原核基因表達(dá)調(diào)控 (6)講稿_第1頁
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文檔簡介

1、關(guān)于原核基因表達(dá)調(diào)控 (6)第一張,PPT共六十六頁,創(chuàng)作于2022年6月緒論原核生物和單細(xì)胞真核生物直接暴露在變幻莫測的環(huán)境中,食物供應(yīng)毫無保障,只有能根據(jù)環(huán)境條件的改變合成各種不同的蛋白質(zhì),使代謝過程適應(yīng)環(huán)境的變化,才能維持自身的生存和繁衍。自然選擇傾向于保留高效率的生命過程。在一個每30min增殖一倍的109細(xì)菌群體中,若有一個細(xì)菌變成了29.5min增殖一倍,大約經(jīng)過80天的連續(xù)生長后,這個群體中的99.9%都將具有29.5min增殖一倍的生長速度。第二張,PPT共六十六頁,創(chuàng)作于2022年6月一個大腸桿菌細(xì)胞中約有2500-3000個基因。估計正常情況下,可帶有107個蛋白質(zhì),平均每

2、個基因產(chǎn)生3000多個蛋白質(zhì)分子。但大腸桿菌中一般帶有15,000-30,000個核糖體,有50余種核糖體結(jié)合蛋白,數(shù)量也很驚人。此外,負(fù)責(zé)糖酵解系統(tǒng)的蛋白質(zhì)數(shù)量也很大。而象半乳糖苷酶等誘導(dǎo)酶,其含量可少至每細(xì)胞僅1-5個分子。 第三張,PPT共六十六頁,創(chuàng)作于2022年6月一個體系在需要時被打開,不需要時被關(guān)閉。這種“開-關(guān)”(on-off)活性是通過調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄來建立的,也就是說mRNA的合成是可以被調(diào)節(jié)的。當(dāng)我們說一個系統(tǒng)處于“off”狀態(tài)時,也有本底水平的基因表達(dá),常常是每世代每個細(xì)胞只合成1或2個mRNA分子。所謂“關(guān)”實際的意思是基因表達(dá)量特別低,很難甚至無法檢測??茖W(xué)家把這個從DNA

3、到蛋白質(zhì)的過程稱為基因表達(dá)(gene expression),對這個過程的調(diào)節(jié)就稱為基因表達(dá)調(diào)控(gene regulation或gene control)。要了解動、植物生長發(fā)育的規(guī)律、形態(tài)結(jié)構(gòu)特征和生物學(xué)功能,就必須弄清楚基因表達(dá)調(diào)控的時間和空間概念,掌握了基因表達(dá)調(diào)控的秘密,我們手中就有了一把揭示生物學(xué)奧妙的金鑰匙。 第四張,PPT共六十六頁,創(chuàng)作于2022年6月基因表達(dá)調(diào)控主要表現(xiàn)在以下幾個方面: 轉(zhuǎn)錄水平上的調(diào)控(transcriptional regulation); mRNA加工成熟水平上的調(diào)控(differential processing of RNA transcript)

4、; 翻譯水平上的調(diào)控(differential translation of mRNA).原核生物中,營養(yǎng)狀況(nutritionalstatus)和環(huán)境因素(environmental factor)對基因表達(dá)起著舉足輕重的影響。在真核生物尤其是高等真核生物中,激素水平(hormone level)和發(fā)育階段(developmental stage)是基因表達(dá)調(diào)控的最主要手段,營養(yǎng)和環(huán)境因素的影響力大為下降。 第五張,PPT共六十六頁,創(chuàng)作于2022年6月第六張,PPT共六十六頁,創(chuàng)作于2022年6月一、 乳糖操縱子的調(diào)控模式 大腸桿菌乳糖操縱子(lactose operon)包括3個結(jié)構(gòu)基

5、因:Z、Y和A,以及啟動子、控制子和阻遏子等。轉(zhuǎn)錄時,RNA聚合酶首先與啟動區(qū)(promoter,P)結(jié)合,通過操縱區(qū)(operator,O)向右轉(zhuǎn)錄。轉(zhuǎn)錄從O區(qū)的中間開始,按ZYA方向進(jìn)行,每次轉(zhuǎn)錄出來的一條mRNA上都帶有這3個基因。轉(zhuǎn)錄的調(diào)控是啟動區(qū)和操縱區(qū)進(jìn)行的 .第七張,PPT共六十六頁,創(chuàng)作于2022年6月第八張,PPT共六十六頁,創(chuàng)作于2022年6月Z編碼-半乳糖苷酶;Y編碼-半乳糖苷透過酶;A編碼-半乳糖苷乙酰基轉(zhuǎn)移酶。-半乳糖苷酶是一種-半乳糖苷鍵的專一性酶,除能將乳糖水解成葡萄糖和半乳糖外,還能水解其他-半乳糖苷(如苯基半乳糖苷)。-半乳糖苷透過酶的作用是使外界的-半乳糖苷

6、(如乳糖)能透過大腸桿菌細(xì)胞壁和原生質(zhì)膜進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)。-半乳糖苷乙酰基轉(zhuǎn)移酶的作用是把乙酰輔酶A上的乙?;D(zhuǎn)到-半乳糖苷上,形成乙酰半乳糖。第九張,PPT共六十六頁,創(chuàng)作于2022年6月1 酶的誘導(dǎo)-lac體系受調(diào)控的證據(jù)在不含乳糖及-半乳糖苷的培養(yǎng)基中,lac+基因型每個大腸桿功細(xì)胞內(nèi)大約只有1-2個酶分子。如果在培養(yǎng)基中加入乳糖,酶的濃度很快達(dá)到細(xì)胞總蛋白量的6%或7%,每個細(xì)胞中可有超過105個酶分子。 第十張,PPT共六十六頁,創(chuàng)作于2022年6月第十一張,PPT共六十六頁,創(chuàng)作于2022年6月第十二張,PPT共六十六頁,創(chuàng)作于2022年6月科學(xué)家把大腸桿菌細(xì)胞放在加有放射性35S標(biāo)記的

7、氨基酸但沒有任何半乳糖誘導(dǎo)物的培養(yǎng)基中繁殖幾代,然后再將這些帶有放射活性的細(xì)菌轉(zhuǎn)移到不含35S、無放射性的培養(yǎng)基中,隨著培養(yǎng)基中誘導(dǎo)物的加入,-半乳糖苷酶便開始合成。分離-半乳糖苷酶,發(fā)現(xiàn)這種酶無35S標(biāo)記。說明酶的合成不是由前體轉(zhuǎn)化而來的,而是加入誘導(dǎo)物后新合成的。第十三張,PPT共六十六頁,創(chuàng)作于2022年6月已經(jīng)分離在有誘導(dǎo)物或沒有誘導(dǎo)物的情況下都能產(chǎn)生lacmRNA的突變體,這種失去調(diào)節(jié)能力的突變體稱為永久型突變體,為分兩類:I型和O型。 I型:野生型為I+,突變型為I-O型:野生型為O+,突變型為Oc。 第十四張,PPT共六十六頁,創(chuàng)作于2022年6月I+I-或O+Oc后,Z、Y、A

8、結(jié)構(gòu)基因均表現(xiàn)為永久表達(dá),所以I基因被稱為調(diào)節(jié)基因(regulatory gene)。研究發(fā)現(xiàn),I基因是一個產(chǎn)生阻遏物的調(diào)節(jié)基因,其產(chǎn)物使體系關(guān)閉。I-突變體由于不能產(chǎn)生阻遏物,使細(xì)胞成為lac永久表達(dá)型。I-/I+局部二倍體由于帶有一個正常阻遏物,使細(xì)胞中的lac仍然被抑制。 第十五張,PPT共六十六頁,創(chuàng)作于2022年6月遺傳學(xué)圖譜分析指出,Oc突變位于I與Z之間,所以,lac體系的4個基因的序列為IOZY。通過這些觀察,Jacob和Monod推斷Oc突變代表DNA鏈上的一個位點或一個非編碼區(qū)域,而不是一個基因,因為可編碼的基因具有互補性,而Oc沒有這一特性。O決定相鄰Z基因的產(chǎn)物是誘導(dǎo)型

9、合成還是永久型合成,O區(qū)域稱為操縱基因。 第十六張,PPT共六十六頁,創(chuàng)作于2022年6月第十七張,PPT共六十六頁,創(chuàng)作于2022年6月第十八張,PPT共六十六頁,創(chuàng)作于2022年6月2. 操縱子模型 Jacob和Monod認(rèn)為誘導(dǎo)酶(他們當(dāng)時稱為適應(yīng)酶)現(xiàn)象是個基因調(diào)控問題,可以用實驗方法進(jìn)行研究,因此選為突破口,終于通過大量實驗及分析,建立了該操縱子的控制模型。第十九張,PPT共六十六頁,創(chuàng)作于2022年6月第二十張,PPT共六十六頁,創(chuàng)作于2022年6月第二十一張,PPT共六十六頁,創(chuàng)作于2022年6月 Z、Y、A基因的產(chǎn)物由同一條多順反子的mRNA分子所編碼。 這個mRNA分子的啟動

10、子緊接著O區(qū),而位于I與O之間的啟動子區(qū)(P),不能單獨起動合成-半乳糖苷酶和透過酶的生理過程。 操縱基因是DNA上的一小段序列(僅為26bp),是阻遏物的結(jié)合位點。當(dāng)阻遏物與操縱基因結(jié)合時,lacmRNA的轉(zhuǎn)錄起始受到抑制。誘導(dǎo)物通過與阻遏物結(jié)合,改變它的三維構(gòu)象,使之不能與操縱基因結(jié)合,從而激發(fā)lacmRNA的合成。當(dāng)有誘導(dǎo)物存在時,操縱基因區(qū)沒有被阻遏物占據(jù),所以啟動子能夠順利起始mRNA的合成。第二十二張,PPT共六十六頁,創(chuàng)作于2022年6月3. Lac操縱子的本底水平表達(dá)因為誘導(dǎo)物需要穿過細(xì)胞膜才能與阻遏物結(jié)合,而運轉(zhuǎn)誘導(dǎo)物需要透過酶。在非誘導(dǎo)狀態(tài)下有少量(1-5個mRNA分子)l

11、ac mRNA合成-本底水平永久型合成。 第二十三張,PPT共六十六頁,創(chuàng)作于2022年6月4. 葡萄糖對lac操縱子的影響-代謝物阻遏效應(yīng) 研究表明,葡萄糖對lac操縱子表達(dá)的抑制作用是間接的,因為存在一種大腸桿菌突變株,它正常的糖酵解過程受阻,葡萄糖-6-磷酸不能轉(zhuǎn)化為下一步代謝中間物,該菌株能在有葡萄糖存在的情況下被誘導(dǎo)合成lac mRNA。第二十四張,PPT共六十六頁,創(chuàng)作于2022年6月5. cAMP與代謝物激活蛋白 第二十五張,PPT共六十六頁,創(chuàng)作于2022年6月第二十六張,PPT共六十六頁,創(chuàng)作于2022年6月當(dāng)葡萄糖和乳糖同時存在于培養(yǎng)基中時,lac啟動子表達(dá)受阻,沒有-半乳

12、糖苷酶活性;當(dāng)葡萄糖消耗完以后(圖中箭頭處),細(xì)胞內(nèi)cAMP濃度增加,-半乳糖苷酶活性被誘導(dǎo),一度停止生長的細(xì)胞又恢復(fù)分裂。如果將細(xì)菌放在缺乏碳源的培養(yǎng)基中,細(xì)胞內(nèi)cAMP濃度就很高;若在含葡萄糖的培養(yǎng)基中培養(yǎng),細(xì)菌中的cAMP濃度就會很低;如果將細(xì)菌置于甘油或乳糖等不進(jìn)行糖酵解的碳源培養(yǎng)基中,細(xì)菌中cAMP的濃度也會很高。第二十七張,PPT共六十六頁,創(chuàng)作于2022年6月第二十八張,PPT共六十六頁,創(chuàng)作于2022年6月第二十九張,PPT共六十六頁,創(chuàng)作于2022年6月 研究證實,葡萄糖所引起的代謝物抑制(Catabolite repression)現(xiàn)象的實質(zhì)是該代謝物降低了細(xì)胞中cAMP的

13、含量.事實上,cAMP-CAP復(fù)合物是lac體系的positive regulator,它們不能代替lacI和lacO的功能(negative regulator)。cAMP-CAP不但能與DNA相結(jié)合,造成雙螺旋彎曲,易于形成三元轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物,它還能直接影響RNA聚合酶的活性。Dominant negative(Trans-dominant)lacI-d,只要有這個環(huán)的亞基存在,lacI+基因產(chǎn)物(阻遏物)無法與O區(qū)相結(jié)合lac operon得到表達(dá)。 第三十張,PPT共六十六頁,創(chuàng)作于2022年6月6. lac操縱子DNA的調(diào)控區(qū)域-P.O.區(qū) lac P(啟動子區(qū))從I基因結(jié)束到mRN

14、A轉(zhuǎn)錄起始位點止,共長82bp(-82+1)O區(qū)就是阻遏物結(jié)合區(qū),位于P區(qū)后半部分和轉(zhuǎn)錄起始區(qū)(-7+28),該區(qū)序列有對稱性,其對稱中心點在+11位。P區(qū)的CAMP-CAP結(jié)合區(qū)(-67-52)也有對稱性,其對稱位點在-60-59之間。第三十一張,PPT共六十六頁,創(chuàng)作于2022年6月 在一個完全被誘導(dǎo)的細(xì)胞中,-半乳糖苷酶、透過酶及乙?;D(zhuǎn)移酶的拷貝數(shù)比例為1:0.5:0.2,這個比例在一定程度上反映了以-半乳糖苷作為唯一碳源時細(xì)胞的需要。不同的酶在數(shù)量上的差異是由于在翻譯水平上受到調(diào)節(jié)所致。 lac mRNA可能與翻譯過程中的核糖體相脫離,從而終止蛋白質(zhì)鏈的翻譯。這種現(xiàn)象發(fā)生的頻率取決于

15、每一個后續(xù)的AUG密碼子再度起始翻譯的概率。 在lac mRNA分子內(nèi)部,A基因比Z基因更易受內(nèi)切酶作用發(fā)生降解,因此,在任何時候Z基因的完整拷貝數(shù)要比A基因多。第三十二張,PPT共六十六頁,創(chuàng)作于2022年6月二、 色氨酸操縱子的調(diào)控模式色氨酸操縱子(tryptophane operon)負(fù)責(zé)色氨酸的生物合成,當(dāng)培養(yǎng)基中有足夠的色氨酸時,這個操縱子自動關(guān)閉,缺乏色氨酸時操縱子被打開,trp基因表達(dá),色氨酸或與其代謝有關(guān)的某種物質(zhì)在阻遏過程(而不是誘導(dǎo)過程)中起作用。由于trp體系參與生物合成而不是降解,它不受葡萄糖或cAMP-CAP的調(diào)控。 色氨酸的合成分5步完成。每個環(huán)節(jié)需要一種酶,編碼這

16、5種酶的基因緊密連鎖在一起,被轉(zhuǎn)錄在一條多順反子mRNA上,分別以trpE、trpD、trpC、trpB、trpA代表,編碼了鄰氨基苯甲酸合成酶、鄰氨基苯甲酸焦磷酸轉(zhuǎn)移酶、鄰氨基苯甲酸異構(gòu)酶、色氨酸合成酶和吲哚甘油-3-磷酶合成酶。第三十三張,PPT共六十六頁,創(chuàng)作于2022年6月trpE基因是第一個被翻譯的基因,和trpL和trpa(不是trpA)。trp操縱子中產(chǎn)生阻遏物的基因是trpR,該基因距trp基因簇很遠(yuǎn),后者在大腸桿菌染色體圖上25min處,而前者則位于90min處。在位于65min處還有一個trpS(色氨酸t(yī)RNA合成酶),它和攜帶有trp的tRNATrp也參與trp操縱子的調(diào)

17、控作用。 L區(qū)編碼了前導(dǎo)肽,當(dāng)有高濃度Trp存在時,由于弱化子a的作用,轉(zhuǎn)錄迅速減弱停止,生成140核苷酸的前導(dǎo)RNA;當(dāng)Trp濃度較低時,弱化子不起作用,轉(zhuǎn)錄得以正常進(jìn)行,生成長約7kb的mRNA,操縱子中第一個結(jié)構(gòu)基因的起始密碼子AUG在+162處。第三十四張,PPT共六十六頁,創(chuàng)作于2022年6月第三十五張,PPT共六十六頁,創(chuàng)作于2022年6月1trp操縱子的阻遏系統(tǒng) trpR基因突變常引起trp mRNA的永久型合成,該基因產(chǎn)物因此被稱為輔阻遏蛋白(aporepressor)。除非培養(yǎng)基中有色氨酸,否則這個輔阻遏蛋白不會與操縱區(qū)結(jié)合。輔阻遏蛋白與色氨酸相結(jié)合形成有活性的阻遏物,與操縱

18、區(qū)結(jié)合并使之關(guān)閉轉(zhuǎn)錄trp mRNA。 阻遏-操縱機制對色氨酸來說是一個一級開關(guān),主管轉(zhuǎn)錄是否啟動,相當(dāng)于粗調(diào)開關(guān)。trp操縱子中對應(yīng)于色氨酸生物合成的還有另一個系統(tǒng)進(jìn)行細(xì)調(diào)控,指示已經(jīng)啟動的轉(zhuǎn)錄是否繼續(xù)下去。這個細(xì)微調(diào)控是通過轉(zhuǎn)錄達(dá)到第一個結(jié)構(gòu)基因之前的過早終止來實現(xiàn)的,由色氨酸的濃度來調(diào)節(jié)這種過早終止的頻率。第三十六張,PPT共六十六頁,創(chuàng)作于2022年6月2弱化子與前導(dǎo)肽 在trp mRNA 5端trpE基因的起始密碼前有一個長162bp的mRNA片段被稱為前導(dǎo)區(qū),研究發(fā)現(xiàn),當(dāng)mRNA合成起始以后,除非培養(yǎng)基中完全沒有色氨酸,轉(zhuǎn)錄總是在這個區(qū)域終止,產(chǎn)生一個僅有140個核苷酸的RNA分子

19、,終止trp基因轉(zhuǎn)錄。因為轉(zhuǎn)錄終止發(fā)生在這一區(qū)域,并且這種終止是被調(diào)節(jié)的,這個區(qū)域就被稱為弱化子。 分析前導(dǎo)肽序列,發(fā)現(xiàn)它包括起始密碼子AUG和終止密碼子UGA,編碼了一個14個氨基酸的多肽。該多肽有一個特征,其第10位和11位有相鄰的兩個色氨酸密碼子。正是這兩個相連的色氨酸密碼子(組氨酸、苯丙氨酸操縱子中都有這種現(xiàn)象)調(diào)控了蛋白質(zhì)的合成。第三十七張,PPT共六十六頁,創(chuàng)作于2022年6月第三十八張,PPT共六十六頁,創(chuàng)作于2022年6月第三十九張,PPT共六十六頁,創(chuàng)作于2022年6月第四十張,PPT共六十六頁,創(chuàng)作于2022年6月當(dāng)培養(yǎng)基中色氨酸的濃度很低時,負(fù)載有色氨酸的tRNATrp也

20、就少,這樣翻譯通過兩個相鄰色氨酸密碼子的速度就會很慢,當(dāng)4區(qū)被轉(zhuǎn)錄完成時,核糖體才進(jìn)行到1區(qū)(或停留在兩個相鄰的trp密碼子處),這時的前導(dǎo)區(qū)結(jié)構(gòu)是2-3配對,不形成3-4配對的終止結(jié)構(gòu),所以轉(zhuǎn)錄可繼續(xù)進(jìn)行,直到將trp操縱子中的結(jié)構(gòu)基因全部轉(zhuǎn)錄。 當(dāng)培養(yǎng)基中色氨酸濃度較高時,核糖體可順利通過兩個相鄰的色氨酸密碼子,在4區(qū)被轉(zhuǎn)錄之前就到達(dá)2區(qū),使2-3區(qū)不能配對,3-4區(qū)自由配對形成基一環(huán)終止子結(jié)構(gòu),轉(zhuǎn)錄被終止,trp操縱子被關(guān)閉。第四十一張,PPT共六十六頁,創(chuàng)作于2022年6月3trp操縱子弱化機制的實驗依據(jù) trpS5是溫度敏感型突變株,它所編碼的Trp-tRNAtrp合成酶只在30時有

21、活性,42時無酶活性。比較野生型和突變型在42和30時,突變體的Trp操縱子與野生型一樣受色氨酸濃度的調(diào)控。42時,突變體中Trp操縱子的表達(dá)不受色氨酸濃度的調(diào)控。 另有一個缺失前導(dǎo)區(qū)及D基因的突變體(trpLD102),該細(xì)菌在有色氨酸的培養(yǎng)基中仍有很高的色氨酸合成酶活性。第四十二張,PPT共六十六頁,創(chuàng)作于2022年6月 TrpED53中L不缺失(弱化子存在),trpLD102中L缺失(弱化子不存在),缺失前導(dǎo)區(qū)后的表達(dá)比有前導(dǎo)區(qū)的表達(dá)要高得多,充分說明trp操縱子的表達(dá)調(diào)控除阻遏作用外,還受到前導(dǎo)區(qū)的影響,失去了這個因素就失去了一個調(diào)控機制。 第四十三張,PPT共六十六頁,創(chuàng)作于2022

22、年6月4阻遏與弱化作用的協(xié)調(diào) 有實驗證明,在不加色氨酸的培養(yǎng)基中,trp mRNA的合成仍然受到部分阻遏,現(xiàn)在一般認(rèn)為,野生型細(xì)胞中同時存在著有活性和無活性的阻遏物,培養(yǎng)基中色氨酸濃度的變化,能夠使這兩種阻遏物間的平衡發(fā)生傾斜,最終做出關(guān)閉或啟動trp操縱子的決定,從而維持一定的色氨酸含量。第四十四張,PPT共六十六頁,創(chuàng)作于2022年6月細(xì)菌中為什么要有弱化子系統(tǒng)呢?一種可能是阻遏物從有活性向無活性的轉(zhuǎn)變速度極低,需要有一個能更快地做出瓜的系統(tǒng),以保持培養(yǎng)基中適當(dāng)?shù)纳彼崴?。或者,弱化子系統(tǒng)主要是對外源色氨酸濃度做出反應(yīng)。外源色氨酸濃度很低的信號雖然足以引起trp操縱子的去阻遏作用,但是這

23、個信號還不足以很快引發(fā)內(nèi)源色氨酸的合成。在這種環(huán)境下,弱化子就通過抗終止的方法來增加trp基因表達(dá),從而提高內(nèi)源色氨酸濃度。 那么為什么還要有阻遏體系呢?目前認(rèn)為阻遏物的作用是當(dāng)有大量外源色氨酸存在時,阻止非必需的先導(dǎo)mRNA的合成,它使這個合成系統(tǒng)更加經(jīng)濟第四十五張,PPT共六十六頁,創(chuàng)作于2022年6月三、 其他操縱子的調(diào)控機制1 半乳糖操縱子大腸桿菌半乳糖操縱子(galactose operon)包括3個結(jié)構(gòu)基因: 異構(gòu)酶(UDP-galactose-4epimerase,galE), 半乳糖-磷酸尿嘧啶核苷轉(zhuǎn)移酶(galactose transferase, galT), 半乳糖激酶(

24、galactose kinase, galk)。這3個酶的作用是使半乳糖變成葡萄糖-1-磷酸。GalR與galE、T、K及操縱區(qū)O等離得很遠(yuǎn),而galR產(chǎn)物對galO的作用與lacI-lacO的作用相同。第四十六張,PPT共六十六頁,創(chuàng)作于2022年6月gal操縱子的特點: 它有兩個啟動子,其mRNA可從兩個不同的起始點開始轉(zhuǎn)錄; 它有兩個O區(qū),一個在P區(qū)上游-67-53,另一個在結(jié)構(gòu)基因galE內(nèi)部。第四十七張,PPT共六十六頁,創(chuàng)作于2022年6月 因為半乳糖的利用效率比葡萄糖低,人們猜想葡萄糖存在時半乳糖操縱子不被誘導(dǎo),但實際上有葡萄糖存在時,gal操縱子仍可被誘導(dǎo)?,F(xiàn)已分離到一些突變株

25、,其中一類突變株能在不含葡萄糖的培養(yǎng)基中高水平合成半乳糖代謝酶類(gal結(jié)構(gòu)基因高效表達(dá));而另一類突變株中g(shù)al基因的表達(dá)完全依賴于葡萄糖,培養(yǎng)基中如無葡萄糖存在,這些細(xì)菌的gal基因不表達(dá),不合成半乳糖代謝酶類。 第四十八張,PPT共六十六頁,創(chuàng)作于2022年6月分析gal操縱子P-O區(qū)的DNA序列發(fā)現(xiàn),該操縱子確實存在兩個相距僅5bp的啟動子,可以分別起始mRNA的合成。每個啟動子擁有各自的RNA聚合酶結(jié)合位點S1和S2。 從S1起始的轉(zhuǎn)錄只有在培養(yǎng)基中無葡萄糖時,才能順利進(jìn)行,RNA聚合酶與S1的結(jié)合需要半乳糖、CAP和較高濃度的cAMP。從S2起始的轉(zhuǎn)錄則完全依賴于葡萄糖,高水平的c

26、AMP-CAP能抑制由這個啟動子起始的轉(zhuǎn)錄。當(dāng)有cAMP-CAP時,轉(zhuǎn)錄從S1開始,當(dāng)無cAMP-CAP時,轉(zhuǎn)錄從S2開始。第四十九張,PPT共六十六頁,創(chuàng)作于2022年6月為什么gal操縱子需要兩個轉(zhuǎn)錄起始位點?半乳糖不僅可以作為唯一碳源供細(xì)胞生長,而且與之相關(guān)的物質(zhì)-尿苷二磷酸半乳糖(UDPgal)是大腸桿菌細(xì)胞壁合成的前體。在沒有外源半乳糖的情況下,UDP-gal是通過半乳糖差向異構(gòu)酶的作用由UDP-葡萄糖合成的,該酶是galE基因的產(chǎn)物。生長過程中的所有時間里細(xì)胞必須能夠合成差向異構(gòu)酶?,F(xiàn)在設(shè)想只有S1一個啟動子,那么由于這個啟動子的活性依賴于cAMP-CRP,當(dāng)培養(yǎng)基中有葡萄糖存在時

27、就有能合成異構(gòu)酶。假如唯一的啟動子是S2,那么,即使在葡萄糖存在的情況下,半乳糖也將使操縱子處于充分誘導(dǎo)狀態(tài),這無疑是一種浪費。無論從必要性或經(jīng)濟性考慮,都需要一個不依賴于cAMP-CAP的啟動子(S1)對高水平合成進(jìn)行調(diào)節(jié)。第五十張,PPT共六十六頁,創(chuàng)作于2022年6月2 阿拉伯糖操縱子 阿拉伯糖(arabinose)是另一個可以為代謝提供碳源的五碳糖。在大腸桿菌中阿拉伯糖的降解需要3個基因:araB、araA和araD,分別編碼3個酶:araB基因編碼核酮糖激酶(ribulokinase),araA編碼L-阿拉伯糖異構(gòu)酶(L-arabinose isomerase),araD編碼L-核酮

28、糖-5-磷酸-4-差向異構(gòu)酶(L-ribulose-5phosphate-4epimerase)。與araBAD相鄰的是一個復(fù)合的啟動子區(qū)域和一個調(diào)節(jié)基因araC,這個AraC蛋白同時顯示正、負(fù)調(diào)節(jié)因子的功能。AraBAD和araC基因的轉(zhuǎn)錄是分別在兩條鏈上以相反的方向進(jìn)行的。在標(biāo)準(zhǔn)的遺傳學(xué)圖譜上,araBAD基因簇從啟動子PBAD開始向左進(jìn)行轉(zhuǎn)錄,而araC基因則是從Pc向右轉(zhuǎn)錄。第五十一張,PPT共六十六頁,創(chuàng)作于2022年6月第五十二張,PPT共六十六頁,創(chuàng)作于2022年6月AraC蛋白作為PBAD活性正、負(fù)調(diào)節(jié)因子的雙重功能是通過該蛋白的兩種異構(gòu)體來實現(xiàn)的。Pr是起阻遏作用的形式,可以

29、與現(xiàn)在尚未鑒定的類操縱區(qū)位點相結(jié)合,而Pj是起誘導(dǎo)作用的形式,它通過與PBAD啟動子結(jié)合進(jìn)行調(diào)節(jié)。在沒有阿拉伯糖時,Pr形式占優(yōu)勢;一旦有阿拉伯糖存在,它就能夠與AraC蛋白結(jié)合,使平衡趨向于Pi形式。這樣,阿拉伯糖的誘導(dǎo)作用就可以解釋為阿拉伯糖與Pr的結(jié)合,使Pr離開它的結(jié)合位點,然后,產(chǎn)生大量的Pi,并與啟動子結(jié)合。 第五十三張,PPT共六十六頁,創(chuàng)作于2022年6月第五十四張,PPT共六十六頁,創(chuàng)作于2022年6月因為培養(yǎng)基中含有葡萄糖,所以cAMP-CAP沒有與操縱區(qū)位點相結(jié)合,AraC蛋白處于Pr形式并與A位點結(jié)合,RNA聚合酶很少再與Pc結(jié)合,araC基因雖然仍有轉(zhuǎn)錄,但受到抑制,

30、只有少量 AraC蛋白形成,整個系統(tǒng)幾乎處于靜止?fàn)顟B(tài)。 沒有葡萄糖,也沒有阿拉伯糖,因為沒有誘導(dǎo)物,盡管有cAMP-CAP與操縱區(qū)位點相結(jié)合,AraC蛋白仍以Pr形式為主,無法與操縱區(qū)B位點相結(jié)合,無araBAD mRNA轉(zhuǎn)錄。無葡萄糖,阿拉伯糖時,大量araC基因產(chǎn)物以Pi形式存在,并分別與操縱區(qū)B、A位點相結(jié)合,在cAMP-CAP的共同作用下,araC和araBAD基因大量表達(dá),操縱子充分激活。第五十五張,PPT共六十六頁,創(chuàng)作于2022年6月3. 組氨酸操縱子 與His降解代謝有關(guān)的兩組酶類被稱為hut酶(histidine utilizing enzyme),控制這些酶合成的操縱子被稱

31、為hut operon。由一個多重調(diào)節(jié)的操縱子控制,有兩個啟動子,兩個操縱區(qū)及兩個正調(diào)節(jié)蛋白。Hut操縱子共編碼4種酶和一個阻遏物。4種酶分別由hutG、hutH、hutI及hutU基因編碼,阻遏物則由hutC基因編碼。在產(chǎn)氣克氏菌中,以上基因構(gòu)成兩個轉(zhuǎn)錄單位,hutI、hutG、hutC和hutU、hutH分別被轉(zhuǎn)錄合成兩條mRNA長鏈。這兩個轉(zhuǎn)錄單位各自都有一個啟動子和一個操縱區(qū),其轉(zhuǎn)錄過程都是從左向右進(jìn)行的,hutC阻遏物能與每個操縱區(qū)相結(jié)合。第五十六張,PPT共六十六頁,創(chuàng)作于2022年6月第五十七張,PPT共六十六頁,創(chuàng)作于2022年6月無論以組氨酸作為唯一碳源或氮源,hut操縱子都

32、會處于有活性狀態(tài)。Hut操縱子的每一個啟動子上都有cAMP-CAP結(jié)合位點,當(dāng)碳供應(yīng)匱乏時,能合成cAMP,出現(xiàn)cAMP-CAP復(fù)合物,并與操縱區(qū)上的相應(yīng)位點結(jié)合,誘發(fā)基因轉(zhuǎn)錄。雖然尚不清楚氮源缺乏時的信號是什么,但它很可能也是一個正效應(yīng)子。 第五十八張,PPT共六十六頁,創(chuàng)作于2022年6月4. 多啟動子調(diào)控的操縱子 I rRNA操縱子大腸桿菌rRNA操縱子(rrnE)上有兩個啟動子,P1和P2。P1是強啟動子,營養(yǎng)充沛時,由P1起始的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物比由P2起始的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物高3-5倍。當(dāng)營養(yǎng)匱乏時,P1的作用被抑制,但P2仍有功能。 第五十九張,PPT共六十六頁,創(chuàng)作于2022年6月II. 核糖體蛋

33、白SI操縱子核糖體蛋白SI操縱子(rpsA),它也受應(yīng)急反應(yīng)調(diào)節(jié)。RpsA有4個啟動子,P1、P2是強啟動子,平時主要依靠它們來啟動基因的表達(dá),合成SI蛋白。P3、P4是弱啟動子,只有在緊急情況下,P1、P2啟動子受ppGpp的抑制,由P3、P4起始合成的SI蛋白維持了生命的最低需要。 第六十張,PPT共六十六頁,創(chuàng)作于2022年6月III. Dna Q蛋白操縱子Dna Q蛋白是DNA聚合酶全酶的亞基之一,其主要功能是校正DNA復(fù)制中可能出現(xiàn)的錯誤。在RNA聚合酶活性較低時,操縱子的轉(zhuǎn)錄由弱啟動子P2控制;而RNA聚合酶活性較高時,就開始利用強啟動子P1。 第六十一張,PPT共六十六頁,創(chuàng)作于2022年6月四、 原核生物種的轉(zhuǎn)錄后調(diào)控 1稀有密碼子對翻譯的影響 已知dnaG和rpoD

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