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外文摘要信息獲取南方醫(yī)科大學(xué)醫(yī)學(xué)情報學(xué)教研室張政寶Tel/p>

E-mail:newinfoman@163.com一、常用外文摘要數(shù)據(jù)庫二、認(rèn)識PubMed文獻(xiàn)三、PubMed檢索特點(diǎn)（重點(diǎn)）四、PubMed基本檢索功能（重點(diǎn)）五、PubMed高級檢索功能（重點(diǎn)）六、PubMed檢索結(jié)果的處理七、PubMed主題詞檢索八、MyNCBI個性化服務(wù)

外文摘要信息獲取一、常用外文摘要數(shù)據(jù)庫常用外文摘要數(shù)據(jù)庫PubMedEMBaseEngineeringVillage2WebofScienceScopusBIOSISPreviewSciFinderScholar

PubMed概況網(wǎng)址：http://(com;org;net)由美國國立醫(yī)學(xué)圖書館（NationalLibraryofMedicine-

NLM）國家生物技術(shù)信息中心（NationalCenterforBiotechnologyInformation-NCBI）向因特網(wǎng)用戶提供免費(fèi)MEDLINE檢索服務(wù)(自1997-6-26起)收錄80多個國家5000多種生物醫(yī)學(xué)期刊的題錄與文摘，是世界上最權(quán)威的醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫?，F(xiàn)有1865年以來的2000多萬篇文獻(xiàn)的記錄(其中MEDLINE記錄1830多萬條)最近3年平均每年增加80余萬條文獻(xiàn)記錄在全部記錄中有78%的文獻(xiàn)為英文；在2000年以來的記錄中90%的文獻(xiàn)為英文；收錄中文刊60余種（我校學(xué)報被收錄）。

PubMed概況PubMed的外部鏈接功能

提供NCBI開發(fā)的分子生物學(xué)數(shù)據(jù)庫的鏈接，如Nucleotide、Protein、Genome、OMIN、Structure、Taxonomy等。提供美國國立醫(yī)學(xué)圖書館多種資源的鏈接提供相關(guān)文獻(xiàn)（RELATEDARTICLES）的鏈接提供其它外部資源的鏈接，如生物醫(yī)學(xué)期刊網(wǎng)站全文鏈接、NCBI資源。外部鏈接外部鏈接二、認(rèn)識PubMed文獻(xiàn)檢索練習(xí)與演示問題：砒霜是什么？有什么特點(diǎn)與作用？砒霜（三氧化二砷，白砷）：arsenictrioxide,whitearsenic，As2O3利用PubMed數(shù)據(jù)庫檢索有關(guān)砒霜的文獻(xiàn)作者AU題名TI來源SOPubMed記錄類型（狀態(tài)）

PubMed題錄

PubMed記錄類型（狀態(tài)）PubMed除了1966年以前的OldMedline，其余文獻(xiàn)記錄按處理過程分4種類型（或狀態(tài)）PubMed-assuppliedbypublisherPubMed-inprocessPubMedPubMed-indexedforMEDLINE

屬于Medline收錄范圍，建立ti、au、ab等基本書目信息。不屬于Medline收錄范圍，但也建立ti、au、ab等基本書目信息。賦予MeSH、PT等字段并被index。三、PubMed檢索特點(diǎn)

PubMed檢索特點(diǎn)檢索運(yùn)算符AND、NOT、OR必須大寫。(vitamincORzinc)ANDcommoncold支持截詞檢索（*），但對詞組無效。如bacter*,可以檢出以bacter為詞干的單詞bacteria、bacterium等最多600個單詞。截詞檢索時，系統(tǒng)的自動詞語匹配功能和MeSH自動擴(kuò)展功能將不再被執(zhí)行，如：heartattack*將不映射到MeSH

詞MyocardialInfarction。PubMed檢索特點(diǎn)強(qiáng)制檢索：雙引號""或限定字段

"endocrinedisruption"

endocrinedisruption注意：所有的"

"

、*、()、-都必須是英文狀態(tài)下輸入。PubMed常用字段Affiliation[AD]（機(jī)構(gòu)地址）Author[AU]（作者）：姚開泰（yao

kaitai-->yao

kt,yao

kaitai-->yaok）；

tan

j[au]與"tanj"[au]不同

Language[LA]（文獻(xiàn)語種）：chinese[la]或chi[la]（前3個字母）MeSHTerms[MH]（主題詞）：自動擴(kuò)展下位主題詞；如需關(guān)閉該功能，使用[mh:noexp]

PubMed常用字段PublicationDate[DP]

（出版日期）：1998/03[dp];1998[dp];1996:1998[dp];1998/01:1998/04[dp]PublicationType[PT]（文獻(xiàn)類型）：review[pt]Title[TI]

（文獻(xiàn)題名）TextWords[TW]（文本詞）

：包括Title,Abstract,MeSHTerms,MeSHSubheadings,ChemicalSubstanceNames,PersonalNameasSubject等字段Title/Abstract[TIAB]

（題名與摘要）檢索練習(xí)檢索珠江醫(yī)院醫(yī)護(hù)人員發(fā)表的論文（zhujianghospital;zhu

jianghospital

）檢索珠江醫(yī)院肝膽外科方馳華教授發(fā)表的論文檢索珠江醫(yī)院醫(yī)護(hù)人員2005年以來發(fā)表的英文論文四、PubMed基本檢索功能檢索練習(xí)與演示2000年10月4日美國食品藥物管理局（FDA）批準(zhǔn)以砒霜（三氧化二砷）治療某種類型的白血病用砒霜治療的白血病名稱是：acutepromyelocyticleukemia（APL，急性早幼粒細(xì)胞白血?。┡?三氧化二砷，白砷)：arsenictrioxide,whitearsenic，As2O3利用PubMed數(shù)據(jù)庫檢索有關(guān)砒霜治療白血病的文獻(xiàn)自由詞檢索在檢索框中鍵入一到多個單詞，如鍵入：vitamincANDcommoncoldhepatitisbAND(diagnosisORtherapy)

檢索詞可出現(xiàn)于PubMed各記錄中的標(biāo)題、摘要等全部可檢索字段。自由詞檢索自由詞檢索檢索細(xì)節(jié)（SearchDetails）轉(zhuǎn)換后的檢索式可進(jìn)行修改作者檢索檢索時姓用全稱，名用首字母。2002年以來的文獻(xiàn)可以用姓名全拼形式查找。作者姓名書寫格式1.西方人姓名書寫格式：Firstname、MiddleName、Lastname。美國肯尼迪總統(tǒng)名為：JohnFrankKenedy，Kenedy為Lastname（姓）。Frank為Middlename，比較少看到，多看到JohnF.Kenedy，中間名縮寫了。如果看到姓名中間有逗號，則逗號前一定是姓。如：Kenedy,JohnF.作者檢索作者姓名書寫格式2.中國人姓名格式：Lastname、Firstname。如：鐘世鎮(zhèn)，就有如下拼寫形式可供檢索：Shi-zhen

Zhong；Shizhen

ZhongZhongshi-zhen；Zhong，shizhenZhong，shi-zhen

→zhong

szShizhen

Zhong，zhong

shizhen→zhongs期刊檢索檢索時可輸入期刊全名，如：molecularbiologyofthecell，系統(tǒng)自動轉(zhuǎn)換為”molbiolcell”[JournalName]；也可輸入期刊標(biāo)準(zhǔn)縮寫形式（如：molbiolcell）或期刊的ISSN（國際標(biāo)準(zhǔn)出版物編號，如：1059-1524）。如果期刊名是一個單詞或恰好是MeSH詞表中的詞，如GeneTherapy、Science、Cell等，則必須在刊名后加[ta]（期刊名稱字段標(biāo)識符），也可使用[so]。期刊檢索如果雜志全名中包括括弧或方括號，鍵入時應(yīng)該予以取消，例如雜志名為：JHandSurg[Am]，檢索時應(yīng)轉(zhuǎn)成：JHandSurgAm。中文期刊，用漢語拼音：Nanfangyi

ke

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xue

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baoBeijingda

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nei

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zhi限定檢索（Limits）文獻(xiàn)類型（TypeofArticle）、語種（Languages）、文獻(xiàn)子集限定（Subsets）研究對象：物種（Species）、性別（Sex）、年齡（Ages）全文鏈接（FullText或FreeFullText）、有摘要（Abstracts）以上各種限定可以單獨(dú)或組合進(jìn)行。限定檢索界面五、PubMed高級檢索功能檢索舉例姚開泰院士2001年以前發(fā)表的有關(guān)鼻咽癌（nasopharyngealcancer）方面的文獻(xiàn)分析姚開泰，2001年以前，nasopharyngealcancer點(diǎn)擊“Limits”后顯示限定檢索框各檢索式之間可以進(jìn)行邏輯組配，可以#n代替檢索式。注意：限定檢索結(jié)束后，點(diǎn)擊“Change”修改或“Remove”取消限定項(xiàng)。為了驗(yàn)證檢索結(jié)果是否正確，需通過Abstract格式查看作者所在的機(jī)構(gòu)名稱。六、PubMed檢索結(jié)果的處理檢索結(jié)果的處理顯示格式(DisplaySettings)結(jié)果排序(DisplaySettings-Sortby)保存為本地文件（最多10000篇）(Sendto–File)臨時存放至剪貼板(Sendto–Clipboard)保存為個人資料集(Sendto–Collections)發(fā)送至電子郵箱(Sendto–E-mail)（一）顯示格式設(shè)置（DisplaySettings）題錄格式：作者、題名、出處顯示格式——Summary格式（默認(rèn)）顯示格式——Abstract格式顯示格式——MEDLINE格式導(dǎo)入NoteExpress的必選格式（二）將檢索結(jié)果保存為本地文件（三）檢索結(jié)果臨時存放至剪貼板（Clipboard）將每次選中的檢索結(jié)果暫時保存至此最后集中處理（下載存盤或發(fā)E-mail）最多500條記錄斷開連接后仍可保存8小時選取記錄，將記錄發(fā)送到Clipboard記錄保存到Clipboard后有提示信息在Clipboard中查看保存的記錄在檢索歷史中顯示Clipboard操作歷史（四）將檢索結(jié)果發(fā)送到郵箱七、PubMed主題詞檢索MeSH(MedicalSubjectHeadings)

PubMed記錄中的醫(yī)學(xué)主題詞(MeSH)是由標(biāo)引員為PubMed中的Medline文獻(xiàn)所人工指定的詞。例：ascorbicacid是MeSHTerms，而vitaminc則不是。標(biāo)引員使用能恰當(dāng)描述文章內(nèi)容的最相關(guān)MeSH詞。通常一篇文章可有多個MeSH詞。PubMed能自動地為輸入的檢索詞尋找相應(yīng)的MeSH詞用戶利用一個MeSH詞能找出所有有關(guān)該主題的文獻(xiàn)

不同拼寫：leukemia(s),leukaemia(s)→leukemia同義詞：tumor(s),tumour(s),cancer(s),neoplasm(s)→neoplasmsMeSH(MedicalSubjectHeadings)

MeSH詞獨(dú)有特征主要MeSH詞(MAJORTOPIC):MeSHtermasmainsubjectofthearticle(*)次要MeSH詞擴(kuò)展(EXPLODE)：chosenMeSHtermandallmorespecificunderlyingMeSHterms副主題詞(SUBHEADINGS)SubHeadings

副主題詞對一個主題詞的多個方面進(jìn)行修飾限定的詞，又稱限定詞。目前有83個副主題詞并非每個主題詞都能和83個副主題詞組配。主題詞等級排列，檢索時可以將包含其下位詞的文獻(xiàn)都檢索出來。一個主題詞可以同時處在不同類目下?？蛇x用的副主題詞檢索有關(guān)糖尿?。―iabetes）流行病學(xué)方面的文獻(xiàn)。第一步：輸入