計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)智慧樹知到期末考試答案2024年

計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)智慧樹知到期末考試答案2024年計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)同源模建的可行性在于：同源蛋白是由（）由同一祖先蛋白趨異進(jìn)化而產(chǎn)生的蛋白質(zhì)。

A:三個(gè)B:兩個(gè)或兩個(gè)以上C:零個(gè)D:一個(gè)答案:兩個(gè)或兩個(gè)以上同源模建的基本流程大致可分為6步。第一步是

A:構(gòu)建蛋白可變區(qū)B:蛋白結(jié)構(gòu)的評(píng)價(jià)C:構(gòu)建蛋白保守區(qū)D:同源蛋白的搜索答案:同源蛋白的搜索利用測(cè)試集驗(yàn)證藥效團(tuán)模型，主要的方法為

A:牛頓拉普森法B:偏最小二乘回歸（PLS回歸）C:排列組合法D:疊加法答案:偏最小二乘回歸（PLS回歸）分子對(duì)接分類中適合考察比較大的體系是

A:剛體對(duì)接B:半剛體對(duì)接C:柔性對(duì)接D:半柔性對(duì)接答案:剛體對(duì)接從頭預(yù)測(cè)法從理論上為理想的方法，它要求方法本身可以只根據(jù)（）來預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)的二級(jí)結(jié)構(gòu)和高級(jí)結(jié)構(gòu)，但是現(xiàn)在的所有方法還不能完全達(dá)到這個(gè)要求。

A:氨基酸的種類B:氨基酸的序列C:氨基酸殘基D:氨基酸的數(shù)目答案:氨基酸的種類蛋白結(jié)構(gòu)保守區(qū)是指在生物進(jìn)化或者一個(gè)蛋白家族中（），他們一般具有重要的功能。

A:具有不變或相同的結(jié)構(gòu)域B:可變的結(jié)構(gòu)域C:不同的結(jié)構(gòu)域D:單一的結(jié)構(gòu)域答案:具有不變或相同的結(jié)構(gòu)域同源模建其實(shí)屬于蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)技術(shù)的其中一個(gè)方法，另外還有從頭預(yù)測(cè)法和（）。

A:反向折疊法B:參比構(gòu)建法C:片段法D:特定構(gòu)型法答案:反向折疊法地西泮具有以下哪類結(jié)構(gòu)母核

A:丁酰苯類B:環(huán)丙二酰脲類C:苯并二氮卓類D:吩噻嗪類答案:苯并二氮卓類.以下哪一個(gè)藥物不屬于非甾體類抗炎藥物。

A:吲哚美辛B:布洛芬C:美洛昔康D:地塞米松答案:地塞米松序列比較時(shí)，兩個(gè)蛋白質(zhì)具有的性質(zhì)不包括

A:差異性B:一致性C:同源性D:相似性答案:差異性在得到初步的藥效團(tuán)模型后，對(duì)于這個(gè)初步模型，還需要依據(jù)受體-配體復(fù)合物的結(jié)構(gòu)，分析配體-受體相互作用關(guān)鍵位點(diǎn)，對(duì)藥效團(tuán)模型進(jìn)行

A:簡(jiǎn)化B:驗(yàn)證和優(yōu)化C:歸類D:拆分答案:驗(yàn)證和優(yōu)化藥效團(tuán)模型中，不同顏色的球代表不同的藥效特征元素，其中芳環(huán)中心的顏色是

A:紫色B:綠色C:紅色D:黃色答案:黃色氫鍵給體：氫鍵給體主要包括氫原子以及與之相連的氧原子和氮原子，以下屬于氫鍵給體的是

A:氨基酸B:二硫鍵C:非酸性羥基；氨基；但不包括三氟甲基磺酰胺和四唑中的次氨基D:巰基答案:非酸性羥基；氨基；但不包括三氟甲基磺酰胺和四唑中的次氨基實(shí)現(xiàn)藥效特征簡(jiǎn)化所采用的方法是

A:共軛梯度法B:聚類分析C:隨機(jī)搜索法D:模擬退火法答案:聚類分析分子對(duì)接方法的兩大課題是分子之間的空間識(shí)別和

A:片斷生長B:模擬退火C:能量識(shí)別D:格點(diǎn)計(jì)算答案:能量識(shí)別在配體和受體相互作用時(shí)，在配體的某些取代位置上存在某些原子或原子團(tuán)可能會(huì)和受體產(chǎn)生不利的原子碰撞，這些位置上的原子或原子團(tuán)占有的位置就構(gòu)成

A:電荷中心B:疏水中心C:靜電中心D:排斥體積答案:排斥體積計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)的應(yīng)用可以加快靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)的速度,

A:發(fā)現(xiàn)更多的靶點(diǎn)B:增加藥物的靶點(diǎn)C:提高靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)的準(zhǔn)確度D:提高靶點(diǎn)的包容度答案:提高靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)的準(zhǔn)確度同源建模模型評(píng)價(jià)的方法不包括（）

A:平面化學(xué)B:RMSDC:PROSA程序評(píng)價(jià)D:Veerify3D答案:平面化學(xué)藥效團(tuán)的構(gòu)建是基于訓(xùn)練集實(shí)施的，以下屬于藥效團(tuán)的構(gòu)建的方法的是

A:偏最小二乘法B:基于藥效團(tuán)模型的三維結(jié)構(gòu)搜尋方法和假想受點(diǎn)點(diǎn)陣C:反射法D:蒙特卡羅（MonteCarlo）方法答案:基于藥效團(tuán)模型的三維結(jié)構(gòu)搜尋方法和假想受點(diǎn)點(diǎn)陣在藥物和受體之間的識(shí)別中起重要作用的非鍵相互作用的主要有：

A:疏水場(chǎng)B:立體相互作用C:共價(jià)鍵D:包括離子-偶極作用在內(nèi)的靜電作用答案:共價(jià)鍵藥效團(tuán)的構(gòu)建是基于訓(xùn)練集實(shí)施的，以下哪些方法適用于藥效團(tuán)構(gòu)建

A:假想受點(diǎn)點(diǎn)陣B:活性類似物法C:距離幾何法D:基于藥效基團(tuán)模型的三維結(jié)構(gòu)搜尋方法答案:距離幾何法;假想受點(diǎn)點(diǎn)陣;活性類似物法;基于藥效基團(tuán)模型的三維結(jié)構(gòu)搜尋方法柔性對(duì)接的方法

A:遺傳算法和進(jìn)化規(guī)劃B:構(gòu)象的系綜方法C:片段的方法D:基于分子模擬的方法答案:構(gòu)象的系綜方法;片段的方法;遺傳算法和進(jìn)化規(guī)劃;基于分子模擬的方法分子對(duì)接的重要原則

A:特異性B:能量最低性C:互補(bǔ)性D:預(yù)組織性答案:互補(bǔ)性###預(yù)組織性目前計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)存在的問題

A:設(shè)計(jì)的分子能否進(jìn)行化學(xué)合成B:藥物體內(nèi)轉(zhuǎn)運(yùn)、代謝和體內(nèi)毒副作用問題C:受體-配體相互作用的方式問題D:蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)三維結(jié)構(gòu)的真實(shí)性和可用性問題答案:蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)三維結(jié)構(gòu)的真實(shí)性和可用性問題###受體-配體相互作用的方式問題###設(shè)計(jì)的分子能否進(jìn)行化學(xué)合成###藥物體內(nèi)轉(zhuǎn)運(yùn)、代謝和體內(nèi)毒副作用問題分子對(duì)接是基于受體結(jié)構(gòu)進(jìn)行的藥物設(shè)計(jì),其具體應(yīng)用有

A:研究配體-受體復(fù)合物的結(jié)合模式B:指導(dǎo)先導(dǎo)化合物的合成改造和優(yōu)化C:尋找和發(fā)現(xiàn)新的先導(dǎo)化合物D:預(yù)測(cè)受體-配體的結(jié)合能力答案:預(yù)測(cè)受體-配體的結(jié)合能力;研究配體-受體復(fù)合物的結(jié)合模式;指導(dǎo)先導(dǎo)化合物的合成改造和優(yōu)化;尋找和發(fā)現(xiàn)新的先導(dǎo)化合物下列哪些是QSAR常用的參數(shù)

A:疏水性參數(shù)B:指示變量C:電性參數(shù)D:立體參數(shù)答案:立體參數(shù);電性參數(shù);指示變量;疏水性參數(shù)蛋白與小分子的相互作用之一的靜電作用包括

A:離子-誘導(dǎo)偶極相互作用B:離子-偶極鍵C:離子鍵D:偶極-偶極相互作用答案:離子鍵###離子-偶極鍵###偶極-偶極相互作用###離子-誘導(dǎo)偶極相互作用在操作分子對(duì)接的過程中，活性位點(diǎn)的確定方法有：

A:基于配體生成B:基于能量計(jì)算生成C:自動(dòng)生成D:基于關(guān)鍵氨基酸殘基生成答案:自動(dòng)生成;基于配體生成;基于關(guān)鍵氨基酸殘基生成以下哪些屬于藥效團(tuán)模型評(píng)價(jià)參數(shù)

A:CDQB:FEATSC:SpecifityD:PARETO答案:Specifity###PARETO###FEATS主要應(yīng)用于loop及氨基酸側(cè)鏈建模的基于知識(shí)的蛋白質(zhì)的建模方法包括

A:匹配補(bǔ)充法B:空間限制滿足法C:基于片段裝配法D:艾迪莎法答案:空間限制滿足法內(nèi)部檢驗(yàn)的方法有

A:擬和相關(guān)系數(shù)B:交互檢驗(yàn)C:Y隨機(jī)D:sample法答案:擬和相關(guān)系數(shù);交互檢驗(yàn);Y隨機(jī);sample法下列屬于同源模建模型評(píng)價(jià)方法的有

A:碳骨架二面角B:PROSA程序評(píng)價(jià)C:SMDD:Veerify3D答案:PROSA程序評(píng)價(jià);Veerify3D;碳骨架二面角分子力學(xué)的能量最小化算法有哪些

A:共軛梯度法B:分子場(chǎng)分析法C:牛頓拉普森方法D:最速下降法答案:最速下降法###共軛梯度法###牛頓拉普森方法QSAR模型的內(nèi)部驗(yàn)證擬和相關(guān)系數(shù)包括

A:F檢驗(yàn)值B:P值C:相關(guān)系數(shù)（R）D:標(biāo)準(zhǔn)偏差（S）答案:相關(guān)系數(shù)(R)###標(biāo)準(zhǔn)偏差(S)###F檢驗(yàn)值定量構(gòu)效關(guān)系研究中，電場(chǎng)類型包括

A:靜電場(chǎng)B:疏水場(chǎng)C:氫鍵場(chǎng)D:立體場(chǎng)答案:立體場(chǎng)###靜電場(chǎng)###疏水場(chǎng)###氫鍵場(chǎng)對(duì)接方法尚需解決的問題

A:溶劑化效應(yīng)B:分子的柔性C:打分函數(shù)D:構(gòu)象選擇答案:溶劑化效應(yīng)###分子的柔性###打分函數(shù)QSAR模型的內(nèi)部驗(yàn)證交互檢驗(yàn)除了隨機(jī)模型檢驗(yàn)法，還有以下哪些方法

A:Leave-many(group)–out(LMO)B:Out-of-train(OOT)C:BootstrappingD:leave-one-out答案:leave-one-out;Leave-many(group)–out(LMO);Bootstrapping;Out-of-train(OOT)下列哪些是定量構(gòu)效關(guān)系CoMFA方法用到的參數(shù)

A:疏水性參數(shù)B:指示變量C:結(jié)構(gòu)參數(shù)D:立體參數(shù)E:電性參數(shù)答案:立體參數(shù)###結(jié)構(gòu)參數(shù)###指示變量###電性參數(shù)分子對(duì)接的基本步驟

A:計(jì)算復(fù)合物的結(jié)合能B:最佳受體－配體復(fù)合物構(gòu)象C:調(diào)整受體或配體的構(gòu)象D:確定活性位點(diǎn)答案:確定活性位點(diǎn);調(diào)整受體或配體的構(gòu)象;計(jì)算復(fù)合物的結(jié)合能;最佳受體－配體復(fù)合物構(gòu)象能使機(jī)體生理、生化功能加強(qiáng)的藥物作用稱為興奮，如腎上腺素對(duì)心肌收縮力的加強(qiáng)作用。

A:錯(cuò)B:對(duì)答案:對(duì)將保守突變的因素考慮在內(nèi)，就可以定義各種打分方案(scoringschemes))對(duì)兩序列的相似程度打分，所得分值即代表其相似的程度

A:正確B:錯(cuò)誤答案:正確蛋白質(zhì)的三級(jí)結(jié)構(gòu)依靠不同氨基酸之間的C=O和N-H基團(tuán)間的氫鍵形成的穩(wěn)定結(jié)構(gòu)，主要為α螺旋、β折疊β－轉(zhuǎn)角和無規(guī)卷曲。

A:錯(cuò)誤B:正確答案:錯(cuò)誤疏水相互作用是配體與受體相互識(shí)別的重要作用方式。

A:正確B:錯(cuò)誤答案:正確Y隨機(jī)檢驗(yàn)，將響應(yīng)值如生物活性隨機(jī)打亂順序，而保持描述符的順序不變，從而建立新的QSAR模型。

A:正確B:錯(cuò)誤答案:正確體內(nèi)能與受體特異性結(jié)合的物質(zhì)，稱為配體或配基

A:對(duì)B:錯(cuò)答案:對(duì)序列比對(duì)的統(tǒng)計(jì)學(xué)檢驗(yàn)是評(píng)價(jià)序列相似性的關(guān)鍵。

A:錯(cuò)B:對(duì)答案:對(duì)現(xiàn)代藥物發(fā)現(xiàn)也有其局限性，其研究對(duì)象為“藥物-疾病”關(guān)系而非“靶點(diǎn)-藥物”關(guān)系。

A:正確B:錯(cuò)誤答案:錯(cuò)誤SAMPLE法確定留一法的交叉驗(yàn)證r2是依據(jù)樣本距離偏最小二乘法

。

A:對(duì)B:錯(cuò)答案:對(duì)先導(dǎo)化合物是通過各種途徑、方法、手段獲得的具有某種藥理學(xué)或生物學(xué)活性的化合物。其不一定為實(shí)用的優(yōu)良藥物,可能因其藥效不強(qiáng)、特異性不高、毒性較大等而不能直接藥用,需要進(jìn)行結(jié)構(gòu)修飾和改造,使之成為實(shí)用的高效、低毒、可控的優(yōu)良藥物,這一過程稱為先導(dǎo)化合物的優(yōu)化.

A:對(duì)B:錯(cuò)答案:對(duì)最小抑菌濃度（MIC）指在體外培養(yǎng)細(xì)菌8~12小時(shí)后能一直培養(yǎng)基內(nèi)病原菌生長的最低藥物濃度。

A:錯(cuò)B:對(duì)答案:對(duì)多序列比對(duì)問題其實(shí)是雙序列比對(duì)問題的推廣。

A:對(duì)B:錯(cuò)答案:對(duì)同源模建第三步到第五步為序列比對(duì)、loop區(qū)和氨基酸側(cè)鏈。

A:錯(cuò)誤B:正確答案:錯(cuò)誤QSAR模型的外部驗(yàn)證環(huán)節(jié)中我們利用測(cè)試集進(jìn)行評(píng)價(jià)，測(cè)試集testset從研究的化合物中挑選出合理數(shù)量和結(jié)構(gòu)特征的樣本組成預(yù)測(cè)集，預(yù)測(cè)集中的樣本不參加模型的構(gòu)建。

A:對(duì)B:錯(cuò)答案:對(duì)Out-of-train（OOT法）和Bootstrapping的區(qū)別在于，在抽取M個(gè)化合物作為測(cè)試集后，OOT會(huì)隨機(jī)在N-M個(gè)化合物中選擇一些化合物進(jìn)行重復(fù)以保證訓(xùn)練集化合物數(shù)目保持不變，而不是用N-M個(gè)化合物直接建立QSAR模型并進(jìn)行活性預(yù)測(cè)。

A:對(duì)B:錯(cuò)答案:錯(cuò)CoMFA字段列中每個(gè)標(biāo)稱列可能代表數(shù)千個(gè)變量，字段中的每個(gè)格點(diǎn)對(duì)應(yīng)一個(gè)變量。

A:對(duì)B:錯(cuò)答案:對(duì)多序列比對(duì)能夠揭示雙序列比對(duì)所不能發(fā)現(xiàn)