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動物生物化學知識點復習第1章緒論生物化學(Biochemistry):是生命的化學,是從分子水平上闡明生命有機體的化學規(guī)律以揭示生命現(xiàn)象本質(zhì)的科學。生物化學研究生命有機體的化學組成及其結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系,研究細胞中的物質(zhì)代謝和與之相伴隨的能量轉(zhuǎn)換過程,研究機體組織器官機能的生化機理。研究生物體內(nèi)各種化合物的結(jié)構(gòu)、化學性質(zhì)和功能(主要有糖類、脂類、蛋白質(zhì)、核酸、酶、維生素和激素)研究構(gòu)成生物體的基本物質(zhì)在生命活動中進行的化學變化,即新陳代謝及代謝過程中能量的轉(zhuǎn)換和調(diào)節(jié)靜態(tài)生物化學動態(tài)生物化學生物化學研究的內(nèi)容代謝與能量糖類化學脂類化學蛋白質(zhì)化學核酸化學酶學靜態(tài)生物化學動態(tài)生物化學糖類代謝脂類代謝蛋白質(zhì)代謝核酸代謝代謝調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)的降解氨基酸代謝蛋白質(zhì)的生物合成核酸的降解核苷酸代謝核酸的生物合成生物化學研究的內(nèi)容第2章生命的化學特征2.2生物體系中的非共價作用力存在于生物分子中主要的非共價相互作用力包括:氫鍵、離子鍵、范德華力、疏水力。2.4生物能量學
AdenosineTriphosphate,ATP:三磷酸腺苷第3章蛋白質(zhì)(protein)3.3蛋白質(zhì)的化學組成
主要的:CHO
N
S
50~55%6~8%20~23%15~18%
0~4%微量的:PFeCuZnMoISe3.3.1元素組成各元素的百分比對于大多數(shù)蛋白質(zhì)都較相似,大多數(shù)蛋白質(zhì)含氮量較恒定,平均16%,即1g氮相當于6.25g蛋白質(zhì)。6.25稱為蛋白質(zhì)系數(shù)。這可用于測定蛋白質(zhì)的含量——凱氏定氮法。樣品中蛋白質(zhì)含量=樣品中的含氮量6.25
×第3章蛋白質(zhì)(protein)3.3.2蛋白質(zhì)的基本結(jié)構(gòu)單元蛋白質(zhì)的基本結(jié)構(gòu)單元是氨基酸aminoacid多個氨基酸首尾連結(jié)(連接方式:肽鍵)形成長而不分支的多聚物——多肽鏈多肽鏈再折疊卷曲,形成蛋白質(zhì)第3章蛋白質(zhì)(protein)20種氨基酸分類氨基酸的主要理化性質(zhì)蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)、理化性質(zhì)定義——1969年,國際純化學與應用化學委員會(IUPAC)規(guī)定:蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu)指蛋白質(zhì)多肽連中AA的排列順序,包括二硫鍵的位置。
一、蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu)2.一級結(jié)構(gòu)的意義
蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu)是指蛋白質(zhì)肽鏈中氨基酸的排列順序。蛋白質(zhì)的化學結(jié)構(gòu)包括肽鏈數(shù)目、端基組成、氨基酸序列和二硫鍵的位置,又稱共價結(jié)構(gòu)。蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu)是最基本的結(jié)構(gòu),它決定著蛋白質(zhì)高級結(jié)構(gòu)。一級結(jié)構(gòu)中包含的共價鍵主要指肽鍵和二硫鍵。
蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu)是指蛋白質(zhì)多肽鏈主鏈原子局部的空間結(jié)構(gòu),但不包括與其他肽段的相互關(guān)系及側(cè)鏈構(gòu)象的內(nèi)容。(一)二級結(jié)構(gòu)的概念
二.蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu)
天然蛋白質(zhì)包括α-螺旋、
β-折疊、
β-轉(zhuǎn)角、
無規(guī)則卷曲等二級結(jié)構(gòu)。1.超二級結(jié)構(gòu)的定義指蛋白質(zhì)中相鄰的二級結(jié)構(gòu)單位(即單個-螺旋或-轉(zhuǎn)角)組合在一起,形成有規(guī)則的在空間上能辯認的二級結(jié)構(gòu)組合體。三.蛋白質(zhì)的超二級結(jié)構(gòu)和結(jié)構(gòu)域2.結(jié)構(gòu)域(domain)指多肽鏈在二級結(jié)構(gòu)或超二級結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上形成三級結(jié)構(gòu)的局部折疊區(qū),它是相對獨立的緊密球狀實體,稱為結(jié)構(gòu)域(domain)或功能域。四.蛋白質(zhì)的三級結(jié)構(gòu)
三級結(jié)構(gòu):指的是多肽鏈在二級結(jié)構(gòu)、超二級結(jié)構(gòu)和結(jié)構(gòu)域的基礎(chǔ)上,主鏈構(gòu)象和側(cè)鏈構(gòu)象相互作用,進一步盤曲折疊形成球狀分子結(jié)構(gòu)。(一)三級結(jié)構(gòu)的概念(三)維持三級結(jié)構(gòu)的作用力二硫鍵
——共價鍵疏水作用非共價鍵(次級鍵)氫鍵離子鍵范德華力穩(wěn)定蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)的作用力1離子鍵2氫鍵3疏水作用4范德華引力5二硫鍵五.蛋白質(zhì)的四級結(jié)構(gòu)(一)四級結(jié)構(gòu)的概念
四級結(jié)構(gòu):由兩條或兩條以上具有三級結(jié)構(gòu)的多肽鏈聚合而成、有特定三維結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì)構(gòu)象。每條多肽鏈又稱為亞基。血紅蛋白由四條多肽鏈形成,是一種寡聚蛋白質(zhì)。這四條鏈主要通過非共價鍵相互作用締合在一起。血紅蛋白分子上有四個氧的結(jié)合部位,因為每條鏈上含有一個血紅素輔基。(一)四級結(jié)構(gòu)的概念(1)有關(guān)四級結(jié)構(gòu)的一些概念亞基(單體),同多聚,雜多聚(2)四級締合的驅(qū)動力主要有范氏作用力,氫鍵,離子鍵和疏水作用力,其中疏水作用力最為重要,二硫鍵對于穩(wěn)定四級結(jié)構(gòu)有重要意義。(3)亞基相互作用的方式
亞基之間的分布有各種各樣的對稱關(guān)系。第4章核酸核酸的一級結(jié)構(gòu):一分子核苷酸的3’-位羥基與另一分子核苷酸的5’-位磷酸基通過脫水可形成3’,5’-磷酸二酯鍵,將兩分子核苷酸連接起來。核酸就是由多個核苷酸單位通過3’,5’-磷酸二酯鍵連接起來形成的不含側(cè)鏈的長鏈狀化合物。核酸是有方向性的長鏈狀化合物,多核苷酸鏈的兩端,一端稱為5’-端,另一端稱為3’-端。核酸是生物體內(nèi)的高分子化合物,包括脫氧核糖核酸(DNA)和核糖核酸(RNA)兩大類。一、元素組成 組成核酸的元素有C、H、O、N、P等,與蛋白質(zhì)比較,其組成上有兩個特點:一是核酸一般不含元素S,二是核酸中P元素的含量較多并且恒定,約占9-10%(通常取9.5%)。因此,核酸定量測定的經(jīng)典方法,是以測定P含量來代表核酸量。二、化學組成與基本單位 核酸經(jīng)水解可得到很多核苷酸,因此核苷酸是核酸的基本單位。核酸就是由很多單核苷酸聚合形成的多聚核苷酸。核苷酸可被水解產(chǎn)生核苷和磷酸,核苷還可再進一步水解,產(chǎn)生戊糖和含氮堿基。兩類核酸的分子組成RNADNA組分磷酸磷酸戊糖核糖脫氧核糖堿基嘌呤嘧啶AGUCT核苷酸的紫外吸收
堿基中含有共軛雙鍵,最大吸收峰
260nm左右核酸溶液紫外吸收以摩爾磷的吸光度表示,摩爾磷即相當于摩爾核苷酸。ε:摩爾吸光系數(shù)A:吸收值
W:每升溶液磷重量L:比色杯內(nèi)徑
由于共振作用,所有核苷酸的堿基都吸收紫外光,核酸在260nm附近有強大光吸收。第5章糖類
單糖是指最簡單的糖,即在溫和條件下不能再分解成更小的單體糖,如葡萄糖、果糖等。按碳原子的數(shù)目單糖又可分為三碳(丙)糖、四碳(丁)糖、五碳(戊)糖、六碳(已)糖、七碳(庚)糖等。
糖類的本質(zhì):多羥基醛、多羥基酮多羥基醛或多羥基酮的衍生物三糖甘油醛
二羥丙酮一、一些重要單糖的結(jié)構(gòu)五碳糖核糖核酮糖木糖六碳糖葡萄糖果糖一、一些重要單糖的結(jié)構(gòu)
麥芽糖α-葡萄糖(1→4)葡萄糖苷一、一些重要雙糖的結(jié)構(gòu)
蔗糖α-葡萄糖(1→2)β-果糖苷一、一些重要雙糖的結(jié)構(gòu)
乳
糖乳糖(半乳糖--1,4-葡萄糖)
一、一些重要雙糖的結(jié)構(gòu)
淀粉直鏈:
a-1,4-糖苷鍵分支點:
a-1,6-糖苷鍵一、一些重要多糖的結(jié)構(gòu)
淀粉直鏈:
a-1,4-糖苷鍵分支點:
a-1,6-糖苷鍵
纖維素b-1,4-糖苷鍵一、一些重要多糖的
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