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文檔簡介
2、組:泛指一個(gè)有生命體、或細(xì)胞器的全部遺傳物質(zhì);在真核生物,組是指一套(單倍體3、組學(xué):指從組水平研究遺傳的學(xué)科4、C值:通常是指一種生物單倍體組DNA的總量,在真核生物中,C值一般隨著生物的進(jìn)化而增加,高等生5、C值:指一個(gè)有機(jī)體的C值和其編碼能力缺乏相關(guān)性6、RNA組學(xué)對(duì)細(xì)胞中全部RNA分子的結(jié)構(gòu)與功能進(jìn)行系統(tǒng)的研體水平闡明RNA的生物學(xué)意義即為RNA組8、轉(zhuǎn)錄組學(xué):就是在組學(xué)后新興的一門學(xué)科,即研究細(xì)胞在某能狀態(tài)下所含mRNA的類型與拷貝數(shù)。即研,10酶的活性單位:在特定的條件下,111為1個(gè)酶的單位(國際單位IU)。11、酶的比:酶的與蛋白質(zhì)的量相聯(lián)系的1種單位。如每mg酶蛋白所具有的酶(單位/mg蛋白),每ml酶制劑含有的酶(單位/m1),或每g酶制劑具有的單位(單位/g)等。對(duì)同一種酶來講,比12、PH:pHpH 蛋白質(zhì)組:由一個(gè)組所表達(dá)的全部相應(yīng)的蛋白質(zhì),同一組在不同細(xì)胞、不同組織中的表達(dá)情況各不相同;在空間和時(shí)間上動(dòng)態(tài)變化。16、蛋白質(zhì)組學(xué):從整體的角度分析細(xì)胞內(nèi)動(dòng)態(tài)變化的蛋白質(zhì)組成、結(jié)構(gòu)、表達(dá)水平與修飾狀態(tài),了解蛋白質(zhì)之間的相互作用與聯(lián)系,揭示蛋白質(zhì)功能與細(xì)胞生命活動(dòng)規(guī)律。應(yīng)用各種技術(shù)來研究蛋白質(zhì)組的一門新興科、電場(chǎng)下對(duì)蛋白質(zhì)進(jìn)行等電聚焦(IEF),再在第一向垂直方向上進(jìn)行第二向SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳SDS)。 生物:通過將大量的特異性分子固定到固相支持物上,再與標(biāo)記的樣品分子進(jìn)行雜交,通過檢每個(gè)分子19、技術(shù):通過微陣列技術(shù),將高密度DNA片段陣列通過高速機(jī)器人或原位合成方式以一定的順序使20、生物信息學(xué):是一門交叉科學(xué),它包含了生物信息的獲取、加工、、分配、分析、解釋等在內(nèi)的所有(HGP,21、RFLP:用于分析相關(guān)多態(tài)性的技術(shù)。即用同一種限制性內(nèi)切酶,完全酶切來源于同一物種不同的基DNA,DNA22、SNP:DNADNA的某一位點(diǎn)處的核苷酸,A、T、G、C都有可能出現(xiàn)而且概率均大于1%,稱之。SNP最多四種,但人類組很大,平均每1000對(duì)就有一個(gè)。SNPDNA EST:從互補(bǔ)DNA(cDNA)分子所測(cè)得部分序列的短段DNA(通常300~500bp)?;驹恚旱鞍踪|(zhì)推測(cè)mRNA的序列,mRNA反轉(zhuǎn)錄為cDNA,然后利用其與所列進(jìn)行雜交,鑒別出與轉(zhuǎn)錄有關(guān)的。組可由DNA組成,也可由RNA組成,但不能共存于同一。DNA:多數(shù)為雙鏈(ds)、環(huán)狀或線性;RNAmRNA。二、試述原核組結(jié)構(gòu)與功能的特點(diǎn)色體。細(xì)菌DNA在胞內(nèi)形成一個(gè)致密區(qū)域,即類核(nucleoid,類核無核膜將之與胞漿分開。結(jié) 無現(xiàn)象 在原核生物組中含有編碼同工酶的在不同原核生物組中GC含量變化很大除細(xì)菌外,還有能自主的雙鏈環(huán)狀DNA分子,稱為質(zhì)粒。3、不存在子結(jié)構(gòu),功能相關(guān)分散在不同的上。都由一個(gè)結(jié)構(gòu)與相關(guān)的調(diào)控區(qū)組成,轉(zhuǎn)mRNA<103子使外顯子拼接,才能形成成mRNA。7、功能相關(guān)的構(gòu)成各種,它們可串聯(lián)在一起,亦可相距很遠(yuǎn),但即使串聯(lián)在一起的成簇的也是分8、組中也存在一些可移動(dòng)的遺傳因素,這些DNA順序并無明顯生物學(xué)功能,似乎為自己的目的而組織,故有自私DNA之稱,其移動(dòng)多被RNA介導(dǎo)(如在哺乳動(dòng)物及人類組中發(fā)現(xiàn)的逆轉(zhuǎn)座子,也有被DNA介導(dǎo)的(如在果蠅DNA。四、試述人類組結(jié)構(gòu)特點(diǎn)3、編碼序列只占組總DNA量的5%以下,非編碼區(qū)占95%以上,大量為重復(fù)序列。構(gòu)建BAC克隆;限制性酶處理獲得;根據(jù)方法組建BAC克隆群;根據(jù)STS標(biāo)記,將BAC克隆群標(biāo)定在物理圖上;每個(gè)BAC克隆內(nèi)部采用鳥槍法,組裝;將BAC插入順序與BAC克隆 群六、試述RNA研究領(lǐng)域有何新發(fā)現(xiàn)完全沒有蛋白質(zhì)的電子云存在。說明肽健的形成是由rRNA2、RNAФ29RNA(pRNA)裝配成分子馬達(dá),依賴此分子馬達(dá)的轉(zhuǎn)動(dòng),將噬菌體DNA裝入外殼。3、RNA具調(diào)控功能:①女性Xist編碼不表達(dá)蛋白質(zhì)的RNA,它與2條X中的一條結(jié)合,使其失活。②細(xì)胞時(shí),DNA每一次,端粒DNA縮短點(diǎn),直到端粒全部。此時(shí)細(xì)胞再也不能,??烧f是端粒RNA,控制了細(xì)胞的和的發(fā)生。4、RNA調(diào)控遺傳信息:通過"再編碼"的方式或不同方式的RNA剪接,-種可在不同的發(fā)育分化階段、不同的生理病理?xiàng)l件或不同的細(xì)胞、組織中合成不同的蛋白質(zhì)。RNA編輯是以另一RNA為模板來修飾mRNA前體,可以給mRNA前6、RNA攜帶遺傳信息:HIV(、丙肝(肝癌)等是RNA8、組研究中的“”可能是RNA七、試從結(jié)構(gòu)特點(diǎn)及作用機(jī)制比較siRNA和miRNA的差異前 內(nèi)源或外源長雙鏈RNA誘導(dǎo)內(nèi)源發(fā)夾環(huán)結(jié)構(gòu)的轉(zhuǎn)產(chǎn) 產(chǎn)結(jié) 雙鏈分功 降解 八、試比較轉(zhuǎn)錄組和組的區(qū)別40%左右。代謝物的種類要遠(yuǎn)小于和蛋白的數(shù)目,每個(gè)生物體中代謝產(chǎn)物大103數(shù)量級(jí),細(xì)菌組中幾千導(dǎo)致代謝物的化學(xué)復(fù)雜性。技術(shù)難題:代謝組學(xué)中的主要技術(shù)難點(diǎn)在于分析物濃度的動(dòng)態(tài)范圍?(ml2)提高的倍數(shù):是表示提純方法有效的程度,比較每一步純化的效率。純化倍數(shù)是指提純前后比之比,pH十二、試述酶測(cè)定中常用的對(duì)照方法。測(cè)定管中產(chǎn)物量須減去照管中產(chǎn)物量是正由酶促應(yīng)所生的產(chǎn)物白管和照管易空管”“”。制劑與酶接觸時(shí)間而增大。按照抑制劑對(duì)酶作用時(shí)選擇性不同,又將不可逆的抑制劑分為專一性和非專一性的。Ks型不可逆抑制劑;是根據(jù)底物的結(jié)構(gòu)設(shè)計(jì)的,具有和底物相似的結(jié)構(gòu),可和相應(yīng)的酶結(jié)合,同時(shí)還帶有一Kcat型不可逆抑制劑;是根據(jù)酶催化過程設(shè)計(jì)的,具有和底物相似的被酶結(jié)合和被酶催化反應(yīng)的性質(zhì),還1、競(jìng)爭(zhēng)性抑制劑(competitiveIESVmKm增大低,KmESISEII和E,Vm,Km一.表達(dá)調(diào)控的基本方式1、組成型表達(dá)(constitutivegene:組蛋白、核糖體蛋白、糖酵解酶(基原表答、基原;持續(xù)性、恒定表達(dá)誘導(dǎo)表達(dá)(induction):在特定環(huán)境因素下,激活蛋白被激活,表達(dá)產(chǎn)物水平增高的表達(dá)。阻遏表達(dá)(repression):在特定環(huán)境因素下,阻遏蛋白被激活,表達(dá)產(chǎn)物水平減少的表達(dá)。組突變:DNA調(diào)控序列突變,使適應(yīng)性表達(dá)轉(zhuǎn)變?yōu)榻M表達(dá),這種突變稱之。3(coordinate順式調(diào)節(jié):調(diào)控蛋白結(jié)合自身的DNA調(diào)控序列,調(diào)節(jié)自身的表達(dá),為分子內(nèi)調(diào)節(jié)方式,稱為順式(cis)反式調(diào)節(jié):調(diào)控蛋白特異識(shí)別、結(jié)合另一的DNA調(diào)控序列,調(diào)節(jié)另一的開啟和關(guān)閉,為分子間的調(diào)節(jié)二.乳糖子表達(dá)調(diào)控機(jī)制CAPGAC↓→cAMP↓→CAPGAC↑→cAMP↑→CAP↑→CAPCAPsite協(xié)調(diào)調(diào)節(jié):低乳糖,低G:CAP能與CAPsite結(jié)合,促進(jìn)表達(dá),但阻遏蛋白與結(jié)合—不表達(dá);低乳糖,高G:CAP與CAPsite結(jié)合少,基礎(chǔ)表達(dá),且阻遏蛋白與結(jié)合—不表達(dá);高乳糖,高G:CAPCAPsite結(jié)合少,基礎(chǔ)表達(dá),阻遏蛋白與別乳糖結(jié)合——基礎(chǔ)表達(dá);高乳糖,低G:CAPCAPsitetrpO色氨酸濃度高:前導(dǎo)序列延長到終止子,核糖體通過1區(qū),終止2區(qū)前,覆蓋2區(qū)。不能形成2/3發(fā)夾結(jié)構(gòu)??梢孕纬?/4發(fā)夾結(jié)構(gòu),轉(zhuǎn)錄終止。Trp結(jié)構(gòu)不表達(dá)。色氨酸濃度低:前導(dǎo)序列翻譯終止在Trp子核糖體不能覆蓋2區(qū)形成2/3發(fā)夾結(jié)構(gòu),不能形成3/4發(fā)夾結(jié)構(gòu),轉(zhuǎn)錄不終止。Trp結(jié)構(gòu)表達(dá)。四.順式作用元件分類及其在真核表達(dá)調(diào)控中的作用::啟動(dòng)子轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)及其上游200bp。啟動(dòng)子元件:7~20bp。分為啟動(dòng)子、啟動(dòng)子上游元件UPE。前者結(jié)合通用轉(zhuǎn)錄因子和RNA聚合酶,決定轉(zhuǎn)錄起點(diǎn)。UPE與轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合,調(diào)節(jié)啟動(dòng)子與通用轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)合,影響RNA聚合酶作用,增強(qiáng)轉(zhuǎn)錄效率。::(enhancer點(diǎn):序列長度:在100~200bp之間多個(gè)短序列組成:對(duì)堿基順序有嚴(yán)格要求序列:8~12bp組成回文結(jié)構(gòu):部分序列的特征。間。③無定位(silncer淋巴細(xì)胞T抗原受體T淋巴細(xì)胞輔助受體CD4/CD8等③有些DNA序列既有增強(qiáng)子作用也有沉默子作用,(insulator沒有正或負(fù)的調(diào)控作用。絕緣子增強(qiáng)子活性五.增強(qiáng)子及其結(jié)構(gòu)和作用特點(diǎn)序列長度:100~200bp多個(gè)短序列組成:對(duì)堿基順序有嚴(yán)格要求序列:8~12bp組成。回文結(jié)構(gòu):部分序列的特征。具有組織特異性或細(xì)胞特異性,一個(gè)可以受一個(gè)以上的增強(qiáng)子調(diào)控?;A(chǔ)轉(zhuǎn)錄因子:每一RNApol啟動(dòng)子都需要的調(diào)控蛋白,又稱通用轉(zhuǎn)錄因子,參與RNApolⅡ轉(zhuǎn)錄的是通用轉(zhuǎn)錄Ⅱ(TFⅡ強(qiáng)子要求有不同的激活蛋白。激活蛋白與增強(qiáng)子結(jié)合的遠(yuǎn)距離作用:DNA鏈結(jié)構(gòu)發(fā)生變化,或成環(huán),使各種(coactivatorsa.活化蛋白(轉(zhuǎn)錄因子)結(jié)合;c.ATPATP,提供能量;甲基化程度與表達(dá)活性呈反比關(guān)系DNADNADNADNADNAH3-H4H3-H4八、siRNAmiRNAsiRNARNaseⅢ(DicerdsRNAsiRNAcomplexRISC5、RISC的解旋酶解開siRNA雙鏈,靶mRNA與正義siRNA進(jìn)行交換,與反義siRNA特異識(shí)別結(jié)合。RNAi有相當(dāng)?shù)男?yīng),而且特異性更好,所需有效濃度更低。目前,體外合成的siRNA已成為研miRNA,屬非蛋白質(zhì)編碼miRNA初級(jí)產(chǎn)物(pri-miRNA):發(fā)夾結(jié)構(gòu)RNA前體(porin(p5雙鏈):胞漿mRNA:RISC中miRNAmRNAmRNA⑶對(duì)信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)分子與細(xì)胞信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)SHSH:Src蛋白同源區(qū),Src蛋白是src表達(dá)的1種膜蛋白,含3個(gè)SHSH1:Tyr22二、信號(hào)分子:cAMP、cGMP、DAG(二?;视?、IP3(1,4,5Ca2+、NO。GGAC、AC-cAMP-PKA→G蛋白耦聯(lián)受體→G蛋白→腺苷酸環(huán)化酶→cAMP→cAMP的蛋白激酶A→調(diào)控蛋白→轉(zhuǎn)錄PLC-IP3/DAG-PKCII三.參與酶偶聯(lián)受體的酶有那些,介導(dǎo)哪些信號(hào)途徑及其轉(zhuǎn)導(dǎo)基本途徑。 蛋白酪氨酸激酶受體信號(hào)傳導(dǎo)途徑EGF→TKR→Ras→MAPKJanus激酶(JAK-STAT途徑) Ras受體酪氨酸激酶(RPTK)結(jié)合信號(hào)分子,形成二聚體,并發(fā)生自磷酸化而活化,活化的RPTKRAS,由活化的RAS引起蛋白激酶的磷酸化級(jí)聯(lián)反應(yīng)。RasGDPGTP的釋放需要鳥苷酸交換因子(GEF,如Sos)SH3結(jié)構(gòu)域,但沒有SH2結(jié)構(gòu)域,因此不能直接和受體結(jié)合,需要接頭蛋白(如Grb2)的連接,接頭蛋白SH2與受體的磷酸酪氨酸殘基結(jié)合,再通過SH3SosSosRas接觸,從而活化RasRasGTPGTP酶活化蛋白(GAP)的參與,使RasGTP水解而失活,GAPSH2結(jié)構(gòu)域可直接與活化的受體結(jié)合。RasRafN端結(jié)構(gòu)域結(jié)合并使其激活,Raf是絲氨酸/蘇氨酸(Ser/Thr)蛋白激酶(又稱活化的Raf結(jié)合并磷酸化另一種蛋白激酶MAPKK,使其活化。MAPKKMAPK的蘇氨酸和酪氨酸殘基使之激活。MAPK為有 原活化蛋白激酶(mitogen-activatedproteinkinase,MAPK),屬絲氨酸/蘇氨酸殘激酶?;罨腗APK進(jìn)入細(xì)胞核,可使許多轉(zhuǎn)錄因子活化,如將Elk-1激活,促進(jìn)c-fos,c-jun的表達(dá)。RPTK-Ras信號(hào)通路可概括如下:配體→RPTK→adaptor→GEF→Ras→Raf(配體→RPTK→adaptor→GEF→Ras→Raf(MAPKKK)→MAPKK→MAPK表JAK-STATJAK:JAKTyrJAKTyr,STATSTATJAKSTATTyrTGF-βTβR-Ⅱ結(jié)絲氨酸/蘇氨酸磷酸化而使TβR-Ⅰ激活,活化的SmadDNA上的Smad結(jié)合元件結(jié)合,激活特定的靶基因。Smad6和Smad7通過Smad2和Smad3Smads轉(zhuǎn)錄復(fù)合物的形成來抑制TGF-β 進(jìn)行等電聚焦(IEF),再在第一向垂直方向上進(jìn)行第二向SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳(SDS)。10~100kD分子量的蛋白質(zhì);高靈敏度和高分辨率;便于計(jì)算機(jī)進(jìn)行圖像分析處理;與質(zhì)MS/MS電泳CE。(M+能提供的信息:12、分子式(樣品的元素組成)345、人機(jī)回答,三個(gè)基本因素:1、在噬菌體PⅢ和PⅧ衣殼蛋白N端插入外源待篩編碼的蛋白,形成的融合蛋白表達(dá)在噬菌體菌體的表面,其編碼、可通過分泌型噬菌體的單鏈DNA推導(dǎo)出來蛋白文庫4、改造和提高蛋白質(zhì)的生物學(xué)和免疫學(xué)特性5、研究新型多肽藥物、和抗體6、研究涉及到蛋(三胞裂解液過柱,先用低鹽溶液洗脫下未結(jié)合的蛋白質(zhì),然后用高鹽溶液或SDS溶液洗脫結(jié)合在柱子上的蛋白一.簡述技術(shù)的概念和主要特點(diǎn)DNA二.試述生物制作方法和分析過程。制作方法:光刻DNA三.簡述的優(yōu)缺點(diǎn)和主要應(yīng)用領(lǐng)域。傳統(tǒng)方法檢測(cè)眾多要經(jīng)歷多次實(shí)驗(yàn)而且自動(dòng)化程度低,因而每次實(shí)驗(yàn)之間是存在系統(tǒng)誤差的可以克。表達(dá)檢測(cè)擬南芥、酵母表達(dá)研究等DNA序列測(cè)定人類組計(jì)劃、雜交等藥物篩選在水平上尋找藥物靶標(biāo)等文庫作圖通過確定克隆的次序從而對(duì)酵母組進(jìn)行作圖。四試述原位光蝕刻合成技術(shù) 在合成堿基單體的5'羥基末端連上一個(gè)光敏保護(hù)5'端保護(hù)的核苷酸單體連接上去,這個(gè)五試述應(yīng)用Geospiza對(duì)表達(dá)譜進(jìn)行數(shù)據(jù)挖掘的主要流程輸入http: 4,QuickLoadWizard、AdvancedUploadMetho
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