蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)與功能8_第1頁
蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)與功能8_第2頁
蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)與功能8_第3頁
蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)與功能8_第4頁
蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)與功能8_第5頁
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文檔簡介

一、蛋白質(zhì)是構(gòu)成生物體的基本成分分布廣:所有器官、組織都含有蛋白質(zhì);細胞的各個部分都含有蛋白質(zhì)。含量高:蛋白質(zhì)是細胞內(nèi)最豐富的有機分子,約占人體干重的45%,某些組織含量更高。當(dāng)前1頁,總共103頁。1)生物催化作用(酶)2)代謝調(diào)節(jié)作用(激素)3)免疫保護作用(抗體)4)物質(zhì)的轉(zhuǎn)運和存儲(血紅蛋白)5)運動與支持作用(肌動蛋白)6)控制生長和分化作用(核蛋白)7)參與細胞間信息傳遞(受體蛋白)二、蛋白質(zhì)具有多樣性的生物學(xué)功能當(dāng)前2頁,總共103頁。

第一節(jié)

蛋白質(zhì)的分子組成當(dāng)前3頁,總共103頁。一、蛋白質(zhì)的元素組成主要有C、H、O、N和S。

有些蛋白質(zhì)含有少量磷、硒或金屬元素鐵、銅、鋅、錳、鈷、鉬,個別蛋白質(zhì)還含有碘。當(dāng)前4頁,總共103頁。

各種蛋白質(zhì)的含氮量很接近,平均為16%。

由于體內(nèi)的含氮物質(zhì)以蛋白質(zhì)為主,因此,只要測定生物樣品中的含氮量,就可以根據(jù)以下公式推算出蛋白質(zhì)的大致含量:100克樣品中蛋白質(zhì)含量(g%)

=每克樣品含氮克數(shù)×

6.25×100蛋白質(zhì)元素組成的特點當(dāng)前5頁,總共103頁。案例分析1:乳品企業(yè)中為什么要加“三聚氰胺”?當(dāng)前6頁,總共103頁。當(dāng)前7頁,總共103頁。二、蛋白質(zhì)的基本組成單位

—氨基酸天然存在的氨基酸約300余種,但組成人體蛋白質(zhì)的編碼氨基酸僅有20種,稱為基本氨基酸。且均屬L-α-氨基酸(甘氨酸除外)。當(dāng)前8頁,總共103頁。H甘氨酸CH3丙氨酸L-氨基酸的通式R當(dāng)前9頁,總共103頁。(一)氨基酸結(jié)構(gòu)上的共同特點:均為-氨基酸,脯氨酸為-亞氨基酸。R側(cè)鏈不同。除甘氨酸外,均具有旋光性。皆為L--氨基酸。當(dāng)前10頁,總共103頁。當(dāng)前11頁,總共103頁。非極性側(cè)鏈氨基酸極性中性側(cè)鏈氨基酸酸性側(cè)鏈氨基酸(2種)4.堿性側(cè)鏈氨基酸(3種)(二)氨基酸的結(jié)構(gòu)與分類(R側(cè)鏈)*20種氨基酸的英文名稱、縮寫符號及分類如下:當(dāng)前12頁,總共103頁。當(dāng)前13頁,總共103頁。當(dāng)前14頁,總共103頁。當(dāng)前15頁,總共103頁。+胱氨酸二硫鍵-HH當(dāng)前16頁,總共103頁。稀有氨基酸

多肽合成后由基本氨基酸經(jīng)酶促修飾而來,無翻譯密碼。如羥脯氨酸、羥賴氨酸。當(dāng)前17頁,總共103頁。

第二節(jié)

蛋白質(zhì)的分子結(jié)構(gòu)當(dāng)前18頁,總共103頁。一級結(jié)構(gòu)(AA序列)二級結(jié)構(gòu)超二級結(jié)構(gòu)結(jié)構(gòu)域三級結(jié)構(gòu)(球蛋白)四級結(jié)構(gòu)(聚合體)

蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的層次性當(dāng)前19頁,總共103頁。當(dāng)前20頁,總共103頁。一、蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu)*肽鍵:由一個氨基酸的-羧基與另一個氨基酸的-氨基脫水縮合而形成的化學(xué)鍵。(一)肽鍵和肽當(dāng)前21頁,總共103頁。+-HOH甘氨酰甘氨酸肽鍵當(dāng)前22頁,總共103頁。肽是由氨基酸通過肽鍵縮合而形成的化合物。兩分子氨基酸縮合形成二肽,三分子氨基酸縮合則形成三肽……肽鏈中的氨基酸分子因為脫水縮合而基團不全,被稱為氨基酸殘基。由十個以內(nèi)氨基酸相連而成的肽稱為寡肽,由更多的氨基酸相連形成的肽稱多肽。當(dāng)前23頁,總共103頁。N末端:多肽鏈中有自由氨基的一端;C末端:多肽鏈中有自由羧基的一端。多肽鏈有兩個末端:多肽鏈:是指許多氨基酸之間以肽鍵連接而成的一種結(jié)構(gòu)。當(dāng)前24頁,總共103頁。當(dāng)前25頁,總共103頁。N末端C末端牛核糖核酸酶當(dāng)前26頁,總共103頁。1、定義蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu)指多肽鏈中氨基酸的排列順序。(二)蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu)主要的化學(xué)鍵肽鍵,有些蛋白質(zhì)還包括二硫鍵。

當(dāng)前27頁,總共103頁?!耙患壗Y(jié)構(gòu)是蛋白質(zhì)空間構(gòu)象和特異生物學(xué)功能的基礎(chǔ)?!碑?dāng)前28頁,總共103頁。(三)生物活性肽生物體內(nèi)存在許多具有生物活性的小分子肽,它們在代謝調(diào)節(jié)和神經(jīng)傳導(dǎo)等方面起著重要作用,故稱為生物活性肽。重要的有谷胱甘肽、多肽類激素、神經(jīng)肽及多肽類抗生素等。

當(dāng)前29頁,總共103頁。當(dāng)前30頁,總共103頁。當(dāng)前31頁,總共103頁。

體內(nèi)許多激素屬寡肽或多肽2.多肽類激素及神經(jīng)肽當(dāng)前32頁,總共103頁。3.多肽類抗生素

一類能抑制或殺死細菌的多肽,如短肽桿菌S、短桿菌肽A、纈氨霉素等。當(dāng)前33頁,總共103頁。

二、蛋白質(zhì)的空間結(jié)構(gòu)

當(dāng)前34頁,總共103頁。蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的主要層次一級結(jié)構(gòu)四級結(jié)構(gòu)二級結(jié)構(gòu)三級結(jié)構(gòu)primarystructuresecondary

structureTertiarystructurequariernarystructure超二級結(jié)構(gòu)結(jié)構(gòu)域

supersecondarystructureStructuredomain當(dāng)前35頁,總共103頁。維持蛋白質(zhì)構(gòu)象的化學(xué)鍵---次級鍵(副鍵)1、氫鍵:發(fā)生于負電性很強的原子(O,N)與一個已和氧或氮形成共價結(jié)合的氫原子之間。

2、疏水鍵:由非極性基團受到水分子排斥相互聚集在一起的作用力。3、離子鍵:由異性電荷間的靜電吸引形成的鍵。4、二硫鍵:5、范德華引力:原子、基團、分子間相互作用力。

當(dāng)前36頁,總共103頁。當(dāng)前37頁,總共103頁。(一)蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu)蛋白質(zhì)分子中某一段肽鏈的局部空間結(jié)構(gòu),即該段肽鏈主鏈骨架原子的相對空間位置,并不涉及氨基酸殘基側(cè)鏈的構(gòu)象

。定義

主要的化學(xué)鍵:

氫鍵

當(dāng)前38頁,總共103頁。1、肽單元參與肽鍵的6個原子C1、C、O、N、H、C2位于同一平面,C1和C2在平面上所處的位置為反式構(gòu)型,此同一平面上的6個原子構(gòu)成了所謂的肽單元

。當(dāng)前39頁,總共103頁。雖是單鍵卻有雙鍵性質(zhì);周邊六個原子在同一平面上;前后兩個a-carbon在對角。CNCHaNCOCa0.123nm0.132nm0.153nm0.149nmC-N0.149nmC=N0.127nm當(dāng)前40頁,總共103頁。

肽平面和二面角示意圖當(dāng)前41頁,總共103頁。多肽鏈可以看成由Cα串聯(lián)起來的無數(shù)個肽單位組成,肽單位是蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的最小單位。當(dāng)前42頁,總共103頁。2、蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)的主要形式

-螺旋(-helix)

-折疊(-pleatedsheet)

-轉(zhuǎn)角(-turn)

無規(guī)卷曲(randomcoil)

當(dāng)前43頁,總共103頁。

-螺旋當(dāng)前44頁,總共103頁。橫截面觀當(dāng)前45頁,總共103頁。α-螺旋要點:

①右手螺旋,每隔3.6個氨基酸殘基螺旋上升一圈,螺距0.54nm,殘基高度0.15nm;②氫鍵是α螺旋穩(wěn)定的主要次級鍵,相鄰螺圈之間形成鏈內(nèi)氫鍵。③R側(cè)鏈分布于螺旋的外側(cè),并影響螺旋的形成和穩(wěn)定。當(dāng)前46頁,總共103頁。影響α-螺旋穩(wěn)定的因素:

⑴極大的側(cè)鏈基團(存在空間位阻);

⑵連續(xù)存在的側(cè)鏈帶有相同電荷的氨基酸殘基(同種電荷的互斥效應(yīng));

⑶有Pro等亞氨基酸存在(不能形成氫鍵)。

當(dāng)前47頁,總共103頁。-折疊當(dāng)前48頁,總共103頁。

β-折疊要點:a、肽鍵平面之間折疊成鋸齒狀;b、相鄰肽鏈之間的氫鍵是維持結(jié)構(gòu)穩(wěn)定的主要次級鍵;c、肽鏈平行的走向有順式和反式兩種;d、R側(cè)鏈分布在片層的上下。

當(dāng)前49頁,總共103頁。β-折疊當(dāng)前50頁,總共103頁。

β-折疊的平行式和反平行式當(dāng)前51頁,總共103頁。-折角當(dāng)前52頁,總共103頁。β-折角要點:

主鏈骨架本身以大約180°回折;回折部分通常由四個氨基酸殘基構(gòu)成;構(gòu)象依靠第一個殘基的-CO基與第四殘基的-NH基之間形成氫鍵來維系。

當(dāng)前53頁,總共103頁。-折角:當(dāng)前54頁,總共103頁。

無規(guī)卷曲

用來闡述沒有確定規(guī)律性的那部分肽鏈結(jié)構(gòu)。當(dāng)前55頁,總共103頁。蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)的主要形式當(dāng)前56頁,總共103頁。(二)蛋白質(zhì)的三級結(jié)構(gòu)疏水鍵、氫鍵和鹽鍵等。主要的化學(xué)鍵整條肽鏈中全部氨基酸殘基的相對空間位置。即肽鏈中所有原子在三維空間的排布位置。

定義當(dāng)前57頁,總共103頁。

肌紅蛋白(Mb)

N端C端當(dāng)前58頁,總共103頁。當(dāng)前59頁,總共103頁。胰島素分子的三級結(jié)構(gòu)當(dāng)前60頁,總共103頁。溶菌酶分子的三級結(jié)構(gòu)當(dāng)前61頁,總共103頁。

(三)結(jié)構(gòu)域多肽鏈中某些局部的二級結(jié)構(gòu)常常匯集在一起,形成能發(fā)揮生物學(xué)功能的特定區(qū)域,稱為結(jié)構(gòu)域(domain)。每個結(jié)構(gòu)域具有特定的功能。當(dāng)前62頁,總共103頁。

免疫球蛋白的12個結(jié)構(gòu)域當(dāng)前63頁,總共103頁。

對于較小的蛋白質(zhì)分子來說,結(jié)構(gòu)域和三級結(jié)構(gòu)往往是一個意思,即單結(jié)構(gòu)域的。大的蛋白質(zhì)分子可以由2個或更多個結(jié)構(gòu)域組成。

當(dāng)前64頁,總共103頁。亞基之間的結(jié)合力主要是疏水作用,其次是氫鍵和離子鍵。(三)蛋白質(zhì)的四級結(jié)構(gòu)蛋白質(zhì)分子中各亞基的空間排布及亞基接觸部位的布局和相互作用,稱為蛋白質(zhì)的四級結(jié)構(gòu)。有些蛋白質(zhì)分子含有二條或兩條以上多肽鏈,每一條多肽鏈都有完整的三級結(jié)構(gòu),稱為蛋白質(zhì)的亞基。當(dāng)前65頁,總共103頁。血紅蛋白的四級結(jié)構(gòu)

當(dāng)前66頁,總共103頁。當(dāng)前67頁,總共103頁。蛋白質(zhì)的分子結(jié)構(gòu)小結(jié)當(dāng)前68頁,總共103頁。

第三節(jié)

蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系當(dāng)前69頁,總共103頁。蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)是空間結(jié)構(gòu)形成的物質(zhì)基礎(chǔ);蛋白質(zhì)的生物學(xué)功能是蛋白質(zhì)分子特定的天然構(gòu)象所表現(xiàn)的性質(zhì)或具有的屬性。當(dāng)前70頁,總共103頁。(一)一級結(jié)構(gòu)是空間結(jié)構(gòu)與功能的基礎(chǔ)

一、蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系牛核糖核酸酶的一級結(jié)構(gòu)二硫鍵當(dāng)前71頁,總共103頁。

天然狀態(tài),有催化活性

尿素、β-巰基乙醇

去除尿素、β-巰基乙醇非折疊狀態(tài),無活性說明:只要一級結(jié)構(gòu)未破壞,就可能恢復(fù)到原來的三級結(jié)構(gòu)和功能,當(dāng)前72頁,總共103頁。

(二)一級結(jié)構(gòu)改變,功能也隨之改變當(dāng)前73頁,總共103頁。(三)血紅蛋白一級結(jié)構(gòu)變化與疾病例:鐮刀形紅細胞貧血N-val·his·leu·thr·pro·glu·glu·····C(146)HbSβ肽鏈HbAβ肽鏈N-val·his·leu·thr·pro·val·glu·····C(146)

這種由蛋白質(zhì)分子發(fā)生變異所導(dǎo)致的疾病,稱為“分子病”。當(dāng)前74頁,總共103頁。當(dāng)前75頁,總共103頁。當(dāng)前76頁,總共103頁。二、蛋白質(zhì)的空間結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系(一)血紅蛋白空間結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系血紅蛋白的功能是運輸O2。由于血紅蛋白亞基之間存在大量鹽鍵,使其構(gòu)象呈緊張態(tài),對氧的親和力很低,第一個亞基與O2結(jié)合時,鹽鍵的破壞較難,所需要的能量較多。

當(dāng)前77頁,總共103頁。當(dāng)前78頁,總共103頁。當(dāng)血紅蛋白的一個亞基結(jié)合氧之后引起它的構(gòu)象從緊張態(tài)變成松弛態(tài),其它的鹽鍵也依次破壞,此時破壞鹽鍵所需要的能量也少,構(gòu)象的變化導(dǎo)致血紅蛋白對氧的親和力大大增強,因此第四個亞基結(jié)合氧的能力比第一個大幾百倍。當(dāng)前79頁,總共103頁。(二)蛋白質(zhì)構(gòu)象改變與疾病蛋白質(zhì)構(gòu)象疾病:若蛋白質(zhì)的折疊發(fā)生錯誤,盡管其一級結(jié)構(gòu)不變,但蛋白質(zhì)的構(gòu)象發(fā)生改變,仍可影響其功能,嚴(yán)重時可導(dǎo)致疾病發(fā)生。當(dāng)前80頁,總共103頁。蛋白質(zhì)構(gòu)象改變導(dǎo)致疾病的機理:有些蛋白質(zhì)錯誤折疊后相互聚集,常形成抗蛋白水解酶的淀粉樣纖維沉淀,產(chǎn)生毒性而致病,表現(xiàn)為蛋白質(zhì)淀粉樣纖維沉淀的病理改變。這類疾病包括:人紋狀體脊髓變性病、老年癡呆癥、亨停頓舞蹈病、瘋牛病等。當(dāng)前81頁,總共103頁。瘋牛病中的蛋白質(zhì)構(gòu)象改變瘋牛病是由朊病毒蛋白(PrP)引起的一組人和動物神經(jīng)退行性病變。正常的PrP富含α-螺旋,稱為PrPc。PrPc在某種未知蛋白質(zhì)的作用下可轉(zhuǎn)變成全為β-折疊的PrPsc,從而致病。PrPcα-螺旋PrPscβ-折疊正常瘋牛病當(dāng)前82頁,總共103頁。

正常朊病毒蛋白結(jié)構(gòu)(顯示-螺旋)

朊病毒結(jié)構(gòu)(顯示-片層結(jié)構(gòu))當(dāng)前83頁,總共103頁。

第四節(jié)

蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)當(dāng)前84頁,總共103頁。一、蛋白質(zhì)的兩性解離性質(zhì)蛋白質(zhì)分子除兩端的氨基和羧基可解離外,氨基酸殘基側(cè)鏈中某些基團,在一定的溶液pH條件下都可解離成帶負電荷或正電荷的基團。

蛋白質(zhì)的等電點(pI)當(dāng)?shù)鞍踪|(zhì)溶液處于某一pH時,蛋白質(zhì)分子解離成正、負離子的趨勢相等,即成為兼性離子,凈電荷為零,此時溶液的pH稱為蛋白質(zhì)的等電點。當(dāng)前85頁,總共103頁。蛋白質(zhì)陽離子蛋白質(zhì)兼性離子蛋白質(zhì)陰離子當(dāng)前86頁,總共103頁。在下列各種pH溶液中使清蛋白(pI=4.7)帶正電荷的是()A.pH4.0

B.pH5.0

C.pH6.0

D.pH7.0蛋白質(zhì)是兩性電解質(zhì),當(dāng)其帶負電荷時,溶液的pH為()

A.酸B.pH>pI

C.pH=pI

D.pH<pI當(dāng)前87頁,總共103頁。二、蛋白質(zhì)的高分子性質(zhì)

蛋白質(zhì)屬于生物大分子之一,分子量可自1萬至100萬之巨,其分子的直徑可達1~100nm,為膠粒范圍之內(nèi)。*蛋白質(zhì)膠體穩(wěn)定的因素同種電荷水化膜當(dāng)前88頁,總共103頁。+++++++帶正電荷的蛋白質(zhì)--------帶負電荷的蛋白質(zhì)在等電點的蛋白質(zhì)水化膜++++++++帶正電荷的蛋白質(zhì)--------帶負電荷的蛋白質(zhì)不穩(wěn)定的蛋白質(zhì)顆粒酸堿酸堿酸堿脫水作用脫水作用脫水作用蛋白質(zhì)膠體顆粒的沉淀當(dāng)前89頁,總共103頁。透析當(dāng)前90頁,總共103頁。三、蛋白質(zhì)的變性、復(fù)性與凝固*蛋白質(zhì)的變性:在某些物理和化學(xué)因素作用下,其特定的空間構(gòu)象被破壞,也即有序的空間結(jié)構(gòu)變成無序的空間結(jié)構(gòu),從而導(dǎo)致其理化性質(zhì)改變和生物活性的喪失。當(dāng)前91頁,總共103頁。

造成變性的因素如高溫、高壓、紫外線等;強酸、強堿、重金屬離子及生物堿試劑等。

變性的本質(zhì)——破壞非共價鍵和二硫鍵,不改變蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu)。當(dāng)前92頁,總共103頁。

應(yīng)用舉例:臨床醫(yī)學(xué)上,變性因素常被應(yīng)用來消毒及滅菌。此外,防止蛋白質(zhì)變性也是有效保存蛋白質(zhì)制劑(如疫苗等)的必要條件。

當(dāng)前93頁,總共103頁。若蛋白質(zhì)變性程度較輕,去除變性因素后,蛋白質(zhì)仍可恢復(fù)或部分恢復(fù)其原有的構(gòu)象和功能,稱為復(fù)性(renaturation)。當(dāng)前94頁,總共103頁。

天然狀態(tài),有催化活性

尿素、β-巰基乙醇

去除尿素、β-巰基乙醇非折疊狀態(tài),無活性當(dāng)前95頁,總共103頁。蛋白質(zhì)沉淀在一定條件下,蛋白疏水側(cè)鏈暴露在外,肽鏈融會相互纏繞繼而聚集,因而從溶液中析出。變性的蛋白質(zhì)易于沉淀,有時蛋白質(zhì)發(fā)生沉淀,但并不變性。蛋白質(zhì)的凝固:蛋白質(zhì)變性后的絮狀物加熱可變成比較堅固的凝塊,此凝塊不易再溶于強酸和強堿中。

當(dāng)前9

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