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1、酶作用的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)第一節(jié):酶活性中心結(jié)構(gòu):一、酶活性中心概念:二、酶活性中心組成:結(jié)合中心:結(jié)合基團(tuán)微環(huán)境催化中心:催化基團(tuán)微環(huán)境三、酶活性中心的測(cè)定:化學(xué)修飾法:反應(yīng)動(dòng)力學(xué)法:光譜法:專一性抑制劑研究法:差示標(biāo)記法:親和標(biāo)記法: X光衍射分析法:第二節(jié):酶和底物結(jié)合機(jī)理:一、鎖鑰學(xué)說(shuō):二、三點(diǎn)附著理論:三、誘導(dǎo)契合學(xué)說(shuō): Induced-fit hypothesis第三節(jié)、酶催化反應(yīng)機(jī)理:一、催化劑降低反應(yīng)活化能的方式:1. 中間態(tài)穩(wěn)定化作用2. 過(guò)渡態(tài)去穩(wěn)定化作用:1. 中間態(tài)穩(wěn)定化作用2. 過(guò)渡態(tài)去穩(wěn)定化作用:二、酶作用機(jī)理:1.鄰近效應(yīng)和定向效應(yīng):2.底物形變:3.酸堿催化作用:4.親和
2、親電催化:5.微環(huán)境的效應(yīng)一、鄰近效應(yīng)Proximity 、 定向效應(yīng)Orientation底物分子A、B 結(jié)合在酶活性中心,失去活動(dòng)自由能,A、B反應(yīng) 進(jìn)入過(guò)渡態(tài)所需的能量大大降低。aba: 反應(yīng)物的反應(yīng)基團(tuán)和催化基團(tuán)不靠近,也 不彼此定向b: 兩個(gè)基團(tuán)雖靠近, 但不定向,還不利反應(yīng) c: 兩個(gè)基團(tuán)即靠近又定向,有利于反應(yīng)c化學(xué)反應(yīng)分子軌道理論: 對(duì)稱性匹配最高占據(jù)電子軌道 HOMO最低非占據(jù)電子軌道 LUMO能量相當(dāng)、重疊最大、對(duì)稱性允許酶催化反應(yīng):酶分子的參與,導(dǎo)致底物敏感鍵基團(tuán)電子云密度增加或減少,改變敏感鍵電子組態(tài),使敏感鍵產(chǎn)生電子張力,發(fā)生形變。酶分子構(gòu)象也發(fā)生變化,形成酶底物復(fù)合
3、物。適合于誘導(dǎo)契合學(xué)說(shuō)。二、底物形變(Distortion) 產(chǎn)生張力(Strain)底物發(fā)生形變底物分子和酶分子都發(fā)生變化三、酸堿催化和質(zhì)子轉(zhuǎn)移通路酸堿催化:Acid-Base catalysis狹義的酸堿催化劑(Specific acid-base catalyst): H+、OH-廣義的酸堿催化劑(General acid-base catalyst): 質(zhì)子供體和質(zhì)子受體的催化,電子受體和電子供體的催化。 Lewis 酸 和 Lewis堿的催化咪唑基:氨基: -NH3+ -NH2 + H+羧基: -COOH -COO- + H+巰基: -SH -S- + H+羥基: -OH -O- + H+酚基: -C6H4-OH -C6H4-O- + H+羧基咪唑基磷酸之間質(zhì)子轉(zhuǎn)移通道:四、共價(jià)催化:Cavalent catalysis親核反應(yīng):Nucleophilic reaction親電反應(yīng):Electrophilic reaction酶的親核催化作用:絲氨酸酶:與底物酰基形成?;笌€基酶:巰基與底物形成硫酯鍵組氨酸類酶:咪唑基被磷酸化賴氨酸類酶:氨基與底物的羰基形成西佛堿中間物酶的親電催化作用:五、酶活性中心微環(huán)境的影響酶活性中心的特殊環(huán)境,低介電常數(shù)的介質(zhì)有利于電荷之間相互作用。有利于酶底
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