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文檔簡介
1、生存分析第10章 非參數(shù)檢驗SPSS應用華中科技大學公共衛(wèi)生學院流行病學與衛(wèi)生統(tǒng)計學系蔣紅衛(wèi)jhwccc21內容基本概念基本步驟基本操作基本結果解釋生存分析(survival analysis)是將事件的結果(終點事件)和出現(xiàn)這一結果所經(jīng)歷的時間結合起來分析的一種統(tǒng)計分析方法。生存分析不同于其它多因素分析的主要區(qū)別點就是生存分析考慮了每個觀測出現(xiàn)某一結局的時間長短。基本概念生存分析的目的描述生存過程,估計不同時間的總體生存率,計算中位生存期,繪制生存函數(shù)曲線。Kaplan-Meier(K-M)法壽命表法比較:比較不同處理組的生存率,如比較不同療法治療腦瘤的生存率,以了解哪種治療方案較優(yōu)。log
2、-rank檢驗影響因素分析:研究某個或某些因素對生存率或生存時間的影響作用。如,了解影響腦瘤病人預后的主要因素,包括年齡、性別、腫瘤分期、治療方案等。cox比例風險回歸模型預測cox回歸預測模型生存分析菜單例1:為了比較不同手術方法治療腎上腺腫瘤的療效,43例病人隨機分為兩組其中有“+”者是刪失數(shù)據(jù),表示病人仍生存或失訪,括號內為死亡人數(shù)。例1文件格式定義5個變量生存時間變量:Time,值標簽“生存時間(月)”生存狀態(tài)變量 :status,取值“0=死亡,1=刪失或存活”頻數(shù)變量(可無):f,值標簽“人數(shù)”分組變量:group,取值“0=甲組,1=乙組”生存時間序號變量(可無):IDSPSS基
3、本操作生存時間最大生存時間組距生存狀態(tài)定義終點事件分組因素分組定義生存狀態(tài)定義生存狀態(tài)定義SPSS基本操作生成壽命表生存曲線作圖等各組比較的方式不作比較整體性比較兩兩比較Kaplan-Meier法Kaplan-Meier過程用于(尤其小樣本資料)估計各生存時間的生存率以及中位生存時間。繪制各種曲線:如生存函數(shù)、風險函數(shù)曲線等。比較某研究因素不同水平的生存時間有無差異。控制某個分層因素后對研究因素不同水平的生存時間分布進行比較。對多組生存時間分布進行兩兩比較(各總體分布比較采用Log-rank等非參數(shù)方法)SPSS基本操作SPSS基本操作生存時間生存狀態(tài)定義生存狀態(tài)分組因素SPSS基本操作SPS
4、S基本操作比較方法SPSS基本操作比較方法比較方式幾點說明檢驗統(tǒng)計量Test Statistics: 都用于檢驗時間分布是否相同對數(shù)秩Log-rank:各時間點的權重一樣。 Breslow:按各時間點的觀察例數(shù)賦權Tarone-Ware:按各時間點觀察例數(shù)的平方根賦權Linear trend for factor levels:線性趨勢檢驗Pooled over strata:水平間整體性比較For each stratum:每層進行各分組水平間的整體性比較Pairwise over strata:分組各水平間的兩兩比較Pairwise for each stratum:每層上各水平間的兩兩比
5、較SPSS基本操作統(tǒng)計指標作圖Cox回歸在醫(yī)學中, 一方面要看治療結局的好壞,另一方面還要看生存時間的長短。 生存時間的長短不僅與治療措施有關, 還可能與病人的體質, 年齡, 病情的輕重等多種因素有關。如何找出其中哪些因素與生存時間有關、哪些無關呢?由于失訪、試驗終止等原因造成某些時間的不完全,不能用多元線性回歸分析。 1972年英國統(tǒng)計學家Cox DR. 提出一種比例危險模型方法, 能處理多個因素對生存時間影響的問題。其目的多個因素對生存時間的影響作用分析和比較生存(或死亡)風險預測 上式的右側分兩部分: h0(t)與時間有關的任意函數(shù),其分布和形狀無明確假定, 是非參數(shù)部分. 另一部分是參
6、數(shù)部分,其參數(shù)可以通過樣本估計. 因為無須估計h0(t), 故Cox回歸的模型擬和不是直接用生存時間作為因變量, 而是以風險函數(shù)與基礎風險函數(shù)的比值為因變量。Cox 比例風險模型Cox回歸-多因素分析數(shù)據(jù)格式設含有p個變量x1, x2,xp及時間T和結局C的 n個觀察對象. 其數(shù)據(jù)結構為:IDx1x2xpTimeStatus1x11x12x1py102x21x22x2py21Nxn1xn2xnpyn0例3例3:為探討某惡性腫瘤的預后,某研究者收集了63例患者的生存時間、生存結局及影響因素。影響因素包括病人年齡、性別、組織學類型、治療方式、淋巴結轉移、腫瘤浸潤程度,生存時間以月計算。試用Cox回
7、歸模型進行分析。IDX1X2X3X4X5X6timestatusIDX1X2X3X4X5X6timestatus15400110520336200010120025701000510344011101 40135800011351355010010 26144311110103036331100012005480100071375711100120064001000600384810010120074401000580392800010 3183600011291405410110120193911101700413501011 71104201001670424700010 18111420
8、100066043491011012001242101108704443010001200135111100850454811000 151145501001820464400010 411549111017604760111001200165211101740484000010 161174811100630493201001 2411854101111010504400011 19119380100010005148100101200204011101661527201010 241213800010930534200010 21221900010241546310110120023671
9、0110930555501100 121243700110900563900010 512543100101515744000101200264900010315842111001200275011111870597400011 712853111001200606101010 401293211100120061451011010803046010011200623801000 2413143101101200636200010 161324410110120063名某惡性腫瘤患者的生存時間(月)及影響因素SPSS基本操作SPSS基本操作生存時間生存狀態(tài)設定狀態(tài)協(xié)變量SPSS基本操作SPSS基本操作啞變量SPSS基本操作與Logistic回歸設置相同啞變量形式SPSS基本操作作圖SPSS基本操作作圖類型比較各變量的各類曲線SPSS基本操作選項SPSS基本操作回歸系數(shù)可信區(qū)間各參數(shù)估計間的相關性Cox逐步回歸與Logistic逐步回歸相似變量篩選方法選項SPSS基本操作篩選標準Cox回歸注意事項嚴格設計樣本量應較大注意檢驗Cox回歸前提條件,如,比例風險假設等某些情況下,Cox回歸不能適用,如,手術的長期效應等小結SPSS中“Analy
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