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第2節(jié)
基因工程的基本操作程序第3課時(shí)1.目的基因的篩選和獲取-前提利用PCR獲取和擴(kuò)增人工合成2.構(gòu)建基因表達(dá)載體-核心目的基因、啟動(dòng)子、終止子、標(biāo)記基因3.將目的基因?qū)胧荏w細(xì)胞-關(guān)鍵農(nóng)桿菌轉(zhuǎn)化法(植物)、顯微注射法(動(dòng)物)、
感受態(tài)細(xì)胞轉(zhuǎn)化法(微生物);4.目的基因的檢測(cè)與鑒定-保證分子檢測(cè):是否插入、轉(zhuǎn)錄、翻譯個(gè)體水平:是否具有抗性以及抗性強(qiáng)度等基因工程的基本操作程序檢測(cè)轉(zhuǎn)基因生物染色體DNA上是否插入了目的基因方法:PCR等技術(shù)提取DNA根據(jù)目的基因的序列設(shè)計(jì)PCR引物PCR操作是否擴(kuò)增出目的基因瓊脂糖凝膠電泳DNA測(cè)序技術(shù)你知道PCR會(huì)擴(kuò)增出哪些不同的片段嗎?只含目的基因片段目的基因在整個(gè)DNA片段的中央位置復(fù)制3次后這兩個(gè)DNA分子量相同嗎?種類1種類2種類3種類4種類5怎么鑒定PCR的產(chǎn)物?電泳?、貾CR利用了DNA的熱變性原理,通過(guò)調(diào)節(jié)溫度來(lái)控制DNA雙鏈的解聚與結(jié)合。PCR儀實(shí)質(zhì)上就是一臺(tái)能夠自動(dòng)調(diào)控溫度的儀器,一次PCR一般要經(jīng)歷30次循環(huán)。②PCR擴(kuò)增DNA片段還利用了DNA半保留復(fù)制的原理。探究·實(shí)踐:DNA片段的擴(kuò)增及電泳鑒定1.實(shí)驗(yàn)原理(1)PCR在體外進(jìn)行DNA片段的擴(kuò)增原理(2)DNA片段電泳鑒定的原理①DNA分子具有____________,在一定的____下,這些基團(tuán)可以帶上________________。在_________的作用下,這些___________會(huì)向著__________________的電極移動(dòng),這個(gè)過(guò)程就是電泳??山怆x的基團(tuán)pH正電荷或負(fù)電荷帶電分子與它所帶電荷相反電場(chǎng)②PCR的產(chǎn)物一般通過(guò)瓊脂糖凝膠電泳來(lái)鑒定。在凝膠中DNA分子的遷移速率與凝膠的濃度、DNA分子的大小和構(gòu)象等有關(guān)。③凝膠中的DNA分子通過(guò)染色,可以在波長(zhǎng)為300nm的紫外燈下被檢測(cè)出來(lái)。一般使用的電泳緩沖液pH=8,DNA分子帶負(fù)電荷,在電場(chǎng)中DNA便向正極移動(dòng)。電泳:
在電場(chǎng)的作用下,DNA、RNA、蛋白質(zhì)等這些帶電分子會(huì)向著與它所帶電荷相反的電極移動(dòng),這個(gè)過(guò)程就是電泳。正極負(fù)極電場(chǎng)力瓊脂糖凝膠濃度(%)分離DNA分子大?。↘b)遷移速率0.61~20慢快0.70.8~100.90.5~71.20.4~61.50.2~42.00.1~3瓊脂糖凝膠濃度越大,分離的DNA分子越小,遷移速率越快DNA分子的遷移速率與凝膠的濃度關(guān)系PCR儀2.材料用具①PCR儀(自動(dòng)控溫,實(shí)現(xiàn)DNA的擴(kuò)增)②微量離心管(實(shí)際上是進(jìn)行PCR反應(yīng)的場(chǎng)所)③微量移液器(用于向微量離心管轉(zhuǎn)移PCR配方中的液體)④一次性吸液槍頭(微量移液器吸取一種試劑更換一次槍頭)⑤電泳裝置(包括電泳儀、電泳槽等)(1)用具:微量離心管2.材料用具①4種脫氧核苷酸等量混合液、2種引物、TaqDNA聚合酶、模板DNA、擴(kuò)增緩沖液、無(wú)菌水、電泳緩沖液、凝膠載樣緩沖液、瓊脂糖和核酸染料等。②PCR反應(yīng)體系的配方(見教材)。(2)材料:PCR反應(yīng)體系的配方10倍濃縮的擴(kuò)增緩沖液(含Mg2+)5μL20mmol/L的4種脫氧核苷酸的等量混合液(實(shí)為dNTP)1μL20μmol/L的引物Ⅰ2.5μL20μmol/L的引物Ⅱ2.5μLH2O28~33μL1~5U/μL的TaqDNA聚合酶(即為耐高溫的DNA聚合酶)1~2U模板DNA(1pg~1μg)5~10μL總體積50μL三點(diǎn)提醒在PCR過(guò)程中實(shí)際加入的為dNTP(即dATP、dGTP、dTTP、dCTP),既可作為合成DNA子鏈的原料,又可為DNA的合成提供能量。引物既可以是DNA單鏈,也可以為RNA單鏈。細(xì)胞內(nèi)的DNA進(jìn)行復(fù)制時(shí),也需要引物,一般為RNA片段;PCR引物一般為DNA片段。真核細(xì)胞和細(xì)菌的DNA聚合酶都需要Mg2+激活。因此,PCR反應(yīng)緩沖溶液中一般要添加Mg2+。1233.方法步驟(1)DNA片段的擴(kuò)增用微量移液器按照PCR反應(yīng)體系配方或PCR試劑盒的說(shuō)明書,在微量離心管中依次加入各組分。待所有組分都加入后,蓋嚴(yán)離心管的蓋子,將微量離心管放入離心機(jī)里,離心約10s,使反應(yīng)液集中在離心管的底部(提高反應(yīng)速率)。使DNA充分變性,以利于引物更好地與模板結(jié)合。循環(huán)程序變性復(fù)性延伸預(yù)變性94℃,5min30次94℃,30s55℃,30s72℃,1min最后一次94℃,1min55℃,30s72℃,1min參照下表的參數(shù),設(shè)置好PCR儀的循環(huán)程序。將裝有反應(yīng)液的微量離心管放入PCR儀中進(jìn)行反應(yīng)。移液離心擴(kuò)增PCR實(shí)驗(yàn)操作過(guò)程[思考]為什么最后1次變性時(shí)間延長(zhǎng)?
TaqDNA聚合酶活性會(huì)隨著循環(huán)次數(shù)增加而下降。在每一輪循環(huán)中,部分片段可能沒有完全延伸完,TaqDNA聚合酶就脫落了。最后1次變性時(shí)間延長(zhǎng),讓這些DNA打開,重新延伸。3.方法步驟(2)DNA片段的電泳鑒定配制瓊脂糖溶液根據(jù)待分離DNA片段的大小,用電泳緩沖液配制瓊脂糖溶液,一般配制質(zhì)量體積比0.8%~1.2%的瓊脂糖溶液。在沸水浴或微波爐內(nèi)加熱至瓊脂糖熔化。稍冷卻后,加入適量的核酸染料混勻。制備凝膠加樣電泳觀察記錄
常用的核酸染色劑有EB(溴化乙錠)、GoldView等,EB能插入DNA分子中的堿基對(duì)之間,導(dǎo)致EB與DNA結(jié)合。嵌入核酸堿基間的EB能吸收300nm波長(zhǎng)的紫外光,發(fā)出可見熒光。其熒光強(qiáng)度與DNA分子的含量成正比。(2)DNA片段的電泳鑒定配制瓊脂糖溶液根據(jù)待分離DNA片段的大小,用電泳緩沖液配制瓊脂糖溶液,一般配制質(zhì)量體積比0.8%~1.2%的瓊脂糖溶液。在沸水浴或微波爐內(nèi)加熱至瓊脂糖熔化。稍冷卻后,加入適量的核酸染料混勻。制備凝膠將溫?zé)岬沫傊侨芤貉杆俚谷肽>?,并插入合適大小的梳子,以形成加樣孔。待凝膠溶液完全凝固,小心拔出梳子,取出凝膠放入電泳槽內(nèi)。將電泳緩沖液加入電泳槽中,電泳緩沖液沒過(guò)凝膠1mm為宜。加樣電泳觀察記錄(2)DNA片段的電泳鑒定配制瓊脂糖溶液根據(jù)待分離DNA片段的大小,用電泳緩沖液配制瓊脂糖溶液,一般配制質(zhì)量體積比0.8%~1.2%的瓊脂糖溶液。在沸水浴或微波爐內(nèi)加熱至瓊脂糖熔化。稍冷卻后,加入適量的核酸染料混勻。制備凝膠將溫?zé)岬沫傊侨芤貉杆俚谷肽>?,并插入合適大小的梳子,以形成加樣孔。待凝膠溶液完全凝固,小心拔出梳子,取出凝膠放入電泳槽內(nèi)。將電泳緩沖液加入電泳槽中,電泳緩沖液沒過(guò)凝膠1mm為宜。加樣將擴(kuò)增得到的PCR產(chǎn)物與凝膠載樣緩沖液(內(nèi)含指示劑)混合,再用微量移液器將混合液緩慢注入凝膠的加樣孔內(nèi)。留一個(gè)加樣孔加入指示分子大小的標(biāo)準(zhǔn)參照物。電泳觀察記錄(2)DNA片段的電泳鑒定配制瓊脂糖溶液根據(jù)待分離DNA片段的大小,用電泳緩沖液配制瓊脂糖溶液,一般配制質(zhì)量體積比0.8%~1.2%的瓊脂糖溶液。在沸水浴或微波爐內(nèi)加熱至瓊脂糖熔化。稍冷卻后,加入適量的核酸染料混勻。制備凝膠將溫?zé)岬沫傊侨芤貉杆俚谷肽>?,并插入合適大小的梳子,以形成加樣孔。待凝膠溶液完全凝固,小心拔出梳子,取出凝膠放入電泳槽內(nèi)。將電泳緩沖液加入電泳槽中,電泳緩沖液沒過(guò)凝膠1mm為宜。加樣將擴(kuò)增得到的PCR產(chǎn)物與凝膠載樣緩沖液(內(nèi)含指示劑)混合,再用微量移液器將混合液緩慢注入凝膠的加樣孔內(nèi)。留一個(gè)加樣孔加入指示分子大小的標(biāo)準(zhǔn)參照物。電泳接通電源,根據(jù)電泳槽陽(yáng)極至陰極之間的距離來(lái)設(shè)定電壓,一般為1~5V/cm。待指示劑前沿遷移接近凝膠邊緣時(shí),停止電泳。觀察記錄取出凝膠置于紫外燈下觀察和照相。DNA片段的電泳結(jié)果①為避免外源DNA等因素的污染,PCR實(shí)驗(yàn)中使用的微量離心管、槍頭和蒸餾水等在使用前必須進(jìn)行高壓滅菌處理。②該實(shí)驗(yàn)所需材料可以直接從公司購(gòu)買,緩沖液和酶應(yīng)分裝成小份,并在-20℃儲(chǔ)存。使用前,將所需試劑從冰箱拿出,放在冰塊上緩慢融化。③在向微量離心管中添加反應(yīng)組分時(shí),每吸取一種試劑后,移液器上的槍頭都必須更換。④在進(jìn)行操作時(shí),一定要戴好一次性手套。⑤PCR擴(kuò)增不能隨意加大試劑用量。4.操作提示(1)你是否成功擴(kuò)增出DNA片段?判斷的依據(jù)是什么?
可以在紫外燈下直接觀察到DNA條帶的分布及粗細(xì)程度來(lái)評(píng)價(jià)擴(kuò)增的結(jié)果。
若出現(xiàn)一條條帶,表明PCR擴(kuò)增是成功的。5.結(jié)果分析與評(píng)價(jià)
如果擴(kuò)增不成功,可能的原因有:漏加了PCR的反應(yīng)成分,各反應(yīng)成分的用量不當(dāng),PCR程序設(shè)置不當(dāng)?shù)?。如果擴(kuò)增結(jié)果不止一條條帶,可能的原因有:引物設(shè)計(jì)不合理,它們與非目的序列有同源性或容易形成二聚體;復(fù)性溫度過(guò)低;DNA聚合酶的質(zhì)量不好等。5.結(jié)果分析與評(píng)價(jià)(2)如果擴(kuò)增不成功,可能的原因有?如果不止一條條帶,請(qǐng)分析產(chǎn)生這個(gè)結(jié)果的可能原因。1.用PCR方法檢測(cè)轉(zhuǎn)基因植株是否成功導(dǎo)入目的基因時(shí),得到以下電泳圖譜,其中1號(hào)為DNA標(biāo)準(zhǔn)樣液(Marker),10號(hào)為蒸餾水。PCR時(shí)加入的模板DNA如圖所示。據(jù)此做出分析不合理的是(
)A.PCR產(chǎn)物的分子大小在250至500bp之間B.3號(hào)樣品為不含目的基因的載體DNAC.9號(hào)樣品對(duì)應(yīng)植株不是所需的轉(zhuǎn)基因植株D.10號(hào)的電泳結(jié)果能確定反應(yīng)體系等對(duì)實(shí)驗(yàn)結(jié)果沒有干擾B2.下列有關(guān)電泳的敘述,錯(cuò)誤的是(
)
A.電泳是指帶電粒子在電場(chǎng)的作用下發(fā)生遷移的過(guò)程
B.待測(cè)樣品中DNA分子的大小和構(gòu)象、凝膠的濃度等都會(huì)影響DNA
在電泳中的遷移速率
C.進(jìn)行電泳時(shí),帶電分子會(huì)向著與其所帶電荷相同的電極移動(dòng)
D.PCR的產(chǎn)物一般通過(guò)瓊脂糖凝膠電泳來(lái)鑒定C3.下圖為轉(zhuǎn)基因抗凍番茄培育過(guò)程的示意圖(其中ampr為抗氨芐青霉素基因)。下列敘述錯(cuò)誤的是()A.④過(guò)程中可利用目的基因作為探針對(duì)植株進(jìn)行篩選B.可同時(shí)選用限制酶PstI、SmaI對(duì)含目的基因的DNA進(jìn)行剪切C.過(guò)程②可采用農(nóng)桿菌轉(zhuǎn)化法將含目的基因的表達(dá)載體導(dǎo)入受體細(xì)胞D.質(zhì)粒上的抗性基因有利于篩選含目的基因的細(xì)胞和促進(jìn)目的基因的表達(dá)D4.設(shè)計(jì)引物是PCR技術(shù)關(guān)鍵步驟之一。某同學(xué)設(shè)計(jì)的兩組引物(只標(biāo)注了部分堿基序列)都不合理(如下圖),請(qǐng)分別說(shuō)明理由。(1)第1組:
;
第2組:
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