《生物信息學(xué)》課程教學(xué)大綱 2

“生物信息學(xué)”課程教學(xué)大綱英文名稱：IntroductiontoMedicalBioinformatics課程編碼：BASM3062學(xué)時：32（理論學(xué)時：16；實(shí)驗(yàn)學(xué)時：16）學(xué)分：1.5適用對象：XXX醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)班。先修課程：分子生物學(xué)、計(jì)算機(jī)網(wǎng)絡(luò)基礎(chǔ)使用教材及參考書：1.楚雍烈.醫(yī)用生物信息學(xué)概論.西安：陜西科學(xué)技術(shù)出版社，2005.2.DavidW.Mount.Bioinformatics:sequenceandgenomeanalysis.NewYork:ColdSpringHarborLaboratory.2004一、課程性質(zhì)和目的性質(zhì)：基礎(chǔ)理論目的：使學(xué)生了解生物信息學(xué)的基本理論知識和技術(shù)。掌握生物信息學(xué)網(wǎng)絡(luò)資源、數(shù)據(jù)庫和常用分析工具的使用。二、課程內(nèi)容簡介生物信息學(xué)是一門新興的交叉學(xué)科，是推動生物醫(yī)學(xué)發(fā)展的重要基礎(chǔ)，是面向宗濂實(shí)驗(yàn)班學(xué)生的選修課。本課程分理論教學(xué)和上機(jī)實(shí)習(xí)兩部分。理論教學(xué)從生物醫(yī)學(xué)研究的應(yīng)用角度出發(fā)，介紹生物信息學(xué)的產(chǎn)生基礎(chǔ)、基本概念、研究內(nèi)容，主要生物信息學(xué)網(wǎng)絡(luò)資源、生物信息學(xué)關(guān)鍵技術(shù)、生物大分子的分析方法和醫(yī)學(xué)研究中相關(guān)的生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫和分析工具。上機(jī)實(shí)習(xí)使學(xué)生實(shí)際操作應(yīng)用生物信息學(xué)網(wǎng)絡(luò)資源、數(shù)據(jù)庫和常用分析工具。三、教學(xué)基本要求1．要求學(xué)生掌握生物信息學(xué)的基本理論知識和基本概念，熟悉生物信息學(xué)的相關(guān)技術(shù)方法，特別是分子生物學(xué)中常用的關(guān)鍵技術(shù)及常用軟件。2．要求學(xué)生熟悉生物信息學(xué)的常用網(wǎng)絡(luò)資源，掌握生物信息學(xué)常用數(shù)據(jù)庫和分析工具的使用。四、教學(xué)內(nèi)容及安排第一章緒論掌握生物信息學(xué)和醫(yī)學(xué)信息學(xué)的概念和研究內(nèi)容熟悉生物信息學(xué)和醫(yī)學(xué)信息學(xué)的重要性了解信息學(xué)基礎(chǔ)、生物信息學(xué)和醫(yī)學(xué)信息學(xué)的產(chǎn)生和發(fā)展

教學(xué)安排及教學(xué)方式教學(xué)環(huán)節(jié)學(xué)時分配課后環(huán)節(jié)（請打“√”）章節(jié)數(shù)授課實(shí)驗(yàn)上機(jī)討論作業(yè)自學(xué)綜合大作業(yè)其他12

第二章生物大分子序列及結(jié)構(gòu)信息相關(guān)實(shí)驗(yàn)技術(shù)熟悉DNA，genome，mRNA，EST，cDNA，蛋白質(zhì)序列測定技術(shù)了解蛋白質(zhì)和核酸結(jié)構(gòu)分析技術(shù)教學(xué)安排及教學(xué)方式教學(xué)環(huán)節(jié)學(xué)時分配課后環(huán)節(jié)（請打“√”）章節(jié)數(shù)授課實(shí)驗(yàn)上機(jī)討論作業(yè)自學(xué)綜合大作業(yè)其他22

第三章生物信息學(xué)和醫(yī)學(xué)信息學(xué)的計(jì)算機(jī)、網(wǎng)絡(luò)基礎(chǔ)熟悉生物信息學(xué)和醫(yī)學(xué)信息學(xué)中的計(jì)算機(jī)基礎(chǔ)知識了解生物信息學(xué)和醫(yī)學(xué)信息學(xué)中的互聯(lián)網(wǎng)基礎(chǔ)知識、互聯(lián)網(wǎng)瀏覽和文件傳輸教學(xué)安排及教學(xué)方式教學(xué)環(huán)節(jié)學(xué)時分配課后環(huán)節(jié)（請打“√”）章節(jié)數(shù)授課實(shí)驗(yàn)上機(jī)討論作業(yè)自學(xué)綜合大作業(yè)其他322

第四章生物信息學(xué)和醫(yī)學(xué)信息學(xué)資源檢索工具熟悉生物信息學(xué)和醫(yī)學(xué)信息學(xué)的網(wǎng)絡(luò)資源來源及分類、文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫檢索了解生物信息學(xué)和醫(yī)學(xué)信息學(xué)資源的通用檢索工具、專業(yè)搜索引擎教學(xué)安排及教學(xué)方式教學(xué)環(huán)節(jié)學(xué)時分配課后環(huán)節(jié)（請打“√”）章節(jié)數(shù)授課實(shí)驗(yàn)上機(jī)討論作業(yè)自學(xué)綜合大作業(yè)其他422

第五章序列聯(lián)配（sequencealignment）熟悉序列聯(lián)配的概念、種類和目的了解序列聯(lián)配的算法教學(xué)安排及教學(xué)方式教學(xué)環(huán)節(jié)學(xué)時分配課后環(huán)節(jié)（請打“√”）章節(jié)數(shù)授課實(shí)驗(yàn)上機(jī)討論作業(yè)自學(xué)綜合大作業(yè)其他52第六章生物信息學(xué)中心和數(shù)據(jù)庫熟悉重要的生物信息學(xué)中心、主要數(shù)據(jù)庫、分析工具教學(xué)安排及教學(xué)方式教學(xué)環(huán)節(jié)學(xué)時分配課后環(huán)節(jié)（請打“√”）章節(jié)數(shù)授課實(shí)驗(yàn)上機(jī)討論作業(yè)自學(xué)綜合大作業(yè)其他624

第七章核酸的生物信息學(xué)分析熟悉序列同源性、系統(tǒng)發(fā)生樹分析、酶切位點(diǎn)及PCR引物設(shè)計(jì)了解RNA二級結(jié)構(gòu)、基因預(yù)測和表達(dá)調(diào)控分析教學(xué)安排及教學(xué)方式教學(xué)環(huán)節(jié)學(xué)時分配課后環(huán)節(jié)（請打“√”）章節(jié)數(shù)授課實(shí)驗(yàn)上機(jī)討論作業(yè)自學(xué)綜合大作業(yè)其他724

第八章蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能分析熟悉蛋白質(zhì)的序列分析、二級結(jié)構(gòu)與理化特性分析了解蛋白質(zhì)的高級結(jié)構(gòu)、功能預(yù)測、功能域的判定