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文檔簡介

第六章核酸的酶促降解和核苷酸代謝本章討論核酸酶的類別和特點,對核苷酸的生物合成和分解代謝作一般介紹。第一節(jié)核酸的酶促降解第三節(jié)核苷酸的合成代謝第二節(jié)核苷酸的分解代謝第一節(jié)核酸的酶促降解一、核酸酶二、限制性內(nèi)切酶

核酸酶核苷酸酶核苷磷酸化酶

核酸核苷酸核苷堿基+戊糖-1-P磷酸核酸酶

1、核酸酶的分類(1)根據(jù)對底物的專一性分為(2)根據(jù)切割位點分為核糖核酸酶(RNase)脫氧核糖核酸酶(DNase)非特異性核酸酶核酸內(nèi)切酶核酸外切酶2、核酸酶的作用特點內(nèi)切核酸酶對RNA的水解位點示意圖5′

p

p

p

pOHPyPuPyPy1′

p

p

pGACU

p

p

pGA3′RNAaseIRNAaseIRNAaseT1RNAaseT1Pu:嘌呤Py:嘧啶

限制性內(nèi)切酶

類型命名意義原核生物中存在著一類能識別外源DNA雙螺旋中4-8個堿基對所組成的特異的具有二重旋轉(zhuǎn)對稱性的回文序列,并在此序列的某位點水解DNA雙螺旋鏈,產(chǎn)生粘性末端或平末端,這類酶稱為限制性內(nèi)切酶(ristrictionendonuclease)。常用的DNA限制性內(nèi)切酶的專一性酶辨認(rèn)的序列和切口說明‥‥AGCT‥‥‥‥TCGA‥‥‥‥GGATCC‥‥‥‥CCTAGG‥‥‥‥AGATCT‥‥‥‥TCTAGA‥‥‥‥GAATTC‥‥‥‥CTTAAG‥‥‥‥AAGCTT‥‥‥‥TTCGAA‥‥‥‥GTCGAC‥‥‥‥CAGCTG‥‥‥‥CCCGGG‥‥‥‥GGGCCC‥‥BamHIAluIBglIEcoRIHindⅢSalISmaI四核苷酸,平端切口六核苷酸,平端切口六核苷酸,粘端切口六核苷酸,粘端切口六核苷酸,粘端切口六核苷酸,粘端切口六核苷酸,粘端切口限制性內(nèi)切酶類型

I型:分子量大于105,多亞基,需S-線苷蛋氨酸、ATP和Mg2+,識別位點與切割位點相差甚遠(yuǎn),產(chǎn)物為異質(zhì),是限制與修飾相排斥的多功能酶.

Ⅱ型:分子量小于105,需Mg2+,切割位點位于識別位點上,產(chǎn)物為專一性片段,不具修飾酶功能?,F(xiàn)在分子生物學(xué)研究所用的限制性內(nèi)切酶均為此類。

ⅡI型:識別位點為5-7bp的非對稱序列

,切割位點在順序之外離識別序列5-10bp,切割雙鏈,個別也切割單鏈。是限制與修飾相多功能酶.限制性內(nèi)切酶的命名和意義EcoRI序號屬名種名株名例:EcoRI,這是從大腸桿菌(Ecoli)R菌珠中分離出的一種限制性內(nèi)切酶限制性內(nèi)切酶是分析染色體結(jié)構(gòu)、制作DNA限制圖譜、進(jìn)行DNA序列測定和基因分離、基因體外重組等研究中不可缺少的工具,是一把天賜的神刀,用來解剖纖細(xì)的DNA分子。嘌呤的分解

嘌呤的降解

嘌呤(鳥嘌呤和腺嘌呤)均經(jīng)脫氨氧化轉(zhuǎn)變?yōu)辄S嘌呤再進(jìn)行降解。由于不同種類的生物的降解酶系不一樣,因而降解的終產(chǎn)物也不同:尿酸(uricacid):人類、靈長類、鳥類、爬行動物和大多數(shù)昆蟲;尿囊素:非靈長目哺乳動物、腹足類;尿囊酸:某些硬骨魚;尿酸和乙醛酸:大多數(shù)魚類、兩棲類;氨和二氧化碳:海洋腔腸動物和甲殼動物。尿酸是嘌呤核苷酸在人體內(nèi)分解代謝的終產(chǎn)物。痛風(fēng)癥患者由于體內(nèi)嘌呤核苷酸分解代謝異常,可致血中尿酸水平升高,以尿酸鈉晶體沉積于軟骨、關(guān)節(jié)、軟組織及腎臟,臨床上表現(xiàn)為皮下結(jié)節(jié),關(guān)節(jié)疼痛等。第三節(jié)核苷酸的合成代謝一、核糖核苷酸的生物合成二、脫氧核糖核苷酸的生物合成三、單核苷酸轉(zhuǎn)變成核苷二磷酸和核苷三磷酸(自學(xué))四、各種核苷酸的相互轉(zhuǎn)變核糖核苷酸的生物合成1、嘌呤核苷酸的生物合成(1)從頭合成途徑(2)補(bǔ)救途徑(自學(xué))2、嘧啶核苷酸的生物合成(1)從頭合成途徑(2)補(bǔ)救合成途徑(自學(xué))一、嘌呤核苷酸的合成代謝(一)從頭合成途徑:1.概念:通過利用一些簡單的前體物,如5-磷酸核糖,氨基酸,一碳單位及CO2等,逐步合成嘌呤核苷酸的過程稱為從頭合成途徑(denovosynthesis)。這一途徑主要見于肝臟,其次為小腸和胸腺。

2.合成步驟:可分為三個階段:⑴PRPP的合成:首先在磷酸核糖焦磷酸合成酶催化下,消耗ATP,由5’-磷酸核糖合成(5’-磷酸核糖-1’-焦磷酸)。(2)次黃嘌呤核苷酸的合成:再經(jīng)過大約10步反應(yīng),合成第一個嘌呤核苷酸—--次黃苷酸(IMP)。

磷酸核糖焦磷酸合成酶5'-磷酸核糖PRPP→→→→IMP

ATP

(3)腺苷酸及鳥苷酸的合成:IMP在腺苷酸代琥珀酸合成酶的催化下,由天冬氨酸提供氨基合成腺苷酸代琥珀酸(AMP-S),然后裂解產(chǎn)生AMP;IMP也可在IMP脫氫酶的催化下,以NAD+為受氫體,脫氫氧化為黃苷酸(XMP),后者再在鳥苷酸合成酶催化下,由谷氨酰胺提供氨基合成鳥苷酸(GMP)。

AMP-SAMPIMPXMPGMPAspNAD+Gln5-磷酸核糖焦磷酸PRPP5-磷酸核糖胺甘氨酸甘氨酰胺核苷酸甲酰甘氨酰胺核苷酸甲酰甘氨咪核苷酸5-氨基咪唑核苷酸5-氨基咪唑-4-羧核苷酸IMP的生物合成5-氨基咪唑-4-琥珀基-甲酰胺核苷酸5-氨基咪唑-4-氨甲酰核苷酸5-甲酰氨基咪唑-4-氨甲酰核苷酸次黃嘌呤核苷酸(IMP)甲酰THFA嘌呤核苷酸合成補(bǔ)救途徑(自學(xué))

磷酸核糖轉(zhuǎn)移酶嘌呤+PRPPA(G)MP+PPi嘌呤+1-P-核糖嘌呤核苷

A(G)MPATP

ADP嘧啶核苷酸從頭合成途徑

c、UMP轉(zhuǎn)變?yōu)镃TPCTPCTP合成酶

ATPGlnH2OUMPUDPUTP

a、嘧啶環(huán)上原子的來源b、UMP的從頭合成嘧啶環(huán)上各原子的來源

天冬氨酸CO2NH3NNCCCC654321H2N-CO-P氨甲酰磷酸尿嘧啶核苷酸合成途徑2.胞苷酸的合成:

3.脫氧嘧啶核苷酸的合成:

嘧啶核苷酸補(bǔ)救合成途徑(自學(xué))尿嘧啶+PRPP尿嘧啶+1-P-核糖尿嘧啶核苷+ATPUMP+PPi尿嘧啶核苷+PiUMP+ADP脫氧核苷酸的合成

2、脫氧胸腺嘧啶核苷酸的合成1、脫氧核苷酸的合成核糖核苷酸的還原反應(yīng)硫氧還蛋白核糖核酸還原酶系硫氧還蛋白還原酶核糖核苷酸還原酶核糖核苷酸還原酶NADP+NADPH+H+硫氧還蛋白還原酶FADATP、Mg2+硫氧還蛋白(還原型)SHSH硫氧還蛋白(氧化型)SSOP-P-CH2NOHOH核糖核苷二磷酸OP-P-CH2NOHH+H2O脫氧核糖核苷二磷酸核糖核苷酸的還原反應(yīng)FAD核糖核苷酸還原酶ATP、Mg2+硫氧還蛋白SHSH硫氧還蛋白SS硫氧還蛋白還原酶核糖核苷二磷酸+H2O脫氧核糖核苷二磷酸FADH2谷氧還蛋白SS谷氧還蛋白SHSHNADP+NADPH+H+谷氧還蛋白還原酶OP-P-CH2NOHOHOP-P-CH2NOHHGSSG2GSH谷胱甘肽還原酶核糖核苷酸還原酶示意圖底物特異性調(diào)節(jié)位點酶活性調(diào)節(jié)位點活性位點R1亞基R2亞基脫氧胸腺嘧啶核苷酸的合成

胸腺嘧啶核苷酸合成酶NADPH+H++SerNADP++Gly

N5、N10—CH2—FH4FH2二氫葉酸還原酶Ser羥甲基轉(zhuǎn)移酶ONHNOdR-PCH3ONHNOdR-P葉酸和四氫葉酸(FH4)葉酸四氫葉酸HH105N5,N10-CH2-FH4N5-CHO-FH4CH2CHO一碳基團(tuán)的來源與轉(zhuǎn)變S-腺苷蛋氨酸N5-CH2-FH4N5N10-

CH2-FH4N5,N10=CH-FH4

N10-CHO-FH4N5,

N10-CH2-FH4還原酶N5,

N10-CH2-FH4脫氫酶環(huán)水化酶

絲氨酸

組氨酸苷氨酸參與

甲基化反應(yīng)為胸腺嘧啶合成提供甲基參與嘌呤合成FH4FH4FH4

HCOOHH2ONAD+NDAH+H+NAD+NDAH+H+H+參與嘌呤合成核苷酸的合成及相互關(guān)系七、核酸的酶促降解和核苷酸的代謝

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