分子診斷與精準(zhǔn)醫(yī)療分析課件

分子診斷與精準(zhǔn)醫(yī)療分析分子診斷與精準(zhǔn)醫(yī)療分析精準(zhǔn)醫(yī)療2015年3月11日，國家首次精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)戰(zhàn)略專家會議，提出中國精準(zhǔn)醫(yī)療計劃衛(wèi)計委表示，將其列入國家“十三五”科技發(fā)展重大專項3月，國家衛(wèi)計委公布了第一批腫瘤診斷與治療項目高通量基因測序技術(shù)臨床試點單位

精準(zhǔn)醫(yī)療2015年3月11日，國家首次精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)戰(zhàn)略專家會議，精確診斷第一步：明確患者的基因突變狀態(tài)

精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)是精確診斷和靶向治療的結(jié)合精確診斷第一步：明確患者的基因突變狀態(tài)精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)是精確診什么是分子診斷？分子診斷（moleculardiagnosis）：應(yīng)用分子生物學(xué)方法檢測患者體內(nèi)遺傳物質(zhì)的結(jié)構(gòu)或表達水平的變化而做出診斷的技術(shù)，稱為分子診斷。包括DNA、RNA和蛋白質(zhì)所有疾病(除外傷)的發(fā)生均與基因檢測技術(shù)：測序(Sequence)原位雜交(Hybridization)聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)什么是分子診斷？分子診斷（moleculardiagnos與遺傳有關(guān)的DNA結(jié)構(gòu)是由鹼基連接而成的雙股雙螺旋結(jié)構(gòu)。一些鹼基片段即為基因

基因：DNA的結(jié)構(gòu)與遺傳有關(guān)的DNA結(jié)構(gòu)是由鹼基連接而成的雙股雙螺旋結(jié)構(gòu)。一些

當(dāng)基因丟失，或易位，或插入外來基因即可發(fā)生腫瘤免疫監(jiān)控功能失效—不能識別和清除基因突變的細胞

腫瘤藥物的發(fā)展趨勢腫瘤藥物的發(fā)展趨勢腫瘤患者的個體差異、腫瘤的異質(zhì)性決定了單一模式的“OneSizeFitsAll”的粗放醫(yī)療時代將被以分子檢測手段為基礎(chǔ)的個體化醫(yī)療所取代。腫瘤患者的個體差異、腫瘤的異質(zhì)性決定了單一模式的“OneS分子診斷與精準(zhǔn)醫(yī)療分析課件EGFR突變檢測的意義1、吉非替尼-Gefitinib，商品名:易瑞沙-Iressa，2015，F(xiàn)DA批準(zhǔn)一線藥，生產(chǎn)商:阿斯利康（AstraZeneca）。2、厄洛替尼-Erlotinib，商品名:特羅凱-Tarceva，2013年，F(xiàn)DA批準(zhǔn)一線藥，生產(chǎn)商：羅氏（Roche）。3、埃克替尼-Icotinib，商品名：凱美納-Conmana，2011，CFDA批準(zhǔn)的二線藥，生產(chǎn)廠家：貝達藥業(yè)股份有限公司。4、19缺失或外顯子21(L858R)取代突變，阿法替尼-Afatinib，商品名：Gilotrif，2013，F(xiàn)DA批準(zhǔn)的一線藥，2015年8月在華上市，生產(chǎn)廠家：德國勃林格殷格翰公司。5、T790M突變：AZD9291(阿斯利康)，RociletinibEGFR突變檢測的意義1、吉非替尼-Gefitinib，商品EGFR基因突變狀態(tài)是EGFR酪氨酸酶抑制劑(EGFR-TKI)治療晚期NSCLC最重要的療效預(yù)測因子。EGFR信號通路及靶向治療機制EGFR基因突變狀態(tài)是EGFR酪氨酸酶抑制劑(EGFR-TK4.肺癌EGFR通路靶向分子病理檢測EGFR突變較易發(fā)生于亞洲人、女性、腺癌、不吸煙患者。最有效的是E19/E21突變，占總突變90%，E20為耐藥突變。EGFR突變患者使用吉非替尼反應(yīng)率可達到71.2%，而野生型患者只有1.1%。EGFR野生型患者使用吉非替尼死亡風(fēng)險增加185%。1.EGFR4.肺癌EGFR通路靶向分子病理檢測EGFR突變較易發(fā)生于亞2.K-RASK-ras信號通路K-RAS基因?qū)賀as基因家族，正常時能調(diào)控細胞生長路徑；異常時，導(dǎo)致細胞持續(xù)生長。K-RAS蛋白是EGFR信號傳導(dǎo)中關(guān)鍵下游調(diào)節(jié)因子。K-RAS基因突變使結(jié)直腸癌患者對西妥昔單抗治療產(chǎn)生耐藥性。2.K-RASK-ras信號通路K-RAS基因?qū)賀as基因K-RAS基因突變檢測K-RAS基因突變檢測K-RAS基因突變檢測K-RAS基因突變檢測3.B-RAFBRAF是MAPK的最強激活劑，40多種突變，15外顯子1799T/A最常見；多見于黑色素瘤（突變率40-60%）、結(jié)直腸癌、甲狀腺乳頭狀癌、NSCLC（突變率0.5-4.9%，女性、肺腺癌患者）；3.B-RAFBRAF是MAPK的最強激活劑，40多種突變，3、埃克替尼-Icotinib，商品名：凱美納-Conmana，2011，CFDA批準(zhǔn)的二線藥，生產(chǎn)廠家：貝達藥業(yè)股份有限公司。精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)是精確診斷和靶向治療的結(jié)合腫瘤患者的個體差異、腫瘤的異質(zhì)性決定了單一模式的“OneSizeFitsAll”的粗放醫(yī)療時代將被以分子檢測手段為基礎(chǔ)的個體化醫(yī)療所取代。RRM1mRNA，RRM1(37)EML4-ALK融合基因可見于多種腫瘤，如間變性大細胞淋巴瘤、炎性成肌纖維細胞瘤、成神經(jīng)細胞瘤和NSCLC等；EML4-ALK陽性者并不能從EGFR-TKI靶向治療中獲益，而Crizotinib對EML4-ALK突變型晚期NSCLC患者的疾病控制率可達90%，接受Crizotinib治療可使患者獲得明顯的生存獲益檢測PIK3CA基因突變可以預(yù)測腫瘤患者對EGFR-TKI等藥物的耐藥性，用于臨床輔助診斷，為臨床醫(yī)生選擇靶向藥物提供參考?！鶨ML4-ALK融合和EGFR突變大多數(shù)情況下不同時存在。50%結(jié)直腸癌患者中；所有疾病(除外傷)的發(fā)生均與基因當(dāng)基因丟失，或易位，或插入外來基因即可發(fā)生腫瘤9號外顯子（E542K、E545K、E545G突變）；胃腸道間質(zhì)瘤分子診斷項目NQO1(465/609)K-RAS基因突變檢測20號外顯子（H1047R、H1047L突變）；TUBB3mRNA，STMN1mRNAK-RAS基因突變檢測當(dāng)基因丟失，或易位，或插入外來基因即可發(fā)生腫瘤EML4-ALK陽性者并不能從EGFR-TKI靶向治療中獲益，而Crizotinib對EML4-ALK突變型晚期NSCLC患者的疾病控制率可達90%，接受Crizotinib治療可使患者獲得明顯的生存獲益4.ALK融合基因ALK激酶抑制劑：克唑替尼、色瑞替尼3、?？颂婺?Icotinib，商品名：凱美納-ConmanEML4-ALK融合基因可見于多種腫瘤，如間變性大細胞淋巴瘤、炎性成肌纖維細胞瘤、成神經(jīng)細胞瘤和NSCLC等；在NSCLC人群中，EML4-ALK陽性率約為3%～7%左右；主要存在于腺癌中、輕度吸煙、年輕男性；33%非EGFR、KRAS突變的NSCLC患者出現(xiàn)EML-4-ALK突變，排他性強；EML4-ALK陽性者并不能從EGFR-TKI靶向治療中獲益，而Crizotinib對EML4-ALK突變型晚期NSCLC患者的疾病控制率可達90%，接受Crizotinib治療可使患者獲得明顯的生存獲益分子診斷與精準(zhǔn)醫(yī)療分析課件臨床意義：

EML4-ALK基因融合或ALK基因斷裂呈陽性的患者可以從克唑替尼/色瑞替尼的治療中獲得最大化的生存效益。

在克唑替尼上市時，F(xiàn)ISH被美國食品藥品監(jiān)督管理局（FDA)批準(zhǔn)為EML4-ALK陽性NSCLC的伴隨診斷方法，是ALK融合基因檢測的金標(biāo)準(zhǔn)。

臨床意義：■關(guān)于陽性率：→西方肺腺癌患者EGFR突變陽性率約為10%，亞裔腺癌患者為50%左右，亞裔鱗癌約為2.7%；→不吸煙、女性、肺腺癌患者EGFR突變陽性率更高；→KRAS突變在非亞裔、吸煙及黏液癌中最常見；50%結(jié)直腸癌患者中；→EML4-ALK融合陽性率約為3%-11%?！鲫P(guān)于互斥性：→EGFR和KRAS突變重疊在肺癌患者的發(fā)生率<1%；→EML4-ALK融合和EGFR突變大多數(shù)情況下不同時存在?！鲫P(guān)于陽性率：5.PIK3CAPIK3CA是一種癌基因，編碼I類磷脂酰肌醇-3激酶的p110催化亞單位，PI3Kp110a；該基因可以發(fā)生體細胞突變而致癌的基因。突變熱點均能增強PI3K的脂質(zhì)激酶活性。已發(fā)現(xiàn)多種癌癥，如結(jié)直腸癌（10－32%）、乳腺癌、非小細胞肺癌等存在PIK3CA基因突變。PIK3CA存在兩個熱點突變區(qū)：9號外顯子（E542K、E545K、E545G突變）；20號外顯子（H1047R、H1047L突變）；

5.PIK3CAPIK3CA是一種癌基因，編碼I類磷脂酰肌PIK3CA基因突變導(dǎo)致PI3K/Akt信號通路持續(xù)性活化，PI3K作為EGFR下游信號分子被激活，導(dǎo)致腫瘤細胞對EGFR-TKI等藥物的耐藥。PIK3CA基因突變導(dǎo)致PI3K/Akt信號通路持續(xù)性活化，

臨床意義

檢測PIK3CA基因突變可以預(yù)測腫瘤患者對EGFR-TKI等藥物的耐藥性，用于臨床輔助診斷，為臨床醫(yī)生選擇靶向藥物提供參考。PIK3CA與K-RAS同時突變，具有很高的耐西妥昔單抗特性。分子診斷與精準(zhǔn)醫(yī)療分析課件6.KIT和PDGFRa6.KIT和PDGFRaGISTs中KIT基因突變率約為90%，且突變形式多樣。主要集中于11號外顯子（Lys550-Val560）約占70-80%、9號外顯子（Ala502-Tyr503）約占5%-10%。GISTs中KIT基因突變率約為90%，且突變形式多樣。主要臨床意義伊馬替尼(Glivec，格列衛(wèi))是一種特殊的酪氨酸激酶抑制劑，經(jīng)FDA批準(zhǔn)可應(yīng)用于c-Kit陽性、不能手術(shù)切除和/或轉(zhuǎn)移性的惡性GISTs的治療。檢測KIT基因突變對于指導(dǎo)GISTs患者的合理用藥，具有重要的參考價值。臨床意義→不吸煙、女性、肺腺癌患者EGFR突變陽性率更高；TUBB3mRNA，STMN1mRNA胃腸道間質(zhì)瘤分子診斷項目免疫療法，MEDI4736、Pembrolizumab、Nivolumab，在NSCLC中顯示出有效性；臨床常見的幾種化療藥物TYMS(3'-/5'-UTR)EGFR基因突變狀態(tài)是EGFR酪氨酸酶抑制劑(EGFR-TKI)治療晚期NSCLC最重要的療效預(yù)測因子。TUBB3mRNA，STMN1mRNA分子病理臨床價值案例-小結(jié)(I)與遺傳有關(guān)的DNA結(jié)構(gòu)是由鹼基連接而成的雙股雙螺旋結(jié)構(gòu)。最有效的是E19/E21突變，占總突變90%，E20為耐藥突變。EGFR突變患者使用吉非替尼反應(yīng)率可達到71.與遺傳有關(guān)的DNA結(jié)構(gòu)是由鹼基連接而成的雙股雙螺旋結(jié)構(gòu)。已發(fā)現(xiàn)多種癌癥，如結(jié)直腸癌（10－32%）、乳腺癌、非小細胞肺癌等存在PIK3CA基因突變。突變熱點均能增強PI3K的脂質(zhì)激酶活性。9號外顯子（E542K、E545K、E545G突變）；EGFR突變較易發(fā)生于亞洲人、女性、腺癌、不吸煙患者。臨床常見的幾種化療藥物分子診斷（moleculardiagnosis）：應(yīng)用分子生物學(xué)方法檢測患者體內(nèi)遺傳物質(zhì)的結(jié)構(gòu)或表達水平的變化而做出診斷的技術(shù)，稱為分子診斷。EGFR信號通路及靶向治療機制靶向治療提高藥物有效性、安全性、減少毒副作用；同時會產(chǎn)生耐藥耐藥原發(fā)耐藥：KRAS獲得性耐藥：T790M和C-MET→不吸煙、女性、肺腺癌患者EGFR突變陽性率更高；靶向治療動態(tài)監(jiān)測NSCLC患者（經(jīng)EGFR-TKI治療）血漿DNA的EGFR突變狀態(tài)，由初始檢測到實時檢測；三代EGFR-TKIAZD9291，對于EGFR敏感突變和T790M耐藥突變的患者均有效；已初步確立臨床療效；二代ALK抑制劑Alectinib治療克唑替尼耐藥患者，已初見臨床療效；免疫療法，MEDI4736、Pembrolizumab、Nivolumab，在NSCLC中顯示出有效性；以C-MET過表達為靶點，克服EGFR-TKI獲得性耐藥；2015ASCO最新進展動態(tài)監(jiān)測NSCLC患者（經(jīng)EGFR-TKI治療）血漿DNA的7.HER-2基因擴增7.HER-2基因擴增分子診斷與精準(zhǔn)醫(yī)療分析課件分子診斷與精準(zhǔn)醫(yī)療分析課件各腫瘤的分子病理診斷方案各腫瘤的分子病理診斷方案13肺癌13肺癌14.結(jié)直腸癌分子診斷項目13結(jié)直腸癌分子診斷項目14.結(jié)直腸癌分子診斷項目13結(jié)直腸癌分子診斷項目乳腺癌分子診斷項目乳腺癌分子診斷項目17.白血病分子診斷項目胃腸道間質(zhì)瘤分子診斷項目17.白血病分子診斷項目胃腸道間質(zhì)瘤分子診斷項目TYMSmRNA，TYMPmRNAEGFR突變檢測的意義EGFR基因突變狀態(tài)是EGFR酪氨酸酶抑制劑(EGFR-TKI)治療晚期NSCLC最重要的療效預(yù)測因子。UGT1A1(*6/*28)5、T790M突變：AZD9291(阿斯利康)，Rociletinib主要集中于11號外顯子（Lys550-Val560）約占70-80%、9號外顯子（Ala502-Tyr503）約占5%-10%。TUBB3mRNA，STMN1mRNA20號外顯子（H1047R、H1047L突變）；與遺傳有關(guān)的DNA結(jié)構(gòu)是由鹼基連接而成的雙股雙螺旋結(jié)構(gòu)。各腫瘤的分子病理診斷方案腫瘤患者的個體差異、腫瘤的異質(zhì)性決定了單一模式的“OneSizeFitsAll”的粗放醫(yī)療時代將被以分子檢測手段為基礎(chǔ)的個體化醫(yī)療所取代。獲得性耐藥：T790M和C-METRRM1mRNA，RRM1(37)K-RAS基因突變檢測DPYD(2A/5A/9A)精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)是精確診斷和靶向治療的結(jié)合檢測PIK3CA基因突變可以預(yù)測腫瘤患者對EGFR-TKI等藥物的耐藥性，用于臨床輔助診斷，為臨床醫(yī)生選擇靶向藥物提供參考。當(dāng)基因丟失，或易位，或插入外來基因即可發(fā)生腫瘤原位雜交(Hybridization)精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)是精確診斷和靶向治療的結(jié)合腫瘤化療分子診斷項目TYMSmRNA，TYMPmRNA腫瘤化療分子診斷項目分子病理臨床價值案例-小結(jié)(I)分子病理臨床價值案例-小結(jié)(I)分子病理臨床價值案例-小結(jié)(II)分子病理臨床價值案例-小結(jié)(II)鉑類ERCC1mRNA，BRCA1mRNAERCC1(118)、ERCC2(312)XRCC1(194/399)、GSTP1(105)順鉑卡鉑抗微管類TUBB3mRNA，STMN1mRNAMDR1(2677/3435)紫杉醇白蛋白結(jié)合型紫杉醇長春瑞濱長春花堿多西他賽氟尿嘧啶類TYMSmRNA，TYMPmRNATYMS(3'-/5'-UTR)MTHFR(677/1298)DPYD(2A/5A/9A)培美曲塞吉西他濱RRM1mRNA，RRM1(37)依托泊苷TOP2AmRNA伊立替康UGT1A1(*6/*28)絲裂霉素NQO1(465/609)異環(huán)磷酰胺CYP2C9(*3)，CYP2C19(*2/*3)基因表達/多態(tài)性檢測能有效預(yù)測患者化療的藥物敏感性及毒副作用強弱!8、化療類化療類分子診斷項目鉑類ERCC1mRNA，BRCA1mRNA順鉑抗微管類T臨床常見的幾種化療藥物蒽環(huán)類、伊立替康、甲氨蝶呤、依托泊苷、巰嘌呤類、絲裂霉素、培美曲塞、環(huán)磷酰胺、替莫唑胺等臨床常見的幾種化療藥物蒽環(huán)類、伊立替康、甲氨蝶呤、依托泊苷、1.ERCC1與鉑類1.ERCC1與鉑類2.RRM1與吉西他濱2.RRM1與吉西他濱3.TUBB3與紫杉醇類3.TUBB3與紫杉醇類4.BRCA1與鉑類/抗微管類4.BRCA1與鉑類/抗微管類當(dāng)基因丟失，或易位，或插入外來基因即可發(fā)生腫瘤肺癌EGFR通路靶向分子病理檢測EGFR突變檢測的意義K-RAS基因?qū)賀as基因家族，正常時能調(diào)控細胞生長路徑；PIK3CA存在兩個熱點突變區(qū)：分子病理臨床價值案例-小結(jié)(II)胃腸道間質(zhì)瘤分子診斷項目獲得性耐藥：T790M和C-MET胃腸道間質(zhì)瘤分子診斷項目當(dāng)基因丟失，或易位，或插入外來基因即可發(fā)生腫瘤臨床常見的幾種化療藥物MDR1(2677/3435)→西方肺腺癌患者EGFR突變陽性率約為10%，亞裔腺癌患者為50%左右，亞裔鱗癌約為2.主要集中于11號外顯子（Lys550-Val560）約占70-80%、9號外顯子（Ala502-Tyr503）約占5%-10%。TUBB3mRNA，STMN1mRNA5、T790M突變：AZD9291(阿斯利康)，Rociletinib多見于黑色素瘤（突變率40-60%）、結(jié)直腸癌、甲狀腺乳頭狀癌、NSCLC（突變率0.EGFR突變患者使用吉非替尼反應(yīng)率可達到71.最有效的是E19/E21突變，占總突變90%，E20為耐藥突變。BRAF是MAPK的最強激活劑，40多種突變，15外顯子1799T/A最常見；9號外顯子（E542K、E545K、E545G突變）；胃腸道間質(zhì)瘤分子診斷項目EML4-ALK融合基因可見于多種腫瘤，如間變性大細胞淋巴瘤、炎性成肌纖維細胞瘤、成神經(jīng)細胞瘤和NSCLC等；50%結(jié)直腸癌患者中；三代EGFR-TKIAZD9291，對于EGFR敏感突變和T790M耐藥突變的患者均有效；當(dāng)基因丟失，或易位，或插入外來基因即可發(fā)生腫瘤EML4-ALK基因融合或ALK基因斷裂呈陽性的患者可以從克唑替尼/色瑞替尼的治療中獲得最大化的生存效益。PIK3CA基因突變導(dǎo)致PI3K/Akt信號通路持續(xù)性活化，PI3K作為EGFR下游信號分子被激活，導(dǎo)致腫瘤細胞對EGFR-TKI等藥物的耐藥。K-RAS基因突變檢測腫瘤患者的個體差異、腫瘤的異質(zhì)性決定了單一模式的“OneSizeFitsAll”的粗放醫(yī)療時代將被以分子檢測手段為基礎(chǔ)的個體化醫(yī)療所取代。K-RAS基因突變使結(jié)直腸癌患者對西妥昔單抗治療產(chǎn)生耐藥性。腫瘤患者的個體差異、腫瘤的異質(zhì)性決定了單一模式的“OneSizeFitsAll”的粗放醫(yī)療時代將被以分子檢測手段為基礎(chǔ)的個體化醫(yī)療所