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文檔簡介
遺傳與發(fā)育
綜合實驗
講義
第一部分:分子標(biāo)記技術(shù)系列實驗:實驗一RAPD標(biāo)記
實驗內(nèi)容:1DNA制備
2PCR擴增3
RAPD結(jié)果檢測統(tǒng)計分析
實驗二SSR標(biāo)記實驗內(nèi)容:1基因組DNA制備2微衛(wèi)星DNA的擴增
3
SSR標(biāo)記檢測分析
實驗三AFLP標(biāo)記實驗內(nèi)容:1酶切與連接
2選擇性擴增3銀染
4目的DNA的回收第二部分植物基因克隆技術(shù)系列實驗實驗一利用RT-PCR技術(shù)分離目標(biāo)cDNA片段實驗內(nèi)容:1cDNA合成
2PCR擴增3篩選目標(biāo)cDNA實驗二mRNA差別顯示技術(shù)實驗內(nèi)容:1
RNA制備
2逆轉(zhuǎn)錄3PCR差異顯示mRNA
4.測序膠分離PCR產(chǎn)物
5.銀染6.結(jié)果與討論第一部分
分子標(biāo)記技術(shù)系列實驗遺傳標(biāo)記在遺傳學(xué)的建立和發(fā)展中有著舉足輕重的作用,同時也是作物遺傳育種的重要工具。遺傳標(biāo)記主要分為:形態(tài)標(biāo)記、細(xì)胞學(xué)標(biāo)記、生化標(biāo)記分子標(biāo)記。分子標(biāo)記則是DNA水平遺傳變異的直接反映。DNA分子標(biāo)記具有能對各發(fā)育時期的個體、各個組織、器官甚至是細(xì)胞作檢測,既不受環(huán)境的影響,也不受基因表達(dá)與否的限制;數(shù)量豐富;遺傳穩(wěn)定;操作簡便等特點。廣泛應(yīng)用。
DNA分子標(biāo)記使得基因組作圖工作成了遺傳學(xué)上描述細(xì)胞中所含遺傳物質(zhì)的一個簡單概念,已形成了一門復(fù)雜的新興學(xué)科—基因組學(xué),其影響之大不僅波及了生物學(xué)、醫(yī)學(xué)和農(nóng)業(yè)的各個方面,而且對社會也產(chǎn)生了巨大的沖擊。
RAPD(RandomAmplifiedPolymorphicDNA,其發(fā)音與英文字母“rapid”相同)技術(shù)是由美國杜邦公司的Williams和加里福尼亞生物研究所的Welsh于1990年同時發(fā)展起來的。核心技術(shù)都是通過PCR進行DNA擴增。
第一單元:RAPD標(biāo)記RAPD的基本原理:通過DNA擴增片段的多態(tài)性來檢測DNA所發(fā)生的遺傳變異。RAPD以檢測DNA的多態(tài)性為目的,但它檢查的不是限制性內(nèi)切酶片段的多態(tài)性,而是PCR擴增DNA片段的多態(tài)性,這種多態(tài)性反映了不同個體模板DNA的核苷酸變化。多態(tài)性產(chǎn)生的原因:一,模板中引物結(jié)合區(qū)的核苷酸變化導(dǎo)致擴增DNA片段多態(tài)性。
二,擴增范圍內(nèi)的堿基插入、缺失、DNA重排等核苷酸變化導(dǎo)致擴增DNA片段多態(tài)性。
1)取50-200mg新鮮葉片,置液氮中研磨成粉。2)將凍粉分配到兩個1.5或2.0ml的離心管中,加入提取緩沖液900μl,輕輕攪動,。3)各加入100μlSDS,于65℃水浴中保溫10-15min(間隔晃動2-3次)。實驗操作:1.DNA制備4)各加入160μl5mol/LKAc,充分混勻,冰浴中放置30min。5)
4℃下12000rpm離心15min。6)上清轉(zhuǎn)入新離心管中,加入等體積的氯仿/異戊醇,輕輕顛倒離心管數(shù)次,放置片刻。7)4℃下8000rpm離心10min。8)上清轉(zhuǎn)入另一離心管中,加入2/3倍體積、-20℃預(yù)冷的異丙醇,混勻,放置30min,觀察DNA沉淀生成。9)
4℃下8000rpm離心10min,傾去上清液,將離心管倒置于吸水紙上,控干上清液。10)用80%的乙醇洗滌沉淀,吹干10-15min。11)加入100μlTE緩沖液充分溶解沉淀(若溶解不好,可置37℃水浴中保溫,促進溶解)。12)加入2μlRNase酶液,于37℃保溫1h。13)加入等體積的氯仿/異戊醇,混勻,放置幾分鐘后10000rpm5min,重復(fù)一次。14)轉(zhuǎn)移并量出上清液體積,置新離心管中,加入1/5倍體積的3mol/LNaAC,混勻,加入2.5倍體積的無水乙醇,輕緩混勻,室溫放置數(shù)分鐘。15)10000rpm離心5-10min,按9)操作,去盡上清液。16)用80%乙醇洗滌沉淀2-3次,吹干。加入10μlTE或dH2O溶解DNA,備用。1)在冰上做好針對不同DNA的100個PCR反應(yīng)混合液(加樣次序如下):水1475μl10×緩沖液200μl10×dNTPS200μl引物(20μmol/L)20μlTag聚合酶5
μl終體積1900μl(分裝100管)DNA(10-100ng)每管1μl2.
PCR擴增:2)將反應(yīng)混合液等量分裝到反應(yīng)管中。3)加入DNA或引物4)蓋上小管,放到PCR儀上。5)進行PCR反應(yīng),采用3步PCR程序:a)1個循環(huán)94℃4min36℃1min72℃1.5minb)45個循環(huán)94℃1min36℃1min72℃1.5minc)72℃5min4℃保存3.RAPD結(jié)果檢測:1)用1×TBE配2%瓊脂糖凝膠。2)PCR結(jié)束后,每個樣品中加入4μl凝膠上樣緩沖液。每個泳道上樣20μl,選擇合適的相對分子質(zhì)量Maker(如λHindIII/EcoRI)。3)
電泳。4)
觀察。第三單元:SSR標(biāo)記在人類及動植物的基因組中,包括內(nèi)含子、編碼區(qū)及染色體上的任一區(qū)域,均存在著由1~6個堿基對組成的簡單重復(fù)序列(simplesequencerepeats),簡稱SSR,又稱之為微衛(wèi)星DNA(microsatellteDNA).研究表明,在真核生物中大約每隔10~50kb就存在1個微衛(wèi)星,其主要以2個核苷酸為重復(fù)單位,也有一些微衛(wèi)星重復(fù)單位為3個核苷酸,極少數(shù)為4個核苷酸或更多.
SSR較早應(yīng)用于人類和哺乳動物的研究,既可以作探針進行Southern分析,又可以根據(jù)其序列設(shè)計引物進行PCR檢測,是構(gòu)建遺傳連鎖圖譜非常有效的分子標(biāo)記。
另外,SSR標(biāo)記在物種的起源和進化、遺傳多樣性、遺傳疾病的診斷、基因表達(dá)等遺傳和育種有關(guān)的研究領(lǐng)域中有著廣闊的應(yīng)用前景.SSR標(biāo)記因具有:①隨機分布在整個基因組中;②多態(tài)性高;③可通過PCR迅速測定,重復(fù)性好;④技術(shù)難度低,實驗成本較低;⑤引物序列公開發(fā)表,易在各實驗室中廣為傳播使用等特點。1.基因組DNA制備(略)。
注意:進行SSR分析時,要制備高分子量(HMW)的基因組DNA。SSR標(biāo)記雖然對DNA的質(zhì)量要求不是特別高,但要通過加入蛋白酶和RNA酶消化去除其中的蛋白質(zhì)和RNA,同時嚴(yán)格避免不同DNA之間的交叉污染.提取DNA后,測定濃度,并稀釋到10×10-9~20×10-9g/μL(10~20ng/μL),-20℃貯存?zhèn)溆谩?.微衛(wèi)星DNA的擴增:反應(yīng)總體積為25μL
包括:10mmol/LTrisHClpH8.3,30mmol/LMg2+25mmol/LdNTP
0.4~10uDNA聚合酶2μmol/LSSR引物約100ng基因組DNAPCR擴增程序:94℃5min94℃30s退火溫度30s30cycle72℃1min72℃5min3.SSR標(biāo)記電泳檢測:分3個主要環(huán)節(jié)。1)電泳:
采用6%聚丙烯酰胺凝膠電泳,設(shè)恒定功率,預(yù)電泳約30min后,加擴增樣品DNA4~6μL,電泳40~60min(視SSR分子量大小及差異帶的可辨度調(diào)整電泳時間)。
2)染色:SSRPCR擴增產(chǎn)物電泳之后用銀染法來檢測擴增產(chǎn)物,不僅可避免使用同位素,而且分辨率很高,甚至能檢測出1ng以下的DNA。3)統(tǒng)計分析:觀察帶的有(計為1)或無(計為0)及相對位置,然后根據(jù)不同的研究目的,應(yīng)用相關(guān)軟件進行分析。第三單元:AFLP標(biāo)記AFLP(擴增片斷長度多態(tài)性
amplifiedfragmentlengmentpolymorphism)是一種十分有效的DNA指紋圖譜技術(shù)。1993年由Zabean和Vos提出完善。
AFLP不僅是RFLP和PCR相結(jié)合的一種技術(shù),而且完善了RFLP和RAPD兩種方法的特長。
基本原理:對基因組DNA限制性酶切片段進行選擇性擴增,使用雙鏈人工接頭與該酶切片段相連接作為擴增反應(yīng)的模板,在DNA聚合酶作用下進行PCR反應(yīng)。該技術(shù)的獨特之處在于人工設(shè)計合成了限制性內(nèi)切酶的通用接頭以及可與接頭序列配對的專用引物,因此在不需要事先知道DNA系列信息的前提下,就可對酶切片段性傳統(tǒng)的PCR擴增。
在檢測AFLP時,先用內(nèi)切酶酶解基因組DNA,再將接頭連接到限制性片段的兩端,然后用專用引物擴增連接后的限制性片段的混合物,擴增結(jié)果通過電泳顯示。
一般采用兩個限制性內(nèi)切酶,一個酶為多切點,另一個酶的切點較少,因而AFLP反應(yīng)過程中產(chǎn)生的主要是兩個酶共同酶切的片段。此外,設(shè)計的專用引物除了核心堿基系列和限制性內(nèi)切酶識別序列外,引物的3’段引伸出1-13個數(shù)量不等的隨機核苷酸堿基,通過運用不同數(shù)量的這種堿基,可以調(diào)節(jié)AFLP產(chǎn)物的條帶特異性和數(shù)量,從而提供較多的基因組多態(tài)性信息。
不同樣品由于DNA序列不同,擴增出片段數(shù)及長度各不相同,經(jīng)變性的聚丙烯酰胺凝膠電泳就能區(qū)分出不同樣品的帶之間的差異,作為遺傳標(biāo)記構(gòu)建連鎖圖,或由于其獨到的檢測DNA多態(tài)性的方式,已成為基因組研究的一個非常有用的工具,與RFLP相比,它無需了解DNA模板序列,產(chǎn)生的多態(tài)性較多,與RAPD相比,它的可重復(fù)性得到極大提高。
AFLP技術(shù)的應(yīng)用:從AFLP技術(shù)建立以來,在植物研究領(lǐng)域已被應(yīng)用于許多方面,如:生物多樣子性分析、建立基因圖譜、得當(dāng)與農(nóng)業(yè)性狀對應(yīng)的標(biāo)志、用于基因克隆等。作為分子標(biāo)記技術(shù)應(yīng)有以下要求:穩(wěn)定性好、分辨率高、多態(tài)性強、效率高。另外,AFLP的標(biāo)志還可以進一步用于系譜分類,通過各樣品共有標(biāo)志的多少,可以分出它們之間的遠(yuǎn)近。
AFLP最大的特點是能產(chǎn)生大量的DNA標(biāo)志,建立基因圖譜,通過對它的分析,人們可以了接導(dǎo)基因結(jié)構(gòu)特點。到目前為止,已有幾十種植物得到了大量DNA標(biāo)志。包括:向日葵、棉花、油松、胡椒、小麥、大麥、馬鈴薯、水稻、蘭花、橡樹、番茄、甜菜等。
本實驗應(yīng)用AFLP技術(shù)對特異物種的基因組DNA進行分析,找出差異DNA條帶并作進一步分析。
實驗操作酶切與連接模板(50ng/ul)4ul接頭1ulEcolⅠ(4u/ul)1ulMseⅠ(4u/ul1ulT4DNAligase(3u/ul)1ul2×PCRbuffer2ulATP2ul(10mM)H2O8ul離心,混勻。程序:30℃,4小時。8℃過夜。在PCR儀中運行。預(yù)擴增模板2ul引物2×0.2uldNTP0.5ul10×PCRbuffer2.5ulTaq酶(2u/ul)0.5ulH2O19.1ul離心,混勻。程序:94℃2min94℃40s56℃30s30Cycle72℃80s72℃5min選擇性擴增
預(yù)擴增產(chǎn)物按1:20稀釋。稀釋后的樣品作為選擇性擴增的模板。模板2ul
引物(EcolⅠ和MseⅠ的引物各一種)2×0.2uldNTP1ul10×PCRbuffer5ulTaq酶(2u/ul)2ulH2O39.6ul
離心,混勻。程序:
94℃2min94℃30s65℃30s72℃80stouchdown每輪0.7℃,共12輪。94℃30s55℃30s
72℃80s擴增23輪。銀染樣品的準(zhǔn)備:選擇性擴增的產(chǎn)物與甲酰胺上樣緩沖液(98%甲酰胺,10mMEDTA,0.25%溴酚蘭)2:1混勻,95℃變性8分鐘,立即冰浴,待用。6%變性膠的制備、電泳1、6%Arc/Bis膠貯液尿素420.42gArc60g定容到1L,過濾。
Bis3.16g4℃保存。10×TBE50ml2、膠的制備6%Arc/Bis50ml10%AP250ul10×TBE50ul3、玻璃板的消化及組裝洗凈的玻璃板淋干,用95%的酒精沖洗2遍,干燥。用吹風(fēng)機預(yù)熱玻璃板。分別向兩板上用擦鏡紙涂300ml剝離硅烷。通風(fēng)廚中干燥30分鐘。組裝。灌膠。4、預(yù)電泳向上槽液中加入0.5×TBE,下槽液中加入1×TBE,300V電泳半小時。5、上樣、電泳吹凈加樣孔中的尿素和氣泡。上樣。250V電泳4小時。銀染1、固定:10%的乙醇和0.5%冰醋酸固定6分鐘,分兩次進行,可過夜2、染色:0.2%硝酸銀溶液中浸泡20分鐘,時間可稍長。3、漂洗:蒸餾水充分漂洗。2-3遍。4、顯色:1.5%氫氧化鈉和0.4%甲醛顯色。預(yù)冷。10℃最好。5、終止:0.75%碳酸氫鈉溶液。6、膠可在固定液中保存幾天。7、也可制備干膠。制備前,將膠和剝離紙在5%的甘油溶液中浸泡3小時。目的DNA的回收用刀片切取差異條帶,置于Ep管中。加入100ul雙蒸水,室溫靜置10分鐘。煮沸15分鐘。高速離心2分鐘。棄沉淀,留上清。向上清中加入10ul,3mol/l,PH5.2,NaAc;5ul,10mg/ml糖原;400ul,100%乙醇?;靹?。-70℃放置30分鐘,或者-20℃更長時間。4℃高速離心10分鐘。棄上清。加入500ul,85%乙醇洗沉淀。干燥,溶于10ul雙蒸水。取4ul進行PCR反應(yīng),其余-20℃保存。第二部分植物基因克隆技術(shù)系列實驗第一單元:用差異顯示法分離特異表達(dá)的基因片段
差式顯示(Differentialdisplay)是由Liang和Pardee在1922年建立的一種新的分子生物學(xué)技術(shù),其目的就是對不同細(xì)胞的mRNA進行比較,尋找特異表達(dá)的基因。由于該方法簡便直觀,目前在動物、植物中已有很多成功應(yīng)用。
差式顯示的基本策略是通過反轉(zhuǎn)錄與PCR擴增mRNA中特定的一小部分,用DNA序列分析膠(6%~8%polyacrylamidegel)同步分離顯示擴增產(chǎn)物以進行比較。首先,要以5’-T(n)MN-3’(3’固定引物,3’anchoredprimer,其中n=10~20,M=dA/dC/dG,N=dA/dC/dT/dG)作引物,將待比較的mRNA進行逆轉(zhuǎn)錄得到單鏈cDNA為模板,由于該引物具有poly(dT),故可與mRNA的3’-poly(A)結(jié)合,而另外兩個堿基MN的作用是使它定位在poly(A)的5’端,并使它只介導(dǎo)約1/12的mRNA的逆轉(zhuǎn)錄(為什么?)。
逆轉(zhuǎn)錄之后,以單鏈cDNA為模板,立即進行PCR,3’端就是上述3’固定引物,5’端引物是10~13個堿基的隨機引物(5’arbitraryprimer)。對于在細(xì)胞A中表達(dá)而不在細(xì)胞B中表達(dá)的基因來說,若引物合適,就可能在A的PCR產(chǎn)物中發(fā)現(xiàn)相應(yīng)的基因片段,而不會在細(xì)胞B的PCR產(chǎn)物中發(fā)現(xiàn)該片段。由于5’端引物較短,特異性較低,能以相對較高的機率與cDNA5’端結(jié)合,從而保證每一對引物都能擴增出適當(dāng)數(shù)量的DNA片段(約50~150條)。若片段數(shù)過少,要對全部mRNA進行比較就必須合成大量引物,進行大量PCR;若片段數(shù)過多,又會增加分離純化的難度,當(dāng)每次PCR擴增50~150個片段時,通過對12個3’引物和25個5’引物的不同組合,可以在95%的情況下分析15000個不同的基因,基本包括單個細(xì)胞所能表達(dá)的全部基因數(shù)。
由于PCR的產(chǎn)物一般含有幾十至上百個分子量相近的DNA片段,所以需要用高分辨率的測序膠(6%~8%的聚丙烯酰胺凝膠)來分離這些片段。
PCR產(chǎn)物分離后的顯色,本實驗采用銀染法。
顯色后我們會看到很多條帶,其中大多數(shù)是共有的,但在某些位置上會有特異的條帶,這些條帶就是我們要找的特異表達(dá)的基因片段。
銀染法的原理是利用了DNA對銀離子的吸附作用,將吸附的銀離子還原成金屬銀,從而顯示DNA條帶的位置。其優(yōu)點是靈敏度高,顯色快速簡單,可在電泳后幾十分鐘內(nèi)得到結(jié)果。使用放射性同位素雖可達(dá)到近似的靈敏度,但一般需曝光幾十小時以上,并且要求PCR中摻入同位素,因此對防護的要求較高,使操作復(fù)雜化。
銀染法的缺點是必須將DNA固定在膠上才能有好的染色效果,這就使得從膠上回收特異的DNA片段進行后續(xù)實驗十分困難,所以在實際操作中并不使用。
操作步驟1.
RNA制備1)液氮研磨,材料剪碎直接放入研缽中,加入少量液氮,迅速研磨,再加少量液氮,再研磨,如此三次,按50-100mg組織/mlTrizol加入Trizol,轉(zhuǎn)入離心管進行第2步操作。2)室溫放置5min,使其充分裂解。注:此時可放入-70℃長期保持。3)12,000rpm離心5min,棄沉淀。4)按200ul氯仿/mlTrizol加入氯仿,振蕩混勻后室溫放置15min。注:禁用漩渦振蕩器,以免基因組DNA斷裂。5)4℃12,000g離心15min。6)吸取上層水相,至另一離心管中。注:千萬不要吸取中間界面。7)按0.5ml異丙醇/mlTrizol加入異丙醇混勻,室溫放置5-10min。8)4℃12,000g離心10min,棄上清,RNA沉于管底。9)按1ml75%乙醇/mlTrizol加入75%乙醇,溫和振蕩離心管,懸浮沉淀。10)4℃8,000g離心5min,盡量棄上清。11)室溫晾干或真空干燥5-10min。
注:RNA樣品不要過于干燥,否則很難溶解。12)可用50ulH2O,TEbuffer或0.5%SDS溶解RNA樣品,55-60℃,5-10min。
注:H2O、TE或0.5%SDS均須用DEPC處理并高壓。2.逆轉(zhuǎn)錄:1)按下列方法建立四套不同的簡并oligo(dT)錨定引物(T7T12MG,T7T12MA,T7T12MC,T7T12MT)5×RTbuffer4ul
dNTP1(1mM):1ul
總RNA:0.2ug(或mRNA0.1ug)
T7T12MN:1ul
加水補足:19ul
離心數(shù)秒混勻。2)65℃溫育2min,37℃溫育5min;3)加入1ulM-MLV(RNaseH-)反轉(zhuǎn)錄酶,離心數(shù)秒,37℃50min;4)95℃溫育5min滅活反轉(zhuǎn)錄酶,稍加高速離心以收集液滴,可立即用于PCR擴增,或貯存于-20℃,用于下面實驗。3PCR差異顯示mRNA:1)對于每一套引物按以下方案準(zhǔn)備20ul反應(yīng)液:10×PCRbuffer:2uldNTP2(0.2mM):1ulT7T12MN:1ulM13十聚體隨機引物:1ulcDNA(RT產(chǎn)物):2ulTaq-plus:0.5-1ul加水補足:20ul2)離心數(shù)秒,按下列參數(shù)進行PCR擴增:94℃預(yù)變性2min94℃變性30秒40℃復(fù)性20秒40循環(huán)72℃延伸60秒72℃延伸加時10min4.測序膠分離PCR產(chǎn)物配膠:5.7g丙烯酰胺,0.3gN,N’-甲叉雙丙烯酰胺,48克尿素,放入200mL燒杯中,加入20mL5×TBE,20mL重蒸水,攪拌溶解,由于尿素溶解時吸熱,故可將燒杯置于37℃水浴促溶。待完全溶解后,定容至100mL,Wattman3MM濾紙過濾,然后于4℃避光保存?zhèn)溆?。另外配?0%過硫酸銨溶液0.5mL,注意一定要現(xiàn)用現(xiàn)配。膠板的準(zhǔn)備:將兩塊玻璃板洗凈,蒸餾水沖洗一遍,晾干。用脫脂棉蘸2~3mL疏水硅化液在長方形玻璃板上均勻涂抹至干,用裝無水乙醇的洗瓶自上至下沖洗一遍,沖掉未結(jié)合上的硅化液,晾干備用。在凹形玻璃板上用親水硅化液5mL同法進行親水硅化。灌膠:在兩塊玻璃板之間兩側(cè)各夾上一個0.4mm厚與膠板等長的塑料間隔片(spacer),用膠布將三面封死,用鐵夾夾緊。在100mL配好的聚丙烯酰胺凝膠貯液中加入0.5mL10%過硫酸銨,輕搖混勻,再加入50μLTEMED(N,N,N’,N’-四甲基乙二胺),輕搖混勻,注意不起氣泡。然后將立起膠板,稍傾斜,將配好的膠沿玻璃板慢慢倒入膠板間的空隙,注意不要再膠中留著氣泡。若已產(chǎn)生氣泡,可將膠板適當(dāng)傾斜以使膠面降至氣泡以下,氣泡會自然破裂。倒?jié)M膠厚,水平放置膠板,將梳子的平面插入兩板之間約4~5mm,用鐵夾固定,靜置1h左右使膠聚合完全。上樣:膠凝厚,撕去膠布,輕輕撥出,注意不要損壞膠面。用注射器水沖洗膠面,洗掉碎膠。反轉(zhuǎn)梳子,將鋸齒面插入兩板之間,使齒尖稍進入膠面(約0.5mm),數(shù)字齒之間的間隙即是樣品槽。把膠板固定在電泳槽上,槽中加入1×TBE至沒過膠面。用1900V預(yù)電泳20min,同時將樣品于80~100℃加熱變性2min后立即置于冰上,使其保持單鏈狀態(tài)。停止預(yù)電泳,用注射器灌電泳液將膠面上析出的尿素沖掉,即可開始上樣。上樣使用微量進樣器,每個樣品取10μ左右。
注意,每一對樣品必須相鄰并且同時電泳。電泳:上完樣后,立即開始電泳。電壓設(shè)為1900V左右。電泳時注意不要使膠的溫度太高,必要時可將鐵板夾在玻璃板上幫助散熱。電泳至第二道染料(二甲苯菁FF)即將出膠時停止(一般需2~4h)。放掉電泳液,取下膠板,將兩塊板輕輕撬開,膠將會留在親水硅化過的板上。5.銀染拿膠板時應(yīng)戴手套,拿膠板的邊緣,以防止指紋。固定:膠面向上將膠板放入一個淺塑料盤中,倒入固定液,使其沒過膠面。輕輕搖晃20min左右至看不見膠上的染料時,將板取出。注意回收固定液。洗膠:用重蒸水浸泡膠板2min,取出后瀝干10~20s,換水浸泡。重復(fù)三次。染色:將板轉(zhuǎn)入染色液,輕搖30min。顯色(注意要嚴(yán)格控制各步的時間):a:將3mL甲醛及400μL硫代硫酸鈉(10mg/mL)溶液加入10~20℃的顯色液中。b:從染色液中取出膠板,重蒸水中浸泡5~10s,立即取出(若超出時間,須重復(fù)染色步驟)。c:將膠板置于1L預(yù)冷的顯色液中,充分振蕩,直至看見第一個條帶,然后將膠板轉(zhuǎn)至另1L顯色液中,繼續(xù)顯色2~3min,至其余條帶清晰可見。終止顯色:將回收的等體積固定液直接倒入顯色液中,搖2~3min終止顯色。清洗:用重蒸水浸泡兩次,每次2min。干燥:將膠板置于室溫晾干。然后,在淺色背景下即可進行觀察。結(jié)果與討論1.PCR是一種高度靈敏的DNA擴增反應(yīng),它可把單個DNA分子擴增105倍以上。反應(yīng)體系中微量的DNA污染都可能對結(jié)果產(chǎn)生很大的影響,因此在配制PCR反應(yīng)混合物時應(yīng)非常小心,所用的tip頭應(yīng)是滅菌的新tip頭,每加一種試劑應(yīng)換一個頭。模板DNA應(yīng)最后加,以盡可能減少污染的幾率。由于本實驗要對兩組cDNA進行比較,所以二者的反應(yīng)條件應(yīng)盡可能相同,以免引入虛假的差別。為達(dá)到此
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