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文檔簡介

1、關(guān)于實(shí)驗(yàn)體外重組第一張,PPT共二十五頁,創(chuàng)作于2022年6月實(shí)驗(yàn)?zāi)康呐c要求掌握體外DNA的重組過程;學(xué)習(xí)外源DNA分子經(jīng)限制性內(nèi)切酶切割后與載體的連接及轉(zhuǎn)化過程;學(xué)習(xí)對(duì)DNA重組子的篩選方法。 第二張,PPT共二十五頁,創(chuàng)作于2022年6月實(shí)驗(yàn)原理實(shí)驗(yàn)材料實(shí)驗(yàn)步驟預(yù)期結(jié)果注意事項(xiàng)第三張,PPT共二十五頁,創(chuàng)作于2022年6月一、實(shí)驗(yàn)原理1、DNA重組簡介2、DNA連接酶3、TA克隆4、藍(lán)白篩選第四張,PPT共二十五頁,創(chuàng)作于2022年6月DNA重組是外源DNA與載體分子的連接,重組的DNA分子是在DNA連接酶的作用下,有Mg2、ATP存在的連接緩沖系統(tǒng)中,將經(jīng)過酶切的或脫磷酸處理的載體分子與

2、外源DNA分子進(jìn)行連接。這樣經(jīng)過重新組合的DNA叫做重組體或重組子。1、DNA重組簡介第五張,PPT共二十五頁,創(chuàng)作于2022年6月DNA重組包括如下步驟: 外源DNA片段的制備; 載體的選擇; DNA片段與載體連接; 導(dǎo)入宿主細(xì)胞。第六張,PPT共二十五頁,創(chuàng)作于2022年6月第七張,PPT共二十五頁,創(chuàng)作于2022年6月第八張,PPT共二十五頁,創(chuàng)作于2022年6月 2種連接酶T4噬菌體DNA連接酶和大腸桿菌DNA連接酶。 (1)大腸桿菌DNA連接酶 僅能連接具有相同粘性末端的兩個(gè)DNA分子。2、DNA連接酶第九張,PPT共二十五頁,創(chuàng)作于2022年6月(2) T4噬菌體DNA連接酶 不僅

3、能連接具有相同粘性末端的兩個(gè)DNA分子,還可以連接平末端雙鏈DNA分子。 但后者連接效率比較低,一般可提高T酶濃度或增加DNA濃度來提高平末端的連接效率。第十張,PPT共二十五頁,創(chuàng)作于2022年6月2、DNA連接酶 T4噬菌體DNA連接酶催化DNA連接反應(yīng)分為3步: 首先,T4連接酶與輔助因子AMP形成酶-AMP復(fù)合物; 然后,酶-AMP復(fù)合物再結(jié)合到具有5-磷酸基和3-羥基切口的DNA上,使DNA腺苷化; 最后,產(chǎn)生一個(gè)新的磷酸二酯鍵,把切口封起來。酶最適溫度為37 ,但該溫度下粘性末端氫鍵不穩(wěn)定,所以連接反應(yīng)一般采取1216 連接過夜。第十一張,PPT共二十五頁,創(chuàng)作于2022年6月磷酸

4、二酯鍵的形成DNA連接酶DNA連接酶DNA連接酶目的基因與載體的連接第十二張,PPT共二十五頁,創(chuàng)作于2022年6月3、TA克隆將3端具有單個(gè)“A”突出末端的PCR產(chǎn)物克隆到3端具有單個(gè)“T”突出末端的線性化載體的克隆法。第十三張,PPT共二十五頁,創(chuàng)作于2022年6月第十四張,PPT共二十五頁,創(chuàng)作于2022年6月4、 藍(lán)白篩選pUC質(zhì)粒載體含有大腸桿菌-半乳糖苷酶基因(lac z)的啟動(dòng)子(受IPTG誘導(dǎo))及其編碼肽鏈( -半乳糖苷酶的氨基末端短片段)的DNA序列(特稱為lac z基因)。位于 lac z基因中靠近5端有一段多克隆位點(diǎn)(MCS)區(qū)段,但它并不破壞該基因的功能。第十五張,PP

5、T共二十五頁,創(chuàng)作于2022年6月受體大腸桿菌細(xì)胞的-半乳糖苷酶發(fā)生了突變,失去的氨基末端。當(dāng)lacz基因編碼的肽鏈同失去了正常氨基末端的-半乳糖苷酶突變體互補(bǔ)時(shí),便會(huì)產(chǎn)生出有活性的-半乳糖苷酶分子,在IPTG誘導(dǎo)下,會(huì)啟動(dòng)表達(dá),分解X-gal產(chǎn)生藍(lán)色背景。第十六張,PPT共二十五頁,創(chuàng)作于2022年6月當(dāng)MCS中插入外源基因后,會(huì)阻斷肽鏈合成,不能形成互補(bǔ),不能產(chǎn)生功能活性的-半乳糖苷酶,也就不會(huì)產(chǎn)生藍(lán)色背景。所以含有重組質(zhì)粒載體的克隆是白色的。第十七張,PPT共二十五頁,創(chuàng)作于2022年6月二、實(shí)驗(yàn)材料l、儀器和材料 感受態(tài)細(xì)胞(如E. coli JMl09、DH5 a)恒溫培養(yǎng)箱,恒溫?fù)u

6、床,恒溫水浴槽,1.5 mL微量離心管(Ep管),微量取液器200 L及20 L吸頭,電泳儀,電泳槽。第十八張,PPT共二十五頁,創(chuàng)作于2022年6月 2、試劑 (1) 載體:質(zhì)粒pUC l8/19 (2) 目的基因:如小牛胸腺DNA (3) 限制性內(nèi)切酶:EcoRI,Hind (4) T4 DNA連接酶 (5) 0.1 mol/L CaCl2溶液 (6) LB瓊脂固體平板 (含氨芐青霉素) (7) 5 mL LB液體培養(yǎng)基(含氨芐青霉素) (8) 20 mg/mL X-gal(5-溴-4-氯-3-吲哚-D-半乳糖苷) (9) 200 mg/mL IPTG(異丙基硫代-D-半乳糖苷) (10)

7、 瓊脂糖 (11) 無菌雙蒸水第十九張,PPT共二十五頁,創(chuàng)作于2022年6月三、實(shí)驗(yàn)步驟1、雙酶切目的基因及載體(TA克隆法可省此步)2、連接與轉(zhuǎn)化3、培養(yǎng)觀察第二十張,PPT共二十五頁,創(chuàng)作于2022年6月1、連接(5L 體系):pEASY T3 1L PCR純化產(chǎn)物 1-4L (Taq酶擴(kuò)增)25 連接15min。一般,載體:外源基因(摩爾比)=1:21:102、轉(zhuǎn)化:10L連接產(chǎn)物全用來轉(zhuǎn)化200L大腸桿菌感受態(tài)細(xì)胞。在含Amp的LB平板上,添加40 L 20 mg/mL X-gal及4 L 200 mg/mL IPTG,然后涂布轉(zhuǎn)化后的細(xì)胞。3、培養(yǎng):37 ,倒置培養(yǎng)16h后,觀察結(jié)

8、果。計(jì)數(shù)白色和藍(lán)色菌落。第二十一張,PPT共二十五頁,創(chuàng)作于2022年6月四、預(yù)期實(shí)驗(yàn)結(jié)果37倒置培養(yǎng)1216 h后,平板上可見生長有藍(lán)色和白色的菌落,其中白色菌落含有重組DNA,藍(lán)色菌落含有未重組成功的質(zhì)粒DNA 第二十二張,PPT共二十五頁,創(chuàng)作于2022年6月五、注意事項(xiàng)雙酶切時(shí),注意選擇合適高效的2種酶,注意雙酶的緩沖液、溫度的協(xié)調(diào)。酶的加入量須小于反應(yīng)體積的1/10,否則酶液中所含有甘油會(huì)抑制酶解反應(yīng)。注意連接體系中,載體與插入片段之間的 摩爾比。插入片段所需量(ng)=載體含量(ng)*插入片段長度(kb)載體長度(kb)*片段與載體摩爾比第二十三張,PPT共二十五頁,創(chuàng)作于2022年6月時(shí)間安排8: 3

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