Pubmed數(shù)據(jù)庫檢索與利用

PubMed數(shù)據(jù)庫檢索與利用江西中醫(yī)藥大學圖書館查青林2015.11.27主要內(nèi)容PubMed概述PubMed檢索途徑與使用方法檢索結(jié)果導入NoteExpressPubMed元數(shù)據(jù)利用2主要內(nèi)容PubMed概述PubMed檢索途徑與使用方法檢索結(jié)果導入NoteExpressPubMed元數(shù)據(jù)利用3PubMed簡介PubMed是由美國國立醫(yī)學圖書館(NationalLibraryofMedicine,NLM)下屬美國生物技術信息中心(NationalCenterforBiotechnologyInformation,NCBI)研制的基于Web的文獻數(shù)據(jù)庫收錄全世界包括美國在內(nèi)80多個國家的5000余種生物醫(yī)學期刊的文摘及題錄數(shù)據(jù)，內(nèi)容涉及護理學、牙科學、獸醫(yī)學、藥理學、保健系統(tǒng)等醫(yī)學各個領域現(xiàn)有文獻2200萬余條，收錄文獻時間起自20世紀50年代PubMed提供部分免費全文，包括①NLM開發(fā)的免費生物醫(yī)學數(shù)字化期刊全文數(shù)據(jù)庫PubMedCentral(PMC)；

②開放獲取(OpenAccess,OA)期刊的文獻；③部分出版商提供的免費期刊文獻。PubMed每條記錄均有惟一的識別號PMID(PubMedUniqueIdentifier)

。MEDLINE:PubMed主體部分，記錄均標有[PubMed-indexedforMEDLINE]

InProcessCitation:又稱PreMEDLINE,記錄均標有[PubMed-inprocess]Publisher-SuppliedCitation:記錄均標有[PubMed-assuppliedbypublisher][PubMed-indexedforMEDLINE][PubMed-assuppliedbypublisher][PubMed-inprocess]NLM早在1879年即開始編譯醫(yī)學文獻的檢索刊物《醫(yī)學索引》(IndexMedicus,IM)從1964年起，采用計算機進行電子編輯和排版，在此基礎上開發(fā)了“醫(yī)學文獻分析與檢索系統(tǒng)”(MedicalLiteratureAnalysis&RetrievalSystem)，即著名的MEDLARS系統(tǒng)1971年正式建立了該系統(tǒng)的聯(lián)機系統(tǒng)，稱為“MEDLARS聯(lián)機檢索系統(tǒng)”(MEDLARSonline)，即MEDLINE系統(tǒng)隨著網(wǎng)絡技術的發(fā)展，開發(fā)人員致力于將MEDLINE數(shù)據(jù)庫的信息放到網(wǎng)上，供廣大醫(yī)務人員免費使用。從1997年6月起，PubMed開始在網(wǎng)上免費向讀者提供服務發(fā)展歷程收錄范圍廣、內(nèi)容齊全、回溯時間長免費提供題錄、文摘檢索功能完善、使用方便提供檢索詞自動轉(zhuǎn)換匹配功能、MeSH主題詞檢索可直接下載全部元數(shù)據(jù)，便于利用各種工具進行分析提供相關文獻鏈接:Relatedcitations,Linkout更新速度快:數(shù)據(jù)實時更新個性化服務(MyNCBI)PubMed特點

PubMed提供檢索詞自動轉(zhuǎn)換匹配功能(AutomaticTermMapping,ATM)。

PubMed對鍵入的檢索詞自動進行分析、匹配、轉(zhuǎn)換并檢索，是一種智能化的檢索過程。MeSH轉(zhuǎn)換表

Vitaminh→

"biotin"[MeSHTerms]OR"biotin"[AllFields]OR"vitaminh"[AllFields]期刊轉(zhuǎn)換表

newenglandjournalofmedicine→

"NEnglJMed"[Journal]OR"newenglandjournalofmedicine"[AllFields]作者索引

SmithJA→SmithJA[Author]主要內(nèi)容PubMed概述PubMed檢索途徑與使用方法檢索結(jié)果導入NoteExpressPubMed元數(shù)據(jù)利用10二、PubMed檢索途徑與使用方法基本檢索高級檢索主題詞檢索題錄檢索期刊檢索基本檢索框高級檢索題錄檢索主題詞檢索期刊檢索臨床查詢臨床試驗網(wǎng)址13輸入檢索式例：類風濕關節(jié)炎（rheumatoidarthritis）應用雷公藤（triperygiumwilfordii）方面的文獻。點擊“Search”顯示設置檢索結(jié)果標題含有檢索詞文獻標題含有檢索詞文獻點擊“Seemore”在PubMed注冊自己的賬戶點擊篇名點擊出版物類型相關文獻點擊“LinkOut”點擊數(shù)據(jù)庫名稱時間限定文獻類型限定語種限定限定結(jié)果點擊高級檢索檢索式顯示框構(gòu)建檢索式檢索歷史輸入檢索詞顯示索引例：檢索2009年以來發(fā)表的有關腫瘤護理方面的英文綜述性文獻輸入檢索詞選擇檢索字段點擊“Search”完整檢索式檢索結(jié)果點擊主題詞檢索輸入檢索詞點擊“Search”例：通過主題詞途徑，檢索有關心肌梗塞（myocardialinfarction）方面的文獻添加到檢索框檢索勾選主題詞檢索結(jié)果輸入檢索詞點擊“Search”例：通過主題詞途徑，檢索有關心肌梗塞（myocardialinfarction）預防（preventionandcontrol)方面的文獻確定主題詞選擇副主題詞添加到檢索框檢索主題詞加權(quán)檢索選項檢索結(jié)果例：通過主題詞途徑，檢索有關心肌梗塞（myocardialinfarction）預防（preventionandcontrol)方面的文獻。要求主題詞加權(quán)、不擴展檢索勾選加權(quán)檢索、不擴展檢索選項添加到檢索框檢索檢索結(jié)果題錄檢索例：檢索《病毒雜志》（archivesofvirology）2009年發(fā)表的《基因穩(wěn)定性與連續(xù)性分析》（geneticstabilityandlinkageanalysis）這篇文獻輸入檢索信息點擊“Search”點擊期刊檢索檢索框輸入刊名點擊“Search”例：查找《新英格蘭醫(yī)學雜志》（nejm）

PubMed基本檢索規(guī)則布爾運算符AND，OR，NOT必須大寫例如：vitaminORzincPubMed從左至右進行布爾運算，可以通過加圓括符改變運算順序例如：commoncoldAND(vitaminORzinc)指定文獻記錄字段名稱檢索

例如：DNA［mh］ANDcrick［au］AND1993［dp］

常用字段名稱縮寫：

DP——出版日期如1998［dp］；輸入日期范圍則用冒號連接，如1996：1998［dp］

AD——第一作者機構(gòu)名稱、地址、資助號如tianjin［ad］

AU——作者姓名如woods［au］

TA——期刊名稱包括期刊名全稱、簡稱、ISSN如science［ta］或0021-9258［ta］

LA——文獻出版語言如Chinese［la］

MH——Mesh主題詞如neoplasm［mh］

PT——出版類型如review［pt］

TW——自由詞

TI——文獻標題內(nèi)自由詞如leiomyosarcoma［ti］

作者姓名[字段標識]Woods[au]輸入檢索詞詳細檢索過程輸入檢索詞詳細檢索過程刊名[字段標識]Science[ta]輸入檢索詞詳細檢索過程輸入檢索詞詳細檢索過程詞組檢索例如：“singlecell”截詞檢索：*例如：輸入infect*，可檢出infection，infectious，infective，infectivity，infector等截詞檢索只限于單詞，對詞組無效

雙引號，系統(tǒng)進行強制檢索注意：檢索詞自動轉(zhuǎn)換匹配功能關閉輸入檢索詞檢索結(jié)果詳細檢索過程詞組檢索輸入檢索詞檢索結(jié)果詳細檢索過程*通配符，可同時檢索含有infection，infected，infections等詞的文獻注意：檢索詞自動轉(zhuǎn)換匹配功能關閉輸入檢索詞詳細檢索過程主要內(nèi)容PubMed概述PubMed檢索途徑與使用方法檢索結(jié)果導入NoteExpressPubMed元數(shù)據(jù)利用65從圖書館網(wǎng)站下載NoteExpress66檢索結(jié)果保存為Medline格式文件67從