NGS實(shí)驗(yàn)室建設(shè)實(shí)用標(biāo)準(zhǔn)與要求｜喜格

1、實(shí)用標(biāo)準(zhǔn)文案實(shí)用標(biāo)準(zhǔn)文案文檔大全文檔大全NGS 實(shí)驗(yàn)室建設(shè)標(biāo)準(zhǔn)與要求一、高通量測(cè)序（NGS）實(shí)驗(yàn)室簡(jiǎn)介NGSNGSNEXT GENERATION SEQUENCINGSANGER測(cè)序（稱為一代測(cè)序技術(shù)）革命性的改變, 可同時(shí)關(guān)于幾種的轉(zhuǎn)錄組和基因組進(jìn)行細(xì)致全貌的分析成為可能, 也稱為深度測(cè)序(EEP SEQUENCING)。NGSNGSNGS二、NGS 實(shí)驗(yàn)室臨床應(yīng)用的基本條件NGS檢測(cè)設(shè)備必需契合標(biāo)準(zhǔn) NGS 實(shí)驗(yàn)室設(shè)置要求：高通量測(cè)序儀及配套服信息管理系統(tǒng)等。NGS 實(shí)驗(yàn)室必需建立嚴(yán)格的實(shí)驗(yàn)室管理制度、建立標(biāo)準(zhǔn)化操作程序確保實(shí)驗(yàn)室衛(wèi)生安全，確保實(shí)驗(yàn)室長(zhǎng)期穩(wěn)定運(yùn)行。NGS三、NGS主體結(jié)構(gòu)主

2、體為彩鋼板、鋁合金型材。室內(nèi)一切陰角、陽(yáng)角均采用鋁合金 50 內(nèi)圓角鋁，從而解決容易污染、積塵、不易清掃等問題。結(jié)構(gòu)牢固，線條簡(jiǎn)明，美觀大方，密封性好。標(biāo)準(zhǔn)的各區(qū)分隔和氣壓調(diào)節(jié)PCR驗(yàn)區(qū)。整個(gè)區(qū)域有一個(gè)整體緩沖走廊。每個(gè)獨(dú)力實(shí)驗(yàn)區(qū)設(shè)置有緩沖區(qū)， 同并且降低擴(kuò)增產(chǎn)物關(guān)于人員和環(huán)境的污染?？纱蜷_緩沖區(qū)和 PCR 擴(kuò)增區(qū)的排風(fēng)扇往外排氣，在實(shí)驗(yàn)區(qū)的外墻上和各扇門上都安裝有風(fēng)量可調(diào)的回風(fēng)口，空氣經(jīng)過回風(fēng)口向室內(nèi)換氣。消毒在每個(gè)實(shí)驗(yàn)區(qū)和緩沖區(qū)頂部以及傳送窗內(nèi)部安裝有紫外燈，供消毒用。在各區(qū)還設(shè)置移動(dòng)紫外線燈，關(guān)于實(shí)驗(yàn)桌進(jìn)行局部消毒。機(jī)械連鎖不銹鋼傳遞窗實(shí)用標(biāo)準(zhǔn)文案實(shí)用標(biāo)準(zhǔn)文案試劑和標(biāo)本經(jīng)過機(jī)械連鎖不銹鋼

3、（不建議使用電子連鎖方式）傳遞窗傳遞， 保證試劑和標(biāo)本在傳遞進(jìn)程中不受污染（人物分流）。地面地面建議使用 PVC 卷材地面或自流坪地面，整體性好。便于進(jìn)行清掃，耐侵蝕。沒有條件的也可采用水磨石地面，或大塊的瓷磚（至少 800MM 800MM）接縫需要小于 2MM。照明燈具要選用凈化燈具，能達(dá)到便于清洗、不積塵的特點(diǎn)。平面布局NGS四、各項(xiàng)目實(shí)驗(yàn)室建設(shè)標(biāo)準(zhǔn)產(chǎn)前篩查與產(chǎn)前診斷（全基因組低拷貝測(cè)序技術(shù)）文檔大全實(shí)驗(yàn)室平面圖文檔大全實(shí)用標(biāo)準(zhǔn)文案實(shí)用標(biāo)準(zhǔn)文案文檔大全文檔大全圖 1：產(chǎn)前篩查與診斷實(shí)驗(yàn)室平面圖技術(shù)流程圖圖 2：產(chǎn)前篩查與診斷技術(shù)流程圖技術(shù)參數(shù)分區(qū)分區(qū)壓力溫度相關(guān)于濕度照明專用走廊0Pa緩沖

4、區(qū)+5Pa40%60主實(shí)驗(yàn)室300LX，其20-25試劑準(zhǔn)備室+15Pa%余房間 200300LX標(biāo)本與文庫(kù)制+10Pa備區(qū)備區(qū)文庫(kù)擴(kuò)增與檢-5Pa測(cè)區(qū)測(cè)序區(qū)-10Pa分區(qū)功能試劑準(zhǔn)備室主要功能：在 NGS 進(jìn)程中使用到的試劑的配制、分裝和保存。標(biāo)本與文庫(kù)制備區(qū)主要功能：血液處理、血漿制備、NA 提取、NA 片段化、NA 樣本的純化、NA 濃度檢測(cè)、末端修復(fù)、接頭連接、構(gòu)建樣本的測(cè)序文庫(kù)。文庫(kù)擴(kuò)增與檢測(cè)區(qū)主要功能：文庫(kù)構(gòu)建后的 PCR 擴(kuò)增與純化、文庫(kù)濃度檢測(cè)、文庫(kù)的混合及混合后的質(zhì)檢分析。測(cè)序區(qū)主要功能：測(cè)序模板制備（乳液 PCR 與磁珠富集回收）、上機(jī)測(cè)序、數(shù)據(jù)分析、報(bào)告審核及發(fā)放。儀器配

5、置試劑準(zhǔn)備室實(shí)用標(biāo)準(zhǔn)文案實(shí)用標(biāo)準(zhǔn)文案主要儀器設(shè)備：加樣器、冰箱、分析天平、微量臺(tái)式離心機(jī)、渦旋振蕩器、移液器、可移動(dòng)紫外燈和超凈工作臺(tái)等。標(biāo)本與文庫(kù)制備區(qū)主要儀器設(shè)備：冷凍離心機(jī)、微量臺(tái)式離心機(jī)、掌上三管離心機(jī)、渦旋震蕩器、垂直混合儀、移液器、可移動(dòng)紫外燈、生物安全柜、冰箱、托盤天平、Qubit 2.0 核酸定量?jī)x、電腦（可連接互聯(lián)網(wǎng)）、條形碼打印機(jī)、普通打印機(jī)、掃描槍、磁力架等。文庫(kù)擴(kuò)增與檢測(cè)區(qū)QPCRQubit2.0UPS磁力架等。測(cè)序區(qū)主要儀器設(shè)備：高通量測(cè)序儀、PC 電腦、打印機(jī)、UPS、恒溫金屬浴、純水儀、冰箱、微量臺(tái)式離心機(jī)、渦旋振蕩器、移液器、超凈工作臺(tái)、可移動(dòng)紫外燈、磁力架、P

6、CR 儀等。胚胎植入前遺傳學(xué)診斷（全基因組低拷貝測(cè)序）文檔大全實(shí)驗(yàn)室平面圖文檔大全實(shí)用標(biāo)準(zhǔn)文案實(shí)用標(biāo)準(zhǔn)文案文檔大全文檔大全圖 3：PG 實(shí)驗(yàn)室平面圖技術(shù)流程圖圖 4：PG 技術(shù)流程圖技術(shù)參數(shù)分區(qū)分區(qū)壓力溫度相關(guān)于濕度照明專用走廊0Pa40%60主實(shí)驗(yàn)室緩沖區(qū)+5Pa20-25%房間 200300LX試劑準(zhǔn)備室+15Pa實(shí)用標(biāo)準(zhǔn)文案實(shí)用標(biāo)準(zhǔn)文案文檔大全文檔大全WGA 制備室WGA 制備室+10pa擴(kuò)增一區(qū)-5pa標(biāo)本檢測(cè)區(qū)-10Pa測(cè)序區(qū)-15Pa電泳區(qū)0Pa分區(qū)功能試劑準(zhǔn)備室主要功能：在 NGS 進(jìn)程中使用到的試劑的配制、分裝和保存。WGA主要功能：基因組 NA 釋放、全基因組 NA 擴(kuò)增。電

7、泳區(qū)主要功能： NA 電泳檢測(cè)及結(jié)果反饋、NA 打斷等擴(kuò)增一區(qū)主要功能：NA 片段的末端修復(fù)與純化、接頭連接與純化、文庫(kù)混合、缺口平移。文庫(kù)檢測(cè)區(qū)主要功能：文庫(kù)濃度質(zhì)檢分析。測(cè)序區(qū)主要功能：測(cè)序模板制備（乳液 PCR 與磁珠富集回收）、上機(jī)測(cè)序、數(shù)據(jù)分析、報(bào)告審核及發(fā)放。儀器配置試劑準(zhǔn)備區(qū)主要儀器設(shè)備：冰箱、分析天平、微量臺(tái)式離心機(jī)、渦旋振蕩器、移液器、可移動(dòng)紫外燈和超凈工作臺(tái)等。電泳區(qū)主要儀器設(shè)備：電泳儀、微波爐、凝膠成像儀、冰箱、掌式離心機(jī)、渦旋振蕩器、移液器、可移動(dòng)紫外燈等。WGA主要儀器設(shè)備：PCR 儀、超凈工作臺(tái)、冰箱、掌式離心機(jī)、渦旋振蕩器、移液器、可移動(dòng)紫外燈等。擴(kuò)增一區(qū)主要儀器

8、設(shè)備：PCR 儀、可移動(dòng)紫外燈、超凈工作臺(tái)、冰箱、微量臺(tái)式離心機(jī)、渦旋振蕩器、UPS、移液器、磁力架等。文庫(kù)檢測(cè)區(qū)主要儀器設(shè)備： QPCR 儀、Qubit2.0 核酸定量?jī)x、可移動(dòng)紫外燈、超凈工作臺(tái)、冰箱、微量臺(tái)式離心機(jī)、渦旋振蕩器、冰箱、移液器等。實(shí)用標(biāo)準(zhǔn)文案實(shí)用標(biāo)準(zhǔn)文案測(cè)序區(qū)主要儀器設(shè)備：高通量測(cè)序儀、PC 電腦、打印機(jī)、UPS、恒溫金屬浴、純水儀、冰箱、微量臺(tái)式離心機(jī)、渦旋振蕩器、移液器、超凈工作臺(tái)、可移動(dòng)紫外燈、磁力架、PCR 儀等。遺傳病診斷+腫瘤診斷與治療（雜交捕獲測(cè)序技術(shù) +SANGER 測(cè)序驗(yàn)證）實(shí)驗(yàn)室平面圖圖 5：腫瘤診斷實(shí)驗(yàn)室平面圖文檔大全技術(shù)流程圖文檔大全實(shí)用標(biāo)準(zhǔn)文案實(shí)用

9、標(biāo)準(zhǔn)文案文檔大全文檔大全圖 6：腫瘤診斷技術(shù)流程圖實(shí)用標(biāo)準(zhǔn)文案實(shí)用標(biāo)準(zhǔn)文案文檔大全文檔大全圖 7：一代測(cè)序?qū)嶒?yàn)流程圖技術(shù)參數(shù)分區(qū)分區(qū)壓力溫度相關(guān)于濕度照明潔凈走廊0Pa緩沖區(qū)+5Pa試劑準(zhǔn)備室+15Pa標(biāo)本與文庫(kù)+10Pa制備區(qū)主實(shí)驗(yàn)室NA 打斷區(qū)+10Pa300LX，其余20-2540%60%雜交捕獲區(qū)房間 200-5Pa（擴(kuò)增一區(qū)）300LX文庫(kù)擴(kuò)增區(qū)-10Pa（擴(kuò)增二區(qū)）文庫(kù)檢測(cè)區(qū)-10Pa測(cè)序區(qū)-15Pa電泳區(qū)電泳區(qū)0 Pa分區(qū)功能試劑準(zhǔn)備區(qū)主要功能：在 NGS 進(jìn)程中使用到的試劑的配制、分裝和保存。標(biāo)本與文庫(kù)制備區(qū)NARNANANANANANA主要功能： NA 打斷（片段化）。電泳區(qū)

10、主要功能： 片段化 NA 電泳檢測(cè)及結(jié)果反饋。雜交捕獲區(qū)（擴(kuò)增一區(qū)）NASangerPCR文庫(kù)擴(kuò)增區(qū)（擴(kuò)增二區(qū)）主要功能：雜交捕獲后擴(kuò)增與純化、文庫(kù)濃度質(zhì)檢分析、及 Sanger 測(cè)序的PCR 擴(kuò)增反映與純化。測(cè)序區(qū)（PCRSanger 測(cè)序。儀器配置試劑準(zhǔn)備區(qū)移液器、可移動(dòng)紫外燈和超凈工作臺(tái)等。標(biāo)本與文庫(kù)制備區(qū)Qubit 2.0PCR 儀、電腦（可連接互聯(lián)網(wǎng)）、條形碼打印機(jī)、普通打印機(jī)、掃描槍等。NA主要儀器設(shè)備：Covaris S220蕩器、移液器、可移動(dòng)紫外燈等。電泳區(qū)主要儀器設(shè)備：電泳儀、微波爐、凝膠成像儀、冰箱、掌式離心機(jī)、渦旋振蕩器、移液器、可移動(dòng)紫外燈等。雜交捕獲區(qū)（擴(kuò)增一區(qū)）主要儀器設(shè)備：PCR 儀、可移動(dòng)紫外燈、超凈工作臺(tái)、冰箱、微量臺(tái)式離心機(jī)、渦旋振蕩器等。文庫(kù)擴(kuò)增區(qū)（擴(kuò)增二區(qū)）主要儀器設(shè)備：PCR 儀