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生物化學(xué)第七版考研考點(diǎn)及其分布三第三篇DNA、RNA、蛋白質(zhì)的生物合成這三章考點(diǎn)分散,第十三章考研涉及的比較少(可能是資料不全的原因,這部分是考博考點(diǎn)高頻區(qū)),第十四章考過至少20次,集中在第二節(jié)(P352-356)第十章DNA生物合成1復(fù)制replication概念2DNA復(fù)制的基本規(guī)律:半保留復(fù)制,雙向復(fù)制,半不連續(xù)復(fù)制3origin復(fù)制起點(diǎn)、genome基因組、replicon復(fù)制子、leadingstrand領(lǐng)頭鏈、laggingstrand隨從鏈4原核生物DNA聚合酶分三種類型,其中DNA聚合酶I比較重要,其功能是什么,木瓜蛋白酶酶切可分成兩部分,Klenow片段,5P244“科學(xué)之家”的閱讀材料里,Kornberg家族父子三人各自的貢獻(xiàn)(2013簡答)6mismatchrepair錯(cuò)配修復(fù)7DNA復(fù)制保真性(highfidelity)至少依賴三種機(jī)制:遵守嚴(yán)格的堿基配對(duì)規(guī)律;聚合酶在復(fù)制延長中對(duì)堿基的選擇功能;復(fù)制出錯(cuò)時(shí)有即時(shí)校讀功能8DNAtopoisomeraseDNA拓?fù)洚悩?gòu)酶9原核與真核DNA生物合成過程10岡崎片段11衛(wèi)星DNAsatelliteDNA,中心體centrosome,端粒telomere12端粒酶telomerase概念、功能、爬行模型P25613reversetranscription逆轉(zhuǎn)錄,reversetranscriptase逆轉(zhuǎn)錄酶概念及作用、整合integration、ribozyme核酶、cDNAcomplementaryDNA、14噬菌體DNA滾環(huán)復(fù)制和線粒體DNA的D環(huán)復(fù)制再加上病毒的逆轉(zhuǎn)錄復(fù)制及簡要說明各自過程(簡答)P25815AmestestAmes試驗(yàn)P26116引起突變的分子類型17DNA損傷修復(fù)類型及修復(fù)過程(P263,考過7次以上)光修復(fù)酶photolyase(存在于植物中,人沒有)、調(diào)節(jié)子regulon、SOS修復(fù)第十一章RNA生物合成(21-23補(bǔ)充自王鏡巖生化,這些是RNA考點(diǎn)的高頻區(qū))1transcription轉(zhuǎn)錄2轉(zhuǎn)錄與復(fù)制相似之處:都是酶促核苷酸聚合;都以DNA為模板;都需依賴DNA的聚合酶;聚合過程都形成磷酸二酯鍵;都從5端向3端延伸;都遵從堿基配對(duì)規(guī)律區(qū)別:模板不同;原料不同;酶不同;產(chǎn)物不同;配對(duì)不同3結(jié)構(gòu)基因structuralgene、轉(zhuǎn)錄不對(duì)稱性4DNA兩條鏈編碼鏈=有意義鏈=正鏈=Crick鏈=與mRNA序列一致(T變U)模板鏈=反義鏈=負(fù)鏈=Waston鏈=編碼mRNA模板(4次以上)編碼鏈codingstrand5promoter啟動(dòng)子6大腸桿菌只有一種RNA聚合酶全酶為α2ββ·δ核心酶α2ββ·利福平或利福霉素專一性結(jié)合RNA聚合酶的β亞基,抑制蛋白合成7RNA聚合酶保護(hù)法8Pribnow盒、轉(zhuǎn)錄泡transcriptionbubble、多聚核糖體polysome、發(fā)卡hairpin9原、真核RNA合成比較10真核生物三種RNA聚合酶,各自特點(diǎn)(2次簡單,2次以上的客觀題)11α-鵝膏覃堿敏感性、羧基末端結(jié)構(gòu)域carboxyl-terminaldomainDTD12啟動(dòng)子核心序列、順式作用元件cis-actingelement、增強(qiáng)子enhancerHognest盒、管家基因housekeepinggene、GC盒和CAAT盒13轉(zhuǎn)錄因子transcriptionfactors分為:通用轉(zhuǎn)錄因子和特異性轉(zhuǎn)錄因子14中介子mediator、上游因子upstreamfactor、轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物pre-initiationcomplexPIC、可誘導(dǎo)因子induciblefactor、15II型基因中四類轉(zhuǎn)錄因子P27816P279拼版理論17真核mRNA加工:加帽、加尾、剪接的過程(加帽加尾沒考過,剪接高頻)斷裂基因splitgene、外顯子exon、內(nèi)含子intron、18內(nèi)含子功能(P284)與非編碼序列是兩個(gè)概念19mRAN剪接mRNAsplicing、剪接體spliceomsome、選擇性剪接alternativesplicing、RNA編輯RNAediting20tRNA前體的加工21RNA拼接的四種方式類型I自我拼接、類型II自我拼接、hnRNA拼接、tRNA酶促拼接,這四類均屬于順式拼接(cis-splicing),即都在同一初級(jí)轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物上發(fā)生的剪接,還有一種mRNA反式拼接(trans-splicing):在剪接過程中,兩條不同(或相同)的hnRNA分子間發(fā)生了剪接,將來自兩個(gè)hnRNA分子上的外顯子連接在一起,目前主要在錐蟲和線蟲中發(fā)現(xiàn)22由于存在拼接(splicing)、編輯(editing)和再編碼(recoding),斷裂基因(splitgene/interruptedgene)可以產(chǎn)生多種蛋白,即同源蛋白(同源體isoform)mRNA編輯、mRNA剪接、剪切cleavage、再編碼recoding概念的區(qū)別:剪切cleavage:剪去某些內(nèi)含子,然后在上游外顯子3端直接進(jìn)行多聚腺苷化,不進(jìn)行相鄰?fù)怙@子之間的鏈接反應(yīng)。剪切RNA的5種方式:普通方式外顯子滑動(dòng)、外顯子延長、內(nèi)含子保留、選擇性外顯子mRNAeditingmRNA編輯:指在mRNA水平上改變遺傳信息的過程,即mRNA分子中由于核苷酸的缺失、插入或置換使基因轉(zhuǎn)錄物序列與基因編碼序列不互補(bǔ),使翻譯出的蛋白氨基酸序列與不同于基因序列中編碼信息的現(xiàn)象。mRNA編輯的方向是從3端向5端進(jìn)行,與其他的相反mRNA編輯的意義:可消除移碼突變的危害;增加基因產(chǎn)物多樣性,轉(zhuǎn)錄出多種同源蛋白;與生物分化發(fā)育有關(guān),是基因重要調(diào)控方式;可使基因產(chǎn)物獲得新結(jié)構(gòu)和功能,利于生物進(jìn)化;可能與學(xué)習(xí)和記憶有關(guān)mRNAsplicingmRNA剪接:除去初級(jí)轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物中的內(nèi)含子,把外顯子連接為成熟的mRNA稱為剪接RNA剪接的意義:生物機(jī)體進(jìn)化中形成,是進(jìn)化的結(jié)果;是基因表達(dá)調(diào)控重要環(huán)節(jié);主要存在于真核生物,原核生物中極少見但并非沒有;內(nèi)含子與外顯子是相對(duì)的,有些內(nèi)含子也能編碼產(chǎn)生蛋白或功能RNAmRNArecodingmRNA再編碼:mRNA改變?cè)瓉淼木幋a信息,以不同的方式進(jìn)行翻譯這種mRNA編碼和讀碼方式的改變成為mRAN再編碼。23RNA的生物功能多樣性表現(xiàn):在遺傳信息翻譯中起著決定多用;有重要的催化功能和其他持家功能;RNA轉(zhuǎn)錄后加工和修飾依賴于各類小RNA和其他蛋白復(fù)合物;對(duì)基因表達(dá)和細(xì)胞功能具有重要調(diào)節(jié)作用;RNA在生物進(jìn)化中其重要作用第十二章蛋白質(zhì)生物合成1蛋白生物合成三個(gè)過程:氨基酸活化;肽鏈合成;肽鏈形成后修飾2mRNA、tRNA在蛋白合成中的作用,原、真中的異同(簡答、論述各一次)3codon密碼子、openreadingframe開放閱讀框、起始密碼子AUG,終止密碼子UAA、UGA、UAG,密碼子五個(gè)特點(diǎn):方向性,連續(xù)性,簡并性(degenerate),通用性,擺動(dòng)性(wobble)框移突變frameshifmutation、nonsensemutation無義突變4核糖體結(jié)構(gòu)與功能,注意哪些部分有催化功能P295(至少4次,考過簡答或論述)5原、真核蛋白合成過程以及區(qū)別,區(qū)別見P306頁圖各種酶、起始復(fù)合物(initiationcomplex)、SD序列(Shine-Dalgarnosequence)KozakconsensussequenceKozak共有序列(3次)、多肽延長的循環(huán)過程:進(jìn)位、成肽、轉(zhuǎn)位,具體過程與能量消耗起始蛋白因子:真核的eIF-2與原核的EF-G功能類似延長因子和釋放因子原、真核也有類似的P3046蛋白質(zhì)翻譯后修飾(09-12年至少4次,其中論述題1次)主要為三大要點(diǎn):多肽鏈折疊為天然構(gòu)象的蛋白;蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)修飾主要是肽鍵水解和化學(xué)修飾;蛋白空間結(jié)構(gòu)修飾包括亞基聚合和輔基連接——這三大要點(diǎn)又可各自獨(dú)立稱為簡答題P308-3127翻譯后修飾posttranslationalmodification、蛋白的靶向輸送proteintargeting、分子伴侶molecularchaperon、伴侶蛋白(伴侶素)chaperonin蛋白質(zhì)二硫鍵異構(gòu)酶、肽-脯氨酰順反異構(gòu)酶8蛋白質(zhì)靶向運(yùn)輸機(jī)理信號(hào)序列signalsequence、信號(hào)肽signalpeptide、核定位序列nuclearlocalizationsequence,NLS、信號(hào)肽識(shí)別顆粒signalrecognitionparticleSRP、內(nèi)質(zhì)網(wǎng)滯留信號(hào)序列endoplasmicreticulumretentionsignal(KDEL)、導(dǎo)肽(線粒體基質(zhì)蛋白前體N-端保守的長度為20-35個(gè)氨基酸的信號(hào)序列,富含SerThr及堿性氨基酸)9antibiotic抗生素考過氯霉素(結(jié)合原核的50S亞基)鏈霉素(結(jié)合原核的30S亞基)利福平(原核RNA聚合酶的β亞基)作用10干擾素interferonIFN及其作用機(jī)制P319第十三章基因表達(dá)調(diào)控1基因表達(dá)geneexpression時(shí)序調(diào)節(jié)temporalregulation生命體在生長、發(fā)育等各個(gè)階段中,按照一定的時(shí)間順序?qū)ο嚓P(guān)基因進(jìn)行調(diào)控表達(dá)的模式。2可誘導(dǎo)基因induciblegene、可阻遏基因repressiblegene、誘導(dǎo)induction、阻遏repression、阻遏蛋白repressor、3協(xié)調(diào)調(diào)節(jié)coordinateregulation4DNA重排rearrngement指為適應(yīng)特定需要,將一個(gè)基因從遠(yuǎn)離啟動(dòng)子的地方移到距啟動(dòng)子很近的地方從而啟動(dòng)轉(zhuǎn)錄的方式。DNAamplificationDNA擴(kuò)增:為一特異蛋白質(zhì)編碼的基因的拷貝數(shù)選擇性地增加而其他基因并未按比例增加的過程。分解代謝物基因激活蛋白catabolitegeneactivatorproteinCAP:或稱cyclicAMPreceprorproteinCRP環(huán)腺苷酸受體蛋白,能與cAMP結(jié)合而活化,作用于啟動(dòng)子區(qū)域,促進(jìn)轉(zhuǎn)錄,也含有螺旋-轉(zhuǎn)角-螺旋(HTH)的基序。5操縱子operon、乳糖操縱子lacoperon乳糖操縱子的兩個(gè)調(diào)節(jié)機(jī)制P3291阻遏蛋白負(fù)性調(diào)節(jié):a沒有乳糖存在時(shí),調(diào)節(jié)基因(阻遏基因)表達(dá)阻遏蛋白;阻遏蛋白結(jié)合到操縱基因上,封閉結(jié)構(gòu)基因,不表達(dá)酶。b存在乳糖時(shí),乳糖被β-半乳糖酶催化為半乳糖,半乳糖與阻遏蛋白結(jié)合使得阻遏蛋白不能與操縱基因結(jié)合,結(jié)構(gòu)基因被活化,相關(guān)酶表達(dá)。乳糖操縱子的阻遏蛋白含有螺旋-轉(zhuǎn)角-螺旋(HTH)的基序。2CAP的正性調(diào)節(jié):a當(dāng)有葡萄糖存在時(shí),葡萄糖被組成酶(constitutiveenzyme)降解的產(chǎn)物抑制了腺苷酸環(huán)化酶活性,活化磷酸二酯酶,使cAMP濃度下降,CAP含量隨之下降。乳糖操縱子轉(zhuǎn)錄受抑制;b反之,無葡萄糖時(shí),CAP含量促進(jìn)乳糖操縱子轉(zhuǎn)錄。3協(xié)同調(diào)節(jié):當(dāng)阻遏蛋白封閉轉(zhuǎn)錄時(shí),CAP對(duì)該系統(tǒng)不能發(fā)揮作用。若無CAP存在,即使沒有阻遏蛋白與操縱子序列結(jié)合,操縱子仍無轉(zhuǎn)錄活性Crabtreeeffect克勒勃屈利效應(yīng),又稱葡萄糖效應(yīng):單純?nèi)樘谴嬖跁r(shí),細(xì)菌利用乳糖作碳源;若有葡萄糖或葡萄糖/乳糖共同存在時(shí),細(xì)菌首先利用葡萄糖而不利用乳糖的現(xiàn)象稱為葡萄糖現(xiàn)象。6色氨酸操縱子調(diào)節(jié),衰減attenuation機(jī)制1阻遏物-操縱基因調(diào)節(jié):trp操縱子轉(zhuǎn)錄起始的調(diào)控是通過阻遏蛋白實(shí)現(xiàn)的。調(diào)節(jié)基因產(chǎn)生阻遏蛋白結(jié)合于trp操縱基因特異序列,阻止轉(zhuǎn)錄起始。但阻遏蛋白的DNA結(jié)合活性受Trp調(diào)控,Trp起著一個(gè)效應(yīng)分子的作用。a在有高濃度Trp存在時(shí),阻遏蛋白-色氨酸復(fù)合物形成一個(gè)同源二聚體,并且與色氨酸操縱子緊密結(jié)合,因此可以阻止轉(zhuǎn)錄。阻遏蛋白-色氨酸復(fù)合物與基因特異位點(diǎn)結(jié)合的能力很強(qiáng),因此細(xì)胞內(nèi)阻遏蛋白數(shù)量僅有20~30分子已可充分發(fā)揮作用。b當(dāng)Trp水平低時(shí),阻遏蛋白以一種非活性形式存在,不能結(jié)合DNA。在這樣的條件下,trp操縱子被RNA聚合酶轉(zhuǎn)錄,同時(shí)Trp生物合成途徑被激活。2弱化作用(attenuation)trp操縱子轉(zhuǎn)錄終止的調(diào)控是通過弱化作用實(shí)現(xiàn)的。在色氨酸操縱子的前導(dǎo)區(qū)編碼的mRNA前導(dǎo)序列(leadersequence)有4個(gè)區(qū),且有相鄰的兩個(gè)色氨酸密碼子。a當(dāng)Trp濃度很低時(shí),負(fù)載有Trp的Trp-tRNATrp也就少,這樣翻譯通過兩個(gè)相鄰色氨酸密碼子的速度就會(huì)很慢,核糖體停留在mRNA前導(dǎo)序列1區(qū),轉(zhuǎn)錄得以完成;b高濃度的Trp使負(fù)載有Trp的Trp-tRNATrp增加,翻譯通過兩個(gè)相鄰色氨酸密碼子的速度就會(huì)很快,核糖體到達(dá)在mRNA前導(dǎo)序列2區(qū),使3-4區(qū)自我配對(duì)形成莖環(huán)結(jié)構(gòu),轉(zhuǎn)錄終止。形成莖環(huán)結(jié)構(gòu)的3-4區(qū)即衰減子(attenuator)序列。衰減子attenuator指原核生物操縱子上游中能顯著減弱甚至終止轉(zhuǎn)錄作用的一段核苷酸序列,該區(qū)域能形成不同的二級(jí)結(jié)構(gòu),利用原核微生物轉(zhuǎn)錄與翻譯的偶聯(lián)機(jī)制對(duì)轉(zhuǎn)錄進(jìn)行調(diào)節(jié)。7真核基因組結(jié)構(gòu)特點(diǎn)P332(2010)單順反子monocistron、反向重復(fù)序列invertrepeat、衛(wèi)星DNAsatelliteDNA、8轉(zhuǎn)錄激活狀態(tài)染色質(zhì)的變化(至少5次)活性染色質(zhì)activechromatin、CpG島、基因組印記genomicimprinting印記控制區(qū)imprintingcontrolregionICR、組蛋白修飾histonemodification其中DNA堿基的甲基化修飾變化考過簡答,組蛋白變化為2013最后的論述題9增強(qiáng)子enhancer沉默子silencer鋅指zincfingerP33810運(yùn)鐵蛋白受體tansferrinreceptorTfR、鐵反應(yīng)元件ironresponseelementIRE、ALA合酶P340-34111小分子RNA對(duì)基因表達(dá)的調(diào)節(jié)(考研2010論述題)P341-343尤其是P343的比較圖第十四章基因重組與基因工程1整合integration、化學(xué)裂解法與雙脫氧測序法2基因重組包括同源重組homologousrecombination、特異位點(diǎn)重組sitespecificrecombination、轉(zhuǎn)座重組transpositionalrecombination以及三個(gè)概念3Holliday模型的關(guān)鍵四步P346(問答)4細(xì)菌基因轉(zhuǎn)移與重組的四種方式:接合、轉(zhuǎn)化、轉(zhuǎn)導(dǎo)、細(xì)胞融合P347(問答及客觀題,其中轉(zhuǎn)化考頻極高)5P350頁免疫球蛋白的基因重排(考博真題出現(xiàn)過兩次論述題)只做了解6關(guān)于轉(zhuǎn)座轉(zhuǎn)座子transposon、逆轉(zhuǎn)座子(retrotransponsons):在基因組內(nèi)存在著通過DNA轉(zhuǎn)錄為RNA后,再經(jīng)逆轉(zhuǎn)錄成為cDNA并插入到基因組的新位點(diǎn)上的因子,被稱為逆轉(zhuǎn)座子,逆轉(zhuǎn)座作用的關(guān)鍵酶為逆轉(zhuǎn)錄酶和整合酶。自身編碼逆轉(zhuǎn)錄酶和/或整合酶的非傳染性轉(zhuǎn)座因子稱為逆轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子7P352DNA克隆標(biāo)題下的三段話包含若干名詞解釋DNAclone/clone、復(fù)制子replicon、嵌合DNADNAchimeras、重組DNArecombinantDNA、基因工程geneticengineering、重組DNA技術(shù)recombinantDNAtechnology、轉(zhuǎn)染(transfection)指真核細(xì)胞由于外源DNA摻入而獲得新的遺傳標(biāo)志的過程。常規(guī)轉(zhuǎn)染技術(shù)可分為瞬時(shí)轉(zhuǎn)染和穩(wěn)定轉(zhuǎn)染(永久轉(zhuǎn)染)兩大類8限制-修飾體系restriction-modificationsystem
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