大數(shù)據(jù)sci基礎(chǔ)課

1、這是什么樣的餡餅，讓我來為大家下這類文章屬于數(shù)據(jù)挖掘類文章，通過分析別人的實(shí)驗(yàn)高通實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)例如芯片或二代數(shù)據(jù)根據(jù)生物信息學(xué)方法來尋找這是什么樣的餡餅，讓我來為大家下這類文章屬于數(shù)據(jù)挖掘類文章，通過分析別人的實(shí)驗(yàn)高通實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)例如芯片或二代數(shù)據(jù)根據(jù)生物信息學(xué)方法來尋找潛在重要的生物分子，可以作為診斷標(biāo)志物或預(yù)后標(biāo)志物2. 為什么用別人的數(shù)據(jù)還可章這些產(chǎn)生的海量大數(shù)據(jù)的上傳者一般是取某幾個(gè)重要的分子來研究來文章，因?yàn)榫τ邢?，不可能把所有潛在的分子都研究一遍，但由于的文章必?要數(shù)據(jù)庫(kù)，例如 GEO 數(shù)據(jù)庫(kù)。所以你可以挖掘這些 數(shù)據(jù)上傳你的原始數(shù)據(jù)到來發(fā)現(xiàn)新的潛在有價(jià)值的知識(shí)，這也是這類文章的原因和

2、新穎點(diǎn)。 當(dāng)然你也發(fā)現(xiàn)這類文章影響因子在 1-2 之間，不高。這也是理所當(dāng)然的，如沒有進(jìn)一步實(shí)驗(yàn)研究就能發(fā) 分以上的文章，那就是天上掉妹子的事了3. 完成這類文章要是做些首先，一個(gè)新的 idea，最好是別人在這方向沒有做類似你要做的工作。例如上面的肝癌已過了就不要做了。其次，一個(gè)新的分析方法，一般是構(gòu)建生物網(wǎng)絡(luò)之類的，或根據(jù)新的生物信息學(xué)分析方法，如果這方法是你，那即使是研究的對(duì)象也是上述的肝癌也是能的最后就是寫作，其實(shí)仔細(xì)研究上面的文章發(fā)現(xiàn)也是一般的模版式或羅列式寫法。當(dāng)然要寫的有新意也是不容易的。其中，可能最大的難點(diǎn)是數(shù)據(jù)的挖掘和分析。首先，要會(huì)用一些數(shù)據(jù)庫(kù)，例如 GEO其次，了解些基本的

3、分析方法，看懂分析結(jié)果的生物學(xué)含義。最后，就是實(shí)踐這些分析的過程，可能要編程。方向較少，所以本次公開投稿決定的方向是膽囊癌。特此邀請(qǐng)o 椰子同參這是GEO 數(shù)據(jù)庫(kù)中膽囊癌的數(shù)據(jù)通3-4周1 2 數(shù)據(jù)庫(kù)的這是GEO 數(shù)據(jù)庫(kù)中膽囊癌的數(shù)據(jù)通3-4周1 2 數(shù)據(jù)庫(kù)的具體講解，如數(shù)據(jù)，數(shù)據(jù)分析的方法和結(jié)果3目前會(huì)按照以上進(jìn)度進(jìn)行更新，當(dāng)然可能也會(huì)有所變動(dòng)。方法學(xué)重要，但寫作的思路和切入點(diǎn)也非常重要，關(guān)鍵點(diǎn)是為什么選擇膽囊癌，這是一個(gè)需要體會(huì)的東西，我會(huì)盡快錄制詳細(xì)有關(guān)寫作思路的，因?yàn)榭紤]到，況且文章尚未完工，防止一些耍小聰明的人，我會(huì)想個(gè)辦法呈現(xiàn)給大家，但相信感一定是可以看到的。的童鞋另一點(diǎn)，對(duì)于此次

4、只有2 位同學(xué)報(bào)名，感覺挺失落，大家跟帖表支持，我很欣再一點(diǎn)，帶著公開投稿的機(jī)會(huì)對(duì)于零基礎(chǔ)從來沒寫過 SCI 的童鞋來說，機(jī)會(huì)是十分難得的，既可以親身參與，又可以第一次SCI 文章以我一定會(huì)嚴(yán)格把關(guān)參與童鞋的真“零礎(chǔ)”的給零基礎(chǔ)童鞋學(xué)習(xí)，將會(huì)檢索該童鞋的情況，一些非零基礎(chǔ)的童鞋的行為。本欄寫的文章都是高效率的非實(shí)驗(yàn)性文章，講究的是效率和高產(chǎn)，一般不需要耗費(fèi)很多的體力和精力，所以每次公開投稿只一位即可，一切看第一次公開投稿的情況吧，如果不是很受歡迎，就不做了，畢竟也要花精力的。文獻(xiàn)調(diào)研：在pubed輸入allblddran本欄寫的文章都是高效率的非實(shí)驗(yàn)性文章，講究的是效率和高產(chǎn)，一般不需要耗費(fèi)很

5、多的體力和精力，所以每次公開投稿只一位即可，一切看第一次公開投稿的情況吧，如果不是很受歡迎，就不做了，畢竟也要花精力的。文獻(xiàn)調(diào)研：在pubed輸入allblddranermirarray。再輸入Gallbladder rotein-eraction0microarray和protein-eractionnetwork而hccmicroarray作為就2 查詢下而hccmicroarray作為就2 查詢下的膽囊癌的標(biāo)志物的研究review3，數(shù)據(jù)集的來源文3，數(shù)據(jù)集的來源文geo 中及時(shí)更新，所以要通過人名和geo 中及時(shí)更新，所以要通過人名和4 Ma MZ 膽囊癌的文章，仔細(xì)比3 篇是geo

6、相符，文章的內(nèi)容都是某個(gè)lincRNA實(shí)MaMZ4 Ma MZ 膽囊癌的文章，仔細(xì)比3 篇是geo 相符，文章的內(nèi)容都是某個(gè)lincRNA實(shí)MaMZ是通過篩選從而得出他的lncrna 重點(diǎn)在于lncRNA，那么mRNA 這些Ma MZ 4，方法學(xué)上的創(chuàng)新3下期將更新 GEO 數(shù)據(jù)和分析篇章。鑒于上述講解對(duì)于零基礎(chǔ)從未接觸過大數(shù)據(jù)分析的童鞋來說鑒于上述講解對(duì)于零基礎(chǔ)從未接觸過大數(shù)據(jù)分析的童鞋來說，估計(jì)還是有點(diǎn)力，我會(huì)視大家的反應(yīng)看是不是要進(jìn)一步用手把手來做更詳細(xì)的講解。GEO 數(shù)據(jù)集和簡(jiǎn)單分：v，2 種方法第一種（優(yōu)先原始數(shù)據(jù)數(shù)，2 種方法第一種（優(yōu)先原始數(shù)據(jù)數(shù)據(jù) cel 表達(dá)譜數(shù)據(jù)（矩陣形式）

7、12.1MINiMLformattedfamilyfile(s)中的GPL2.2SeriesMatrix12.1MINiMLformattedfamilyfile(s)中的GPL2.2SeriesMatrixFile(s)中的matrix以上就是所的文件格式，最后導(dǎo)入R 語言進(jìn)行處理。以后的分析具體只有標(biāo)有如的數(shù)據(jù)集才能在 數(shù)據(jù)庫(kù)上進(jìn)行簡(jiǎn)單的分1名稱即可：例如1名稱即可：例如2.2 3.1 2.2 3.1 3.3 和 3.3 和 44查查XX疾病背景，分析了geoXX疾病的數(shù)據(jù)，為了闡明其發(fā)生發(fā)展機(jī)制XX疾病背景，分析了geoXX疾病的數(shù)據(jù)，為了闡明其發(fā)生發(fā)展機(jī)制s Materialsand

8、Microarray ）singoftheMicroarray GOentandConstructthe XXidentificationofanetwork-basedConstructthe XXidentificationofanetwork-basedIdentificationofGOentandXX Key HYPERLINK http:/w/ 作sci*2預(yù)后分*3*miRNA-）*lncRNA-miRNA （）* 拷貝數(shù)-mRNA （，）* 甲基化-mRNA （甲基）* 轉(zhuǎn)錄因子）學(xué)到了這種文章的套路，不同與臨床性文章和meta分析，這是個(gè)目前還學(xué)到了這種文章的套路，不同與臨床性文章和meta分析，這是個(gè)目前還下兩個(gè)數(shù)據(jù)tcga，和oncemine 數(shù)據(jù)庫(kù)，是目前腫瘤最好數(shù)據(jù)庫(kù)，可以直接看