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第三章蛋白質(zhì)研究技術(shù)
第一節(jié)蛋白質(zhì)的分離純化第二節(jié)蛋白質(zhì)的鑒定第三節(jié)蛋白質(zhì)的檢測第四節(jié)蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)分析當(dāng)前第1頁\共有78頁\編于星期五\21點第一節(jié)蛋白質(zhì)的分離與純化
一、蛋白質(zhì)分離純化的基本原則二、蛋白質(zhì)分離純化的方法當(dāng)前第2頁\共有78頁\編于星期五\21點
蛋白質(zhì)分離純化蛋白質(zhì)分離純化概圖當(dāng)前第3頁\共有78頁\編于星期五\21點一、蛋白質(zhì)分離純化的基本原則
1、選擇豐度高、便于提取的材料(磷酸單脂酶,肝、胰、脾豐富,但選幾乎不含磷酸二脂酶的前列腺)2、了解目的蛋白質(zhì)的穩(wěn)定性(肝素材料的冷凍和干燥)3、探索有效的抽提和濃縮方法(包括細(xì)胞破碎:機(jī)械、細(xì)胞溶解與自溶;抽提:稀酸減、有機(jī)溶劑、緩沖系統(tǒng);濃縮:沉淀、吸附、超濾、透析、凍干等)4、建立一套層析組合方法和檢測方法
(如吸附、離子交換、親和層析、凝膠過濾;純化評價)5、包裝、貯存方法(生產(chǎn)日期、批次、含量、活性或效價)當(dāng)前第4頁\共有78頁\編于星期五\21點二、蛋白質(zhì)分離純化的方法粗提:1.鹽析:固體加入法:飽和溶液加入法:2.有機(jī)溶劑沉淀:3.結(jié)晶(10-50mg/ml)
4.等電點沉淀精提:1.離心(centrifugation)2.電泳(electrophoresis)
3.層析(chromatography)注:S1:原飽和度;S2:預(yù)期飽和度;S3:加入液飽和度。V:欲加入體積(ml);V0:原液體積當(dāng)前第5頁\共有78頁\編于星期五\21點1.離心(centrifugation)
原理:懸液中的各種粒子(細(xì)胞,細(xì)胞器及大分子)有不同質(zhì)量(mass)或密度(density),故在離心場中有不同沉降速率。
蛋白質(zhì)分子量差別很大,密度差別很?。ú怀^15%)。蛋白質(zhì)的平均密度是1.37g/cm3。結(jié)合蛋白密度差異較大。沉降系數(shù)(sedimentationconstant):顆粒在單位離心力場中粒子移動的速度(S)。當(dāng)前第6頁\共有78頁\編于星期五\21點離心(centrifugation)
①.差速離心(differentialcentrifugation)②.速率區(qū)帶離心(rate-zonalcentrifugation)當(dāng)前第7頁\共有78頁\編于星期五\21點①.差速離心(differentialcentrifugation)
利用不同物質(zhì)沉降速率的差異,通過離心速度差異分離不同質(zhì)量顆粒的離心技術(shù)。
從組織勻漿中將可溶性的蛋白質(zhì)與不溶性成分分開。離心后,蛋白質(zhì)留在上清液(Supernatant)中,其他成分形成沉淀(Pellet)當(dāng)前第8頁\共有78頁\編于星期五\21點細(xì)胞成份的差速離心分離離心力
時間當(dāng)前第9頁\共有78頁\編于星期五\21點②.速率區(qū)帶離心(rate-zonalcentrifugation)
也稱平衡密度梯度離心,根據(jù)顆粒在介質(zhì)中的沉降速度差異分離目標(biāo)顆粒的方法。蔗糖、甘油或氯化銫形成密度梯度;超速離心機(jī)(≈40,000r/min)離心后,分離物分布在相應(yīng)的密度區(qū)帶內(nèi);當(dāng)前第10頁\共有78頁\編于星期五\21點
注意:控制時間:太短,不能充分分離;太長,分離物沉淀到離心管底部。不能精確測定分子量,因為蛋白質(zhì)的形狀差異影響沉降率;一次分離多種不同類型聚合物或顆粒的最有效方法
多用于分離細(xì)胞器,DNA當(dāng)前第11頁\共有78頁\編于星期五\21點2.電泳(electrophoresis)
帶電顆粒在電場中的移動速度的差異,從而將其分離。由電荷–質(zhì)量比決定。電泳分類:按支持物:移動界面電泳,聚焦電泳,區(qū)帶電泳(凝膠、線絲)等按電泳裝置:水平平板,垂直平板,圓盤,雙向電泳,毛細(xì)管電泳,脈沖電泳。按電電流(壓):常壓電泳,高壓電源。當(dāng)前第12頁\共有78頁\編于星期五\21點①SDS聚丙烯酰胺凝膠電泳(SDS-polyacrylamidegelelectrophoresis,SDS)②等電聚焦(isoelectricfocusing,IEF)③雙向電泳(two-dimensionalgelelectrophoresis)④脈沖電泳(pulsed-fieldgelelectrophoresis)常用的電泳方法當(dāng)前第13頁\共有78頁\編于星期五\21點①.SDS聚丙烯酰胺凝膠電泳(SDS-polyacrylamidegelelectrophoresis,PAGE)凝膠丙烯酰胺(acrylamide),甲叉雙丙烯酰胺(methylenebisacrylamide)聚合而成;T%=(a:單體g;b:雙體g;m:溶液體積)凝膠孔徑:選擇丙烯酰胺濃度,甲叉雙丙烯酰胺膠聯(lián)劑的濃度;C%=(a:b=19:1)凝膠有分子篩效應(yīng)。a+bm100%ba+b100%acrbis當(dāng)前第14頁\共有78頁\編于星期五\21點SDSSDS(sodiumdodecylsulfate)陰離子洗滌劑,幾乎能破壞蛋白質(zhì)中所有的非共價鍵,使亞基解聚(巰基乙醇),使多肽鏈呈伸展?fàn)顟B(tài),消除了蛋白質(zhì)構(gòu)形對遷移率(migrationrate)的影響;SDS以1:2的比例與肽鏈中的氨基酸殘基結(jié)合,使變性蛋白質(zhì)帶上大量的凈負(fù)電荷,而且電荷量與蛋白質(zhì)分子量(即肽鏈長度)成正比。所以分子量成為決定蛋白質(zhì)遷移率的唯一因素。當(dāng)前第15頁\共有78頁\編于星期五\21點SDSSDS分離的蛋白質(zhì)可以用Coomassieblue染色,也可銀染(silverstain)SDS能分離分子量差異小于10%的蛋白質(zhì)用于蛋白質(zhì)純化和表觀分子量測定當(dāng)前第16頁\共有78頁\編于星期五\21點②.等電聚焦(isoelectricfocusing,IEF)凝膠中加入兩性電解質(zhì)(Ampholyte;Ampholime),電泳時會形成連續(xù)的pH梯度;聚焦后,各蛋白質(zhì)停留在等電點(pI)相同的位置。IEF能分離pI值僅相差0.01的蛋白質(zhì)(即一個凈電單位)等電聚焦當(dāng)前第17頁\共有78頁\編于星期五\21點電泳過程中不連續(xù)電泳的三種效應(yīng):濃縮效應(yīng),分子篩效應(yīng)電荷效應(yīng)當(dāng)前第18頁\共有78頁\編于星期五\21點③.雙向電泳(two-dimensional
gelelectrophoresis)分離分子量差異很小的蛋白質(zhì)
雙向電泳=IEF+SDS
第一向:根據(jù)電荷差異用IEF分離第二向:根據(jù)分子量差異用SDS分離當(dāng)前第19頁\共有78頁\編于星期五\21點雙向電泳(two-dimensionalgelelectrophoresis)IEFSDS當(dāng)前第20頁\共有78頁\編于星期五\21點雙向電泳(two-dimensionalgelelectrophoresis)
蛋白質(zhì)可用染色法(銀染、考馬斯藍(lán)
)或放射自顯影進(jìn)行檢測;斑點挖取做質(zhì)譜鑒定。當(dāng)前第21頁\共有78頁\編于星期五\21點④.脈沖電泳(pulsed-fieldgelelectrophoresis)用于分離大片段DNA(10kb-10Mb);在電場中,大片段DNA以伸展的方式進(jìn)行移動;斷電后,DNA分子卷曲成不規(guī)則形狀;DNA從伸展到卷曲所需要的時間與其長度成正比;電場不斷在兩種方向(有一定夾角,如90°-180°)變動,如此反復(fù)進(jìn)行,逐步把不同大小的DNA分開.當(dāng)前第22頁\共有78頁\編于星期五\21點3.層析(chromatography)原理:溶液中蛋白質(zhì)分子與固定相表面結(jié)合及解離的過程中,由于蛋白質(zhì)分子量、帶電性和結(jié)合特異性的不同,而導(dǎo)致結(jié)合與解離的差異,最終使蛋白質(zhì)通過層析柱的流速差異。
固定相的性質(zhì)決定被分離蛋白的分離效率流動相固定相當(dāng)前第23頁\共有78頁\編于星期五\21點層析(chromatography)①.凝膠過濾層析(gelfiltrationchromatography)②.離子交換層析(ion-exchangechromatography)③.親和層析(affinitychromatography)當(dāng)前第24頁\共有78頁\編于星期五\21點
①.凝膠過濾層析(gelfiltration
chromatography)
分離分子量差異的蛋白質(zhì);多孔小珠由聚丙烯酰胺(polyacrylamide)、葡聚糖(dextran)或瓊脂糖(agarose)組成;葡聚糖顆粒大分子
小分子當(dāng)前第25頁\共有78頁\編于星期五\21點凝膠過濾層析小分子進(jìn)入顆粒凝膠內(nèi)部,而大分子被排阻在外,因此小分子在層析柱中流動速度慢,從而把混合物按不同分子量分開可根據(jù)洗脫體積(elutionvolume)估計蛋白質(zhì)分子量,分子量大洗脫體積小。當(dāng)前第26頁\共有78頁\編于星期五\21點基本原理凝膠上柱后,顆粒外的外水體積(Vo),顆粒內(nèi)體積稱內(nèi)水體積(Vi),顆粒中膠的體積(Vg),因而,總的柱床體積(Vt),Vt=Vo+Vi+Vg,Vg可忽略。Vt=Vo+Vi。當(dāng)進(jìn)行洗脫時,某一溶質(zhì)的洗脫體積(Ve)就取決于Vo,Vi和在兩相中的分配系數(shù)(kd)Ve=Vo+kd·Vi當(dāng)前第27頁\共有78頁\編于星期五\21點①當(dāng)kd=0時,Ve=Vo,溶質(zhì)全從Vo出來,無分配。②當(dāng)kd=1時,Ve=Vo+Vi,溶質(zhì)全進(jìn)篩子,各物質(zhì)盡管有分配,但各物質(zhì)不能分開。③當(dāng)0<kd<1時,Ve=Vo+kd·Vi各溶質(zhì)具不同分配,以得到分離。
若已知某一物質(zhì)的kd,據(jù)上式計算它的洗脫體積(Ve),也可用溶質(zhì)洗脫峰處的洗脫體積來測量。用此法來分離介質(zhì)可用三種模式描述:當(dāng)前第28頁\共有78頁\編于星期五\21點凝膠類型及型號與蛋白質(zhì)分子量葡聚糖與多孔瓊脂糖珠共價交聯(lián)(吸水量是型號1/10)瓊脂糖凝膠丙烯葡聚糖凝膠當(dāng)前第29頁\共有78頁\編于星期五\21點②.離子交換層析(ion-exchange
chromatography,IEC)
離子交換劑為固定相,據(jù)流動相中的蛋白離子與交換劑上的平衡離子進(jìn)行可逆交換時的親合力差異而進(jìn)行分離的一種層析方法。離子交換劑分三部分:高分子聚合物基質(zhì)、電荷基團(tuán)和平衡離子
離子交換劑:離子交換樹脂(Ionexchangeresin)和離子交換纖維素(IonexchangeCellulose),如DEAE-cellulose和CM-cellulose不同的蛋白質(zhì)與交換劑有不同的親和力,而可用不同鹽濃度或pH值的buffer洗脫洗脫示意圖結(jié)合洗脫曲線陽離子陰離子陽離子帶正電荷,與陰離子交換帶負(fù)電荷,與陽離子交換當(dāng)前第30頁\共有78頁\編于星期五\21點離子交換層析收集陽離子洗脫陰離子當(dāng)前第31頁\共有78頁\編于星期五\21點陽離子交換劑分離氨基酸當(dāng)前第32頁\共有78頁\編于星期五\21點③.親和層析(affinitychromatography)親和層析:利用蛋白質(zhì)分子與配體間特異、可逆的親和作用,而進(jìn)行分離的一種層析技術(shù)。配體的偶聯(lián):抑制劑、活化劑、輔酶(輔基)、底物及類似物、抗體、受體等(如外源凝集素、金屬離子等)與固定相偶聯(lián);上柱結(jié)合:與配體特異結(jié)合的蛋白質(zhì)被滯留在層析柱中,其他(雜質(zhì))成分流出;洗脫:加入過量的配體、配體類似物或改變洗脫液濃度(或pH)使結(jié)合的蛋白質(zhì)被頂替下來。當(dāng)前第33頁\共有78頁\編于星期五\21點雜質(zhì)溶液偶聯(lián)親和層析的基本要素當(dāng)前第34頁\共有78頁\編于星期五\21點親和層析當(dāng)前第35頁\共有78頁\編于星期五\21點金屬螯合層析法(MCAE)固定相當(dāng)前第36頁\共有78頁\編于星期五\21點4.膜蛋白的分離方法
膜蛋白:指與生物膜鑲嵌、結(jié)合或附著的一系列蛋白質(zhì)。2004年蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫提交的3D物已超過22,000個,但幾乎都為可溶性蛋白,膜蛋白不到1%。(Uniprot數(shù)據(jù)庫)膜蛋白是一種難以分離和純化的蛋白質(zhì)。從質(zhì)膜中分離時,暴露的疏水區(qū)互作,易引起蛋白質(zhì)聚集、沉淀,不易獲得結(jié)晶。去污劑(detergents)是一種兩親分子,能嵌入到磷脂雙層(phospholipidbilayers)中,破壞質(zhì)膜。其疏水部分與烴基結(jié)合,親水部分與水結(jié)合,因此可使脂質(zhì)和蛋白質(zhì)增溶(Solubilization).當(dāng)前第37頁\共有78頁\編于星期五\21點幾種去污劑去污劑包括兩類:非離子型(nonionicdetergents)如TritonX-100、辛基葡萄糖離子型(ionicdetergents)如脫氧膽酸鈉、十六烷基三甲基溴化銨、十二烷基硫酸納。當(dāng)前第38頁\共有78頁\編于星期五\21點去污劑的作用機(jī)制:低濃度時,去污劑以游離形式存在于溶液中。隨著濃度的增加,它們聚集在一起,形成微團(tuán)(micelles).微團(tuán)親水部分向外,疏水部分向內(nèi)。去污劑開始形成微團(tuán)時的濃度,為去污劑的特征常數(shù);稱臨界微團(tuán)濃度(criticalmicelleconcentration,CMC)。當(dāng)前第39頁\共有78頁\編于星期五\21點離子型去污劑:除了能與膜蛋白的疏水區(qū)結(jié)合外,還能結(jié)合水溶性蛋白質(zhì)的疏水核心。由于它們帶電,所以能夠破壞蛋白質(zhì)中的鹽鍵和氫鍵,使蛋白質(zhì)變性。非離子型去污劑:比離子型溫和,不同濃度有不同作用方式高濃度(>CMC)時,與磷脂、膜蛋白一起形成微團(tuán).
低濃度(<CMC)時,雖然不形成微團(tuán),但仍能與大部分膜蛋白的疏水區(qū)結(jié)合,起增溶作用.當(dāng)前第40頁\共有78頁\編于星期五\21點大部分膜周邊蛋白(peripheralprotein)是可溶性。它們借離子鍵或其他弱鍵與特定的膜蛋白結(jié)合,故可用高濃度鹽或能與二價陽離子(如Ca2+)結(jié)合的試劑進(jìn)行分離。開發(fā)既保持膜蛋白的天然結(jié)構(gòu),又高產(chǎn)和高純度純化方法是人們的期待。(NovaGen新開發(fā)TM-PEK:ProteoExtract膜蛋白抽提試劑盒)當(dāng)前第41頁\共有78頁\編于星期五\21點第二節(jié)蛋白質(zhì)的鑒定
一、分子量測定二、等電點測定三、末端氨基酸殘基測定四、蛋白質(zhì)分子中的糖鏈五、蛋白質(zhì)分子中的脂
當(dāng)前第42頁\共有78頁\編于星期五\21點一、分子量測定
1.滲透壓(osmoticpressure)2.沉降平衡(sedimentationequilibrium)3.凝膠過濾層析(gelfitrationchromatography)4.SDS5.激光解吸電離飛行時間質(zhì)譜(LDI-TOF-MS)當(dāng)前第43頁\共有78頁\編于星期五\21點1.滲透壓(osmoticpressure)同時測定幾個不同濃度的滲透壓,以π/c對c作圖并外推到蛋白質(zhì)濃度為零,得截距,從而求出M。為避免pH值的影響,在溶解度允許的范圍內(nèi),盡量采用等電點或接近等電點的緩沖液,并增加溶液中無機(jī)鹽的濃度??梢詼y分子量在1-10萬范圍的蛋白質(zhì)。實驗裝置簡單,準(zhǔn)確度高。但不能區(qū)別溶液中蛋白質(zhì)分子是否均一。當(dāng)前第44頁\共有78頁\編于星期五\21點2.沉降平衡(sedimentationequilibrium)用較低的速度離心(8,000-20,000r/min)離心開始后,顆粒發(fā)生沉降,造成濃度梯度,同時產(chǎn)生擴(kuò)散作用。擴(kuò)散力與離心力作用方向相反,相互平衡。公式:當(dāng)前第45頁\共有78頁\編于星期五\21點3.凝膠過濾層析(gelfitrationchromatography)公式:logM=K1-K2Ve
Ve:洗脫體積先測出幾種標(biāo)準(zhǔn)蛋白質(zhì)的Ve
,以它們的logM對Ve作圖得一直線,再測出待測樣品的Ve,即可從圖中確定蛋白質(zhì)的分子量.樣品可以是不純的。只要它具有專一的生物活性(或標(biāo)準(zhǔn)樣),借助活性找出洗脫峰位置,確定它的洗脫體積就能測定它的分子量.當(dāng)前第46頁\共有78頁\編于星期五\21點4.SDS公式:logM=K1-K2μR
以幾種標(biāo)準(zhǔn)單體蛋白質(zhì)分子量的logM對其μR值作圖,根據(jù)待測樣品的μR,從標(biāo)準(zhǔn)曲線上查出它的分子量。當(dāng)前第47頁\共有78頁\編于星期五\21點SDS用以分析蛋白質(zhì)的分子量當(dāng)前第48頁\共有78頁\編于星期五\21點5.激光解吸電離飛行時間質(zhì)譜(laser
desorptionionization-timeofflight-mass
spectrometry,LDI-TOF-MS)高純度蛋白質(zhì)與有機(jī)酸混合,在靶金屬表面干燥.激光射線使蛋白質(zhì)離子化,離子經(jīng)加速后,飛入自由漂移區(qū),最后到達(dá)檢測器。飛行時間與分子量成反比,與電量成正比??蓽y定10-15-2×105MW的蛋白質(zhì),誤差僅為0.0001。當(dāng)前第49頁\共有78頁\編于星期五\21點二、等電點測定溶解度法等電聚焦(IEF)
IEF原理IEF測pI當(dāng)前第50頁\共有78頁\編于星期五\21點三、末端氨基酸殘基測定用于未知蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)研究和基因工程表達(dá)產(chǎn)物的末端分析N-terminus氨基酸殘基測定C-terminus氨基酸殘基測定當(dāng)前第51頁\共有78頁\編于星期五\21點
N-terminus氨基酸殘基測定化學(xué)法二硝基氟苯法(Sangerreaction)
(DNFB+肽→DNP-肽)丹磺酰氯法(DNS-Cl)異硫氰酸苯酯法(Edman降解法)(氨基末端→苯乙內(nèi)酰硫脲衍生物)酶法氨肽酶法(aminopeptidase)氨基酸層析圖譜當(dāng)前第52頁\共有78頁\編于星期五\21點C-terminus氨基酸殘基測定
化學(xué)法
肼解法(hydrazinolysis)無水肼100℃處理,釋放C端aa
酶法羧肽酶法(carboxypeptidase)選擇合適的酶濃度及反應(yīng)時間,得單個C端aa
當(dāng)前第53頁\共有78頁\編于星期五\21點四、蛋白質(zhì)分子中的糖鏈血球凝集反應(yīng)(植物凝結(jié)素)糖蛋白電泳(甲苯胺蘭、R山蘭、schiff試劑)糖組分分析(薄層層析、液相色譜、紅外分析)當(dāng)前第54頁\共有78頁\編于星期五\21點五、蛋白質(zhì)分子中的脂
蘇丹黑預(yù)染、電泳當(dāng)前第55頁\共有78頁\編于星期五\21點第三節(jié)蛋白質(zhì)的檢測一、抗體檢測二、WesternBlotting三、放射性同位素標(biāo)記法
當(dāng)前第56頁\共有78頁\編于星期五\21點一、抗體檢測
多抗(polyclonalantibodies,通常以抗血清的形式存在)是指不同種類抗體的混合物,能識別抗原分子中的多個抗原決定簇(epitopes)。單抗(monoclonalantibodies)指的是同種抗體,識別抗原分子中的特定抗原決定簇。單抗由一定數(shù)量的相同細(xì)胞產(chǎn)生。這些細(xì)胞來源于同一雜交瘤細(xì)胞(hybridoma:脾:瘤細(xì)胞融合)。抗體可以檢測表面只相差一個殘基的蛋白質(zhì)。借助特殊的分析試劑可對蛋白質(zhì)進(jìn)行精確定量或定位(免疫細(xì)胞化學(xué)、染色質(zhì)免疫共沉淀、WesternBlot
)。當(dāng)前第57頁\共有78頁\編于星期五\21點抗體檢測兩級抗體:一抗和二抗。一抗特異的與抗原結(jié)合,二抗除了與一抗結(jié)合外,還帶有檢測標(biāo)記。檢測標(biāo)記:如熒光、放射性、化學(xué)發(fā)光、顯色基團(tuán)及酶(如堿性磷酸酶、辣根過氧化物酶,催化無色物質(zhì)生成有色物質(zhì))。ELISA-enzyme-linkedimmunosorbentassay當(dāng)前第58頁\共有78頁\編于星期五\21點ELISA當(dāng)前第59頁\共有78頁\編于星期五\21點ELISA結(jié)果當(dāng)前第60頁\共有78頁\編于星期五\21點二、WesternBlotting靈敏度高,用于檢測極微量的蛋白質(zhì)(Findaneedleinahastack.大海撈針)
與SDS、antibody、enzyme聯(lián)合使用當(dāng)前第61頁\共有78頁\編于星期五\21點WesternBlotting當(dāng)前第62頁\共有78頁\編于星期五\21點三、放射性同位素標(biāo)記法
放射性同位素的摻入不影響分子的性質(zhì)。選擇合適的同位素:根據(jù)實驗?zāi)康暮头派湫酝凰氐奶卣鳎ㄈ绨胨テ?、放射產(chǎn)生的能量及能否進(jìn)入細(xì)胞等)進(jìn)行選擇。放射自顯影:用感光材料進(jìn)行感光,如X光膠片,液體乳膠。然后肉眼或顯微鏡觀察,可半定量。定量測定:用計數(shù)器(counter),如蓋革計數(shù)器(Geigercounter)、液閃計數(shù)器(scintillationcounter)。分析生物大分子在細(xì)胞內(nèi)的定位及運(yùn)動。當(dāng)前第63頁\共有78頁\編于星期五\21點第四節(jié)蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)分析一、蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)的測定二、已知序列肽鏈的人工合成三、蛋白質(zhì)構(gòu)象的確定當(dāng)前第64頁\共有78頁\編于星期五\21點一、蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)的測定
-Edman降解法(PTH法)
N末端氨基與苯異硫氰酸酯(PITC)在弱堿性條件下,形成相應(yīng)的苯氨基硫甲酰衍生物,后者在硝基甲烷中與酸作用發(fā)生環(huán)化,生成相應(yīng)的苯乙內(nèi)酰硫脲(PTH)-AA,而從肽鏈上降解,產(chǎn)物可用氣-液色譜法進(jìn)行分離鑒定。
弱堿硝基甲烷苯氨基硫甲酰衍生物當(dāng)前第65頁\共有78頁\編于星期五\21點HPLC分析氨基酸當(dāng)前第66頁\共有78頁\編于星期五\21點二、已知序列肽鏈的人工合成合成肽用途:結(jié)構(gòu)分析、抗體制備、活性肽功能、新蛋白研究。
抗體制備:在動物體內(nèi),10-15個殘基的小肽能刺激機(jī)體產(chǎn)生抗體。從而對蛋白質(zhì)進(jìn)行分離、檢測及細(xì)胞內(nèi)定位。
新蛋白研究:分析末端AA,反推核苷酸,合成引物,PCR獲得基因或ORF,BLAST分析,同源性比對;蛋白質(zhì)特征及功能分析。當(dāng)前第67頁\共有78頁\編于星期五\21點tBOC:叔丁氧羰基,保護(hù)氨基酸氨基端.CF3COOH:三氟乙酸,去保護(hù)DCC:二環(huán)己基碳二亞胺,縮合劑HF:氫氟酸,把肽鏈從聚苯乙烯小株上斷裂下來掛接去保護(hù)縮合去保護(hù)斷裂肽鏈人工合成當(dāng)前第68頁\共有78頁\編于星期五\21點三、蛋白質(zhì)構(gòu)象的確定1.X射線結(jié)晶(X-RayCrystallography)2.冷凍電鏡術(shù)(CryoelectronMicroscopy)3.核磁共振(Nuclearmag
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