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文檔簡介
4.5細(xì)菌的遺傳分析和基因定位細(xì)菌作為遺傳研究對(duì)象的特點(diǎn)結(jié)構(gòu)簡單:屬于原核生物,無明顯細(xì)胞核,染色體裸露,不與組蛋白結(jié)合,不進(jìn)行減數(shù)分裂。世代周期短:20分鐘一代容易獲得各種突變型①合成代謝缺陷型(營養(yǎng)缺陷型)②分解代謝缺陷型③抗性突變型易培養(yǎng),可長期保藏1細(xì)菌之間遺傳物質(zhì)的轉(zhuǎn)移方式轉(zhuǎn)化:細(xì)胞從周圍介質(zhì)中吸收裸露的DNA。接合:DNA從供體菌到受體菌直接轉(zhuǎn)移。轉(zhuǎn)導(dǎo):由噬菌體所介導(dǎo)的DNA從供體菌到受體菌的轉(zhuǎn)移。24.5.1
細(xì)菌的轉(zhuǎn)化和基因定位轉(zhuǎn)化的類型
①自然轉(zhuǎn)化(naturaltransformation)細(xì)菌能夠自然地吸收DNA,如枯草桿菌的轉(zhuǎn)化。②工程轉(zhuǎn)化(engineeredtransformation)通過某種處理使細(xì)菌能夠攝入外源DNA,如大腸桿菌的轉(zhuǎn)化。轉(zhuǎn)化效率:約1%轉(zhuǎn)化片段的長度:20kb3細(xì)菌轉(zhuǎn)化過程示意圖4轉(zhuǎn)化在基因定位中的應(yīng)用判斷兩個(gè)基因的位置關(guān)系①觀察DNA濃度降低時(shí)AB基因共轉(zhuǎn)化頻率的下降和A、B各自轉(zhuǎn)化頻率下降的程度:程度相同表明
;共轉(zhuǎn)化頻率下降的程度遠(yuǎn)大于各自轉(zhuǎn)化頻率下降的程度,表明
。②觀察轉(zhuǎn)化頻率:
AB共轉(zhuǎn)化頻率與A、B各自轉(zhuǎn)化的頻率相近,表明
;相差很遠(yuǎn),表明
?;蜃鲌D:判斷基因間的距離
連鎖不連鎖連鎖不連鎖5計(jì)算重組值6遺傳作圖74.5.2細(xì)菌的接合與基因定位一、接合現(xiàn)象的發(fā)現(xiàn)1946年,萊德伯格(Lederberg)和塔特姆(Tatum)A菌株:met-bio-thi+leu+thr+(thi:硫胺素B1)B菌株:met+bio+thi-leu-thr-原養(yǎng)型:met+bio+thi+leu+thr+8
A菌株:met-bio-thi+leu+thr+(thi:硫胺素B1)B菌株:met+bio+thi-leu-thr-
AA+BB
基本培養(yǎng)基
原養(yǎng)型:met+bio
+
thi+leu+
thr+
出現(xiàn)頻率:10-79分析原因發(fā)生了回復(fù)突變?可能是轉(zhuǎn)化的結(jié)果。培養(yǎng)基中含有某些代謝產(chǎn)物,混合后這些產(chǎn)物互相補(bǔ)充了對(duì)方的不足而得以在基本培養(yǎng)基上生長。10結(jié)論:重組子的產(chǎn)生需要兩個(gè)菌株的直接接觸,二者之間發(fā)生了遺傳物質(zhì)的轉(zhuǎn)移。Davis(1950)U型管實(shí)驗(yàn)11結(jié)論:接合過程是一種單向轉(zhuǎn)移,從供體到受體。二、遺傳物質(zhì)的轉(zhuǎn)移方向1953年,海斯(W.Hayes)的雜交實(shí)驗(yàn)①菌株B(str處理)+菌株A
↓
無菌落
②菌株A(str處理)+菌株B
↓
有菌落
12三、F因子1.F因子:致育因子(性因子)攜帶F因子的菌株稱為供體菌或雄性,用F+表示。未攜帶F因子的菌株為受體菌或雌性,用F-表示。2.F因子的組成:①復(fù)制區(qū)
(含2個(gè)復(fù)制起點(diǎn)oriT,oriV);②致育基因區(qū);③配對(duì)區(qū)(含有4個(gè)IS)133.
F因子的轉(zhuǎn)移:
144.F+×F-的特點(diǎn):(1)F因子轉(zhuǎn)移的頻率高,1/10,使F-→F+。(2)染色體重組頻率低;10-6。(3)F+×F+不發(fā)生接合。因此,F(xiàn)+品系又稱為低頻重組品系(lowfrequencyrecombination,Lfr)。15四、高頻重組(Hfr)1.Hfr的形成及轉(zhuǎn)移過程由F因子和細(xì)菌染色體的單交換產(chǎn)生;轉(zhuǎn)移時(shí)帶有供體細(xì)菌的染色體。162.Hfr的特點(diǎn):
(1)染色體重組頻率高,比F+×F-高1000倍;(2)F因子轉(zhuǎn)移頻率低,F(xiàn)-→F+很少或沒有。3.Hfr和F+的聯(lián)系和區(qū)別
聯(lián)系:都是雄性菌,含有F質(zhì)粒區(qū)別:(1)前者高頻重組,后者低頻重組;(2)前者F因子轉(zhuǎn)移頻率低,后者F因子轉(zhuǎn)移頻率高;(3)前者F因子整合,后者F因子游離。17五、中斷雜交作圖根據(jù)供體基因進(jìn)入受體細(xì)胞的順序和時(shí)間繪制連鎖圖的技術(shù)。181961年
Jacob和Wollman
供體HfrH:strsthr+leu+azirtonr
lac+gal+受體F-:strrthr-leu-azistons
lac-gal-操作方法:37℃混合培養(yǎng)每隔一段時(shí)間取樣攪拌器中斷雜交涂布含鏈霉素的基本篩選培養(yǎng)基影印培養(yǎng)于含鏈霉素的幾種不同的培養(yǎng)基(選擇培養(yǎng)基)上觀察重組子鑒定各基因的轉(zhuǎn)移時(shí)間192021HfrH菌株各非選擇標(biāo)記基因進(jìn)入F-細(xì)菌的時(shí)間和頻率22
以基因出現(xiàn)的時(shí)間為標(biāo)準(zhǔn),作出E.coli的遺傳連鎖圖23六、環(huán)狀連鎖圖結(jié)論:不同Hfr菌株向F-細(xì)胞轉(zhuǎn)移的順序、起點(diǎn)和方向不同。表明大腸桿菌的染色體是環(huán)狀的。24252627七、細(xì)菌的重組作圖細(xì)菌重組的特點(diǎn):①基因重組發(fā)生在部分二倍體中;②只有偶數(shù)次交換才能產(chǎn)生平衡的重組子;③在選擇培養(yǎng)基上只出現(xiàn)一種重組子,而沒有相反的重組子。2829例如:根據(jù)中斷雜交試驗(yàn)已知lac和ade基因是緊密連鎖的,而且lac比ade先進(jìn)入受體。
Hfrlac+ade+strs×F-lae-ade-strr303132未重組的基因型是lac+ade+重組體的基因型是lac-ade+lac-ade間的距離:
lac-ade+(lac+ade+)+(lac-ade+)×100
lac-ade+
ade+=×10033八、F’因子與性導(dǎo)F’因子:從Hfr染色體上不精確分離產(chǎn)生的含有細(xì)菌基因組的新的F因子。性導(dǎo):利用F’因子將供體細(xì)胞的基因?qū)胧荏w形成部分二倍體的過程。內(nèi)基因子和外基因子344.5.3細(xì)菌的轉(zhuǎn)導(dǎo)與作圖一、噬菌體噬菌體結(jié)構(gòu)組成:頭部:核酸和蛋白質(zhì)外殼;頸部:中空的針狀結(jié)構(gòu)及外鞘;尾部:由基板、尾針和尾絲組成。35類型:①烈性噬菌體:使宿主發(fā)生裂解的噬菌體。②溫和噬菌體:除偶爾情況外,感染后不裂解細(xì)菌的噬菌體。溫和噬菌體的增殖周期:①溶菌周期:細(xì)菌受到感染后,噬菌體迅速增殖,菌體被裂解,噬菌體釋放。②溶源周期:噬菌體感染細(xì)菌后,其DNA整合到細(xì)菌染色體中,隨宿主染色體的復(fù)制而復(fù)制,細(xì)菌繼續(xù)增殖。363738原噬菌體:整合到宿主染色體中的噬菌體基因組。溶源性細(xì)菌:帶有原噬菌體的細(xì)菌。附加體:噬菌體既可整合在細(xì)菌染色體上,又可游離于細(xì)胞質(zhì)中。39Lederberg
和N.Zinder的雜交試驗(yàn)(1952年)沙門氏菌
LT22:
phe-trp-tyr-met+his+×
LT2:phe+trp+tyr+met-his-
二、細(xì)菌染色體的轉(zhuǎn)導(dǎo)作圖結(jié)果:10-5頻率出現(xiàn)野生型菌株基本培養(yǎng)基結(jié)論:重組通過一種過濾性因子實(shí)現(xiàn)。后來發(fā)現(xiàn)這種過濾因子是一種溫和噬菌體P22。
40轉(zhuǎn)導(dǎo)類型:①普遍性轉(zhuǎn)導(dǎo):通過噬菌體可以轉(zhuǎn)移細(xì)菌染色體上的任何基因,如P22,P1。②特異性轉(zhuǎn)導(dǎo):噬菌體只能轉(zhuǎn)移細(xì)菌染色體的特定部分,如噬菌體。411.普遍性轉(zhuǎn)導(dǎo)的過程422.普遍性轉(zhuǎn)導(dǎo)作圖①原理:如果兩個(gè)基因始終一起轉(zhuǎn)導(dǎo)或同時(shí)轉(zhuǎn)導(dǎo)頻率較高,那么表明這兩個(gè)基因是連鎖的;兩個(gè)基因同時(shí)轉(zhuǎn)導(dǎo)的現(xiàn)象稱為共轉(zhuǎn)導(dǎo)或并發(fā)轉(zhuǎn)導(dǎo)(contransduction);兩基因共轉(zhuǎn)導(dǎo)頻率愈高,表明兩個(gè)基因連鎖愈緊密;相反,共轉(zhuǎn)導(dǎo)頻率愈低,則表明兩個(gè)基因距離愈遠(yuǎn)。43判斷細(xì)菌基因間的位置關(guān)系
以普遍性轉(zhuǎn)導(dǎo)噬菌體P1為例,測(cè)定大腸桿菌的leu、thr、azi三個(gè)基因的順序。供體thr+leu+azir
→
受體thr-leu-azis,觀察其共轉(zhuǎn)導(dǎo)率。三個(gè)基因間的排列順序44②重組值的計(jì)算
a+b+供體→ab受體453.特異性轉(zhuǎn)導(dǎo)(局限性轉(zhuǎn)導(dǎo))(1)產(chǎn)生機(jī)制46(2)低頻轉(zhuǎn)導(dǎo)(low-frequencytransduction,LFT)由于不正常環(huán)化現(xiàn)象發(fā)生的頻率較低,在釋放出的106個(gè)噬菌體中只有1個(gè)gal+轉(zhuǎn)導(dǎo)噬菌體感染受體,因此轉(zhuǎn)導(dǎo)的頻率很低,稱為低頻轉(zhuǎn)導(dǎo)。λdgal→gal-受體①穩(wěn)定轉(zhuǎn)導(dǎo)子②不穩(wěn)定:整合—切離47(3)高頻轉(zhuǎn)導(dǎo)(highfrequencytrasduction,HFT)
由于產(chǎn)生λ/λdgal雙重溶源菌,使溶菌物中既含有大量的λdgal,又包含正常的λ噬菌體,正常的λ起了輔助缺陷型噬菌體成熟的作用,所以稱為輔助噬菌體,從而導(dǎo)致高頻轉(zhuǎn)導(dǎo)。
484.6噬菌體的重組作圖一、常用的表型特征①宿主范圍(hostrange)野生型h+:能感染E.coliB,不能感染E.coliB/2,噬菌斑半透明;突變型h:二者均可感染,噬菌斑透明。②嗜菌斑形態(tài)(plaquemorphology)野生型r+:形成小菌斑(1mm左右),邊緣模糊;突變型r:形成大菌斑(2mm左右),邊緣清晰。③溫度敏感49用h+r和hr+共感染E.coliB噬菌體染色體在宿主細(xì)胞內(nèi)復(fù)制噬菌體染色體間發(fā)生重組噬菌體組裝、細(xì)菌裂解、子噬菌體釋放噬菌體遺傳重組原
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