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文檔簡介
細(xì)菌分類鑒定的
實(shí)驗(yàn)室技術(shù)發(fā)展(一)細(xì)菌分類鑒定的指標(biāo)
1.傳統(tǒng)指標(biāo)2.分子生物學(xué)指標(biāo)1.生物分類的傳統(tǒng)指標(biāo)形態(tài)特征群體:菌落形態(tài),在半固體或液體培養(yǎng)基中的生長狀態(tài)等;個體:細(xì)胞形態(tài),染色反應(yīng),各種特殊構(gòu)造等。
從不同層次,用不同學(xué)科的技術(shù)方法來研究和比較不同微生物的細(xì)胞、細(xì)胞組分或代謝產(chǎn)物,從中發(fā)現(xiàn)的反映微生物類群特征的資料。生理生化反應(yīng)營養(yǎng)要求:能源,碳源,氮源,生長因子等;酶:產(chǎn)酶種類和反應(yīng)特性等;代謝產(chǎn)物:種類,產(chǎn)量,顯色反應(yīng)等。生態(tài)特性:
生長溫度,對氧的需要,宿主種類等;生活史特點(diǎn):
在生活史中出現(xiàn)的菌體變化特點(diǎn)及其規(guī)律性;血清學(xué)反應(yīng):
利用抗原構(gòu)造上的差別進(jìn)行鑒定;噬菌體的敏感性;其他2.生物分類的分子生物學(xué)指標(biāo)DNARNA染色鏡檢形態(tài)觀察按照標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行傳統(tǒng)的生化反應(yīng)鑒定標(biāo)準(zhǔn)化成品鑒定產(chǎn)品(如:API試劑條)
半自動細(xì)菌鑒定儀(如:ATBExpression)全自動細(xì)菌鑒定儀(如:VITEK2)色譜、光譜分析技術(shù)分子生物學(xué)技術(shù)1.生理生化檢測技術(shù)2.色譜、光譜分析技術(shù)3.分子生物學(xué)技術(shù)(二)細(xì)菌分類鑒定的實(shí)驗(yàn)室技術(shù)人工鑒定培養(yǎng)基的微量化、標(biāo)準(zhǔn)化和商品化數(shù)碼分類鑒定技術(shù)(生化反應(yīng)的數(shù)字化)自動化鑒定技術(shù)(生物信息的電腦化)細(xì)菌的鑒定和藥敏試驗(yàn)都實(shí)現(xiàn)了自動化1.生理生化檢測技術(shù)前期準(zhǔn)備增菌劃線分離染色鏡檢血清手工細(xì)菌鑒定手工鑒定流程
1)
臨床常見菌的初步分群雙岐索引鑒定
例如:葡萄球菌屬雙岐索引鑒定早在七十年代中期,一些國外公司就研究出借助生物信息編碼鑒定細(xì)菌的新方法。這些技術(shù)的應(yīng)用,為醫(yī)學(xué)微生物檢驗(yàn)工作提供了一個簡便、科學(xué)的細(xì)菌鑒定程序,大大提高了細(xì)菌鑒定的準(zhǔn)確性。目前,微生物編碼鑒定技術(shù)已經(jīng)得到普遍應(yīng)用,并早已商品化和形成獨(dú)特的不同細(xì)菌鑒定系統(tǒng)。如API、Micro-ID、RapID、Enterotube和Minitek等系統(tǒng)。這種鑒定系統(tǒng)是自動化鑒定系統(tǒng)的基礎(chǔ)。2)數(shù)碼鑒定法
數(shù)碼鑒定是指通過數(shù)學(xué)的編碼技術(shù)將細(xì)菌的生化反應(yīng)模式轉(zhuǎn)換成數(shù)學(xué)模式,給每種細(xì)菌的反應(yīng)模式賦予一組數(shù)碼,建立數(shù)據(jù)庫或編成檢索本。通過對未知菌進(jìn)行有關(guān)生化試驗(yàn)并將生化反應(yīng)結(jié)果轉(zhuǎn)換成數(shù)字(編碼),查閱檢索本或數(shù)據(jù)庫,得到細(xì)菌名稱。
其基本原理是計算并比較數(shù)據(jù)庫內(nèi)每個細(xì)菌條目對系統(tǒng)中每個生化反應(yīng)出現(xiàn)的頻率總和。數(shù)碼鑒定法基本原理微量生化反應(yīng)系統(tǒng)Micro-ID系統(tǒng)VP硝酸鹽還原
苯丙氨酸脫羧酶硫化氫吲哚鳥氨酸賴氨酸丙二酸鹽尿素七葉甘ONPG阿拉伯糖側(cè)金盞花醇肌醇三梨醇421421421421421—+——+++———+++——
020021400021400
23434相加所得數(shù)字:23434查出相應(yīng)細(xì)菌為:大腸埃希菌項(xiàng)目分值數(shù)碼鑒定法基本原理先將細(xì)菌分離純化。做染色形態(tài)觀察、氧化酶、糖發(fā)酵試驗(yàn)。根據(jù)染色、氧化酶、糖發(fā)酵試驗(yàn)結(jié)果選擇不同的生化反應(yīng)板進(jìn)行接種(同一個鑒定系統(tǒng),配有不同細(xì)菌的生化反應(yīng)板)。培養(yǎng)后,讀取生化反應(yīng)結(jié)果,得到一組數(shù)據(jù)。將這組數(shù)據(jù)查編碼本(即數(shù)據(jù)庫),即得到鑒定結(jié)果。實(shí)驗(yàn)方法:數(shù)碼鑒定法基本原理3)自動化的微生物鑒定和藥敏試驗(yàn)分析系統(tǒng)
細(xì)菌數(shù)碼分類技術(shù)是細(xì)菌自動化鑒定技術(shù)的基礎(chǔ),細(xì)菌鑒定自動化是把生化反應(yīng)數(shù)字化技術(shù)進(jìn)一步電腦化,數(shù)據(jù)庫用電腦管理,結(jié)果用電腦分析和鑒定。
鑒定系統(tǒng)的工作原理因不同的儀器和系統(tǒng)而異。不同的細(xì)菌對底物的反應(yīng)不同是生化反應(yīng)鑒定細(xì)菌的基礎(chǔ),而試驗(yàn)結(jié)果的準(zhǔn)確度取決于鑒定系統(tǒng)配套培養(yǎng)基的制備方法、培養(yǎng)物濃度、孵育條件和結(jié)果判定等。大多鑒定系統(tǒng)采用細(xì)菌分解底物后反應(yīng)液中pH的變化,色原性或熒光原性底物的酶解,測定揮發(fā)或不揮發(fā)酸,或識別是否生長等方法來分析鑒定細(xì)菌。對標(biāo)本同時進(jìn)行鑒定與藥敏測試全自動細(xì)菌鑒定/藥敏檢測系統(tǒng)檢測流程純培養(yǎng)新鮮平板上挑取菌落制成標(biāo)準(zhǔn)濁度(0.5~0.6麥?zhǔn)蠁挝唬┑木鷳乙壕杭尤肴鉁校谷霗z測板,上機(jī)檢測。檢測流程掃描板條,輸入資料,等待鑒定結(jié)果。檢測流程挑選菌落樣品制備于樣品盤上菌種鑒定結(jié)果未知微生物?
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