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文檔簡介

淺析食品中諾如病毒檢測技術(shù)研究【摘要】在最近幾年中,食源性疾病高發(fā),飲食成為了人們面臨的重要課題。研究表明,在食源性疾病傳播中,病毒有著重要地位。諾如病毒(Norovirus,NoV)是一種杯狀病毒,是導(dǎo)致急性病毒性腸胃炎發(fā)作的重要因素,容易在一些集中的場所爆發(fā),比如學(xué)校、醫(yī)院、餐館等。在本文中,分析了諾如病毒主要的檢測技術(shù),同時(shí)分析了技術(shù)使用的優(yōu)點(diǎn)和缺點(diǎn),希望給諾如病毒之后的研究帶來參考。【關(guān)鍵詞】食品;諾如病毒;檢測;技術(shù)一、核酸檢測(一)RT-qPCR在諾如病毒檢測中,分子RT-qPCR檢測是其“金標(biāo)準(zhǔn)”,有著很強(qiáng)的敏感性和特異性,能夠快速檢測到糞便和其環(huán)境中的諾如病毒核酸,同時(shí)能夠?qū)Σ《据d量進(jìn)行測定。在測序PCR產(chǎn)物時(shí),能夠判斷諾如病毒基因型。過程:(1)提取病毒RNA:使用德國QIAGEN公司的QIAampVialRNAMinikit試劑盒,采用柱純化技術(shù),操作步驟按試劑盒說明書進(jìn)行,最后以30μL洗脫液洗脫。(2)熒光定量RT-PCR法檢測:實(shí)驗(yàn)反應(yīng)體系采用上海之江生物科技有限公司NorwalkVirusRealTimeRT-PCRkit。操作步驟按試劑盒說明書進(jìn)行相對定量檢測,用MJRe-searchOption2熒光定量PCR分析儀,最后根據(jù)檢測樣品的RT-PCR反應(yīng)體系擴(kuò)增曲線在FAM檢測通道有無對數(shù)增長期或Ct值判定是否陽性:1無對數(shù)增長期或Ct值≥37,判為陰性;2有對數(shù)增長期且Ct值≤35,判為陽性。3有對數(shù)增長期且3535,判為陰性。該試劑盒能同時(shí)檢測GI和GⅡ型,最低度檢測限103copies/mL。RT-qPCR能夠在單一反應(yīng)內(nèi)放大信號,對熒光信號進(jìn)行實(shí)時(shí)檢測,從而實(shí)現(xiàn)定量效果。在實(shí)際中,該檢測方式有著很強(qiáng)的特異性,并且靈敏性高,是當(dāng)前檢測NoV的“金標(biāo)準(zhǔn)”。這種檢測方法靈敏度能達(dá)到103DNA拷貝數(shù)/mL,同時(shí)也不會和其他腸道病毒產(chǎn)生交叉反應(yīng),分析靈敏度高。RT-qPCR是當(dāng)前使用最為普遍的檢測方式,其特異性很強(qiáng)、靈敏度高,然而卻難以將致病性以及非致病性諾如病毒顆粒區(qū)分開來,在食品樣品基質(zhì)內(nèi),有很多分子檢測抑制劑,同樣會影響到檢測的結(jié)果。因此,很多研究將其和其他技術(shù)綜合起來分析,比如先使用PGM,分離活性病毒粒子,然后再使用RT-qPCR。(二)數(shù)字PCR微滴式數(shù)字PCR在使用中首先微滴化處理樣品,其中產(chǎn)生熒光信號判讀為1,否則為0,按照陽性微滴比例判斷結(jié)果。ddPCR不需要依靠外部曲線標(biāo)準(zhǔn),突破了Ct值局限,成為了一種可以代替RT-qPCR的方式。同時(shí),其使用有著很高的靈敏度,不會被基質(zhì)抑制,能夠精準(zhǔn)檢測,是十分理想的檢測方式。在當(dāng)前,更多研究集中在數(shù)字PCR上,在食源性致病微生物檢測中有著顯著的優(yōu)勢。然而其設(shè)備十分昂貴,影響著技術(shù)的應(yīng)用,相信在未來的發(fā)展中,隨著儀器成本的降低,這種檢測方法能夠得到很好的普及。(三)二代測序技術(shù)二代測序(NGS)主要是在基因芯片和PCR上產(chǎn)生的,是DNA測序的一種,該技術(shù)能夠?qū)NA復(fù)制的流程進(jìn)行記錄,測序其中新添加堿基包含的特殊標(biāo)記,有著高速、高通量的優(yōu)勢。一般RT-PCR只可以對NoVRNA存在進(jìn)行簡單的檢測,很難分辨出是感染性或者是非感染性的病毒顆粒。為了防止非感染性病毒顆粒出現(xiàn)假陽性的問題,要實(shí)施樣品的RNase預(yù)處理。研究表明,NGS技術(shù)的應(yīng)用能夠?qū)鋬鰸{果內(nèi)的致病性病毒進(jìn)行檢測。二代測序技術(shù)能夠鑒別分析一些罕見和常見的NoV變異序列,在分型溯源中有著顯著的優(yōu)勢。另外,該方法要進(jìn)一步進(jìn)行優(yōu)化,大大減少其中的干擾序列,要求能夠在高度豐富的核酸條件下更加方便檢測,比如DNases處理樣品。二、免疫學(xué)檢驗(yàn)免疫學(xué)檢驗(yàn)是使用特異性抗體對樣本內(nèi)的NoV進(jìn)行檢測。使用量化或檢測分析物的不同標(biāo)記方式,又可以劃分成不同的類型,在當(dāng)前,主要檢測諾如病毒的技術(shù)方法包含免疫層析技術(shù)和ELISA。(一)免疫層析技術(shù)免疫層析技術(shù)主要是基于免疫滲濾逐漸發(fā)展形成的新型免疫學(xué)檢測方式。在樣品中如果有相應(yīng)抗原,就會和抗體產(chǎn)生特異性反應(yīng),檢測線展現(xiàn)出能夠看見的條帶。免疫層析有著很長的保質(zhì)期,同時(shí)其檢測時(shí)間短、成本低等等,很多商業(yè)免疫層析試劑盒也得到了廣泛的應(yīng)用。在Kumthip的研究中,對最新的諾如病毒免疫層析試劑盒進(jìn)行了驗(yàn)證,測試了其在諾如病毒檢測中的特異性和敏感性,同時(shí)和RT-PCR技術(shù)做出了對比。結(jié)果表明,該試劑盒的應(yīng)用有著很強(qiáng)的特異性和靈敏度,同時(shí)和一些胃腸炎病毒不會產(chǎn)生交叉反應(yīng)。因?yàn)槊庖邔游黾夹g(shù)的特異性低、靈敏度差,因此其分型NoV的能力不足,多數(shù)應(yīng)用在臨床樣本檢測中。但可將其與其他技術(shù)聯(lián)合以提高檢測的靈敏度,從而滿足食品中NoV的檢測要求。(二)ELISAELISA技術(shù)的應(yīng)用能夠把抗體或抗原結(jié)合在固相載體表面,之后添加酶標(biāo)抗體或抗原,在抗原抗體產(chǎn)生特異性結(jié)合下,酶催化底物就會顯色,這就實(shí)現(xiàn)了檢測的目標(biāo)。ELISA檢測方式容易操作、檢測時(shí)間短等等。在臨床中,很多商業(yè)ELISA試劑盒都得到了廣泛的應(yīng)用。比如英國的DakoCytomation公司研發(fā)了IDEIATM諾如病毒試劑盒,德國也研發(fā)了該技術(shù),然而這些試劑盒應(yīng)用中的特異性和靈敏度存在很大差距,同時(shí)可能產(chǎn)生假陽性的情況,影響了其推廣和使用。在食品中如果NoV的量少,然而ELISA檢測的最低濃度是104病毒顆粒/g,這就無法滿足低濃度的檢測使用。ELISA和另外一些免疫學(xué)檢測方法相同,其特異性和靈敏度低,最低的檢測濃度是104~106個(gè)病毒顆粒/g,無法滿足食品基質(zhì)內(nèi)的NoV檢測。在當(dāng)前,一些新技術(shù)層出不窮,這給食品內(nèi)NoV檢測帶來很大幫助。在最近的研究中,將近紅外熒光和免疫層析法綜合起來,設(shè)置了一種便攜式試紙條,能夠檢測貝類中的諾如病毒。當(dāng)前新型的免疫分析方法主要是在納米材料基礎(chǔ)上,可以檢測黃瓜、雞肉和生菜內(nèi)的諾如病毒。在當(dāng)前,免疫學(xué)技術(shù)和其他技術(shù)的綜合使用顯著提高了檢測的效率,大大增強(qiáng)了檢測的靈敏度,能夠更好地符合食品中諾如病毒的檢測需要,同時(shí)檢測操作十分方便。三、生物傳感器生物傳感器的應(yīng)用原理是把生物響應(yīng)轉(zhuǎn)變成能夠進(jìn)行測量的光、電以及物理信號,包含了理化轉(zhuǎn)換系統(tǒng)和生物刺激性材料識別元件。按照應(yīng)用信號轉(zhuǎn)換器的不同,生物傳感器又可以劃分成為光學(xué)、電化學(xué)、半導(dǎo)體生物傳感器和壓電晶體。該設(shè)備使用的靈敏度高、成本低廉、分析快等等,有著很強(qiáng)的集成化和自動化,這些也都成為研究的重點(diǎn)。(一)電化學(xué)生物傳感器電化學(xué)生物傳感器是一種將生物識別轉(zhuǎn)換為電流、電位、阻抗等電信號的傳感平臺,具有低成本、高靈敏度的特點(diǎn)。在Baek研究中,使用NoroBP-nonFoul-(FlexL)2多肽作為一種結(jié)合劑,研發(fā)出了電化學(xué)生物傳感器。NoroBP多肽可以和NoV特異性結(jié)合。該多肽包含巰基,能夠生成Au—S共價(jià)鍵把多肽包在電極上,在這種情況下,隨著病毒的增加,電流信號呈現(xiàn)出遞減趨勢。電化學(xué)生物傳感器檢測的敏感度高,同時(shí)其下限在1.7拷貝數(shù)/mL,有著很高的靈敏度,特別實(shí)在牡蠣樣品中的應(yīng)用,能夠?qū)崿F(xiàn)6.21拷貝數(shù)/mL的檢測。NoV衣殼蛋白檢測和諾如病毒樣顆粒都能夠?qū)崿F(xiàn)間接的。Guo等研發(fā)出了一種光電化學(xué)生物傳感器,主要進(jìn)行特異性檢測。在這個(gè)該傳感器中,電極光電流能夠跟隨NoV的衣殼蛋白濃度出現(xiàn)變化,能夠半小時(shí)內(nèi)使用濃度依賴形式檢測到2×10-10g/mL的NoV衣殼蛋白。另外,Lee在研究中應(yīng)用了外加磁力,把金/磁性納米顆粒修飾的石墨烯沉積在叉指式鉑電極上作為電傳感通道,之后和GII型NoV抗體偶聯(lián),成為病毒顆粒傳感平臺。這個(gè)傳感平臺的使用能夠?qū)Χ緲宇w粒的變化使用電阻變化形式表現(xiàn)出來,檢測限是1.16pg/mL。電化學(xué)生物傳感器有著很高的靈敏蘇,同時(shí)也是新型工具,能夠進(jìn)行快速診斷,增強(qiáng)檢測的靈敏性,然而在實(shí)際中,并沒有進(jìn)行普及和推廣。(二)光學(xué)生物傳感器光學(xué)生物傳感器包含類型眾多,同時(shí)需要使用的樣品少,具有無標(biāo)記的特點(diǎn),其特異性和靈敏度都很多,可以進(jìn)行實(shí)時(shí)檢測,在諾如病毒檢測中有著很大的應(yīng)用潛力。在實(shí)際中,局域表面等離子體共振是使用最多的傳感方式,能夠快速響應(yīng),同時(shí)其衰變長度短等等,能夠?qū)ξ矬w表面的分析物進(jìn)行高精度檢測。Heo等應(yīng)用這項(xiàng)技術(shù)研發(fā)了人源NoV的傳感器,主要是由親和肽引導(dǎo)的。親和肽能夠在多價(jià)M13隨機(jī)肽庫內(nèi)篩選出來,和NoV產(chǎn)生特異性結(jié)合,在ELISA鑒定后,其和NoV結(jié)合的親和力是納摩爾級別。NoV衣殼蛋白含量和LSPR信號中的吸光度呈現(xiàn)正比,同時(shí)其最低檢測限是0.1ng/mL。然而在實(shí)際的LSPR傳感中,必須要對反應(yīng)條件進(jìn)行嚴(yán)格的控制,減少非特異性結(jié)合,配體在傳感器表面固定之后,就會導(dǎo)致天然構(gòu)型產(chǎn)生變化,影響到和分析物之間的結(jié)合。另外,熒光的光學(xué)傳感器也能夠應(yīng)用到食品的諾如病毒檢測中。除了光學(xué)生物和電化學(xué)的傳感器,另外還有很多生物傳感器也都可以進(jìn)行諾如病毒的檢測,比如比色型生物傳感器、基于質(zhì)量的生物傳感器(石英晶體微天平和微懸臂梁)、免疫傳感器等。在這些檢測方法中,生物傳感器的應(yīng)用優(yōu)勢最顯著,比如其成本低廉、使用的樣品量很少、有著很高的靈敏度、能夠快速進(jìn)行分析等等,在檢測食品內(nèi)的諾如病毒方面有著突出的優(yōu)勢。然而雖然生物傳感器的應(yīng)用有著眾多的優(yōu)勢,能夠大大提高檢測靈敏度,然而在實(shí)際中并沒有推廣和普及,并且使用配體捕獲NoV時(shí),有時(shí)會對配體天然構(gòu)象造成改變,阻礙了其和分析物的結(jié)合,因此必須要在未來進(jìn)行改進(jìn)。四、結(jié)束語諾如病毒是導(dǎo)致急性胃腸炎的主要病原,因?yàn)槠渖飳W(xué)特性突出,十分容易造成食品污染。檢測食品內(nèi)的諾如病毒能夠給諾如病毒胃腸炎的防治帶來基礎(chǔ)和保障。在長期的研究中,食品諾如病毒檢測技術(shù)也獲得了很大的發(fā)展,人們對其基因分型、病學(xué)特征和檢測診斷等等有了更為全面的認(rèn)識。然而在當(dāng)前的諾如病毒檢測技術(shù)中,依然存在很多不足和挑戰(zhàn),必須要深入研究。【參考文獻(xiàn)】[1]徐蕾蕊,李丹,汪琦,馬丹,魏詠新,魏海燕,趙曉娟,張西萌,曾靜.基于RT-ddPCR技術(shù)的食品中諾如病毒定量檢測[J].食品科學(xué),2022,43(20):313-320.[2]廖小艷,陳麗麗,白亞龍.食品中諾如病毒檢測技術(shù)研究進(jìn)展[J].食品與機(jī)械,2021,37(04):200-206+232.DOI:10.13652/j.issn.1003-5788.2021.04.037.[3]YanzhenHan,JianchangWang,ShuhongZhang,JinfengWang,ChenQin,YanqingHan,XiangdongXu.RapiddetectionofnorovirusgenogroupIIinclinicalandenvironmentalsamplesusingrecombinasepolymeraseamplification[J].AnalyticalBiochemistry,2020,605.[4]ValentinaTerio,PatrizioLorusso,AnnaMottola,CanioBuonavoglia,GiuseppinaTan

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