細菌的分類及命名ppt課件

1、2022-2-64 16S rRNA 16S rRNA特點：特點：1 1、16SrRNA16SrRNA存在于一切生物中并執(zhí)行一樣的功存在于一切生物中并執(zhí)行一樣的功能能合成蛋白質(zhì)。合成蛋白質(zhì)。2 2、 進化相對保守，分子序列變化緩慢；進化相對保守，分子序列變化緩慢；3 3、相對分子質(zhì)量適中；、相對分子質(zhì)量適中；4 4、16S rRNA16S rRNA普遍存在真核生物為普遍存在真核生物為18SrRNA)18SrRNA)；5 5、微生物的、微生物的16S rRNA16S rRNA可從樣品中直接提取，可從樣品中直接提取，分析、比較其序列，進而確定其家族樹中位置分析、比較其序列，進而確定其家族樹中位置

2、微生物分類學(xué) 一門按微生物的親緣關(guān)系把他們分門別類的排成各種分類單元或分類群的學(xué)科 分類學(xué)義務(wù) 分類、鑒定、命名 微生物分類學(xué)的開展 經(jīng)典分類學(xué) 微生物系統(tǒng)學(xué) 種：最根本的分類單位 是一群表型特征高度類似、親緣關(guān)系極其接近、與同屬內(nèi)其他種有著明顯差別的菌株的總稱 菌株 某條件、地域分別得到的詳細菌株。它是由一獨立分別的單細胞繁衍而成的純遺傳型群體及其一切后代，典型菌株、方式株 俗名 結(jié)核桿菌：結(jié)核分歧桿菌 學(xué)名 菌種的科學(xué)稱號，是按照“國際命名法那么進展命名并受國際學(xué)術(shù)界公認的通用正式稱號，由拉丁詞或拉丁化的詞構(gòu)成 林奈的“雙名法 三名法 學(xué)名 屬名：首字母大寫，斜體字 種名加詞：小寫，斜體字

3、 初次定名人：正體字，用括號 如今定名人：正體字 定名年份 大腸埃希氏菌 枯草芽孢桿菌Escherichia coli ( Migula) Castellani et Chalmers 1919Bacillus subtilis ( Ehrrnbeg) Cohn 1872屬名+種名加詞+(subsp.或var.)+亞種(變種)加詞 實例 蘇云金芽孢桿菌蠟螟亞種Bacillus thuringiensis subsp. galleria 釀酒酵母橢圓變種Saccharomyces cerevisiae var. ellipsoideus 屬名：表示該微生物主要特征的名詞或用作名詞的描畫詞，單數(shù)

4、常代表微生物的主要特征，如形狀芽孢桿菌屬、葡萄球菌屬、生理乳桿菌屬 更多學(xué)名連在一同，假設(shè)屬名一樣，屬名可縮寫 種名加詞：代表一個種的次要特征，補充闡明微生物的顏色、外形、用途等次要特征。也可以從人名巴斯德酵母、地名華根霉衍生而來 未完成鑒定的菌種：種名加詞可用sp.或spp.表示 學(xué)名的發(fā)音：拉丁字母規(guī)那么發(fā)音，歐美學(xué)者按本人語種發(fā)音 不受國際命名法規(guī)限制 亞種：進一步細分種時所用的單元，普通指除某一明顯而穩(wěn)定的特征外，其他鑒定特征都與方式種一樣的種。 命名方法按照三名法處置 變種：與亞種是同義詞，如今很少運用 菌型：曾用作菌株的同義詞，現(xiàn)已廢除，僅作假設(shè)干變異型的后綴 菌群：兩種微生物介于

5、他們之間的一些過渡類型的菌種，具有某些共同性狀。 如：大腸菌群包括大腸桿菌、產(chǎn)氣腸細菌及他們之間的過渡類型 菌株稱號屬名+種的加詞+菌株代號，菌株代號可隨意用字母、符號、編號或字母加編號等自行決議 大腸桿菌K12菌株 E.coli K12 E.coli O157:H7：致病性，抗原特征 方式菌株：菌落、菌株、菌苔、斜面、菌種、培育物、酶：產(chǎn)酶種類、反響特性100%=G +Cmol%所得數(shù)值范圍從23751. DNA的堿基組成(G+Cmol%) 每個生物種都有特定的GC%范圍，因此 可以作為分類鑒定的目的。細菌的GC%范圍為25-75%，變化范圍最大，因此更適宜于細菌的分類鑒定。 GC%測定主要

6、用于對表型特征難區(qū)分的細菌 作出鑒定，G+C含量的比較主要用于分類鑒定中的否認含量的比較主要用于分類鑒定中的否認但具有類似但具有類似G+C含量的生物并不一定闡明它們含量的生物并不一定闡明它們之間具有近的親緣關(guān)系。之間具有近的親緣關(guān)系。 同一個種內(nèi)的不同菌株G+C含量差別應(yīng)在45%以下；同屬不同種的差別應(yīng)低于1015%； 假設(shè)二個在形狀及生理生化特性方面及其假設(shè)二個在形狀及生理生化特性方面及其類似的菌株，假設(shè)其類似的菌株，假設(shè)其G+C含量的差別大于含量的差別大于5%，那么一定不是同一個種，大于那么一定不是同一個種，大于15%那么一定不那么一定不是同一個屬。是同一個屬。2. 核酸的分子雜交t 核酸

7、分子雜交(hybridization)間接比較t 不同微生物DNA堿基陳列順序的類似性1DNA-DNA雜交；親緣關(guān)系相對近的微生物之間的親緣關(guān)系比較親緣關(guān)系相對近的微生物之間的親緣關(guān)系比較2DNA-rRNA雜交；親緣關(guān)系相對遠的微生物之間的親緣關(guān)系比較親緣關(guān)系相對遠的微生物之間的親緣關(guān)系比較3核酸探針；利用特異性的探針，用于細菌等的快速鑒定利用特異性的探針，用于細菌等的快速鑒定微型、簡便、快速或自動化鑒定技術(shù)微型、簡便、快速或自動化鑒定技術(shù)1、 API 細菌數(shù)值鑒定系統(tǒng)細菌數(shù)值鑒定系統(tǒng)菌種菌種根本培育基根本培育基液體液體 菌懸液菌懸液檢測、編碼、查表、鑒定檢測、編碼、查表、鑒定適用于適用于AP

8、IAPI鑒定細鑒定細菌有菌有700700多種多種Analytica Products INC的簡稱。法國生物- 梅里埃公司消費的細菌數(shù)值分類分析鑒定系統(tǒng)。約有1 000 種生化反響,可鑒定的細菌大于550 種。目前中國各級疾病預(yù)防控制機構(gòu)在細菌學(xué)檢驗中比較多地運用了此項技術(shù) APIAPI細菌鑒定系統(tǒng)細菌鑒定系統(tǒng) 不同培育基分裝不同小槽中，同不同培育基分裝不同小槽中，同步接種，培育后檢測、查表、鑒定。步接種，培育后檢測、查表、鑒定。自動化、快速自動化、快速 可鑒定細菌有可鑒定細菌有11401140多種、酵母菌多種、酵母菌267267種、目種、目前曾經(jīng)可用于絲狀真菌。前曾經(jīng)可用于絲狀真菌。每個孔中含有每個孔中含有不同的底物不同的底物菌懸液或菌懸液或無菌水