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文檔簡介
石家或計算機職業(yè)學(xué)院
史物化學(xué)(理例M
系部:醫(yī)學(xué)系______________________
任課教師:________________________
教師職稱:餅師____________________
授課對象:_______7夕級護理專業(yè)_________________
課程學(xué)時:學(xué)______________________
學(xué)年學(xué)期:2019-2020一切第一學(xué)期_______________
第一!_次課學(xué)時2--
第一章緒論
授課題目(章,節(jié))
授課類型(請打J)理論課口研討課口習(xí)題課口復(fù)習(xí)課口其他口
教學(xué)目的:
使學(xué)生了解生物化學(xué)的發(fā)展史,掌握生物化學(xué)的定義、研究內(nèi)容及學(xué)習(xí)方法:理解生物化學(xué)與其他學(xué)科的關(guān)
系,認識學(xué)習(xí)生物化學(xué)的重要意義;了解生物化學(xué)知識在生活中的廣泛應(yīng)用,激發(fā)學(xué)生學(xué)習(xí)生物化學(xué)的興趣。
教學(xué)方法、手段:
板書、多媒體
教學(xué)重點、難點:
教學(xué)重點:生物化學(xué)發(fā)展簡史;生物化學(xué)研究的內(nèi)容。
教學(xué)難點:生物化學(xué)研究的內(nèi)容。
補充內(nèi)容和
教學(xué)內(nèi)容及過程設(shè)計
時間分配
一、新課導(dǎo)入
首先通過多媒體課件讓學(xué)生明白生物化學(xué)課時生命類學(xué)科的一門必修的專業(yè)基礎(chǔ)課,為之后(10分鐘)新
的學(xué)習(xí)打基礎(chǔ);學(xué)生物化學(xué)有意思、有用。很多生化的理論可以指導(dǎo)我們的生活,能實現(xiàn)很多個課導(dǎo)入
人愿望,舉例子說明等。學(xué)生了解之后興趣大增,再開始逐一講解。
二、講授新課
一、生物化學(xué)的概念與研究內(nèi)容
生物化學(xué)(Biochemistry)是用化學(xué)的原理和手段研究生命現(xiàn)象,并闡述因果關(guān)系的一門邊緣學(xué)科。
稱生物的化學(xué)(Biologicalchemistry)或生理的化學(xué)(physiologcalchemistry)。
生物化學(xué)的研究對象是生物體,包括植物、動物和微生物。
(1)生物體重要化學(xué)組分,尤其是糖、脂、蛋白質(zhì)和核酸生物大分子結(jié)構(gòu)、性質(zhì)和功能。
(2)生物體內(nèi)的物質(zhì)代謝、能量代謝及調(diào)節(jié)方式。
(3)生物體遺傳信息傳遞與表達。
(一)生物體重要化學(xué)組分,尤其是糖、脂、蛋白質(zhì)和核酸生物大分子結(jié)構(gòu)、性質(zhì)和功能
大量元素:C、H、O、N、P、S、Cl、Mg、K,Na、Ca(生物體組成的99%以上)。
微量元素:Fe、Cu、Zn、Mo、Mn、Co、Si、Se、I、Al、B等元素所組成。
這些元素通常又以碳為中心形成各種化合物,參與生物體的建成。(35分鐘)詳
碳氫化合物主要包括以下五種形式:細介紹生物
(1)氨基酸以及由其構(gòu)成的肽、蛋白質(zhì)?;瘜W(xué)研究的
(2)核甘酸、核酸。內(nèi)容,使學(xué)生
(3)糖類及其衍生物。從宏觀上認
(4)脂類及其衍生物。識生物化學(xué)。
(5)維生素、激素及其它小分子有機物。
其中,糖類、脂類、蛋白質(zhì)、核酸四類化合物只存在于生物體內(nèi),分子量也很大,因此這些化合物
大分子(Biologicalmacromolecue)<>
(-)生物體內(nèi)的物質(zhì)代謝、能量代謝及調(diào)節(jié)
生物體區(qū)別于非生命物體的一個最主要特征就是具有新陳代謝作用,即生物體與其外界環(huán)境之間不
和能量的交換過程。
同化作用
異化作用
這部分內(nèi)容主要包括:糖代謝、脂代謝、蛋白質(zhì)代謝和核酸代謝、生物氧化和代謝調(diào)節(jié)六章。
(三)生物體遺傳信息傳遞與表達
生物體區(qū)別于非生物物體的另一個重要特征就是具有自我復(fù)制的能力,即以自身為模板復(fù)制出與自
代的能力也即繁殖作用。本質(zhì)是遺傳信息在生物體親子代間的傳遞作用。
生物化學(xué)按其研究內(nèi)容的不同又可以劃分為:
靜態(tài)生物化學(xué)(有機生物化學(xué))
代謝生物化學(xué)(動態(tài)生物化學(xué))
功能生物化學(xué)(機能生物化學(xué))
(四)生命物質(zhì)的基本特征
生命是物質(zhì)的一種特殊存在形式,生命物質(zhì)具有一系列基本特征。
(1)生物體內(nèi)的化學(xué)反應(yīng)遵循普通物理化學(xué)規(guī)律。
(2)生物功能分子的結(jié)構(gòu)、理化性質(zhì)及功能之間具有明顯的相互依存關(guān)系。
(3)細胞是生命活動的基本結(jié)構(gòu)和功能單位,一切重要功能分子都有明確的細胞定位。
(4)生命是“一致性與差異性”的統(tǒng)一體
1)不同生物體內(nèi)的各類有機大分子均由相同的單體構(gòu)成。
2)不同生物體內(nèi)各類有機大分子的代謝均按照相同的方式進行。
3)所有生物體均以核酸為遺傳信息載體,并共用一套遺傳密碼。
二、生物化學(xué)發(fā)展簡史
生物化學(xué)和其他自然科學(xué)一樣,他的產(chǎn)生和發(fā)展主要是由生產(chǎn)實踐和科學(xué)研究的需要所決定。早期
展的動力主要來自于醫(yī)藥學(xué)及發(fā)酵業(yè)的興起。在西方,十七、十八世紀工業(yè)革命的興起對生物化學(xué)
著重大的推動作用。
生物化學(xué)作為一門科學(xué),他的發(fā)展大體上可以分成三個階段。
20世紀之前
20世紀初至50年代
20世紀50年代以后
20世紀之前,本時期是靜態(tài)生物化學(xué)迅速興起的時期,主要研究生物體的化學(xué)組成成分的種類、結(jié)
分布。整體上屬于描述性的,在此時期出現(xiàn)了許多奠基性的重要發(fā)現(xiàn)。(20分鐘)生
1770-1774年P(guān)riestely發(fā)現(xiàn)02,并證明動物消耗02,植物產(chǎn)生02。物化學(xué)的發(fā)
1776-1778年Scheele(舍勒)通過對許多天然藥物化學(xué)成分的分析,首次分離得到了乳酸、酒石酸展簡史,以及
尿酸、甘油等一系列天然有機物。生物化學(xué)學(xué)
1779-1796年Ingen-Housz證明綠色植物產(chǎn)生02需要光,并證明綠色植物可利用C02??瓢l(fā)展大記
1780-1789年Lavoisier(拉瓦錫),法國的一位生物化學(xué)家,第一次發(fā)現(xiàn)動物的呼吸作用本質(zhì)就是氧事。是學(xué)生產(chǎn)
和蠟燭的燃燒作用一樣,都是碳氫化合物的氧化反應(yīng),并首先認識到乙醇的形成是一系列化學(xué)反應(yīng)生濃厚興趣。
1854-1864年L.Pasteur證明發(fā)酵是由于微生物活動的結(jié)果,推翻了自生論。
1864年Hoppe-seyler結(jié)晶出第一種蛋白質(zhì)血紅蛋白。
1869年Miescher發(fā)現(xiàn)核酸。
1877年Hoppe-seyler首次提出Biochemie,譯成英語是Biochemistry或Biologicalchemistry將生理化
化學(xué),使生物化學(xué)從生理學(xué)中分離出來,成為一門獨立的學(xué)科。
Hoppe-seyler還首創(chuàng)Proteids譯成英語即Protein,他還創(chuàng)辦了世界上第一本生物化學(xué)方面的雜志《
志》。因此,Hoppe-seyler是生物化學(xué)的創(chuàng)始人之一。
20世紀初期至50年代該時期是新陳代謝過程研究的全盛時期,由于酶、激素、維生素等活性物質(zhì)
離提取,使生物化學(xué)家的研究興趣從此從靜態(tài)轉(zhuǎn)到到了動態(tài),導(dǎo)致了許多新的代謝過程的被發(fā)現(xiàn),
知的許多代謝過程都是在那個時期研究清楚的。
1905年,Knoop提出了脂肪酸的B-氧化。
1912年,Nuberg提出了生醇發(fā)酵的化學(xué)過程。
1933年,Embden-Myerhof證明糖酵解及發(fā)酵化學(xué)歷程中的關(guān)鍵性中間物。
1937-1940年,Kreb's提出了三竣酸循環(huán)的假設(shè)等。
20世紀50年代以后這個時期是生物大分子結(jié)構(gòu)與功能研究突飛猛進的時期,許多與此有關(guān)的重要
這個時期取得的。
1950年P(guān)auling和Corey在X-光衍射實驗的基礎(chǔ)上提出了蛋白質(zhì)的二級模型學(xué)說。
1953年Sanger完成了世界上第一個天然蛋白質(zhì)分子牛胰島素51個氨基酸序列的分析。
同年,Watson和Crick在M.H.F.WilkinsX-光衍射圖譜研究的基礎(chǔ)上提出了著名的DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)
此貢獻這三人分別獲得了1962年度的諾貝爾生理醫(yī)學(xué)獎
1960年,Kendrew獲得了高分辨率的鯨魚血紅蛋白結(jié)構(gòu)X-光衍射分析。
1961年,Jacob、Monod提出了操縱子學(xué)說,并假設(shè)了mRNA的功能,獲得1965年度的諾貝爾生理
1965年,Holly測定了酵母丙氨酸t(yī)RNA的一級結(jié)構(gòu),獲得了1968年度諾貝爾生理醫(yī)學(xué)獎。
1965年,我國首次在世界上用人工的方法合成了具有天然活性的結(jié)晶牛胰島。
1973年,使用0.18umX-光衍射分析法測定了牛胰島素的空間結(jié)構(gòu)。
1975年,DulbeccoTemin和Baltimore在勞氏肉瘤病毒中發(fā)現(xiàn)逆轉(zhuǎn)錄現(xiàn)象,共享諾貝爾生理醫(yī)學(xué)獎。
1980年,Sanger發(fā)明DNA雙脫氧測序法,與Gilbert和Berg共享諾貝爾生理醫(yī)學(xué)獎。
1981年,中國上海生物化學(xué)研究所的科學(xué)工作者人工全成了具有完全生物活性的酵母丙氨酸t(yī)RNA.
1989年,Altman和Cech由于發(fā)現(xiàn)某些RNA具有催化作用(核酶),獲諾貝爾化學(xué)獎。
1993年,Robert和Sharp由于發(fā)現(xiàn)斷裂基因,諾貝爾生理醫(yī)學(xué)獎。
Mullis因發(fā)明PCR儀與第一個設(shè)計基因突變的Smith共享諾貝爾化學(xué)獎。
1997年,Prusiner由于發(fā)現(xiàn)早老性癡呆癥的病因——骯病毒,諾貝爾生理醫(yī)學(xué)獎。
1990年10月:被譽為生命科學(xué)“阿波羅登月計劃''的人類基因組計劃(HumanGenomeProject,HGP)
目標是了解人類自身,操縱生命。
1998年5月,美國科學(xué)家建塞萊拉遺傳公司,目標是投入3億美元,到2001年繪制出完整的人體基因
國際人類基因組計劃展開競爭。
2000年6月26日,科學(xué)家公布人類基因組工作草圖。
2001年7月,國際人類基因組計劃的科學(xué)家和美國塞萊拉公司分別宣布將繪制人類基因變異圖譜。
1999年7月,中國科學(xué)院遺傳所人類基因組中心,在國際人類基因組HGSI注冊,承擔(dān)了其中1%,B
上3000萬個堿基的測序任務(wù),使我國成為繼美、英、德、日、法之后第六個參與該計劃的國家,也
展中國家。
2002年4月3日,中國科學(xué)家公布水稻基因組工作草圖,水稻基因組有4億3千萬個堿基對(約為人的基[
12對染色體,50,000個基因,我國科學(xué)工作者承擔(dān)測序的是4號染色體,36Mb(占8%)。
繼2001年,人類基因組計劃,小鼠、大鼠、水稻、擬南芥等模式生物基因組計劃的完成,生物學(xué)研究
因組時代。
比較基因組學(xué)(comparativegenomics)
功能基因組學(xué)(functionalgenomics)
蛋白質(zhì)組學(xué)(proteomics)
RNA組學(xué)(RNomics)
代謝組學(xué)(metabonomics)
三、生物化學(xué)與工農(nóng)業(yè)生產(chǎn)關(guān)系
(-)生物化學(xué)與工業(yè)生產(chǎn)的關(guān)系
發(fā)酵工業(yè)是利用微生物的生命活動,生產(chǎn)人類所需產(chǎn)品的工藝過程。由于原料的投入到產(chǎn)品的形成
制的條件下,通過微生物的新陳代謝來實現(xiàn)的。在工業(yè)發(fā)酵過程中,人們之所以能夠獲得多種多樣
鍵就是微生物代謝的多樣性、工藝條件的不同性,因此生物化學(xué)知識對發(fā)酵工業(yè)來講是非常重要,
業(yè)發(fā)酵機理、選擇合理工藝條件、指導(dǎo)微生物菌種的選育等都有重要意義。
(-)生物化學(xué)與農(nóng)業(yè)的關(guān)系
生物化學(xué)對農(nóng)業(yè)生產(chǎn)也有很大使用意義,如弄清楚植物的新陳代謝規(guī)律,我們就可以控制植物的發(fā)
白質(zhì)、糖、脂等的生物合成規(guī)律,我們就可以控制一定的條件,獲得更多、更優(yōu)質(zhì)的農(nóng)產(chǎn)品。
在現(xiàn)代品質(zhì)育種中,也有許多只有通過生化技術(shù)才能辦到的工作,如農(nóng)作物育種親本的選擇,各種
測定、許多遺傳性狀如抗旱型、耐寒性、高產(chǎn)性的鑒定等都可以用生物化學(xué)方法來實現(xiàn)。
(三)生物化學(xué)與醫(yī)學(xué)的關(guān)系
生物化學(xué)對于醫(yī)學(xué)研究有極其重要意義,集中體現(xiàn)在四個方面:一是闡明疾病發(fā)生機理,二是提供(15分鐘)生
驗和診斷方法,三是尋找治療方法,四是為新藥設(shè)計提供理論依據(jù)等。物化學(xué)與工
生物化學(xué)對營養(yǎng)學(xué)也很重要,如為人類提供合適營養(yǎng)是保證人體健康的重要保證,而各種營養(yǎng)成分白農(nóng)業(yè)生產(chǎn)關(guān)
功能如何,過多過少會有什么問題等等都可以從生物化學(xué)中找到答案。因此,有人說營養(yǎng)學(xué)是生物系
類的一個重要貢獻,我覺得這一點也不夸張。
四、生物化學(xué)學(xué)習(xí)中應(yīng)該注意的幾個問題(5分鐘)生
1.善于記憶、勤于思考學(xué)習(xí)心理學(xué)理論認為,學(xué)習(xí)可以分成為4個不同的層次,即記住、理解、活1物化學(xué)學(xué)習(xí)
2.堅持用辨證統(tǒng)一的觀點和唯物辯證的觀點學(xué)習(xí)和分析生物化學(xué)問題。方法及注意
3.要學(xué)會從生物進化和生物體整體觀點看待生物化學(xué)問題。問題。
4.學(xué)以致用的原則,理論學(xué)習(xí)與實踐技能學(xué)習(xí)并重的原則。
(5分鐘)本
次課的總結(jié)
思考題、作業(yè)題、討論題:
思考題:
1.生物體化學(xué)組成成分及存在形式。
2.生物化學(xué)研究的主要內(nèi)容是什么?
作業(yè)題:
I.生物化學(xué)的研究對象是什么?
2.生物化學(xué)研究的主要內(nèi)容是什么?
3.生物化學(xué)與畜牧專業(yè)的關(guān)系?
課后總結(jié)分析:
第—2次課學(xué)時2
授課題目(章,節(jié))第二章蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)與功能1
授課類型(請打J)理論課?口研討課口習(xí)題課口復(fù)習(xí)課口其他口
教學(xué)目的:
通過學(xué)習(xí)宏觀的了解第二章的總體內(nèi)容;掌握蛋白質(zhì)的化學(xué)組成。
教學(xué)方法、手段:
多媒體技術(shù)與板書并用。
教學(xué)重:點、難點:
1、20種氨基酸的分子式、三字母縮寫、分子式。
2、蛋白質(zhì)的元素組成及含量計算。
補充內(nèi)容和
教學(xué)內(nèi)容及過程設(shè)計
時間分配
一、課程回顧
上次課講的主要內(nèi)容:1、生物化學(xué)的概述;2、生物化學(xué)研究的內(nèi)容;3、生物化學(xué)(10分鐘)
的發(fā)展簡史;4、生物化學(xué)與動物生產(chǎn)、健康的關(guān)系;5、學(xué)習(xí)生物化學(xué)的方法和注意課程回顧
事項。
二、新課導(dǎo)入
蛋白質(zhì)是生物體的基本組成成分之一,也是含量最豐富、功能最多的高分子物質(zhì),
約占人體固體成分的45%。蛋白質(zhì)是生命的物質(zhì)基礎(chǔ),沒有蛋白質(zhì)就沒有生命。(10分鐘)
蛋白質(zhì)在生命活動中執(zhí)行著多種功能,如催化功能(酶);調(diào)節(jié)功能(部分激素是新課導(dǎo)入
蛋白質(zhì)、非蛋白激素的合成因不開酶的催化、激素受體是蛋白質(zhì)、基因的調(diào)控也離不開
蛋白質(zhì));運輸功能(血紅蛋白、載體、轉(zhuǎn)運蛋白等);運動功能(肌肉收縮是實現(xiàn)軀體
運動、血液循環(huán)、呼吸、胃腸蠕動的基礎(chǔ),都依賴有收縮功能的蛋白);防御功能(抗
體和補體);應(yīng)激功能(神經(jīng)的傳導(dǎo)和大腦的思維離不開蛋白質(zhì));機械支持功能(皮膚、
結(jié)締組織、骨骼的膠原蛋白);物質(zhì)代謝;細胞信息傳遞;個體生長發(fā)育;組織修復(fù)等。
三、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能概述
(-)蛋白質(zhì)是生命的表征,哪里有生命活動哪里就有蛋白質(zhì)
1.酶:作為酶的化學(xué)本質(zhì),溫和、快速、專一,任何生命活動之必須,酶的另一化學(xué)本
質(zhì)是RNA,不過它比蛋白質(zhì)差遠了,種類、速度、數(shù)量。
2.免疫系統(tǒng):防御系統(tǒng),抗原(進入“體內(nèi)”的生物大分子和有機體),發(fā)炎。
細胞免疫:T細胞本身,分化,膿細胞。
體液免疫:B細胞,釋放抗體,導(dǎo)彈,免疫球蛋白(1g)。
3.肌肉:肌肉的伸張和收縮靠的是肌動蛋白和肌球蛋白互動的結(jié)果,體育生化。
4.運輸和儲存氧氣:Hb和Mb。
5.激素:含氮類激素,固醇類激素。
6.基因表達調(diào)節(jié):操縱子學(xué)說,阻遏蛋白。
7.生長因子:EGF(表皮生長因子),NGF(神經(jīng)生長因子),促使細胞分裂。
8.信息接收:激素的受體,糖蛋白,G蛋白。
9.結(jié)構(gòu)成分:膠原蛋白(肌腱、筋),角蛋白(頭發(fā)、指甲),膜蛋白等。生物體就是蛋
白質(zhì)堆積而成,人的長相也是由蛋白質(zhì)決定的。
-2-
10.精神、意識方面:記憶、痛苦、感情靠的是蛋白質(zhì)的構(gòu)象變化,蛋白質(zhì)的構(gòu)象分類
是目前熱門課題。(25分鐘)
11.蛋白質(zhì)是遺傳物質(zhì)?只有不確切的少量證據(jù)。如庫魯病毒,怕蛋白酶而不怕核酸酶。講授新課,蛋
(二)、構(gòu)成蛋白質(zhì)的元素白質(zhì)結(jié)構(gòu)與
構(gòu)成蛋白質(zhì)的主要元素有C、H、0、N、S5種,其中N元素的含量很穩(wěn)定,16%,因此,功能概述,把
測定樣品中氮元素的含量就能算出蛋白質(zhì)的量。大把白紙這
(三)、蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)層次一章的內(nèi)容
1.一級結(jié)構(gòu):蛋白質(zhì)分子中氨基酸的線性排列順序。概括的講一
2.二級結(jié)構(gòu):蛋白質(zhì)主鏈局部有規(guī)則的空間排布方式。下,讓學(xué)生們
3.三級結(jié)構(gòu):肽鏈在空間的折疊和卷曲形成的形狀,所有原子在空間的排布。宏觀的了解
4.四級結(jié)構(gòu):多條肽鏈之間的作用。一下這一章
四:蛋白質(zhì)功能上的多樣性是由其結(jié)構(gòu)的千差萬別所決定的。只有在深入了解蛋白質(zhì)結(jié)的內(nèi)容,然后
構(gòu)的基礎(chǔ)上才能更透徹了解蛋白質(zhì)的功能。再展開講解。
150萬種生物中,有1010?1012種蛋白質(zhì)及1010種核酸、人體蛋白質(zhì)有106種。
四、講授新課
第一節(jié)蛋白質(zhì)的分子組成
蛋白質(zhì)(Protein)的元素組成及其特點。
(10分鐘)蛋
主要C、H、0、N、S?其他P、Fe、Cu、Zn、Mn、Co,Mo,I。
白質(zhì)的元素
蛋白質(zhì)含氮量平均為16%,而且大部分氮元素存在在蛋白質(zhì)中
組成和含量
測定生物樣品含氮量,可推算出蛋白質(zhì)大致含量。
計算。
每克樣品含氮克數(shù)><6.23X100=100克樣品中蛋白質(zhì)含量(g%)
一、氨基酸(aminoacid;aa,AA)
蛋白質(zhì)的基本組成單位是氨基酸。
存在于自然界中的氨基酸有300余種,組成蛋白質(zhì)的氨基酸只有20種,均屬L—a—氨基
酸(甘氨酸除外)。但由于氨基酸的種類、數(shù)量、排列順序及組合方式的不同,20種氨
基酸可構(gòu)成種類繁多、功能各異的蛋白質(zhì)。D型氨基酸沒有營養(yǎng)價值,僅存在于綴氨霉
素、短桿菌肽等極少數(shù)寡肽之中,沒有在蛋白質(zhì)中發(fā)現(xiàn)。
氨基酸的通式(脯氨酸除外):
COOH
-3-
1
H2N—C—II
I
1
R
連在段基上的C稱為a—碳原子,為不對稱碳原子(甘氨酸除外),不同的氨基酸
其側(cè)鏈(R)各異。
(-)氨基酸的分類
(20分鐘)氨
根據(jù)其側(cè)鏈的結(jié)構(gòu)和理化性質(zhì)分為四類:基酸的分類
1.非極性疏水性氨基酸側(cè)鏈基團有甲基、苯環(huán)等疏水基團。側(cè)鏈彼此連結(jié)形成和性質(zhì),這段
疏水鍵,是蛋白質(zhì)三級結(jié)構(gòu)中數(shù)量最多的次級鍵。內(nèi)容比較抽
甘、丙、綴、亮、異亮、苯丙、脯。(7種)象,把抽象的
2.極性中性氨基酸側(cè)鏈基團有羥基、酚基、筑基和酰胺基等極性親水基團。內(nèi)容用通俗
色、絲、酪、半胱、蛋、蘇、天冬酰胺、谷氨酰胺。(8種)的舉例子的
3.酸性氨基酸側(cè)鏈上有竣基,在中性水溶液中電離出H+而帶負電荷。方法講解出
天冬氨酸(Asp)、谷氨酸(Glu)來,再結(jié)合課
4.堿性氨基酸側(cè)鏈氨基、臟基和咪噗基可接受H+而帶正電荷。件中的圖片,
賴氨酸(Lys)、精氨酸(Arg)、組氨酸(His)爭取學(xué)生課
脯氨酸與半胱氨酸較為特殊。脯氨酸屬亞氨基酸,亞氨基能與另一竣基形成肽鍵;N在堂能理解掌
環(huán)中,移動的自由度受到限制,處于多肽鏈中時,往往使肽鏈走向形成折角。兩個半胱握。
氨酸脫氫以二硫鍵相連形成胱氨酸。在蛋白質(zhì)分子中二硫鍵(共價鍵)是連接肽鏈內(nèi)或
肽鏈間的主要橋鍵,造成肽鏈分支或成為環(huán)狀。
蛋氨酸又稱甲硫氨酸。
(二)氨基酸的理化性質(zhì)
1.兩性解離及等電點
(1)兩性解離氨基酸含有堿性的a-氨基和酸性的a-竣基,在酸性溶液中與質(zhì)子
結(jié)合成帶正電荷的陽離子,在堿性溶液中與0H一結(jié)合,失去質(zhì)子成為帶負電荷的陰離子。
氨基酸是兩性電解質(zhì),具有兩性解離特性。
(2)pl氨基酸解離方式取決于所溶液的pH,解離成陽離子和陰離子的趨勢及程度
相等成為兼性離子,呈電中性時的溶液pH稱為該氨基酸的等電點。
-4-
氨基酸的pl是由a-段基和a-氨基的解離常數(shù)的負對數(shù)pKl和pK2決定的。pl=1/2
(pKl+pK2)(Glu:3.22;Lys:9.74)
2.紫外吸收性質(zhì)
參與蛋白質(zhì)組成的20種氨基酸,在可見光區(qū)域都沒有光吸收,但在遠紫外區(qū)
?220nm)均有光吸收。在近紫外光區(qū)域(220-300nm)只有酪氨酸(Tyr)、苯丙氨酸
(Phe)和色氨酸(Trp)有吸收光的能力。因為它們的R基含有苯環(huán)共規(guī)雙鍵系統(tǒng)。
測定蛋白質(zhì)溶液在280nm波長處光吸收值,可快速、簡便分析溶液中蛋白質(zhì)含量。
3.前三酮反應(yīng)
在氨基酸的分析化學(xué)中,具有特殊意義的是氨基酸與荀三酮的反應(yīng)。瑋三酮在弱酸
性溶液中與a-氨基酸共熱,引起氨基酸氧化脫氨、脫歿反應(yīng),最后司三酮與反應(yīng)物一
一氨和還原瑋三酮發(fā)生作用,生成藍紫色化合物,最大吸收峰在570nm波長處。荀三酮
顯色可用于氨基酸的定性或定量測定。(10分鐘)氨
二、肽基酸的理化
(一)肽(peptide)性質(zhì)和分類。
1.肽鍵由一個氨基酸的a-竣基與另一個氨基酸的a-氨基脫水形成的共價鍵,又
稱為酰胺鍵,是蛋白質(zhì)的主鍵。
-H2O
H2N-CH-C00H+H2N-CH-C00H---H2N-CH-C0-NH-CH-C00H
1III
1111
RIR2RIR2
2.肽是由許多氨基酸殘基通過肽鍵連接形成的鏈狀結(jié)構(gòu)。又稱肽鏈。
3.寡肽、多肽10個以內(nèi)氨基酸相連而成的肽稱為寡肽,更多的氨基酸相連而成的
肽稱為多肽。
4.氨基酸殘基肽鏈中的氨基酸由于脫水而結(jié)構(gòu)不完整,稱為氨基酸殘基。
5.N—端、C一端多肽鏈有兩端,自由氨基端稱為氨基末端(N端),寫在左側(cè),自
由艘基端稱為較基末端(C端)寫在右側(cè)。
三、蛋白質(zhì)的分類
(-)根據(jù)蛋白質(zhì)的組成成分
1.單純蛋白質(zhì)只含氨基酸。
2.結(jié)合蛋白質(zhì)還含非蛋白部分(輔基),以共價鍵與蛋白質(zhì)結(jié)合。如色素、寡糖、脂(5分鐘)小
-5-
類、磷酸、金屬離子、核酸。結(jié),把這次可
(二)根據(jù)蛋白質(zhì)的形狀得內(nèi)容總結(jié)
1.纖維狀蛋白質(zhì):分子長軸的長度比短軸長10倍以上。纖維狀的結(jié)構(gòu)蛋白質(zhì),難一下。
溶于水?
2.球狀蛋白質(zhì):球形或橢圓形的功能蛋白質(zhì),可溶于水。
小結(jié):
思考題、作業(yè)題、討論題:
1、蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)。2、20種氨基酸的結(jié)構(gòu)特點。3、氨基酸的理化性質(zhì)及分類。
課后總結(jié)分析:
第二一次課學(xué)時2
授課題目(章,節(jié))第二章蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能2
授課類型(請打J)理論課口研討課口習(xí)題課口復(fù)習(xí)課口其他口
教學(xué)目的:
掌握蛋白質(zhì)的化學(xué)組成、基本結(jié)構(gòu)特點以及結(jié)構(gòu)和功能的關(guān)系,熟悉蛋白質(zhì)和氨基酸重要的理化性
質(zhì),了解蛋白質(zhì)的分類和分離純化的手段。
教學(xué)方法、手段:
老師示范、板書、多媒體技術(shù)
教學(xué)重點、難點:
1、蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu)和空間結(jié)構(gòu)。2、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系。
補充內(nèi)容和時間
教學(xué)內(nèi)容及過程設(shè)計
分配
-6-
二、課程回顧
回顧上節(jié)課學(xué)過的內(nèi)容:
1、蛋白質(zhì)的生物學(xué)功能。
(10分鐘)上次
2、20種氨基酸的名稱和性質(zhì)。
課程內(nèi)容回顧,以
3、氨基酸的理化性質(zhì)。
提問的方式和學(xué)
二、新課講授
生互動。加強鞏固
第二節(jié)蛋白質(zhì)的分子結(jié)構(gòu)上次課所學(xué)內(nèi)容。
蛋白質(zhì)分子是由許多氨基酸通過肽鍵相連形成的生物大分子。氨基酸排列順序及肽
鏈的空間排布等構(gòu)成蛋白質(zhì)分子結(jié)構(gòu)。
分為:基本結(jié)構(gòu)(一級)和高級結(jié)構(gòu)或空間構(gòu)象(二級、三級、四級結(jié)構(gòu))。
構(gòu)象:是化學(xué)鍵的旋轉(zhuǎn)形成的立體結(jié)構(gòu),改變構(gòu)象不涉及共價鍵的破壞。
構(gòu)型:是指各原子或基團在不對稱碳原子上的排列形成的空間結(jié)構(gòu),改變構(gòu)型必須
將共價鍵斷裂后重新連結(jié)。
一、蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu)(15分鐘)蛋白
1.定義:蛋白質(zhì)分子中氨基酸由N端至C端的排列順序。即氨基酸序列。質(zhì)一級結(jié)構(gòu)的講
2.主鍵:肽鍵。有些蛋白質(zhì)還含二硫鍵。解。
3.意義:是蛋白質(zhì)空間構(gòu)象和特異生物學(xué)功能的基礎(chǔ),不是決定空間構(gòu)象的唯
一因素。
10
(25分鐘)蛋白
質(zhì)二級結(jié)構(gòu)的講
解。
二、蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu)
-7-
(一)定義:蛋白質(zhì)分子中某一段肽鏈主鏈骨架原子的相對空間位置,不涉及氨基
酸殘基側(cè)鏈的構(gòu)象。是蛋白質(zhì)主鏈局部的空間構(gòu)象。
(二)肽單元:參予肽鍵的Cal、C、0、N,H、Ca26個原子處于同一平面構(gòu)成。
0Ca
C---------N
CaII
根據(jù)X衍射技術(shù)測定(根據(jù)鍵長和鍵角,推斷肽的空間結(jié)構(gòu))
一般有機胺C-N單鍵鍵長0.149nm
異鼠根C=N雙鍵鍵長0.127nm(20分鐘)蛋白
肽鍵C-N鍵長0.132nm質(zhì)二級結(jié)構(gòu)的講
肽鍵鍵長位于單鍵和雙鍵之間,因此具有一定程度的雙鍵性質(zhì)(近似以n鍵),解,這段內(nèi)容和抽
不能自由旋轉(zhuǎn)。參與肽鍵的6個原子被約束于同一個平面上,Cal和Ca2是在平面象,結(jié)合課件中的
的兩個對角,為反式構(gòu)型,這就是肽單元。Ca與N和默基碳原子相連的鍵都是典型圖片,使學(xué)生更容
的單鍵,可以自由旋轉(zhuǎn),旋轉(zhuǎn)角度決定兩個相鄰肽單元平面的相對空間位置。易學(xué)習(xí)。
這樣可以把多肽鏈的主鏈看成是由被Ca隔開的許多肽單元所組成。而肽單元
可以看做蛋白質(zhì)構(gòu)象的基本單元。肽單元圍繞a—碳原子旋轉(zhuǎn),使多肽鏈形成各種
形式的主鏈構(gòu)象和側(cè)鏈構(gòu)象。但實際上側(cè)鏈間、主鏈間相互吸引或排斥,相互影響
或制約,使整個蛋白質(zhì)分子形成一個最穩(wěn)定的特定構(gòu)象。一種天然的蛋白質(zhì)的多肽
鏈,在一定條件下,往往只有一種或很少幾種構(gòu)象。
(三)主要形式肽鏈局部主鏈原子空間構(gòu)象的分子模型
1.a-螺旋
(1)多肽鏈的主鏈圍繞中心軸呈有規(guī)律地螺旋式上升,為右手螺旋。
(2)螺旋每上升一圈(旋轉(zhuǎn)360。為一個螺旋周期)含3.6個氨基酸殘基,螺距
為0.54nm?
(3)每個肽鍵的N-H和第四個肽鍵的談基氧C=0形成氫鍵,氫鍵的方向與螺
旋軸基本平行。穩(wěn)定a-螺旋結(jié)構(gòu)。
(4)側(cè)鏈基團位于a-螺旋的外側(cè),不參與a-螺旋的維系,但對a-螺旋的形成
和穩(wěn)定有重要影響。
-8-
-9-
2.0-折疊
(1)幾條多肽鏈或一條多肽鏈反折形成的若干肽段互相靠攏,平行排列。
(2)所有肽鍵的C=0和N-H形成鏈間氫鍵,氫鍵與主鏈互相垂直。
(3)側(cè)鏈基團交替地伸向片層的上方和下方。由于側(cè)鏈基團的存在,而主鏈又
必須互相靠攏,所以主鏈不能完全伸展,而呈鋸齒狀折疊的片層結(jié)構(gòu)。
(4)相鄰肽鏈走向相反者為反平行式,結(jié)構(gòu)較穩(wěn)定,間距0.7nin。相鄰肽鏈走向
相同為平行式,間距0.65nm。完全伸展的肽鏈間距為0.72nm。
3、8-轉(zhuǎn)角常發(fā)生于肽鏈進行180度回折時的轉(zhuǎn)角上,第一個氨基酸殘基的C0和第
四個氨基酸殘基的Nil形成氫鍵,以保持結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定。又稱為發(fā)夾結(jié)構(gòu)或U形轉(zhuǎn)折。
-10-
4.無規(guī)卷曲沒有確定規(guī)律性的部分肽鏈結(jié)構(gòu)。
(四)維持鍵:氫鍵維持二級結(jié)構(gòu)穩(wěn)定。
蛋白質(zhì)中,存在二個或三個具有二級結(jié)構(gòu)的肽段所形成的特殊空間構(gòu)象,稱為
模序,發(fā)揮著特殊的生物學(xué)功能。
三、蛋白質(zhì)的三級結(jié)構(gòu)
1.定義:多肽鏈主鏈和側(cè)鏈的全部原子的三維空間排布位置。
2.穩(wěn)定因素:疏水作用、離子鍵、氫鍵、Vanderwaals力。(次級鍵)
3.結(jié)構(gòu)域:對于較大的蛋白質(zhì)分子或亞基,多肽鏈往往由兩個或兩個以上相對
獨立的三維實體締合而成三級結(jié)構(gòu)。這種相對獨立的三維實體就稱為結(jié)構(gòu)域。(結(jié)構(gòu)
(10分鐘)
域介于超二級結(jié)構(gòu)和三級結(jié)構(gòu)之間)對于那些較小的蛋白質(zhì)分子或亞基來說結(jié)構(gòu)域
蛋白質(zhì)三級結(jié)構(gòu)
和三級結(jié)構(gòu)往往是一個意思,也就是說這些蛋白質(zhì)是單結(jié)構(gòu)域的。
講解,學(xué)生們在掌
4.亞基:具有獨立完整三級結(jié)構(gòu)的多肽鏈。
握了二級結(jié)構(gòu)的
基礎(chǔ)上較容易學(xué)
習(xí)三級結(jié)構(gòu)。
圖1-13肌紅蛋白的三級結(jié)構(gòu)
a.肌包:蛋白的三維構(gòu)復(fù)
-II-
?肌紅蛋白(Mb)
四、蛋白質(zhì)的四級結(jié)構(gòu)
1.定義:蛋白質(zhì)亞基之間的締合,由2個或2個以上的亞基借次級鍵聯(lián)接構(gòu)成的
更復(fù)雜的結(jié)構(gòu)。各個亞基的空間排布及接觸部位的布局和相互作用。
(10分鐘)
2.穩(wěn)定因素:主要是疏水作用,其次是氫鍵和離子鍵。依靠次級鍵維系。
蛋白質(zhì)四級結(jié)構(gòu)
含有四級結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì),獨立的亞基一般沒有生物學(xué)功能,只有完整的四級結(jié)
講解,學(xué)生們在掌
構(gòu)寡聚體才有生物學(xué)功能。
握了三級結(jié)構(gòu)的
基礎(chǔ)上較容易學(xué)
血習(xí)四級結(jié)構(gòu)。
紅
蛋
白
的
四
級
結(jié)
構(gòu)
-12-
第三節(jié)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系
一、蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系
(-)一級結(jié)構(gòu)是空間構(gòu)象的基礎(chǔ)
(15分鐘)
核糖核酸酶的變性和復(fù)性實驗是一個很有說服力的證明。
蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功
8M尿素透析去尿素
能的關(guān)系。
天然RNA酶-一-ff-變性RNA酶-一----復(fù)性RNA酶
筑基乙醇和疏基乙醇
變性:采用尿素和疏基乙醇處理,破壞次級鍵和二硫鍵,其二、三級結(jié)構(gòu)破
壞,肽鍵不受影響,一級結(jié)構(gòu)仍在,醵活性喪失。
復(fù)性:采用透析法除去變性劑和還原劑以后,酶活力幾乎恢復(fù)到變性前的水平。
經(jīng)檢查,其理化性質(zhì)也與天然酶一致,表明其構(gòu)象也已恢復(fù)。據(jù)數(shù)學(xué)計算,此酶還
原后的8個半胱氨酸的茶基重新結(jié)合成4對二硫鍵共有105種可能的配對方式,其中只
有一種是正確的配對,而只有按這種正確的配對方式連接才能表現(xiàn)此酶的活性。上
述實驗酶活性的恢復(fù)說明一級結(jié)構(gòu)包含著建立正確的空間結(jié)構(gòu)的全部信息。
(二)一級結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系
一級結(jié)構(gòu)是空間構(gòu)象和功能的基礎(chǔ)。一級結(jié)構(gòu)相似的蛋白質(zhì),其空間構(gòu)象和功
能也相似。蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)發(fā)生改變則影響其正常功能,引起的疾病稱為分子病。
許多遺傳性疾病是由于某一重要蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu)發(fā)生了差錯而引起。例如鐮
刀形紅細胞性貧血患者的血紅蛋白(HbS,a2B26谷一綴),B亞基第6位谷氨酸變
成綴氨酸,使水溶性的血紅蛋白具集成絲,相互粘著,導(dǎo)致紅細胞變成鐮刀狀而極
易破碎。通過脾臟不易變形而溶血。純合子他5占80%,兒童期就死亡;雜合子UbS
占50%,只有30歲左右的壽命。這種疾病見于非洲某些地區(qū)。
比較一些廣泛存在于生物界的蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu),可以幫助了解物種進化間的
關(guān)系。物種進化相差越遠,一級結(jié)構(gòu)的差別越大。一一分子分類學(xué).
二、蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系
(―)肌紅蛋白(Mb)和血紅蛋白(Hb)結(jié)構(gòu)
都是含有血紅素輔基的蛋白質(zhì)。
l.Mb
是一個只有三級結(jié)構(gòu)的單鏈蛋白質(zhì),球狀分子內(nèi)部有一個袋形空穴,血紅素居
于其中。
-13-
2.Hb
是具有四個亞基組成四級結(jié)構(gòu),成人紅細胞Hb主要由兩條a鏈和兩條8鏈組
成,a鏈含141個氨基酸殘基;B鏈含146個氨基酸殘基。11b各亞基的三級結(jié)構(gòu)與Mb
相似。
1.協(xié)同效應(yīng)
一個亞基與其配體(Hb中的配體為02)結(jié)合后,能影響此寡聚體中另一亞基與
配體的結(jié)合能力。如果是促進作用則為正協(xié)同效應(yīng),反之,則為負協(xié)同效應(yīng)。(寡聚
體:由二個或多個亞基組成的蛋白質(zhì)。無四級結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì)如溶菌酶、肌紅蛋白等
稱為單體蛋白質(zhì)。)
2.變構(gòu)效應(yīng)
一個氧分子與Hb亞基結(jié)合后引起亞基的構(gòu)象變化,稱為變構(gòu)效應(yīng)。小分子氧稱
為變構(gòu)劑或效應(yīng)劑。Hb則被稱為變構(gòu)蛋白。變構(gòu)效應(yīng)不僅發(fā)生在Hb與02之間,一
些酶與變構(gòu)效應(yīng)劑的結(jié)合,配體與受體的結(jié)合也存在著變構(gòu)效應(yīng)。一個蛋白質(zhì)與其
它配體(或其它蛋白質(zhì))結(jié)合后,蛋白質(zhì)的構(gòu)象發(fā)生變化,使它更適合于功能需要,(5分鐘)學(xué)生提
這一類變化稱為變構(gòu)效應(yīng)。問與學(xué)生互動,了
解學(xué)生接受情況
小結(jié):和學(xué)生一起回憶本次講過的內(nèi)容,并板書出來。
1、蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu):蛋白質(zhì)分子中氨基酸由N端至C端的排列順序。即氨基酸
序列。
2、蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu):蛋白質(zhì)分子中某一段肽鏈主鏈骨架原子的相對空間位置,不
涉及氨基酸殘基側(cè)鏈的構(gòu)象?是蛋白質(zhì)主鏈局部的空間構(gòu)象。(5分鐘)本次課
3、蛋白質(zhì)的三級結(jié)構(gòu):的內(nèi)容總結(jié)
4、蛋白質(zhì)的四級結(jié)構(gòu):
5、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系。
思考題、作業(yè)題、討論題:
1、蛋白子的一級結(jié)構(gòu)。
2、蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu)及四種形式。
3、蛋白質(zhì)的三、四級結(jié)構(gòu)及特點。
-14-
課后總結(jié)分析:
第4次課學(xué)時_2
授課題目(章,節(jié))第二章蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能3
授課類型(請打J)理論課口研討課口習(xí)題課口復(fù)習(xí)課口其他口
教學(xué)目的:掌握蛋白質(zhì)的理化性質(zhì),了解蛋白質(zhì)分離純化技術(shù)。
教學(xué)方法、手段:
多媒體技術(shù)和板書
理論為主多媒體為輔。
教學(xué)重點、難點:
補充內(nèi)容和時
教學(xué)內(nèi)容及過程設(shè)計
間分配
-15-
一、課程回顧
上節(jié)課我們學(xué)習(xí)的內(nèi)容:(10分鐘)
1、蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu)、二級結(jié)構(gòu)、三級結(jié)構(gòu)、四級結(jié)構(gòu)。上節(jié)課內(nèi)容回
2、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能之間的關(guān)系。顧。
二、新課講授
第四節(jié)蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)及其分離純化
一、蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)
(-)蛋白質(zhì)的兩性電離和等電點
蛋白質(zhì)
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