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文檔簡介
1、關(guān)于實(shí)驗(yàn)五轉(zhuǎn)基因植物的檢測第1頁,共29頁,2022年,5月20日,22點(diǎn)11分,星期三1、檢測外源基因在植物細(xì)胞中的轉(zhuǎn)錄,對(duì)外源基因表達(dá)調(diào)控進(jìn)行研究,掌握引物的選擇、cDNA的合成、RT-PCR檢測的原理與方法。實(shí)驗(yàn)?zāi)康牡?頁,共29頁,2022年,5月20日,22點(diǎn)11分,星期三第3頁,共29頁,2022年,5月20日,22點(diǎn)11分,星期三第4頁,共29頁,2022年,5月20日,22點(diǎn)11分,星期三第5頁,共29頁,2022年,5月20日,22點(diǎn)11分,星期三第6頁,共29頁,2022年,5月20日,22點(diǎn)11分,星期三第7頁,共29頁,2022年,5月20日,22點(diǎn)11分,星期三第8頁
2、,共29頁,2022年,5月20日,22點(diǎn)11分,星期三第9頁,共29頁,2022年,5月20日,22點(diǎn)11分,星期三第10頁,共29頁,2022年,5月20日,22點(diǎn)11分,星期三第11頁,共29頁,2022年,5月20日,22點(diǎn)11分,星期三第12頁,共29頁,2022年,5月20日,22點(diǎn)11分,星期三第13頁,共29頁,2022年,5月20日,22點(diǎn)11分,星期三第14頁,共29頁,2022年,5月20日,22點(diǎn)11分,星期三第15頁,共29頁,2022年,5月20日,22點(diǎn)11分,星期三1、材料: 轉(zhuǎn)基因植物的RNA或mRNA制備物。 非轉(zhuǎn)化的植株材料總RNA或mRNA制備物2、設(shè)備
3、:PCR儀、移液器、PCR管等。3、試劑:10RT緩沖液、dNTP、逆轉(zhuǎn)錄酶、 引物(隨機(jī)引物,Oligo dT; 特異引物)、 10One Step RNA PCR Buffer、25 mM MgCl2、10 mM dNTP、RNase Inhibitor (40 U/l)、AMV-Optimized Taq1 l、AMV RTase XL (5 U/l)、上游特異Primer (20 M)*1、下游特異Primer (20 M)*2、RNase Free H2O。實(shí)驗(yàn)材料、設(shè)備及試劑第16頁,共29頁,2022年,5月20日,22點(diǎn)11分,星期三實(shí)驗(yàn)操作步驟:1)RNA提?。?關(guān)鍵 防止R
4、NA降解RNA提取的成功與否是RT-PCR檢測中最重要的步驟。第17頁,共29頁,2022年,5月20日,22點(diǎn)11分,星期三2、cDNA第一鏈的合成: 取1個(gè)0.2ml的PCR管,依次加入下列試劑:10PCR Buffer 1 l RNase Free dH2O 5.75 l dNTP 1 l RNase Inhibitor 0.25 l AMV RTase Transcriptase 0.5 l oligo dT-Adaptor primer 0.5 l RNA 1l Total 10l實(shí)驗(yàn)步驟第18頁,共29頁,2022年,5月20日,22點(diǎn)11分,星期三反應(yīng)條件: 42 30min 9
5、9 5min 5 5min第19頁,共29頁,2022年,5月20日,22點(diǎn)11分,星期三3、PCR反應(yīng)取一個(gè)0.2ml的PCR管,依次加入下列試劑:10PCR Buffer 4 l滅菌蒸餾水 9l 10 mM dNTP .5 lTaq酶 0.1 l 上游特異Primer (20 M)*1 0.2 l下游特異Primer (20 M)*2 0.2l Total 16 l將(1)的反應(yīng)結(jié)果稀釋20倍,取10 l 加入到(2)管中,輕輕搖勻。第20頁,共29頁,2022年,5月20日,22點(diǎn)11分,星期三反應(yīng)條件:94 2min94 30s55 30s 72 1min72 7min30Cycles
6、第21頁,共29頁,2022年,5月20日,22點(diǎn)11分,星期三目前研究轉(zhuǎn)基因植物外源基因轉(zhuǎn)錄表達(dá)的常用方法1、RT-PCR (RNA) 2、Northern blot (RNA) 3、real-time PCR (RNA ) 第22頁,共29頁,2022年,5月20日,22點(diǎn)11分,星期三結(jié)果與分析利用凝膠成像分析儀對(duì)電泳結(jié)果進(jìn)行拍照和結(jié)果記錄;觀察膠上是否有預(yù)擴(kuò)增的主要產(chǎn)物帶。對(duì)比目的基因產(chǎn)物的電泳譜帶分子量和譜帶的特異性,確定和描述譜帶特征。 RT-PCR擴(kuò)增得到的810bp的目的基因產(chǎn)物的電泳結(jié)果第23頁,共29頁,2022年,5月20日,22點(diǎn)11分,星期三1、將實(shí)驗(yàn)結(jié)果粘到實(shí)驗(yàn)報(bào)告
7、上。2、 如何選擇RT-PCR的反轉(zhuǎn)錄引物。3、結(jié)合實(shí)驗(yàn)結(jié)果,試論應(yīng)用RT-PCR研究外源基因轉(zhuǎn)錄表達(dá)的優(yōu)缺點(diǎn)。 實(shí)驗(yàn)報(bào)告第24頁,共29頁,2022年,5月20日,22點(diǎn)11分,星期三實(shí)驗(yàn)一、質(zhì)粒三種提取方法的比較為什么要用對(duì)數(shù)期的菌液提取質(zhì)粒 ?因?yàn)閷?duì)數(shù)期菌的 生長狀況和數(shù)量最佳,有利于提取質(zhì)粒 溶液、溶液的作用?溶液 50mM 葡萄糖 / 10mM EDTA / 25mM Tris-HCl,pH=8.0 葡萄糖增稠,使懸浮后的大腸桿菌不會(huì)快速沉積到管子的底部;EDTA 抑制DNase的活性。這一步溶液中還可以加入RNase,不受EDTA影響,并且可以在后續(xù)步驟中被除去 溶液 0.2M N
8、aOH / 1% SDS 破細(xì)胞的主要是堿,而不是SDS,所以才叫堿法抽提。 溶液 3M 醋酸鉀 / 2M 醋酸 這一步的K置換了SDS(十二烷基磺酸鈉)中的Na,得到PDS(十二烷基磺酸鉀)沉淀;SDS易與蛋白質(zhì)結(jié)合,平均兩個(gè)氨基酸上結(jié)合一個(gè)SDS分子,鉀鈉離子置換所產(chǎn)生的大量沉淀自然就將絕大部分蛋白質(zhì)也沉淀了,同時(shí)基因組DNA也被PDS共沉淀 第25頁,共29頁,2022年,5月20日,22點(diǎn)11分,星期三溶菌酶的作用作用?沸水加熱的作用?利用溶菌酶和TritonX-100破壞細(xì)胞壁,加熱可使蛋白質(zhì)和染色體DNA變性.將實(shí)驗(yàn)電泳結(jié)果粘到實(shí)驗(yàn)報(bào)告上,并對(duì)結(jié)果分析。比較三種提取方法的區(qū)別?第2
9、6頁,共29頁,2022年,5月20日,22點(diǎn)11分,星期三實(shí)驗(yàn)二、醋酸鋰法轉(zhuǎn)化酵母細(xì)胞觀察并描述培養(yǎng)狀況,統(tǒng)計(jì)單菌落個(gè)數(shù)。比較酵母細(xì)胞轉(zhuǎn)化與大腸桿菌細(xì)胞轉(zhuǎn)化的區(qū)別。酵母菌屬于真核生物 ,大腸桿菌是細(xì)菌屬于原核生物 .酵母轉(zhuǎn)化在室溫,大腸桿菌轉(zhuǎn)化在冰上酵母轉(zhuǎn)化用醋酸鋰,大腸桿菌轉(zhuǎn)化用氯化鈣酵母轉(zhuǎn)化用穿梭質(zhì)粒,大腸桿菌轉(zhuǎn)化用普通質(zhì)粒穿梭質(zhì)粒是指一類人工構(gòu)建的具有兩種不同復(fù)制起點(diǎn)和選擇標(biāo)記,因而可以在兩種不同類群宿主中存活和復(fù)制的質(zhì)粒載體。 比如說通常能夠在哺乳動(dòng)物,酵母或者其他細(xì)菌復(fù)制表達(dá)的質(zhì)粒,同時(shí)可以在大腸桿菌內(nèi)復(fù)制。這樣利于對(duì)質(zhì)粒的分子生物學(xué)操作和大量制備。 第27頁,共29頁,2022年,5月20日,22點(diǎn)11分,星期三實(shí)驗(yàn)三、侵染菌種對(duì)除菌抗生素的敏感性頭孢酶素100200300400500600頭孢唑啉鈉-頭孢哌酮鈉-頭孢曲松鈉-+頭孢噻肟鈉-+-:表示無抑制作用;+:表示抑菌圈
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