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文檔簡介
1、stata制作or/rr的95%ci森林圖,及橫坐標x軸調(diào)整,如何產(chǎn)生長短不均坐標軸最近在做危險因素or的森林圖,stata效果較好。但也遇到問題,如一些文獻中橫坐標x 軸坐標尺不一樣,如何調(diào)整,論壇里一直每一找到這方面太多的解釋,但在公衛(wèi)人里面的 peking.sky里面提到了這個問題的解決方法。壇里有朋友說是對數(shù)轉(zhuǎn)換,是正解呀,但沒 有給出步驟。我就來個拋磚引玉吧,跟大家一起學習stata做森林圖,一個采用命令metan; 是用鼠標,即usermeta-analysis下面的選項、一、數(shù)據(jù)步:1. 數(shù)據(jù)中輸入4個變量分別為factor or cll ci2 (分別代表or值,ci下限、ci
2、上限),并輸 入數(shù)值。2. 產(chǎn)生新變量,對數(shù)據(jù)進行對數(shù)轉(zhuǎn)換。程序:gene lnor=ln(or)gene lncil=ln(cll)gene lnci2=ln(ci2)二、作圖步:3. 作圖,我們看到的橫坐標標尺不一樣,即是使用了對數(shù)轉(zhuǎn)換,使用eform這個命令:metan inor incil inci2, eform label(nameva“factor)4. 我們常常在x軸上要添加坐標數(shù)值,常常0.5,1010也要寫上,用xlabel語句,如 xlabel(0.5,1.0,10),數(shù)值可隨意增加和修改,用逗號分開即可;x軸的坐標尺采用xtick命令, xtick只顯示坐標軸下面的小線
3、條即坐標尺,不出現(xiàn)數(shù)值,如xtick(2,3,4,567,8,9)。5. 我們?nèi)绻亲鑫kU因素or的森林圖,那我們常常不需要最后一行stata直接給出的overall, 那就用nooverall,即overall那一行的or不出現(xiàn);不需要出現(xiàn)最右邊加權(quán)項的值,貝!j用noowt; 圖中的or點上有吋候去會看到灰色的大方塊,這個灰色方塊表示權(quán)重的大小,常常不好看, 若不需要顯示則用noboxo好,那綜合這個功能,做or的森林圖程序就是metan inor incil inci2zeform lable(namevar=factor) xlable(o.5z1.0,10) xtick(2,3,4,
4、5,6,7,8,9) nowt no overall n obox若作圖了,我們可以看到橫坐標的標尺是不均衡的,這是由于上面采用了對數(shù)轉(zhuǎn)換的關系。 但是,我們現(xiàn)在一般是采用鼠標點擊usermeta-analysisof binary and continuous進行操 作。在鼠標操作用,若要橫坐標標尺不一致,使用的數(shù)據(jù)必須對數(shù)in轉(zhuǎn)換(用excel或者前面的 gene命令語句),同時在effect選上exponentiate。metan 1.86 meta-analysis of binary & contin.-metan 1.86 meta-analysis of binary &
5、amp; con tin -xx1 metan 1.86 meta-analysis of binary & contin x這是采用了橫坐標對數(shù)轉(zhuǎn)換的圖。(即使用in數(shù)據(jù),和選上effect中的exponentiate的結(jié)果)studyidoddsratio (95% cl)sex1.95 (0.89, 4.25)ageabc1.02(1.00, 1.04)7.79 (4.13, 14.69)1.01 (0.97,1.05)1.08 (1.02, 1.13).51234 5 6 7 89對比一下,如果我們采用原始數(shù)據(jù)or, cll, ci2作圖的話,同時不勾選exponentiate
6、 (下面 這個圖的橫坐標標尺是一致的、等距的)idratio (95% cl)sexageab1.95 (0.89, 4.25) 1.02(1.00f 1.04)7.79 (4.13, 14.69)1.01 (0.97, 1.05) 1.08(1.02, 1.13)這兩個森林圖相比,可能第一個比較方便,尤其是有or的ci比較接近且小時候,第二個等 間距坐標較難看,而且近似一個點。當然第二個森林圖的標記線在x=0處,這是我們不需要 的;我們需要的是x=1出,即在graph opts增加一個null即可;若不寫,此處默認是null(0), 即x=0處。xageabmetan 1.86 meta-analysis of binary & contin.-oddsstudyidratio (95% cl)-/sex 1.95 (0.89,4.25)1.02(1.00, 1.04)7.79 (4.13, 14.69)1.01 (0.97, 1.05)1.08 (1.02,1.13).5 123456789好了,對比這兒張森林圖,我想,關于橫坐標轉(zhuǎn)換,標尺不一致的問題大家應該了解了,核 心就是對原始數(shù)據(jù)對數(shù)轉(zhuǎn)換,寫程序的話,
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