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文檔簡介
1、 基因表達調(diào)控 Regulation of Gene Expression南方醫(yī)科大學 基因工程研究所 危 敏 副教授Institute of Genetic Engineering基本概念與原理Basic Conceptions and Principle第 一 節(jié)Institute of Genetic Engineering基因表達 (gene expression) 基因經(jīng)過轉(zhuǎn)錄、翻譯,產(chǎn)生具有特異生物學功能的蛋白質(zhì)分子的過程。并非所有基因表達過程都產(chǎn)生蛋白質(zhì)。如 基因轉(zhuǎn)錄生成 rRNA,tRNA一、基因表達的概念I(lǐng)nstitute of Genetic Engineering基因表達
2、調(diào)控Gene expression regulation生物體通過特定的蛋白質(zhì)與DNA、蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)之間的相互作用來控制基因是否表達,或調(diào)節(jié)表達產(chǎn)物的多少以滿足生物體的自身需求以及適應環(huán)境變化的過程。Institute of Genetic Engineering 在某一特定時期或生長階段,基因組中只有 一小部分基因處于表達狀態(tài)。 個體某種功能的基因產(chǎn)物在細胞中的數(shù)量隨著時間、環(huán)境而變化?;虮磉_是受調(diào)控的腫瘤的特異基因表達腫瘤標志物(Tumor Marker)是反映腫瘤存在的化學類物質(zhì)。它們或不存在于正常成人組織而僅見于胚胎組織,或在腫瘤組織中的含量大大超過在正常組織里的含量,提示腫瘤的性
3、質(zhì),借以了解腫瘤的組織發(fā)生、細胞分化、細胞功能,以幫助腫瘤的診斷、分類、預后判斷以及治療指導。甲胎蛋白是肝癌的特異性標志 降鈣素:肺癌Institute of Genetic Engineering二、基因表達的特異性(一)時間特異性 (temporal specificity)按功能需要,某一特定基因的表達嚴格按特定的時間順序發(fā)生。階段特異性 (stage specificity)與分化、發(fā)育階段一致Institute of Genetic Engineering(二)空間特異性 (spatial specificity)細胞或組織特異性 (cell or tissue specificit
4、y)。在個體生長全過程,某種基因產(chǎn)物在個體的不同組織或器官表達。二、基因表達的特異性Institute of Genetic Engineering一個基因是不是所有組織中表達?肝細胞、腎細胞等基因組是否一樣?為什么功能不同? 基因表達與空間的關(guān)系Institute of Genetic Engineering差異基因表達(differential gene expression)基因表達譜(gene expression profile)不同細胞基因表達的種類和強度,決定了細胞的分化狀態(tài)和功能。Institute of Genetic Engineering三、基因表達的方式(一)基本表達某
5、些基因在一個個體的幾乎所有細胞中持續(xù)表達,通常被稱為管家基因 (housekeeping gene)。 基本或組成性基因表達 (constitutive gene expression)。Institute of Genetic Engineering(二)誘導和阻遏表達在特定環(huán)境信號刺激下,相應的基因被激活,基因表達產(chǎn)物增加,這種基因稱為可誘導基因??烧T導基因在特定環(huán)境中表達增強的過程,稱為誘導 (induction)。舉例:DNA損傷 修復酶基因激活 Institute of Genetic Engineering如果基因?qū)Νh(huán)境信號應答是被抑制,這種基因是可阻遏基因??勺瓒艋虮磉_產(chǎn)物水平
6、降低的過程稱為阻遏 (repression)。舉例:色氨酸充分 色氨酸合成酶編碼基因抑制(二)誘導和阻遏表達Institute of Genetic Engineering在一定機制控制下,功能上相關(guān)的一組基因,無論其為何種表達方式,均需協(xié)調(diào)一致、共同表達,即為協(xié)調(diào)表達,這種調(diào)節(jié)稱為協(xié)調(diào)調(diào)節(jié)(coordinate regulation)。(三)協(xié)調(diào)表達 (coordinate expression)Institute of Genetic Engineering四、基因表達調(diào)控的生物學意義(一)適應環(huán)境、維持生長和增殖 原核生物:葡萄糖、乳糖代謝 高等生物:常飲酒者體內(nèi)醇氧化酶活性高(二)維持
7、個體發(fā)育與分化 各組織、器官的發(fā)育、分化是由特定的基因控制的。Institute of Genetic Engineering分節(jié)基因(segmentation genes)果蠅發(fā)育母親效應基因(maternal effect genes)Institute of Genetic Engineering 基因表達調(diào)控的基本原理Basic Principle of Regulation of Gene Expression 第 二 節(jié) 2010-4Institute of Genetic EngineeringInstitute of Genetic Engineering一、基因表達調(diào)控的多層
8、性和復雜性DNA擴增DNA重排甲基化 基本控制點轉(zhuǎn)錄起始蛋白質(zhì)降解蛋白質(zhì)翻譯翻譯后加工修飾轉(zhuǎn)錄水平 轉(zhuǎn)錄后加工mRNA降解Institute of Genetic Engineering二、基因轉(zhuǎn)錄激活調(diào)節(jié)基本要素特異DNA序列 有調(diào)節(jié)功能的DNA序列。原核生物 操縱子(operon) 機制真核生物 順式作用元件Institute of Genetic Engineering操縱子學說1961年,法國科學家莫諾(JLMonod)與雅可布(FJacob)發(fā)表“蛋白質(zhì)合成中的遺傳調(diào)節(jié)機制”一文,提出操縱子學說,開創(chuàng)了基因調(diào)控的研究。四年后的1965年,莫諾與雅可布即榮獲諾貝爾生理學與醫(yī)學獎。 In
9、stitute of Genetic Engineering 通常由2個以上的編碼序列與啟動序列、操縱序列以及其他調(diào)節(jié)序列在基因組中成簇串聯(lián)組成。操 縱 子編碼序列 啟動序列 操縱序列 其他調(diào)節(jié)序列(promoter)(operator)(coding sequence)Institute of Genetic Engineering是RNA聚合酶結(jié)合并啟動轉(zhuǎn)錄的特異DNA序列。1) 啟動序列RNA轉(zhuǎn)錄起始-35區(qū)-10區(qū)TTGACATTAACTTTTACATATGATTTTACATATGTTTTGATATATAATCTGACGTACTGTN17N16N17N16N16N7N7N6N7N6AA
10、AAAtrp tRNATyrlacrecAAra BAD TTGACA TATAAT共有序列Institute of Genetic Engineering阻遏蛋白 (repressor) 的結(jié)合位點當操縱序列結(jié)合有阻遏蛋白時,會阻礙RNA聚合酶與啟動序列的結(jié)合,或使RNA聚合酶不能沿DNA向前移動 ,阻礙轉(zhuǎn)錄,介導負性調(diào)節(jié)。啟動序列編碼序列操縱序列pol阻遏蛋白2 操縱序列Institute of Genetic Engineering3) 其他調(diào)節(jié)序列、調(diào)節(jié)蛋白激活蛋白(activator)可結(jié)合原核操縱子調(diào)節(jié)序列中特異的DNA序列,促進RNA聚合酶與啟動序列的結(jié)合,增強RNA聚合酶活性,
11、使轉(zhuǎn)錄激活,介導正性調(diào)節(jié)。有些基因在沒有激活蛋白存在時,RNA聚合酶很少或完全不能結(jié)合啟動序列。Institute of Genetic Engineering真核生物的特異DNA序列順式作用元件(cis-acting element)指與結(jié)構(gòu)基因表達調(diào)控有關(guān),能夠被調(diào)控蛋白特異性識別和結(jié)合的DNA序列;或凡能激活或阻遏基因轉(zhuǎn)錄的DNA序列。包括啟動子、增強子、沉默子等。共有序列:如TATA盒、CCAAT盒等,這些共有序列是RNA聚合酶或特異轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)合位點。Institute of Genetic Engineering順式作用元件非編碼序列不一定都位于轉(zhuǎn)錄起始點上游真核基因的順式作用元件
12、分為: 啟動子、增強子、沉默子Institute of Genetic Engineering2. 調(diào)節(jié)蛋白原核生物特異因子:決定RNA聚合酶對一個或一套啟動序列的特異性識別和結(jié)合能力。阻遏蛋白負性調(diào)節(jié)激活蛋白正性調(diào)節(jié)Institute of Genetic Engineering真核基因的調(diào)節(jié)蛋白:轉(zhuǎn)錄因子順式作用順式作用蛋白真核轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子由其編碼基因表達后,通過與特異的順式作用元件的識別、結(jié)合(即DNA-蛋白質(zhì)相互作用)反式激活另一基因的轉(zhuǎn)錄,稱反式作用蛋白或反式作用因子。 反式作用因子 (trans-acting factor) 1)反式作用與反式作用因子絕大多數(shù)真核轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子是DN
13、A結(jié)合蛋白,由某一個基因表達后(蛋白質(zhì))特異地與另一個基因的順式作用元件(DNA)作用,反式激活該基因的轉(zhuǎn)錄。 2)順式作用與順式作用蛋白有些基因產(chǎn)物可以特異地識別、結(jié)合自身基因的調(diào)節(jié)序列,調(diào)節(jié)自身基因的開啟與關(guān)閉。具有這種調(diào)節(jié)方式的調(diào)節(jié)蛋白稱順式作用蛋白。Institute of Genetic EngineeringDNA-蛋白質(zhì)相互作用指反式作用因子與順式作用元件之間的特異識別及結(jié)合。非共價結(jié)合絕大多數(shù)調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)結(jié)合DNA前,需通過蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用,形成二聚體(dimer)或多聚體(polymer)。3. DNA-蛋白質(zhì)、蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)的相互作用Institute of Genet
14、ic Engineering4. RNA聚合酶 啟動序列/啟動子與RNA聚合酶活性啟動序列會影響其與RNA聚合酶的親和力,直接影響轉(zhuǎn)錄起動的頻率。共有序列決定啟動序列的轉(zhuǎn)錄活性大小。 Institute of Genetic Engineering 調(diào)節(jié)蛋白與RNA聚合酶活性特異調(diào)節(jié)蛋白在適當環(huán)境信號刺激下表達,然后通過DNA-蛋白質(zhì)、蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用影響RNA聚合酶活性,從而使基礎(chǔ)轉(zhuǎn)錄頻率發(fā)生改變,出現(xiàn)表達水平變化。如因子可以改變RNA聚合酶識別啟動序列的特異性4. RNA聚合酶Institute of Genetic Engineering小結(jié):基因表達調(diào)控的基本規(guī)律基因表達具有時空
15、特異性誘導表達和阻遏表達是基因表達調(diào)控的普遍方式基因表達受順式作用元件和反式作用因子共同調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)-DNA以及蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)的相互作用是基因表達調(diào)控的分子基礎(chǔ)基因表達調(diào)控是多層次的復雜調(diào)節(jié)Institute of Genetic Engineering原核基因轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)Regulation of Prokaryotic Gene Transcription第 三 節(jié)Institute of Genetic Engineering調(diào)節(jié)的主要環(huán)節(jié)在轉(zhuǎn)錄起始一、原核基因轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)特點(一)因子決定RNA聚合酶識別特異性(二)操縱子模型的普遍性(三)阻遏蛋白與阻遏機制的普遍性(四)多順反子: 一個mRNA
16、分子編碼多個多肽鏈Institute of Genetic Engineering(一)乳糖操縱子(lac operon)的結(jié)構(gòu)Institute of Genetic EngineeringmRNA阻遏蛋白IDNAZYAOPpol沒有乳糖存在時(二)阻遏蛋白的負性調(diào)節(jié)阻遏基因Institute of Genetic Engineering(二)阻遏蛋白的負性調(diào)節(jié)mRNA阻遏蛋白IDNAZYAOPpol啟動轉(zhuǎn)錄mRNA有乳糖存在時半乳糖-半乳糖苷酶乳糖Institute of Genetic Engineering+ + + + 轉(zhuǎn)錄無葡萄糖,cAMP濃度高時有葡萄糖,cAMP濃度低時(三)C
17、AP的正性調(diào)節(jié)ZYAOPDNACAPCAPCAPCAPCAPCAPInstitute of Genetic Engineering(四)協(xié) 調(diào) 調(diào) 節(jié)當阻遏蛋白封閉轉(zhuǎn)錄時,CAP對該系統(tǒng)不能發(fā)揮作用;如無CAP存在,即使沒有阻遏蛋白與操縱序列結(jié)合,操縱子仍無轉(zhuǎn)錄活性。葡萄糖對 lac 操縱子的阻遏作用稱分解代謝阻遏(catabolic repression) Institute of Genetic Engineering單純?nèi)樘谴嬖跁r,細菌利用乳糖作碳源若有葡萄糖或葡萄糖/乳糖共同存在時,細菌首先利用葡萄糖(四)協(xié) 調(diào) 調(diào) 節(jié)Institute of Genetic Engineeringm
18、RNA 低葡萄糖 cAMP濃度高 高葡萄糖cAMP濃度低RNA-polOOOO乳糖操縱子的協(xié)調(diào)調(diào)節(jié)無乳糖高乳糖 色氨酸操縱子是可阻遏操縱子 合成代謝操縱子由合成產(chǎn)物關(guān)閉合成代謝操縱子在基礎(chǔ)狀態(tài)下持續(xù)開放,在產(chǎn)物達到滿足需要量時才關(guān)閉。 分解和合成代謝的操縱子操縱子基礎(chǔ)狀態(tài)調(diào)控方式分解代謝關(guān)閉由誘導物開放合成代謝開放由輔阻遏物關(guān)閉Institute of Genetic Engineering大腸桿菌色氨酸操縱子(trp operon)調(diào)節(jié)基因trpR、啟動子P、操縱基因trpO、前導序列trpL和衰減子trpaTrp Trp 高時Trp 低時mRNA OPtrpR調(diào)節(jié)區(qū) 結(jié)構(gòu)基因 RNA聚合酶
19、 RNA聚合酶 色氨酸操縱子的作用原理操縱子關(guān)閉Institute of Genetic Engineering三、原核生物轉(zhuǎn)錄終止調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄終止機制: 依賴Rho因子的轉(zhuǎn)錄終止 不依賴Rho因子的轉(zhuǎn)錄終止終止調(diào)節(jié)方式: 衰減導致RNA鏈的過早終止; 抗終止阻止衰減的發(fā)生,使下游基因得以表達。1) 兩段富含GC的反向重復序列,中間間隔若干核苷酸;2) 下游含一系列U。Institute of Genetic Engineering轉(zhuǎn)錄衰減機制(二)色氨酸操縱子的弱化機制實質(zhì)是 轉(zhuǎn)錄與翻譯調(diào)控的偶聯(lián) 色氨酸操縱子(trp operon)除了產(chǎn)物阻遏負調(diào)控外,還有轉(zhuǎn)錄衰減(attenuation)調(diào)
20、控方式。 衰減是轉(zhuǎn)錄-翻譯的偶聯(lián)調(diào)控。 衰減子和前導肽在trp mRNA 5端 trpE基因的起始密碼子前有一個長162bp的mRNA片段稱為前導序列,其中有一短的序列可形成轉(zhuǎn)錄終止子結(jié)構(gòu),對操縱子的轉(zhuǎn)錄有減弱作用,這一短序列被稱為衰減子。前導序列中含有起始密碼子AUG和終止密碼子UAG,對應于一個含14個氨基酸的小肽,它的合成直接影響到衰減子結(jié)構(gòu)的形成,從而影響轉(zhuǎn)錄,此小肽稱為前導肽。UUUUUUUU調(diào)節(jié)區(qū) 結(jié)構(gòu)基因 trpROP前導序列 衰減子區(qū)域 UUUU前導mRNA1234衰減子結(jié)構(gòu) 第10、11密碼子為trp密碼子 終止密碼子 14aa前導肽編碼區(qū): 包含序列1 形成發(fā)夾結(jié)構(gòu)能力強弱
21、: 序列1/2序列2/3序列3/4 trp 密碼子 UUUUUUUU34UUUU 334核糖體 前導肽 前導mRNA當色氨酸濃度高時 轉(zhuǎn)錄衰減機制 125 trp 密碼子 衰減子結(jié)構(gòu)就是終止子可使轉(zhuǎn)錄前導DNA UUUU 3 RNA聚合酶 終止UUUU342423UUUU核糖體 前導肽 15 trp 密碼子 結(jié)構(gòu)基因前導DNA RNA聚合酶 當色氨酸濃度低時 Trp合成酶系相關(guān)結(jié)構(gòu)基因被轉(zhuǎn)錄 序列3、4不能形成衰減子結(jié)構(gòu) 前導mRNA 在Trp操縱子中,阻遏蛋白對結(jié)構(gòu)基因轉(zhuǎn)錄的負調(diào)控起到粗調(diào)的作用,而衰減子起到精調(diào)的作用。Institute of Genetic Engineering調(diào)節(jié)蛋白
22、結(jié)合mRNA靶位點,阻止核蛋白體識別翻譯起始區(qū),從而阻斷翻譯。調(diào)節(jié)蛋白一般作用于自身mRNA,抑制自身的合成,稱為自我控制(autogenous control)。四、原核生物翻譯水平調(diào)節(jié)(一)蛋白質(zhì)分子的自我調(diào)節(jié)Institute of Genetic Engineering(二)反義RNA對翻譯的調(diào)節(jié)作用調(diào)節(jié)RNA:可調(diào)節(jié)基因表達的RNA分子。反義RNA含有與特定mRNA翻譯起始部位互補的序列,通過與mRNA雜交阻斷30S小亞基對起始密碼子的識別及與SD序列的結(jié)合,抑制翻譯起始,稱為反義控制 (antisense control)。Institute of Genetic Engineer
23、ing真核基因表達調(diào)節(jié)Regulation of Eukaryotic Gene Expression第 四 節(jié)Institute of Genetic Engineering一、真核基因組結(jié)構(gòu)特點(一)真核基因組結(jié)構(gòu)龐大 編碼基因;重復基因;非編碼序列(二)單順反子 (monocistron)即一個編碼基因轉(zhuǎn)錄生成一個mRNA分子、經(jīng)翻譯生成一條多肽鏈。Institute of Genetic Engineering(三)重復序列單拷貝序列(一次或數(shù)次)高度重復序列(106 次)中度重復序列(103 104次)多拷貝序列反向重復序列(四)基因不連續(xù)性一、真核基因組結(jié)構(gòu)特點真核基因組 原核基因
24、組基因組龐大,與組蛋白結(jié)合形成染色質(zhì)只有一個DNA分子或RNA分子許多DNA不轉(zhuǎn)錄絕大部分參與基因的表達或調(diào)控單順反子多順反子有重復序列重復序列少斷裂基因(有內(nèi)含子)操縱子結(jié)構(gòu)(無內(nèi)含子)Institute of Genetic Engineering真核與原核基因組區(qū)別Institute of Genetic Engineering二、真核基因表達調(diào)控特點(一)RNA聚合酶(RNA pol 、) TATA盒結(jié)合蛋白(TBP)為共有亞基(二)活性染色體結(jié)構(gòu)變化1. 對核酸酶敏感活化基因常有核酸酶超敏位點(hypersensitive site),位于調(diào)節(jié)蛋白結(jié)合位點附近。Institute o
25、f Genetic Engineering2. DNA拓撲結(jié)構(gòu)變化天然雙鏈DNA均以負性超螺旋構(gòu)象存在。RNA-pol正超螺旋負超螺旋轉(zhuǎn)錄方向二、真核基因表達調(diào)控特點Institute of Genetic Engineering3. DNA堿基修飾變化 真核DNA約有5%的胞嘧啶被甲基化 甲基化程度與基因表達程度呈反比,處于轉(zhuǎn)錄活化狀態(tài)的基因CpG序列一般低甲基化。4. 組蛋白變化 組蛋白乙酰化,消除組蛋白與DNA的離子鍵結(jié)合 松弛染色質(zhì),活化轉(zhuǎn)錄二、真核基因表達調(diào)控特點表觀遺傳學表觀遺傳現(xiàn)象包括DNA甲基化、RNA干擾、組蛋白修飾等。與經(jīng)典遺傳學以研究基因序列影響生物學功能為核心相比,表觀
26、遺傳學主要研究這些“表觀遺傳現(xiàn)象”建立和維持的機制。其研究內(nèi)容主要包括兩類,一類為基因選擇性轉(zhuǎn)錄表達的調(diào)控,有DNA甲基化、基因印記、組蛋白共價修飾和染色質(zhì)重塑;另一類為基因轉(zhuǎn)錄后的調(diào)控,包括基因組中非編碼RNA、微小RNA、反義RNA、內(nèi)含子及核糖開關(guān)等。 Institute of Genetic Engineering采用正性調(diào)節(jié)機制更精準采用負性調(diào)節(jié)不經(jīng)濟(三)正性調(diào)節(jié)占主導(四)轉(zhuǎn)錄與翻譯分隔進行(五)轉(zhuǎn)錄后修飾、加工二、真核基因表達調(diào)控特點Institute of Genetic Engineering三、RNA pol轉(zhuǎn)錄起始的調(diào)節(jié)(一)順式作用元件1. 啟動子真核基因啟動子是RN
27、A聚合酶結(jié)合位點周圍的一組轉(zhuǎn)錄控制組件,至少包括一個轉(zhuǎn)錄起始點以及一個以上的功能組件。典型的啟動子由TATA盒及上游的CAAT盒和/或GC盒組成。Institute of Genetic Engineering真核啟動子的典型結(jié)構(gòu) TATA Box CAAT Box GC Box Enhancercis-acting elements structural gene-GCGC-CAAT-TATAInitiation siteInstitute of Genetic Engineering2. 增強子(enhancer)指遠離轉(zhuǎn)錄起始點、決定基因的時間、空間特異性表達、增強啟動子轉(zhuǎn)錄活性的DNA
28、序列,其作用方式通常與方向、距離無關(guān)。酵母中存在上游激活序列(upstream activator sequences, UASs)3. 沉默子(silencer)某些基因的負性調(diào)節(jié)元件,當其結(jié)合特異蛋白因子時,對基因轉(zhuǎn)錄起阻遏作用。(一)順式作用元件 增強子的功能與特征增強子與被調(diào)控基因位于同一條DNA鏈上,屬于順式作用元件。增強子是組織特異性轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)合部位。可以遠距離實施調(diào)控,上游或下游作用與序列的方向性無關(guān)。需要啟動子才能發(fā)揮作用。同一增強子可以影響不同類型啟動子的轉(zhuǎn)錄。Institute of Genetic Engineering(二)反式作用因子 1. 轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子分類(按功能
29、特性) 基本轉(zhuǎn)錄因子(general transcription factors)RNA聚合酶結(jié)合啟動子所必需的一組蛋白因子,決定三種RNA(mRNA、tRNA及rRNA)轉(zhuǎn)錄的類別。TFD是三種聚合酶的基本轉(zhuǎn)錄因子。Institute of Genetic Engineering特異轉(zhuǎn)錄因子(special transcription factors)為個別基因轉(zhuǎn)錄所必需,決定該基因的時間、空間特異性表達。 轉(zhuǎn)錄激活因子:增強子結(jié)合蛋白 轉(zhuǎn)錄抑制因子:沉默子結(jié)合蛋白 (transcription activators) (transcription inhibitors)(二)反式作用因子
30、Institute of Genetic Engineering2. 轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子結(jié)構(gòu)TF蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)結(jié)合域(二聚化結(jié)構(gòu)域)轉(zhuǎn)錄激活域 谷氨酰胺富含域酸性激活域脯氨酸富含域DNA結(jié)合域鋅指結(jié)構(gòu)堿性螺旋-環(huán)-螺旋亮氨酸拉鏈Institute of Genetic Engineering最常見的DNA結(jié)合域 1. 鋅指 (zinc finger)常結(jié)合GC盒螺旋折疊Institute of Genetic Engineering 2. -螺旋常結(jié)合CAAT盒堿性氨基酸殘基組成最常見的DNA結(jié)合域Institute of Genetic Engineering3. 亮氨酸拉鏈(leucine zi
31、pper) 蛋白質(zhì)C末端每隔6個氨基酸出現(xiàn)一個疏水性的Leu殘基形成的二聚體N末端富含堿性氨基酸,其正電荷與DNA骨架上的磷酸基團結(jié)合。Institute of Genetic Engineering4.堿性螺旋-環(huán)-螺旋(basic helix-loop-helix,bHLH) Institute of Genetic Engineering(三)mRNA 轉(zhuǎn)錄激活及其調(diào)節(jié)polTFHTAFTFFTAFTAFTFATFBTBP真核RNA聚合酶在轉(zhuǎn)錄因子幫助下,形成的轉(zhuǎn)錄起始復合物.TATA DNATBP相關(guān)因子EBP基因活化蛋白質(zhì)與增強子或UASs的結(jié)合;通用轉(zhuǎn)錄因子在啟動子處的組裝;輔助激
32、活子(coactivator)和/或中介子(medicator)在通用轉(zhuǎn)錄因子/RNA聚合酶II復合物與基因活化蛋白質(zhì)之間的輔助和中介作用。 RNA聚合酶II與啟動子的結(jié)合、啟動轉(zhuǎn)錄需要諸多蛋白質(zhì)因子的協(xié)同作用。這通常包括:TATA盒TF IIDRNA聚合酶II通用轉(zhuǎn)錄因子轉(zhuǎn)錄方向中介子活化蛋白活化蛋白增強子增強子DNATF IIAInstitute of Genetic Engineering真核基因轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)是復雜的、多樣的不同的DNA元件組合可產(chǎn)生多種類型的轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)方式;多種轉(zhuǎn)錄因子又可結(jié)合相同或不同的DNA元件。轉(zhuǎn)錄因子與DNA元件結(jié)合后,對轉(zhuǎn)錄激活過程所產(chǎn)生的效果各異,有正性調(diào)節(jié)或負性
33、調(diào)節(jié)之分。Institute of Genetic Engineering(一)HIV基因組轉(zhuǎn)錄終止調(diào)節(jié)抗終止蛋白Tat Tat,抗終止蛋白,與mRNA5端結(jié)合(二)熱休克蛋白基因的轉(zhuǎn)錄終止調(diào)節(jié)熱休克時停止大多數(shù)基因的轉(zhuǎn)錄和翻譯五、RNA pol轉(zhuǎn)錄終止的調(diào)節(jié)Institute of Genetic Engineering六、轉(zhuǎn)錄后水平的調(diào)節(jié)(一)hnRNA加工成熟的調(diào)節(jié) 1. 加帽 2. 加尾 3. 剪接 4. 編輯5加帽的作用在于: 有助于保護mRNA免于被核糖核酸酶降解;5帽結(jié)合蛋白復合體參與mRNA和核糖體的結(jié)合來起始翻譯 。促進mRNA從細胞核運輸?shù)郊毎麧{;協(xié)助mRNA的剪接。在剪接
34、第一個外顯子時,剪接體的形成需要帽結(jié)合蛋白的參與;poly(A)尾可結(jié)合一種或多種特殊蛋白,避免mRNA被酶降解,并在翻譯過程中具有重要作用。poly(A)尾的作用:人視黃醛還原酶mRNA的選擇性剪接mRNAPre-mRNA同種異型mRNAInstitute of Genetic Engineering(二)mRNA運輸、胞漿內(nèi)穩(wěn)定性的調(diào)節(jié)穩(wěn)定性降解途徑保證mRNA不在細胞中累積并避免合成過多的蛋白質(zhì)。合成速率 降解速率六、轉(zhuǎn)錄后水平的調(diào)節(jié)不同真核基因的mRNA的降解速率大不相同。 暫時需要的基因產(chǎn)物:半衰期可能僅為幾分鐘、甚至幾秒鐘。 經(jīng)常需要的基因產(chǎn)物:其mRNA 可在多代細胞中穩(wěn)定存在。
35、 真核細胞mRNA降解由每種mRNA分子的序列所決定。 poly(A)的逐漸短縮:最常見的途徑mRNA分子一旦進入細胞漿中,核酸外切酶會使poly(A)末端逐步短縮,當剩下約30個A時,5端發(fā)生脫帽,mRNA分子被迅速降解。一些mRNA分子的3UTR的特殊序列有助于特殊蛋白質(zhì)的結(jié)合,增加或降低poly(A)短縮的速度。 Institute of Genetic Engineering RNA與蛋白質(zhì)結(jié)合形成核蛋白體復合物(RNP)。 鐵轉(zhuǎn)運蛋白受體(TfR)mRNA穩(wěn)定性的調(diào)節(jié)決定于mRNA分子中3UTR特定的重復序列, 稱為鐵反應元件(iron-response element, IRE)。
36、細胞內(nèi)高鐵濃度時,IRE可促進TfR mRNA的降解。細胞內(nèi)鐵不足時, TfR mRNA穩(wěn)定性增加,受體蛋白合成增多。六、轉(zhuǎn)錄后水平的調(diào)節(jié) IRE-BP對轉(zhuǎn)鐵蛋白受體mRNA穩(wěn)定性的調(diào)節(jié)低鐵狀態(tài)轉(zhuǎn)鐵蛋白受體mRNA5編碼區(qū)活化的IRE-BP3poly(A)n翻譯TfR蛋白IRE高鐵狀態(tài)轉(zhuǎn)鐵蛋白受體mRNA5編碼區(qū)鐵失活的IRE-BP3poly(A)nmRNA降解IRE微小RNA(microRNA)是一種大小約2123個堿基的單鏈小分子RNA,是由具有發(fā)夾結(jié)構(gòu)的約70-90個堿基大小的單鏈RNA前體經(jīng)過Dicer酶加工后形成。miRNA與其他蛋白質(zhì)組成誘導沉默復合體(RISC),通過與靶mRNA
37、分子的3端非編碼區(qū)互補匹配,抑制mRNA分子的翻譯。Institute of Genetic Engineering(三)小分子RNA對基因表達的調(diào)節(jié)siRNA通常是一段長21個核苷酸的雙股RNA(dsRNA),參與RISC組成,與特異的靶mRNA完全互補結(jié)合,導致靶mRNA降解阻斷翻譯過程。RNA干涉(RNA interference,RNAi)Institute of Genetic Engineering(三)小分子RNA對基因表達的調(diào)節(jié)小干擾RNA(small interference RNA)700bp左右RNA前體配對堿基DICER20-25bp miRNA5RISC靶mRNA未配
38、對區(qū)域靶mRNA降解導入的雙鏈RNA片段siRNARDE-1DICERRISCRISCRISC5靶mRNA靶mRNA被核酸內(nèi)切酶切割靶mRNA被核酸外切酶降解 miRNA 與siRNA使靶mRNA沉默機制siRNA和miRNA的差異比較siRNAmiRNA前體內(nèi)源或外源長雙鏈RNA誘導產(chǎn)生內(nèi)源發(fā)夾環(huán)結(jié)構(gòu)的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物結(jié)構(gòu)雙鏈分子單鏈分子功能降解mRNA阻遏其翻譯靶mRNA結(jié)合需完全互補不需完全互補生物學效應抑制轉(zhuǎn)座子活性和病毒感染發(fā)育過程的調(diào)節(jié)Institute of Genetic EngineeringInstitute of Genetic Engineering(一)翻譯起始因子(eIF)活性的調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)合成速率的快速變化
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