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關(guān)于蛋白質(zhì)的分離純化與定性定量分析第一頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三什么是蛋白質(zhì)的分離純化分離:將蛋白質(zhì)混合物分成單一的蛋白成分。純化:得到單一蛋白的純品。第二頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三為什么要純化蛋白質(zhì)?研究特定蛋白質(zhì)的生物學(xué)功能(酶、生物活性蛋白,etc)制備抗體蛋白質(zhì)晶體學(xué)研究研究蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用第三頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三怎樣純化蛋白質(zhì)?生化學(xué)家根據(jù)特定蛋白質(zhì)與其他蛋白質(zhì)的性質(zhì)差異,來分離或純化它??扇苄?、等電點(diǎn)、分子大小、生物學(xué)性質(zhì)……可溶性:硫酸銨沉淀等電點(diǎn):離子交換層析分子大?。耗z過濾層析生物學(xué)性質(zhì):親和層析第四頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三蛋白質(zhì)純化的基本設(shè)計(jì)原則原料應(yīng)易得到,并盡可能富含目的蛋白;應(yīng)有特異性的蛋白質(zhì)檢測(cè)方法(最重要的因素,決定了純化能否成功);分級(jí)分離,先粗后細(xì);純化條件盡量溫和,避免蛋白失活。第五頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三蛋白質(zhì)的檢測(cè)方法蛋白質(zhì)的活性檢測(cè)方法:必須快,必須是特異性的蛋白質(zhì)的免疫學(xué)檢測(cè)方法:western-blot,前提是有特異的抗體第六頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三分離純化的一般程序前處理(取決于采用的材料)動(dòng)物材料處理:剔除結(jié)締組織和脂肪組織種子處理:去種皮,有機(jī)溶劑脫脂動(dòng)物細(xì)胞破碎:勻漿器、超聲波處理植物組織:研磨,纖維素酶細(xì)菌破碎:超聲波,溶菌酶如果蛋白質(zhì)定位于某一細(xì)胞器,可用差速離心法將其分離。第七頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三相對(duì)離心力/×g時(shí)間/min沉降的組分1
0005真核細(xì)胞4
00010葉綠體、細(xì)胞碎片、細(xì)胞核15
00020線粒體、細(xì)菌30
00030溶酶體、細(xì)菌細(xì)胞碎片100
0003~10h核糖體第八頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三第九頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三粗分級(jí)分離(rough
fractionation)獲得蛋白質(zhì)提取液后,用一定方法,將蛋白質(zhì)與其它雜蛋白分離開來。常用方法:鹽析、等電點(diǎn)沉淀、有機(jī)溶劑分級(jí)分離等特點(diǎn):簡(jiǎn)便、處理量大、既能除去大量雜質(zhì)(包括脫鹽),又能濃縮蛋白質(zhì)溶液。第十頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三細(xì)分級(jí)分離(fine
fractionation)主要方法:層析:凝膠過濾、離子交換層析、吸附層析、親和層析等
第十一頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三1.
蛋白質(zhì)的層析分離第十二頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三層析(chromatography)chrome意為“色彩”,graphy源自希臘文,意為“寫”?!皩游觥本褪恰吧V”。層析最早由俄國(guó)植物學(xué)家Цвет于1903年創(chuàng)造,1941年英國(guó)學(xué)者M(jìn)artin和Synge提出分配層析,此后這種方法得到很大的發(fā)展。層析是利用物質(zhì)在固定相與流動(dòng)相之間不同的分配比例,達(dá)到分離目的的技術(shù)。第十三頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三固定相:固定相是層析的基質(zhì)。通常是固體(如吸附劑,凝膠,離子交換劑等),能與待分離的化合物進(jìn)行可逆的吸附,溶解,交換等作用。流動(dòng)相:在層析過程中,推動(dòng)固定相上待分離的物質(zhì)朝著一個(gè)方向移動(dòng)的液體、氣體等,都稱為流動(dòng)相。柱層析中一般稱為洗脫劑,薄層層析時(shí)稱為展層劑。第十四頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三按操作形式不同分類:柱層析:將固定相裝于柱內(nèi),使樣品沿一個(gè)方向移動(dòng)而達(dá)到分離。紙層析:用濾紙做液體的載體,點(diǎn)樣后,用流動(dòng)相展開,以達(dá)到分離鑒定的目的。薄層層析:將適當(dāng)粒度的吸附劑鋪成薄層,以紙層析類似的方法進(jìn)行物質(zhì)的分離和鑒定。
紙層析和薄層層析主要適用于小分子物質(zhì)的快速檢測(cè)分析和少量分離制備,通常為一次性使用;柱層析是常用的層析形式,適用于樣品分析、分離。生物化學(xué)中常用的凝膠層析、離子交換層析、親和層析、高效液相色譜等都通常采用柱層析形式。第十五頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三第十六頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三怎樣純化蛋白質(zhì)?生化學(xué)家根據(jù)特定蛋白質(zhì)與其他蛋白質(zhì)的性質(zhì)差異,來分離或純化它??扇苄?、等電點(diǎn)、分子大小、生物學(xué)性質(zhì)……可溶性:硫酸銨沉淀等電點(diǎn):離子交換層析分子大?。耗z過濾層析生物學(xué)性質(zhì):親和層析第十七頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三1.離子交換層析離子交換層析利用物質(zhì)的電荷與層析載體(離子交換劑)電荷之間的相互作用而達(dá)到分離純化的目的,屬于吸附層析。離子交換層析的固定相稱為離子交換劑,由基質(zhì)和基團(tuán)兩部分組成?;|(zhì):纖維素、瓊脂糖、葡聚糖、苯乙烯-二乙烯苯等高分子聚合物;基團(tuán):共價(jià)結(jié)合在基質(zhì)上的帶電基團(tuán),可分為正電基團(tuán)和負(fù)電基團(tuán)。第十八頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三第十九頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三Ion-ExchangechromatographyIfpHmobilephase=7.2
Thenchargeoftheproteins:(-)(-)(+)(+)--++++++++------++++++++++++Anionexchangecolumn=+charged第二十頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三IncreasedsaltconcentrationIon-Exchangechromatography--+++++++--Na+Na+Na+Na+Na+Na+++++++Cl-Cl-Cl-Cl-Cl-Cl-++++++------Na+Na+Na+第二十一頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三基本操作過程樣品制備,裝柱與平衡上樣(樣品溶解于A液中)洗脫:穿透峰,洗脫峰收集、鑒定第二十二頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三離子交換層析有兩種洗脫方式分步洗脫:用間斷地遞增的不同離子強(qiáng)度的流動(dòng)相分次洗脫樣品蛋白的方法;梯度洗脫:連續(xù)改變流動(dòng)相離子強(qiáng)度的方法。目前隨著層析的自動(dòng)化,梯度洗脫成為大多數(shù)情況下的首選方案。第二十三頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三分步洗脫第二十四頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三梯度洗脫第二十五頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三2.凝膠過濾層析利用分子量不同的蛋白質(zhì),通過凝膠分子篩時(shí)速度不同來分離蛋白質(zhì)的方法。固定相:凝膠顆粒(gel
bead),多孔的網(wǎng)狀結(jié)構(gòu),其網(wǎng)孔決定了凝膠的分級(jí)分離范圍,即能被該凝膠分離的蛋白質(zhì)混合物的Mr范圍,如SephadexG-50的分離范圍是1500~30000。常用的凝膠有Sephadex、Sepharose、Sephacryl、Superdex等。第二十六頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三Size-exclusionchromatography第二十七頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三Size-exclusionchromatographyAbsorbanceat280isusedtoidentifyprotein-containingfractions.Youcanalsoperformanenzymespecificassay.第二十八頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三要根據(jù)待分離物質(zhì)的分子量,選擇特定的凝膠過濾基質(zhì);凝膠過濾層析不僅可用于親水性分子的分離,也可用于疏水性分子的分離,當(dāng)用于疏水性分子分離時(shí),該類層析往往被稱為“凝膠通透層析”;凝膠過濾層析可提供樣品的分子量信息;凝膠過濾的上樣量一般在柱床體積的1~5%;凝膠過濾的樣品濃度越大越好,但一般不要超過100mg/ml。凝膠過濾的注意事項(xiàng)第二十九頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三第三十頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三3.親和層析以樣品的生物活性為依據(jù)的分離方法。生物分子的特點(diǎn)是有專一的活性,如酶與底物的結(jié)合,抗原與抗體,激素與受體,糖與凝集素……等。將上述作用體系的一方連接到層析基質(zhì)上,使之固定化,就有可能分離純化專一作用的另一方。第三十一頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三AffinitychromatographyMakesuseofspecificbindinginteractionsbetweenmolecules1-Incubatecrudesamplewiththeimmobilizedligand2-Washawaynonboundsamplecomponentsfromsolidsupport3-Elute第三十二頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三Commonlyusedaffinitycolumns:Ni2+bindstopolyHistines(example6xHis)Specificantibodies(anti-Flagtag)glutathionebindstoGSTProteinAorGbindsantibodiesAffinitychromatography第三十三頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三Possibleelutionstrategies:pHIonstrenghDenatureCompetitorligandoranalogAffinitychromatography第三十四頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三Ni-NTAcolumnsThehighaffinityoftheNi-NTAresinsfor6xHis-taggedproteinsorpeptidesisdueto:1-thestrengthwithwhichtheseionsareheldtotheNTAresinNTAhasatetradentatechelatinggroupthatoccupiesfourofsixsitesinthenickelcoordinationsphere第三十五頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三2-thespecificityoftheinteractionbetweenhistidineresiduesandimmobilizednickelions第三十六頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三第三十七頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三在各種表達(dá)載體上都帶有各種標(biāo)簽蛋白,如GST-tag、His-tag、V5-tag等,它們不僅可用于鑒定蛋白表達(dá)與否,更可用于與之相連的目標(biāo)蛋白的純化;通過免疫親和層析技術(shù),只需一步,即可純化帶有標(biāo)簽的目標(biāo)蛋白。親和層析是基因工程中最常用的純化技術(shù)第三十八頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三高效與簡(jiǎn)便:一旦固定化配體制備好后,操作使用非常方便;親和層析是高度濃縮的過程;可從樣品中去除大量雜質(zhì);可在活性物質(zhì)中去除理化性質(zhì)幾乎完全相同的但已失活的那些“雜質(zhì)”。親和層析的優(yōu)點(diǎn)第三十九頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三免疫親和層析:將蛋白質(zhì)抗體偶聯(lián)到免疫親和柱可用于抗原蛋白的純化;凝集素親和層析:凝集素是一大類能專一性和糖類和糖復(fù)合物結(jié)合的蛋白質(zhì),固定化凝集素可用于糖蛋白純化;染料親和層析:有多種染料可與各種類型的酶結(jié)合,又不受酶的作用,可用于多種蛋白的分離。親和層析中的三大通用技術(shù)第四十頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三4.疏水層析與反向?qū)游龅鞍踪|(zhì)具有親水與疏水兩重性,如果在層析基質(zhì)上接上疏水的基團(tuán),就能在一定條件下與某些蛋白質(zhì)的疏水基團(tuán)相互作用,使之吸附,而達(dá)到分離純化的目的。一般情況下,是高鹽吸附(1~2M硫酸銨),降低流動(dòng)相的鹽濃度,使樣品洗脫。疏水層析的機(jī)制與離子交換層析正好相反,因此兩者是互補(bǔ)的。第四十一頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三反向?qū)游?,或稱反相色譜,reverse
phase
chromatography,是液相色譜分析中最常用的技術(shù)。當(dāng)反相色譜用于蛋白質(zhì)分離時(shí),其原理與疏水層析基本相同,區(qū)別在于:疏水層析的配基疏水性較弱(苯基等),所以高鹽吸附,低鹽洗脫;反相色譜配基疏水性強(qiáng)(C18等),所以需要使用有機(jī)溶劑洗脫。反向?qū)游雠c疏水層析原理相同第四十二頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三反相色譜分離蛋白質(zhì)的原理第四十三頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三反相色譜是最高效的蛋白質(zhì)層析技術(shù)之一第四十四頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三第四十五頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三2.
蛋白質(zhì)的電泳分離第四十六頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三電泳(electrophoresis)帶電粒子在電場(chǎng)中向與自身電荷相反的電極移動(dòng)的現(xiàn)象稱為電泳。蛋白質(zhì)是兩性電解質(zhì),在不同pH溶液中帶不同電荷,在直流電場(chǎng)中能夠泳動(dòng)。第四十七頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三電泳基本原理蛋白質(zhì)在電場(chǎng)中泳動(dòng)時(shí),受到兩種方向相反的力的作用:電場(chǎng)力F=qE,q為帶電量,E為電場(chǎng)強(qiáng)度摩擦力Ff=fv,f為摩擦系數(shù),v為遷移速度當(dāng)?shù)鞍踪|(zhì)以恒速運(yùn)動(dòng)時(shí),F(xiàn)-Ff=0,即qE=fv,此時(shí):v/E=q/f=q/6r第四十八頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三在一定介質(zhì)中,蛋白質(zhì)的q/f是一個(gè)定值,因此v/E也是定值,它被稱為電泳遷移率,即:=v/E可通過實(shí)驗(yàn)測(cè)定,蛋白質(zhì)的值為0.1×10-4
~1.0×10-4
cm2·V-1·s-1,它是蛋白質(zhì)的特性之一。第四十九頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三電泳的分類自由電泳(移動(dòng)界面電泳)區(qū)帶電泳:在支持物上,蛋白質(zhì)混合物被分離成若干區(qū)帶。穩(wěn)態(tài)電泳:蛋白質(zhì)遷移一段時(shí)間后達(dá)到穩(wěn)態(tài),帶的寬度不再隨時(shí)間而改變。第五十頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三1.聚丙烯酰胺凝膠電泳凝膠由丙烯酰胺(Acr)和甲叉雙丙烯酰胺(bis)經(jīng)共聚合而成,此過程在TEMED和過硫酸銨催化下進(jìn)行。Acr在AP和TEMED的作用下形成單鏈,隨后通過bis的作用交叉互聯(lián)形成網(wǎng)狀結(jié)構(gòu),聚合成凝膠。凝膠的孔徑可在較寬范圍內(nèi)變化,以迎合不同的分離需要。第五十一頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三第五十二頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三根據(jù)凝膠的均勻性(孔徑、pH)可分為連續(xù)與不連續(xù)兩類;根據(jù)是否加蛋白質(zhì)變性劑,可分為變性與非變性兩類;根據(jù)是否加還原劑2-巰基乙醇或DTT,可分為還原與非還原兩類;還可根據(jù)電泳裝置的不同,分為圓盤電泳和平板電泳。PAGE的分類第五十三頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三平板PAGE第五十四頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三不連續(xù)平板PAGE,是使用最廣泛的蛋白質(zhì)電泳技術(shù),它由濃縮膠與分離膠兩部分組成。不連續(xù)PAGE有很高的分辨力,因?yàn)樗幸韵氯N效應(yīng):濃縮效應(yīng)電荷效應(yīng)分子篩效應(yīng)不連續(xù)PAGE第五十五頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三制備凝膠樣品電泳目的蛋白檢測(cè)基本操作第五十六頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三染色法:考馬斯亮藍(lán)染色法(多種類型可選)、銀染法;活性檢測(cè)法:適用于NativePAGE,其中蛋白質(zhì)保持天然活性,可用酶學(xué)方法檢測(cè);免疫印跡法:用特異性抗體檢測(cè)蛋白質(zhì)的技術(shù)。PAGE的檢測(cè)方法多種多樣第五十七頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三2.等電聚焦電泳根據(jù)蛋白質(zhì)的等電點(diǎn)進(jìn)行分離的一種技術(shù)。基本原理:利用兩性電解質(zhì)載體形成一個(gè)連續(xù)而穩(wěn)定的線性pH梯度,使pH從正極到負(fù)極逐漸增加。蛋白質(zhì)分子在偏離其等電點(diǎn)的pH位置帶電,因此在電場(chǎng)中可以移動(dòng);當(dāng)?shù)鞍踪|(zhì)移動(dòng)到pH等于pI位點(diǎn),其靜電荷為0,在電場(chǎng)中不再移動(dòng),據(jù)此可將不同pI的蛋白質(zhì)分離。第五十八頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三第五十九頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三優(yōu)點(diǎn)樣品加樣位置和體積不受限制;分辨率高于其它類型電泳;可測(cè)定pI值;缺點(diǎn)樣品在pI區(qū)域易沉淀,為增加樣品溶解度,可以在膠中加入尿素,但導(dǎo)致蛋白質(zhì)失活;樣品前處理麻煩。等電聚焦的優(yōu)缺點(diǎn)第六十頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三3.雙向電泳將等電聚焦技術(shù)與SDS技術(shù)組合起來的新技術(shù),是目前分離蛋白質(zhì)混合物最強(qiáng)大的技術(shù),也是蛋白質(zhì)組學(xué)研究的重要技術(shù)?;静襟E:第一相等電聚焦后,在等電聚焦的垂直的方向進(jìn)行第二相SDS。第六十一頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三pH3------10(1)
IEF等電聚焦電泳(2)SDS(3)染色脫色第六十二頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三考馬斯亮藍(lán)銀染第六十三頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三可綜合利用層析和電泳分離純化蛋白質(zhì)第六十四頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三第六十五頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三蛋白質(zhì)的濃縮超濾法使用特制薄膜對(duì)溶液中的溶質(zhì)分子進(jìn)行選擇性過濾的技術(shù)。常用離心力使蛋白質(zhì)透過濾膜,而使蛋白質(zhì)截留在膜內(nèi)。第六十六頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三冷凍干燥法在冷凍狀態(tài)下使樣品中水分升華而濃縮蛋白質(zhì)的技術(shù),保持蛋白質(zhì)構(gòu)象的最好方法。注意:必須保證蛋白質(zhì)始終處于冷凍狀態(tài)(在-70℃冰箱預(yù)冷),為提高溶解度可加賦形劑(右旋糖酐、甘露醇等)。第六十七頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三吸收法采用吸水劑直接吸去蛋白質(zhì)溶液中的水。PEG、蔗糖、凝膠干粉等。沉淀法硫酸銨、PEG、有機(jī)溶劑沉淀;免疫沉淀。第六十八頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三3.
蛋白質(zhì)的含量測(cè)定第六十九頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三蛋白質(zhì)的含量測(cè)定目前蛋白質(zhì)的直接定量分析技術(shù)只能測(cè)定樣品的總蛋白含量;目前沒有任何方法能直接分析樣品中某一特定蛋白成分的含量;最常用的蛋白定量方法是比色法,包括Bradford(考馬斯亮藍(lán))、BCA法、紫外分光光度法等。第七十頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三1.Lowry法1951年Lowry在Folin酚試劑法和雙縮脲法的基礎(chǔ)上建立原理:第一步反應(yīng):在堿性溶液中蛋白與Cu2+反應(yīng)形成紫紅色的絡(luò)合物;第二步反應(yīng):酚試劑(磷鉬酸和磷鎢酸混合液)與蛋白質(zhì)芳香族氨基酸反應(yīng)呈深藍(lán)色。第七十一頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三優(yōu)點(diǎn):同時(shí)分析多個(gè)樣品,簡(jiǎn)便;靈敏度提高;避免酚試劑局限于色氨酸和酪氨酸所造成的蛋白質(zhì)含量測(cè)定偏差。缺點(diǎn):要求溶液完全溶解透明;酚試劑在堿性溶液中穩(wěn)定性差,導(dǎo)致測(cè)定誤差;反應(yīng)受多種物質(zhì)干擾。第七十二頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三2.Bradford法由Bradford等人于1976年建立。基本原理:考馬斯亮藍(lán)G-250在一定條件下可與蛋白質(zhì)結(jié)合,導(dǎo)致其顏色從紅色變?yōu)樗{(lán)色,最大光吸收峰從465nm移至595nm,其吸收度與蛋白質(zhì)濃度成正比。目前絕大多數(shù)公司都提供基于此原理的蛋白質(zhì)定量試劑盒。第七十三頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三優(yōu)缺點(diǎn)優(yōu)點(diǎn):操作簡(jiǎn)便,配合酶標(biāo)儀,可同時(shí)測(cè)定多個(gè)樣品;可測(cè)定低達(dá)25g/ml的蛋白質(zhì)樣品;對(duì)干擾劑不敏感;缺點(diǎn):染料主要結(jié)合蛋白質(zhì)的疏水區(qū),因此不同組成的蛋白質(zhì)與染料的結(jié)合比例不同。第七十四頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三3.BCA法原理:第一步,在堿性溶液中,蛋白質(zhì)與Cu2+反應(yīng)形成復(fù)合物;第二步,BCA試劑與該復(fù)合物反應(yīng),生成深紫色化合物,在562nm處有吸收峰。優(yōu)點(diǎn):操作簡(jiǎn)便,線性范圍20~2000g/ml;有試劑盒出售。第七十五頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三4.紫外分光光度法原理:蛋白質(zhì)中的Trp、Tyr在280nm有特征性吸收;肽鍵在215nm附近有特異吸收。可通過測(cè)定該波長(zhǎng)的光吸收度,計(jì)算蛋白質(zhì)濃度。C=A/KL,其中A為吸光度,K為摩爾消光系數(shù),L為光程。K值可通過各種方法得到(包括軟件分析等)。第七十六頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三優(yōu)缺點(diǎn)優(yōu)點(diǎn):操作簡(jiǎn)便,且敏感度高(20g/ml);樣品不損失,測(cè)定后可繼續(xù)使用。缺點(diǎn):核酸可干擾測(cè)定結(jié)果;不同蛋白質(zhì)芳香族氨基酸含量變動(dòng)較大。第七十七頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三5.
凱氏定氮法1883年,丹麥化學(xué)家Kjeldahl建立,基于蛋白質(zhì)的含氮量在16%左右。蛋白質(zhì)+硫酸→CO2+H2O+NH3→硫酸銨+強(qiáng)堿→氨優(yōu)點(diǎn):適用樣品廣泛,結(jié)果可靠缺點(diǎn):樣品中非蛋白態(tài)氨影響測(cè)定值;蛋白質(zhì)氨基酸有偏差時(shí)(大量堿性氨基酸、酰胺、小分子量氨基酸)誤差較大;操作繁瑣。第七十八頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三4.
蛋白質(zhì)分子量的測(cè)定第七十九頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三1.SDS測(cè)定分子量基本原理:SDS可以破壞蛋白質(zhì)中的疏水鍵和氫鍵,并按一定比例(1g蛋白質(zhì)結(jié)合1.4gSDS)和蛋白質(zhì)組成復(fù)合物,使蛋白質(zhì)帶的負(fù)電荷的量遠(yuǎn)遠(yuǎn)超過其本身的電荷量,并與蛋白質(zhì)的分子量成正比。2-巰基乙醇破壞了蛋白質(zhì)二硫鍵,使蛋白質(zhì)呈橢圓棒形,其軸長(zhǎng)與分子量成正比。=q/f=q/6r,所有蛋白質(zhì)的遷移率都相同。第八十頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三在SDS中遷移的蛋白質(zhì)的分子量與電泳遷移率的關(guān)系符合下述公式:lg
Mr=lgK-bm=K1-bm其中Mr為蛋白質(zhì)相對(duì)分子量,K、K1為常數(shù),b為斜率,m為遷移率。注意:此公式也適用于核酸在瓊脂糖凝膠中的遷移第八十一頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三第八十二頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三第八十三頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三在半對(duì)數(shù)坐標(biāo)紙上做出標(biāo)準(zhǔn)曲線注意:標(biāo)準(zhǔn)曲線的斜率會(huì)根據(jù)所用凝膠濃度而發(fā)生微小的改變。第八十四頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三2.凝膠過濾層析法測(cè)定分子量蛋白質(zhì)在凝膠過濾層析柱中的洗脫體積Ve,與其分子量的關(guān)系如下式所示:lg
Mr=K1-K2
Ve在實(shí)驗(yàn)中,只要測(cè)得幾種蛋白質(zhì)分子量標(biāo)準(zhǔn)物的Ve,并以它們的lg
Mr對(duì)Ve作圖得一直線,再測(cè)出樣品的Ve,即可從圖中得到樣品的分子量。第八十五頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三SDS與凝膠過濾法是互補(bǔ)的凝膠過濾法測(cè)得的是蛋白質(zhì)四級(jí)結(jié)構(gòu)(如果它有的話)的分子量;SDS測(cè)得的是蛋白質(zhì)亞基的分子量;在有2-巰基乙醇(或DTT)存在時(shí),SDS可測(cè)得蛋白質(zhì)每條多肽鏈的分子量。綜合應(yīng)用這兩種方法,可得到待測(cè)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的許多信息。第八十六頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三例如:凝膠過濾法得到的蛋白質(zhì)分子量:180kDSDS(不加還原劑)結(jié)果:45kDSDS(加還原劑)結(jié)果:兩條蛋白帶(15kD和30kD)則結(jié)論是:該蛋白質(zhì)由4個(gè)相同的亞基組成,每個(gè)亞基由兩條多肽鏈經(jīng)二硫鍵連接而成,兩條多肽鏈的分子量分別為15kD和30kD。第八十七頁(yè),共一百頁(yè),編輯于2023年,星期三
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