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附件1:廣東省人民醫(yī)院高性能計(jì)算系統(tǒng)I期建設(shè)需求一、項(xiàng)目概述廣東省人民醫(yī)院(廣東省醫(yī)學(xué)科學(xué)院)創(chuàng)建于1946年,下轄2個(gè)分院、6個(gè)門診部和6個(gè)研究所,托管2家醫(yī)院,綜合實(shí)力名列國(guó)內(nèi)前茅,病人來源覆蓋國(guó)內(nèi)外,深受廣大群眾信賴。2008年,廣東省醫(yī)學(xué)科學(xué)院恢復(fù)掛牌,與廣東省人民醫(yī)院合署辦公。2014年,與華南理工大學(xué)簽約合作共建華南理工大學(xué)醫(yī)學(xué)院、華南理工大學(xué)生命科學(xué)研究院和華南理工大學(xué)第一臨床學(xué)院。醫(yī)院整體科研實(shí)力雄厚,標(biāo)志性科研項(xiàng)目成績(jī)斐然?!笆濉币詠?,獲得國(guó)家科技進(jìn)步二等獎(jiǎng)1項(xiàng)、省科學(xué)技術(shù)獎(jiǎng)17項(xiàng)(其中一等獎(jiǎng)2項(xiàng))、中華醫(yī)學(xué)科技獎(jiǎng)一等獎(jiǎng)1項(xiàng)、授權(quán)專利130項(xiàng),承擔(dān)國(guó)家和省級(jí)科研項(xiàng)目627項(xiàng),獲得國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃重點(diǎn)專項(xiàng)5項(xiàng)、課題18項(xiàng),發(fā)表SCI論文1447篇,總IF值5235.213。擁有4所廣東省重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,2006年起承擔(dān)臨床試驗(yàn)項(xiàng)目818項(xiàng),2018年新獲科研項(xiàng)目資助總額達(dá)6882.5萬(wàn)元。根據(jù)廣東省人民醫(yī)院的規(guī)劃藍(lán)圖,作為廣東省高等醫(yī)學(xué)院校教學(xué)醫(yī)院,承擔(dān)了華南理工大學(xué)、南方醫(yī)科大學(xué)、中山大學(xué)、汕頭大學(xué)等多所院校理論教學(xué)和實(shí)習(xí)帶教任務(wù),并結(jié)合生物信息綜合分析平臺(tái)、健康醫(yī)療大數(shù)據(jù)技術(shù)平臺(tái)、院內(nèi)科學(xué)大數(shù)據(jù)管理與研究相關(guān)的系統(tǒng)生物醫(yī)學(xué)等建設(shè)需高性能計(jì)算平臺(tái)的需求,醫(yī)院擬建設(shè)一套生物信息綜合分析平臺(tái)、臨床大數(shù)據(jù)系統(tǒng)和系統(tǒng)生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)系統(tǒng),系統(tǒng)平臺(tái)包括高性能計(jì)算機(jī)系統(tǒng)及配套應(yīng)用軟件的安裝調(diào)試。整體參照《信息安全技術(shù)網(wǎng)絡(luò)安全等級(jí)保護(hù)基本要求》(GB/T22239-2019)的“第三級(jí)安全要求”相關(guān)標(biāo)準(zhǔn),機(jī)房基礎(chǔ)設(shè)施主要參照《電子信息系統(tǒng)機(jī)房設(shè)計(jì)規(guī)范》GB50714-2017中劃分的B級(jí)機(jī)房的規(guī)范要求設(shè)計(jì)。如果醫(yī)院已有符合監(jiān)管要求的網(wǎng)絡(luò)、安全和機(jī)房,可以重用、擴(kuò)容或整合。建設(shè)完畢后,面向省醫(yī)大數(shù)據(jù)相關(guān)的科研開放共享。二、項(xiàng)目原則本系統(tǒng)要求具備高性能、可擴(kuò)展、高可靠、易管理,以支持今后不斷更新和升級(jí)的需要。要求系統(tǒng)解決方案的設(shè)計(jì)主要遵循以下設(shè)計(jì)原則:(1)先進(jìn)性和成熟性充分采用符合國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)的、先進(jìn)并且成熟的計(jì)算機(jī)系統(tǒng)、存儲(chǔ)系統(tǒng)、以及操作系統(tǒng)等先進(jìn)技術(shù)和產(chǎn)品。先進(jìn)是指技術(shù)領(lǐng)先期長(zhǎng),在醫(yī)學(xué)科研和應(yīng)用領(lǐng)域國(guó)內(nèi)外技術(shù)市場(chǎng)領(lǐng)先;成熟是指產(chǎn)品線豐富完整、經(jīng)過實(shí)踐檢驗(yàn)、價(jià)格合理。這里所講的先進(jìn)性是為了能夠運(yùn)用當(dāng)今國(guó)內(nèi)、國(guó)際上最先進(jìn)成熟的計(jì)算機(jī)軟硬件技術(shù),使新建立的系統(tǒng)和采用的技術(shù)達(dá)到當(dāng)代國(guó)際較先進(jìn)水平,同時(shí)要兼顧實(shí)用性,避免盲目追求高精配置。(2)互聯(lián)性和開放性計(jì)算機(jī)系統(tǒng)選用開放式系統(tǒng),具有多平臺(tái)多系統(tǒng)的互聯(lián)支持能力,以滿足多類型用戶開發(fā)和使用的要求。(3)高可靠性、高可用性、高可維護(hù)性高性能計(jì)算系統(tǒng)要求7×24小時(shí)的持續(xù)服務(wù)能力,因此在方案設(shè)計(jì)時(shí),首先應(yīng)考慮選用穩(wěn)定可靠的產(chǎn)品和技術(shù),使其具有優(yōu)秀的RAS特性和必要的冗余容錯(cuò)能力,為用戶提供高可用服務(wù)。要求系統(tǒng)在硬件配置、操作系統(tǒng)、以及系統(tǒng)管理等環(huán)節(jié)采取嚴(yán)格的安全可靠性措施,保證系統(tǒng)的正常運(yùn)轉(zhuǎn)。(4)可縮放性和可擴(kuò)展性系統(tǒng)不但要能滿足現(xiàn)階段的業(yè)務(wù)要求,而且要能滿足將來業(yè)務(wù)的增長(zhǎng)和新技術(shù)發(fā)展的要求,要在原有設(shè)備繼續(xù)發(fā)揮作用的基礎(chǔ)上,保證用戶能方便地增加或調(diào)整設(shè)備,改善系統(tǒng)功能和性能,支持將來系統(tǒng)不斷更新和便于升級(jí)。系統(tǒng)結(jié)構(gòu)應(yīng)能支持主要的協(xié)議、標(biāo)準(zhǔn)和規(guī)范,應(yīng)能運(yùn)行當(dāng)今流行的軟件環(huán)境下開發(fā)的各種應(yīng)用系統(tǒng)并可以在線軟件升級(jí)、調(diào)配;同時(shí)應(yīng)留有充分的擴(kuò)展余地,并保證系統(tǒng)的完整性不受影響,保證系統(tǒng)可以平滑升級(jí)、擴(kuò)容。(5)可管理性系統(tǒng)具有完善的管理措施和功能,便于設(shè)備的安裝、配置和維護(hù),以及對(duì)各種軟硬件資源的分配、調(diào)度和管理,提高資源和資產(chǎn)利用率,減輕系統(tǒng)管理人員的工作負(fù)擔(dān)。三、總體要求(1)供應(yīng)商應(yīng)按照系統(tǒng)要求同時(shí)提供所需硬件配置明細(xì)表、系統(tǒng)軟件及應(yīng)用軟件明細(xì)表、應(yīng)有的配件明細(xì)表、線纜等。對(duì)于需求文件中未列出但系統(tǒng)正常運(yùn)行又必需的各類部件以及軟件等,供應(yīng)商必須補(bǔ)齊并將有關(guān)價(jià)格含入用戶需求書的價(jià)格中,否則將視為免費(fèi)提供。(2)供應(yīng)商所交付的硬件產(chǎn)品,其所有部件必須都是原廠原裝部件,而且產(chǎn)品應(yīng)是交付前最新生產(chǎn)且未被使用過的全新產(chǎn)品,同時(shí)必須具有在中國(guó)境內(nèi)的合法使用權(quán)。(3)本用戶需求書中列出了采購(gòu)人可以接受的最小的技術(shù)指標(biāo)。供應(yīng)商英推薦的每一品目的軟硬件設(shè)備必須在速度、容量、性能等方面不低于表中所列的各項(xiàng)指標(biāo)。(4)供應(yīng)商人所提供的設(shè)備應(yīng)符合下列工作環(huán)境準(zhǔn)則:能夠在下列條件下運(yùn)行環(huán)境溫度:+10℃-+35℃操作時(shí):20%-80%非操作時(shí):20%-80%電源:220V單相,或380V三相;50/60Hz(5)供應(yīng)商必須承諾所有硬件產(chǎn)品提供原廠商不少于三年的免費(fèi)保修服務(wù)。(6)供應(yīng)商必須承諾簽訂合同前提供所投產(chǎn)品廠商合同期內(nèi)、合同期滿后同類型產(chǎn)品價(jià)格均不可高于本次采購(gòu)價(jià)格的承諾函。(7)對(duì)硬件系統(tǒng)進(jìn)行調(diào)試,包括服務(wù)器節(jié)點(diǎn)、以太網(wǎng)絡(luò)、并行存儲(chǔ)系統(tǒng)等;確認(rèn)硬件系統(tǒng)工作正常,網(wǎng)絡(luò)通訊正常。(8)供應(yīng)商需提供承諾函,承諾在三年維保期內(nèi)無(wú)條件配合醫(yī)院內(nèi)在生物信息綜合分析平臺(tái)、臨床大數(shù)據(jù)系統(tǒng)和系統(tǒng)生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)系統(tǒng)安裝、調(diào)試新增加的軟件。負(fù)責(zé)用戶需求文件中列出的所有應(yīng)用軟件進(jìn)行安裝、調(diào)優(yōu)。對(duì)集群管理軟件系統(tǒng)進(jìn)行安裝調(diào)試,確認(rèn)軟件正常工作,軟件系統(tǒng)包括集群軟件系統(tǒng)、操作系統(tǒng)、并行環(huán)境、編譯器、數(shù)學(xué)庫(kù)等。軟件技術(shù)支持,原廠軟件系統(tǒng)3年技術(shù)支持服務(wù),軟件升級(jí)服務(wù)。(9)供應(yīng)商必須承諾免費(fèi)為用戶開設(shè)不少于10小時(shí)容器調(diào)度和軟件集成方面的線上培訓(xùn)課程,并且針對(duì)不同應(yīng)用軟件定制GPU調(diào)度模板;免費(fèi)為用戶開設(shè)不少于15學(xué)時(shí)的AI、GPU調(diào)度的線上培訓(xùn)課程,提供詳實(shí)的培訓(xùn)方案。(10)整體群集計(jì)算性能不低于110TFlops,存儲(chǔ)可用空間不低于2PB(11)整體拓?fù)浼軜?gòu)如下圖:四、采購(gòu)清單采購(gòu)設(shè)備及數(shù)量序號(hào)名稱配置描述數(shù)量1刀片機(jī)箱不低于以下參數(shù):機(jī)箱高度不低于2U;全模塊化設(shè)計(jì);節(jié)點(diǎn)在機(jī)箱前部安裝,支持節(jié)點(diǎn)前維護(hù);IO/散熱/電源與節(jié)點(diǎn)完全解耦式設(shè)計(jì),與節(jié)點(diǎn)分離安裝;網(wǎng)卡:配置4個(gè)管理端口;服務(wù):三年原廠4小時(shí)免費(fèi)上門保修(配件+人力)。102高性能計(jì)算刀片計(jì)算節(jié)點(diǎn)每節(jié)點(diǎn)不低于以下參數(shù):CPU:2*IntelXeonGold6230N20C125W2.3GHz處理器或同等性能以上;內(nèi)存:12*16GDDR42933MHzRDIMM,采用六通道配置;硬盤:2*960GB企業(yè)級(jí)2.5寸SSD盤;IB卡:MellanoxConnectX-41x100GbE/EDRIBQSFP28VPI適配器;網(wǎng)卡:10Gb2SFP+端口管理模塊:企業(yè)版;保修:三年原廠4小時(shí)免費(fèi)上門保修(配件+人力)。403高性能計(jì)算大內(nèi)存計(jì)算節(jié)點(diǎn)每節(jié)點(diǎn)不低于以下參數(shù):CPU:4*IntelXeonGold6230N20C2.3GHz150W處理或同等性能以上;內(nèi)存:2TBDDR42933MHzRDIMM;硬盤:2*960GB企業(yè)級(jí)2.5寸SSD盤;IB卡:MellanoxConnectX-41x100GbE/EDRIBQSFP28VPI適配器;網(wǎng)卡:10Gb2個(gè)SFP+端口;管理模塊:企業(yè)版;保修:三年原廠4小時(shí)免費(fèi)上門保修(配件+人力)。34高性能計(jì)算管理登錄服務(wù)器節(jié)點(diǎn)每節(jié)點(diǎn)不低于以下參數(shù):CPU:2*IntelXeonGold6230N20C2.3GHz處理器或同等性能以上;內(nèi)存:12*16GDDR42933MHzRDIMM,采用六通道配置;硬盤:2*960GB企業(yè)級(jí)2.5寸SSD盤;陣列卡:配置RAID0/1/5帶2GB閃存PCIe12Gb適配器;IB卡:MellanoxConnectX-42x100GbE/EDRIBQSFP28VPI適配器;網(wǎng)卡:10Gb2個(gè)SFP+端口;管理模塊:企業(yè)版;保修:三年原廠4小時(shí)免費(fèi)上門保修(配件+人力)。25高性能計(jì)算GPU計(jì)算節(jié)點(diǎn)每節(jié)點(diǎn)不低于以下參數(shù):CPU:2*IntelXeonGold6230R26C2.1GHz處理器或同等性能以上;內(nèi)存:12*32GDDR42933MHzRDIMM,采用六通道配置;硬盤:2*960GB企業(yè)級(jí)2.5寸SSD盤;IB卡:MellanoxConnectX-41x100GbE/EDRIBQSFP28VPI適配器;GPU卡:2*NVIDIATeslaV10032GBPCIe被動(dòng)式GPU網(wǎng)卡:10Gb2個(gè)SFP+端口;管理模塊:企業(yè)版;保修:三年原廠4小時(shí)免費(fèi)上門保修(配件+人力)。146高性能計(jì)算GPU計(jì)算集群整體要求:高性能分布式多機(jī)多GPU集群,集群節(jié)點(diǎn)服務(wù)器數(shù)量不低于2臺(tái)。每節(jié)點(diǎn)不低于以下參數(shù):CPU:2*IntelXeonGold6230R26C2.1GHz處理器或同等性能以上;內(nèi)存:12*32GDDR42933MHzRDIMM,采用六通道配置;硬盤:2*960GB企業(yè)級(jí)2.5寸SSD盤;IB卡:MellanoxConnectX-41x100GbE/EDRIBQSFP28VPI適配器;GPU卡:4*NVIDIATeslaV10032GBPCIe被動(dòng)式GPU網(wǎng)卡:10Gb2個(gè)SFP+端口;管理模塊:企業(yè)版;保修:三年原廠4小時(shí)免費(fèi)上門保修(配件+人力)。17高性能存儲(chǔ)及并行文件系統(tǒng)整體要求:高性能分布式存儲(chǔ),包含3300TB裸容量計(jì)IO讀寫性能超過20GB/s)??捎么鎯?chǔ)不低于2PB。每節(jié)點(diǎn)不低于以下參數(shù):CPU:2*IntelXeonGold624018C150W2.6GHz;內(nèi)存:12*16GBDDR42933MHzRDIMM;系統(tǒng)盤:2*300GB10KSAS12Gb熱插拔;存儲(chǔ)硬盤:418*8TB7.2KNL-SAS;陣列卡:配置RAID0/1/5陣列卡帶2GB閃存PCIe12Gb適配器;IB卡:2*MellanoxConnectX-5EDRIBVPIDual-portx16PCIe3.0HCA;網(wǎng)卡:1Gb2個(gè)電口端口;電源:2*1100W白金級(jí)熱插拔電源;軟件:滿足所投標(biāo)數(shù)量的商用版本的并行文件系統(tǒng),非開源,并可提供原廠技術(shù)支持服務(wù)。;保修:三年原廠4小時(shí)免費(fèi)上門保修(配件+人力)。18計(jì)算網(wǎng)絡(luò)交換機(jī)不低于以下參數(shù):端口:36PortEDR100Gb/sInfiniband智能交換機(jī);線纜:25條3米MellanoxEDRIBQSFP28銅纜,4條10米MellanoxEDRIBQSFP28主動(dòng)光纜;保修:三年原廠4小時(shí)免費(fèi)上門保修(配件+人力)。39管理網(wǎng)絡(luò)交換機(jī)整體要求不低于以下參數(shù):知名品牌千兆交換機(jī)4臺(tái),萬(wàn)兆交換機(jī)2臺(tái),核心交換機(jī)根據(jù)組網(wǎng)需求,同時(shí)支持1G管理網(wǎng)和10G數(shù)據(jù)網(wǎng),不低于以下參數(shù):千兆交換機(jī):端口:48Port1Gb,帶4個(gè)10Gb上行端口;萬(wàn)兆交換機(jī):48Port10Gb萬(wàn)兆交換機(jī);線纜配置:56條5mOM3LC-LC光纖,200條3米CAT6雙絞線;保修:三年原廠4小時(shí)免費(fèi)上門保修(配件+人力)。110萬(wàn)兆下一代防火墻每節(jié)點(diǎn)不低于以下參數(shù):高度:標(biāo)準(zhǔn)2U;接口:8個(gè)10/1000MBase-TX和4個(gè)SFP接口,4個(gè)SFP+萬(wàn)兆接口,2個(gè)擴(kuò)展槽位;支持IPSecVPN和SSLVPN模塊:200個(gè)并發(fā)用戶;性能:最大整機(jī)吞吐:40Gbps;每秒新建連接數(shù):18萬(wàn);最大并發(fā)連接數(shù):1000萬(wàn);服務(wù):三年原廠4小時(shí)免費(fèi)上門保修(配件+人力)。211機(jī)柜套件每套件不低于以下參數(shù):機(jī)柜規(guī)格:42U機(jī)柜;PDU:≥2組24口防浪涌pdu電源;保修:三年原廠4小時(shí)免費(fèi)上門保修(配件+人力)。1012KVM1U機(jī)架式;≥24個(gè)RJ-45接口的端口;支持刀片服務(wù)器;支持PS/2、USB、SunLegacy及串口(RS-232)連接;本地控制端支持USB鍵盤與鼠標(biāo);支持跨平臺(tái)服務(wù)器環(huán)境;支持級(jí)聯(lián)113高性能集群管理軟件商業(yè)版集群管理軟件,License覆蓋計(jì)算系統(tǒng)所有服務(wù)器商業(yè)版提供軟件著作權(quán)登記證書及供應(yīng)商承擔(dān)全部知識(shí)產(chǎn)權(quán)糾紛的承諾函;提供集群部署、集群管理、集群監(jiān)控、告警處理、作業(yè)調(diào)度及管理、集群報(bào)表等功能??梢粋€(gè)或多個(gè)軟件實(shí)現(xiàn)。114集群編譯環(huán)境IntelC/C++/Fortran,MKL,TBB,IPP、Advisor、Inspector、Vtune、MPI、Tracetool115編譯器Intel?ParallelStudioXEClusterEditionforLinux,commercialedition116融合計(jì)算云平臺(tái)管理軟件下一代的云計(jì)算IaaS云平臺(tái),管理包括計(jì)算、存儲(chǔ)和網(wǎng)絡(luò)在內(nèi)的數(shù)據(jù)中心的各種資源。117免疫組學(xué)、全基因組學(xué)等基于特征分析需要的生命科學(xué)相關(guān)的應(yīng)用軟件詳見五、產(chǎn)品規(guī)格參數(shù)(二)軟件平臺(tái)2.免疫組學(xué)、全基因組學(xué)等基于特征分析需要的生命科學(xué)相關(guān)的應(yīng)用軟件及其衍生版本8718集成及技術(shù)服務(wù)提供平臺(tái)集成、調(diào)優(yōu)及原廠專家培訓(xùn)服務(wù)1五、產(chǎn)品規(guī)格參數(shù)(一)硬件參數(shù)1、刀片機(jī)箱技術(shù)要求設(shè)備名稱指標(biāo)項(xiàng)技術(shù)規(guī)格要求刀片機(jī)箱品牌國(guó)際知名品牌刀片機(jī)箱全模塊化設(shè)計(jì),模塊化設(shè)計(jì),各主要組件不停電維護(hù)。計(jì)算刀片和IO獨(dú)立維護(hù)??晒芾砗途S護(hù)性配置獨(dú)立的熱插拔刀箱管理模塊,擁有4個(gè)管理端口。對(duì)刀箱內(nèi)部刀片統(tǒng)一管理,包括:節(jié)點(diǎn)狀態(tài)、刀箱電源風(fēng)扇的狀態(tài)、電源及風(fēng)扇管理、日志管理等功能。IPMI2.0接口SNMPv3.0RESTRedfishHTML5,無(wú)需獨(dú)立Java/activex客戶端。多個(gè)刀箱管理模塊串聯(lián)(≥7個(gè)串聯(lián)),通過單一管理界面統(tǒng)一管理。電源配置N+N冗余白金級(jí)熱插拔電源,電源輸出功率≥2000W。風(fēng)扇配置冗余系統(tǒng)風(fēng)扇配件配置滑軌套件服務(wù)3年7*24小時(shí)保修服務(wù),4小時(shí)上門服務(wù)。2、高性能計(jì)算刀片計(jì)算節(jié)點(diǎn)服務(wù)器技術(shù)要求設(shè)備名稱指標(biāo)項(xiàng)技術(shù)規(guī)格要求計(jì)算節(jié)點(diǎn)服務(wù)器品牌國(guó)際知名品牌,與GPU節(jié)點(diǎn)服務(wù)器為同一品牌。處理器類型配置兩個(gè)Intel至強(qiáng)處理器主頻≥2.3GHz且單個(gè)Intel至強(qiáng)處理器≥20核,L3緩存≥27MB,125W處理器或以上(SPECCFP2017Rate≥200),可選最大可支持至28核205W處理器。性能要求提供采用節(jié)點(diǎn)機(jī)型基于所投處理器型號(hào)配置時(shí)SPECCFP2017Rate浮點(diǎn)測(cè)試性能不低于200,要求提供測(cè)試結(jié)果鏈接證明,不接受估算/推算結(jié)果。內(nèi)存配置數(shù)目配置≥12*16GBDDR42933MHzRDIMM。內(nèi)存擴(kuò)展能力最大支持?jǐn)U展≥16個(gè)內(nèi)存插槽,滿足未來擴(kuò)展性需求。內(nèi)置硬盤容量及數(shù)目配置≥2塊2.5英寸960GBSSD硬盤,支持?jǐn)U展至6個(gè)2.5英寸SAS/SSD,滿足未來擴(kuò)展性需求。M.2支持支持M.2SSD系統(tǒng)啟動(dòng),支持RAID1。陣列控制器支持獨(dú)立12GbSAS/SATARaid卡,支持Raid0/1/10/5/50。I/O擴(kuò)展支持≥2個(gè)PCIe3.0x8設(shè)備?;颉?個(gè)PCIe3.0x16設(shè)備。
可維護(hù)性可不開箱維護(hù)PCIE設(shè)備。IB卡≥1個(gè)MellanoxEDR100GbInfiniBand適配器。網(wǎng)卡配置≥10GbSFP+2端口可信平臺(tái)模塊配置符合中國(guó)國(guó)家可信計(jì)算標(biāo)準(zhǔn)的可信計(jì)算密碼模塊??晒芾砗途S護(hù)性1)通過瀏覽器訪問帶外管理界面,可以收集和查看硬件資產(chǎn)信息、系統(tǒng)日志和診斷信息,監(jiān)控服務(wù)器系統(tǒng)運(yùn)行狀態(tài)、健康情況和性能信息,實(shí)時(shí)監(jiān)控服務(wù)器用電情況,監(jiān)控捕捉操作系統(tǒng)掛起時(shí)的視頻顯示內(nèi)容,設(shè)置事件日志轉(zhuǎn)發(fā)和自動(dòng)通報(bào)。符合CIM、IPMIv2.0、SNMPv3、DCMIv1.5、Redfish標(biāo)準(zhǔn)的RESTAPI。2)帶內(nèi)和帶外方式配置服務(wù)器設(shè)置和更新系統(tǒng)/適配器固件,圖形化BIOS/UEFI配置、RAID配置等,并可以將BIOS/UEFI配置信息和RAID配置信息等保持到USB或網(wǎng)絡(luò)文件,并復(fù)制到其它服務(wù)器。3)顯示實(shí)時(shí)和歷史服務(wù)器用電數(shù)據(jù)和溫度圖形,顯示系統(tǒng)資源利用率歷史記錄;基于HTML5的遠(yuǎn)程控制臺(tái)和遠(yuǎn)程控制,無(wú)需Java和ActiveX插件。服務(wù)3年7*24小時(shí)保修服務(wù),4小時(shí)上門服務(wù)。環(huán)境認(rèn)證產(chǎn)品通過中國(guó)環(huán)境標(biāo)志產(chǎn)品認(rèn)證,要求提供證書掃描件供查證。廠商資質(zhì)產(chǎn)品原廠商具備ISO14001環(huán)境管理體系認(rèn)證和ISO9001質(zhì)量管理體系認(rèn)證證書,要求提供證書。產(chǎn)品原廠商服務(wù)體系通過信息技術(shù)服務(wù)管理體系。ISO/IEC20000認(rèn)證和信息安全管理體系。ISO/IEC27001認(rèn)證,要求提供證書掃描件供查證。3、高性能計(jì)算大內(nèi)存計(jì)算節(jié)點(diǎn)服務(wù)器技術(shù)要求設(shè)備名稱指標(biāo)項(xiàng)技術(shù)規(guī)格要求大內(nèi)存計(jì)算節(jié)點(diǎn)服務(wù)器品牌國(guó)際知名品牌,與GPU節(jié)點(diǎn)服務(wù)器為同一品牌。芯片組IntelC624芯片組或以上,支持Intel至強(qiáng)可擴(kuò)展處理器家族銅牌、銀牌、金牌及鉑金處理器產(chǎn)品。處理器類型配置四個(gè)Intel至強(qiáng)處理器主頻≥2.3Hz且單個(gè)Intel至強(qiáng)處理器≥20核,L3緩存≥27MB,125W(以SPECCFP2017Rate≥400),可選最大可支持至28核205W處理器。性能要求提供采用節(jié)點(diǎn)機(jī)型基于所投處理器型號(hào)配置時(shí)SPECCFP2017Rate浮點(diǎn)測(cè)試性能不低于400,要求提供測(cè)試結(jié)果鏈接證明,不接受估算/推算結(jié)果。內(nèi)存配置數(shù)目≥2TBDDR42933MHzRDIMM,最大支持9TB內(nèi)存擴(kuò)展或最大支持48根內(nèi)存插槽。內(nèi)存擴(kuò)展能力實(shí)配≥48條內(nèi)存插槽。硬盤要求2塊960GB熱插拔2.5寸SSD硬盤,最大支持16個(gè)硬盤擴(kuò)展,支持前置直連U.2NVMeSSD硬盤。支持內(nèi)置兩個(gè)M.2且支持RAID0/1可切換SAS/SATA/U.2硬盤不用更換背板。陣列卡配置12Gb陣列卡配1GB閃存,支持0/1/10/5/50RAID級(jí)別,可選RAID6/60,最大支持4GB閃存。網(wǎng)卡配置≥10GbSFP+2端口IB卡≥1個(gè)MellanoxConnectX-41x100GbE/EDRIBQSFP28VPI適配器電源實(shí)配電源2個(gè)80+鉑金電源,1+1熱插拔冗余電源。支持240V高壓直流。冷卻系統(tǒng)6個(gè)冗余熱插拔系統(tǒng)風(fēng)扇。I/O擴(kuò)展最大支持8個(gè)PCIe插槽,包括一個(gè)內(nèi)置陣列卡專用插槽,六個(gè)標(biāo)準(zhǔn)PCIe插槽,與一個(gè)LOM專用插槽。USB接口提供前置USB口或其他端口可連接手機(jī)管理服務(wù)器。工作溫度支持工作溫度最高支持0-45攝氏度,并提供國(guó)家級(jí)認(rèn)證機(jī)構(gòu)相關(guān)證明材料。高可用滿足平均無(wú)故障時(shí)間MTBF的m1值≥150000小時(shí),并提供國(guó)家級(jí)認(rèn)證機(jī)構(gòu)相關(guān)證明材料故障定位針對(duì)處理器,內(nèi)存,內(nèi)部存儲(chǔ),風(fēng)扇,電源,陣列卡等關(guān)鍵部件的故障預(yù)報(bào)警機(jī)制。針對(duì)處理器,內(nèi)存插槽,風(fēng)扇,電源,CPU板的LED故障報(bào)警指示燈可選的手機(jī)故障診斷面板。服務(wù)3年7*24小時(shí)保修服務(wù),4小時(shí)上門服務(wù)。4、高性能計(jì)算管理登錄服務(wù)器節(jié)點(diǎn)服技術(shù)要求設(shè)備名稱指標(biāo)項(xiàng)技術(shù)規(guī)格要求登錄/管理節(jié)點(diǎn)服務(wù)器品牌國(guó)際知名品牌,要求與GPU節(jié)點(diǎn)服務(wù)器為同一品牌芯片組IntelC624芯片組或以上,支持Intel至強(qiáng)可擴(kuò)展處理器家族銅牌、銀牌、金牌及鉑金處理器產(chǎn)品。處理器類型配置兩個(gè)Intel至強(qiáng)處理器主頻≥2.3Hz且單個(gè)Intel至強(qiáng)處理器≥20核,L3緩存≥27MB,125W處理器或以上(以SPECCFP2017Rate≥200),可選最大可支持至28核205W處理器性能要求提供采用節(jié)點(diǎn)機(jī)型基于所投處理器型號(hào)配置時(shí)SPECCFP2017Rate浮點(diǎn)測(cè)試性能不低于200,要求提供測(cè)試結(jié)果鏈接證明,不接受估算/推算結(jié)果。內(nèi)存配置數(shù)目配置≥12*16GBDDR42933MHzRDIMM,最大支持9TB內(nèi)存擴(kuò)展或最大支持24根內(nèi)存插槽。內(nèi)存擴(kuò)展能力實(shí)配≥24條內(nèi)存插槽。硬盤要求配置≥2塊2.5英寸960GBSSD硬盤,最大支持26個(gè)硬盤擴(kuò)展,支持前置直連U.2NVMeSSD硬盤。支持內(nèi)置兩個(gè)M.2且支持RAID0/1??汕袚QSAS/SATA/U.2硬盤不用更換背板。陣列卡配置12Gb陣列卡配1GB閃存,0/1/10/5/50RAID級(jí)別,可選RAID6/60,最大支持4GB閃存。網(wǎng)卡配置≥10GbSFP+2端口。IB卡≥1個(gè)MellanoxConnectX-42x100GbE/EDRIBQSFP28VPI適配器。電源實(shí)配電源2個(gè)80+鉑金電源,1+1熱插拔冗余電源。支持240V高壓直流。冷卻系統(tǒng)支持6個(gè)冗余熱插拔系統(tǒng)風(fēng)扇。I/O擴(kuò)展最大支持8個(gè)PCIe插槽,包括一個(gè)內(nèi)置陣列卡專用插槽,六個(gè)標(biāo)準(zhǔn)PCIe插槽,與一個(gè)LOM專用插槽。USB接口提供前置USB口可連接手機(jī)管理服務(wù)器。工作溫度支持工作溫度最高支持0-45攝氏度,并提供國(guó)家級(jí)認(rèn)證機(jī)構(gòu)相關(guān)證明材料高可用滿足平均無(wú)故障時(shí)間MTBF的m1值≥150000小時(shí),并提供國(guó)家級(jí)認(rèn)證機(jī)構(gòu)相關(guān)證明材料故障定位針對(duì)處理器,內(nèi)存,內(nèi)部存儲(chǔ),風(fēng)扇,電源,陣列卡等關(guān)鍵部件的故障預(yù)報(bào)警機(jī)制。針對(duì)處理器,內(nèi)存插槽,風(fēng)扇,電源,CPU板的LED故障報(bào)警指示燈可選的手機(jī)故障診斷面板。服務(wù)3年7*24小時(shí)保修服務(wù),4小時(shí)上門服務(wù)。5、高性能計(jì)算GPU計(jì)算節(jié)點(diǎn)服務(wù)器技術(shù)要求設(shè)備名稱指標(biāo)項(xiàng)技術(shù)規(guī)格要求GPU計(jì)算節(jié)點(diǎn)服務(wù)器品牌國(guó)際知名品牌,要求節(jié)點(diǎn)服務(wù)器為同一品牌芯片組IntelC624芯片組或以上,支持Intel至強(qiáng)可擴(kuò)展處理器家族銅牌、銀牌、金牌及鉑金處理器產(chǎn)品。處理器類型配置兩個(gè)Intel至強(qiáng)可擴(kuò)展處理器主頻≥2.1GHz且單個(gè)Intel至強(qiáng)處理器≥26核,L3緩存≥35MB,150W,,可選最大可支持至28核205W處理器。內(nèi)存配置數(shù)目≥12*32GBDDR42933MHzRDIMM,最大支持9TB內(nèi)存擴(kuò)展或最大支持24根內(nèi)存插槽。內(nèi)存擴(kuò)展能力實(shí)配≥24條內(nèi)存插槽。硬盤要求2塊960GB熱插拔2.5寸SSD硬盤,最大支持26個(gè)硬盤擴(kuò)展,支持前置直連U.2NVMeSSD硬盤。支持內(nèi)置兩個(gè)M.2且支持RAID0/1??汕袚QSAS/SATA/U.2硬盤不用更換背板。陣列卡配置12Gb陣列卡配1GB閃存,支持0/1/10/5/50RAID級(jí)別,可選RAID6/60,最大支持4GB閃存。網(wǎng)卡配置10GbSFP+2端口。GPU≥2個(gè)NVIDIATeslaV100S32GBPCIe被動(dòng)式GPU。Ib卡≥1個(gè)MellanoxConnectX-41x100GbE/EDRIBQSFP28VPI適配器。電源實(shí)配電源80+鉑金電源,1+1熱插拔冗余電源。支持240V高壓直流。冷卻系統(tǒng)6個(gè)冗余熱插拔系統(tǒng)風(fēng)扇。I/O擴(kuò)展最大支持8個(gè)PCIe插槽,包括一個(gè)內(nèi)置陣列卡專用插槽,六個(gè)標(biāo)準(zhǔn)PCIe插槽,與一個(gè)LOM專用插槽。USB接口提供前置USB口可連接手機(jī)管理服務(wù)器。工作溫度支持工作溫度最高支持0-45攝氏度,并提供國(guó)家級(jí)認(rèn)證機(jī)構(gòu)相關(guān)證明材料高可用滿足平均無(wú)故障時(shí)間MTBF的m1值≥150000小時(shí),并提供國(guó)家級(jí)認(rèn)證機(jī)構(gòu)相關(guān)證明材料故障定位針對(duì)處理器,內(nèi)存,內(nèi)部存儲(chǔ),風(fēng)扇,電源,陣列卡等關(guān)鍵部件的故障預(yù)報(bào)警機(jī)制。針對(duì)處理器,內(nèi)存插槽,風(fēng)扇,電源,CPU板的LED故障報(bào)警指示燈可選的手機(jī)故障診斷面板。服務(wù)3年7*24小時(shí)保修服務(wù),4小時(shí)上門服務(wù)。6、高性能計(jì)算GPU計(jì)算集群技術(shù)要求設(shè)備名稱指標(biāo)項(xiàng)技術(shù)規(guī)格要求高性能計(jì)算GPU計(jì)算集群品牌國(guó)際知名品牌,要求節(jié)點(diǎn)服務(wù)器為同一品牌體系結(jié)構(gòu)集中式或分布式多機(jī)多GPU計(jì)算、存儲(chǔ),全冗余架構(gòu),任意一個(gè)服務(wù)器的故障不影響整個(gè)系統(tǒng)的使用,無(wú)硬件單點(diǎn)故障。高性能計(jì)算GPU計(jì)算集群節(jié)點(diǎn)服務(wù)器數(shù)≥2臺(tái)。每個(gè)高性能計(jì)算GPU計(jì)算集群節(jié)點(diǎn)配置:≥2個(gè)Intel至強(qiáng)CPU,每個(gè)CPU的核必須≥26核心,主頻≥2.1GHz,L3緩存≥35MB,≥384GBDDR4內(nèi)存,≥2塊960GB熱插拔2.5寸SSD硬盤,≥4個(gè)NVIDIATeslaV100S32GBPCIe被動(dòng)式GPU。芯片組IntelC624芯片組或以上,支持Intel至強(qiáng)可擴(kuò)展處理器家族銅牌、銀牌、金牌及鉑金處理器產(chǎn)品。處理器類型配置兩個(gè)Intel至強(qiáng)可擴(kuò)展處理器主頻≥2.1GHz且單個(gè)Intel至強(qiáng)處理器≥26核,L3緩存≥35MB,150W,處理器或以上,可選最大可支持至28核205W處理器。內(nèi)存配置數(shù)目≥12*32GBDDR42933MHzRDIMM,最大支持9TB內(nèi)存擴(kuò)展或最大支持24根內(nèi)存插槽。擴(kuò)展性節(jié)點(diǎn)可平滑在線橫向擴(kuò)展、縮減或遷移。硬盤要求2塊960GB熱插拔2.5寸SSD硬盤,最大支持8個(gè)硬盤擴(kuò)展,支持前置直連U.2NVMeSSD硬盤。支持內(nèi)置兩個(gè)M.2且支持RAID0/1。可切換SAS/SATA/U.2硬盤不用更換背板。支持硬盤類型支持SSD、NL-SAS硬盤,支持SSD和NL-SAS硬盤混插。陣列卡配置12Gb陣列卡配1GB閃存,支持0/1/10/5/50RAID級(jí)別,可選RAID6/60,最大支持4GB閃存。網(wǎng)卡配置10GbSFP+2端口。GPU≥4個(gè)NVIDIATeslaV100S32GBPCIe被動(dòng)式GPU。Ib卡≥1個(gè)MellanoxConnectX-41x100GbE/EDRIBQSFP28VPI適配器。電源實(shí)配電源2個(gè)80+鉑金電源,1+1熱插拔冗余電源。支持240V高壓直流。冷卻系統(tǒng)支持6個(gè)冗余熱插拔系統(tǒng)風(fēng)扇。I/O擴(kuò)展最大支持8個(gè)PCIe插槽,包括一個(gè)內(nèi)置陣列卡專用插槽,六個(gè)標(biāo)準(zhǔn)PCIe插槽,與一個(gè)LOM專用插槽。USB接口提供前置USB口等其他接口可連接手機(jī)管理服務(wù)器。工作溫度支持工作溫度最高支持0-45攝氏度,并提供國(guó)家級(jí)認(rèn)證機(jī)構(gòu)相關(guān)證明材料高可用滿足平均無(wú)故障時(shí)間MTBF的m1值≥150000小時(shí),并提供國(guó)家級(jí)認(rèn)證機(jī)構(gòu)相關(guān)證明材料故障定位針對(duì)處理器,內(nèi)存,內(nèi)部存儲(chǔ),風(fēng)扇,電源,陣列卡等關(guān)鍵部件的故障預(yù)報(bào)警機(jī)制。針對(duì)處理器,內(nèi)存插槽,風(fēng)扇,電源,CPU板的LED故障報(bào)警指示燈可選的手機(jī)故障診斷面板。服務(wù)3年7*24小時(shí)保修服務(wù),4小時(shí)上門服務(wù)。7、高性能存儲(chǔ)及并行文件系統(tǒng)技術(shù)要求設(shè)備名稱指標(biāo)項(xiàng)技術(shù)規(guī)格要求高性能存儲(chǔ)及并行文件系統(tǒng)品牌國(guó)際知名品牌,要求節(jié)點(diǎn)服務(wù)器為同一品牌體系結(jié)構(gòu)集中式或分布式存儲(chǔ),全冗余架構(gòu),存儲(chǔ)節(jié)點(diǎn)無(wú)主從差異,任意一個(gè)服務(wù)器的故障不影響整個(gè)系統(tǒng)的使用,無(wú)硬件單點(diǎn)故障。每個(gè)存儲(chǔ)控制器配置:≥2個(gè)Intel至強(qiáng)CPU,每個(gè)CPU須≥18核心,主頻≥2.6GHz或以上處理器?!?92GBDDR4內(nèi)存,≥2*300G10K2.5系統(tǒng)盤。擴(kuò)展性存儲(chǔ)系統(tǒng)可平滑在線橫向擴(kuò)展、縮減或遷移。存儲(chǔ)容量當(dāng)前配置≥418個(gè)硬盤,單盤容量≥8TB,裸容量不低于3.3PB,要求使用企業(yè)級(jí)NL-SAS硬盤??捎么鎯?chǔ)容量不低于2PB。支持硬盤類型支持SSD、NL-SAS硬盤,支持SSD和NL-SAS硬盤混插。前端主機(jī)端口支持10Gb、56GbFDRIB、100GbEDRIB等接口。后端數(shù)據(jù)連接采用12GbSAS或IB連接存儲(chǔ)磁盤柜,需采用冗余鏈路,避免單點(diǎn)故障。總體性能指標(biāo)單存儲(chǔ)節(jié)點(diǎn)實(shí)測(cè)輸出讀/寫帶寬:≥20GB/s(測(cè)試工具:采用IOZONE,寫入文件需≥所有測(cè)試節(jié)點(diǎn)和存儲(chǔ)節(jié)點(diǎn)內(nèi)存總和的2倍。)要求提供相關(guān)證明材料。性能要求采用IOZONE,供應(yīng)商所投存儲(chǔ)設(shè)備的測(cè)試性能如果達(dá)不到用戶需求要求,須承諾無(wú)條件免費(fèi)提供足夠的相同型號(hào)的存儲(chǔ)和硬盤,直至達(dá)到用戶需求要求的讀/寫性能。數(shù)據(jù)保護(hù)方式支持RAID6或相當(dāng)?shù)臄?shù)據(jù)保護(hù)模式,支持副本數(shù)據(jù)保護(hù)方式。數(shù)據(jù)恢復(fù)支持磁盤故障快速恢復(fù),當(dāng)前配置下10TB硬數(shù)據(jù)重建時(shí)間≤10個(gè)小時(shí)磁盤監(jiān)控自動(dòng)監(jiān)控磁盤性能狀態(tài),探測(cè)到磁盤部件性能下降影響存儲(chǔ)性能時(shí),應(yīng)自動(dòng)提前替換(從系統(tǒng)全局熱備盤)。多站點(diǎn)支持支持遠(yuǎn)程多存儲(chǔ)集群災(zāi)難恢復(fù),具備災(zāi)備功能。數(shù)據(jù)條帶范圍64KB到16MB。可管理性基于B/S架構(gòu)的web統(tǒng)一圖行管理界面。數(shù)據(jù)快照現(xiàn)有配置下,最大snapshot配置數(shù)量≥256個(gè)。數(shù)據(jù)分層支持SSD緩存、支持?jǐn)?shù)據(jù)自動(dòng)分層,可設(shè)置靈活策略,在不同存儲(chǔ)層間進(jìn)行數(shù)據(jù)移動(dòng)。數(shù)據(jù)壓縮支持在線自動(dòng)壓縮。數(shù)據(jù)遷移支持信息生命周期管理,可根據(jù)策略自動(dòng)遷移或備份數(shù)據(jù)。遠(yuǎn)程同步支持和遠(yuǎn)程存儲(chǔ)系統(tǒng)主動(dòng)數(shù)據(jù)同步。QoS支持IO的QoS。I/O協(xié)議支持多種I/O協(xié)議:POSIX、NFSv4、SMBv3.0、支持OpenStackCinder(block方式)、OpenStackSwift(object方式)、S3(object方式)。并行文件系統(tǒng)配置主流成熟的商業(yè)并行文件系統(tǒng),并提供所有服務(wù)器端和客戶端使用授權(quán)??蛻舳酥С种С衷腖inux、windows客戶端。文件系統(tǒng)功能提供客戶端數(shù)據(jù)緩存與預(yù)讀功能:支持在客戶端內(nèi)存中記錄最近的I/O,減少訪問磁盤的次數(shù)。支持客戶端SSD緩存。支持海量小文件讀寫,每個(gè)文件系統(tǒng)最多2的63次方個(gè)文件。服務(wù)3年7*24小時(shí)保修服務(wù),4小時(shí)上門服務(wù)。8、計(jì)算網(wǎng)絡(luò)交換機(jī)技術(shù)要求設(shè)備名稱指標(biāo)項(xiàng)技術(shù)規(guī)格要求Infiniband交換機(jī)品牌國(guó)際知名品牌技術(shù)要求1U高度;≥36個(gè)100Gb/sinfinibandEDR端口??偼掏铝俊?Tb/s,端口間延遲≤90s。交換機(jī)內(nèi)置子網(wǎng)管理器。采用冗余電源,冗余風(fēng)扇。線纜配置≥25條3米MellanoxEDRIBQSFP28銅纜,配置≥4條10米MellanoxEDRIBQSFP28主動(dòng)光纜服務(wù):三年原廠4小時(shí)免費(fèi)上門保修(配件+人力)。9、管理網(wǎng)絡(luò)交換機(jī)技術(shù)要求設(shè)備名稱指標(biāo)項(xiàng)技術(shù)規(guī)格要求千兆以太網(wǎng)交換機(jī)品牌采用知名品牌交換機(jī)技術(shù)要求48個(gè)1Gb端口,4個(gè)上行萬(wàn)兆端口。性能要求交換容量≥432Gbps
轉(zhuǎn)發(fā)率≥144Mpps
MAC地址≥16K功能要求IPv4和IPv6的靜態(tài)路由、RIP/RIPng、OSPFv2/OSPFv3等三層路由協(xié)議線纜每臺(tái)交換機(jī)配置≥4條5m進(jìn)口原裝OM3LC-LC光纖
≥48條3米CAT6千兆網(wǎng)線滿足硬件管理網(wǎng)絡(luò)和系統(tǒng)管理網(wǎng)絡(luò)配置要求。服務(wù)三年原廠免費(fèi)上門保修(配件+人力)。萬(wàn)兆以太網(wǎng)交換機(jī)品牌采用知名品牌交換機(jī),與千兆以太網(wǎng)交換機(jī)為同一品牌技術(shù)要求48個(gè)10Gbps光端口交換機(jī)。性能要求交換容量≥3.2T轉(zhuǎn)發(fā)率≥1900Mpps功能要求冗余電源冗余散熱支持RIP,OSPF,BGP,RIPng,OSPFv3,BGP4+支持VRRP、VRRPV3、IPEvent、GR、IPFRR、NSR、DLDP、BFD線纜每臺(tái)交換機(jī)配置≥20條5m進(jìn)口原裝OM3LC-LC光纖服務(wù)三年原廠免費(fèi)上門保修(配件+人力)。10、防火墻技術(shù)要求設(shè)備名稱指標(biāo)項(xiàng)技術(shù)規(guī)格要求安全設(shè)備萬(wàn)兆下一代防火墻標(biāo)準(zhǔn)2U設(shè)備,冗余電源。配置≥8個(gè)10/1000MBase-TX,≥4個(gè)SFP接口,≥4個(gè)SFP+萬(wàn)兆接口,≥2個(gè)擴(kuò)展槽位。IPSecVPN和SSLVPN模塊(200個(gè)并發(fā)用戶)。性能:最大整機(jī)吞吐量:≥12Gbps;每秒新建連接數(shù):≥18萬(wàn);最大并發(fā)連接數(shù):≥1000萬(wàn)。服務(wù):三年原廠免費(fèi)上門保修(配件+人力)。11、機(jī)柜技術(shù)要求設(shè)備名稱指標(biāo)項(xiàng)技術(shù)規(guī)格要求機(jī)柜和電源插座具體要求要求黑色,前后都為網(wǎng)格≥2組24口防浪涌pdu電源。服務(wù):三年原廠免費(fèi)上門保修(配件+人力)。12、KVM技術(shù)要求設(shè)備名稱指標(biāo)項(xiàng)技術(shù)規(guī)格要求KVM切換器具體要求1U機(jī)架式;≥24個(gè)RJ-45接口的端口,滿配連接模塊;支持刀片服務(wù)器;支持PS/2、USB、SunLegacy及串口(RS-232)連接;本地控制端支持USB鍵盤與鼠標(biāo);支持跨平臺(tái)服務(wù)器環(huán)境;支持級(jí)聯(lián);服務(wù):三年原廠免費(fèi)上門保修(配件+人力)。(二)軟件平臺(tái)1、高性能計(jì)算系統(tǒng)基礎(chǔ)平臺(tái)軟件名稱名稱模塊功能描述要求操作系統(tǒng)操作系統(tǒng)市場(chǎng)主流的企業(yè)級(jí)Linus操作系統(tǒng),如CentOSLinus7高性能計(jì)算系統(tǒng)基礎(chǔ)平臺(tái)集群管理軟件軟件許可證數(shù)量商業(yè)版集群管理軟件,License覆蓋計(jì)算系統(tǒng)所有服務(wù)器??傮w要求提供軟件著作權(quán)登記證書及供應(yīng)商承擔(dān)全部知識(shí)產(chǎn)權(quán)糾紛的承諾函;提供B/S架構(gòu)的集群部署、集群管理、集群監(jiān)控、告警處理、作業(yè)調(diào)度及管理、集群報(bào)表等功能??梢粋€(gè)或多個(gè)軟件實(shí)現(xiàn)。集群管理1.用戶管理:支持通過Web頁(yè)面管理多種用戶角色,如系統(tǒng)管理員、運(yùn)維管理員、站點(diǎn)管理員、組管理員、普通用戶等,支持用戶權(quán)限配置管理;提供統(tǒng)一的WEB界面來管理集群系統(tǒng);根據(jù)不同的用戶角色權(quán)限展現(xiàn)不同的Web界面;支持自定義設(shè)置Web頁(yè)面展現(xiàn)內(nèi)容。2.監(jiān)控告警功能:針對(duì)高性能集群可分組管理和監(jiān)控不同的功能節(jié)點(diǎn)。在WEB頁(yè)面監(jiān)控節(jié)點(diǎn)的運(yùn)行關(guān)鍵狀態(tài)(如CPU,內(nèi)存使用率,網(wǎng)絡(luò),硬盤使用率,計(jì)算資源,存儲(chǔ)資源等)。并能針對(duì)監(jiān)控項(xiàng)自定義告警設(shè)置,包含溫度預(yù)警、計(jì)算超負(fù)荷預(yù)警、提供自動(dòng)化巡檢報(bào)告、系統(tǒng)體檢、系統(tǒng)運(yùn)行情況提醒等信息;軟件提供限額設(shè)置、區(qū)間設(shè)置等條件設(shè)置預(yù)警。須提供相關(guān)功能截圖以供驗(yàn)證。3.存儲(chǔ)管理:支持和NFS、S3、GPFS、Lustre、HDFS等文件系統(tǒng)無(wú)縫對(duì)接,提供Web頁(yè)面對(duì)文件系統(tǒng)初始化、文件目錄設(shè)置、磁盤配額設(shè)置、目錄配額設(shè)置。4.提供基于命令行的集群環(huán)境配置工具軟件,實(shí)現(xiàn)了整個(gè)所有節(jié)點(diǎn)的SSH/RSH無(wú)密碼訪問、網(wǎng)絡(luò)連通檢測(cè)、IPMI配置、NFS配置、停止系統(tǒng)無(wú)用服務(wù)、同步集群時(shí)間、同步集群用戶、同步文件。5.支持手機(jī)端APP客戶端或微信端,使用語(yǔ)音、短信以及照片等形式幫助用戶及時(shí)反映集群故障和問題。針對(duì)計(jì)算集群平臺(tái)軟硬件故障,最高可達(dá)到分鐘級(jí)響應(yīng),及時(shí)響應(yīng)和排除故障。須提供相關(guān)功能截圖以供驗(yàn)證。6.提供集群?jiǎn)栴}庫(kù)可找到同類問題解決方法,并且支持生成故障處理的結(jié)果和記錄報(bào)告,可統(tǒng)計(jì)集群軟硬件歷史故障和問題。與后臺(tái)集群無(wú)縫集成,給管理員形成一站式的集群硬件和軟件,監(jiān)控和報(bào)表的平臺(tái)。7.所有HPC軟件接口直接向用戶開放,用戶可以非常方便的要求定制或進(jìn)行二次開發(fā)。8.提供集群管理軟件著作證書。作業(yè)調(diào)度1.提供靈活的資源管理機(jī)制:可以通過自定義腳本實(shí)現(xiàn)外部資源的管理;可以定義節(jié)點(diǎn)間共享和非共享資源;管理自定制的靜態(tài)和動(dòng)態(tài)資源,用于調(diào)度系統(tǒng)的資源匹配,比如磁盤空間,操作系統(tǒng)類型等等;支持資源地圖映射配置,管理員可以配置各個(gè)節(jié)點(diǎn)的資源歸屬。2.支持基礎(chǔ)的調(diào)度策略在集群中共存:先進(jìn)先出,搶占,回填,支持CPU/內(nèi)存等多種資源的高級(jí)預(yù)約功能,絕對(duì)優(yōu)先級(jí),獨(dú)占等;可以配置隊(duì)列在不同時(shí)間段的不同策略和內(nèi)容。例如在工作時(shí)間和非工作時(shí)間采取不同的調(diào)度策略,以提高集群的效率。3.高級(jí)調(diào)度策略的支持:支持動(dòng)態(tài)優(yōu)先級(jí)調(diào)度,可以根據(jù)需要給不同影響因素定義不同的加權(quán)值,來決定用戶作業(yè)的動(dòng)態(tài)優(yōu)先級(jí)。因素包括CPU加權(quán)參數(shù),運(yùn)行時(shí)間加權(quán)參數(shù),用戶自定義加權(quán)調(diào)整參數(shù)等;根據(jù)用戶對(duì)資源的使用量,動(dòng)態(tài)調(diào)整用戶當(dāng)前作業(yè)啟動(dòng)和運(yùn)行順序。支持具有層次關(guān)系的份額控制。支持動(dòng)態(tài)的優(yōu)先級(jí)控制,系統(tǒng)會(huì)根據(jù)用戶使用資源的歷史和現(xiàn)狀對(duì)用戶的優(yōu)先級(jí)進(jìn)行排序來控制用戶使用資源。支持CPU綁定(processorbinding)調(diào)度,將作業(yè)按照BALANCE,PACK或CPU列表等方式將作業(yè)綁定到PROCESSOR上。支持脫離于隊(duì)列調(diào)度之外的全局調(diào)度策略配置,管理員可以配置全局的資源使用規(guī)則。支持基于網(wǎng)絡(luò)拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)的智能調(diào)度:并行作業(yè)按照BALANCE,EXCLISIVE或指定并行程序部署在空余資源最多或者最少的計(jì)算單元內(nèi),使得計(jì)算性能達(dá)到最優(yōu),防止資源浪費(fèi)。支持GPU的調(diào)度:用戶可以用過系統(tǒng)觀察GPU資源的使用狀態(tài)。應(yīng)用在通過LSF的調(diào)度策略被派發(fā)之后,再根據(jù)GPU的共享、獨(dú)占模式來使用GPU資源。4.支持自定義調(diào)度器和其它底層調(diào)度:用戶可以通過系統(tǒng)提供的API自定制調(diào)度器和調(diào)度策略。支持諸如SLURM,SGICPUSET,RMS等底層調(diào)度環(huán)境。作業(yè)控制和管理:1.作業(yè)運(yùn)行限制:管理員可對(duì)運(yùn)行作業(yè)的內(nèi)存大小、運(yùn)行時(shí)間、CPU時(shí)間等設(shè)置使用限制,可對(duì)不滿足要求的作業(yè)進(jìn)行中止或自動(dòng)重新調(diào)整優(yōu)先級(jí)。2.自定義作業(yè)控制:管理員可以通過定制的腳本對(duì)作業(yè)的屬主、申請(qǐng)的資源、提交的時(shí)間等進(jìn)行單個(gè)或多個(gè)指標(biāo)的同時(shí)控制,不符合要求,可自動(dòng)拒絕該作業(yè)。作業(yè)管理:管理員在WEB頁(yè)面或者命令行對(duì)作業(yè)按照項(xiàng)目名稱、用戶名(組)、機(jī)器名(組)、作業(yè)名、作業(yè)狀態(tài)等作業(yè)相關(guān)的信息進(jìn)行作業(yè)的查詢;對(duì)支持按照作業(yè)調(diào)度優(yōu)先級(jí)顯示作業(yè)排隊(duì)情況,方便用戶動(dòng)態(tài)掌握作業(yè)等待情況;對(duì)作業(yè)的控制可實(shí)現(xiàn)包括保留、釋放、掛起、恢復(fù)、重新運(yùn)行等操作。計(jì)算系統(tǒng)編譯器和并行環(huán)境編譯器和并行環(huán)境IntelClusterStudio軟件工具包,提供IntelC/C++/Fortran編譯器,IntelMKL高性能數(shù)學(xué)函數(shù)庫(kù),IntelMPI,MVAPICH,OpenMPI并行環(huán)境軟件等。高性能計(jì)算系統(tǒng)并行軟件系統(tǒng)基本要求提供商業(yè)版并行文件系統(tǒng),要求支持原生Linux、Windows客戶端,支持NFS、CIFS、HTTP、SWIFT、S3等協(xié)議。關(guān)鍵功能要求提供統(tǒng)一的命名空間。良好支持Windows、Linux系統(tǒng)的統(tǒng)一、混合數(shù)據(jù)存取訪問功能。具有Windows和Linux操作系統(tǒng)本地客戶端,不接受采用NFS、CIFS客戶端訪問方式。支持OPA、InfiniBand兩種網(wǎng)絡(luò)的RDMA通訊訪問,支持萬(wàn)兆以太網(wǎng)、千兆以太網(wǎng)等多種網(wǎng)絡(luò)的統(tǒng)一數(shù)據(jù)存取訪問功能;支持OPA、InfiniBand網(wǎng)絡(luò)和以太網(wǎng)同時(shí)數(shù)據(jù)存取訪問功能。具備良好的容錯(cuò)和恢復(fù)功能,支持元數(shù)據(jù)和目標(biāo)數(shù)據(jù)的多副本數(shù)據(jù)復(fù)制,提供方便的用戶管理和數(shù)據(jù)備份支持。在不停止服務(wù)的情況下,可支持存儲(chǔ)系統(tǒng)在線擴(kuò)充和縮小容量,支持動(dòng)態(tài)加入和移除磁盤,支持在線升級(jí)。支持元數(shù)據(jù)分布在所有I/O服務(wù)器管理。高速、低速存儲(chǔ)系統(tǒng)要求做到共用單一統(tǒng)一命名空間管理,對(duì)前端應(yīng)用透明,可以方便定制數(shù)據(jù)分層管理策略,必須提供如下自動(dòng)數(shù)據(jù)分層管理策略:用戶半年以上未訪問的數(shù)據(jù)自動(dòng)遷移到低速存儲(chǔ)系統(tǒng)用戶指定目錄或指定后綴的文件自動(dòng)遷移到低速存儲(chǔ)系統(tǒng)。過大(比如超過20GB)的用戶文件自動(dòng)壓縮。融合計(jì)算云平臺(tái)管理軟件總體要求本項(xiàng)目配置云計(jì)算軟件許可證數(shù)量滿足所投硬件數(shù)量,不限虛擬機(jī)實(shí)例數(shù)的軟件授權(quán),不接受OEM產(chǎn)品。品牌要求軟件原廠商為中國(guó)品牌,且具有《計(jì)算機(jī)軟件著作權(quán)登記證書》,需通過中國(guó)可信云開源解決方案認(rèn)證。須提供相關(guān)證書復(fù)印件。計(jì)算虛擬化要求提供物理機(jī)高可用功能,當(dāng)一臺(tái)宿主機(jī)發(fā)生故障時(shí),之上的虛擬機(jī)可以在集群之內(nèi)的其它宿主機(jī)上重新啟動(dòng),保障業(yè)務(wù)連續(xù)性。云平臺(tái)能夠采用Passthrough方式調(diào)度和使用NVIDIATeslaV100GPU加速卡。提供虛擬機(jī)在線遷移功能,實(shí)現(xiàn)虛擬機(jī)在不同宿主機(jī)之間遷移,保障業(yè)務(wù)連續(xù)性。支持計(jì)算節(jié)點(diǎn)的無(wú)限水平熱擴(kuò)展,可以按需擴(kuò)展單個(gè)或者多個(gè)計(jì)算節(jié)點(diǎn),在擴(kuò)展的同時(shí)不影響業(yè)務(wù)的正常運(yùn)行、不停機(jī)。提供虛擬機(jī)在線熱添加CPU,虛擬機(jī)不重啟。能夠按節(jié)點(diǎn)設(shè)置超售比,指定計(jì)算節(jié)點(diǎn)設(shè)置CPU和內(nèi)存超售比。提供批量部署虛擬機(jī)。提供在線更改虛擬機(jī)配置功能,包括虛擬機(jī)的CPU、內(nèi)存和磁盤。提供虛擬機(jī)組管理,并且可設(shè)置虛擬機(jī)組內(nèi)虛擬機(jī)是否開啟親和性配置。提供虛擬機(jī)異常狀態(tài)自動(dòng)重啟。虛擬機(jī)創(chuàng)建時(shí)可以注入用戶自定義腳本,實(shí)現(xiàn)用戶對(duì)虛擬機(jī)個(gè)性化配置。提供計(jì)算節(jié)點(diǎn)按組配置及管理,用戶可選擇指定計(jì)算節(jié)點(diǎn)組創(chuàng)建虛擬機(jī)。虛擬機(jī)創(chuàng)建時(shí)可以選擇多個(gè)虛擬網(wǎng)絡(luò)??梢詾樘摂M機(jī)配置多個(gè)安全組。提供安全組開啟和關(guān)閉配置功能。虛擬機(jī)創(chuàng)建可以指定私有網(wǎng)絡(luò)IP地址。虛擬機(jī)可以綁定指定公網(wǎng)IP地址。2、免疫組學(xué)、全基因組學(xué)等基于特征分析需要的生命科學(xué)相關(guān)的應(yīng)用軟件及其衍生版本序號(hào)軟件說明1Annovar用于對(duì)接異位點(diǎn)進(jìn)行基因功能等的相關(guān)注釋2apache-ant一個(gè)將軟件編譯、測(cè)試、部署等步驟聯(lián)系在一起的自動(dòng)化工具3BAMStats從BAM文件生成統(tǒng)計(jì)信息、合并多個(gè)示例、用于驗(yàn)證生成的統(tǒng)計(jì)信息文件的工具4Bamtools提供了一個(gè)快速、靈活的C++、API工具包,用于讀取、寫入和操作BAM文件5bcl2fastq是一款由illumina官方提供的將bcl文件轉(zhuǎn)化為fastq文件的文件轉(zhuǎn)換工具6bedtools處理基因組信息分析的強(qiáng)大工具集合7bedtools2-2.19.1處理基因組信息分析的強(qiáng)大工具集合8binaries一個(gè)二進(jìn)制包,里面包括了編譯好的可供直接使用的程序,只需把它解壓縮到你想要安裝的目錄即可使用9blasr第三代測(cè)序比對(duì)軟件10blast序列對(duì)比軟件11blat序列對(duì)比軟件12boostBoost庫(kù)由Boost社區(qū)組織開發(fā)、維護(hù),其目的是為C++程序員提供免費(fèi)、同行審查的、可移植的程序庫(kù)13bowtie短序列比對(duì)工具14Burrows-WheelerAligner(bwa)一款將序列比對(duì)到參考基因組上的軟件15Circos主要用于基因組序列相關(guān)數(shù)據(jù)的可視化,已應(yīng)用于多個(gè)領(lǐng)域,如影視作品中的人物關(guān)系分析,物流公司的訂單來源和流向分析等16clustalomega多序列比對(duì)排列工具17clustalw多序列比對(duì)排列工具18Cluster聚類分析、熱圖可視化的軟件19cmake-編譯工具20Config-General-2.56一款快速應(yīng)用軟件配置工具21COPE一種精確的基于k-mer的對(duì)端讀取連接工具,以促進(jìn)基因組組裝22Cpat轉(zhuǎn)錄本蛋白編碼能力預(yù)測(cè)軟件23cramtools-2.1一組Java和api工具,用于有效地壓縮序列讀取數(shù)據(jù)24cufflinks主要用于基因表達(dá)量的計(jì)算和差異表達(dá)基因的尋找25cutadapt-1.4.1是一款在一定容錯(cuò)率的情況下,對(duì)高通量測(cè)序的數(shù)據(jù)進(jìn)行識(shí)別/剪切/去除序列的軟件26Cytoscape一款網(wǎng)絡(luò)顯示和分析軟件。軟件的核心部分提供了網(wǎng)絡(luò)顯示、布局、查詢等方面的基本功能。27EigenstratEIGENSTRAT主要用于計(jì)算PCA顯著的主成分,并將主成分加入到協(xié)變量中,從而進(jìn)行相關(guān)分析的一款計(jì)算軟件28Emboss序列分析軟件包29fastq_screen_v0.4.2針對(duì)一組序列數(shù)據(jù)庫(kù)篩選FastQ格式的序列庫(kù)30fastQC用于高通量序列數(shù)據(jù)的質(zhì)量控制工具。31FASTX過濾不合格序列工具32fastx_toolkit過濾不合格序列工具33FLASH測(cè)序數(shù)據(jù)拼接工具34GenomeAnalysisToolkit(GATK)是用來處理高通量測(cè)序數(shù)據(jù)的一套軟件,主要注重于變異的查找、物種的數(shù)據(jù)分析35HISAT能夠?qū)NA-Seq的讀取與基因組進(jìn)行快速比對(duì)36HMMER用于搜索序列數(shù)據(jù)庫(kù)中的序列同源物,并進(jìn)行序列比對(duì)。37Homer用于Motif查找和二代數(shù)據(jù)分析的工具。38HtseqHTSeq是使用Python編寫的一支用于進(jìn)行基因Count表達(dá)量分析的軟件,能根據(jù)SAM/BAM比對(duì)結(jié)果文件和基因結(jié)構(gòu)注釋GTF文件得到基因水平的Counts表達(dá)量39IgBLAST一款專一的blast工具,主要用于比對(duì)抗體(immunoglobulin,IG)或T細(xì)胞受體(Tcellreceptor,TR)序列。40IGVTools最常用的NGS數(shù)據(jù)可視化工具41JAVA編譯語(yǔ)言42MACS注釋和可視化ChIP-seq結(jié)果43MACS2注釋和可視化ChIP-seq結(jié)果44MAFFT(Multiple
alignment
program
for
amino
acid
or
nucleotide
sequences)多重序列比對(duì)45miRDeep2用于新microRNA的預(yù)測(cè),以及microRNA的定量46MISO是一款經(jīng)典的可變剪切分析工具,與rmats類似,該軟件也支持對(duì)可變剪切事件進(jìn)行定量和差異分析47MUSCLE是一款蛋白質(zhì)水平多序列比對(duì)的軟件,在速度和精度上都優(yōu)于ClustalW。48MySQLserver數(shù)據(jù)庫(kù)軟件49ncbi-blast-2.2.28+是一款基本局部對(duì)齊搜索、序列相似性搜索工具50PAML利用DNA或Protein數(shù)據(jù)使用最大似然法進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育分析的軟件51Pandaseq雙端測(cè)序,用于涉及到兩端拼接的軟件52Pca是一種數(shù)學(xué)降維方法,利用正交變換(orthogonaltransformation)把一系列可能線性相關(guān)的變量轉(zhuǎn)換為一組線性不相關(guān)的新變量,也稱為主成分,從而利用新變量在更小的維度下展示數(shù)據(jù)的特征53PeakSplitter經(jīng)典的peak注釋軟件54Penncnv一個(gè)免費(fèi)的軟件工具,用于從SNP基因分型微陣列數(shù)據(jù)進(jìn)行拷貝數(shù)變異(CNV)檢測(cè)。目前,它可以處理來自Illumina和Affymetrix來源的數(shù)據(jù)55Perl編譯語(yǔ)言56PHP編譯語(yǔ)言57PHYLIP進(jìn)化樹分析、構(gòu)建進(jìn)化樹的軟件58Picard一個(gè)用來處理高通量測(cè)序(HTS)的數(shù)據(jù)和格式的Java命令行工具箱59Picard-tools一個(gè)用來處理高通量測(cè)序(HTS)的數(shù)據(jù)和格式的Java命令行工具箱60Pindel用于檢查結(jié)構(gòu)變異工具61pip-1.5.6Python包管理工具包62Plink運(yùn)算軟件,用于數(shù)據(jù)處理、質(zhì)量控制的基本統(tǒng)計(jì)、群體分層分析、單位點(diǎn)的基本關(guān)聯(lián)分析、家系數(shù)據(jù)的傳遞不平衡檢驗(yàn)、多點(diǎn)連鎖分析、單倍體關(guān)聯(lián)分析、拷貝數(shù)變異分析,以及Meta分析等等63Python編譯語(yǔ)言64RepeatMasker一款專門用于基因組重復(fù)序列識(shí)別注釋和分類統(tǒng)計(jì)的軟件,幾乎適用于所有物種。是研究基因組、非編碼RNA、轉(zhuǎn)座子和著絲粒領(lǐng)等相關(guān)領(lǐng)域的必備軟件65rMATS一款對(duì)RNA-Seq數(shù)據(jù)進(jìn)行差異可變剪切分析的軟件。66RNA-SeQC計(jì)算RNA-Seq數(shù)據(jù)并對(duì)質(zhì)量控制的計(jì)量學(xué)的java程序67Rstudioserver一個(gè)集成開發(fā)環(huán)境,需要調(diào)用R軟件68Rsyncserver一個(gè)非常靈活的命令行網(wǎng)絡(luò)同步工具69Samtools一個(gè)用于操作sam和bam文件的工具合集70SeqP
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