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生物大分子結(jié)構(gòu)與功能第一頁(yè),共三十九頁(yè),編輯于2023年,星期日生物大分子(Biomacromolecule)指有一定分子結(jié)構(gòu)規(guī)律,即由一定的基本結(jié)構(gòu)單位,按一定的排列順序和連接方式而形成的多聚體,分子量一般大于104。蛋白質(zhì)與核酸是體內(nèi)主要的生物大分子核酸具有傳遞遺傳信息的功能蛋白質(zhì)幾乎涉及所有的生理過(guò)程第二頁(yè),共三十九頁(yè),編輯于2023年,星期日一、蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)與功能第三頁(yè),共三十九頁(yè),編輯于2023年,星期日蛋白質(zhì)的重要性
蛋白質(zhì)是生命的物質(zhì)基礎(chǔ),是構(gòu)成生物體的基本成分,是生命活動(dòng)的執(zhí)行者。人體的45%為蛋白質(zhì),脾、肺、肌肉含量均超過(guò)80%,細(xì)菌的含量為50~80%,干酵母的含量為46.6%。第四頁(yè),共三十九頁(yè),編輯于2023年,星期日蛋白質(zhì)的生物學(xué)功能
生物催化(酶)代謝調(diào)節(jié)(多肽激素等)免疫保護(hù)(免疫球蛋白,補(bǔ)體等)物質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)和貯存(離子通道,轉(zhuǎn)運(yùn)載體等)運(yùn)動(dòng)與支持(肌蛋白)生長(zhǎng)、繁殖、遺傳和變異生物膜的功能和受體生化制藥(分離純化血液制品,基因工程產(chǎn)品)第五頁(yè),共三十九頁(yè),編輯于2023年,星期日蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)蛋白質(zhì)由20種氨基酸經(jīng)肽鍵連接而成生物體蛋白質(zhì)平均由300-400個(gè)氨基酸組成,平均分子量(MW)30,000-45,000
一個(gè)含有100個(gè)氨基酸組成的蛋白質(zhì)可存在20100種不同的形式
E.coli約含有3,000種蛋白質(zhì),人體約含有100,000種第六頁(yè),共三十九頁(yè),編輯于2023年,星期日第一節(jié)氨基酸與多肽一、氨基酸(aminoacid)蛋白質(zhì)是由氨基酸組成的:
蛋白質(zhì)混合物20種基本氨基酸
蛋白質(zhì)的元素組成:CHONSPISe等,其中含氮元素約16%,根據(jù)含氮量可計(jì)算出樣品中的蛋白質(zhì)含量:每克樣品含氮克數(shù)×6.25×100=100g樣品中的蛋白質(zhì)含量(g%)酸、堿、酶電泳第七頁(yè),共三十九頁(yè),編輯于2023年,星期日核糖核酸酶第八頁(yè),共三十九頁(yè),編輯于2023年,星期日蛋白質(zhì)的基本組成單位——氨基酸編碼氨基酸:20種,
除Gly外,均為L(zhǎng)-氨基酸,Pro為環(huán)狀亞氨酸非編碼氨基酸:胱氨酸、碘代酪氨酸、羥脯氨酸與羥賴(lài)氨酸等第九頁(yè),共三十九頁(yè),編輯于2023年,星期日COO-
C
NH3RL-α-氨基酸通式H+R為側(cè)鏈HOCHCHOCH2OHH3NCH+CH3
COO-L-甘油醛L-丙氨酸第十頁(yè),共三十九頁(yè),編輯于2023年,星期日第十一頁(yè),共三十九頁(yè),編輯于2023年,星期日按照R的化學(xué)性質(zhì)分為:1.非極性、疏水性氨基酸
R
為烴基、苯甲基等非極性基團(tuán)(Gly,Ala,Val,Leu,Ile,Phe,Pro)2.極性、中性氨基酸
R為羥基(Ser,Thr,Tyr)、巰基(Cys,Met)、酰胺基(Trp,Asn,Gln)等極性基團(tuán),
有親水性,在中性溶液中不電離3.酸性氨基酸(Asp,Glu)4.堿性氨基酸(Lys,Arg)第十二頁(yè),共三十九頁(yè),編輯于2023年,星期日非極性疏水性氨基酸第十三頁(yè),共三十九頁(yè),編輯于2023年,星期日極性中性氨基酸第十四頁(yè),共三十九頁(yè),編輯于2023年,星期日酸性氨基酸第十五頁(yè),共三十九頁(yè),編輯于2023年,星期日堿性氨基酸第十六頁(yè),共三十九頁(yè),編輯于2023年,星期日氨基酸的縮寫(xiě)與等電點(diǎn)中文名英文名三字符一字符pI甘氨酸GlycineGlyG5.97丙氨酸AlanineAlaA6.00纈氨酸ValineValV5.96亮氨酸LeucineLeuL5.98異亮氨酸IsoleucineIleI6.02苯丙氨酸PhenylalaninePheF5.48脯氨酸ProlineProP6.30色氨酸TryptophanTrpW5.89絲氨酸SerineSerS5.68酪氨酸TyrosineTyrY5.66半胱氨酸CysteineCysC5.07蛋氨酸MethionineMetM5.74天冬酰氨AsparagineAsnN5.41谷氨酰氨GlutamineGlnQ5.65蘇氨酸ThreonineThrT5.60天冬氨酸AsparticacidAspD2.97谷氨酸GlutamicacidGluE3.22賴(lài)氨酸LysineLysK9.74精氨酸ArginineArgR10.76組氨酸HistidineHisH7.59第十七頁(yè),共三十九頁(yè),編輯于2023年,星期日-OOC-CH-CH2-SH+HS-CH2-CH-COO-
-OOC-CH-CH2-S——S-CH2-CH-COO-
+NH3+NH3+NH3+NH3-2H半胱氨酸胱氨酸胱氨酸和二硫鍵第十八頁(yè),共三十九頁(yè),編輯于2023年,星期日COO-
C
NH3RL-α-氨基酸通式H+R為側(cè)鏈HGlyCH3Ala(CH3)2-CHVal(CH3)2-CH-CH2LeuCH3-CH2-CHICH3R非極性疏水性氨基酸PheIle第十九頁(yè),共三十九頁(yè),編輯于2023年,星期日
COO-
C
NH3RH+極性中性氨基酸NCH2SerTyrCysThrAsnMetGlnTrp第二十頁(yè),共三十九頁(yè),編輯于2023年,星期日
COO-
C
NH3RH+AspGluLys堿性氨基酸ArgHis第二十一頁(yè),共三十九頁(yè),編輯于2023年,星期日(1)R為脂肪烴基:(2)R為羥基和硫:
小結(jié)Gly、Ala、Val、Leu、Ile疏水性逐漸增加,pI幾乎相等
Ser、Thr含羥基,Ser有極性可形成氫鍵,大多數(shù)酶的活性中心有該殘基存在,Thr形成氫鍵能力弱;Cys含巰基,兩個(gè)Cys可形成含二硫鍵的胱氨酸,二硫鍵在蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)中起重要作用;R中含甲硫基(-SCH3)的為Met—-(CH2)2-S-CH3第二十二頁(yè),共三十九頁(yè),編輯于2023年,星期日(3)R含芳香基團(tuán)的有:
(4)R為堿性基團(tuán)的有:
Phe、Tyr、Trp—在280nm有紫外吸收峰;均含一個(gè)共軛π電子體系,易與缺π電子體系形成電荷轉(zhuǎn)移復(fù)合物或電子重疊物,在受體-底物和分子識(shí)別中起作用His
含三個(gè)可解離基團(tuán),故在酶的催化機(jī)制中有重要作用Lys
在生理?xiàng)l件下帶有一正電荷(NH3+)Arg
的胍基幾乎完全質(zhì)子化,是已知最強(qiáng)的有機(jī)堿第二十三頁(yè),共三十九頁(yè),編輯于2023年,星期日
(5)R有酸性基團(tuán):
Asp和Glu為生理?xiàng)l件下僅有的帶負(fù)電荷的氨基酸(6)R中含?;陌被酇sn和Gln分別為Asp和Glu的酰胺化產(chǎn)物,酰胺基中的氨基易發(fā)生氨基轉(zhuǎn)移反應(yīng),在生物合成和代謝中有重要作用(7)R為環(huán)狀的為Pro由于其α-NH2在環(huán)中,多肽中Pro所在位置易發(fā)生方向變化,在蛋白質(zhì)立體結(jié)構(gòu)中有重要作用第二十四頁(yè),共三十九頁(yè),編輯于2023年,星期日氨基酸的理化性質(zhì)1.物理性質(zhì):無(wú)色或白色結(jié)晶,熔點(diǎn)>200℃,α氨基酸均可溶于強(qiáng)酸、強(qiáng)堿和水,Lys和Arg在水中的溶解度最大,Tyr的溶解度最小。氨基酸在乙醚中溶解度最小。2.兩性電離性質(zhì):結(jié)合或釋放質(zhì)子取決于環(huán)境pH*pI(Isoelectricpoint):在一定pH環(huán)境下,氨基酸游離成陰、陽(yáng)離子的程度及趨勢(shì)相等或不游離(氨基酸不帶電荷或所帶電荷數(shù)相等)而成為兼性離子(Zwitterion),在電場(chǎng)中既不向陽(yáng)極也不向陰極遷移時(shí)的pH值。第二十五頁(yè),共三十九頁(yè),編輯于2023年,星期日R-CH-COOHR-CH-COO-
R-CH-COO-+NH3
NH2+NH3R-CH-COOH
NH2+OH-+OH-+H++H+陽(yáng)離子
pH<pI兼性離子
pH=pI陰離子
pH>pI第二十六頁(yè),共三十九頁(yè),編輯于2023年,星期日3.紫外吸收性質(zhì):Trp、Tyr和Phe含共軛雙鍵苯環(huán),在280nm處有最大吸收峰,利用此特點(diǎn)可用分光光度法測(cè)定蛋白質(zhì)含量也可粗略估計(jì)核酸中蛋白質(zhì)污染程度(A260/A280<1.7)。4.化學(xué)性質(zhì):α-NH2、α-COOH和R側(cè)鏈的活性基團(tuán)可發(fā)生相關(guān)化學(xué)反應(yīng),用于氨基酸性質(zhì)的分析鑒定。第二十七頁(yè),共三十九頁(yè),編輯于2023年,星期日0240250260270280290300310光密度波長(zhǎng)(nm)芳香族氨基酸的紫外吸收TrpTyrPhe第二十八頁(yè),共三十九頁(yè),編輯于2023年,星期日
化學(xué)性質(zhì)1亞硝酸反應(yīng):測(cè)定產(chǎn)生的N2可計(jì)算氨基酸的含量,為VanSlyke定氮法的基礎(chǔ)。2甲醛反應(yīng):氨基酸與甲醛反應(yīng)生成二羥甲基氨基酸,為中和法測(cè)定氨基酸含量的依據(jù),稱(chēng)甲醛滴定法,兩性氨基酸在與甲醛反應(yīng)后使氨基封閉而酸性增強(qiáng),可用強(qiáng)堿滴定。32,4-二硝基氟苯反應(yīng):在堿性中生成二硝基苯基氨基酸,N端分析。第二十九頁(yè),共三十九頁(yè),編輯于2023年,星期日4與酰氯化合物反應(yīng):α-氨基與苯甲氧基甲酰氯(Cbz-Cl)反應(yīng)生成Cbz-氨基酸,為化學(xué)合成多肽時(shí)一個(gè)重要的氨基保護(hù)反應(yīng);氨基酸與5-二甲氨基萘磺酰氯反應(yīng)生成DNS-氨基酸,紫外光下強(qiáng)烈熒光,靈敏度高,用于多肽分析。5茚三酮反應(yīng):與茚三酮在弱酸性溶液中加熱可產(chǎn)生有色化合物,含游離α-氨基的氨基酸和肽類(lèi)生成紫色化合物,而脯氨酸因其α-氨基被取代而生成黃色化合物,較靈敏,顏色深淺可定量。第三十頁(yè),共三十九頁(yè),編輯于2023年,星期日二、肽鍵與肽鏈NH2-CH-C+NH-CH-CNH2-CH-C-N-CH-CR1OHHR2OHR1HR2OHOOOO(Polypeptidebond&Polypeptidechain)概念:
肽鍵:一個(gè)氨基酸的α-羧基與另一氨基酸的α-氨基脫水縮合
肽:氨基酸通過(guò)肽鍵相連而形成的化合物第三十一頁(yè),共三十九頁(yè),編輯于2023年,星期日
寡肽(oligopeptide):
十個(gè)以下氨基酸縮合成的肽統(tǒng)稱(chēng)為寡肽
多肽鏈(polypeptidechain):
十個(gè)以上氨基酸形成的肽,
典型的多肽MW<104
蛋白質(zhì):
由一條或幾條多肽鏈組成的生物大分子
氨基酸殘基(aminoacidresidues):蛋白質(zhì)肽鏈中的每個(gè)氨基酸部分
多肽主鏈(mainchain):由肽鍵連接各氨基酸殘基形成的長(zhǎng)鏈骨架
多肽側(cè)鏈(sidechain):蛋白質(zhì)多肽鏈中的各氨基酸側(cè)鏈基團(tuán)第三十二頁(yè),共三十九頁(yè),編輯于2023年,星期日肽的書(shū)寫(xiě)格式NH2-甘-丙-谷-……-組-蛋-COOHNH2-Gly-Ala-Glu-……His-Met-COOHNH2-GAE……HM-COOHGAE……HM第三十三頁(yè),共三十九頁(yè),編輯于2023年,星期日
SH
O
CH2
HH2N-CH-CH2-C-
N-CH-C
-N-CH2-COOHCOOH
HO谷胱甘肽(谷-半胱-甘三肽)還原過(guò)氧化氫解毒(嗜電子)、抗氧化(-SH還原劑)三、醫(yī)學(xué)上重要的多肽γ羧基1、谷胱甘肽(glutathione,GSH)第三十四頁(yè),共三十九頁(yè),編輯于2023年,星期日2GSHGSHGSH過(guò)氧化物酶還原酶GSSGNADP+NADPH+H+H2O22H2OGSH與GSSG間的轉(zhuǎn)換第三十五頁(yè),共三十九頁(yè),編輯于2023年,星期日
HCNHNCHC
CH2H2C—CH2
CH2
H2CCH2
OCCH-CO-
NH-CH-CO
-N—CH
—CO-NH2
NH促甲狀腺素
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