Pubmed檢索方法課件分享

1、pubmed檢索方法(課件分享)作者：作者：dr.fengdr.fengpubmed檢索方法(課件分享)pubmed檢索方法(課件分享)2pubmed pubmed檢索方法(課件分享)3 pubmed是美國(guó)是美國(guó)nlm所屬的國(guó)家生物技術(shù)信息中心所屬的國(guó)家生物技術(shù)信息中心（ncbi）開發(fā)的一個(gè)以開發(fā)的一個(gè)以web方式向用戶提供服務(wù)的生物醫(yī)方式向用戶提供服務(wù)的生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)檢索系統(tǒng)，學(xué)文獻(xiàn)檢索系統(tǒng)，是是pubmed檢索方法(課件分享)4出版商提供的書目信息出版商提供的書目信息 premedlineoldmedline(1950-1965)medlinepubmed檢索方法(課件分享)5l收錄范圍：收

2、錄范圍：來(lái)源于美國(guó)和世界上來(lái)源于美國(guó)和世界上7070多個(gè)國(guó)家和地區(qū)、多個(gè)國(guó)家和地區(qū)、5050種語(yǔ)言種語(yǔ)言的的7395種種(截止到現(xiàn)在截止到現(xiàn)在)權(quán)威權(quán)威生物醫(yī)學(xué)生物醫(yī)學(xué)及相關(guān)學(xué)科期刊，內(nèi)容涉及及相關(guān)學(xué)科期刊，內(nèi)容涉及生物醫(yī)學(xué)各個(gè)領(lǐng)域；生物醫(yī)學(xué)各個(gè)領(lǐng)域；85%以上以上原文為英語(yǔ)，原文為英語(yǔ)，80%記錄有文摘，記錄有文摘，5%免費(fèi)全文。目前記錄已達(dá)約免費(fèi)全文。目前記錄已達(dá)約2200萬(wàn)條，約萬(wàn)條，約40萬(wàn)篇萬(wàn)篇/年年 。l回溯時(shí)間：回溯時(shí)間：1966年至今年至今。l記錄中有記錄中有indexed for medlien標(biāo)記標(biāo)記pubmed檢索方法(課件分享)6l學(xué)科范圍學(xué)科范圍：l基礎(chǔ)生命科學(xué)基礎(chǔ)生

3、命科學(xué)臨床生命科學(xué)臨床生命科學(xué) l生物科學(xué)生物科學(xué) 解剖學(xué)解剖學(xué)l組織學(xué)組織學(xué)化學(xué)與藥物化學(xué)與藥物l心理學(xué)心理學(xué)社會(huì)醫(yī)學(xué)社會(huì)醫(yī)學(xué)l農(nóng)業(yè)農(nóng)業(yè) 醫(yī)技設(shè)備學(xué)醫(yī)技設(shè)備學(xué) l醫(yī)技工業(yè)學(xué)醫(yī)技工業(yè)學(xué) 醫(yī)學(xué)信息學(xué)醫(yī)學(xué)信息學(xué)使用詞表：使用詞表：mesh（醫(yī)學(xué)主題詞表）（醫(yī)學(xué)主題詞表）pubmed檢索方法(課件分享)7l 是一種由是一種由正在加工處理正在加工處理中的文獻(xiàn)記錄組成的數(shù)據(jù)庫(kù)，這些中的文獻(xiàn)記錄組成的數(shù)據(jù)庫(kù)，這些新記錄還未被或正在標(biāo)引，暫時(shí)存放在新記錄還未被或正在標(biāo)引，暫時(shí)存放在premedline數(shù)據(jù)庫(kù)數(shù)據(jù)庫(kù)中。中。每天更新每天更新，經(jīng)過(guò)標(biāo)引（增加主題詞、文獻(xiàn)類型、數(shù)據(jù)庫(kù)存，經(jīng)過(guò)標(biāo)引（增加主題詞、文獻(xiàn)類

4、型、數(shù)據(jù)庫(kù)存取號(hào)等字段）以后轉(zhuǎn)入取號(hào)等字段）以后轉(zhuǎn)入medline，一旦記錄被轉(zhuǎn)入到一旦記錄被轉(zhuǎn)入到medline數(shù)據(jù)庫(kù)，就被從數(shù)據(jù)庫(kù)，就被從premedline數(shù)據(jù)庫(kù)中刪除。數(shù)據(jù)庫(kù)中刪除。記錄中有記錄中有pubmed-in process的標(biāo)記。的標(biāo)記。pubmed檢索方法(課件分享)8pre-medline最新信息最新信息medlinenew datacollectprocess一周以后一周以后pubmed檢索方法(課件分享)9 出版商提供的書目出版商提供的書目信息（信息（publisher-supplied citation ） 出版商直接向出版商直接向pubmed提供的非提供的非med

5、line收錄的電子刊物，收錄的電子刊物，記錄標(biāo)有記錄標(biāo)有record as supplied by publishers標(biāo)記。（如：標(biāo)記。（如：science或或nature中的地質(zhì)學(xué)文獻(xiàn)等）。中的地質(zhì)學(xué)文獻(xiàn)等）。 pubmed檢索方法(課件分享)10標(biāo)記不同，出自分庫(kù)亦不同標(biāo)記不同，出自分庫(kù)亦不同pubmed檢索方法(課件分享)11nucleotide：dna序列數(shù)據(jù)庫(kù)序列數(shù)據(jù)庫(kù)protein：蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫(kù)蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫(kù)genome：基因組序列數(shù)據(jù)庫(kù)基因組序列數(shù)據(jù)庫(kù)structure：分子結(jié)構(gòu)模型數(shù)據(jù)庫(kù)分子結(jié)構(gòu)模型數(shù)據(jù)庫(kù)omim：人類孟德爾遺傳學(xué)在線數(shù)據(jù)庫(kù)人類孟德爾遺傳學(xué)在線數(shù)據(jù)庫(kù)pm

6、c: pubmed中心，免費(fèi)中心，免費(fèi)全文期刊檢索全文期刊檢索pubmed檢索方法(課件分享)123.特點(diǎn)特點(diǎn)l獲取生物醫(yī)學(xué)權(quán)威期刊最多 世界上70多個(gè)國(guó)家的7395種權(quán)威期刊l多種檢索方法，多條檢索途徑l時(shí)效性極強(qiáng)(每周更新)l回溯年代久遠(yuǎn)（1950年至今）l利用mesh作為轉(zhuǎn)換詞表，標(biāo)引質(zhì)量高l部分文獻(xiàn)可以免費(fèi)獲取全文l檢全率、檢準(zhǔn)率高pubmed檢索方法(課件分享)13免費(fèi)進(jìn)入免費(fèi)進(jìn)入pubmedpubmed途徑：途徑： pubmed檢索方法(課件分享)14l主頁(yè)結(jié)構(gòu)主頁(yè)結(jié)構(gòu)pubmed檢索方法(課件分享)15pubmed檢索方法(課件分享)16pubmed檢索方法(課件分享)17pub

7、med提供了詞匯自動(dòng)轉(zhuǎn)換功能：提供了詞匯自動(dòng)轉(zhuǎn)換功能： mesh轉(zhuǎn)換表轉(zhuǎn)換表期刊轉(zhuǎn)換表期刊轉(zhuǎn)換表短語(yǔ)表短語(yǔ)表作者姓名索引作者姓名索引邏輯運(yùn)算符檢索邏輯運(yùn)算符檢索pubmed檢索方法(課件分享)18pubmed檢索方法(課件分享)19（1）邏輯運(yùn)算符： or、and、not 運(yùn)算順序：orandnot，可用（）改變檢索詞的處理順序。（2）截詞符：*。eg: cell*：cell、cells、celliferous、cellophane和cellular等詞的文獻(xiàn)。（3）利用字段標(biāo)識(shí)符進(jìn)行限定檢索： 檢索式格式：檢索詞a字段標(biāo)識(shí)b，檢索在字段中含有檢索詞a的文獻(xiàn)。 如： hepatitisti，s

8、mith au，cellta。（4）“ ”，將短語(yǔ)做為不可分割的整體進(jìn)行檢索。 如：“oxygen free radicals ”注意：注意：and 必須大寫、必須大寫、 和和“ ”必須為英文或中文半角。必須為英文或中文半角。pubmed檢索方法(課件分享)20pubmed簡(jiǎn)單檢索實(shí)例簡(jiǎn)單檢索實(shí)例例一例一 查找有關(guān)查找有關(guān)“肝癌和肝炎的關(guān)系肝癌和肝炎的關(guān)系”的文獻(xiàn)，英文的文獻(xiàn)，英文 “l(fā)iver cancer ” 和和 “hepatitis” pubmed檢索方法(課件分享)21檢索結(jié)果顯示檢索結(jié)果顯示顯示檢索策略顯示檢索策略pubmed檢索方法(課件分享)22pubmed檢索方法(課件分享)

9、23l例二例二 查找作者查找作者 hemila h著作的文獻(xiàn)著作的文獻(xiàn)在西文文獻(xiàn)里，著者的署名一般名在前姓在后，在西文文獻(xiàn)里，著者的署名一般名在前姓在后，例例:著者著者“henry hemila”應(yīng)轉(zhuǎn)換成應(yīng)轉(zhuǎn)換成“ hemila h”,后加著者字段限定來(lái)檢索，后加著者字段限定來(lái)檢索，注意：姓在前，名在后注意：姓在前，名在后 姓全稱，名縮寫姓全稱，名縮寫pubmed檢索方法(課件分享)24pubmed檢索方法(課件分享)25pubmed檢索方法(課件分享)26pubmed檢索方法(課件分享)27檢索框檢索框預(yù)覽預(yù)覽檢索史檢索史限定檢索限定檢索30個(gè)字段pubmed檢索方法(課件分享)28limi

10、ts （限定）限定）publication types：有有7種類型種類型languages：提供常用的提供常用的7種語(yǔ)種種語(yǔ)種ages：共有共有13個(gè)年齡段個(gè)年齡段gender：男性、女性男性、女性human or animalsubsets（子集）：子集）：11個(gè)主要子集個(gè)主要子集dates：可檢索可檢索1965年至今的文獻(xiàn)年至今的文獻(xiàn)pubmed檢索方法(課件分享)29限定檢索限定檢索索引檢索索引檢索pubmed檢索方法(課件分享)30pubmed高級(jí)高級(jí)檢索實(shí)例檢索實(shí)例 例例: : 查找關(guān)于查找關(guān)于“鋅對(duì)于鋅對(duì)于2歲歲嬰兒嬰兒（即出生至（即出生至23個(gè)月）個(gè)月）成長(zhǎng)的作用成長(zhǎng)的作用”（

11、要求時(shí)間（要求時(shí)間200020020002008 8）的英文文獻(xiàn)）的英文文獻(xiàn) 步驟一，確定關(guān)鍵詞步驟一，確定關(guān)鍵詞zinc infant growth，把它們輸入檢索框。把它們輸入檢索框。 pubmed檢索方法(課件分享)31 步驟二，限定時(shí)間。點(diǎn)擊步驟二，限定時(shí)間。點(diǎn)擊。在其中的。在其中的publication date的輸入框內(nèi)輸入的輸入框內(nèi)輸入from2000 to2008 . 步驟三，限定語(yǔ)種。在步驟三，限定語(yǔ)種。在languages下拉菜單內(nèi)選擇下拉菜單內(nèi)選擇english。pubmed檢索方法(課件分享)32pubmed檢索方法(課件分享)33pubmed檢索方法(課件分享)34l

12、mesh database：l例例1：從主題途徑查找：從主題途徑查找fk506副作用副作用l例例2：從主題途徑查找從主題途徑查找腎移植腎移植的文獻(xiàn)的文獻(xiàn)l例例3：從主題途徑查找阿司匹林治療高血壓的文獻(xiàn)：從主題途徑查找阿司匹林治療高血壓的文獻(xiàn)pubmed檢索方法(課件分享)35l檢索流程檢索流程l第一步：主題分析第一步：主題分析 英文轉(zhuǎn)換英文轉(zhuǎn)換lfk506 adverse effectslkidney transplantation點(diǎn)擊點(diǎn)擊mesh database mesh界面界面 輸入檢索詞輸入檢索詞 gopubmed檢索方法(課件分享)36pubmed檢索方法(課件分享)37fk506p

13、ubmed檢索方法(課件分享)38第二步：第二步：選定該主題詞選定該主題詞 主題詞輪排表主題詞輪排表點(diǎn)擊該主題詞點(diǎn)擊該主題詞 主題詞細(xì)節(jié)屏主題詞細(xì)節(jié)屏 pubmed檢索方法(課件分享)39主題詞輪排主題詞輪排提示相關(guān)詞提示相關(guān)詞主題詞輪排表主題詞輪排表pubmed檢索方法(課件分享)40第三步：第三步：主題詞細(xì)節(jié)屏主題詞細(xì)節(jié)屏（主題詞詞義注釋、副主題詞、加權(quán)或不擴(kuò)展、主題詞詞義注釋、副主題詞、加權(quán)或不擴(kuò)展、入口詞、曾用詞、樹狀結(jié)構(gòu)）入口詞、曾用詞、樹狀結(jié)構(gòu)） 選擇合適的副主題詞選擇合適的副主題詞選擇加權(quán)或不擴(kuò)展選擇加權(quán)或不擴(kuò)展 send to pubmed檢索方法(課件分享)41主題詞細(xì)節(jié)屏主

14、題詞細(xì)節(jié)屏主題詞詞義注釋主題詞詞義注釋主題詞細(xì)節(jié)屏主題詞細(xì)節(jié)屏副主題詞選擇副主題詞選擇主題詞詞義注釋主題詞詞義注釋加權(quán)檢索加權(quán)檢索不擴(kuò)展檢索不擴(kuò)展檢索pubmed檢索方法(課件分享)42曾用詞曾用詞藥理作用藥理作用樹狀結(jié)構(gòu)樹狀結(jié)構(gòu)曾用詞曾用詞入口詞入口詞樹狀結(jié)構(gòu)樹狀結(jié)構(gòu)藥理作用藥理作用pubmed檢索方法(課件分享)43 選擇發(fā)送方式選擇發(fā)送方式search box with andsearch box with orsearch box with not pubmed檢索方法(課件分享)44第四步：第四步：search box 點(diǎn)擊點(diǎn)擊 search pubmed 檢索結(jié)果檢索結(jié)果pubme

15、d檢索方法(課件分享)45search boxpubmed檢索方法(課件分享)46題錄格式界面題錄格式界面pubmed檢索方法(課件分享)47邏輯組配（邏輯組配（#4 and #6）pubmed檢索方法(課件分享)48pubmed檢索方法(課件分享)49l例：檢索利用阿司匹林治療高血壓的文獻(xiàn)。例：檢索利用阿司匹林治療高血壓的文獻(xiàn)。l分析：本課題包含兩個(gè)主題詞，即阿司匹林（分析：本課題包含兩個(gè)主題詞，即阿司匹林（aspirin)aspirin)和高血和高血壓壓(hypertension)(hypertension)，阿司匹林（，阿司匹林（aspirin) aspirin) 組配副主題詞治療組配副

16、主題詞治療應(yīng)用（應(yīng)用（theraputic use)theraputic use)，高血壓應(yīng)組配副主題詞藥物療法，高血壓應(yīng)組配副主題詞藥物療法（drug therapy)drug therapy)，兩條檢索式之間用，兩條檢索式之間用andand聯(lián)接。聯(lián)接。pubmed檢索方法(課件分享)50 pubmed主題詞檢索的功能：主題詞檢索的功能： （1）理解詞義和收入詞表的時(shí)間）理解詞義和收入詞表的時(shí)間 （2）限定副主題詞限定副主題詞 ，提高查準(zhǔn)率。提高查準(zhǔn)率。 （3 3）加權(quán)檢索加權(quán)檢索，提高查準(zhǔn)率。提高查準(zhǔn)率。 （4）了解樹形結(jié)構(gòu)了解樹形結(jié)構(gòu), ,擴(kuò)展檢索，擴(kuò)展檢索，提高查全率提高查全率 （5

17、5）了解同義詞，提高查全率。）了解同義詞，提高查全率。 pubmed檢索方法(課件分享)51pubmed檢索方法(課件分享)52pubmed檢索方法(課件分享)53ljournal database (期刊數(shù)據(jù)庫(kù)期刊數(shù)據(jù)庫(kù))l 可輸入刊名全稱、縮寫或國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)期刊號(hào)（issn)檢索特定期刊的編目信息；pubmed檢索方法(課件分享)54l檢索： pubmed中收錄關(guān)于高血壓(hypertension)的期刊有哪些？pubmed檢索方法(課件分享)55pubmed檢索方法(課件分享)56l引文匹配器（single citation matcher） nursing，2008，38（12）：61 p

18、ubmed檢索方法(課件分享)57pubmed pubmed檢索方法(課件分享)58 1、檢索結(jié)果的顯示與標(biāo)記 2、檢索結(jié)果的保存及定購(gòu) pubmed檢索方法(課件分享)59檢索結(jié)果顯示檢索結(jié)果顯示默認(rèn)為題錄格式默認(rèn)為題錄格式每頁(yè)顯示每頁(yè)顯示20條記錄條記錄結(jié)果顯示格式結(jié)果顯示格式每頁(yè)顯示記錄數(shù)每頁(yè)顯示記錄數(shù)結(jié)果排序方式結(jié)果排序方式pubmed檢索方法(課件分享)60純文本方式顯示pubmed檢索方法(課件分享)61純文本顯示記錄純文本顯示記錄pubmed檢索方法(課件分享)62文摘顯示格式文摘顯示格式pubmed檢索方法(課件分享)63medline格式格式pubmed檢索方法(課件分享)64可鏈接到可鏈接到springerlink數(shù)據(jù)庫(kù)數(shù)據(jù)庫(kù)獲取全文獲取全文 ，但是是收費(fèi)但是是收費(fèi)的的可鏈接到可鏈接到pubmed中中心獲取免費(fèi)全文心獲取免費(fèi)全文 全文鏈接圖標(biāo)全文鏈接圖標(biāo)pubmed檢索方法(課件分享)65選擇選擇“file”，可完成將記錄可完成將記錄保存為文件；保存為文件；選擇選擇“clipboard”，可將記錄保存可將記錄保存在剪貼板；在剪貼板；選擇選擇“e-mail”,可以通過(guò)郵件可以通過(guò)郵件發(fā)送記錄發(fā)送記錄pubmed檢索方法(課件分享)66剪切板靜止?fàn)顟B(tài)下最長(zhǎng)保存