氨基酸密碼子對照表(共6頁)

1、精選優(yōu)質文檔-傾情為你奉上丙氨酸AlanineA 或 Ala89.079CH 3 -脂肪族類精氨酸ArginineR 或 Arg174.188HN=C(NH 2 )-NH-(CH 2 ) 3 -堿性氨基酸類天冬酰胺AsparagineN 或 Asn132.104H 2 N-CO-CH 2 -酰胺類天冬氨酸Aspartic acidD 或 Asp133.089HOOC-CH 2 -酸性氨基酸類半胱氨酸CysteineC 或 Cys121.145HS-CH 2 -含硫類谷氨酰胺GlutamineQ 或 Gln146.131H 2 N-CO-(CH 2 ) 2 -酰胺類谷氨酸Glutamic aci

2、dE 或 Glu147.116HOOC-(CH 2 ) 2 -酸性氨基酸類甘氨酸GlycineG 或 Gly75.052H-脂肪族類組氨酸HistidineH 或 His155.141N=CH-NH-CH=C-CH 2 -|_|堿性氨基酸類異亮氨酸IsoleucineI 或 Ile131.160CH 3 -CH 2 -CH(CH 3 )-脂肪族類亮氨酸LeucineL 或 Leu131.160(CH 3 ) 2 -CH-CH 2 -脂肪族類賴氨酸LysineK 或 Lys146.17H 2 N-(CH 2 ) 4 -堿性氨基酸類蛋氨酸MethionineM 或 Met149.199CH 3 -

3、S-(CH 2 ) 2 -含硫類苯丙氨酸PhenylalanineF 或 Phe165.177Phenyl-CH 2 -芳香族類脯氨酸ProlineP 或 Pro115.117-N-(CH 2 ) 3 -CH-|_|亞氨基酸絲氨酸SerineS 或 Ser105.078HO-CH 2 -羥基類蘇氨酸ThreonineT 或 Thr119.105CH 3 -CH(OH)-羥基類色氨酸TryptophanW 或 Trp204.213Phenyl-NH-CH=C-CH 2 -|_|芳香族類酪氨酸TyrosineY 或 Tyr181.1764-OH-Phenyl-CH 2 -芳香族類纈氨酸Valine

4、V 或 Val117.133CH 3 -CH(CH 2 )-脂肪族類與核苷酸序列相關的特征關鍵詞表關鍵詞說明allele相關的個體或菌株含有相同基因的穩(wěn)定的其它形式,該形式區(qū)別于這一位置的現(xiàn)有的序列(和或許其它序列)attenuator存在調節(jié)轉錄的終止的DNA區(qū)域,它控制了一些細菌操縱子的表達; (2)位于啟動子和第一個結構基因之間，引起轉錄的部分終止的序列區(qū)段C_region免疫球蛋白輕和重鏈的恒定區(qū),和T-細胞受體,和鏈；根據(jù)特定的鏈可包括一個或多個外顯子CAAT_signalCAAT盒;位于可能參與RNA聚合酶結合的真核生物轉錄單位的起始點的75bp上游的保守序列的一部分；共有序列GG

5、(C或T)CAATCTCDS編碼序列;對應于蛋白質中的氨基酸序列的核苷酸的序列(位置包括終止密碼子);特征包括氨基酸概念上的翻譯Conflict在這一位點或區(qū)域,單獨確定的“相同”序列有所不同D-loop置換環(huán)；線粒體DNA內的一個區(qū)域,其中RNA的短的序列與DNA的一條鏈配對,代替了這一區(qū)域的原始配對DNA鏈;也用于說明在RecA蛋白質催化的反應中，侵入的單鏈替代雙鏈DNA的一條鏈的區(qū)域D-segment免疫球蛋白重鏈的多變區(qū),和T-細胞受體的鏈Enhancer順式-作用序列,它增強了(一些)真核生物啟動子的作用,并能在任一方向和與啟動子相關的任何位置處 (上游或下游)起作用Exon編碼剪接

6、mRNA部分的基因組區(qū)域;可以含有5UTR,所有CDS,和3UTRGC_signalGC盒;位于真核生物轉錄單位起始點上游的保守的富含GC區(qū)域,可以以多重拷貝或任一方向存在;共有序列=GGGCGGgene鑒定為基因的生物學意義的區(qū)域,并已經指定名稱iDNA間插DNA;通過幾種重組中的任何一種能被消除的DNAintron被轉錄的DNA區(qū)段,但通過同時剪接位于其兩側的序列(外顯子)即可從轉錄本內部將其除去J_segment免疫球蛋白輕鏈和重鏈的連接區(qū)段,和T-細胞受體,和鏈LTR長的末端重復,在確定序列的兩端直接重復的序列, 類型典型地見于逆轉錄病毒中mat_peptide成熟的肽或蛋白質的編碼序

7、列;翻譯后修飾之后成熟的或最終的肽或蛋白質產物的編碼序列;位置不包括終止密碼子(與相應的CDS不同)misc_binding不能用任何其它Binding關鍵詞(primer_bind或protein_bind)表述的與另一個組成成分共價或非-共價結合的核酸中的位點misc_difference特征序列與記載中存在的有所不同,并且不能用任何其它不同關鍵詞(conflict,unsure,old_sequence,mutation,variation,allele或modified_base)表述misc_feature不能用任何其它的特征關鍵詞表述的具有生物學意義的區(qū)域;新的或少見的特征misc

8、_recomb任何一般性的,位點特異性的或復制的重組事件的位點,該位點中有不能用其它重組關鍵詞(iDNA和virion)或來源關鍵詞的修飾詞(/transposon,/proviral)表述的雙螺旋DNA的斷裂和愈合misc_RNA不能用其他RNA關鍵詞（prim_transcript,precursor_RNA,mRNA,5clip,3clip,5UTR,3UTR,exon,CDS,sig_peptide,transit_ _peptide,mat_peptide,intron,polyA_site,rRNA,tRNA,scRNA和snRNA)限定的任何轉錄本或RNA產物misc_signa

9、l含有控制或改變基因功能或表達之信號的任何區(qū)域,所述信號不能用其他Signal關鍵詞(promoter,CAAT_signal,TATA_signal,-35_signal,10_signal,GC_signal,RBS,polyA_signal,enhancer,attenuator,terminator,和rep_origin)表述misc_structure不能用其他Structure關鍵詞(stem_loop和D-loop)表述的任何二級或三級結構或構象modified_base被指示的核苷酸是經修飾的核苷酸,并應由被指示的分子(在mod_base修飾詞意義中給出)所取代mRNA信使R

10、NA；包括5非翻譯區(qū)(5UTR)，編碼序列(CDS，外顯子)和非翻譯區(qū)（UTR）mutation在此位置處，相關品系的序列中具有突然的，可遺傳的變化N_region在重排的免疫球蛋白區(qū)段之間插入的額外的核苷酸Old_sequence在此位置處，所表述的序列修改了此序列以前的版本PolyA_signal聚腺苷酸化之后內切核酸酶裂解RNA轉錄本所必需的識別區(qū)域；共有序列AATAAAPolyA_siteRNA轉錄本上的位點,通過轉錄后聚腺苷酸化該位點將被加上腺嘌呤殘基Precursor_RNA仍不是成熟的RNA產物的任何RNA種類；可包括5剪切區(qū)(5clip)，5非翻譯區(qū)(5UTR)，編碼序列(CD

11、S，外顯子)，間插序列（內含子），3非翻譯區(qū)（3UTR）,和3剪切區(qū)(3clip)prim_transcript初級（最初的，未加工的）轉錄本；包括剪切區(qū)（clip）,非翻譯區(qū)（UTR）,編碼序列(CDS,外顯子),間插序列(內含子),3非翻譯區(qū)(3UTR)和3剪切區(qū)(3clip)prim_bind起始復制,轉錄或逆轉錄的非共價的引物結合位點;包括合成的例如PCR引物元件的位點Promoter參與RNA聚合酶的結合以啟動轉錄的DNA分子區(qū)域protein_bind核酸上非共價的蛋白質結合位點RBS核糖體結合位點repeat_region含有重復單位的基因組區(qū)域repeat_unit單個重復元件

12、rep_origin復制起點;復制核酸以得到兩個相同拷貝的起始位點RRNA成熟的核糖體RNA；將氨基酸裝配成蛋白質的核糖核蛋白顆粒（核糖體）中的RNA成份S_region免疫球蛋白重鏈的開關區(qū)；它參與重鏈DNA的重排,導致來自相同B細胞的不同免疫球蛋白類的表達Satellite短的基本重復單位的很多串聯(lián)重復(相同或相關的);大多數(shù)具有的堿基組成或其它性質與基因組的一般水平不同,這使得它們與大部分(主帶)的基因組DNA分離開來ScRNA小的細胞質RNA;幾個小的細胞質分子中的任何一個存在于真核生物的細胞質和（有時）核中sig_peptide信號肽編碼序列；被分泌的蛋白質的末端結構域的編碼序列；此

13、結構域涉及新生多肽與膜的結合；前導序列SnRNA小的核RNA；很多小的RNA種類中的任何一個都被局限于核中；幾個snRNA參與剪接或其它RNA加工反應source鑒定序列中特定范圍的生物來源；此關鍵詞是強制性的；每一項至少要有一個跨越整個序列的單一來源關鍵詞；每個序列可允許有一個以上的來源關鍵詞stem_loop發(fā)卡結構；由RNA或DNA單鏈的相鄰（反向）互補序列之間的堿基一配對形成的雙螺旋區(qū)域STS序列標記位點：表述基因組上作圖界標并能通過PCR檢測的短的，單拷貝DNA序列；通過測定STS系列的次序即可作出圖譜的基因組區(qū)域TATA_signalTATA盒；Goldberg-Hogness盒；

14、在每個真核生物RNA聚合酶轉錄單位起點前約25bp處發(fā)現(xiàn)的保守的富含AT的七聚體，它可能涉及使酶定位以正確地起始；共有序列TATA（或）（或）terminator或者位于轉錄本的末端或者與啟動子區(qū)域相鄰的DNA序列，該序列可導致RNA聚合酶終止轉錄；也可以是阻抑蛋白的結合位點transit_peptide轉運肽編碼序列；核編碼的細胞器蛋白質末端結構域的編碼序列；此結構域參與將蛋白質翻譯后運送到細胞器中tRNA成熟的轉移RNA,，小的RNA分子（7585個堿基長），介導核酸序列翻譯成氨基酸序列unsure作者不能確定此區(qū)域的準確序列V_region免疫球蛋白輕鏈和重鏈的可變區(qū)，和細胞受體，和鏈；

15、編碼可變的氨基末端部分；可由Vsegment,D_segment,N_region和J_segment組成V_segment免疫球蛋白輕鏈和重鏈的可變區(qū)段，和T 細胞受體，和鏈；編碼大多數(shù)可變區(qū)（v_region）和前導肽的最后幾個氨基酸variation含有來自相同基因的穩(wěn)定突變的相關系列（例如RFLP，多態(tài)性等），在此（和可能其它）位置處所述相同基因與被表述的不同3clip在加工過程中被切下的前體轉錄本3端大部分區(qū)域3UTP不被翻譯成蛋白質的成熟轉錄本的末端區(qū)域（終止密碼子之后）5clip在加工過程中被切下的前體轉錄本端大部分區(qū)域5UTP不被翻譯成蛋白質的成熟轉錄本的末端區(qū)域（起始密碼子之

16、前）_ 10 _signalPribnow盒；細菌轉錄單位起點上游約10bp處的保守區(qū)域,它可能參與結合RNA聚合酶;共有序列=TatAaT_ 35 _signal細菌轉錄單位起點上游約35bp處的保守六聚體；共有序列=TTGACa或TGTTGACA與蛋白質序列相關的特征關鍵詞表關鍵詞說明CONFLICT不同的論文報道了不同的序列VARIANT作者報道存在序列變體VARSLIC由可選擇的剪接產生的序列變體的表述MUTAGEN經實驗操作已改變的位點MOD_RES殘基的翻譯后修飾ACETYLATIONN末端或其它AMIDATION通常位于成熟的活性肽的C末端BLOCKED不能被測定的N或C末端封閉

17、基團FORMYLATIONN末端甲硫氨酸的GAMMA-CARBOXY-GLUTAMIC ACIDHYDROXYLATION天冬酰胺，天冬氨酸，脯氨酸或賴氨酸的METHYLATION通常為賴氨酸或精氨酸的PHOSPHORYLATION絲氨酸，蘇氨酸，酪氨酸，天冬氨酸或組氨酸的PYRROLIDONECARBOXYLICACID已形成內部環(huán)內酰胺的N末端谷氨酸SULFATATION通常為酪氨酸的LIPID脂質組成成分的共價結合MYRISTATE通過酰胺鍵與蛋白質成熟形式的N末端甘氨酸殘基或內部的賴氨酸殘基結合的豆蔻酸基團PALMITATE通過硫酯鍵與半胱氨酸殘基或通過酯鍵與絲氨酸或蘇氨酸殘基結合的棕

18、櫚酸基團FARNESYL通過硫酯鍵與半胱氨酸殘基結合的法尼基GERANYL-GERANYL通過硫酯鍵與半胱氨酸殘基結合的香葉基香葉基基團GPIANCHOR與蛋白質成熟形式末端殘基的羧基相連的糖基磷脂酰肌醇（GPI）基團NACYLDIGLYCERIDE原核生物脂蛋白成熟形式的N末端半胱氨酸，所述脂蛋白具有酰胺鍵聯(lián)的脂肪酸和通過酯鍵連接了兩個脂肪酸的甘油基DISULFID二硫鍵；“FROM”和“TO”終點表示通過一個鏈內二硫鍵連接的兩個殘基；如果“FROM”和“TO”終點是完全相同的，則二硫鍵是鏈間鍵，而說明書領域示出交聯(lián)的性質THIOLEST硫醇酯鍵；“FROM”和“TO”終點表示通過硫醇酯鍵連接的兩個殘基THIOETH硫醚鍵；“FROM”和“TO”終點表示通過硫醚鍵連接的兩個殘基CARBOHYD糖基化位點；碳水化物（如果已知）的性質在說明書領域給出METAL金屬離子的結合位點；說明書領域示出金屬的性質BINDING任何化學基團（輔酶，輔基，等等）的結