外文數(shù)據(jù)庫pubmed研

外文數(shù)據(jù)庫認(rèn)識PubMed——讓它融入您的科研認(rèn)識PubMed——讓它融入您的科研日期時間地點批次內(nèi)容1．3（星期五）第3-5節(jié)圖書館（三四樓電子閱覽室）12013010001～2013020079外文數(shù)據(jù)庫實習(xí)1．3（星期五）第6-8節(jié)圖書館（三四樓電子閱覽室）22013020080～2013040154外文數(shù)據(jù)庫實習(xí)1.5（星期日）8:30-11:00圖書館（三四樓電子閱覽室）3

2013040155～2013060241外文數(shù)據(jù)庫實習(xí)1.5（星期日）15:00-17:30圖書館（三四樓電子閱覽室）42013060242～2013060325外文數(shù)據(jù)庫實習(xí)郵箱：gdmcwxjs@126.com密碼：wxjs123456聯(lián)系QQ：1580123718電話：2388565一、

認(rèn)識PubMed二、PubMed

檢索入門三、PubMed高級檢索四、PubMed醫(yī)學(xué)主題詞表檢索五、PubMed其他功能六、PubMed個性化服務(wù)認(rèn)識PubMed——讓它融入您的科研標(biāo)引質(zhì)量高更新速度快信息量大使用方便選擇PubMed的n個理由一、認(rèn)識PubMed網(wǎng)址：/pubmed

或/pubmed

或(com;org;net)由美國國立醫(yī)學(xué)圖書館（NationalLibraryofMedicine-

NLM）國家生物技術(shù)信息中心（NationalCenterforBiotechnologyInformation-NCBI）向因特網(wǎng)用戶提供免費MEDLINE檢索服務(wù)一、認(rèn)識PubMed一、認(rèn)識PubMed收錄從1946年至今80多個國家和地區(qū)37種文字的5400多種生物醫(yī)學(xué)期刊上的文獻2000多萬條。每日更新（周二到周六），每天增加2000－4000

條完整記錄。PUBMED中90%的原文為英文文獻，79%有英文摘要。PubMedABDCMedlineOldMedlineIn

Process

CitationsRecordsuppliedbypublisher一、認(rèn)識PubMedPUBMED收錄的文獻包括4個數(shù)據(jù)庫：

概況

A:Medline

是NLM最主要的文獻數(shù)據(jù)庫，覆蓋了醫(yī)學(xué)、獸醫(yī)、衛(wèi)生等各個學(xué)科。收錄1966年以來生物醫(yī)學(xué)期刊上的文獻。該數(shù)據(jù)庫文獻的標(biāo)識為：[PubMed-indexedforMEDLINE]。

認(rèn)識PubMed——讓它融入您的科研

B:OldMedline

收錄1946年至1965年期間發(fā)表的200萬篇生物醫(yī)學(xué)文獻，標(biāo)識為[PubMed-OldMedline]。

認(rèn)識PubMed——讓它融入您的科研目前通過PubMed可查到的最早文獻為1809年出版的Medico-chirurgicaltransactions上的文獻，且為免費全文。/pmc/articles/PMC2128800/?page=1

C：InProcessCitationsPubMED中每天增加的數(shù)據(jù)先放在此庫，新記錄只提供基本的題錄信息和文摘，沒有標(biāo)引主題詞，其標(biāo)識為：[PubMed-inprocess]。

InProcessCitations中的數(shù)據(jù)經(jīng)標(biāo)引部門標(biāo)引后再加入到Medline數(shù)據(jù)庫之中。標(biāo)識改為：[PubMed-indexedforMEDLINE]。D:Publisher-SuppliedCitations此外，出版商在印刷版期刊出版之前向PUBMED傳送的電子版內(nèi)容將顯示[Epubaheadofprint]標(biāo)識。由出版商以電子版形式直接傳送到PubMed，標(biāo)識為：[PubMed-assuppliedbypublisher]，大部分出版商提供的文獻處于正在加工狀態(tài)，經(jīng)標(biāo)引后加入到MEDLINE中。此外，還有少部分出版商提供的文獻不進行標(biāo)引，保持[PubMed-assuppliedbypublisher]標(biāo)識或[PubMed]標(biāo)識。認(rèn)識PubMed——讓它融入您的科研PMID（PubMed唯一標(biāo)識碼，PubMedUniqueIdentifier）PUBMED收錄的文獻均有PMID，作為PUBMED與其他數(shù)據(jù)庫聯(lián)系的標(biāo)識及查找全文的標(biāo)記。檢索提問區(qū)文獻匹配臨床咨詢特定主題咨詢期刊檢索主題檢索高級檢索一、認(rèn)識PubMed二、PubMed檢索入門1.檢索字段及標(biāo)識符2.邏輯運算3.自動匹配功能4.截詞檢索和禁用詞5.限定字段檢索6.短語檢索7.檢索結(jié)果二、PubMed檢索入門1.檢索字段及標(biāo)識符21電子出版日期文獻出版日期數(shù)據(jù)加入PubMed日期文獻勘誤參考文獻勘誤全部著者姓名全部調(diào)研者姓名作為文章主題的著者全稱文獻相關(guān)注釋基金編號基因符號期編號資助調(diào)研者資助調(diào)研單位國際標(biāo)準(zhǔn)期刊號美國立醫(yī)學(xué)圖書館識別號期刊全稱22最后修訂日期主題詞表詞規(guī)范詞確立日期系統(tǒng)組織的文摘版權(quán)擁有者題錄提供機構(gòu)的識別號病史相關(guān)與原始記錄其他關(guān)鍵詞提供其他關(guān)鍵詞的機構(gòu)數(shù)據(jù)提供者機構(gòu)文章總頁數(shù)出版商提供數(shù)據(jù)時間期刊出版國數(shù)據(jù)庫文獻編號23作為主題詞的個人姓名出版狀態(tài)文獻類型出版模式（紙張或電子）參考文獻數(shù)已撤回的文獻酶或化學(xué)物質(zhì)代碼正在撤消中的文章初版文獻修訂和再版的文章子專題文檔太空署提供的數(shù)據(jù)二次文獻數(shù)據(jù)庫以及文章討論的分子序列訪問號原文來源引用了病例的文獻內(nèi)部處理代碼標(biāo)準(zhǔn)期刊縮寫文獻標(biāo)題翻譯標(biāo)題更新文獻文獻正在更新期刊卷號2.邏輯運算多個檢索詞間需用邏輯運算符號組配。

邏輯運算符AND、OR、NOT必須大寫系統(tǒng)將“空格”默認(rèn)為ANDVitaminc

coldVitamincANDcold在多個檢索詞間可使用布爾邏輯運算符“AND”、“OR”、“NOT”，需注意的是，邏輯運算符的優(yōu)先順序為從左向右，可通過加括號提高運算的優(yōu)先級。維生素C或維生素E與癌癥的關(guān)系1.VitaminCORvitaminEANDcancer2.(VitaminCORvitaminE)ANDcancer3.CancerAND(VitaminCORvitaminE)4.CancerANDVitaminCORvitaminE3.自動匹配功能(AutomaticTermMapping,ATM)對于輸入檢索框中未加標(biāo)識的檢索詞，PubMed依次在下列詞表中查找匹配的內(nèi)容：MeSHtranslationtableMeSH轉(zhuǎn)換表Journalstranslationtable刊名轉(zhuǎn)換表

Phraselist短語詞表

Authorindex作者及合作者索引當(dāng)用戶在基本檢索界面輸入檢索詞時，PubMed在后臺將檢索詞依次到上面轉(zhuǎn)換表中進行詞語的核對，如果在第一個表中查不到相應(yīng)的詞，則到第二個表中檢索，至到找到為止。

如果在上述幾個表中都找不到匹配的短語，系統(tǒng)將短語拆開，繼續(xù)到這四個表中搜索，短語斷開部分為AND關(guān)系。

如果拆到的單詞在上述幾個表中還是找不到匹配詞，將到所有字段中去搜索這些單詞，單詞之間的邏輯關(guān)系也是AND

Searchdetails:"ascorbicacid"[MeSHTerms]OR("ascorbic"[AllFields]AND"acid"[AllFields])OR"ascorbicacid"[AllFields]OR"vitaminc"[AllFields]如不滿意，可修改再search二、PubMed檢索入門4.截詞檢索和禁用詞截詞符：*一般只作“后截斷”使用，表示0-N個字符。

如：輸入treat*

檢出treatment、treats、treated、treating等截詞符：？一般只作“后截斷”使用，表示0-1個字符。

備注：-

不執(zhí)行自動匹配功能；

-截詞檢索只限于單詞，對詞組無效.PubMed在檢索時忽略一些常用的英語詞匯，下表為禁用詞列表二、PubMed檢索入門5.限定字段檢索檢索詞[字段名]

例：著者檢索(authors)：-姓全稱在前，名首字母在后

JohnSmithSmithJ-以AU作為限定字段 如：CooperSL[au]，”CopperSL”[au]

YaoKT[au]（姓在前，名縮寫在后）二、PubMed檢索入門期刊檢索（journals）：-刊名全稱檢索 例：NewEnglandJournalofMedicine[so]-MEDLINE認(rèn)可的標(biāo)準(zhǔn)刊名縮寫檢索 例：NEnglJMed[so]-國際標(biāo)準(zhǔn)期刊號檢索 例：0028-4793[so]二、PubMed檢索入門例：檢索JosephLeventhal研究干細胞移植的文獻直接輸入檢索式：Stemcelltransplantation

ANDLeventhalJ[AU]二、PubMed檢索入門6.短語檢索對于輸入PubMed的多詞詞組，由于英文單詞間存在“空格”，PubMed會默認(rèn)運算“AND”，則將其拆分成單個詞，分別進行檢索并以AND進行組配，如：singlecell相當(dāng)于檢索singleANDcell。若不想進行邏輯組配，可通過加“”強制將其作為一個詞組進行檢索：如：“singlecell”

使用“”后，系統(tǒng)不進行自動轉(zhuǎn)換匹配和擴展檢索。二、PubMed檢索入門二、PubMed檢索入門7.檢索結(jié)果文獻類型分類顯示設(shè)置FreeArticle:提供免費全文的鏈接。FreePMCArticle:PUBMED提供的完全免費的全文鏈接。二、PubMed檢索入門PMC(PubMedCentral，公共醫(yī)學(xué)中心)生命科學(xué)期刊資源中心免費提供約1199種期刊的200多萬篇全文/pmc/二、PubMed檢索入門認(rèn)識PubMed——讓它融入您的科研二、PubMed檢索入門三、PubMed高級檢索三、PubMed高級檢索限定字段檢索Searchingbyaspecificfield三、PubMed高級檢索Searchingbyaspecificfield三、PubMed高級檢索可選擇邏輯運算符增加一行或減少一行系統(tǒng)會根據(jù)輸入，生成檢索式，通過edit修改。檢索歷史History-Combiningsearchesusinghistory檢索史按檢索式運行的順序列出各檢索式，包括檢索式序號、檢索策略、檢索時間、檢索到的文獻條數(shù)。檢索史最多保存100條檢索式，檢索史將在離開PubMed或其他Entrez數(shù)據(jù)庫8小時后消失。

三、PubMed高級檢索三、PubMed高級檢索History-Combiningsearchesusinghistory

點擊檢索式序號將彈出一選項菜單，提供的選項包括布爾邏輯操作符AND,OR,NOT,點擊相應(yīng)的操作符菜單，將把該條檢索策略加入到檢索框中，并與檢索框中現(xiàn)有的檢索式進行選中的邏輯組配。

三、PubMed高級檢索History-Combiningsearchesusinghistory認(rèn)識PubMed——讓它融入您的科研文獻太多，如何保證查全和查準(zhǔn)？四、PubMed醫(yī)學(xué)主題詞表檢索何為MeSH？MeSH是MedicalSubjectHeadings的縮略詞，即醫(yī)學(xué)主題詞，是用規(guī)范化的醫(yī)學(xué)術(shù)語來描述生物醫(yī)學(xué)概念。論述文獻中心的主題詞稱主要主題詞論述主題某一方面的內(nèi)容的詞稱為副主題詞

4.1MeSHDatabase的運用四、PubMed醫(yī)學(xué)主題詞表檢索詞義解釋四、PubMed醫(yī)學(xué)主題詞表檢索副主題詞四、PubMed醫(yī)學(xué)主題詞表檢索組建檢索式：1.先addtosearchbuilder2.Searchpubmed認(rèn)識PubMed——讓它融入您的科研五、PubMed其他功能實現(xiàn)單篇文章的一對一檢索實現(xiàn)多篇文章的一次性檢索一次最多可檢索PubMed中100條文獻紀(jì)錄,獲得文獻的PMID認(rèn)識PubMed——讓它融入您的科研

選擇相應(yīng)類別選擇檢索范圍檢索結(jié)果更加貼近臨床的需要五、PubMed其他功能認(rèn)識PubMed——讓它融入您的科研限定于各類不同的醫(yī)學(xué)臨床主題進行檢索五、PubMed其他功能認(rèn)識PubMed——讓它融入您的科研實現(xiàn)PubMed與核酸和蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫、基因組數(shù)據(jù)庫、分類學(xué)數(shù)據(jù)、圖書等數(shù)據(jù)庫之間的多向鏈接,多向查詢五、PubMed其他功能認(rèn)識PubMed——讓它融入您的科研與PubMed建立聯(lián)系的網(wǎng)站，如某篇文獻所對應(yīng)期刊的出版商，文獻全文、相關(guān)數(shù)據(jù)庫及網(wǎng)站等。五、PubMed其他功能認(rèn)識PubMed——讓它融入您的科研五、PubMed其他功能認(rèn)識PubMed——讓它融入您的科研eUtils(EntrezProgrammingUtilities)

通過eUtils這個程序設(shè)計模塊,可以通過我們自己設(shè)計的應(yīng)用程序平臺,獲取NCBI數(shù)據(jù)庫的數(shù)據(jù),從而實現(xiàn)這些數(shù)據(jù)資源的深度開發(fā)使用。實現(xiàn)自動化的大批量的從Entrez數(shù)據(jù)庫下載數(shù)據(jù)。并且提供了幾種常用的語言以供選擇，像Perl,Python,Java,和C++等。五、PubMed其他功能認(rèn)識PubMed——讓它融入您的科研免費期刊的獲取PubMed提供了免費全文期刊網(wǎng)址

PubmedCentral

/pmc/journals/向作者索要作者主頁

五、PubMed其他功能認(rèn)識PubMed——讓它融入您的科研六、PubMed的個性化服務(wù)認(rèn)識PubMed——讓它融入您的科研保存檢索式(生成URL或HTML實現(xiàn)共享)檢索結(jié)果的分類過濾特定功能的參數(shù)設(shè)置六、PubMed的個性化服務(wù)認(rèn)識PubMed——讓它融入您的科研經(jīng)由2000多位專家學(xué)者的評價推薦，提供目前世界上最重要的生物學(xué)論文資訊及研究趨勢。特色是收錄每篇具有科學(xué)價值的文獻，而不考慮這些文獻在哪在些期刊里發(fā)表PubMed里檢索出最核心的文獻——Facultyof1000與pubmed的完美結(jié)合六、PubMed的個性化服務(wù)認(rèn)識PubMed——讓它融入您的科研PubMed快速檢索功能的實現(xiàn)NCBISearchToolkit安裝NCBISearchToolkit劃詞右擊直接進行pubmed檢索六、PubMed的個