GB/T 43628-2023空氣中病原微生物宏基因組測(cè)序鑒定方法

ICS07080

CCSA.40

中華人民共和國(guó)國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)

GB/T43628—2023

空氣中病原微生物宏基因組測(cè)序鑒定方法

Methodforidentificationofairbornepathogenicmicroorganismbasedon

metagenomicssequencing

2023-12-28發(fā)布2024-07-01實(shí)施

國(guó)家市場(chǎng)監(jiān)督管理總局發(fā)布

國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)化管理委員會(huì)

GB/T43628—2023

目次

前言

…………………………Ⅲ

引言

…………………………Ⅳ

范圍

1………………………1

規(guī)范性引用文件

2…………………………1

術(shù)語(yǔ)和定義

3………………1

縮略語(yǔ)

4……………………2

原理

5………………………2

試劑

6………………………2

儀器設(shè)備

7…………………2

試驗(yàn)步驟

8…………………3

質(zhì)量控制

9…………………4

空氣病原微生物鑒定

10……………………4

附錄資料性核酸提取方法

A()…………6

附錄資料性測(cè)序流程

B()………………7

附錄資料性參考基因組數(shù)據(jù)庫(kù)和病原微生物選取

C()………………8

附錄資料性鼠疫桿菌及病毒測(cè)序數(shù)據(jù)比對(duì)分析示例

D()SARS……10

參考文獻(xiàn)

……………………12

Ⅰ

GB/T43628—2023

前言

本文件按照標(biāo)準(zhǔn)化工作導(dǎo)則第部分標(biāo)準(zhǔn)化文件的結(jié)構(gòu)和起草規(guī)則的規(guī)定

GB/T1.1—2020《1:》

起草

。

請(qǐng)注意本文件的某些內(nèi)容可能涉及專利本文件的發(fā)布機(jī)構(gòu)不承擔(dān)識(shí)別專利的責(zé)任

。。

本文件由全國(guó)生化檢測(cè)標(biāo)準(zhǔn)化技術(shù)委員會(huì)提出并歸口

(SAC/TC387)。

本文件起草單位中國(guó)計(jì)量科學(xué)研究院深圳華大生命科學(xué)研究院中國(guó)測(cè)試技術(shù)研究院生物研究

:、、

所北京慧榮和科技有限公司南京市計(jì)量監(jiān)督檢測(cè)院

、、。

本文件主要起草人王晶裴娜李曼莉傅博強(qiáng)周李華李俊樺張永卓梁天柱鄭勁林葉德萍

:、、、、、、、、、、

朱蕊

。

Ⅲ

GB/T43628—2023

引言

日常環(huán)境公共場(chǎng)所醫(yī)療衛(wèi)生環(huán)境以及生物安全實(shí)驗(yàn)室的空氣中病原微生物的檢測(cè)與健康安全

、、、

環(huán)境保護(hù)密切相關(guān)病原微生物可通過(guò)生物氣溶膠在空氣中傳播從而引起傳染病的流行空氣中病原

。。

微生物的準(zhǔn)確鑒別對(duì)于傳染病預(yù)防與控制以及環(huán)境的監(jiān)測(cè)與保護(hù)具有重要的意義由于空氣中病原

,。

微生物具有譜系多樣性物種復(fù)雜性較快的變異性等特點(diǎn)使得具有高通量快速準(zhǔn)確等特點(diǎn)的宏基

、、,、、

因組測(cè)序方法在空氣中病原微生物的鑒定中具有技術(shù)優(yōu)勢(shì)

。

針對(duì)空氣中病原微生物宏基因組測(cè)序鑒定方法標(biāo)準(zhǔn)化的需求本文件對(duì)空氣中重要病原微生物的

,

檢測(cè)及鑒定方法在空氣微生物氣溶膠采樣前處理方法文庫(kù)制備測(cè)序數(shù)據(jù)結(jié)果分析等關(guān)鍵環(huán)節(jié)進(jìn)

,、、、、

行了規(guī)定滿足空氣病原微生物宏基因組測(cè)序方法的規(guī)范使用以提升我國(guó)在病原微生物監(jiān)測(cè)上的

,,

能力

。

Ⅳ

GB/T43628—2023

空氣中病原微生物宏基因組測(cè)序鑒定方法

1范圍

本文件規(guī)定了空氣中病原微生物宏基因組測(cè)序鑒定方法的試驗(yàn)條件試驗(yàn)步驟質(zhì)量控制及鑒定

、、。

本文件適用于空氣中細(xì)菌真菌病毒等病原微生物的宏基因組測(cè)序鑒定及監(jiān)測(cè)

、、。

2規(guī)范性引用文件

下列文件中的內(nèi)容通過(guò)文中的規(guī)范性引用而構(gòu)成本文件必不可少的條款其中注日期的引用文

。,

件僅該日期對(duì)應(yīng)的版本適用于本文件不注日期的引用文件其最新版本包括所有的修改單適用于

,;,()

本文件

。

分析實(shí)驗(yàn)室用水規(guī)格和試驗(yàn)方法

GB/T6682

公共場(chǎng)所衛(wèi)生檢驗(yàn)方法第部分空氣微生物

GB/T18204.33:

實(shí)驗(yàn)室生物安全通用要求

GB19489

高通量基因測(cè)序技術(shù)規(guī)程

GB/T30989

顆粒生物氣溶膠采樣器技術(shù)條件

GB/T39990

核酸樣本質(zhì)量評(píng)價(jià)方法

GB/T40974

生物安全柜

GB41918

病原微生物實(shí)驗(yàn)室生物安全標(biāo)識(shí)

WS589

3術(shù)語(yǔ)和定義

下列術(shù)語(yǔ)和定義適用于本文件

。

31

.

病原微生物pathogenicmicroorganism

侵入生物體引起感染甚至傳染病的微生物包括細(xì)菌真菌病毒等

,、、。

32

.

宏基因組metagenome

特定環(huán)境中全部微生物遺傳物質(zhì)的總和包含了可培養(yǎng)的和不可培養(yǎng)的微生物