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生物技術(shù)與工程基因工程高中生物二輪復(fù)習(xí)微專題·PCR引物
PCR技術(shù)中“引物”歸類分析新舊教材對比增:①DNA的粗提取與鑒定;②DNA片段的擴(kuò)增及電泳鑒定;③基因工程在食品工業(yè)方面的應(yīng)用。改:①PCR技術(shù)內(nèi)容更充實(shí);②DNA重組技術(shù)改為重組DNA技術(shù);③關(guān)注生物技術(shù)的倫理問題改為關(guān)注生殖性克隆人。淡化:①從基因文庫中獲取目的基因精減為一句話;②農(nóng)桿菌轉(zhuǎn)化法變?yōu)橘Y料卡考點(diǎn)由高考知核心知識點(diǎn)預(yù)測基因工程的基本工具和基本操作程序考點(diǎn)一:重組DNA技術(shù)的基本工具(3年12考,全國卷3年1考)2024·貴州(選擇題)、2024·湖南(選擇題)2024·江西(解答題)、2023·湖北(選擇題)2022·湖南(選擇題)題型:選擇題、解答題內(nèi)容:考基因工程是選修教材中的重點(diǎn)考察內(nèi)容之一,基因工程的基本操作程序、蛋白質(zhì)工程的原理是重高頻考點(diǎn),山東卷北京卷廣東卷兼顧了實(shí)驗(yàn)“DNA的粗提取與鑒定”??键c(diǎn)二:基因工程的基本操作程序(3年40考,全國卷3年3考)2024·福建(選擇題)、2024·海南(解答題)2024·重慶(解答題)、2024·貴州(解答題)2024·江西(解答題)、2024·北京(解答題)2024·浙江(解答題)、2024·湖南(解答題)2024·吉林(解答題)、2024·全國(選擇題)2024·寧夏(解答題)、2024·安徽(解答題)2023·江蘇(選擇題)、2023·廣東(選擇題)2022·北京(選擇題)、2022·山東(選擇題)考點(diǎn)三:DNA的粗提取與鑒定和DNA片段的
擴(kuò)增與電泳鑒定(3年9考,全國卷3年0考)考情分析高中生物二輪復(fù)習(xí)微專題·PCR引物
PCR技術(shù)中“引物”歸類分析01引物存在的必要性02引物的設(shè)計0304PCR循環(huán)時與引物相關(guān)的計算引物的選擇和互補(bǔ)鏈的判斷PCR技術(shù)中“引物”歸類分析05引物與PCR反應(yīng)時復(fù)性溫度和時間的關(guān)系1.1DNA的復(fù)制需要引物
DNA聚合酶只能催化脫氧核糖核苷酸加至已有核酸鏈的游離3'-羥基上,而不能使脫氧核糖核苷酸自身發(fā)生聚合,即它需要引物鏈的存在。引物是一小段DNA或RNA,它能與DNA母鏈的一段堿基互補(bǔ)配對。細(xì)胞內(nèi)DNA復(fù)制以RNA作引物,從新合成的岡崎片段上發(fā)現(xiàn)含有一短暫存在的小的RNA片段附著在5'端這一事實(shí),可說明DNA復(fù)制時需要RNA引物,這些引物長5~10bp,現(xiàn)已知RNA引物的合成是由一種特殊的RNA合成酶——引物酶所催化的。PCR反應(yīng)以DNA作引物。1.引物存在的必要性DNA的復(fù)制需要引物例1(2011年江蘇卷)請回答基因工程方面的有關(guān)問題;PCR反應(yīng)體系中含有熱穩(wěn)定DNA聚合酶,下面的表達(dá)式不能正確反映DNA聚合酶的功能,這是因?yàn)開_____________。1.引物存在的必要性答案:DNA聚合酶不能從頭開始合成DNA,而只能將單個脫氧核苷酸連續(xù)結(jié)合至雙鏈DNA片段的引物鏈上。引物的作用DNA聚合酶不能從頭開始合成DNA,只能從3'端延伸DNA鏈。當(dāng)引物與DNA母鏈通過堿基互補(bǔ)配對結(jié)合后,DNA聚合酶就能從引物的3'端開始延伸DNA鏈。不同的引物可結(jié)合不同的目的基因并進(jìn)行擴(kuò)增。例2.請回答基因工程方面的有關(guān)問題:(1)若用PCR技術(shù)擴(kuò)增psy基因和crtI基因,需要分別在不同的PCR擴(kuò)增儀中加入__種引物,其作用是_________________________。(2)在利用PCR技術(shù)擴(kuò)增R(抗旱)或
r
基因過程中,利用_______可尋找抗旱基因的位置并進(jìn)行擴(kuò)增。(3)通過PCR技術(shù)可在總cDNA中專一性的擴(kuò)增出Wx基因的cDNA,原因是_________________________。1.引物存在的必要性答案∶(1)2;引物與DNA模板鏈通過堿基互補(bǔ)配對結(jié)合,使DNA聚合酶從引物的3‘端開始連接脫氧核苷酸,從而延伸DNA子鏈;(2)引物。(3)引物是根據(jù)Wx基因的一段已知序列設(shè)計合成的
2.引物的設(shè)計例1.引物的結(jié)合方向(二輪復(fù)習(xí)資料P124)如圖為X蛋白的部分基因序列,所示序列為引物結(jié)合的部分,據(jù)圖分析:擴(kuò)增X蛋白基因所需的引物序列是_________________________________;______________________________。5′-ATGCCGTAAGTCCTAC-3′5′-TGATCTACGGCTTACA-3′書寫引物序列,一般從引物的5′端向3′端書寫,避免誤判。圖中位于上方的模板鏈5′端磷酸基團(tuán)在左側(cè),3′端羥基在右側(cè),可知與上方模板鏈配對的引物5′端在右側(cè),3′端在左側(cè),引物序列為5′-TGATCTACGGCTTACA-3′。同理推測另外一條引物的序列。例2.引物的修飾(二輪復(fù)習(xí)資料P124)(1)(2022·山東,25節(jié)選)某種類型的白血病由蛋白P引發(fā),蛋白UBC可使P被蛋白酶識別并降解,藥物A可通過影響這一過程對該病起到治療作用。為探索藥物A治療該病的機(jī)理,需構(gòu)建重組載體以獲得融合蛋白FLAG-P和FLAG-PΔ。PΔ是缺失特定氨基酸序列的P,F(xiàn)LAG是一種短肽,連接在P或PΔ的氨基端,使融合蛋白能與含有FLAG抗體的介質(zhì)結(jié)合,但不影響P或PΔ的功能。①為構(gòu)建重組載體,需先設(shè)計引物,通過PCR特異性擴(kuò)增P基因。用于擴(kuò)增P基因的引物需滿足的條件是_________________________________________________________,為使PCR產(chǎn)物能被限制酶切割,需在引物上添加相應(yīng)的限制酶識別序列,該限制酶識別序列應(yīng)添加在引物的______(填“3′端”或“5′端”)。能與P基因模板鏈3′端的一段堿基序列互補(bǔ)配對的短單鏈核酸5′端②PCR擴(kuò)增得到的P基因經(jīng)酶切連接插入載體后,與編碼FLAG的序列形成一個融合基因,如圖所示,其中“ATGTGCA”為P基因編碼鏈起始序列。將該重組載體導(dǎo)入細(xì)胞后,融合基因轉(zhuǎn)錄出的mRNA序列正確,翻譯出的融合蛋白中FLAG的氨基酸序列正確,但P基因?qū)?yīng)的氨基酸序列與P不同。據(jù)圖分析,出現(xiàn)該問題的原因是__________________________________________________________________________________________________。修改擴(kuò)增P基因時使用的帶有EcoR
Ⅰ識別序列的引物來解決該問題,具體修改方案是__________________________________________。P基因編碼鏈的第一個堿基與EcoRⅠ識別序列的最后兩個堿基編碼一個氨基酸,導(dǎo)致mRNA的密碼子被錯位讀取在引物中的EcoRⅠ識別序列3′端添加1個堿基引物的處理由于引物延伸從3'端開始,3'端不能進(jìn)行任何修飾,引物5'端對擴(kuò)增特異性影響不大,因此,可給予修飾而不影響擴(kuò)增特異性。引物5'端修飾包括加酶切位點(diǎn)、標(biāo)記生物素、熒光等。為了使經(jīng)PCR擴(kuò)增的目的基因能與運(yùn)載體正常結(jié)合,需要在2種引物的5'端添加不同的限制酶的識別序列。在2種引物的5'端上添加不同的限制酶識別序列,是為了保證目的基因定向插入運(yùn)載體并可避免目的基因自身環(huán)化。2.引物的設(shè)計例5(2018年江蘇卷)為生產(chǎn)具有特定性能的α-淀粉酶,研究人員從某種海洋細(xì)菌中克隆了α-淀粉酶基因(1656個堿基對),利用基因工程大量制備α-淀粉酶。為了便于擴(kuò)增的DNA片段與表達(dá)載體連接,需在引物的____端加上限制性酶切位點(diǎn),且常在2條引物上設(shè)計加入不同的限制性酶切位點(diǎn),主要目的是________________。使DNA片段能定向插入表達(dá)載體,減少自連。5'3.引物的選擇和互補(bǔ)鏈的判斷DNA聚合酶只能特異性地復(fù)制處于2個引物之間的DNA序列,引物5'端的堿基與DNA母鏈3'端的堿基進(jìn)行堿基互補(bǔ)配對,可作為DNA復(fù)制的起始點(diǎn),DNA子鏈的合成方向是從引物的5'端向3'端延伸??衫眠@一特點(diǎn)判斷引物及引物的互補(bǔ)鏈。例8(2016年江蘇卷)為了篩選出轉(zhuǎn)入了重組質(zhì)粒的大腸桿菌,應(yīng)在篩選平板培養(yǎng)基中添加四環(huán)素,平板上長出的菌落,常用PCR鑒定,所用的引物組成為圖7中的
。引物甲和引物丙例9.下圖是為了擴(kuò)增某目的基因所用引物的分布示意圖(圖8),已知引物組合1和2、3和4可擴(kuò)增相關(guān)的目的基因,則引物1、3與______(填α鏈或β鏈)形成堿基互補(bǔ)配對關(guān)系。β鏈
4.引物的數(shù)量計算(二論復(fù)習(xí)資料P124)(1)如圖:一個DNA分子n次擴(kuò)增,則:①子代DNA分子中等長鏈的DNA分子數(shù)為________個;②子代DNA分子中不等長鏈的DNA分子數(shù)為_____個;③子代DNA分子中含模板鏈DNA分子數(shù)為_____個;④子代DNA分子中含引物A(或B)的DNA分子數(shù)為________個;⑤復(fù)制過程中共需引物________個;⑥第n次復(fù)制需要引物______個。2n-2n2n22n-12n+1-22n(2)已知引物1及引物2之間的序列為目的序列,若引物與DNA的結(jié)合位點(diǎn)如圖所示,在第_____輪循環(huán)產(chǎn)物中開始出現(xiàn)兩條單鏈等長的目的片段。24.引物的數(shù)量計算(2)引物用PCR技術(shù)將DNA分子中的A1片段進(jìn)行擴(kuò)增,設(shè)計了引物Ⅰ、Ⅱ,其連接部位如圖所示,X為某限制酶識別序列。擴(kuò)增后得到的絕大部分DNA片段是圖中的在第一次PCR循環(huán)結(jié)束后,得到以引物Ⅱ延長得到的單鏈。在以后的PCR循環(huán)中,以引物Ⅱ所形成的單鏈為模板在引物Ⅰ的作用下合成DNA時,引物Ⅱ上的X片段也被作為模板合成子鏈。因?yàn)閮蓷l引物間的片段以指數(shù)倍數(shù)擴(kuò)增,實(shí)驗(yàn)結(jié)束得到的絕大部分DNA片段是選項中的D?!?.引物與PCR反應(yīng)時復(fù)性溫度和時間的關(guān)系PCR的每次循環(huán)可分為3步:變性(90~95℃)復(fù)性(55~60℃)延伸(70~75℃)變性的溫度與目的基因中G+C含量有關(guān);變性時間的長短與目的基因的長短有關(guān),目的基因越長,變性的時間就越長。復(fù)性是讓2種引物通過堿基互補(bǔ)配對與2條單鏈DNA結(jié)合,復(fù)性的溫度與引物中G+C含量有關(guān),G-C堿基對間有3個氫鍵,A-T堿基對間只有2個氫鍵,引物中G+C含量較高,復(fù)性時溫度就較高;復(fù)性時間的長短與引物的長短有關(guān),引物越長,復(fù)性的時間就越長。延伸的溫度不能太高,以防止新合成的子鏈DNA與母鏈DNA解聚為單鏈,延伸的溫度也不能太低,是為了保證Taq酶的活性;延伸所需要的時間長短與目的基因的長短有關(guān),目的基因越長,延伸所需要的時間就越長。(2)(經(jīng)典高考題節(jié)選)設(shè)計引物時需要避免引物之間發(fā)生_____________,而造成引物自連。同理也要避免引物之間的互補(bǔ)。復(fù)性溫度的設(shè)定與引物長度、堿基組成有關(guān),長度相同且____________的引物需要設(shè)定更高的復(fù)性溫度。P124堿基互補(bǔ)配對G、C含量高5.引物與PCR反應(yīng)時復(fù)性溫度和時間的關(guān)系(3)科學(xué)設(shè)計引物是PCR能否成功的關(guān)鍵,若引物的堿基過多或引物的G、C含量過高,會造成PCR的效率偏低,收獲的目的基因較少,原因是_______________________________________________________________。若對PCR產(chǎn)物進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳檢測,結(jié)果發(fā)現(xiàn)有兩個或多個條帶,從引物角度分析,原因可能是_____________________________。P124引物與模板鏈結(jié)合過于緊密,變性時引物不易與模板鏈脫離(影響變性)引物過短導(dǎo)致引物的特異性下降5.引物與PCR反應(yīng)時復(fù)性溫度和時間的關(guān)系拓展
引物與復(fù)性溫度P124(1)復(fù)性溫度:復(fù)性溫度高,擴(kuò)增特異性強(qiáng);復(fù)性溫度低,擴(kuò)增效率高。(2)引物:①引物長度越長,越容易形成氫鍵,為避免出現(xiàn)錯配,需要適當(dāng)提高復(fù)性溫度;②引物GC含量越高,容易出現(xiàn)非特異性結(jié)合,需要適當(dāng)提高復(fù)性溫度。5.引物與PCR反應(yīng)時復(fù)性溫度和時間的關(guān)系例10(2008年江蘇卷)將動物致病菌的抗原基因?qū)腭R鈴薯制成植物疫苗,飼喂轉(zhuǎn)基因馬鈴薯可使動物獲得免疫力。以下是與植物疫苗制備過程相關(guān)的圖和表。PCR過程中退火(復(fù)性)溫度必須根據(jù)引物的堿基數(shù)量和種類設(shè)定。表1為根據(jù)模板設(shè)計的2對引物序列,圖9為引物對與模板結(jié)合示意圖。請判斷哪一對引物可采用較高的退火溫度?例11,請回答PCR擴(kuò)增時與退火溫度、延伸溫度與延伸時間有關(guān)的問題∶(1)(2018年江蘇卷)進(jìn)行PCR擴(kuò)增時
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