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文檔簡介
第三章
酶(enzyme)主要介紹酶的化學(xué)本質(zhì)、結(jié)構(gòu)和特性;酶的作用動(dòng)力學(xué);酶的作用機(jī)理;酶的應(yīng)用;還介紹了別構(gòu)酶、共價(jià)調(diào)節(jié)酶、同工酶等的概念、性質(zhì)、生物學(xué)意義。
主講老師:華南師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院陳文利★Studyhistory, ★Generalfeatures, ★Classification, ★Chemicalnature,★Kinetics ★Mechanism, ★Regulation酶通論酶的發(fā)現(xiàn)和提出:1897年,Buchner兄弟用不含細(xì)胞的酵母汁成功實(shí)現(xiàn)了發(fā)酵。提出了發(fā)酵與活細(xì)胞無關(guān),而與細(xì)胞液中的酶有關(guān)。1903年,Henri提出了酶與底物作用的中間復(fù)合物學(xué)說。1913年,Michaelis和Menten提出了酶促動(dòng)力學(xué)原理—米氏學(xué)說。1925年,Briggs和Handane對(duì)米氏方程做了修正,提出了穩(wěn)態(tài)學(xué)說。1926年,Sumner從刀豆種子中分離、純化得到了脲酶結(jié)晶,首次證明酶是具有催化活性的蛋白質(zhì)。1930年Northrop分離得到胃蛋白酶、胰蛋白酶和胰凝乳蛋白酶結(jié)晶并證實(shí)其均為蛋白質(zhì),酶的蛋白質(zhì)本質(zhì)確立。
TheNobelPrizeinChemistry1907"forhisbiochemicalresearchesandhisdiscoveryofcell-freefermentation"
Eduard
Buchner
GermanyLandwirtschaftliche
Hochschule(AgriculturalCollege)Berlin,Germanyb.1860
d.1917Ureasecrystals(X728)
Sumner,J.B.(1926)“Theisolationandcrystallizationoftheenzymeurease”J.Biol.Chem.69:435-441.
Pepsincrystals(X90)Northrop,1930)Northrop,J.H.(1930)“Crystallinpepsin,1:Isolationandtestsofpurity”J.Gen.Physiol.
13:739-766.1969年,Merrifield等人工合成了具有酶活性的胰RNase。1982年,Cech和Altman對(duì)四膜蟲的研究中發(fā)現(xiàn)RNA具有催化作用,從而發(fā)現(xiàn)核酶
(ribozyme),打破了以往酶是蛋白質(zhì)的傳統(tǒng)觀念。1986年Schultz和Lerner等人研制成功抗體酶(abzyme)。Boyer和Walker闡明了ATP合酶的合成與分解ATP的分子機(jī)制。近20年來,不少酶的作用機(jī)制被闡明,隨著基因工程技術(shù)的廣泛應(yīng)用,使得酶的結(jié)構(gòu)和功能的研究進(jìn)入一個(gè)新的階段。現(xiàn)在已鑒定出4000多種酶,數(shù)百種酶已經(jīng)被結(jié)晶。近幾十年來,不斷有新理論和新概念出現(xiàn)。在分子水平上揭示酶和生命活動(dòng)的關(guān)系,闡明酶在細(xì)胞代謝調(diào)節(jié)和分化中的作用,酶合成的遺傳機(jī)制,酶的催化機(jī)制等。同時(shí),酶的應(yīng)用——酶工程也得到快速發(fā)展。第一節(jié)通論一、酶是生物催化劑酶的定義:P110酶是由活細(xì)胞產(chǎn)生的,能在體內(nèi)或體外起同樣催化作用的一類具有活性中心和特殊構(gòu)象的生物大分子,包括蛋白質(zhì)和核酸。酶的化學(xué)本質(zhì)
1.大多數(shù)酶是蛋白質(zhì)(Mostenzymesareproteins)1926年美國Sumner脲酶的結(jié)晶,并指出酶是蛋白質(zhì)1930年Northrop等得到了胃蛋白酶、胰蛋白酶和胰凝乳蛋白酶的結(jié)晶,并進(jìn)一步證明了酶是蛋白質(zhì)。J.B.SumnerJ.H.Northrop
TheNobelPrizeinChemistry1946“forhisdiscoverythatenzymescanbecrystallized""fortheirpreparationofenzymesandvirusproteinsinapureform"
JamesBatchellerSumner
JohnHowardNorthrop
WendellMeredithStanley
1/2oftheprize1/4oftheprize1/4oftheprizeCornellUniversity
Ithaca,NY,USARockefellerInstituteforMedicalResearch
Princeton,NJ,USARockefellerInstituteforMedicalResearch
Princeton,NJ,USA1887-19551891-19871904-1971
20世紀(jì)80年代發(fā)現(xiàn)某些RNA有催化活性,還有一些抗體也有催化活性,甚至有些DNA也有催化活性,使酶是蛋白質(zhì)的傳統(tǒng)概念受到很大沖擊。Whatisthedifferencebetweenanenzymeandaprotein?ProteinAllenzymesareproteinsexceptsomeRNAsandnotall
proteinsare
enzymesRNAEnzymesRibozymesItwasassumedthatallenzymesareproteinsuntil1982whenThomasCechandSydneyAltmandiscoveredcatalyticRNAs(Nobel,1989inChemistry);CatalyticRNA,or,ribozymes,satisfyseveralenzymaticcriteria:substratespecificity,enhancereactionrate,andemergefromreactionunchanged;Severalknownribozymes:RNaseP:catalyzescleavageofprecursortRNAmoleculesintomaturetRNAs;GroupI,IIintrons:catalyzetheirownsplicing(cleavingandligating);Ribosome:catalyzespeptidyltransferreactionSubstrates,products,andenzymesEnzymescatalyzetherateatwhichsubstratesareconvertedtoproductSubstratesEnzymeProduct二、酶催化的特征1.高效性2.易變性3.可調(diào)性4.專一性(特異性)
EnzymesarethemostremarkableandspecializedbiologicalcatalystsAnenzymecatalyzesachemicalreactionataspecificallystructuredactivesite,beingoftenapocket.
Enzymeshaveextraordinarycatalyticpower,oftenfargreaterthanthosenon-biologicalcatalysts.Enzymesoftenhaveahighdegreeofspecificityfortheirsubstrates.Enzymesareoftenregulatory.EnzymesusuallyworkunderverymildconditionsoftemperatureandpH.Thesubstanceactedonbyanenzymeiscalledasubstrate,whichbindstotheactivesiteofanenzymeinacomplementarymanner.
降低反應(yīng)所需的活化能Enzymescatalyzereactionsbyloweringtheiractivationenergies
Enzymesstabilizethetransitionstatesofreactions..SubstratesProductsDGFreeEnergy(DG)ReactionCoordinaterxnUncatalyzedReactionEnzymeCatalyzedReaction例2H2O2→2H2O+O2
反應(yīng)活化能非催化反應(yīng)75.24kJ/mol鈀催化反應(yīng)48.9kJ/molH2O2酶催化8.36kJ/mol對(duì)酶作用專一性的幾個(gè)假說P72鎖鑰模式(lockandkeytheory)三點(diǎn)附著學(xué)說(threepointattachmenttheory)誘導(dǎo)契合學(xué)說(induced-fittheory)EmilFicher:(1894)The‘Lock&Key’hypothesis-explainssubstratespecificity-saysnothingaboutwhycatalysisoccursDanKoshland:(1958)‘InducedFit’hypothesis:-enzymesprefertobindtoadistortionofthesubstratethatresemblesthetransitionstate-bothenzymeandsubstratemustadjusttooneanother -inreality,enzymeisnot‘distorted’buthasevolvedtobindinacertainwayandsometimesundergoconformationalchangesSubstrate+EnzymeEScomplexEnzymeSubstrate+EScomplexLockandKey-EmilFischer(1890)InducedFit-DanielE.KoshlandJr.(1958)AnExample:InducedconformationalchangeinhexokinaseCatalyzesphosphorylationofglucosetoglucose6-phosphateduringglycolysissuchalargechangeinaprotein’sconformationisnotunusual
BUT:notallenzymesundergosuchlargechangesin conformation1、鎖鑰學(xué)說(lockandKeytheory)1894年Fischer提出2、三點(diǎn)附著學(xué)說3、誘導(dǎo)契合學(xué)說(induced-fittheory)1958年Koshland提出第二節(jié)
酶的分類和命名
1961年國際酶學(xué)委員會(huì)(enzymecommission)提出的酶的命名和分類方法。和分類Eachenzymeisassignedasystematicnameandafour-digitnumberThesystematicnameidentifiesthesubstratesandtypeofreactioncatalyzed.Thefour-digitnumberindicatesthefollowing:Class(1-6);Sub-classesbasedontypeofsubstrate;Sub-subclassesbasedoncofactortype;Auniquenumberforeachindividualenzymewithinasub-sub-class.
Eachenzymeisgivenasystematicnameandaunique4-digitidentificationnumberforidentificationLactatedehydrogenase(lactate:NAD+
oxidoreductase)ThenumberwasassignedbytheEnzymeCommision(EC)ofIUBMB(since1964).lactate+NAD+
pyruvate+NADH+H+
1-6Enzymeclassification
Enzymesaregroupedinto
six
classes
accordingtothetypeofreactionscatalyzedTransferelectrons(hydrideionsorHatoms);playamajorroleinenergymetabolism.i.e.,thetransferoffunctionalgroupstowater.e.g.,thetransferofaphosphorylgroupfromATPtomanydifferentacceptors.ThesearedirectbondbreakingreactionswithoutbeingattackedbyanotherreactantsuchasH2O.Inchemicalterms,theywouldbedescribedaseliminationandadditionreactions.LeadingtotheformationofC-C,C-S,C-O,C-Nbonds.LactatedehydrogenaseNMPkinaseChymotrypsinFumaraseTriosephosphateisomeraseAminoacyl-tRNA
synthetase三、酶的組成分類
酶的組成
1.單純蛋白質(zhì)酶類屬于單純蛋白質(zhì),主要是水解酶。2.結(jié)合蛋白質(zhì)酶類全酶=酶蛋白+輔助因子(輔酶、輔基或金屬離子)輔酶(coenzyme)輔基(prostheticgroup)第三節(jié)酶催化作用的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)一、酶分子結(jié)構(gòu)的特征1、酶的活性部位酶的活性中心activecenter(又叫活性部位activesite)
定義:在酶分子中,由少數(shù)幾個(gè)氨基酸殘基構(gòu)成的,直接與底物結(jié)合的并和酶的催化作用直接有關(guān)的區(qū)域。通?;钚灾行挠袃蓚€(gè)功能部位:結(jié)合部位催化部位與底物結(jié)合的部位叫結(jié)合部位(結(jié)合基團(tuán))bindingsite底物分子中的化學(xué)鍵在此處被打斷或形成新的化學(xué)鍵叫催化部位(催化基團(tuán))catalyticsite(二)酶活性中心的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)活性中心只占酶分子總體積的很小一部分,往往只占整個(gè)酶分子體積的1%-2%。
某些酶活性部位的AA殘基酶AA殘基數(shù)活性部位的AA殘基核糖核酸酶124
His12,His119,Lys41溶菌酶129Asp52,Glu35胰凝乳蛋白酶241His57,Asp102,Ser195胃蛋白酶348Asp32,Asp215木瓜蛋白酶212Cys25,His159羧肽酶A307Arg127,Glu270,Tyr248,Zn2+EachenzymehasatleastoneactivesiteHowdoenzymeswork?
Enzymesbindsubstratestotheiractivesiteandstabilizethetransitionstateofthereaction.Whatistheactivesite?
Theactivesiteofanenzymeistheplacewherealloftheactionoccurs.Itcontainsthefunctionalgroups(aminoacidsidechains)thatbindthesubstrate(s)andcatalyzeit’sconversiontoproduct(s).TheactivesiteoftheenzymecontainsfunctionalgroupsthatstabilizethetransitionstateofthereactionActivesite
ofchymotrypsinWhatdoestheactivesitedo?Theactivesitebindsthesubstratesandpositionsthemintheproperorientationforthereactiontooccur.Theactivesitecontainschemicalgroupsthatstabilizethetransitionstateofthereaction.Theactivesitedeterminesthespecificityoftheenzyme(i.e.itdetermineswhetheraparticularsubstrateisboundandwhetheraparticularproductismade).CharacteristicsofactivesitesTheactivesitetakesupasmallpartofthetotalvolumeoftheenzymeTheactivesiteis3-dimensionalandisgenerallyfoundinacreviceorcleftontheenzymeTheactivesitedisplayshighlyspecificsubstratebindingTheactivesiteisresponsibleforwhetherthereisorderedorrandombindingofsubstratesandreleaseofproducts溶菌酶(Lysozyme)2、必需基團(tuán)(essentialgroup)
凡是維持酶的活性不可少的基團(tuán)叫必需基團(tuán)。
活性中心內(nèi)的必需基團(tuán)
活性中心外的必需基團(tuán)(若它改變了,活性中心的構(gòu)象就會(huì)改變。)3、活性中心存在的證明方法P78二、酶原及酶原的激活P80酶原(zymogen):不具催化活性的酶的前體稱為zymogenRegulationofdigestiveenzymesActivationofchymotrypsinogenexemplifiesproteolyticactivation-Chymotrypsin(active)
p-Chymotrypsinogen(inactive)p-Chymotrypsin(inactive)SSSSSSSSSSSS胰蛋白酶原(trypsinogen)的激活胰凝乳蛋白酶原(chymotrypsinogen)的激活
底物:substrate
產(chǎn)物:product
A+B
C+DSubstrate(S)enzyme(E)product(P)第四節(jié)酶催化作用的機(jī)理一.酶依靠降低活化能加速化學(xué)反應(yīng)降低反應(yīng)所需的活化能二.一般酸-堿催化
三.共價(jià)催化
四.金屬離子催化五.酶執(zhí)行催化功能的幾個(gè)實(shí)例1.羧肽酶A
Glu270Arg145Tyr248酶單獨(dú)存在時(shí)
:Arg145Tyr248Glu270酶底物復(fù)合物:羧肽酶A(carboxypeptidaseA,CpA)
3、酸堿催化(acid-basecatalysis)
胰凝乳蛋白酶酸堿催化(acid-basecatalysis)胰凝乳蛋白酶(chymotrypsin)
Thedifferentsubstratespecificitiesoftheserineproteasesareduetodifferencesintheirspecificitypockets
P27-28HowdoenzymesstabilizethetransitionstateofareactionGeneralAcid-basecatalysisMetalcatalysisCovalentcatalysisSubstratestrainCatalysisbyapproximation.第五節(jié)酶促反應(yīng)的動(dòng)力學(xué)只有初速度才是酶的反應(yīng)速度,原因:
(1)底物隨反應(yīng)時(shí)間的延長減少;(2)
酶隨反應(yīng)時(shí)間的延長受速度、pH
的影響,酶部分變性;(3)
隨時(shí)間延長,產(chǎn)物增加,產(chǎn)物對(duì)酶的抑制作用;(4)產(chǎn)物增加,逆反應(yīng)速度增加。
因此,只有初速度才是酶的反應(yīng)速度。[S]>>[E] V∝[E]一、酶濃度的影響酶促反應(yīng)的速度和酶濃度成正比。P95
V
Vmax
0[S]
可以用一個(gè)方程來表示:V=Vmax[S]/(Km+[S])
是最基本的動(dòng)力學(xué)方程。二、底物濃度對(duì)反應(yīng)速度的影響1、單底物酶促反應(yīng)動(dòng)力學(xué)(1)米氏方程(Michaelis-Mentenequation)第一步:E+SES中間復(fù)合物學(xué)說:第二步:ES→E+PV∝[ES]
1913年Michaelis和Menten推導(dǎo)了米氏方程
Vmax[S]V=
Km+[S](2)米氏方程的推導(dǎo)(P96)a
Km的物理意義當(dāng)V=1/2Vmax時(shí)的底物濃度,為Km的物理意義。即[S]=KmKm單位:m(mol)/Lb
Km是酶的特征性常數(shù)
不同酶,Km是不一樣的。底物種類,pHopt,topt
要定下來。
(E)A+BC+D此酶有4個(gè)Km值。(3)米氏常數(shù)(Michaelis-constant)的意義
c在一定條件下,Km表示酶與底物的親和力
有些酶有很多底物,Km值最小的底物叫此酶的最適底物,也叫酶的天然底物。d已知Km,可以求出V/Vmax與底物濃度[S]的關(guān)系。測定Km的意義:(以上4點(diǎn))Km在實(shí)際工作中的應(yīng)用:P98UnderstandingKmKmisaconstantderivedfromrateconstantsKmis,undertrueMichaelis-Mentenconditions,anestimateofthedissociationconstantofEfromS,because atequilibrium,Reversiblereaction,dissociationconstantisSosmallKmmeanstightsubstratebinding;highKmmeansweaksubstratebinding.Kmequalstothesubstrateconcentrationatwhichv=1/2vmaxk1k-1UnderstandingVmaxThetheoreticalmaximalvelocity
VmaxisaconstantVmax
isthetheoreticalmaximalrateofthereaction-butitisNEVERachievedinrealityToreachVmaxwouldrequirethatALLenzymemoleculesaretightlyboundwithsubstrateVmaxisasymptoticallyapproachedassubstrateisincreased雙倒數(shù)作圖法,即Lineweaver-Burk法。1/V對(duì)1/S作圖(4)米氏常數(shù)的測定(P98)雙倒數(shù)作圖法(Lineweaver-Burk作圖法)2、雙底物酶促反應(yīng)動(dòng)力學(xué)雙底物雙產(chǎn)物反應(yīng)
A+B P+Q
雙底物雙產(chǎn)物的反應(yīng)按動(dòng)力學(xué)機(jī)制可分為兩大類:雙底物雙產(chǎn)物的反應(yīng)序列反應(yīng)(sequentialreactions)乒乓反應(yīng)(pingpongreactions)有序反應(yīng)(orderdreactions)隨機(jī)反應(yīng)(randomreactions)1.序列有序反應(yīng)2.序列隨機(jī)反應(yīng)3.乒乓反應(yīng)酶的最適溫度(optimumtemperature)
溫度影響的兩個(gè)方面:1.溫度升高,酶反應(yīng)速度增加在達(dá)到最適溫度之前提高溫度,可以增加酶促反應(yīng)的速度。三、溫度的影響2.溫度升高,酶蛋白變性而失活。在最適溫度以前,第1種影響為主。在最適溫度以后,第2種影響為主。大部分酶在600C以上變性,到700C-800C酶達(dá)到不可逆變性;少數(shù)酶能耐受較高的溫度,如細(xì)菌淀粉酶在950C下活力最高,又如牛胰核糖核酸酶加熱到1000C仍不失活。非特征性常數(shù),只在一定情況下才有意義。
1、
最適pH
當(dāng)酶反應(yīng)速度受pH影響,當(dāng)某個(gè)pH,酶表現(xiàn)最大活力,此pH就是pHopt。
pHopt不是酶的特征性常數(shù),受測定環(huán)境的影響很大。
2、pH影響的原因(1)
影響酶的構(gòu)象(過酸過堿引起酶構(gòu)象的變化,使酶失活)(2)
影響酶與底物的解離四、pH的影響1.酶反應(yīng)的最適pH(optimumpH)激活劑:凡是能提高酶活性的物質(zhì),都稱為激活劑。激活劑按分子的大小可以分為以下三類:(一)
無機(jī)離子(inorganic)
1.
金屬離子金屬離子對(duì)酶的作用有兩種:一是作為酶的輔助因子起作用;二是作為激活劑起作用。Mg2+Mn2+Zn2+ Cu2+K+
2.
陰離子
Cl-Br-較突出的是動(dòng)物唾液中的-淀粉酶受Cl-激活。3.氫離子五、激活劑(activator)的影響(二)
小分子有機(jī)物(與酶蛋白相比是小分子)
1.
某些還原劑如:還原型谷胱甘肽,半胱氨酸
2.
EDTA(乙二胺四乙酸)能除去酶中重金屬雜質(zhì),從而解除重金屬離子對(duì)酶的抑制作用。
(三)
大分子有機(jī)物
這類激活劑是指可對(duì)某些無活性的酶原起作用的酶。
(激活作用)無活性的酶原
有活性的酶抑制劑能使酶分子上的某些必需基團(tuán)(主要指酶活性中心上的一些基團(tuán))發(fā)生變化,因而引起酶活力下降,甚至喪失,致使酶反應(yīng)速度降低。凡使酶活力下降,但并不引起酶蛋白變性的作用稱為抑制作用(inhibition)。能引起抑制作用的物質(zhì)稱為酶的抑制劑(inhibitor)六、抑制劑對(duì)酶促反應(yīng)速度的影響特點(diǎn):①抑制劑與酶的結(jié)合是不可逆的;E+I(xiàn)EI②I與E的結(jié)合是一種共價(jià)結(jié)合;③不能用物理的方法(透析、超濾、凝膠過濾)去除掉這個(gè)抑制劑。
1、不可逆抑制作用(irreversibleinhibition)IrreversibleInhibitorCombineswithordestroysanessentialfunctionalgroupontheenzyme(e.g.formscovalentbonds)Inhibitenzymesirreversibly3differenttypes:GroupSpecificReagent:-inhibitordoesnotresemblesubstrateSubstrateAnalogue:-inhibitorresemblessubstrateSuicideInhibitors:-inhibitorresemblessubstrate,turns"dangerous"afterprocessedbyenzyme特點(diǎn):
①這類抑制劑與酶蛋白的結(jié)合是可逆的;
E+I(xiàn)EI②非共價(jià)結(jié)合;③可用物理方法除去。
根據(jù)抑制劑與底物的關(guān)系,可逆抑制作用分為三種類型:2、可逆抑制作用(reversibleinhibition)特點(diǎn):①抑制劑與底物結(jié)構(gòu)相似;②I與S競爭同一種酶的活性中心結(jié)合(非共價(jià));③抑制程序取決于[I]/[S]的比例。所以可以用增加底物濃度的方法來解除這種抑制。(1)競爭性抑制(competitiveinhibition)可逆抑制作用(reversibleinhibition)及其動(dòng)力學(xué)(1)競爭性抑制作用(competitiveinhibition)E+IEI
例:丙二酸對(duì)琥珀酸脫氫酶的抑制作用C、取方程的倒數(shù),進(jìn)行雙倒數(shù)作圖
特點(diǎn):
①I與S結(jié)構(gòu)不相似;②I與E在活性中心外的部位結(jié)合;③抑制取決于抑制劑的絕對(duì)濃度,不管底物濃度有多高,不能用增加底物的方法去除抑制。(2)
非競爭性抑制(noncompetitiveinhibition)(2)非競爭性抑制作用(noncompetitiveinhibition)E+S→ESESIE+I→EIESIC、取方程倒數(shù),進(jìn)行雙倒數(shù)作圖
I不能與E直接結(jié)合,I只能與結(jié)合了底物的酶結(jié)合;I反而增加了E與S的親和力,使E+SES朝ES方向進(jìn)行。E+SESE+PES+I(xiàn)ESI(3)
反競爭性抑制(uncompetitiveinhibition)動(dòng)力學(xué)方程的討論A、與米氏方程比較B、雙倒數(shù)作圖
Vmax
Km競爭性抑制
不變
增加非競爭性抑制
減小
不變反競爭性抑制
減小
減小KmdecreasesvmaxdecreasesSlopeunchangedUncompetitiveInhibitorsNoncompetitiveInhibitorsKmunchangedvmaxdecreasesCompetitiveInhibitorsKmincreasesvmaxunchangedSummaryofClassesofInhibitors
Competitiveinhibition-inhibitor(I)bindsonlytoE,nottoESNoncompetitiveinhibition-inhibitor(I)bindseithertoEand/ortoESUncompetitiveinhibition-inhibitor(I)bindsonlytoES,nottoE.Thisisahypotheticalcasethathasneverbeendocumentedforarealenzyme,butwhichmakesauseful
contrasttocompetitiveinhibition.Mixedinhibition-whenthedissociationconstantsof(I)toEandESaredifferent.Theinhibitionismixed.七、過渡態(tài)類似物是酶的一種潛在抑制劑第六節(jié)重要酶類及其活性調(diào)節(jié)一、多酶體系(multibleenzyme)限速步驟(committedstep)順序反饋抑制(sequentialfeedbackinhibition)P104PhysiologyofallostericenzymesConsiderbiochemicalpathways:
-Homotropicregulation,substrateactivation
activationE1 E2 E3 E4 E5
A B C D E F
-Heterotropicregulation,endproductinhibition
E1 E2 E3 E4 E5A B C D E Finhibition
D E FA B C G H IFinhibitsC->DpartiallyinhibitsA->B二、調(diào)節(jié)酶1.別(變)構(gòu)酶(allostericenzyme)Enzymeactivityisregulatedbyfourdifferentmechanisms*(1)
Allostericcontrol(2)Covalentmodification(3)
Proteolyticactivation(4)Stimulationorinhibitionbycontrolproteins*changesinenzymelevelsduetoregulationofproteinsynthesisordegradationareadditional,long-termwaystoregulateenzymeactivity負(fù)協(xié)同效應(yīng)別構(gòu)酶與米氏酶動(dòng)力學(xué)比較1963年,Monod等首次提出別構(gòu)酶的概念。Monod認(rèn)為別構(gòu)酶應(yīng)具備以下特征:一般含有多個(gè)亞基;別構(gòu)劑(allostericeffectors)能夠結(jié)合于別構(gòu)酶,并引起它的催化活性發(fā)生變化,這一點(diǎn)可能反映了別構(gòu)酶四級(jí)結(jié)構(gòu)的改變?,F(xiàn)已證明,上述觀點(diǎn)是正確的。1.大都是寡聚酶,含有兩個(gè)或兩個(gè)以上的亞基。具四級(jí)結(jié)構(gòu)。2.酶分子上含兩個(gè)中心或部位:活性中心(活性部位)和別構(gòu)中心(別構(gòu)部位)3.具有別構(gòu)效應(yīng)P484.很多別構(gòu)酶的動(dòng)力學(xué)曲線呈S形曲線別構(gòu)酶的特點(diǎn)Allostericenzymes:somedefinitions1.Allosteric=“othersite”otherthanactivesite2.Regulatorymoleculescalled,effectors,modulators, regulatorymolecules3.Homotropicregulation:regulationbysubstrateat
activesite4.Heterotropicregulation:regulationbymolecule
NOTsubstrate(endproducts),atallosteric
site5.Fewenzymesareallosteric6.AllostericenzymesDONOTexhibitM-Mkinetics正協(xié)同效應(yīng)別構(gòu)酶與米氏酶動(dòng)力學(xué)比較別構(gòu)酶舉例
大腸桿菌天冬氨酸轉(zhuǎn)氨甲酰酶(E-Coliaspartate
transcarbamylase,ATCase)
(1)ATCase催化的化學(xué)反應(yīng)和ATCase的動(dòng)力學(xué)曲線(2)ATCase活性調(diào)節(jié)的機(jī)理有催化活性的構(gòu)象無催化活性的構(gòu)象為了解釋別構(gòu)酶的S型動(dòng)力學(xué)曲線,提出了模型:1)序變模型2)齊變模型別構(gòu)酶調(diào)節(jié)酶活性的機(jī)理
1、對(duì)稱或協(xié)同模型(symmetryorconcertedmodel,也稱齊變模型、MWC模型)1965年由Monod、Wyman和Changeux提出。該模型的要點(diǎn):2、序變模型(sequentialmodel,也稱KNF模型)1966年由Koshland、Nemethy和Filmer提出。該模型的要點(diǎn):2、一些酶的活性受可逆的共價(jià)修飾調(diào)節(jié)可逆的共價(jià)修飾的方式常見的是磷酸化/脫磷酸化,腺苷?;?脫腺苷酰化,尿苷酰化/脫尿苷?;?甲基化/脫甲基化等類型。
共價(jià)調(diào)節(jié)酶最典型的例子是動(dòng)物組織的糖原磷酸化酶1.糖原磷酸化酶催化的反應(yīng)催化糖原的磷酸解,生成G-1-P。糖原G-1-P+糖原+H3PO4糖原磷酸化酶(n-1個(gè)Glc基)(n個(gè)Glc基)2、結(jié)構(gòu)特征
CovalentmodificationregulatesthecatalyticactivityofsomeenzymesPhosphorylation-anexampleofregulationbyreversiblecovalentmodificationoftheenzymeProteinkinasescatalyzethephosphorylationofproteinsProteinphosphatasesremovephosphategroupsfromphosphorylatedproteins概念:催化相同的化學(xué)反應(yīng),酶蛋白的分子結(jié)構(gòu)和理化性質(zhì)不完全相同的一組酶。同工酶是一種酶的不同分子形式。同工酶之間相同點(diǎn):
催化的反應(yīng)相同。在酶的分類上相同。三、同工酶(Isozymes)
Whatisanisozyme?
(1)
Isozymesarephysicallydistinctformsofthesameenzyme.
(2)
Isozymesmaydifferfromeachotherbydifferencesintheiraminoacidsequencesorbythepresenceofdifferentposttranslationalmodificationsineachisozyme.
(3)
Therelativeabundanceofdifferentisozymesvariesfordifferenttissues.Theabilitytocontrolwhichisozymesareexpressedinaparticularcellallowseachcelltoadjusttheenzymeactivitybasedonthespecificconditionsthatexistinthecell.LactateDehydrogenaseiscomposedoffourmonomersEachmonomercanbeeitherheartormuscletypeFivedifferentisozymesoflactatedehydrogenaseexist:H4,H3M,H2M2,HM3,andM4RealLife-TissueSpecificityofLactateDehydrogenaseAllofthelactatedehydrogenase
isozymescatalyzetheinterconversionbetweenlactateandpyruvateEachisozymeoflactatedehydrogenasecanbeseparatedbychromatographyDifferenttissueshavedifferentlevelsofeachofthelactatedehydrogenase
isozymes
Duringmyocardialinfarction,endothelialcellsrupture,releasingtheircontentsintothebloodstream.Thisincreasestheserumlevelsforlactatedehydrogenase
isozymes1and2andcanbeusedasadiagnostictool.-+Foreachlane,thefivedifferentisozymesoflactatedehydrogenasearenumber1-5(withtheisozymecontainingallhearttypemonomersbeing1andallmuscletypemonomersbeing5).Thelanelabeled“HEART”isfromtheserumofapatientwithamyocardialinfarction(heartattack),thelanelabeled“NORMAL”isnormalserum,andthelanelabeled“LIVER”isfromapatientwithliverdisease.乳酸脫氫酶(lactatedehydrogenase,LDH)
1、組成和電泳行為
HHHH(LDH1)
HHHM(LDH2)
HHMM(LDH3)
HMMM(LDH4)
MMMM(LDH5)2、功能催化的反應(yīng)乳酸丙酮酸LDH5骨骼肌:乳酸丙酮酸心肌:LDH1同工酶之間相異點(diǎn):P110
(1)分子結(jié)構(gòu)不同(A.A組成、排列序列(一級(jí)結(jié)構(gòu))、亞基的種類、組合不一樣)(2)電泳行為不同(3)催化特性不一樣(Km,toopt,pHopt)(4)分布部位不一樣(5)生理功能不同第七節(jié)酶的分離純化和活力測定一、酶分離純化的一般原則與蛋白質(zhì)的分離純化相似二、酶的活力與測定測定酶活力時(shí)應(yīng)注意幾點(diǎn)(1)應(yīng)測反應(yīng)初速度(initialvelocityorinitialspeed)(2)酶的反應(yīng)速度一般用單位時(shí)間內(nèi)產(chǎn)物的增加量來表示。(3)測酶活力時(shí)應(yīng)使反應(yīng)溫度、pH、離子強(qiáng)度和底物濃度等因素保持恒定。(4)測定酶反應(yīng)速度時(shí),應(yīng)使[S]>>[E]。產(chǎn)物濃度[P](t)1、酶活力酶活力(enzymeactivity)
:
酶催化一定化學(xué)反應(yīng)的能力。注意:確定酶反應(yīng)的時(shí)間,就靠進(jìn)程曲線來定,要在直線階段以內(nèi)的時(shí)間,且要看產(chǎn)物生成測定的靈敏度。2.酶的活力單位:來表示酶活力的大小。(1)國際單位(IU)InternationalUnit
一個(gè)國際單位表示為在250C,pHopt,[S]opt下,一分鐘催化1mol/L底物轉(zhuǎn)變?yōu)楫a(chǎn)物所需的酶量。(2)卡特爾(Katal)
縮寫為Kat,表示為在250C,pHopt,[S]opt下,一秒鐘催化1mol/L底物轉(zhuǎn)變?yōu)楫a(chǎn)物所需的酶量。1Kat=6×107IU可以以納Kat、微Kat來進(jìn)行換算。(3)習(xí)用單位
分母總是時(shí)間(1秒、1分鐘、1小時(shí))產(chǎn)物的生成量(重量單位―-g、mg、g)
(摩爾或摩爾的倍數(shù))習(xí)慣上沿用的單位如:乳酸+NAD+
丙酮酸+NADH+H+
乳酸脫氫酶乳酸脫氫
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