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生態(tài)學(xué)統(tǒng)計(jì)分析方法與實(shí)踐第六章方差分析方差分析(analysisofvariance,ANOVA)作用當(dāng)試驗(yàn)結(jié)果受到多個(gè)因素的影響,而且也受到每個(gè)因素的各水平的影響,為從數(shù)量上反映各因素以至各因素諸水平對(duì)試驗(yàn)結(jié)果的影響時(shí)使用方差分析的方法。基本思想把全部數(shù)據(jù)關(guān)于總均值的離差平方和分解成幾個(gè)部分,每一部分表示某因素交互作用所產(chǎn)生的效應(yīng),將各部分均方與誤差均方相比較,從而確認(rèn)或否認(rèn)某些因素或交互作用的重要性。
總變異=處理效應(yīng)+試驗(yàn)誤差幾個(gè)術(shù)語(yǔ)1.試驗(yàn)指標(biāo)(experimentalindex)2.試驗(yàn)因素(experimentalfactor)3.因素水平(leveloffactor)4.試驗(yàn)處理(treatment)5.試驗(yàn)單位(experimentalunit)6.重復(fù)(repetition)方差分析
方差又稱均方,即標(biāo)準(zhǔn)差的平方,表示變異的量。方差分析就是將總變異分裂為各個(gè)因素的相應(yīng)變異,做出其變量估計(jì),從而發(fā)現(xiàn)各個(gè)因素在變異中所占的重要程度;而且除了可控因素所引起的變異后,其剩余變異又可以提供試驗(yàn)誤差的準(zhǔn)確而無(wú)偏的估計(jì),作為統(tǒng)計(jì)假設(shè)檢驗(yàn)的依據(jù)。方差分析的基本原理線性模型與基本假定
-μ表示全試驗(yàn)觀測(cè)值總體的平均數(shù)-ai是第i個(gè)處理的效應(yīng)(treatmenteffects)表示處理i對(duì)試驗(yàn)結(jié)果產(chǎn)生的影響-εij是試驗(yàn)誤差,相互獨(dú)立,且服從正態(tài)分布N(0,σ2)。所有試驗(yàn)處理必須具有共同的誤差方差即誤差同質(zhì)性假定。(一)固定模型:各個(gè)處理效應(yīng)值是固定,各個(gè)處理的平均效應(yīng)是一個(gè)常量。(二)隨機(jī)模型:各個(gè)處理效應(yīng)值非固定,而是隨機(jī)因素所引起的效應(yīng)。(三)混合模型:一般存在于多因素試驗(yàn)中,既包括固定因素又包括隨機(jī)因素。
三種模型所推導(dǎo)的平方和及自由度的分解公式?jīng)]有區(qū)別,但在進(jìn)行假設(shè)檢驗(yàn)時(shí)所用的統(tǒng)計(jì)數(shù)量計(jì)算公式是不同的。
(一)總平方和的分解在表6-1中,反映全部觀測(cè)值總變異的總平方和是各觀測(cè)值xij與總平均數(shù)的離均差平方和,記為SST。即
其中所以為各處理平均數(shù)與總平均數(shù)的離均差平方和與重復(fù)數(shù)n的乘積,反映了重復(fù)n次的處理間變異,稱為處理間平方和,記為SSt,即
其中,C=/kn稱為矯正數(shù)。(二)總自由度的剖分在計(jì)算總平方和時(shí),資料中的各個(gè)觀測(cè)值要受這一條件的約束,故總自由度等于資料中觀測(cè)值的總個(gè)數(shù)減1,即kn-1。
各部分平方和除以各自的自由度便得到總均方、處理間均方和處理內(nèi)均方,分別記為MST(或)、MSt(或)和MSe(或)。即
MST≠M(fèi)St+MSe。F測(cè)驗(yàn)在方差分析中,F(xiàn)測(cè)驗(yàn)是用于測(cè)驗(yàn)?zāi)稠?xiàng)變異因素的效應(yīng)或方差是否真實(shí)存在,所以在計(jì)算F值時(shí),總是將要測(cè)驗(yàn)的那一項(xiàng)變異因素的均方作為分子,而以另一項(xiàng)變異因素(例如試驗(yàn)誤差項(xiàng))的均方作為分母。多重比較1.最小顯著差數(shù)法(leastsignificantdifference
LSD)兩個(gè)平均數(shù)相比較在多樣本試驗(yàn)中的應(yīng)用,所以LSD法實(shí)際上屬于t測(cè)驗(yàn)性質(zhì)。
應(yīng)用LSD法進(jìn)行多重比較時(shí),必須在測(cè)驗(yàn)顯著的前提下進(jìn)行,并且各對(duì)被比較的兩個(gè)樣本平均數(shù)在試驗(yàn)前已經(jīng)指定,因而它們是相互獨(dú)立的。利用此法時(shí),各試驗(yàn)處理一般是與指定的對(duì)照相比較(假設(shè):H0:μB=μA,H0:μC=μA,…..)。若兩個(gè)平均數(shù)的差數(shù)>LSDa,即在a水平上顯著。由R.A.Fisher1966年提出3.各處理平均數(shù)間的比較采用的是標(biāo)記字母法(或“*”)。若顯著水平a=0.05,差異顯著性用小寫英文字母表示,可先在最大的平均數(shù)上標(biāo)上字母a(或“*”),并將該平均數(shù)與以下各個(gè)平均數(shù)相比,凡相差不顯著的(R<LSRα)都標(biāo)上字母a,直至某一個(gè)與之相差顯著的平均數(shù)則標(biāo)以字母b;再以該標(biāo)有字母b的平均數(shù)為準(zhǔn),與上方各個(gè)平均數(shù)比,凡是不顯著的一律標(biāo)以b;再以標(biāo)有b的最大平均數(shù)為準(zhǔn),與以下各未標(biāo)記的平均數(shù)比,凡是不顯著的繼續(xù)標(biāo)以字母b,直至某一個(gè)與之相差顯著的平均數(shù)則標(biāo)以字母c;……;如此重復(fù),直到最小的一個(gè)平均數(shù)有了標(biāo)記字母為止。在各平均數(shù)之間,凡是標(biāo)有相同字母的,差異不顯著,凡是標(biāo)有不同字母的表示差異顯著。顯著水平a=0.01時(shí),用大寫英文字母表示,標(biāo)記方法同上述。多重比較的方法有LSD(最小顯著差數(shù))法和LSR(最小顯著極差)法。其中LSR法又分為兩種,一是SSR法,一是q測(cè)驗(yàn)法(J.W.Tukey1952,Student-Newman-keul,SNK檢驗(yàn))。三種方法的差別在于多個(gè)樣本平均數(shù)進(jìn)行比較時(shí),采用的顯著標(biāo)準(zhǔn)不同。q測(cè)驗(yàn)標(biāo)準(zhǔn)最高,SSR法次之,而LSD法最低。因此,對(duì)于試驗(yàn)結(jié)論事關(guān)重大或有嚴(yán)格要求的,宜用q測(cè)驗(yàn),q測(cè)驗(yàn)可以不經(jīng)過(guò)F測(cè)驗(yàn);一般試驗(yàn)可采用SSR測(cè)驗(yàn)。LSD法僅適用于處理與指定對(duì)照相比較。ANOVA和GLM過(guò)程SAS系統(tǒng)中,ANOVA過(guò)程可以處理以上情形的方差分析,但它要求每個(gè)分類因子的組合觀察數(shù)相等,即數(shù)據(jù)是均衡的。若不均衡,就要求用GLM(GeneralLinearModel)過(guò)程進(jìn)行處理。均衡數(shù)據(jù)的方差分析(ANOVA過(guò)程)1.過(guò)程格式
PROCANOVA[選擇項(xiàng)]:
CLASS變量表;
MODEL因變量表=效應(yīng);
MEANS效應(yīng)[/選擇項(xiàng)];
TESTH=效果名稱E=效果名稱;By變量表;(1)程序中,CLASS語(yǔ)句和MODEL語(yǔ)句是必需的。而且,CLASS語(yǔ)句必須出現(xiàn)在MODEL語(yǔ)句之前。(2)CLASS語(yǔ)句中的變量是分類變量或因素或者自變量,用來(lái)區(qū)分分類水平,可以是數(shù)值型,也可以是字符型(不超過(guò)16個(gè)字符)。(3)Model語(yǔ)句不能重復(fù),ANOVA過(guò)程只允許使用一個(gè)Model語(yǔ)句。
(3)MODEL語(yǔ)句指明因變量和自變量(因子變量)效應(yīng)。效應(yīng)是分類變量的各種組合,效應(yīng)可以是主效應(yīng)、交互效應(yīng)、嵌套效應(yīng)和混合效應(yīng)。對(duì)應(yīng)的效應(yīng)模型如下:
-主效應(yīng)模型:分類變量本身來(lái)表示。
Procanova;classabc;modely=abc;Run;模型中,a,b,c是主效應(yīng)(自變量),y是因變量(響應(yīng)變量),必須是連續(xù)的數(shù)值型變量。
-交互模型:通過(guò)分類變量之間用“*”號(hào)連接來(lái)規(guī)定。Procanova;Classabc;MODELy=abca*ba*ca*ca*b*c;Run;模型中,a*b,a*c,b*c,a*b*c是交互效應(yīng)。
-豎條(|)記號(hào)可以簡(jiǎn)化因子模型Procanova;classabc;modely=a|b|c;Run;相當(dāng)于:y=aba*bca*cb*ca*b*c-豎條(|)記號(hào),并在@之后再跟隨一個(gè)數(shù)字(即變量的的最大個(gè)數(shù)),以表示展開時(shí)交叉效應(yīng)及嵌套效應(yīng)所含變量的個(gè)數(shù)的最大值。A|C(B)=AC(B)A*C(B)A(B)|C(B)=A(B)C(B)A(B)*C(B)A|B(A)C@2=AB(A)CA*CA|B|C|D@2=ABCDA*BA*CA*DB*CB*DC*D(4)MEANS語(yǔ)句是選擇語(yǔ)句,計(jì)算并輸出所列的效應(yīng)對(duì)應(yīng)的因變量均值??梢允褂萌我舛鄠€(gè)Means語(yǔ)句。-若指明了選擇項(xiàng),則將進(jìn)行主效應(yīng)均值間的檢驗(yàn)。常用的選擇項(xiàng)如下:BON、DUNCAN、LSD、REGWF、REGWO、SNK、SCHEFFE、SIDAK、SMM(GT2)、TUKEY、WALLER。以上選擇項(xiàng)在實(shí)際應(yīng)用中,一般選擇一種或兩種方法即可。-ALPHA=p確定檢驗(yàn)的顯著性水平。缺省值是0.05。
-E=效應(yīng)名稱規(guī)定F測(cè)驗(yàn)的分母。(5)Test語(yǔ)句H=分子E=分母若缺省,仍然使用誤差均方(MSe)作為誤差項(xiàng)對(duì)所有平方和(SS)計(jì)算F值,可以使用多個(gè)test語(yǔ)句。(6)By語(yǔ)句要求按其指定變量分別進(jìn)行方差分析。非平衡數(shù)據(jù)的方差分析(GLM過(guò)程)在SAS/STAT中GLM(GeneralLinearModels)過(guò)程分析功能最多。它包括:簡(jiǎn)單回歸(一元回歸)加權(quán)回歸多重回歸及多元回歸多項(xiàng)式回歸方差分析(尤其對(duì)不平衡設(shè)計(jì)資料更為有效)偏相關(guān)分析協(xié)方差分析多元方差分析重復(fù)測(cè)量方差分析1.過(guò)程格式
PROCGLM[選擇項(xiàng)];
CLASS變量表;
MODEL因變量=效應(yīng);
MEANS效應(yīng)/[選擇項(xiàng)];TESTH=效果名稱E=效果名稱;By變量表;RUN;單向分組資料的方差分析組內(nèi)觀察值數(shù)目相等的單向分組資料的方差分析
單向分組資料:觀察值僅按一個(gè)方向分組的資料。試驗(yàn)中將全部供試單位隨機(jī)地分成若干組,然后按組給以不同處理(即同組各供試單位受相同處理,不同組則受不同處理),所得的觀察值就是單向分組資料。
單向分組資料的方差分析例題:
研究6種氮肥使用方法(k=6)對(duì)羊草的效應(yīng),每種施肥方法中5盆羊草(n=5),完全隨機(jī)設(shè)計(jì),最后測(cè)定它們的含氮量(mg),試作方差分析。(二)F測(cè)驗(yàn)假設(shè)H0:μ1=μ2=….=μ6推斷:F>F0.01,6種施氮法的葉片含氮量是顯著不同的多重比較解:統(tǒng)計(jì)結(jié)果和推斷R-Square:等于模型的平方和除以總平方和,用于度量在因變量的變差里能夠由模型決定的比例有多少,越接近1,效果越好。單因素ANOVA的結(jié)果分析H0(原假設(shè)):μ1=…=μ6.H1(備則假設(shè)):至少有兩組的均值不等。1.從分析結(jié)果得知:F=MSt/MSe=8.89/0.054=164.17,其(Pr>F)值<0.0001,拒絕H0,表示6種施氮法的植株的含氮量是顯著不同的。2.ROOTMSE:MSe的平方根,估計(jì)因變量的標(biāo)準(zhǔn)差。此值為0.23,為0.054的開平方。3.R-square:為0.97,等于模型平方和除以平方和(44.46/45.76=0.97),表明因變量中有97%的方差可由model解釋。4.CoeffVar:為1.78,為變異系數(shù),表示總體的變異性。C.V=(ROOTMSE)/(yMean)
=0.23/13.093*100=1.78從CLASS語(yǔ)句指出的變量的Pr>F(概率值)<0.0001??傻贸龈鞣N施肥方法間有極顯著差異。說(shuō)明6種施氮法的植株的含氮量是顯著不同的。用DUNCAN新復(fù)極差法測(cè)驗(yàn)結(jié)果表明,除第二種方法和第6種施肥法之間無(wú)差異外,其余各種方法間的差異均達(dá)到顯著水平,其中第5種施肥法的效果最好,其次是第2種和第6種。主對(duì)話框方法第一步:建立數(shù)據(jù)集第二步:Solution-Analysis-Analyst第三步:bySASname-work-New-okStatics-Anova-One-WayAnova組內(nèi)觀察值數(shù)目不等的單向分組資料的方差分析例題:調(diào)查三個(gè)森林生態(tài)系統(tǒng)的物種數(shù),按面積比例抽取樣點(diǎn),得三個(gè)系統(tǒng)各樣點(diǎn)的物種數(shù)分別為:21,29,24,22,25,30,27,26;20,25,25,23,29,31,24,26,20,21;24,22,28,25,21,26,試做方差分析。推斷:3個(gè)森林生態(tài)系統(tǒng)的物種數(shù)沒(méi)有顯著差異結(jié)果和統(tǒng)計(jì)推斷當(dāng)每一個(gè)自變量分別是最后一個(gè)入選到回歸模型時(shí),計(jì)算出的Model平方和的增量。
每一個(gè)自變量分別入選到回歸模型Model的平方和的增值。
三個(gè)森林生態(tài)系統(tǒng)間:F=0.32,P=0.7314>0.05,故三個(gè)森林的物種數(shù)沒(méi)有顯著差異,因F檢驗(yàn)不顯著,不需要再做平均數(shù)間的比較。TypeI:1)各因素以適當(dāng)?shù)捻樞蚺帕性诓黄胶獾姆讲罘治瞿P椭校?)純嵌套模型;3)多項(xiàng)式回歸模型。TypeIII:1)任何平衡模型;2)任何主效應(yīng)模型;3)任何純回歸模型。2×2模型的例子:1214201811917A12B12組內(nèi)又分亞組的單向分組資料的方差分析
-系統(tǒng)分組資料(hierarchicalclassificationdesign)一種依照不同因素將受試對(duì)象進(jìn)行分層,每層在分組的科研設(shè)計(jì)類型,這樣的資料的主要特點(diǎn)是嵌套性,即第一層嵌套第二層、第三層嵌套于第二層。這種類型又稱為嵌套設(shè)計(jì)、組內(nèi)分組設(shè)計(jì)或巢式設(shè)計(jì)。組內(nèi)又分亞組的單向分組資料的方差分析
-系統(tǒng)分組資料
-巢式設(shè)計(jì)(Nesteddesign)例:在溫室內(nèi)以四種培養(yǎng)液(l=4)培養(yǎng)某品種,每種3盆(m=3),每盆4株(n=4),一個(gè)月后測(cè)定其株高生長(zhǎng)量(mm),得結(jié)果如下,試做方差分析。
(二)F測(cè)驗(yàn)
對(duì)盆與盆間有無(wú)不同影響作F測(cè)驗(yàn),假設(shè)H0:σe2=0
F=158/89=1.8
v1=8,v2=36的F0.05=2.22,接受H0
對(duì)培養(yǎng)液間有無(wú)不同效應(yīng)作F測(cè)驗(yàn),F(xiàn)=15.0,
v1=3,V2=8的F0.05=4.07,拒絕H0
對(duì)于嵌套試驗(yàn)的誤差均方的計(jì)算則是順序進(jìn)行的。對(duì)第一個(gè)因子該檢驗(yàn)的分母是由第二個(gè)因子產(chǎn)生的均方,對(duì)第二個(gè)因子該檢驗(yàn)的分母是由第三個(gè)因子產(chǎn)生的均方。(三)各培養(yǎng)液的平均數(shù)比較培養(yǎng)液間培養(yǎng)液內(nèi)盆間盆內(nèi)株間*采用合適的嵌套模型則不存在誤差項(xiàng)*不存在誤差項(xiàng),不作F檢驗(yàn)該試驗(yàn)同一培養(yǎng)液內(nèi)各盆間F=1.77,P=0.115>0.05;故同一培養(yǎng)液內(nèi)各盆間的生長(zhǎng)量無(wú)顯著差異;而不同培養(yǎng)液間的生長(zhǎng)量F=15.05,P=0.0012<0.01,故不同培養(yǎng)液間的生長(zhǎng)量有顯著差異,需進(jìn)一步測(cè)驗(yàn)各平均數(shù)間的差異顯著性。NESTED過(guò)程(嵌套過(guò)程)格式:PROCNESTED[選擇項(xiàng)];CLASS
Variables;VARvariable;BYvariables;組內(nèi)又分亞組的單向分組資料的方差分析
-系統(tǒng)分組資料
-巢式設(shè)計(jì)(Nesteddesign)例:在溫室內(nèi)以四種培養(yǎng)液(l=4)培養(yǎng)某品種,每種3盆(m=3),每盆4株(n=4),一個(gè)月后測(cè)定其株高生長(zhǎng)量(mm),得結(jié)果如下,試做方差分析。兩向分組資料的方差分析試驗(yàn)數(shù)據(jù)按兩個(gè)因素交叉分組的,為兩向分組資料,又叫交叉分組。按完全隨機(jī)設(shè)計(jì)的兩因素試驗(yàn)數(shù)據(jù),都是兩向分組資料;其方差分析按各組內(nèi)有無(wú)重復(fù)觀察值分為兩種不同分析方法。兩向分組資料的方差分析例:用生長(zhǎng)素處理豌豆,共6個(gè)處理。豌豆種子發(fā)芽后,分別在每一木箱中移植4株,每組6個(gè)木箱,每個(gè)木箱一個(gè)處理。試驗(yàn)共有4組24箱,試驗(yàn)時(shí)按組排于溫室中,使同組各箱的環(huán)境條件一致。然后記錄各箱見(jiàn)第一朵花時(shí)4株豌豆的總節(jié)數(shù),其結(jié)果如下,試作方差分析。兩因素單獨(dú)觀測(cè)值試驗(yàn)的數(shù)學(xué)模型為:式中,μ為總平均數(shù);αi,βj分別為Ai、Bj的效應(yīng),αi=μi-μ,βj=μj-μ,μi、μj分別為Ai、Bj觀測(cè)值總體平均數(shù),且Σαi=0,Σβj=0;εij為隨機(jī)誤差,相互獨(dú)立,且服從N(0,σ2)。上述這種試驗(yàn)資料如果A、B存在互作,則與誤差混淆,因而無(wú)法分析互作,也不能取得合理的試驗(yàn)誤差估計(jì),只有AB互作不存在時(shí),才能正確估計(jì)誤差。但在野外試驗(yàn)上,隨機(jī)區(qū)組試驗(yàn)中,處理可看作A因素,區(qū)組看作B因素;處理和區(qū)組的互作在理論上是不存在的。但是這種設(shè)計(jì)的誤差自由度一般不應(yīng)小于12。無(wú)交互隨機(jī)區(qū)組設(shè)計(jì)和單因素多水平的區(qū)別
隨機(jī)區(qū)組設(shè)計(jì)適合于安排一個(gè)試驗(yàn)因素和一個(gè)重要的非試驗(yàn)因素(“區(qū)組因素”),實(shí)質(zhì)上是在單因素多水平設(shè)計(jì)的基礎(chǔ)上多考察了一個(gè)區(qū)組因素,可以消除和抵消重要非試驗(yàn)因素對(duì)觀測(cè)結(jié)果的干擾和影響。隨機(jī)區(qū)組設(shè)計(jì)是否優(yōu)于單因素多水平設(shè)計(jì),關(guān)鍵在于所選擇的“區(qū)組因素”的“能量”,當(dāng)所選定的區(qū)組因素確實(shí)對(duì)觀測(cè)結(jié)果有重要影響且完全隨機(jī)的效果無(wú)法保證“區(qū)組因素”對(duì)試驗(yàn)因素各水平組的影響是非常均衡時(shí),隨機(jī)區(qū)組設(shè)計(jì)一定優(yōu)于單因素多水平設(shè)計(jì)。各項(xiàng)平方和與自由度的計(jì)算公式為矯正數(shù)
總平方和
A因素平方和
B因素平方和誤差平方和SSe=SST-SSA-SSB總自由度dfT=ab-1A因素自由度dfA=a-1B因素自由度dfB=b-1誤差自由度dfe=dfT
-dfA-dfB
=(a-1)(b-1)相應(yīng)均方為
A因素(生長(zhǎng)素處理)有6個(gè)水平,即a=6;B因素(區(qū)組)有4個(gè)水平,即b=4,共有a×b=6×4=24個(gè)觀測(cè)值。方差分析如下:X對(duì)照赤霉素吲哚乙酸硫酸腺嘌呤馬來(lái)酸動(dòng)力精如果實(shí)驗(yàn)在必須區(qū)組化時(shí),沒(méi)有區(qū)組化,那么誤差效應(yīng)會(huì)被夸大,導(dǎo)致處理均值間的重要差異不能被識(shí)別出來(lái)。組內(nèi)有重復(fù)觀察值的兩向分組資料的方差分析例:施用三種肥料A1,A2,A3于B1,B2,B3三種土壤,以小麥為指示植物,每處理組合種3盆,得產(chǎn)量結(jié)果(g),試作方差分析。兩因素有重復(fù)觀測(cè)值試驗(yàn)的方差分析
進(jìn)行兩因素或多因素試驗(yàn)時(shí),一般應(yīng)設(shè)置重復(fù),以便正確估計(jì)試驗(yàn)誤差。簡(jiǎn)單效應(yīng)(simpleeffect):
在某因素同一水平上,另一因素不同水平對(duì)試驗(yàn)指標(biāo)的影響稱為簡(jiǎn)單效應(yīng)。主效應(yīng)(maineffect)由于因素水平的改變而引起的平均數(shù)的改變量稱為主效應(yīng)。交互作用(互作,interaction):因素內(nèi)簡(jiǎn)單效應(yīng)的平均差異為交互作用。
1、簡(jiǎn)單效應(yīng):如在表中,在A1(不加N)上,B2-B1=480-470=10;在A2(加N)上,B2-B1=512-472=40;在B1(不加P)上,A2-A1=472-470=2;在B2(加P)上,A2-A1=512-480=32等就是簡(jiǎn)單效應(yīng)。簡(jiǎn)單效應(yīng)實(shí)際上是特殊水平組合間的差數(shù)。2、主效應(yīng):當(dāng)A因素由A1水平變到A2水平時(shí),A因素的主效應(yīng)為A2水平的平均數(shù)減去A1水平的平均數(shù),即A因素的主效應(yīng)=492-475=17,同理,B因素的主效應(yīng)=496-471=25主效應(yīng)也就是簡(jiǎn)單效應(yīng)的平均,如(32+2)÷2=17,(40+10)÷2=25。3、互作效應(yīng)可由(A1B1+A2B2-A1B2-A2B1)/2來(lái)估計(jì)。表中的互作效應(yīng)為:(470+512-480-472)/2=15SSAB=SSA+SSB+SSA×B綜上所述,肥料A1對(duì)小麥的增產(chǎn)效果最好,土類間無(wú)顯著差異;但A1施于油砂土卻比施于其他土壤上更有突出的效果。兩向系統(tǒng)分組數(shù)據(jù)分析
綜合系統(tǒng)分組設(shè)計(jì)和兩向分組設(shè)計(jì)的優(yōu)點(diǎn),不僅能夠同時(shí)分析2個(gè)方向上的效應(yīng),而且可以對(duì)某個(gè)方向上組內(nèi)亞組間的效應(yīng)進(jìn)行分析,克服了單向系統(tǒng)分組設(shè)計(jì)只能分析1個(gè)方向上的效應(yīng)的缺點(diǎn)和兩向分組資料不能系統(tǒng)分組的不足。對(duì)西南農(nóng)業(yè)大學(xué)99級(jí)研究生所做的試驗(yàn)結(jié)果進(jìn)行分析。試驗(yàn)選擇了3個(gè)油菜品種(F,G,H),每個(gè)品種分籽粒黃色和黑色2種顏色,從開花后20d起,每隔7d測(cè)一次葉片中的單寧含量,試驗(yàn)結(jié)果如下:例:考察紅丁香(redclover)的氮含量同幾種菌種的關(guān)系。用物種菌種和這物種菌種的合成來(lái)培養(yǎng)紅丁香的氮含量。檢驗(yàn)這六種菌培養(yǎng)的氮含量是否有顯著差異。統(tǒng)計(jì)推斷:菌種3dok1的平均氮含量比其它菌種的平均含量高菌種3dok5的平均氮含量比compos,3dok4和3dok13高菌種3dok7的平均氮含量比3dok4和3dok13高菌種compos的平均氮含量比3dok13高所有其它菌種的平均值之間沒(méi)有明顯差別。田間試驗(yàn)設(shè)計(jì)試驗(yàn)設(shè)計(jì)的原則
-重復(fù):估計(jì)試驗(yàn)誤差、降低試驗(yàn)誤差
-隨機(jī):無(wú)偏的試驗(yàn)誤差
-局部控制:減少處理間的差異控制土壤差異的小區(qū)技術(shù)
-小區(qū)面積
-小區(qū)形狀:長(zhǎng)發(fā)形小區(qū)試驗(yàn)誤差比方形小區(qū)小
-重復(fù)次數(shù):小區(qū)面積?。?-6次;面積大:2-4次
-對(duì)照區(qū)的設(shè)置常用的田間試驗(yàn)設(shè)順序排列的試驗(yàn)設(shè)計(jì)
-對(duì)比法設(shè)計(jì)(contrastdesign)
有較高的精確度,對(duì)照區(qū)過(guò)多
-間比法設(shè)計(jì)(intervalcontrastdesign)設(shè)計(jì)簡(jiǎn)單,估計(jì)的試驗(yàn)誤差有偏性,理論上不能應(yīng)用統(tǒng)計(jì)分析進(jìn)行顯著性檢驗(yàn)
隨機(jī)排列的試驗(yàn)設(shè)計(jì)
-完全隨機(jī)設(shè)計(jì)(completelyrandomdesign)
完全隨機(jī)設(shè)計(jì)將各處理隨機(jī)分配到各個(gè)試驗(yàn)單元(或小區(qū))中,每一處理的重復(fù)數(shù)可以相等或不相等,這種設(shè)計(jì)對(duì)試驗(yàn)單元的安排靈活機(jī)動(dòng),單因素或多因素試驗(yàn)皆可應(yīng)用。-隨機(jī)區(qū)組設(shè)計(jì)(randomizedblocksdesign)
這種設(shè)計(jì)的特點(diǎn)是根據(jù)“局部控制”的原則,將試驗(yàn)地按肥力程度劃分為等于重復(fù)次數(shù)的區(qū)組,一區(qū)組亦即一重復(fù),區(qū)組內(nèi)各處理都獨(dú)立地隨機(jī)排列。
設(shè)計(jì)簡(jiǎn)單,富于彈性,能提供無(wú)偏的誤差估計(jì),對(duì)試驗(yàn)地的地形要求不嚴(yán)。
肥力梯度-拉丁方設(shè)計(jì)(latinsquaredesign)拉丁方設(shè)計(jì)將處理從縱橫二個(gè)方向排列為區(qū)組(或重復(fù)),使每個(gè)處理在每一列和每一行中出現(xiàn)的次數(shù)相等(通常一次),所以它是比隨機(jī)區(qū)組多一個(gè)方向局部控制的隨機(jī)排列的設(shè)計(jì)。精確度高,但缺乏伸縮性,只限于4-8個(gè)處理的試驗(yàn)
裂區(qū)設(shè)計(jì)(split-plotdesign)多因素試驗(yàn)的一種設(shè)計(jì)方式。主處理:第一個(gè)因素設(shè)置,又叫整區(qū);副處理:主處理的小區(qū)內(nèi)引進(jìn)的第二個(gè)因素設(shè)置,亦稱裂區(qū)。主區(qū)的誤差大于副區(qū)。通常在下列幾種情況下,應(yīng)用裂區(qū)設(shè)計(jì)。(1)在一個(gè)因素的各種處理比另一因素的處理可能需要更大的面積時(shí),為了實(shí)施和管理上的方便而應(yīng)用裂區(qū)設(shè)計(jì)。(2)試驗(yàn)中某一因素的主效比另一因素的主效更為重要,而要求更精確的比較,或二個(gè)因素間的交互作用比其主效是更為重要的研究對(duì)象時(shí),亦宜采用裂區(qū)設(shè)計(jì),將要求更高精確度的因素作為副處理,另一因素作為主處理。(3)根據(jù)以往研究,得知某些因素的效應(yīng)比另一些因素的效應(yīng)更大時(shí),亦適于采用裂區(qū)設(shè)計(jì),將可能表現(xiàn)較大差異的因素作為主處理。再裂區(qū)設(shè)計(jì)(split-splitplotdesign)引進(jìn)第三個(gè)因素的設(shè)置,稱為副副處理,亦稱再裂區(qū)。條區(qū)設(shè)計(jì)(stripblocksdesign)
條區(qū)設(shè)計(jì)是屬裂區(qū)設(shè)計(jì)的一種衍生設(shè)計(jì),如果所研究的兩個(gè)因素都需要較大的小區(qū)面積,且為了便于管理和觀察記載,可將每個(gè)區(qū)組先劃分為若干縱向長(zhǎng)條形小區(qū),安排第一因素的各個(gè)處理(A因素);再將各區(qū)組劃分為若干橫向長(zhǎng)條形小區(qū),安排第二因素的各個(gè)處理(B因素),這種設(shè)計(jì)方式稱為條區(qū)設(shè)計(jì)。溫室與實(shí)驗(yàn)室的試驗(yàn)試驗(yàn)方案設(shè)計(jì)原則與田間試驗(yàn)是一致的。
與田間試驗(yàn)相比,除以生物體本身為試驗(yàn)材料,必須保證供試材料的均一性?!拔ㄒ徊町愒瓌t”同樣適用于溫室和實(shí)驗(yàn)室試驗(yàn)中試驗(yàn)方案和試驗(yàn)條件的設(shè)計(jì)。重復(fù)、隨機(jī)排列及局部控制三原則同樣適用于溫室和實(shí)驗(yàn)室試驗(yàn)的設(shè)計(jì)。唯一差異原則:除了將所研究的因素有意識(shí)地分成不同處理外,其它條件及一切管理措施都應(yīng)盡可能的一致。Plan過(guò)程格式(了解)ProcPlan選擇項(xiàng);Factors主效應(yīng)的抽樣方式/選擇項(xiàng);Treatments其他效應(yīng)的抽樣方式;Outputout=數(shù)據(jù)集;ProcPlan語(yǔ)句選擇項(xiàng)Seed=nn是整數(shù),其作用是設(shè)定一隨機(jī)種子。Ordered要求將主效應(yīng)的組別以整數(shù)從小到大的順序排列,此選項(xiàng)與Factors聯(lián)用。Factors語(yǔ)句主效應(yīng)名稱=m[OFn]抽樣方式;Treatments語(yǔ)句
所指定的其他效果必定是嵌在試驗(yàn)設(shè)計(jì)的每一小格內(nèi),其格式和Factors相同Output語(yǔ)句例:完全隨機(jī)排列的試驗(yàn)設(shè)計(jì):設(shè)計(jì)一個(gè)包括4個(gè)區(qū)組、每個(gè)區(qū)組內(nèi)分8個(gè)小區(qū)的田間試驗(yàn)例:裂區(qū)排列的試驗(yàn)設(shè)計(jì):設(shè)計(jì)一個(gè)包括3個(gè)區(qū)組(block)、每個(gè)區(qū)組內(nèi)分4個(gè)小區(qū)(plot)、每個(gè)小區(qū)在分為3個(gè)亞區(qū)(subplot)的田間試驗(yàn)。完全隨機(jī)和隨機(jī)區(qū)組試驗(yàn)的統(tǒng)計(jì)設(shè)計(jì)完全隨機(jī)試驗(yàn)設(shè)計(jì)的統(tǒng)計(jì)分析
-設(shè)計(jì)最簡(jiǎn)單
-廣泛用于盆栽以及材料系統(tǒng)變異不大的情況
-同單向分組資料的方差分析
總變異=處理間+處理內(nèi)單因素隨機(jī)區(qū)組試驗(yàn)結(jié)果統(tǒng)計(jì)方法
-等同于兩向分組單個(gè)觀察值資料的方差分析。試驗(yàn)有k個(gè)處理,n個(gè)區(qū)組:
nk-1=(n-1)+(k-1)+(n-1)(k-1)總自由度=區(qū)組自由度+處理自由度+誤差自由度總平方和=區(qū)組平方和+處理平方和+試驗(yàn)誤差平方和例:有一模擬降雨試驗(yàn)對(duì)某草原生態(tài)系統(tǒng)微生物量增加(%)的影響,共有A,B,C,D,E,F,G,H8個(gè)處理(k=8),其中A是常年平均降雨量,采用隨機(jī)區(qū)組設(shè)計(jì),重復(fù)3次(n=3),其影響結(jié)果如下,試做方差分析。4.多重比較(1)最小顯著差數(shù)法(LSD法)根據(jù)品種比較試驗(yàn)要求,各個(gè)供試品種應(yīng)與對(duì)照品種進(jìn)行比較,宜應(yīng)用LSD法。首先應(yīng)算得樣本平均數(shù)差數(shù)的標(biāo)準(zhǔn)誤:有一包括A、B、C、D、E、F、G7個(gè)高蛋白大豆品種的蛋白質(zhì)含量比較試驗(yàn),其中E品種為對(duì)照,隨機(jī)區(qū)組設(shè)計(jì),3次重復(fù),蛋白質(zhì)含量結(jié)果如圖11-3所示,試作分析。復(fù)因素隨機(jī)區(qū)組試驗(yàn)和統(tǒng)計(jì)方法設(shè)有A和B兩個(gè)因素,各具有a和b個(gè)水平,則有ab個(gè)處理組合(處理)。采用隨機(jī)區(qū)組設(shè)計(jì),重復(fù)r次,共有abr個(gè)觀察值。由于處理項(xiàng)是由A和B兩個(gè)因素不同水平的組合。因此處理間差異又可分解為A因素水平間差異、B因素水平間差異和A與B的交互作用三部分。
總自由度=區(qū)組間自由度+處理自由度+誤差自由度其中處理項(xiàng)平方和及自由度可進(jìn)一步分解:即:處理平方和SSt=A的平方和SSA+B的平方和SSB+A×B平方和SSA×B
即:處理自由度=A的自由度+B的自由度+A×B的自由度兩因素隨機(jī)區(qū)組試驗(yàn)結(jié)果的方差分析例題:有早稻二因素的試驗(yàn),A因素為品種,分A1(早熟),A2(中熟),A3(晚熟)三個(gè)水平,B因素分為B1(低),B2(中),B3(高)三個(gè)水平,共9個(gè)處理,重復(fù)3次,得產(chǎn)量(單位:斤/60平方尺)。試作方差分析。三因素隨機(jī)區(qū)組試驗(yàn)結(jié)果的方差分析有一隨機(jī)區(qū)組設(shè)計(jì)的細(xì)菌培養(yǎng)試驗(yàn),有A(菌種)、B(溫度)、C(培養(yǎng)時(shí)間)3個(gè)試驗(yàn)因素,各具a=2,b=2,c=3個(gè)水平,得其生長(zhǎng)速率,試作方差分析。溫度菌種培養(yǎng)時(shí)間裂區(qū)試驗(yàn)結(jié)果的方差分析
設(shè)有A和B兩個(gè)試驗(yàn)因素,A因素為主處理,具a個(gè)水平,B因素為副處理,具b個(gè)水平,設(shè)有r個(gè)區(qū)組。注意誤差項(xiàng)的分解平方和的分解例題:設(shè)有一小麥中耕次數(shù)A和施肥量試驗(yàn),主處理為A1,A2,A3三個(gè)水平,副處理分別為B1,B2,B3,B4四個(gè)水平,裂區(qū)設(shè)計(jì),重復(fù)三次,試對(duì)其產(chǎn)量作方差分析。5.試驗(yàn)結(jié)論本試驗(yàn)中耕次數(shù)以A1顯著優(yōu)于A2、A3,施肥量以B2極顯著優(yōu)于B1、B4、B3。由于A×B互作不顯著,故最佳A處理與最佳B處理的組合將為最優(yōu)組合,即A1B2為最優(yōu)組合。拉丁方試驗(yàn)結(jié)果統(tǒng)計(jì)方法
1.平方和與自由度的分解縱行橫行品種多點(diǎn)隨機(jī)區(qū)組設(shè)計(jì)的綜合分析在對(duì)生態(tài)系統(tǒng)過(guò)程的研究當(dāng)中,常須經(jīng)過(guò)多年及不同地點(diǎn)環(huán)境條件的考驗(yàn)才能得到全面可靠的結(jié)論。例:中國(guó)科學(xué)院地理研究所對(duì)8個(gè)草原生態(tài)系統(tǒng)的生產(chǎn)力(ANPP)進(jìn)行區(qū)域性比較試驗(yàn),選其中3個(gè)點(diǎn)的產(chǎn)量數(shù)據(jù)表進(jìn)行方差分析。方差分析結(jié)果表明:品種之間達(dá)到極顯著水平。品種和環(huán)境互作之間達(dá)到顯著水平。為研究生態(tài)系統(tǒng)某個(gè)過(guò)程在不同年份、不同樣地與年份間的互作關(guān)系,區(qū)域性試驗(yàn)需要連續(xù)進(jìn)行若干年,以便為因素如何影響該過(guò)程提供更廣泛的信息。例:設(shè)一個(gè)草原生態(tài)系統(tǒng)N添加區(qū)域試驗(yàn),包括對(duì)照在內(nèi)共有5個(gè)處理,在4個(gè)不同的生態(tài)系統(tǒng)進(jìn)行2年的試驗(yàn),每點(diǎn)每次試驗(yàn)均統(tǒng)一采用相同小區(qū)面積重復(fù)3次的隨機(jī)區(qū)組設(shè)計(jì),其
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