10第十章 微生物的分類與鑒定1

10第十章微生物的分類與鑒定110第十章微生物的分類與鑒定110第十章微生物的分類與鑒定1V:1.0精細(xì)整理，僅供參考10第十章微生物的分類與鑒定1日期：20xx年X月第十章微生物的分類與鑒定一、選擇題真菌的分類單元-門的詞尾為（A）

A、–mycotaB、–mycetesC、–mycotinaD、-mycetidae下列傳統(tǒng)分類指標(biāo)中始終被用作微生物分類和鑒定的重要依據(jù)的是（A）

A、形態(tài)學(xué)特征B、生理特征C、生態(tài)學(xué)特征D、分子生物學(xué)特征下列拉丁文哪個(gè)書寫格式正確（C）

A、FusariumoxysporiumB、AspergillusjaponicusSaito

C、BacillusamyloliquefaciensD、ClostridiumKluyveri1978年，根據(jù)16SrRNA和18SrRNA的堿基序列將生物分為“三域”的科學(xué)家是（D）

A、AinsworthB、BergeyC、LeedaleD、Woese1995年，Ainsworth分類系統(tǒng)把菌物列入真核生物域，將其分為3個(gè)界，下面哪項(xiàng)不屬于其中（D）

A、原生動(dòng)物界B、假菌界C、真菌界D、菌物界有關(guān)菌株的說法，下列哪項(xiàng)說法不對(duì)（B）

A、菌株強(qiáng)調(diào)的是遺傳型純的譜系B、菌株的名稱不可隨意確定

C、菌株與克隆相同，為一個(gè)物種內(nèi)遺傳多態(tài)性的客觀反映

D、菌株實(shí)際上是某一微生物達(dá)到遺傳型純的標(biāo)志，二、是非題微生物的種是微生物分類的基本單元，但是目前還沒有一個(gè)公認(rèn)的、明確的定義。（√）兩個(gè)微生物菌株具有相同G+C含量表明它們之間的親緣關(guān)系一定很相近。（×）亞種是進(jìn)一步細(xì)分種時(shí)所用的單元，一般指除某一明顯而穩(wěn)定的特征外，其余鑒定特征都與模式種相同的種，其命名方法按“三名法”處理。（√）變種是亞種的同義詞，在《國際細(xì)菌命名法規(guī)》中不主張使用。（√）在微生物分類中，DNA（G+C）mol%的比較只能做否定判斷。（√）微生物DNA之間的同源性越高，說明它們之間親緣關(guān)系就越近，反之亦然。（×）菌株是一個(gè)物種內(nèi)遺傳多態(tài)性的客觀反應(yīng)，是遺傳型純的譜系，其名稱可以隨意確定。（√）模式菌株是一個(gè)種的具體活標(biāo)本。（√）據(jù)科學(xué)家1992年估計(jì)，地球上生存的菌物約有150萬種。（√）微生物自動(dòng)化鑒定技術(shù)一般都是利用微生物的生理生化反應(yīng)特性而設(shè)計(jì)的。（√）細(xì)菌分子鑒定常用16SrRNA序列分析，而真菌分子鑒定常用ITS序列分析。（√）所謂“模式菌株”通常是指一個(gè)細(xì)菌的種內(nèi)最具代表性的菌株。（×）對(duì)微生物生理生化特征的比較也是對(duì)微生物基因組的間接比較，加上測定生理生化特征比直接分析基因組要容易得多，因此生理生化特征對(duì)于微生物的系統(tǒng)分類仍然是有意義的。（√）現(xiàn)代微生物分類中，任何能穩(wěn)定地反映微生物種類特征的資料，都有分類學(xué)意義，都可以作為分類鑒定的依據(jù)。（×）DNA-DNA雜交主要用于種、屬水平上的分類研究，而進(jìn)行親緣關(guān)系更遠(yuǎn)(屬以上等級(jí))分類單元的比較，則需進(jìn)行DNA-rRNA雜交。（√）數(shù)值分類由于采用了先進(jìn)的計(jì)算機(jī)技術(shù)，減少了大量的特征測定的實(shí)驗(yàn)操作，所以它是比較科學(xué)的現(xiàn)代微生物系統(tǒng)分類方法。（×）三、填空題1995年，Ainsworth系統(tǒng)把菌物列入真核生物域，分為_原生動(dòng)物界__、_假菌界_和真菌界，真菌界又分為_子囊菌門_、_擔(dān)子菌門__、_壺菌門_、接合菌門、_有絲孢真菌類五個(gè)門。目前學(xué)術(shù)界廣泛采用的菌物分類系統(tǒng)是Ainsworth分類系統(tǒng)（1983年），把真菌界分為粘菌門和真菌門，真菌門又分為5個(gè)亞門，分別為鞭毛菌亞門、接合菌亞門、子囊菌亞門、擔(dān)子菌亞門和半知菌亞門。細(xì)菌的分類單元分為七個(gè)基本的分類等級(jí)，由上而下依次為___界__、___門___、___綱___、__目____、_科_____、__屬___、___種____。菌物界（Mycetalia），即廣義的真菌包括_____黏菌門_____、______假菌門____、______真菌門________三個(gè)門的微生物。微生物分類學(xué)的任務(wù)和內(nèi)容有3個(gè)，包括____分類____、____命名____和____鑒定_____，目前進(jìn)行細(xì)菌分類和鑒定的權(quán)威著作是_《伯杰氏鑒定細(xì)菌學(xué)手冊》___________________，目前該著作已經(jīng)出版到第__11___版。1969年，Whittaker提出生物五界分類系統(tǒng)包括____動(dòng)物界______、_____植物界______、___原生生物界_____、_____真菌界_____和_____原核生物界______。微生物界分別屬于其中的三界，即____原生生物界______、_____真菌界____和_____原核生物界_____。有人建議增補(bǔ)一個(gè)界，即____病毒界______。每一種微生物都有自己專門的名稱，名稱分兩類：____俗名_______和_____學(xué)名________。微生物分類鑒定方法分為4個(gè)不同水平：___細(xì)胞的形態(tài)和習(xí)性水平___、___細(xì)胞組分化學(xué)水平___、___蛋白質(zhì)水平___和____核酸水平____。微生物的學(xué)名表示方法通常采用____“三名法”______和“雙名法”，是由__屬名________和__種名加詞_______組成的，前者采用以大寫字母開頭的拉丁語化的__________，后者采用以小寫字母開頭的拉丁語化的__________。生物分類學(xué)家將_____種____做為分類的基本單位，將相近似的分類基本單位歸為一類，稱之為____屬_____，更高一級(jí)的分類單位依次推為___科_____、_____目_____、___綱____、_____門______、____界_____。微生物的分類方法通常有_____經(jīng)典分類法_______、_______數(shù)值分類法_______、______遺傳分類法______。同一種細(xì)菌在同一種固體培養(yǎng)基上形成的菌落一般表現(xiàn)為___相同_____菌落形態(tài)，這是鑒定菌種的形態(tài)標(biāo)志之一。在液體培養(yǎng)基中，由于細(xì)菌生活習(xí)性不同，有的可形成均勻一致的____混濁液____，有的形成_____沉淀___，有的形成___菌膜______。1978年，Woese根據(jù)16SrRNA和18SrRNA的堿基序列對(duì)生物分界提出了新的認(rèn)識(shí)，將生物分為_____細(xì)菌域____、_____古生菌域_____、_____真核生物域_____三個(gè)域。四、名詞解釋模式（或典型）菌株：在微生物中，一個(gè)種只能用該種內(nèi)的一個(gè)典型菌株當(dāng)作它的具體代表，故此典型菌株就是該種的模式種或模式活標(biāo)本。屬：是介于種（或亞種）與科之間的分類等級(jí)，也是生物分類中的基本分類單元。通常是把具有某些共同特征或密切相關(guān)的種歸為一個(gè)高一級(jí)的分類單元，稱之屬。種：是生物分類中基本的分類單元和分類等級(jí)。微生物的種可以看作是：具有高度特征相似性的菌株群，這個(gè)菌株群與其他類群的菌株有很明顯的區(qū)別。新種：是指權(quán)威性的分類、鑒定手冊中從未記載過的一種新分離并鑒定過的微生物。菌落：菌落（colony）由單個(gè)細(xì)菌（或其他微生物）細(xì)胞或一堆同種細(xì)胞在適宜固體培養(yǎng)基表面或內(nèi)部生長繁殖到一定程度；形成肉眼可見有一定形態(tài)結(jié)構(gòu)等特征的子細(xì)胞的群落。分離物：學(xué)名：是某一菌株的科學(xué)名稱，是按“國際明明法規(guī)”進(jìn)行命名并受國際學(xué)術(shù)界公認(rèn)的通用正式名稱。純培養(yǎng)物：只有一種微生物的培養(yǎng)物。如果某一培養(yǎng)物是由單一微生物細(xì)胞繁殖產(chǎn)生，就稱為該細(xì)菌的純培養(yǎng)物。亞種：當(dāng)某一工人種內(nèi)的不同菌株存在少數(shù)明顯而穩(wěn)定的變異特征或遺傳性狀而又不足以區(qū)分成新種時(shí)，可以將這些菌株細(xì)分成兩個(gè)或更多的小的分類單元稱為亞種。亞種是正式分類單元中地位最低的分類等級(jí)。菌株：從自然界中分離得到的任何一種微生物的純培養(yǎng)物都可以稱為微生物的一個(gè)菌株；用實(shí)驗(yàn)方法（如通過誘變）所獲得的某一菌株的變異型，也可以稱為一個(gè)新的菌株，以便與原來的菌株相區(qū)別。菌株是微生物分類和研究工作中最基礎(chǔ)的操作實(shí)體。DNA（G+C）mol%值：它表示DNA分子中鳥嘌呤（G）和胞嘧啶（C）所占的摩爾百分比值，即（G+C）mol%=G+C/A+T+G+C×100%三域?qū)W說：20世紀(jì)70年代末由于美國伊利諾斯大學(xué)C．R．Woose等人對(duì)大量微生物和其它生物進(jìn)行16S和18SrRNA寡核苷酸測序,并比較其同源性水平后,提出了一個(gè)與以往各種界級(jí)分類不同的新系統(tǒng)，稱為三域?qū)W說。數(shù)值分類法：是根據(jù)數(shù)值分析，借助計(jì)算機(jī)將擬分類的微生物按其性狀的相似程度歸類的方法。五、簡答題將拉丁文和中文名一一對(duì)應(yīng)起來：A、BacillusB、NitrobacterC、PseudomonasD、EscherichiaE、XanthomonasF、Micrococcus（1）黃單胞菌屬（2）芽孢桿菌屬（3）假單胞菌屬（4）微球菌屬（5）大腸桿菌屬（6）硝化桿菌屬答：D、Escherichia--------（5）大腸桿菌屬A、Bacillus-----------（2）芽孢桿菌屬F、Micrococcus---------（4）微球菌屬B、Nitrobacter----------（6）硝化桿菌屬C、Pseudomonas----------（3）假單胞菌屬E、Xanthomonas--------（1）黃單胞菌屬2、什么是學(xué)名舉例說明什么是雙名法并說出微生物學(xué)名的命名和書寫規(guī)則。答：學(xué)名是某一菌種的科學(xué)名稱，是按“國際命名法規(guī)”進(jìn)行命名并受國際學(xué)術(shù)界公認(rèn)的通用正式名稱。雙名法指一個(gè)物種的學(xué)名由前面一個(gè)屬名和后面一個(gè)種名加詞兩部分組成。屬名的詞首須大寫，種名加詞的字首須小寫（包括由人名或地名等專有名詞衍生的）。3、寫出微生物的主要類群，并分別指出他們屬生物分類系統(tǒng)中的哪一界。答：微生物可分為非細(xì)胞生物和細(xì)胞生物，非細(xì)胞生物包括病毒，亞病毒等。 細(xì)胞生物分原核生物和真核生物，原核生物包括古細(xì)菌，真細(xì)菌。真核微生物包括酵母菌，霉菌，單細(xì)胞藻類，原生動(dòng)物。古細(xì)菌，真細(xì)菌屬原核生物界。酵母菌，霉菌屬真菌界。 單細(xì)胞藻類和原生動(dòng)物屬原生生物界。病毒和亞病毒屬病毒界。4、微生物分類的依據(jù)主要有哪些？

答：微生物的分類依據(jù)有：形態(tài)特征：個(gè)體形態(tài)（形狀、大小、染色反應(yīng)等）、群體形態(tài)（菌落特征、液體培養(yǎng)特點(diǎn)等）生理生化特征：代謝產(chǎn)物、營養(yǎng)要求、細(xì)胞壁成分等的測定生態(tài)特征：微生物間各種相互關(guān)系的利用遺傳特征：DNA同源性分析G+C的含量其它：全細(xì)胞蛋白的分析、多位點(diǎn)酶的分析等5、簡述內(nèi)共生假說的基本內(nèi)容。答：認(rèn)為現(xiàn)今一切生物都由一種共同遠(yuǎn)祖進(jìn)化而來，它原是一種小細(xì)胞，先分化出細(xì)菌和古生菌這兩類原核生物，后來在古生菌分支上的細(xì)胞喪失了細(xì)胞壁后，發(fā)展成以變形蟲狀較大型、有真核的細(xì)胞形式出現(xiàn)，它先后吞噬了a變形細(xì)菌（相當(dāng)于G-細(xì)菌）和藍(lán)細(xì)菌，并進(jìn)一步發(fā)生內(nèi)共生，從而兩者進(jìn)化成與宿主細(xì)胞難分難解的細(xì)胞器——線粒體和葉綠體，于是，宿主最終也就發(fā)展成了各類真核生物。微生物的基本分類單元是什么？種以上的分類單元分幾級(jí)，各級(jí)中、英、拉丁文名稱是什么，請舉一例進(jìn)行分類單元排列。答：分類單元（taxon，復(fù)數(shù)taxa）是指具體的分類群，如原核生物界（Procaryotae）、腸桿菌科（Enterobacteriaceae）枯草芽孢桿菌（Bacillussubtilis）等都分別代表一個(gè)分類單元。細(xì)菌的分類單元也分為七個(gè)基本的分類等級(jí)（rank或category）或分類階元，由上而下依次是：界、門、綱、目、科、屬、種。在分類中，若這些分類單元的等級(jí)不足以反映某些分類單元之間的差異時(shí)也可以增加亞等級(jí)，即亞界、亞門……亞種，在細(xì)菌分類中還可以在科（或亞科）和屬之間增加族和亞族等級(jí)。你認(rèn)為該如何確定一個(gè)新種？答：新種是指最新權(quán)威性的分類、鑒定手冊中從未記載過的一種新分離并鑒定過的微生物。確定一個(gè)新種在新種發(fā)表前應(yīng)將其模式菌株存放在權(quán)威保藏機(jī)構(gòu)，保證其他研究者共享；另外一個(gè)新種的確定必須查詢過所有中外權(quán)威分類、鑒定手冊，確定所有手冊的從未有這個(gè)種的存在，才能確定一個(gè)新種，其中花費(fèi)的功夫很大，并且工作細(xì)膩繁雜。微生物分類工作步驟離不開哪三項(xiàng)工作？答：1、獲得該微生物的純培養(yǎng)物；2、測定一系列必要的鑒定指標(biāo)；3、查找權(quán)威性的菌種鑒定手冊。六、問答題微生物的微型、簡便、快速的自動(dòng)化鑒定系統(tǒng)主要有API系統(tǒng)、Enterotube系統(tǒng)和Biology系統(tǒng)，請敘述各自的特點(diǎn)和應(yīng)用。答：API系統(tǒng)：特點(diǎn)：能同時(shí)測定20項(xiàng)以上生化指標(biāo)，因而可用作快速鑒定細(xì)菌的長形卡片，其上整齊地排列著20個(gè)塑料小管，管內(nèi)加有適量的糖類等生化反應(yīng)底物的干粉（有標(biāo)簽標(biāo)明）和反應(yīng)產(chǎn)物的顯色劑。每份產(chǎn)品都有薄膜覆蓋，保證無雜菌污染。使用時(shí)，先打開附有的一小瓶無菌基本培養(yǎng)基（液體），用于稀釋待鑒定的純菌落或菌苔。實(shí)驗(yàn)時(shí)，先把制成的濃度適中的細(xì)菌懸液吸入無菌滴管中，待撕開覆蓋膜后，一一加入到每個(gè)小管中（每管約加0.1ml）一般經(jīng)24～48h保溫后，即可看出每個(gè)小管是否發(fā)生顯色反應(yīng)，并將結(jié)果記錄在相應(yīng)的表格中，再加上若干補(bǔ)充指標(biāo)，包括細(xì)胞形態(tài)、大小、運(yùn)動(dòng)性、產(chǎn)色素、溶血性、過氧化氫酶、芽孢有無和革蘭氏染色反應(yīng)等后，就可按規(guī)定對(duì)結(jié)果進(jìn)行編碼、查檢索表、最后獲得該菌種的鑒定結(jié)果。應(yīng)用：1、用作快速鑒定細(xì)菌的長形卡片；2、國際有關(guān)實(shí)驗(yàn)室普遍選用。Enterotube系統(tǒng)：又稱腸管系統(tǒng)。這是一種用一條有8~12個(gè)分隔小室的劃艇形塑料管制成，面上有塑料薄膜覆蓋，可防雜菌污染。每一個(gè)小室中灌有能鑒別不同反應(yīng)的固體培養(yǎng)基（擺成斜面狀），所有小室間都有一孔，由一條接種用金屬絲縱貫其中，接種絲的兩端突出在塑料管外，使用前有塑料帽遮蓋著。當(dāng)鑒定一未知菌時(shí)，先把兩端塑料帽旋下，抽出接種絲，用一端的接種絲沾取待測菌落，接著在另一端拉出接種絲，然后再回復(fù)原位，以使每個(gè)小室的培養(yǎng)基都接上菌種。培養(yǎng)后，按API系統(tǒng)類似的手續(xù)記錄、編碼、鑒定、菌種。Biology系統(tǒng)：特點(diǎn)：自動(dòng)化、快速、高效和應(yīng)用范圍廣。應(yīng)用：目前可鑒定1140種常見和不常見的微生物，包括幾乎全部人類病原菌，190種動(dòng)、植物病原菌以及部分與環(huán)境有關(guān)的細(xì)菌等。生物的界級(jí)分類學(xué)說有哪些，各主要類群的微生物在各界級(jí)分類學(xué)說中分別屬于哪一界？答：生物的界級(jí)分類學(xué)說有：兩界系統(tǒng)、三界系統(tǒng)、四界系統(tǒng)、五界系統(tǒng)、六界系統(tǒng)。兩界系統(tǒng)：動(dòng)物界和植物界三界系統(tǒng)：動(dòng)物界、植物界、原生生物界四界系統(tǒng)：動(dòng)物界、植物界、原生生物界、菌界五界系統(tǒng)：動(dòng)物界、植物界、原生生物界、真菌界、原核生物界六界系統(tǒng)：動(dòng)物界、植物界、原生生物界、真菌界、原核生物界、病毒界敘述微生物數(shù)值分類工作的基本過程。答：1、計(jì)算兩菌株間的相關(guān)系數(shù)，有以下兩種計(jì)算方式：Ssm=a+b/a+b+c+d；（2）Sj=a/a+b+c。（a為兩