檢者(腫瘤患者、患者親屬、健康人群)樣本進(jìn)行高通量測(cè)序,分析常見的17種遺傳性腫瘤相關(guān)的49個(gè)基因的突變情況,從而預(yù)測(cè)患癌風(fēng)險(xiǎn),輔助醫(yī)生制定相應(yīng)風(fēng)險(xiǎn)管理方案。基因檢測(cè)意義遺傳性腫瘤基因檢測(cè)臨床意義基因檢測(cè)篩查高危(突變基因攜帶)人群1.預(yù)測(cè)患癌風(fēng)險(xiǎn)2.早期干預(yù)、治療3.節(jié)省治療時(shí)間、費(fèi)用癌癥患者基因檢測(cè)查找致病原因1.提供針對(duì)性治療方案(如乳腺癌靶向BRCA藥物)2.預(yù)測(cè)患其他癌癥的風(fēng)險(xiǎn)遺傳性腫瘤檢測(cè)列表疾病類型(17種,49個(gè)基因)乳腺癌甲狀旁腺癌卵巢癌嗜絡(luò)細(xì)胞瘤結(jié)直腸癌多發(fā)性神經(jīng)纖維瘤前列腺癌多發(fā)性軟骨肉瘤腎癌黑色素瘤胃癌多發(fā)性內(nèi)分泌瘤家族性副神經(jīng)節(jié)瘤視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤甲狀腺癌胰腺癌子宮內(nèi)膜癌健康篩查(兩類)男性套餐女性套餐遺傳性腫瘤基因列表疾病名檢測(cè)基因(共49個(gè)基因)乳腺癌(2/21)BRCA1,BRCA2,CHEK2,PALB2,BRIP1,TP53,PTEN,STK11,CDH1,ATM,BARD1,MLH1,MRE11A,MSH2,MSH6,MUTYH,NBN,PMS1,PMS2,RAD50,RAD51C卵巢癌(2/21)BRCA1,BRCA2,CHEK2,PALB2,BRIP1,TP53,PTEN,STK11,CDH1,ATM,BARD1,MLH1,MRE11A,MSH2,MSH6,MUTYH,NBN,PMS1,PMS2,RAD50,RAD51C結(jié)直腸癌(14)APC,AXIN2,EPCAM,MLH1,MLH3,MSH2,MSH6,MUTYH,PMS1,PMS2,STK11,PTEN,SMAD4,BMPR1A胃癌(6)CDH1,MLH1,MSH2,MSH6,PMS2,EPCAM腎癌(4)VHL,MET,FH,FLCN前列腺癌(3)BRCA1,BRCA2,CHEK2多發(fā)性內(nèi)分泌瘤(3)MEN1,RET,CDKN1B甲狀腺癌(2)RET,NTRK1甲狀旁腺癌(2)CDC73,MEN1多發(fā)性神經(jīng)纖維瘤(2)NF1,NF2嗜鉻細(xì)胞瘤(9)SDHAF2,SDHB,SDHC,SDHD,RET,VHL,MAX,NF1,TMEM127家族性副神經(jīng)節(jié)瘤(5)SDHB,SDHC,SDHD,SDHAF2,VHL視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤(1)RB1黑色素瘤(2)CDKN2A,CDK4多發(fā)性軟骨肉瘤(2)EXT1,EXT2胰腺癌(2)BRCA2,PALB2子宮內(nèi)膜癌(5)EPCAM,MLH1,MSH2,MSH6,PMS2基因外顯子數(shù)BRCA124BRCA227CHEK217PALB214BRIP121TP5312PTEN10STK1111CDH117ATM64BARD112MLH120MRE1120MSH217MSH611MUTYH17NBN17PMS114基因外顯子數(shù)PMS216RAD5026RAD51C10APC15AXIN212EPCAM10MLH314MSH611PTEN10SMAD413BMPR1A14VHL4MET22FH11FLCN15TMEM1274基因外顯子數(shù)MEN111RET21CDKN1B4NTRK118NF158NF217SDHAF25RB128CDKN2A4CDK49EXT112EXT216MAX4SDHB9SDHC6SDHD517種腫瘤,49個(gè)基因,779個(gè)外顯子區(qū)域遺傳性腫瘤基因列表Textinhere1.在50歲之前確診的乳腺癌或卵巢癌患者及親屬2.男性乳腺癌患者及親屬3.雙側(cè)乳癌患者及親屬4.同時(shí)患有乳腺癌和卵巢癌的患者及親屬5.三陰癌患者及親戚適用人群1.確診為HNPCC或FAP的患者及親屬2.親屬為APC或MMR突變基因的攜帶者3.50歲之前確診為結(jié)直腸癌的患者及親屬4.有結(jié)腸息肉或有結(jié)直腸癌家族史的患者及親屬腫瘤患者腫瘤患者親屬及健康人群遺傳性結(jié)直腸癌14個(gè)基因遺傳性腫瘤panel女性套餐/男性套餐遺傳性乳腺癌2個(gè)基因/21個(gè)基因適用人群適用人群BRCA1,BRCA2,CHEK2,PALB2,BRIP1,TP53,PTEN,STK11,CDH1,ATM,BARD1,MLH1,MRE11A,MSH2,MSH6,MUTYH,NBN,PMS1,PMS2,RAD50,RAD51CAPC,AXIN2,EPCAM,MLH1,MLH3,MSH2,MSH6,MUTYH,PMS1,PMS2,STK11,PTEN,SMAD4,BMPR1A17種腫瘤相關(guān)的49個(gè)易感基因進(jìn)行檢測(cè)遺傳性腫瘤基因檢測(cè)產(chǎn)品-主要產(chǎn)品BRCA1BRCA2BRCA1——定位于17q21,約100kb,含有24個(gè)外顯子,其中第1、4號(hào)外顯子不編碼氨基酸,另外22個(gè)轉(zhuǎn)錄出7.6kbmRNA,最終可編碼含1863個(gè)氨基酸的蛋白質(zhì)。而第11號(hào)外顯子較大,長(zhǎng)3.4kb。
已報(bào)道其突變位點(diǎn)多于1785個(gè)BRCA2——定位在13q12-13,有27個(gè)外顯子,僅編碼區(qū)就有11.4K。其中11號(hào)外顯子幾乎含編碼序列的一半,完整的BRCA2編碼3418個(gè)氨基酸的蛋白質(zhì)。已報(bào)道其突變位點(diǎn)多于2011個(gè)BRCA1/2
基因遺傳性乳腺癌/卵巢癌基因檢測(cè)遺傳性乳腺癌/卵巢癌基因檢測(cè)BRCA1/2基因突變存在于:
5%~10%的乳腺癌10%~20%的卵巢癌40%~45%的遺傳性乳腺癌患者80%的乳腺癌和卵巢癌高發(fā)家族患者圖:BRCA突變基因攜帶者的患病風(fēng)險(xiǎn)癌癥類型普通人患病風(fēng)險(xiǎn)
基因突變后患病風(fēng)險(xiǎn)BRCA1BRCA2乳腺癌12%50%-80%40%-70%繼發(fā)性乳腺癌3.5%~11%(5年)27%(5年)12%(5年)
40%-50%(20年)卵巢癌1%-2%24%-40%11%-18%男性乳腺癌0.1%1%-2%5%-10%前列腺癌15%(北歐人)
18%(美國(guó)黑人)<30%<39%胰腺癌0.50%1%-3%2%-7%Datafrom:NEnglJMed.1997;336:1401-1408;NatGenet,2006.38(8):p.873-5.
表:BRCA1/2基因突變攜帶者相關(guān)腫瘤患病風(fēng)險(xiǎn)Genetic/FamilialHigh-RiskAssessment:BreastandOvarianVersion4.2013NCCN.org遺傳性乳腺癌/卵巢癌基因檢測(cè)
2基因檢測(cè)BRCA1BRCA2
21基因檢測(cè)BRCA1,BRCA2,CHEK2,PALB2,BRIP1,TP53,PTEN,STK11,CDH1,ATM,BARD1,MLH1,MRE11,MSH2,MSH6,MUTYH,NBN,PMS1,PMS2,RAD50,RAD51C在50歲之前確診的乳腺癌或卵巢癌患者及親屬男性乳腺癌患者及親屬;雙側(cè)乳癌患者及親屬同時(shí)患有乳腺癌和卵巢癌的患者及親屬三陰癌患者及親戚適用人群遺傳性乳腺癌/卵巢癌基因檢測(cè)真實(shí)案例無BRCA1突變
BRCA1突變
乳腺癌/卵巢癌PrY.-J.BIGNONbilBC(55)OC(57)BC(53)BC(34)
OC(36)BC(30)BC(55)OC(65)BC(28)Ovariectomy?基因突變區(qū)域突變情況BRCA1CDS5c.335_335delABRCA2CDS10p.Ile1929Val(ATT>GTT)BRCA2CDS13p.Val2466Ala(GTA->GCA)家族基因檢測(cè)結(jié)果Sanger驗(yàn)證患者control乳腺癌預(yù)防措施生育選擇
產(chǎn)前診斷
PGD預(yù)防性手術(shù)治療乳腺切除卵巢切除預(yù)防性手術(shù)治療他莫西芬化學(xué)預(yù)防手術(shù)預(yù)防生殖細(xì)胞保存>90%96%53%18~21歲,每月進(jìn)行乳腺自檢;21~25歲,每年或者每半年進(jìn)行一次臨床乳腺檢查;25~35歲,每年進(jìn)行一次乳腺X線鉬靶照相或乳腺磁共振成像(MRI);25~35歲,每年或每半年進(jìn)行一次陰道彩色多普勒超聲或CA-125檢查以篩選卵巢癌.遺傳性結(jié)直腸癌25%的結(jié)直腸癌(CRC)是有遺傳背景的,最主要的為HNPCC、FAP。遺傳性非息肉病性結(jié)直腸癌(HNPCC)由錯(cuò)配修復(fù)基因(MMR)的突變導(dǎo)致,包括MLH1、MSH2、MSH6、PMS2等。上述基因有一個(gè)發(fā)生突變,則一生患CRC的概率是80%。家族性腺瘤性息肉病(FAP)是常染色體顯性遺傳病,由APC基因(5q21)突變導(dǎo)致,約占所有CRC的1%;FAP患者一生發(fā)生CRC的概率是100%,平均發(fā)病年齡在39歲左右。
圖:MMR突變基因攜帶者的患病風(fēng)險(xiǎn)《NCCN臨床實(shí)踐指南》提出:
所有的CRC患者都應(yīng)該詢問家族史,疑似遺傳性CRC的應(yīng)當(dāng)進(jìn)行相應(yīng)遺傳學(xué)檢測(cè),并采用更嚴(yán)密的篩查及不同的治療手段。國(guó)家衛(wèi)生部公布的《醫(yī)療機(jī)構(gòu)臨床檢測(cè)項(xiàng)目目錄》:遺傳性非息肉病性結(jié)直腸癌的基因突變檢測(cè)(hMLH1、hMSH2、PMS1、PMS2基因突變檢測(cè))大腸癌易感基因的基因檢測(cè)(APC基因突變檢測(cè))遺傳性結(jié)直腸癌基因檢測(cè)
14基因檢測(cè)APC,AXIN2,EPCAM,MLH1,MLH3,MSH2,MSH6,MUTYH,PMS1,PMS2,STK11,PTEN,SMAD4,BMPR1A遺傳性結(jié)直腸癌基因檢測(cè)產(chǎn)品檢測(cè)適用人群:確診為HNPCC或FAP的患者及親屬親屬為APC或MMR突變基因的攜帶者50歲之前確診為結(jié)直腸癌的患者及親屬有結(jié)腸息肉或有結(jié)直腸癌家族史的患者及親屬遺傳性腫瘤panel基因檢測(cè)產(chǎn)品女性套餐(16,49genes)乳腺癌卵巢癌胃癌結(jié)直腸癌甲狀腺癌甲狀腺旁腺癌黑色素瘤腎癌嗜鉻細(xì)胞瘤多發(fā)性軟骨肉瘤多發(fā)性內(nèi)分泌瘤視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤多發(fā)性神經(jīng)纖維瘤家族性副神經(jīng)節(jié)瘤胰腺癌子宮內(nèi)膜癌男性套餐(15,41genes)乳腺癌前列腺癌胃癌結(jié)直腸癌甲狀腺癌甲狀腺旁腺癌黑色素瘤腎癌嗜鉻細(xì)胞瘤多發(fā)性軟骨肉瘤多發(fā)性內(nèi)分泌瘤視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤多發(fā)性神經(jīng)纖維瘤家族性副神經(jīng)節(jié)瘤胰腺癌檢測(cè)適用人群:腫瘤患者腫瘤患者親屬及健康人群參考權(quán)威文獻(xiàn)報(bào)道以及相關(guān)腫瘤變異數(shù)據(jù)庫一般按常染色體顯性遺傳方式傳遞發(fā)病年齡較早,常為雙側(cè)性或多發(fā)性的特點(diǎn)。利用華大自主研發(fā)的高通量測(cè)序平臺(tái),對(duì)檢測(cè)基因的全部外顯子和剪切位點(diǎn)進(jìn)行測(cè)序,并結(jié)合自主研發(fā)的生物信息和全球最大的黃種人基因組數(shù)據(jù)庫,解讀該區(qū)域的基因突變信息。技術(shù)流程介紹華大技術(shù)特點(diǎn)便捷僅需5ml外周血或2ml唾液即可檢測(cè)精準(zhǔn)準(zhǔn)確率高達(dá)99.9%,規(guī)范的質(zhì)量管理體系確保結(jié)果的準(zhǔn)確性全面可檢測(cè)17種遺傳性腫瘤相關(guān)基因,全球最大的黃種人腫瘤基因數(shù)據(jù)庫專業(yè)專業(yè)遺傳咨詢團(tuán)隊(duì)提供報(bào)告解讀及遺傳咨詢服務(wù)項(xiàng)目開展流程高通量測(cè)序數(shù)據(jù)分析報(bào)告解讀陽性驗(yàn)證發(fā)送報(bào)告文庫制備質(zhì)控QC檢測(cè)富集度質(zhì)控下機(jī)數(shù)據(jù)質(zhì)控完善的信息化管理系統(tǒng)規(guī)范的質(zhì)量管理體系解讀規(guī)范化流程雙人復(fù)核醫(yī)院就診樣本采集DNA提取先證者DNA目標(biāo)區(qū)域捕獲Sanger,QPCR陽性驗(yàn)證*遺傳咨詢與生活指導(dǎo)專業(yè)團(tuán)隊(duì)*Sanger、QPCR陽性驗(yàn)證:是針對(duì)NGS結(jié)果為陽性的樣本進(jìn)行驗(yàn)證,其中QPCR僅針對(duì)CNV結(jié)果進(jìn)行驗(yàn)證。數(shù)據(jù)庫及解讀工具頻率參考數(shù)據(jù)庫:dbSNP,1000G,Localdatabase突變數(shù)據(jù)庫:基因蛋白信息數(shù)據(jù)庫:NCBI,Uniprot檢索引擎:命名:網(wǎng)站:報(bào)告內(nèi)容樣本信息檢測(cè)信息檢測(cè)結(jié)果結(jié)果說明陽性結(jié)果陰性結(jié)果未明結(jié)果建議附錄變異類型Class5:致病突變(Pathogenic)Class4:疑似致病突變(LikelyPathogenic)Class3:臨床意義未明突變(VariantsofUnknownClinicalSignificance)Class2:疑似良性突變(likelyNon-Pathogenic)Class1:良性多態(tài)性(Benign)華大醫(yī)學(xué)遺傳咨詢團(tuán)隊(duì)國(guó)際臨床遺傳咨詢師國(guó)內(nèi)臨床遺傳咨詢師遺傳咨詢師遺傳咨詢客服中心國(guó)際臨床遺傳咨詢師祁鳴教授——美國(guó)羅徹斯特大學(xué)臨床分子遺傳學(xué)中心實(shí)驗(yàn)室主任,浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院特聘教授國(guó)內(nèi)臨床遺傳咨詢師王一鳴教授——華大醫(yī)學(xué)首席遺傳咨詢師,高年資醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)顧問,中山大學(xué)分子醫(yī)學(xué)研究院疾病基因研究所中心主任香港中文大學(xué)醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)博士黃輝團(tuán)隊(duì):遺傳性疾病的診斷、預(yù)防、治療及健康指導(dǎo)遺傳咨詢師遺傳咨詢報(bào)告的審核及咨詢復(fù)雜案例研究及檢測(cè)方案的設(shè)計(jì)疾病發(fā)生及再發(fā)風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估預(yù)測(cè)遺傳咨詢客服中心檢測(cè)內(nèi)容、流程、方法、周期、目的和意義接受適用人群評(píng)估檢測(cè)方案:提供簡(jiǎn)單的已明確的方案樣本類型、運(yùn)輸及保存條件咨詢Oseq?-T腫瘤個(gè)體化診療基因檢測(cè)
治療篇腫瘤個(gè)體化治療以肺癌為例:目前NCCN指南推薦的用于肺癌靶向藥物共10種,其中涉及到共10個(gè)基因EGFR,KRAS,BRAF,ROS1,HER2,ALK,RET,MET,NRAS,PIK3CA而如果要全面了解藥物療效,其中涉及到的基因多達(dá)30多種。以易瑞沙(Iressa)為例:常規(guī)檢測(cè)EGFR/KRAS基因的熱點(diǎn)變異。但與藥效相關(guān)基因除了EGFR/KRAS外,還包括BRAF/PIK3CA/HER2/ALK/MET/ROS1等基因。目前癌癥用藥基因檢測(cè)不全面細(xì)胞信號(hào)通路全面基因檢測(cè)Cell.2011Mar4;144(5):646-74.比較常見的EGFR信號(hào)通路、PI3K-AKT信號(hào)通路、NOTCH信號(hào)通路等在癌癥發(fā)生發(fā)展過程中起關(guān)鍵作用的pathway和已經(jīng)存在的靶向治療藥物。腫瘤靶向藥物Oseq-T設(shè)計(jì)理念
檢測(cè)技術(shù)檢測(cè)內(nèi)容檢測(cè)優(yōu)勢(shì)檢測(cè)周期樣本類型
適用人群檢測(cè)508個(gè)基因全部外顯子,
19個(gè)基因的78個(gè)內(nèi)含子解讀88種腫瘤藥物檢測(cè)所有實(shí)體瘤目標(biāo)區(qū)域捕獲+高通量測(cè)序靈敏度:99%特異性:99%10個(gè)工作日腫瘤組織:新鮮組織
穿刺樣本,石蠟切片對(duì)照:外周血能獲取腫瘤組織的患者產(chǎn)品介紹Oseq-T檢測(cè)內(nèi)容—藥物列表化療藥物(27)靶向藥物(FDA批準(zhǔn)33)靶向藥物(臨床試驗(yàn)階段28)卡鉑吉西他濱EverolimusBevacizumabVismodegibCrenolanibTriciribine順鉑他莫昔芬TemsirolimusPonatinibCetuximabNeratinibAP26113奧沙利鉑來曲唑SirolimusVandetanibceritinibMidostaurinAZD4547環(huán)磷酰胺阿那曲唑TrastuzumabRituximabAxitinibNintedanibMEK162異環(huán)磷酰胺伊立替康PazopanibPanitumumabSorafenibRidaforolimusNVP-TAE684柔紅霉素巰嘌呤BortezomibBosutinibAlemtuzumabLinsitinibPR81多柔比星巰唑嘌呤NilotinibCrizotinibruxolitinibTivantinibR1507表柔比星巰鳥嘌呤PertuzumabImatinib
NecitumumabSU5614伊達(dá)比星培美曲塞CarfilzomibRegorafenib
RamucirumabWZ4002比生群阿糖胞苷DasatinibErlotinib
EpratuzumabXL888甲氨蝶呤紫杉醇VemurafenibGefitinib
MogamulizumabElotuzumab卡培他濱長(zhǎng)春新堿DabrafenibAfatinib
LumiliximabFarletuzumab氟尿嘧啶多西他賽TrametinibLapatinib
GaliximabOcrelizumab依托泊苷
CabozantinibSunitinib
AdecatumumabQuizartinib508個(gè)基因檢測(cè)內(nèi)容—基因列表基本技術(shù)參數(shù)評(píng)估SNV靈敏性99%,特異性99%Indel靈敏性95%,特異性96%CNVSV已知變異,靈敏性99%,特異性99%全面:一次性檢測(cè)508個(gè)基因、解讀88種藥物,并提供推薦藥物的相關(guān)信息準(zhǔn)確:靈敏度和特異性均在99%以上,100%找到與腫瘤相關(guān)的特異性突變,67%患者找到有效靶向藥物。高效:10個(gè)工作日即可出具檢測(cè)報(bào)告技術(shù)優(yōu)勢(shì)目前檢測(cè)的樣本數(shù)量及找到靶向藥物的樣本比率Oseq-T自推出臨床應(yīng)用至今的三個(gè)月內(nèi),共接收不同種類腫瘤患者臨床樣本448例,涵蓋各種常見腫瘤類型。在所有的腫瘤患者中都檢測(cè)到了與腫瘤相關(guān)的特異性基因突變。根據(jù)患者自身腫瘤基因變異情況,我們?yōu)?7%的受檢者找到了合適的靶向藥物。三大癌種找到靶向藥物的樣本比率臨床診斷:女性,48歲,非小細(xì)胞肺癌,左肺腺癌并左肺門及縱膈淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移常規(guī)藥物基因檢測(cè):僅檢測(cè)EGFR和KRAS的熱點(diǎn)突變,發(fā)
現(xiàn)EGFR基因L858R突變,而KRAS基
因2號(hào)外顯子12、13號(hào)密碼子無變異。常規(guī)治療方案:口服易瑞沙兩個(gè)月,無明顯效果。Oseq-T檢測(cè):
EGFR:L858RERBB2(Her2):Ala733Val檢測(cè)后治療方案:
阿法替尼
阿法替尼是EGFR和HER2的雙重抑制劑。案例1肺部腫塊縮小,病情得到控制(如下圖)總結(jié):
全面檢測(cè)腫瘤相關(guān)的508個(gè)基因,為
用藥無效的患者尋找耐藥原因,推薦
新的治療藥物。
尋找耐藥機(jī)制,同癌異治患者信息:女,30歲,口腔癌常規(guī)檢測(cè)結(jié)果:
EGFR高表達(dá)常規(guī)治療方案:
易瑞沙,治療效果不佳,雙肺多發(fā)轉(zhuǎn)移Oseq-T檢測(cè):
KIT,PDGFRA,KDR三個(gè)基因擴(kuò)增檢測(cè)后藥物方案:舒尼替尼(Sunitinib)舒尼替尼是一個(gè)多靶點(diǎn)的小分子抗腫瘤藥物,F(xiàn)DA批準(zhǔn)用于治療對(duì)標(biāo)準(zhǔn)療法沒有響應(yīng)或不能耐受的胃腸道基質(zhì)腫瘤和轉(zhuǎn)移性腎細(xì)胞癌,其藥物主要靶點(diǎn):VEGFR、C-kit、PDGFR、Flt3、RET、CSF1R。雖然病人患的是口腔癌,但是由于她攜帶舒尼替尼有效的藥物靶點(diǎn),因此服用舒尼替尼效果顯著。案例239肺部轉(zhuǎn)移腫瘤得到控制,局部腫瘤組織壞死(如下圖)三個(gè)月后,一個(gè)氣管癌的患者通過Oseq-T檢測(cè)找到了同樣的基因變異,服用舒尼替尼6周后腫瘤縮小。這說明基于相同的基因變異為不同癌種的患者選擇同種合適的藥物,會(huì)對(duì)治療帶來影響??绨┓N用藥異癌同治案例3臨床診斷:女性,56歲,卵巢癌,直腸轉(zhuǎn)移檢測(cè)前治療方案:
多西他賽+卡鉑6周病情繼續(xù)惡化Oseq-T檢測(cè):
XPC、GSTP1和XRCC1變異,
使得受檢者對(duì)于鉑類的化療
藥物不敏感,且容易產(chǎn)生較高
的毒副作用。NF1p.[S2663fs*]是mTOR抑
制劑的有效藥物靶點(diǎn)。檢測(cè)后藥物方案:
mTOR抑制劑。
目前服用一個(gè)月,癥狀得到了
緩解,頸部淋巴結(jié)縮小。總結(jié):
卵巢癌在NCCN指南上推薦以化療方案為主,受檢者在化療效果不佳的情況下通過Oseq-T檢測(cè)。Oseq-T通過全面檢測(cè)腫瘤細(xì)胞中的特異性變異,基于基因變異為傳統(tǒng)藥物方案不佳的腫瘤患者選擇合適的藥物。打破了傳統(tǒng)的治療準(zhǔn)則,跨癌種用藥。優(yōu)質(zhì)規(guī)范的服務(wù)流程高通量測(cè)序數(shù)據(jù)分析報(bào)告解讀陽性驗(yàn)證發(fā)送報(bào)告文庫制備質(zhì)控QC檢測(cè)富集度質(zhì)控下機(jī)數(shù)據(jù)質(zhì)控自主研發(fā)的高通量測(cè)序平臺(tái)完善的信息化管理系統(tǒng)規(guī)范的質(zhì)量管理體系解讀規(guī)范化流程全球最大的黃種人腫瘤基因組數(shù)據(jù)庫雙人復(fù)核醫(yī)院就診樣本采集DNA提取DNA目標(biāo)區(qū)域捕獲Sanger,QPCR陽性驗(yàn)證*個(gè)體化診療方案專業(yè)專家團(tuán)隊(duì)*Sanger、QPCR陽性驗(yàn)證:是針對(duì)NGS結(jié)果為陽性的樣本進(jìn)行驗(yàn)證,其中QPCR僅針對(duì)CNV結(jié)果進(jìn)行驗(yàn)證。Oseq?-TLungCancer肺癌腫瘤個(gè)體化診療基因檢測(cè)
肺癌現(xiàn)狀腫瘤發(fā)病前十位惡性腫瘤
——《2013年中國(guó)腫瘤登記年報(bào)》腫瘤死亡前十位惡性腫瘤
——《2013年中國(guó)腫瘤登記年報(bào)》肺癌是我國(guó)發(fā)病率和死亡率第一的惡性腫瘤,《2012年中國(guó)腫瘤登記年報(bào)》數(shù)據(jù)表明:我國(guó)每年新發(fā)肺癌病例約60萬例,平均每天1664人,全國(guó)每分鐘就有1人被診斷為肺癌。由于大部分肺癌確診時(shí)已經(jīng)到了晚期,因此肺癌致死率極高,5年生存率只有10%-15%。肺癌分類世界衛(wèi)生組織(WHO)按組織學(xué)分類將肺癌分為:
小細(xì)胞肺癌(SCLC)、大細(xì)胞癌(LCC)、鱗狀細(xì)胞癌(SCC)及腺癌
(ADC)。隨著靶向治療和新型化療藥物的出現(xiàn),使得治療前明確肺癌的基因分型變得尤為重要。非小細(xì)胞肺癌基因分型NCCN指南推薦的肺癌治療方案治療非小細(xì)胞肺癌的常用手段:手術(shù)治療、放射治療、化療藥物和靶向藥物
臨床分期治療方案I期、II期和IIIA期可手術(shù)手術(shù)治療+放射治療+化療藥物不可手術(shù)放射治療+化療藥物IIIB期和IV期可手術(shù)手術(shù)治療+放射治療+化療藥物+靶向藥物不可手術(shù)放射治療+化療藥物+靶向藥物NCCN指南明確推薦的肺癌分子檢測(cè)相關(guān)基因
產(chǎn)品內(nèi)容適用人群檢測(cè)內(nèi)容檢測(cè)技術(shù)臨床意義樣本類型Oseq-TLungCancerNCCN推薦:10個(gè)基因10種靶向藥物取得腫瘤組織的肺癌患者
目標(biāo)區(qū)域捕獲+高通量測(cè)序
基因分型選擇合適的靶向用藥監(jiān)測(cè)獲得性耐藥變異10個(gè)工作日檢測(cè)周期腫瘤組織:新鮮組織,穿刺樣
本,石蠟切片檢測(cè)內(nèi)容藥物商品名基因厄洛替尼(Erlotinib)特羅凱(Tarceva)EGFR,KRAS,ERBB2(HER2),BRAF吉非替尼(Gefitinib)易瑞沙(Iressa)EGFR,KRAS,ERBB2(HER2),BRAF克唑替尼(Crizotinib)賽可瑞(Xalkori)ALK,ROS1,MET阿法替尼(Afatinib)GilotrifEGFR,KRAS,ERBB2(HER2),BRAF曲妥珠單抗(Trastuzumab)赫賽?。℉erceptin)ERBB2(HER2)西妥昔單抗(Cetuximab)愛必妥(Erbitus)KRAS,PIK3CA,BRAF卡博替尼(Cabozantinib)CometriqRET威羅菲尼(Vemurafenib)ZelborafBRAF達(dá)拉菲尼(Dabrafenib)TafinlarBRAF貝伐單抗(Bevacizumab)安維汀(Avastin)NRAS檢測(cè)優(yōu)勢(shì)全面基于華大醫(yī)學(xué)自主研發(fā)的高通量測(cè)序平臺(tái)和全球最大的黃種人腫瘤數(shù)據(jù)庫,一次性檢測(cè)目前NCCN指南推薦的全部10種肺癌靶向藥物和相關(guān)的10個(gè)基因。涵蓋了經(jīng)過FDA認(rèn)證的EGFR基因的41個(gè)突變準(zhǔn)確靈敏度99%特異性99%國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)的實(shí)驗(yàn)室和全面嚴(yán)格的質(zhì)控確保結(jié)果的準(zhǔn)確性。高效10個(gè)工作日即可出具報(bào)告專業(yè)國(guó)際國(guó)內(nèi)頂尖的專家提供檢測(cè)后報(bào)告分析優(yōu)質(zhì)規(guī)范的服務(wù)流程
知情同意,樣本采集01現(xiàn)場(chǎng)咨詢,產(chǎn)品選擇
全面一次性檢測(cè)權(quán)威臨床治療指南推薦的10種肺癌藥物和相關(guān)的10個(gè)基因便捷周到便捷的采樣包提供檢測(cè)所需的全部材料樣本接收,檢測(cè)入庫基因檢測(cè),數(shù)據(jù)分析結(jié)果核對(duì),發(fā)送報(bào)告報(bào)告解讀,信息咨詢0203規(guī)范可靠完善的信息化管理系統(tǒng)規(guī)范的質(zhì)量管理體系04權(quán)威準(zhǔn)確可靠全球最大的中國(guó)人腫瘤基因組數(shù)據(jù)庫自主研發(fā)的高通量測(cè)序平臺(tái),全球唯一獲得CFDA認(rèn)證。自主研發(fā)的生物信息分析流程,盡可能滿足臨床和科研需求靈敏度99%特異性99%05規(guī)范準(zhǔn)確半自動(dòng)化解讀,多人復(fù)核,確保報(bào)告的準(zhǔn)確性06專業(yè)全面國(guó)際一流的專家團(tuán)隊(duì)提供報(bào)告解讀與咨詢提供推薦藥物的相關(guān)信息制定個(gè)體化治療方案Oseq?-ctDNA無創(chuàng)腫瘤個(gè)體化診療
治療篇BreastcancerPancreaticcancerColoncancerTargetedtherapyResponsetotherapySelectivepressureBraintumorDNAblockedbyblood-brainbarrierResistancemutation#1Resistancemutation#2OseqTM–ctDNA無創(chuàng)個(gè)體化診療基因檢測(cè)正常細(xì)胞和腫瘤細(xì)胞都會(huì)將DNA釋放到血液循環(huán)系統(tǒng)中,通過采集外周血,對(duì)外周血血漿中的ctDNA(循環(huán)腫瘤DNA)進(jìn)行測(cè)序,可以精確的分辨出血液循環(huán)DNA中的腫瘤來源DNA片段。
僅需抽取少量外周血無需手術(shù)/穿刺無創(chuàng)高通量測(cè)序用藥解析個(gè)體化治療高效的樣本提取技術(shù)優(yōu)化的文庫構(gòu)建技術(shù)靈敏的信息分析技術(shù)SNV/Indel/CNV/SV508個(gè)腫瘤相關(guān)基因靶向藥物+化療藥物癌癥中晚期/復(fù)發(fā)/轉(zhuǎn)移無法手術(shù)患者原治療方案不適合,欲更換藥物患者OseqTM–ctDNA無創(chuàng)個(gè)體化診療基因檢測(cè)綜合性檢測(cè)508個(gè)基因肺癌乳腺癌不斷更新中……結(jié)直腸癌華大醫(yī)學(xué)Oseq?-ctDNA檢測(cè)內(nèi)容5mL外周血2014年底轉(zhuǎn)產(chǎn)時(shí)已完成臨床樣本癌癥分類情況癌癥類型及檢測(cè)數(shù)量,Total
N=176臨床樣本檢測(cè)成功率
3例樣本實(shí)
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