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文檔簡(jiǎn)介
1、蛋白質(zhì)化學(xué)等電點(diǎn)(isoelectric point, pI):當(dāng)氨基酸在溶液中凈電荷為零的pH。在等電點(diǎn)時(shí),氨基酸主要以?xún)尚噪x子形式存在肽鍵(peptide bond):由一個(gè)氨基酸的a-羧基與另一個(gè)氨基酸的a-氨基脫水縮合而形成的化學(xué)鍵。肽:由二個(gè)或兩個(gè)以上氨基酸通過(guò)肽鍵相連而形成的化合物。蛋白質(zhì)的一級(jí)結(jié)構(gòu):指多肽鏈中氨基酸的排列順序與鍵合方式。二級(jí)結(jié)構(gòu):蛋白質(zhì)分子中某一段肽鏈的局部空間結(jié)構(gòu),即該段肽鏈主鏈骨架原子的相對(duì)空間位置,并不涉及氨基酸殘基側(cè)鏈的構(gòu)象。肽單元:參與組成肽鍵的6個(gè)原子位于同一平面,又叫酰胺平面或肽鍵平面。它是蛋白質(zhì)構(gòu)象的基本結(jié)構(gòu)單位。a-螺旋 ( a -helix )
2、 :是蛋白質(zhì)中最常見(jiàn)的一種二級(jí)結(jié)構(gòu),多肽鏈主鏈圍繞中心軸形成右手螺旋-折疊:若干條肽鏈或一條肽鏈的若干肽段平行排列,相鄰肽鏈之間靠氫鍵維持。 超二級(jí)結(jié)構(gòu)(supersecondary struture):蛋白質(zhì)分子中,由若干相鄰的二級(jí)結(jié)構(gòu)單元組合在一起,形成有規(guī)則的、在空間上能辨認(rèn)的二級(jí)結(jié)構(gòu)組合體結(jié)構(gòu)域(domain):在超二級(jí)結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)上組裝成的相對(duì)獨(dú)立的三維實(shí)體。折疊得較為緊密,各行使其功能。蛋白質(zhì)的變性:在某些物理和化學(xué)因素作用下,蛋白質(zhì)分子特定空間構(gòu)象被破壞,導(dǎo)致其理化性質(zhì)改變和生物活性的喪失。復(fù)性:若蛋白質(zhì)變性程度較輕,去除變性因素后,蛋白質(zhì)仍可恢復(fù)或部分恢復(fù)其原有的構(gòu)象和功能。酶化學(xué)
3、全酶:對(duì)結(jié)合酶而言,酶蛋白與輔助因子結(jié)合之后所形成的復(fù)合物,稱(chēng)為全酶,只有全酶才有催化活性,將酶蛋白和輔助因子分開(kāi)后均無(wú)催化作用。全酶 = 酶蛋白 + 輔助因子酶原:某些酶在細(xì)胞內(nèi)合成或初分泌時(shí)沒(méi)有活性,這些沒(méi)有活性的酶的前身稱(chēng)為酶原酸堿催化:通過(guò)瞬時(shí)地向反應(yīng)物提供質(zhì)子或從反應(yīng)物接收質(zhì)子以穩(wěn)定過(guò)渡態(tài)、達(dá)到降低反應(yīng)活化能、加速反應(yīng)的一種催化機(jī)制。共價(jià)催化:通過(guò)與底物形成反應(yīng)活性很高的共價(jià)過(guò)渡物降低反應(yīng)活化能,從而提高反應(yīng)速度的過(guò)程。酶的活性部位:有些必需基團(tuán)雖然在一級(jí)結(jié)構(gòu)上可能相距很遠(yuǎn),但在形成空間結(jié)構(gòu)時(shí)彼此靠近,集中在一起,形成具有一定空間結(jié)構(gòu)的區(qū)域,并能與底物特異地結(jié)合,將底物轉(zhuǎn)化為產(chǎn)物。這
4、一區(qū)域,稱(chēng)為酶的活性部位(Active site)。米氏常數(shù)(Km):反應(yīng)速率達(dá)最大反應(yīng)速率一半時(shí)的底物濃度。單位是:mol/L或mmol/L競(jìng)爭(zhēng)性抑制作用:抑制劑在化學(xué)結(jié)構(gòu)上與底物相似,能與底物競(jìng)爭(zhēng)酶的活性中心,從而阻礙酶-底物復(fù)合物的形成,降低酶促反應(yīng)速度。 此時(shí)這種作用叫做競(jìng)爭(zhēng)性作用。非競(jìng)爭(zhēng)性抑制作用:有些抑制劑可與酶活性中心以外的必需基團(tuán)結(jié)合,不影響酶與底物的結(jié)合,抑制劑和底物可同時(shí)結(jié)合在酶分子上,形成酶-底物-抑制劑復(fù)合物,不能釋放出產(chǎn)物,使酶活性喪失,這種抑制劑稱(chēng)為非競(jìng)爭(zhēng)性抑制劑,這種抑制作用稱(chēng)為非競(jìng)爭(zhēng)性作用。 反競(jìng)爭(zhēng)性抑制作用:抑制劑僅與酶和底物形成的中間產(chǎn)物結(jié)合,使ES的量下降
5、。該抑制劑與單獨(dú)的酶不結(jié)合。這種抑制作用稱(chēng)為反競(jìng)爭(zhēng)性作用。酶的輔助因子:主要包括金屬離子和小分子有機(jī)化合物,在酶促反應(yīng)中主要決定反應(yīng)的種類(lèi)和性質(zhì),在反應(yīng)中起到傳遞電子、原子或某些化學(xué)基團(tuán)的作用。輔酶:把那些與酶蛋白結(jié)合比較松弛,用透析法可以除去的小分子有機(jī)化合物,稱(chēng)為輔酶。輔基:輔基是指以共價(jià)鍵和酶蛋白結(jié)合的小分子有機(jī)物質(zhì),不能通過(guò)透析或超濾的方法除去。激活劑:凡是能提高酶活性的物質(zhì)。抑制劑:能使酶分子的某些必需基團(tuán)發(fā)生變化,從而引起酶活性的下降,甚至消失,使酶反應(yīng)下降的物質(zhì)酶活力(酶活性)是指:酶催化底物化學(xué)反應(yīng)的能力。酶的專(zhuān)一性:絕對(duì)專(zhuān)一性:酶只作用于特定結(jié)構(gòu)的底物,進(jìn)行一種專(zhuān)一的反應(yīng),生
6、成一種特定結(jié)構(gòu)的產(chǎn)物 。相對(duì)專(zhuān)一性:酶作用于一類(lèi)化合物或一種化學(xué)鍵。立體異構(gòu)專(zhuān)一性: 酶僅作用于立體異構(gòu)體中的一種。誘導(dǎo)契合學(xué)說(shuō):該學(xué)說(shuō)認(rèn)為酶與底物相互接近時(shí),其結(jié)構(gòu)相互誘導(dǎo)、相互變形和相互適應(yīng),進(jìn)而相互結(jié)合。中間產(chǎn)物學(xué)說(shuō): 中間產(chǎn)物學(xué)說(shuō)認(rèn)為,酶在催化反應(yīng)時(shí),首先酶與底物形成不穩(wěn)定的中間物,然后再分解成酶與產(chǎn)物。即酶將原來(lái)活化能很高的反應(yīng)分成兩個(gè)活化能較低的反應(yīng)來(lái)進(jìn)行,因而加快了反應(yīng)速率。糖類(lèi)化學(xué)醛糖:一類(lèi)單糖,該單糖中氧化數(shù)最高的C原子(指定為C-1)是一個(gè)醛基酮糖:一類(lèi)單糖,該單糖中氧化數(shù)最高的C原子(指定為C-2)是一個(gè)酮基。變旋現(xiàn)象:一個(gè)旋光溶液放置后其比旋度自行改變的現(xiàn)象。糖苷:?jiǎn)翁?/p>
7、半縮醛上的羥基可與其它含羥基的化合物(醇、酚)縮合失水形成的縮醛衍生物。如杏仁苷、強(qiáng)心苷等,是多種中藥的有效成分。糖苷鍵:一個(gè)糖半縮醛羥基與另一個(gè)分子(例如醇、糖、嘌呤或嘧啶)的羥基、胺基或巰基之間縮合形成的縮醛或縮酮鍵,常見(jiàn)的糖醛鍵有O糖苷鍵和N糖苷鍵。 還原糖:醛糖的半縮醛羥基、酮糖的半縮酮羥基在堿性溶液中具有還原性。所有單糖都是還原糖,易被氧化成酸。常用費(fèi)林試劑判斷還原糖。同多糖:由許多單糖分子或其衍生物縮合而成的高聚物稱(chēng)為多糖,又稱(chēng)為高聚糖??煞譃橥嗵呛彤惗嗵莾深?lèi)。由一種單糖縮合形成的多糖稱(chēng)為同多糖。異多糖:由一種以上單糖縮合形成的多糖稱(chēng)為異多糖。脂類(lèi)物質(zhì)必需脂
8、肪酸:不飽和脂肪酸中亞油酸與亞麻酸人體不能自行合成,必須從食物中攝取,稱(chēng)為必需脂肪酸。磷脂:含磷酸的復(fù)合脂,包括甘油磷脂和神經(jīng)鞘磷酯脂肪酸:脂肪酸(Fatty acid)是一類(lèi)羧酸化合物,由碳?xì)浣M成的烴類(lèi)基團(tuán)連結(jié)羧基所構(gòu)成。三個(gè)長(zhǎng)鏈脂肪酸與甘油形成三酸甘油酯(Triacylglycerols),為脂肪的主要成分。生物膜:是構(gòu)成細(xì)胞所有膜的總稱(chēng),包括圍在細(xì)胞質(zhì)外圍的質(zhì)膜和細(xì)胞器的內(nèi)膜系統(tǒng)。 流動(dòng)鑲嵌模型(Mosaic fluid model):將膜描述為由蛋白質(zhì)在粘滯的流體狀脂質(zhì)雙層中所形成的鑲嵌物。被動(dòng)運(yùn)輸:順濃度梯度,不需要消耗能量的穿膜運(yùn)輸。主動(dòng)運(yùn)輸:物質(zhì)逆濃度梯度的穿膜運(yùn)輸,需消耗代謝能
9、,并需專(zhuān)一性的載體蛋白。如Na+、K+-泵 協(xié)助擴(kuò)散(facilitated diffusion):從高濃度到低濃度(順濃度梯度),需借助載體蛋白的物質(zhì)運(yùn)輸。包括親水性分子如糖、氨基酸等的運(yùn)輸。酸?。禾?然 油 脂 長(zhǎng) 時(shí) 間 暴露在空氣中產(chǎn)生難聞 的氣味,這 種 現(xiàn) 象 稱(chēng) 為 酸 敗。核酸化學(xué)核苷酸:由核苷戊糖上的羥基與磷酸縮合而成的磷酸酯。磷酸二脂鍵:一種化學(xué)基團(tuán),指一分子磷酸與兩個(gè)醇(羥基)酯化形成的兩個(gè)酯鍵DNA雙螺旋:DNA雙螺旋(DNA double helix)是一種核酸的構(gòu)象,在該構(gòu)象中,兩條反向平行的多核甘酸鏈相互纏繞形成一個(gè)右手的雙螺旋結(jié)構(gòu).DNA變性的本質(zhì):維持雙螺旋穩(wěn)
10、定性的氫鍵斷裂,堿基間堆積力遭到破壞,但不涉及到其一級(jí)結(jié)構(gòu)的改變。 DNA的溶解溫度(milting temperature):通常把DNA熱變性引起物化性質(zhì)改變一半時(shí)的溫度稱(chēng)為DNA的溶解溫度。增色效應(yīng):(hyperchromic effect):由于核酸變性而引起紫外光吸收增加的現(xiàn)象。減色效應(yīng) (hypochromic effect ):由于核酸復(fù)性而引起紫外光吸收減少的現(xiàn)象。分子雜交:指不同來(lái)源的單鏈核酸之間可通過(guò)堿基互補(bǔ)形成雙螺旋結(jié)構(gòu)。 退火(annealing):使熱變性DNA緩慢冷卻,則可發(fā)生復(fù)性,此過(guò)程稱(chēng)為退火。新陳代謝與生物氧化呼吸電子傳遞鏈:按嚴(yán)格的方向和順序,即電子從氧化還
11、原電位較低的傳遞體依次通過(guò)氧化還原電位較高的傳遞體逐步流向氧分子。氧化磷酸化:代謝物在生物氧化過(guò)程中釋放出的自由能用于合成ATP(即ADP+PiATP),即在呼吸鏈電子傳遞過(guò)程中偶聯(lián)ADP磷酸化,生成ATP,這種氧化放能和ATP生成(磷酸化)相偶聯(lián)的過(guò)程稱(chēng)氧化磷酸化?;瘜W(xué)滲透理論:主要認(rèn)為在電子傳遞和ATP形成之間起耦聯(lián)作用的是H+濃度。電子經(jīng)呼吸鏈傳遞時(shí),可將質(zhì)子(H+)從線粒體內(nèi)膜的基質(zhì)側(cè)泵到內(nèi)膜胞漿側(cè),產(chǎn)生膜內(nèi)外質(zhì)子電化學(xué)梯度儲(chǔ)存能量。當(dāng)質(zhì)子順濃度梯度回流時(shí)驅(qū)動(dòng)ADP與Pi生成ATP。P/O比:呼吸過(guò)程中無(wú)機(jī)磷酸(Pi)消耗量和原子氧(O2)消耗量的比值稱(chēng)為磷氧比。由于在氧化磷酸化過(guò)程中
12、,每傳遞一對(duì)電子消耗一個(gè)氧原子,而每生成一分子ATP消耗一分子Pi,因此P/O的數(shù)值相當(dāng)于一對(duì)電子經(jīng)呼吸鏈傳遞至氧所產(chǎn)生的ATP分子數(shù)。高能化合物:指水解可釋放的能量,能驅(qū)動(dòng)ADP磷酸化生成ATP的化合物。生物氧化:糖類(lèi)、脂肪、蛋白質(zhì)等有機(jī)物質(zhì)在細(xì)胞中進(jìn)行氧化分解生成CO2和H2O并釋放出能量的過(guò)程。呼吸鏈阻斷劑:能夠阻斷呼吸鏈中某一部位電子流的物質(zhì)稱(chēng)為電子傳遞阻斷劑或呼吸鍵阻斷劑。解偶聯(lián)劑:凡能破壞氧化與磷酸化相偶聯(lián)的作用。能引起解偶聯(lián)作用的物質(zhì)稱(chēng)為解偶聯(lián)劑。糖代謝糖酵解:指在氧氣不足條件下,葡萄糖或糖原分解為丙酮酸或乳酸的過(guò)程,此過(guò)程中伴有少量ATP的生成。發(fā)酵:無(wú)氧等外源氫受體的條件下,
13、底物脫氫后所產(chǎn)生的還原力H未經(jīng)呼吸鏈傳遞而直接交某一內(nèi)源性中間代謝物接受,以實(shí)現(xiàn)底物水平磷酸化產(chǎn)能的一類(lèi)生物氧化反應(yīng)。乳酸發(fā)酵:指糖經(jīng)無(wú)氧酵解而生成乳酸的發(fā)酵過(guò)程,乙醇發(fā)酵同為生物體內(nèi)二種主要的發(fā)酵形式。底物水平磷酸化:物質(zhì)在生物氧化過(guò)程中,常生成一些含有高能鍵的化合物,而這些化合物可直接偶聯(lián)ATP或GTP的合成,這種產(chǎn)生ATP等高能分子的方式稱(chēng)為底物水平磷酸化三羧酸循環(huán):是用于將乙酰CoA中的乙酰基氧化成二氧化碳和還原當(dāng)量的酶促反應(yīng)的循環(huán)系統(tǒng),該循環(huán)的第一步是由乙酰CoA與草酰乙酸縮合形成檸檬酸。磷酸戊糖途徑:葡萄糖氧化分解的一種方式。由于此途徑是由6-磷酸葡萄糖(G6P)開(kāi)始,故亦稱(chēng)為己糖
14、磷酸旁路。糖異生作用:由簡(jiǎn)單的非糖前體轉(zhuǎn)變?yōu)樘堑倪^(guò)程。底物循環(huán):一對(duì)催化兩個(gè)途徑的中間代謝物之間循環(huán)的方向相反、代謝上不可逆的反應(yīng)。糖的有氧氧化無(wú)氧氧化:萄糖在有氧條件下,氧化分解生成二氧化碳和水的過(guò)程稱(chēng)為糖的有氧氧化(aerobicoxidation),并釋放出能量。有氧氧化是糖分解代謝的主要方式,大多數(shù)組織中的葡萄糖均進(jìn)行有氧氧化分解供給機(jī)體能量。無(wú)氧氧化是指在缺氧或供氧不足的情況下,組織細(xì)胞內(nèi)的糖原,能經(jīng)過(guò)一定的化學(xué)變化,產(chǎn)生乳酸和水或乙醇和二氧化碳和水,并釋放出一部分能量的過(guò)程,也稱(chēng)糖酵解。脂類(lèi)代謝脂肪酸的-氧化途徑:脂酰CoA在線粒體基質(zhì)中進(jìn)入氧化要經(jīng)過(guò)四步反應(yīng),即脫氫、加水、再脫氫
15、和硫解,生成一分子乙酰CoA和一個(gè)少兩個(gè)碳的新的脂酰CoA. 。酰基載體蛋白:從頭合成脂肪酸,是由含有多種酶的復(fù)合體的脂肪酸合成系統(tǒng)的催化下進(jìn)行的,而在它的酰基縮合的階段,?;鵆oA不是作為直接底物,而是被轉(zhuǎn)移至復(fù)合體中的酰基載體蛋白起反應(yīng)的。肉毒堿穿梭系統(tǒng):由于酸的-氧化作用是在線粒體的基質(zhì)中進(jìn)行的,而在細(xì)胞液中形成的長(zhǎng)鏈脂酰CoA不能通過(guò)線粒體內(nèi)膜,需要內(nèi)膜上的載體肉堿攜帶,以脂?;男问娇缭絻?nèi)膜而進(jìn)入基質(zhì)。蛋白質(zhì)的酶促降解及氨基酸的代謝尿素循環(huán):肝臟中2分子氨和1分子CO2生成1分子尿素的環(huán)式代謝途徑。氧化脫氨基作用:是指氨基酸在酶的作用下伴有氧化的脫氨基反應(yīng)。轉(zhuǎn)氨:一個(gè)-氨基
16、酸的-氨基借助轉(zhuǎn)氨酶的催化作用轉(zhuǎn)移到一個(gè)-酮酸的過(guò)程。生糖氨基酸:能通過(guò)代謝轉(zhuǎn)變成葡萄糖的氨基酸。聯(lián)合脫氨基作用:轉(zhuǎn)氨基與谷氨酸氧化脫氨或是嘌呤核苷酸循環(huán)聯(lián)合脫氨,以滿(mǎn)足機(jī)體排泄含氮廢物的需求。核酸生物合成半保留復(fù)制: DNA生物合成時(shí),母鏈DNA解開(kāi)為兩股單鏈,各自作為模板按堿基配對(duì)規(guī)律,合成與模板互補(bǔ)的子鏈。子代細(xì)胞的DNA,一股單鏈從親代完整地接受過(guò)來(lái),另一股單鏈則完全重新合成。兩個(gè)子細(xì)胞的DNA都和親代DNA堿基序列一致。復(fù)制叉:是DNA復(fù)制時(shí)在DNA鏈上通過(guò)解旋、解鏈和SSB蛋白的結(jié)合等過(guò)程形成的Y字型結(jié)構(gòu)稱(chēng)為復(fù)制叉。DNA聚合酶: DNA聚合酶 , 以DNA為復(fù)制模板,從將DNA由
17、5'端點(diǎn)開(kāi)始復(fù)制到3'端的酶。DNA聚合酶的主要活性是催化DNA的合成(在具備模板、引物、dNTP等的情況下)及其相輔的活性。前導(dǎo)鏈:與復(fù)制叉移動(dòng)的方向一致,通過(guò)連續(xù)的5-3聚合合成的新的DNA鏈。滯后鏈:與復(fù)制叉移動(dòng)的方向相反,通過(guò)不連續(xù)的5-3聚合合成的新的DNA鏈。岡崎片段:相對(duì)比較短的DNA鏈(大約1000核苷酸殘基),是在DNA的滯后鏈的不連續(xù)合成期間生成的片段。單鏈結(jié)合蛋白:于螺旋酶沿復(fù)制叉方向向前推進(jìn)產(chǎn)生的單鏈區(qū),防止新形成的單鏈DNA重新配對(duì)形成雙鏈DNA或被核酸酶降解的蛋白質(zhì)。轉(zhuǎn)錄:遺傳信息由DNA轉(zhuǎn)換到RNA的過(guò)程。作為蛋白質(zhì)生物合成的第一步,轉(zhuǎn)錄是mRNA
18、以及非編碼RNA(tRNA、rRNA等)的合成步驟。核心酶:大腸桿菌的RNA聚合酶全酶由5個(gè)亞基組成(2,),沒(méi)有基的酶叫核心酶。內(nèi)含子:在轉(zhuǎn)錄后的加工中,從最初的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物除去的內(nèi)部的核苷酸序列。模板鏈:可作為模板轉(zhuǎn)錄為RNA的那條鏈,該鏈與轉(zhuǎn)錄的RNA堿基互補(bǔ)(A-U,G-C)。在轉(zhuǎn)錄過(guò)程中,RNA聚合酶與模板鏈結(jié)合,并沿著模板鏈的3'5'方向移動(dòng),按照5'3'方向催化RNA的合成。編碼鏈:DNA中,不能進(jìn)行轉(zhuǎn)錄的那一條DNA鏈,該鏈的核苷酸序列與轉(zhuǎn)錄生成的RNA的序列一致(在RNA中是以U取代了DNA中的T)。聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng):簡(jiǎn)稱(chēng)PCR,在體外對(duì)特定的DNA
19、片段進(jìn)行高效擴(kuò)增的技術(shù),可看作生物體外的特殊DNA復(fù)制。蛋白質(zhì)的合成中心法則:指遺傳信息從DNA傳遞給RNA,再?gòu)腞NA傳遞給蛋白質(zhì),即完成遺傳信息的轉(zhuǎn)錄和翻譯的過(guò)程。也可以從DNA傳遞給DNA,即完成DNA的復(fù)制過(guò)程。這是所有有細(xì)胞結(jié)構(gòu)的生物所遵循的法則。在某些病毒中的RNA自我復(fù)制(如煙草花葉病毒等)和在某些病毒中能以RNA為模板逆轉(zhuǎn)錄成DNA的過(guò)程(某些致癌病毒)是對(duì)中心法則的補(bǔ)充。翻譯是根據(jù)遺傳密碼的中心法則,將成熟的信使RNA分子(由DNA通過(guò)轉(zhuǎn)錄而生成)中“堿基的排列順序”(核苷酸序列)解碼,并生成對(duì)應(yīng)的特定氨基酸序列的過(guò)程。遺傳密碼決定蛋白質(zhì)中氨基酸順序的核苷酸順序 ,由3個(gè)連續(xù)的核苷酸組成的密碼子所構(gòu)成 。由于脫氧核糖核酸(DNA)雙鏈中一般只有一條單鏈(稱(chēng)為有義鏈或編碼鏈)被轉(zhuǎn)錄為信使核糖核酸(mRNA),而另一條單鏈(稱(chēng)為反義鏈)則不被轉(zhuǎn)錄,所以即使對(duì)于以雙鏈 DNA作為遺傳物質(zhì)的生物來(lái)講,密碼也用核糖核酸(RNA)中的核苷酸順序而不用DNA中的脫氧核苷酸順序表示。起始密碼子:被認(rèn)為對(duì)應(yīng)于AUG。其中原核生物的起始密碼子AUG翻譯對(duì)應(yīng)的是甲酰甲硫氨酸(fMet),真核生物的起始密碼子AUG翻譯對(duì)應(yīng)的是甲硫氨酸(Met)。密碼子: 信使RNA鏈上決定一個(gè)氨基酸的相鄰的三個(gè)堿基。信號(hào)肽:常指新合成多肽鏈中用于指導(dǎo)蛋白質(zhì)的跨膜轉(zhuǎn)移(定位)
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