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1、多聚酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)PCR,一、實(shí)驗(yàn)原理:,PCR又稱多聚酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng),是一種體外酶促合成特異DNA片段的方法,主要由 高溫變性、低溫退火和適溫延伸三個(gè)步驟反復(fù)的熱循環(huán)構(gòu)成:即在高溫下, 待擴(kuò)增的靶DNA雙鏈?zhǔn)軣嶙冃猿蔀閮蓷l單鏈DNA模板;而后在低溫情況下,兩 條人工合成的寡核苷酸引物與互補(bǔ)的單鏈DNA模板結(jié)合,形成部分雙鏈;在 Taq酶的最適溫度(72)下,以引物3端為合成的起點(diǎn),以單核苷酸為原 料,Mg2+存在下,沿模板以53方向延伸,合成DNA新鏈。這樣,每一雙鏈 的DNA模板,經(jīng)過(guò)一次解鏈、退火、延伸三個(gè)步驟的熱循環(huán)后就成了兩條雙鏈 DNA分子。如此反復(fù)進(jìn)行,每一次循環(huán)所產(chǎn)生的DNA均能成為下
2、一次循環(huán)的模 板,每一次循環(huán)都使兩條人工合成的引物間的DNA特異區(qū)拷貝數(shù)擴(kuò)增一倍, PCR產(chǎn)物得以指數(shù)形式迅速擴(kuò)增,經(jīng)過(guò)2530個(gè)循環(huán)后,理論上可使基因 擴(kuò)增數(shù)百萬(wàn)倍。,DNA模板:反應(yīng)中DNA量在50ng200ng左右。且DNA純度較 高, 以增加反應(yīng)特異性。 dNTP:反應(yīng)體系中達(dá)100M200M。 Mg2+:Mg2+是Taq酶的輔基濃度在2.0mM左右,濃度太低 Taq酶活力降低;太高反應(yīng)特異性降低。 引物:根據(jù)目的基因兩側(cè)特定序列設(shè)計(jì)。引物約20堿基 左右;G+C含量在4070之間;引物內(nèi)部不能有回該 序列;引物端不能互補(bǔ)。 Taq酶:它是從嗜熱桿菌中提取的耐熱性聚合酶,在95時(shí)30分
3、鐘還有50活力。,說(shuō)明,PCR過(guò)程示意圖,二、實(shí)驗(yàn)所需器材和試劑 器材: 臺(tái)式高速離心機(jī),恒溫水浴鍋,PCR擴(kuò)增儀,瓊脂糖 凝膠電泳系統(tǒng),凝膠成像系統(tǒng),Eppendorf離心管, PCR小管,試劑: 引物1,引物2,dNTP mix,10X PCR Buffer, Taq DNA 聚合酶,EB,上樣緩沖液,marker,瓊 脂糖,TBE緩沖液,三、實(shí)驗(yàn)步驟,1:加樣 按次序在PCR小管中加入下列試劑(50ul體系): 5ul 10X PCR Buffer 4ul dNTP mix 2ul 引物1 2ul 引物2 3ul 模板 1ul Taq DNA polymerase 加水到總體積50ul,注意事項(xiàng):同時(shí)設(shè)立對(duì)照組(對(duì)照組不加模板DNA),2、按以下參數(shù)進(jìn)行PCR擴(kuò)增(對(duì)于不同的PCR反應(yīng)應(yīng)設(shè)置不同的反應(yīng)條件) 94 4分鐘 94 30秒 51 30秒 進(jìn)行30個(gè)循環(huán) 72 30秒 72 5分鐘 4,將實(shí)驗(yàn)組與對(duì)照組放入PCR儀,按設(shè)定好的條件進(jìn)行擴(kuò)增,3、擴(kuò)增結(jié)束后,取5ul產(chǎn)物進(jìn)行
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