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1、實(shí)驗(yàn)一生活污水(含藥廠廢水)的細(xì)菌學(xué)檢查(綜合性實(shí)驗(yàn))實(shí)驗(yàn)?zāi)康模?. 學(xué)習(xí)水樣的采取方法和水樣中細(xì)菌總數(shù)測(cè)定的方法2了解水源水的平板菌落計(jì)數(shù)的原則3.了解PCR技術(shù)監(jiān)測(cè)污染水體大腸埃希菌的意義和基本原理4掌握PCR操作技術(shù)實(shí)驗(yàn)材料:1培養(yǎng)基 牛肉膏蛋白胨瓊脂培養(yǎng)基。2材料 水樣3儀器及其他用具 恒溫培養(yǎng)箱、三角燒瓶,帶玻璃塞瓶,培養(yǎng)皿,移液器(1mL),移液管(1mL),試管等,PCR儀,水浴鍋,培養(yǎng)箱,電泳儀,自動(dòng)微量移液器(各型號(hào)),濾膜,PCR管,離心管,Whatman 3MM濾紙或相當(dāng)產(chǎn)品。4. 試劑及溶液 含有適當(dāng)抗菌素的LB培養(yǎng)基,Taq DNA聚合酶,正向引物(20 mmol/L
2、)及反向引物(20mmol/L)溶于水中,DNA分子量標(biāo)準(zhǔn),乙酸銨(l0mol/L),無水乙醇, TSEL (50mmol/L Tris-HCl,pH8.0,20%蔗糖,50mmol/L EDTA,1 mg/ml溶菌酶), SSK (50mmo1/L NaCl, 1%SDS, 3mg/mL蛋白酶K), TE緩沖液,l0×擴(kuò)增緩沖液(500mmol/L KCl,100 mmol/L Tris-HCl,15mmol/L,MgC12)。 4種dNTP貯存液(20mmol/L,pH8.0 ),瓊脂糖溶液(0.7%),電泳緩沖液(1×TAE),溴化乙錠染色液,6×凝膠上樣緩
3、沖液。 4.儀器及其他用具實(shí)驗(yàn)原理:本實(shí)驗(yàn)采用平板菌落計(jì)數(shù)技術(shù)測(cè)定水中細(xì)菌總數(shù)。由于水中細(xì)菌種類繁多,它們對(duì)營(yíng)養(yǎng)和其他生長(zhǎng)條件的要求差別很大,不可能找到一種培養(yǎng)基在一種條件下,使水中所有的細(xì)菌均能生長(zhǎng)繁殖。因此,以一定的培養(yǎng)基平板上生長(zhǎng)出來的菌落計(jì)算得到的水中細(xì)菌總數(shù)僅是一種近似值。目前一般是采用牛肉膏蛋白胨瓊脂培養(yǎng)基測(cè)定水中細(xì)菌總數(shù)。大腸埃希菌(Escherichia coli )是指示糞便污染的重要指示物。當(dāng)水體中出現(xiàn)大量的E. coli就說明近期內(nèi)水體受到了糞便污染(因其脫離寄主后,其半存留期會(huì)大大縮短)。PCR檢測(cè)這種微生物非常靈敏,即使每100mL水中只有一個(gè)個(gè)體,也能被檢驗(yàn)出來。實(shí)
4、驗(yàn)內(nèi)容:(一)細(xì)菌總數(shù)測(cè)定自來水(1)用滅菌移液管或移液器吸取lmL水樣,注入滅菌培養(yǎng)皿中。(2)分別傾注約15mL已融化并冷卻到45左右的牛肉膏蛋白胨瓊脂培養(yǎng)基,并立即在桌上作平面旋搖,使水樣與培養(yǎng)基充分混勻。(3)另取一空的滅菌培養(yǎng)皿,傾注牛肉膏蛋白胨瓊脂培養(yǎng)基15mL,作空白對(duì)照。(4)培養(yǎng)基凝固后,倒置于37溫箱中,培養(yǎng)24h,進(jìn)行菌落計(jì)數(shù)。兩個(gè)平板的平均菌落數(shù)即為lmL水樣的細(xì)菌總數(shù)。池水、河水或湖水等(1)稀釋水樣:取3個(gè)滅菌空試管,分別加入9mL滅菌水。取lmL水樣注入第一管9mL滅菌水內(nèi)、搖勻,再自第一管取lmL至下一管滅菌水內(nèi),如此稀釋到第三管,稀釋度分別為10-1,10-2
5、與10-3。稀釋倍數(shù)看水樣污染程度而定,以培養(yǎng)后平板的菌落數(shù)在30300個(gè)之間的稀釋度最為合適,若三個(gè)稀釋度的菌數(shù)均多到無法計(jì)數(shù)或少到無法計(jì)數(shù),則需繼續(xù)稀釋或減小稀釋倍數(shù)。一般中等污染水樣,取10-1,10-2,10-3三個(gè)連續(xù)稀釋度,污染嚴(yán)重的取10-2,10-3,10-4三個(gè)連續(xù)稀釋度。(2)自最后三個(gè)稀釋度的試管中各取1mL稀釋水加入空的滅菌培養(yǎng)皿中。每一稀釋度做兩個(gè)培養(yǎng)皿。(3)各傾注15mL己融化并冷卻至50左右的牛肉膏蛋白胨瓊脂培養(yǎng)基,立即放在桌上搖勻。(4)凝固后倒置于37培養(yǎng)箱中培養(yǎng)24h.。菌落計(jì)數(shù)方法(1) 先計(jì)算相同稀釋度的平均菌落數(shù)。若其中一個(gè)平板有較大片狀菌苔生長(zhǎng)時(shí),
6、則不應(yīng)采用,而應(yīng)以無片狀菌苔生長(zhǎng)的平板作為該稀釋度的平均菌落數(shù)。(2) 選擇平均菌落數(shù)在30300之間的,當(dāng)只有一個(gè)稀釋度的平均菌落數(shù)符合此范圍時(shí),則以該平均菌落數(shù)乘其稀釋倍數(shù)即為該水樣的細(xì)菌總數(shù)。(3) 若有兩個(gè)稀釋度的平均菌落數(shù)均在30300之間,則按兩者菌落總數(shù)之比值來決定。若其比值小于2,應(yīng)采取兩者的平均數(shù);若大于2,則取其中較小的菌落總數(shù)。(4) 若所有稀釋度的平均菌落數(shù)均大于300,則應(yīng)按稀釋度最高的平均菌落數(shù)乘以稀釋倍數(shù)。(5) 若所有稀釋度的平均菌落數(shù)均小于30,則應(yīng)按稀釋度最低的平均菌落數(shù)乘以稀釋倍數(shù)。(6) 若所有稀釋度的平均菌落數(shù)均不在30300之間,則以”近300或30
7、的平均菌落數(shù)乘以稀釋倍數(shù)。(二)應(yīng)用PCR技術(shù)監(jiān)測(cè)污染水體大腸埃希菌1水樣的處理及模板DNA的制備(1) 取水樣lmL,低速(2 000 r/min )離心5min,以除去不溶性雜質(zhì)。取出上清,經(jīng)6 000 r/min離心5min,收集菌體。(2) 將菌體懸于100 mlTSEL溶液中,置37水浴作用30 min。(3) 向反應(yīng)混合物中加入300ml SSK溶液,置37繼續(xù)作用60 min。(4) 向反應(yīng)混合物中加入2倍體積的無水乙醇,搖勻后置-20,2h. 12 000 r/min離心15 min,收集沉淀,室溫晾干后將沉淀物溶于100300ml無菌去離子水或TE緩沖液中備用。如果是純培養(yǎng)的
8、菌落,即將菌落挑入100ml無菌去離子水中,加熱煮沸l(wèi)min,即可作為PCR模板。2引物設(shè)計(jì) 本實(shí)驗(yàn)的引物來自E. coli的lac Z和lam B基因。 lac Z引物1:ZL-1675(5'-ATGAAAGCTGGCTACAGGAAGGCC-3') 引物2:ZR-2025(5'-GGTTTATGCAGCAACGAGACGTCA-3')lam B引物1:BL-4910(5'-CTGATCGAATGGCTGCCAGGCTCC-3')引物2:BR-5219 (5'-CAACCAGACGATAGTTATCACGCA-3')3PCR擴(kuò)增體系 按以下次序,將各成分加在0.5mL PCR薄壁管內(nèi)混合: l0×擴(kuò)增緩沖液5ml 20mmo1/L 4種dNTP混合液(pH8.0)1ml 20mmo1/L正向引物2.5ml 20mmo1/L反向引物2.5ml 模板DNA 510ml Taq DNA聚合酶12單位 補(bǔ)足H2O至總體積50ml4PCR循環(huán)按以下方法進(jìn)行PCR擴(kuò)增,典型的程序有變性、復(fù)性和聚合(延伸
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