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第三章蛋白質(zhì)I:蛋白質(zhì)的組成第一節(jié)蛋白質(zhì)通論一、蛋白質(zhì)的化學(xué)組成C(~50%)、H(~7%)、O(23%)、N(16%)、S(0-3%)P、Fe、Cu、I、Zn、Mo蛋白質(zhì)平均含氮量為16%,這是蛋白質(zhì)元素組成的一個(gè)特點(diǎn),也是凱氏定氮法測(cè)定蛋白質(zhì)含量的計(jì)算基礎(chǔ)。蛋白質(zhì)含氮量=蛋白氮6.25二、蛋白質(zhì)的分類(一)按組成分為兩大類簡(jiǎn)單蛋白質(zhì)(simple
protein)完全由氨基酸殘基組成的蛋白質(zhì)。胰島素結(jié)合蛋白質(zhì)(conjugated
protein)除蛋白質(zhì)部分外,還有非蛋白質(zhì)成分(輔基)。血紅蛋白簡(jiǎn)單蛋白按溶解度又可分為7類:清蛋白(albumin)球蛋白(globulin)谷蛋白(glu
in)溶于水、稀鹽、稀酸堿溶于水或稀鹽溶于稀酸、稀堿谷醇溶蛋白(prolamine)
溶于70-80%乙醇組蛋白(histone)
溶于水與稀酸魚精蛋白(protamine)溶于水和稀酸硬蛋白(scleroprotein)不溶于水、鹽、稀酸堿結(jié)合蛋白按輔基種類分為:輔基白(nucleoprotein
)
核酸脂蛋白(lipoprotein
)
脂質(zhì)糖蛋白(glycoprotein)糖磷蛋白(phosphoprotein)
磷酸基血紅素蛋白(hemoprotein
)血紅素黃素蛋白(flavoprotein
)
FAD金屬蛋白(metallaprotein
)金屬血紅蛋白(轉(zhuǎn)運(yùn)氧)(二)按分子外形分為兩類球狀蛋白質(zhì)(globular
proteins)纖維狀蛋白質(zhì)(fibrous
proteins)(三)按生物功能分為酶(enzyme)調(diào)節(jié)蛋白(regulatory
protein)轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白(transport
protein)蛋白(nutrient
and
storage
protein)收縮和運(yùn)動(dòng)蛋白(contractile
and
motile
protein結(jié)構(gòu)蛋白(structural
protein)防御蛋白(defense
protein)異常蛋白(exotic
protein)A0005801.mov一個(gè)過(guò)程多重功能蛋白三、蛋白質(zhì)的水解(一)酸水解回流煮沸20小時(shí)蛋白質(zhì)氨基酸6
mol/L
HCl(二)堿水解回流煮沸10-20小時(shí)蛋白質(zhì)氨基酸5
mol/L
NaOH(三)酶水解不完全水解習(xí)題蛋白質(zhì)有哪些生物功能?有5
g
植物
,經(jīng)測(cè)定含氮0.06
g。問(wèn)該
蛋白質(zhì)含量是多少?(%):簡(jiǎn)單蛋白質(zhì)、結(jié)合蛋白質(zhì)、球蛋白/球狀蛋白質(zhì)蛋白質(zhì)的水解產(chǎn)物是什么?第二節(jié)氨基酸--蛋白質(zhì)的構(gòu)件分子一、氨基酸的分類(一)常見(jiàn)蛋白質(zhì)氨基酸(standard
amino
acid)-氨基酸結(jié)構(gòu)通式-氨基酸的區(qū)別在于側(cè)鏈R基的不同1
非極性R基氨基酸(Aromatic
R
Groups)
8種吲哚基團(tuán)非極性R基氨基酸2
不
帶
電
荷
的
極
性
R
基
氨
基
酸(Polar,uncharged
R
Group)
7種3
帶正電荷的R基氨基酸(Positively
Charged
R
Group)
3種堿性氨基酸,在pH7時(shí)攜帶正凈電荷.精氨酸(胍基)組氨酸(咪唑基)賴氨酸(-氨基)4
帶負(fù)電荷的R基氨基酸(Negatively
Charged
R
Group)
2種酸性氨基酸,含有2個(gè)羧基,在pH7時(shí)分子帶負(fù)電荷.谷氨酸天冬氨酸重要AA的特征:含芳香環(huán)的氨基酸Phe(F),Trp(W),Tyr(Y)含羥基氨基酸Ser(S),Thr(T),Tyr(Y)含硫的氨基酸Cys(C)(巰基),Met(M)含酰胺基氨基酸Asn(N),Gln(Q)酸性氨基酸:Asp(D),Glu(E)堿性氨基酸:Lys(K),Arg(R),His(H)亞氨基酸:Pro(P)沒(méi)有旋光性的氨基酸:Gly(G)(二)不常見(jiàn)的蛋白質(zhì)氨基酸(稀有氨基酸)蛋白質(zhì)組成中,除常見(jiàn)的20種氨基酸外,還有一些不常見(jiàn)的氨基酸,如4-羥脯氨酸,它們是常見(jiàn)氨基酸衍生來(lái)的。又稱稀有氨基酸。(三)非蛋白質(zhì)氨基酸還有300多種氨基酸不參與蛋白質(zhì)組成,它們以游離狀態(tài)或結(jié)合狀態(tài)存在于細(xì)胞或組織中。多為蛋白質(zhì)氨基酸的衍生物。常作為代謝物前體或中間產(chǎn)物。習(xí)題重要氨基酸的特征AA的三字母、單字母符號(hào):稀有氨基酸、非蛋白質(zhì)氨基酸第二節(jié)氨基酸--蛋白質(zhì)的構(gòu)件分子一、氨基酸的分類二、氨基酸的酸堿化學(xué)三、氨基酸的重要化學(xué)反應(yīng)四、氨基酸的光學(xué)活性和光譜性質(zhì)二、氨基酸的酸堿化學(xué)(一)氨基酸的兼性離子形式中性pH下,氨基酸主要以偶極離子(dipolarion)或兼性離子(zwitterion)形式存在。(二)氨基酸的兩性解離氨基酸的解離狀態(tài)是pH的一個(gè)函數(shù)氨基酸具有特征滴定曲線從滴定曲線理解:(1)
pKa1解離常數(shù)Ka1代表氨基酸羧基解離情況。pKa1等于羧基解離一半時(shí)的pH值。解離常數(shù)Ka2代表氨基酸氨基解離情況。pKa2等于氨基解離一半時(shí)的pH值。(2)氨基酸等電點(diǎn)氨基酸所帶正電荷數(shù)與負(fù)電荷數(shù)相等時(shí)(凈電荷為零時(shí))的溶液pH
值,稱為等電點(diǎn)(isoelectric
point,pI)。pI=1/2
(pKa1+pKa2)酸性AA:pI=1/2
(pKa1+pKR)堿性AA:pI=1/2
(pKa2+pKR)組氨酸的滴定曲線3
氨基酸的帶電狀況與溶液pH有關(guān)pHpI時(shí),AA帶負(fù)電,電場(chǎng)中向正極移動(dòng)pHpI時(shí),帶正電, 向負(fù)移動(dòng)pHpI時(shí),不帶電, 不移動(dòng)(三)氨基酸的
滴定加入
,氨基酸的滴定終點(diǎn)降低2-3個(gè)pH單位。與氨基酸中的氨基作用生成羥甲基衍生物,增加了氨基的酸性解離。三、氨基酸的重要化學(xué)反應(yīng)Sanger反應(yīng)艾德曼(Edman)反應(yīng)茚三酮反應(yīng)(一)桑格反應(yīng)(sanger
reaction)-氨基參加的反應(yīng)(烴基化反應(yīng))桑格試劑:2,4-二硝基氟苯2,4-dinitrofluorobenzene(DNFB,F(xiàn)DNB))Sanger反應(yīng)*
應(yīng)用:
鑒定多肽鏈的氨基末端氨基酸在弱堿性溶液中,
DNFB
將-氨基酸轉(zhuǎn)變成黃色的2,4-二
基氨基酸.(二)艾德曼反應(yīng)(Edman
reaction)試劑:苯異硫 酸酯(Phenylisothiocyanate,
PITC)-氨基參加的反應(yīng)(烴基化反應(yīng))艾德曼反應(yīng)用途:鑒定多肽鏈氨基末端AA;蛋白質(zhì)(三)茚三酮反應(yīng)(Ninhydrin
reaction)-氨基和-羧基同時(shí)參加的反應(yīng)茚三酮反應(yīng)弱酸性溶液中-氨基酸與茚三酮共同加熱,引起氨基酸氧化脫氨﹑脫羧反應(yīng),最后還原茚三酮和氨發(fā)生反應(yīng),生成藍(lán)紫色產(chǎn)物.*
用途:定性或定量氨基酸?氨基酸應(yīng)茚三酮反(四)巰基的反應(yīng)巰基不穩(wěn)定,易被氧化成二硫鍵2半胱氨酸胱氨酸
2
-SH-S-S-與重金屬反應(yīng)AA-SH
+Ag+AA-SAg3二硫鍵的打開氧化:Cys-S-S-Cys+HCOOOH2AA-SO
-3(磺基丙氨酸)還原:Cys-S-S-Cys+-巰基乙醇2Cys-SH4巰基的保護(hù)巰基的烷基化試劑:碘乙酸、碘乙酰胺-SH+I(xiàn)CH2COOH-SCH2COOH+HI四、氨基酸的光學(xué)活性和光譜性質(zhì)1
旋光性除Gly外,都含C*,對(duì)映體,光學(xué)異構(gòu)體幾乎所有天然存在的蛋白質(zhì)氨基酸都為L(zhǎng)-型氨基酸的構(gòu)型指-碳的構(gòu)型2
光吸收Tyr,
Phe,
Trp
因苯環(huán)上含共軛雙鍵,在近紫外區(qū)吸收光,其吸收
在280nm左右。A=CL紫外法測(cè)定蛋白質(zhì)濃度的原理。第三節(jié)氨基酸的分析分離一、分配柱層析(Partition
Chromatography)層析系統(tǒng):固定相(stationary
phase)流動(dòng)相(mobile
phase)分配系數(shù)Kd有效分配系數(shù)Keff二、濾紙層析(Filter-paper
Chromatography)Rf值:從原點(diǎn)到氨基酸停留點(diǎn)的距離/原點(diǎn)到溶劑前沿的距離三、薄層層析(Thin-layer
Chromatography)四、離子交換柱層析(Ion-exchange
ColumnChromatography)離子交換樹脂帶酸性基團(tuán)、能解離出質(zhì)子,與溶液中陽(yáng)離子發(fā)生交換的叫陽(yáng)離子交換樹脂。-SO3H(強(qiáng)酸型)、-COOH(弱酸型)帶正電荷的AA與陽(yáng)離子交換樹脂結(jié)合力強(qiáng)。帶堿性基團(tuán)、能解離出OH-、可與溶液中陰離子發(fā)生交換的叫陰離子交換樹脂。-N(CH3)OH(強(qiáng)堿型)、-NH3OH(弱堿型)帶負(fù)電荷的AA與陰離子交換樹脂結(jié)合力強(qiáng)。五、氣相色譜
(gas-liquid
chromatography流動(dòng)相為氣體,基于分配原理。優(yōu)點(diǎn):微量、快速六、高效液相色譜(HPLC)high
performance
liquid
chromatography溶劑系統(tǒng)為高壓優(yōu)點(diǎn):快速、靈敏、高效習(xí)題為什么用紫外法能測(cè)定蛋白質(zhì)含量?陽(yáng)離子交換柱,pH=3時(shí),中性AA、酸性
AA、堿性AA,哪一種先被洗脫下來(lái)。為什么?:氨基酸pI
桑格反應(yīng)艾德曼反應(yīng)HPLC
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