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1、 上海豐核版權所有,未經(jīng)允許不得傳播??贵w芯片(Antibody microarray細胞因子抗體芯片介紹:細胞因子檢測是判斷機體免疫功能的一個重要指標,在疾病的診斷、病程觀察、療效判斷及細胞因子治療監(jiān)測方面有重要意義。細胞因子抗體芯片您可以同時檢測樣品中多種細胞因子的表達水平,可用于分析樣品之間相關細胞因子的相對表達豐度;還可以作為基因芯片的補充,用于研究細胞因子和基因表達之間的關系。公司的抗體芯片的分析服務包括差異挑選、聚類分析、PCA分析、預測模型構建、與基因芯片或其他蛋白質(zhì)芯片進行關聯(lián)分析等,以闡述芯片結果中隱藏的生物學意義項目一、聚類分析利用層次聚類算法,距離采用pearson相關系
2、數(shù),linkage采用average:圖例如下(部分 原始數(shù)據(jù)的聚類分析。顏色表示信號值的強度,由綠-黑-紅,信號值依次增加。從結果來看規(guī)律性不強。項目二、主成分分析(PCAPCA分析是一種降維技術,可以將高維的芯片數(shù)據(jù)投射到二維空間中。每一個樣本用二維空間的一個點來表示,相似的樣本所在的點將彼此靠近,因此我們可以通過PCA分析找到那些“離群”的樣本: 樣本的主成分分析(參見pca.emf。該圖橫坐標為第一主成分,縱坐標為第二主成分。每個樣本用一個散點表示。不同顏色表示不同的樣本分組。項目三、差異基因篩選利用ANOVA等統(tǒng)計分析方法, 統(tǒng)計不同分組之間的差異表達抗體。差異抗體如下圖例所示: Box plot(箱尾圖: 項目四、決策樹模型決策樹是指利用樹形結構來表示決策集合,是一種直觀的知識表示方法,同時也是高效的分類器.構造決策樹的主要思想是以信息論為工具,在各非葉結點選擇重要的屬性或?qū)傩越M,自上而下地分割訓練實例集,直到滿足某種終止條件。決策樹由一個根結點,若干葉結點和若干非葉結點構成。根結點對應于學習任務.每個葉結點都包含一個分類名。決策樹是模式識別的一種重要方法。其優(yōu)點在于規(guī)
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