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關(guān)于蛋白質(zhì)的純化與鑒定第一頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三LectureOutline蛋白質(zhì)的分離純化的基礎(chǔ)蛋白質(zhì)的分離純化原則和程序蛋白質(zhì)的含量測(cè)定蛋白質(zhì)純度鑒定蛋白質(zhì)的分離純化方法蛋白質(zhì)層析技術(shù)蛋白層析的主要技術(shù)3/26/20232第二頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三第七部分蛋白層析的主要技術(shù)第三頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三蛋白層析的主要技術(shù)GelFiltrationChromatography(GFC)IonExchangeChromatography(IEXorIEC)AffinityChromatography(AC)HydrophobicInteractionChromatography(HIC)3/26/20234第四頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三I.GelFiltrationChromatography(GFC)第五頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三GelChromatography凝膠過濾(gelfiltration)(Porath,Flodin,1959)分子篩層析(molecularsievechromatography)(Hjertén,Mosbach,1962)排阻層析(exclusionchromatography)(Pedersen,1962)
指混合物隨流動(dòng)相經(jīng)固定相的層析柱時(shí),混合物中各組份按其分子大小不同而被分離的技術(shù)。Gelfiltrationisatechniqueofliquidchromatographywhichseparatesmoleculesaccordingtotheirsizes.第六頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三基本原理凝膠層析的數(shù)理關(guān)系凝膠層析的優(yōu)點(diǎn)凝膠層析的缺點(diǎn)凝膠介質(zhì)凝膠類型的選擇其它條件選擇Gelfiltration第七頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三一、基本原理
樣品固定相流動(dòng)相小分子被延滯小分子大分子較快流出
分子篩效應(yīng)分子大小不同,在凝膠受到的阻滯作用有差異,從而造成各組分在凝膠柱中的遷移速度不同得到分離。第八頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三(一)純化:對(duì)生物大分子的純化。如病毒、蛋白質(zhì)、酶、激素、抗體、核酸和多糖等。應(yīng)用:第九頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三Gelfiltrationpurificationofanenzyme:
SDSanalysisM-LMWmarkers1-Startmaterial2-Poolfromionexchange3-PoolfromHIC4-PoolfromSuperdex75pg4321MM67k43k30k第十頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三(二)分子量的測(cè)定:球形蛋白質(zhì)的洗脫體積主要是由它的分子量決定的,在一個(gè)相當(dāng)?shù)姆肿恿糠秶鷥?nèi),洗脫體積大約是分子量對(duì)數(shù)的線性函數(shù)。用相同形狀的和已知的蛋白質(zhì)作出一條校正曲線,測(cè)定洗脫體積后可從校正曲線得到分子量。第十一頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三Highlyefficientdesaltinginlessthan1minute
(三)溶液的濃縮:加入干膠,溶液的水和小分子被膨脹的凝膠吸收。(四)去除干擾的小分子:脫鹽(鹽可被看作是小分子)、EDTA、生物標(biāo)記等。1020304050secAlbuminNaCl第十二頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三(五)更換緩沖液:為接下來的實(shí)驗(yàn)更換緩沖液體系(六)測(cè)定平衡常數(shù):例如藥物的蛋白結(jié)合率。藥物本身分子量較小,與蛋白結(jié)合后成為分子量較大的物質(zhì),通過凝膠過濾將二者分開。第十三頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三二、凝膠層析的數(shù)理關(guān)系
1、柱床體積(VT)
2、洗脫體積(Ve)即欲分離物質(zhì)通過層析柱洗脫下來所需洗脫液的總體積。3、外水體積(V0)4、內(nèi)水體積(Vi)5、凝膠干體積(Vg)6、分配系數(shù)(Kd)
第十四頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三柱床體積VT凝膠干體積Vg內(nèi)水體積Vi存在于柱床內(nèi)凝膠外面空隙之間的水相體積,相應(yīng)于一般層析法中流動(dòng)相的體積。顆粒內(nèi)部所含水相的體積它可從干凝膠顆粒重量和吸水重量相減求得。凝膠體積以及顆粒內(nèi)外間隙體積的總和。
VT=1/4D2h外水體積V0VT=Vg+V0+Vi數(shù)理關(guān)系VoidvolumeVoVolumeofthegelmatrixVgPorevolumeVi第十五頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三洗脫體積VeVoVeVolumeConcentration第十六頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三
Ve-VoKd=————Vi分配系數(shù)(Kd
):特點(diǎn):(1)與被分離物質(zhì)分子的大小和凝膠顆??紫兜拇笮∮嘘P(guān)(2)與柱的長(zhǎng)短粗細(xì)無(wú)關(guān)
每個(gè)溶質(zhì)分子在流動(dòng)相和固定相之間有一個(gè)特定的分配系數(shù)(Kd)Ve=Vo+KdViKdisdifficulttogetbecauseViisdifficulttomeasure第十七頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三(3)Ve=Vo+ViKd=1分子完全不被排阻完全向凝膠顆粒內(nèi)部擴(kuò)散在兩相分配的比值為1,最后流出.(1)Ve=VoKd=0分子完全被排阻于凝膠顆粒之外全部分布于流動(dòng)相里,最先流出。(2)0<Kd<1Ve=Vo+ViKd為溶質(zhì)以某種程度向凝膠顆粒內(nèi)擴(kuò)散
Kd=0
0<Kd<1
Kd=1洗脫體積第十八頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三
三.凝膠層析的優(yōu)點(diǎn)
1.凝膠是一種不帶電荷的惰性載體,結(jié)構(gòu)穩(wěn)定。凝膠本身不與樣品發(fā)生化學(xué)反應(yīng)。
2.操作條件較溫和。用來分離一些理化性質(zhì)不穩(wěn)定的物質(zhì)。
3.樣品得率高,重復(fù)性好,可進(jìn)行大量樣品的分離純化。4.最快的更換緩沖液第十九頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三四、凝膠層析的缺點(diǎn)1.要求樣品和洗脫液的粘度很低。2.凝膠顆粒網(wǎng)絡(luò)孔徑大小非常有限,所以可被純化的物質(zhì)的分子量范圍受到限制。3.凝膠結(jié)構(gòu)對(duì)某些溶質(zhì)分子具有吸附作用。如芳香族化合物與脂蛋白等。第二十頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三葡聚糖(glucose)瓊脂糖(agarose)聚丙烯酰胺(acrylamide)纖維素(cellulose)五、凝膠介質(zhì)第二十一頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三
1959年P(guān)orath和Flodin合成(商品名為Sephadex)(1)結(jié)構(gòu):基本骨架:葡聚糖(dextran)交聯(lián)劑:3-氯代-1,2-環(huán)氧氯丙烷使葡聚糖之間通過醚鍵交聯(lián)聚合而成的三維空間網(wǎng)狀結(jié)構(gòu)。1.葡聚糖凝膠第二十二頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三(2)特點(diǎn):交聯(lián)度:交聯(lián)劑越多,交聯(lián)度越大,網(wǎng)孔結(jié)構(gòu)越緊密。孔隙愈小,吸水后膨脹也愈小,機(jī)械強(qiáng)度高,分離物質(zhì)的分子量也小。反之,交聯(lián)劑的百分比低,分離物質(zhì)的分子量大?;瘜W(xué)性質(zhì):
穩(wěn)定,不溶于水、鹽、弱酸、堿和一般有機(jī)溶劑,耐熱耐堿不耐強(qiáng)酸第二十三頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三Sephadex的分級(jí)范圍
G10<700G15<1,500G251,000~5,000G501,500~30,000G753,000~70,000G1004,000~150,000G1505,000~400,000G2005,000~800,000吸水性G類的型號(hào)表示每克干凝膠吸水量(ml)x10如G-50
每克干凝膠吸水量為5ml。第二十四頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三由瓊脂制成的線性多糖,由D-半乳糖和3,6-脫水L-半乳糖交替組成。大孔凝膠,工作范圍的下限幾乎是Sephadex的上限,可分離MW40萬(wàn)以上的物質(zhì),可用來分離核酸及病毒瓊脂糖凝膠不帶電荷,不受微生物作用而降解對(duì)實(shí)驗(yàn)條件要求高(溫度<40℃,pH=4.5-9.0)2.瓊脂糖凝膠(商品名為Sepharose,Biogel-A)第二十五頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三型號(hào)
近似的瓊脂糖濃度(%)多糖
蛋白質(zhì)
Sepharose2B
220×106
40×106Sepharose4B45×106
20×106Sepharose6B61×106
4×106第二十六頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三是一種人工合成凝膠,是以丙烯酰胺為單位,由甲叉雙丙烯酰胺交聯(lián)成的,經(jīng)干燥粉碎或加工成形制成粒狀,控制交聯(lián)劑的用量可制成各種型號(hào)的凝膠。使用范圍及效果同葡聚糖凝膠相似,但化學(xué)性質(zhì)較葡聚糖穩(wěn)定,可在pH2-11范圍內(nèi)使用.3、聚丙烯酰胺凝膠第二十七頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三■各種層析膠體:PharmaciaSephadexSepharoseSephacrylSephacelglucoseagaroseglucose+acrylamidecelluloseBio-RadBioGelPBioGelAacrylamideagarose第二十八頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三
1.組分離:當(dāng)兩種成分分子量差距很大時(shí)采用,例如脫鹽。凝膠選擇使高分子量的洗脫體積在外水(Vo),低分子量的洗脫體積接近Vt。脫鹽一般推薦SephadexG-25。2.分級(jí)分離:當(dāng)分離幾種分子量接近的組分時(shí),避免幾種成分的洗脫體積接近Vo或Vt。3.分子量測(cè)定:要使樣品分子量落在選擇性曲線的線性部分及處于校正標(biāo)準(zhǔn)品的中間。一般推薦使用SephacrylS-200superfine,SephacrylS-300superfine或SepharoseCL-6B。六、凝膠類型的選擇第二十九頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三七.其它條件選擇
1.柱的選擇
長(zhǎng)的層析柱分辨率要比短的高。但層析柱長(zhǎng)度不能過長(zhǎng),否則會(huì)引起柱子不均一、流速過慢等實(shí)驗(yàn)上的一些困難。一般柱長(zhǎng)度不超過1m,為得到高分辨率,可以將柱子串聯(lián)使用。2.樣品的選擇:樣品體積占床體積的1-5%,粘度小。
3.洗脫液的選擇:完全不帶電荷的物質(zhì)可以用蒸餾水洗脫。帶電荷的物質(zhì)可以用Tris-HCl、磷酸鹽緩沖液,最重要的要考慮洗脫液對(duì)樣品的作用,如pH、離子強(qiáng)度、清潔劑等,是否會(huì)引起蛋白分解,影響酶、輔酶、激素的活性。第三十頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三
八、凝膠過濾的實(shí)驗(yàn)(一)、凝膠的準(zhǔn)備
Sephadex干粉狀,用前需要膨脹,一般用蒸餾水進(jìn)行,注意不要用電磁攪拌,以免破壞凝膠顆粒。不同類型的凝膠膨脹的時(shí)間不同:
G-25,G-50膨脹過夜
G-75一天
G-100二天
G-200三天在沸水中膨脹可縮短時(shí)間,并可除去氣體。
Sephacryl,Sepharose,SepharoseCL是膨脹好的。第三十一頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三
(二)、裝柱將凝膠懸液調(diào)成大約75%。用負(fù)壓泵脫氣。如果是加熱后或冰箱中取出,要放置達(dá)室溫。層析柱放置在避免過度通風(fēng)和陽(yáng)光直射的地方,防止溫度變化。排掉層析床支持物內(nèi)的氣體。層析柱調(diào)到垂直位置。凝膠懸液要一次倒入柱內(nèi),避免分層。第三十二頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三
(三)、檢查層析柱以藍(lán)葡聚糖2000(2mg/ml)為樣品,觀察色帶在柱內(nèi)洗脫時(shí)移動(dòng)的形狀判斷層析柱的質(zhì)量,同時(shí)其洗脫體積又可作為外水體積。(四)、加樣
1.手工加樣
2.加樣閥加樣要求進(jìn)入凝膠的樣品前緣在同一水平。(五)、洗脫洗脫裝置用蠕動(dòng)泵將洗脫液泵入層析柱。要注意洗脫液的供給,不要走干,一旦走干,層析柱必須重新裝才能使用。(六)、凝膠的清洗凝膠在使用數(shù)次后,一些雜質(zhì)會(huì)吸附到上面,影響分離效果,需清洗后才能恢復(fù)原樣。
Sephadex,,Sepacryl,SepharoseCL可用0.2MNaOH。
Sepharose可用4<pH<9緩沖液及非離子清潔劑。第三十三頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三
(七)、凝膠的儲(chǔ)存和防止微生物生長(zhǎng)使用中的柱子里,因?yàn)橛芯彌_液的不斷流動(dòng),微生物不易生長(zhǎng),未用的柱子和放在容器中的凝膠懸液要采用抗菌劑預(yù)防微生物的生長(zhǎng),抗菌劑必須不與樣品作用。通常用的防腐劑有:疊氮鈉0.02%,三氯丁醇0.05%,硫柳汞0.005%,洗必太0.002%,汞苯鹽(乙酸:硝酸)0.001-0.01%。
Sephadex,,Sephacryl,,Sepharose和SepharoseCL都可以在加防腐劑后以膨脹狀態(tài)儲(chǔ)存。最好在4℃冷藏,但要防止凍結(jié),因?yàn)閮鼋Y(jié)將破壞凝膠顆粒。
Sephadex可以干燥后儲(chǔ)存,干燥的程序是徹底清洗膠,除掉鹽和雜質(zhì),去掉多余的水分以后,先加入稀的乙醇,平衡后,換稍濃一些的乙醇,依次增加乙醇的濃度,最后用96%乙醇,使膠皺縮,布氏漏斗抽慮,60-80℃烘干。第三十四頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三II.IonExchangeChromatographyUsefulatallstagesofpurificationandatallscales第三十五頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三基本原理離子交換劑的類型離子交換劑與緩沖液的選擇應(yīng)用離子交換層析的優(yōu)點(diǎn)IonExchangeChromatography第三十六頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三一、原理用離子交換劑(具有離子交換性能的物質(zhì))作固定相,利用它與流動(dòng)相中的某種離子進(jìn)行可逆的交換性質(zhì)來分離離子型混合物的層析方法。第三十七頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三低鹽高鹽分離結(jié)束第三十八頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三帶電荷不同蛋白在特定pH值下有不同帶電性質(zhì)第三十九頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三離子交換樹脂如何分離蛋白質(zhì)洗脫樹脂與樹脂結(jié)合力第四十頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三二、離子交換劑的類型在惰性載體上引入帶有電荷的活性基團(tuán)(一)按活性功能基團(tuán)帶電荷性質(zhì)不同陽(yáng)離子交換劑——
帶負(fù)電荷,與陽(yáng)離子交換陰離子交換劑——帶正電荷,與陰離子交換?
陰離子交換樹脂對(duì)化學(xué)試劑及熱都不如陽(yáng)離子交換樹脂穩(wěn)定。膠體膠體第四十一頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三陽(yáng)離子交換基強(qiáng)酸性,聚苯乙烯樹脂弱酸性,羧甲基纖維素弱酸性,螯合作用,聚苯乙烯樹脂第四十二頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三陰離子交換基強(qiáng)堿性,聚苯乙烯樹脂弱堿性,二乙氨氨乙基纖維素第四十三頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三
基質(zhì)電荷基團(tuán)反離子商品名纖維素—O—CH2——COO-
·Na+CM-纖維素纖維素-O-(CH2)2-N+H(C2H5)2·Cl-DEAE-纖維素聚苯乙烯—————SO3-·
Na+732陽(yáng)離子樹脂
聚苯乙烯——N+(CH2)4·Cl-717陰離子樹脂第四十四頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三離子交換樹脂離子交換纖維素離子交換凝膠(二)按載體種類不同第四十五頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三1.離子交換樹脂:聚苯乙烯樹脂:苯乙烯二乙烯苯聚苯乙烯母體交聯(lián)劑第四十六頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三離子交換樹脂的性質(zhì)1、一般離子交換劑的特性多孔性:疏松、多孔網(wǎng)狀,活性基團(tuán)在網(wǎng)孔內(nèi)不溶性:不溶于稀酸、稀堿、有機(jī)溶劑穩(wěn)定性:離子交換性:具相當(dāng)數(shù)量的可交換或帶電基團(tuán)第四十七頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三Dowex100149mDowex50297mDowex20840m
2、交聯(lián)度:
合成樹脂時(shí)所用的交聯(lián)劑在原料總重量中所占的百分比交聯(lián)度越大樹脂的網(wǎng)孔越小膨脹性小交換量少交聯(lián)度越小樹脂的網(wǎng)孔越大膨脹性大交換量大
膨脹性增加易引起樹脂的機(jī)械變形破損第四十八頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三陽(yáng)離子交換樹脂
強(qiáng)酸型磺酸基
-SO3-H+
中等酸型磷酸根
-O-PO2H2
亞磷酸根-O-POH2
弱酸型羧基-COOH陰離子交換樹脂
強(qiáng)堿季胺基團(tuán)[-N+(CH3)3]
弱堿叔胺、仲胺、伯胺基團(tuán)
可引入的解離基團(tuán)第四十九頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三操作過程:
1.裝柱;
2.離子交換;
3.洗脫第五十頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三三、離子交換劑與緩沖液的選擇(一)離子交換劑的選擇必須考慮的影響因素1.陰、陽(yáng)離子交換劑的選擇2.強(qiáng)、弱離子交換劑的選擇3.不同離子型交換劑的選擇4.不同基質(zhì)離子交換劑的選擇第五十一頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三陰、陽(yáng)離子交換劑的選擇測(cè)定pI確定穩(wěn)定pH范圍堿性分子在偏酸性環(huán)境中穩(wěn)定:細(xì)胞色素c
酸性分子在偏堿性環(huán)境中穩(wěn)定:核酸、HCG第五十二頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三離子交換劑的選擇圖第五十三頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三不同離子型交換劑的選擇選用何種類型離子交換劑?取決于離子交換劑對(duì)諸反離子的結(jié)合力。為了提高交換容量,一般應(yīng)選擇結(jié)合力較小的反離子。據(jù)此,強(qiáng)陽(yáng)性和強(qiáng)陰性離于交換劑應(yīng)分別選擇H型和OH型;弱酸性和弱堿性離子交換劑應(yīng)分別選擇Na型和Cl型。第五十四頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三不同基質(zhì)離子交換劑的選擇1.被分離物質(zhì)帶何種電荷2.被分離物質(zhì)分子的大小
大分子物質(zhì)選用凝膠,其次選用纖維素第五十五頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三1、緩沖液pH的選擇
2、緩沖液離子組成的選擇3、緩沖液離子強(qiáng)度的選擇(二)緩沖液的選擇第五十六頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三1、緩沖液pH的選擇
①要求:起始緩沖液能使樣品中有效成分與離子交換劑結(jié)合,洗脫液能使有效成分從離子交換劑上解離下來。②pH值與目標(biāo)物pI的關(guān)系(pH=pI±1)③選用弱陽(yáng)離子交換劑時(shí),pH高于其pK;選用弱陰離子交換劑時(shí),pH低于其pK;第五十七頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三2、緩沖液離子組成的選擇①采用陽(yáng)離子交換劑應(yīng)選用陰離子緩沖液,如:磷酸鹽、醋酸鹽、檸檬酸鹽②采用陰離子交換劑應(yīng)選用陽(yáng)離子緩沖液,如:Tris③緩沖液離子不影響被分離物的活性、測(cè)定、溶解度。第五十八頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三3、緩沖液離子強(qiáng)度的選擇①起始緩沖液能使樣品中有效成分與離子交換劑結(jié)合,一般小于0.1mol/L。②洗脫液能使有效成分從離子交換劑上解離下來,一般0.15mol/L(或采用pH洗脫)。第五十九頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三
原則:所用洗脫液比吸著物質(zhì)具有更活潑的離子或基團(tuán)
改變pH或離子強(qiáng)度
增強(qiáng)洗脫液與離子交換劑的結(jié)合力降低分離物與離子交換劑的結(jié)合力洗脫方式:梯度洗脫(三)洗脫劑的選擇第六十頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三四、應(yīng)用
分離多肽蛋白、氨基酸、核酸及他帶電的生物分子。第六十一頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三五、離子交換層析的優(yōu)點(diǎn)應(yīng)用范圍廣:20種氨基酸中,大部分帶正電或負(fù)電。處理量大,附載系數(shù)高,一步縮小樣品體積很多。去除雜質(zhì)能力強(qiáng),如對(duì)核酸、外毒素、小牛血清中大部分蛋白,及電荷性有差別的蛋白均可去除。分離能力強(qiáng)??煞旁诩兓に嚨娜魏我徊健5诹?yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三III.AffinityChromatography(AC)
親和層析
第六十三頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三親和層析ACAffinitychromatographyisatechniqueofliquidchromatographywhichseparatesbiomoleculesthroughbiospecificinteractions.基本原理分離過程特點(diǎn)應(yīng)用第六十四頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三一、原理生物分子間存在很多特異性的相互作用,它們之間都能夠?qū)R欢赡娴慕Y(jié)合,這種結(jié)合力就稱為親和力。親和層析通過將具有親和力的兩個(gè)分子中一個(gè)固定在不溶性基質(zhì)上,利用分子間親和力的特異性和可逆性,對(duì)另一個(gè)分子進(jìn)行分離純化。第六十五頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三酶:基質(zhì)類似物,抑制劑,輔酶抗體:抗原,病毒,細(xì)胞細(xì)胞:細(xì)胞表面特異蛋白,外源凝集素核酸:互補(bǔ)堿基序列,組蛋白,核酸聚合酶,結(jié)合蛋白激素或藥物:受體,載體蛋白外源凝集素:多糖,糖蛋白,細(xì)胞表面受體,細(xì)胞具有專一性親和力的生物分子對(duì)第六十六頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三DefinitionsinAffinityChromatographyMatrix(基質(zhì)或載體):aninertgeltowhichaligandcanbecoupledLigand(配基):acomponentwhichinteractsspecificallywiththetargetCoupling(偶聯(lián)):covalentattachmentoftheligandtothematrixBinding(結(jié)合):associationbetweentheligandandthetargetMatrixSpecificligand第六十七頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三第六十八頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三(一)載體的選擇1、載體要求:(1)不溶性(2)滲透性:疏松網(wǎng)狀結(jié)構(gòu),有良好的液體流動(dòng)性(3)化學(xué)和機(jī)械性能穩(wěn)定(4)具備大量能被活化的基因(5)抗微生物和酶的侵蝕第六十九頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三2、常用載體(1)纖維素特點(diǎn):價(jià)廉、來源充足纖維性、非均一性限制大分子的摻入非專一性吸附嚴(yán)重用于抗體和酶的純化(2)葡聚糖凝膠特點(diǎn):化學(xué)及物理性質(zhì)穩(wěn)定多孔性比瓊脂糖低第七十頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三
(3)瓊脂糖凝膠濃度商品2%Sepharose2B4%Sepharose4B6%Sepharose6B
凝膠濃度越低結(jié)構(gòu)越疏松即多孔性越高機(jī)械強(qiáng)度越低第七十一頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三(4)聚丙烯酰胺凝膠(5)多孔玻璃特點(diǎn):不受微生物的侵蝕耐酸、堿、有機(jī)溶劑表面非專一性吸附特點(diǎn):物理化學(xué)性質(zhì)穩(wěn)定抗微生物侵蝕能力比瓊脂糖強(qiáng)可供化學(xué)反應(yīng)的酰胺基較多第七十二頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三(二)配基的選擇1、對(duì)于欲純化的物質(zhì)應(yīng)有專一親和力2、必須具備能被修飾的功能基團(tuán)3、配基偶聯(lián)的位置,需不影響與大分子連接的部位。4、親和柱制備首選大分子配基。第七十三頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三以酶和底物為例:E+LELKL=[E][L]/[EL]=[E0-EL][L0-EL]/[EL]E0、L0:起始濃度當(dāng)L0》E0時(shí)KL=[E0-EL][L0]/[EL][EL]=[E0-EL][L0]/KLKd=結(jié)合酶/游離酶=[EL]/[E0-EL]=[L0]/KLKLKL:解離常數(shù)E:酶L:底物EL:復(fù)合物第七十四頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三(三)固相化——將配體以共價(jià)鍵連接于固相基質(zhì)上制成固相化吸附劑載體的排斥效應(yīng)小孔經(jīng)凝膠會(huì)明顯阻止大分子物與配基結(jié)合載體的空間障礙載體影響了配基的空間,特別是小分子配基。需加碳?xì)滏湣笆直邸?,長(zhǎng)度需適中。第七十五頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三二、親和層析的過程1、裝柱和平衡2、上樣、親和吸附3、洗脫無(wú)效洗脫吸附效率不高有效吸附第七十六頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三影響吸附的因素
1、緩沖液離子成份強(qiáng)度、pH、溫度等都有影響。
2、流速盡可能慢,<10ml/cm2/小時(shí)3、上柱樣品用平衡層析柱緩沖液溶解,濃度約20mg蛋白/ml.
4、上樣體積取決于親和力,低則上樣量減少,一般柱床體積的5%。
第七十七頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三
(1)非特異性洗脫法:需改變緩沖液的pH,離子濃度,介電常數(shù)和溫度。a.分段洗脫法:在惰性蛋白質(zhì)流出后,更換緩沖液,包括組成,pH、離子濃度或溫度的改變
b.梯度洗脫法:連續(xù)改變緩沖液濃度,使洗脫能力逐漸加強(qiáng)(2)特殊洗脫:當(dāng)?shù)鞍孜骄o密或上述方法洗脫會(huì)引起失活,可用專一的化學(xué)方法裂解配基與載體的連接鍵,再用透析或凝膠層析法去除配基。洗脫方法第七十八頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三
(3)專一洗脫技術(shù)
a.競(jìng)爭(zhēng)性效應(yīng):用與固定配基相同的游離配基進(jìn)行洗脫。b.陰性洗脫:在雙底物或多底物存在的親和系統(tǒng)中,如果撤掉其中某一底物,使被吸附的大分子解吸附。例:在前導(dǎo)底物100uMNADH存在下,乳酸脫氫酶強(qiáng)烈吸留在固定的丙酮酸類似物上,在洗脫液中不含NADH時(shí),脫氫酶被迅速洗脫。第七十九頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三
已使用過的柱,經(jīng)過再生,去除非特異吸附的雜質(zhì)后,可重復(fù)使用。再生步驟:起始緩沖液重復(fù)平衡一次用高離子強(qiáng)度和低離子強(qiáng)度溶液處理用弱酸或弱堿溶液處理4、親和柱的再生:第八十頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三三、特點(diǎn)1、只需一步純化步驟,非常簡(jiǎn)單2、產(chǎn)物非常純>95%第八十一頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三三、特點(diǎn)3、可從很稀的溶液中純化到所需物質(zhì)4、還可去除已變性或部分降解物質(zhì)5、但本法必須針對(duì)某一分離對(duì)象,制備專一的配基和尋求層析的穩(wěn)定條件,因此親和層析的應(yīng)用范圍受到了一定的限制6、載體較昂貴,機(jī)械強(qiáng)度低,配基制備困難,有的配基本身要經(jīng)過分離純化第八十二頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三四、應(yīng)用1、分離和純化2、分辨化學(xué)或遺傳學(xué)上修飾的酶3、純化親和標(biāo)記的活化中心肽段和蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)研究4、純化人工合成的多肽和蛋白質(zhì)5、解釋酶作用機(jī)理第八十三頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三IV.Hydrophobicinteractionchromatography(HIC)疏水層析第八十四頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三基本原理操作介質(zhì)的選擇配基的選擇疏水層析的影響因素疏水層析的優(yōu)點(diǎn)疏水層析第八十五頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三
疏水層析亦稱疏水作用層析(hydrophobicinteractionchromatography,HIC),它也屬于吸附層析一類,通過表面疏水性的差異來分離蛋白質(zhì)的柱層析方法。一、疏水層析的原理第八十六頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三
不同蛋白質(zhì)表面及內(nèi)部疏水區(qū)的多少、大小、強(qiáng)弱、分布及空間位阻效應(yīng)各不相同,這也是HIC分離蛋白質(zhì)的根本所在。在20種氨基酸中有8種是疏水性氨基酸,其強(qiáng)弱順序?yàn)門yr、Ile、Phe、Pro、Val、Leu、Met、Ala。第八十七頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三第八十八頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三(一)疏水作用蛋白質(zhì)與固定相結(jié)合原理蛋白質(zhì)表面存在的疏水補(bǔ)丁蛋白質(zhì)發(fā)生(局部可逆性)變性時(shí),原本隱藏于分子內(nèi)部的疏水殘基暴露至分子表面疏水層析的特性:即在高鹽濃度下,暴露于分子表面的疏水殘基容易與疏水性固定相結(jié)合洗脫原理
通過降低流動(dòng)相的離子強(qiáng)度,將結(jié)合于固定相的物質(zhì)按結(jié)合能力的大小依次洗脫下來(疏水作用弱的物質(zhì)先被洗脫下來,隨著離子強(qiáng)度的進(jìn)一步降低,結(jié)合能力強(qiáng)的物質(zhì)也被逐漸洗脫)第八十九頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三(二)吸附劑根據(jù)基質(zhì)的性質(zhì)不同分為:1.親水性吸附劑:目前這類吸附劑主要是交聯(lián)瓊脂糖(Sepharose),配體有苯基和辛基化合物。二者耦合而成特點(diǎn):不耐壓,一般僅用于常壓層析系統(tǒng)2.非親水性吸附劑:這類吸附劑的基質(zhì)有硅膠、樹脂等,配體為苯基、辛基和烷基等,二者通過共價(jià)鍵結(jié)合特點(diǎn):耐壓,機(jī)械性能好。不僅適用于常壓層析,特別適用于高壓層析(如HPLC等)第九十頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三二、操作1.制備層析柱2.加樣與洗脫3.層析柱再生第九十一頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三Equilibration1.Equilibration2.Sampleapplication3.Washing4.ElutionEquilibratethecolumnandadjustthesampletobindingconditionsHydrophobicligandGelmatrixWatermolecules第九十二頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三Sampleapplication1.Equilibration2.Sampleapplication3.
Washing4.ElutionGelmatrixProteinsHydrophobicgroups第九十三頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三Washingoutunboundmaterial1.Equilibration2.Sampleapplication3.Washing4.ElutionConc.saltAbsNon-boundproteins第九十四頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三Elution1.Equilibration2.Sampleapplication3.Washing4.ElutionTargetelutesConc.saltAbs第九十五頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三ElutionConc.saltAbs1.Equilibration2.Sampleapplication3.Washing4.ElutionMorestronglyboundproteins第九十六頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三樣品的準(zhǔn)備:往樣品中添加足夠濃度的鹽,使樣品溶液中的鹽濃度達(dá)到與平衡液基本一致,并調(diào)節(jié)樣品溶液的pH使其滿足吸附條件。HIC的樣品體積受樣品中組分濃度和介質(zhì)的結(jié)合容量的影響,對(duì)于稀釋樣品無(wú)需濃縮可以直接加樣第九十七頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三洗脫的方式:
采用降低流動(dòng)相中鹽濃度的方式洗脫(最常用);通過往流動(dòng)相中添加有機(jī)溶劑,如:乙二醇、丙醇、異丙醇等,降低流動(dòng)相極性的方式洗脫(溶劑中穩(wěn)定性良好的物質(zhì))往流動(dòng)相中添加去污劑等,去污劑本身能與介質(zhì)發(fā)生強(qiáng)烈吸附,從而將結(jié)合在其上的目標(biāo)組分置換下來(分離膜蛋白)第九十八頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三洗脫理論:疏溶劑理論:1976年由Sinanoglu等人提出,認(rèn)為由于溶質(zhì)分子有減少其與水接觸的非極性表面的傾向,而增加了與疏水配基結(jié)合的概率。自由能分離理論:1979年Vanoss等人提出,認(rèn)為生物體界面自由能比水低,與配基產(chǎn)生范德華力,這個(gè)引力隨溶液鹽析能力的改變而改變。熵分離理論:1984年Regnier提出,認(rèn)為高鹽溶液中,蛋白質(zhì)疏水區(qū)域的鄰近分子是有序排列,疏水部分易于配基結(jié)合,減弱了水分子排列的有序度,表面水分子被排斥開,使體系熵增加。第九十九頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三三、介質(zhì)的選擇主要有多糖類如瓊脂糖、纖維素和人工合成聚合物類如聚苯乙烯、聚丙烯酸甲酯類。其中,半剛性的瓊脂糖類凝膠仍是應(yīng)用最廣泛的疏水介質(zhì);
近年來研制超大瓊脂糖(superporous),在擴(kuò)散孔的基礎(chǔ)上增加了對(duì)流孔,在流速較高的條件下獲較好的分辨率;殼聚糖具有良好的生物相容性和化學(xué)穩(wěn)定性,近年來在疏水層析中也得到了應(yīng)用。
第一百頁(yè),共一百一十頁(yè),編輯于2023年,星期三介質(zhì)的再生、貯存再生:常規(guī)用蒸餾水清洗,如有疏水性很強(qiáng)的物質(zhì)如脂類、變性蛋白等牢固結(jié)合在介質(zhì)上,則需合適的清洗劑進(jìn)行清洗,NaOH溶液是其中常用的一種清洗劑,它在清洗層析柱的同時(shí)還能使微生物鈍化失活起到消毒的效果。此外,促溶鹽類的水溶液也是良好的清洗劑。貯存:一般懸浮在20%的乙醇中,如在水溶液體系中保存,則需添加一定量的防腐劑,以防止微生物的生長(zhǎng)。
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