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病原體測(cè)序平臺(tái)一、參數(shù)要求:1高通量測(cè)序儀:*1.1通量數(shù)據(jù)平臺(tái):每次反應(yīng)可生成3000億堿基數(shù)據(jù);1.2數(shù)據(jù)讀取模式:?jiǎn)味俗x取序列和雙端讀取序列;1.3讀長(zhǎng)2×150bp時(shí),整個(gè)測(cè)序運(yùn)行完成時(shí)間:≤30小時(shí);1.4平臺(tái)數(shù)據(jù)讀長(zhǎng):?jiǎn)味俗x取序列,讀長(zhǎng)不低于150個(gè)堿基;雙端讀取序列:讀長(zhǎng)不低于2×150個(gè)堿基;1.5從核酸到可測(cè)序文庫(kù)樣本的處理過(guò)程,無(wú)需進(jìn)行油包水PCR反應(yīng);*1.6測(cè)序文庫(kù)直接用于測(cè)序儀上機(jī),整個(gè)測(cè)序過(guò)程只需操作一臺(tái)設(shè)備,有效降低操作復(fù)雜性,減少實(shí)驗(yàn)誤差;*1.7全封閉檢測(cè)室,集成式測(cè)序卡盒,卡盒內(nèi)包括所有測(cè)序需要的生物酶和試劑,無(wú)需手工配置,減少生物污染;*1.8試劑槽:即插即用,具備可讀取的無(wú)線射頻識(shí)別標(biāo)簽;1.9測(cè)序數(shù)據(jù)準(zhǔn)確性:測(cè)序結(jié)果給出嚴(yán)格的Q30質(zhì)量數(shù)據(jù),當(dāng)2×150bp測(cè)序時(shí),Q30值≥75%;*1.10測(cè)序系統(tǒng)主機(jī)內(nèi)置服務(wù)器,主機(jī)同時(shí)具備樣本文庫(kù)克隆擴(kuò)增、測(cè)序和數(shù)據(jù)分析功能;*1.11儀器主機(jī)內(nèi)不含液流流路,免日常沖洗維護(hù)工作;(提供證明材料)*1.12通過(guò)機(jī)器內(nèi)置生物信息分析和加速模塊,2小時(shí)內(nèi)完成全部下機(jī)數(shù)據(jù)的基因組分析;2中通量測(cè)序儀:2.1數(shù)據(jù)通量:每次反應(yīng)可生成75億堿基數(shù)據(jù);2.2每次運(yùn)行至少可生成可讀2500萬(wàn)個(gè)片段標(biāo)簽序列;2.3從核酸到可測(cè)序文庫(kù)樣本的處理過(guò)程,無(wú)需進(jìn)行油包水PCR反應(yīng),避免人為操作誤差;2.4數(shù)據(jù)讀取兩種模式:?jiǎn)味俗x取序列和雙端讀取序列;2.5單端讀取序列讀長(zhǎng):1×150個(gè)堿基;雙端讀取序列讀長(zhǎng):2×150個(gè)堿基;*2.6讀長(zhǎng)1×100bp時(shí),整個(gè)測(cè)序運(yùn)行完成時(shí)間:≤5小時(shí);(提供證明材料)*2.7讀長(zhǎng)2×150bp時(shí),整個(gè)測(cè)序運(yùn)行完成時(shí)間:≤20小時(shí);2.8測(cè)序結(jié)果給出嚴(yán)格的Q30質(zhì)量數(shù)據(jù);*2.9全封閉檢測(cè)室,集成式測(cè)序卡盒,卡盒內(nèi)包括所有測(cè)序需要的生物酶和試劑,無(wú)需手工配置,減少生物污染;2.10設(shè)備支持讀長(zhǎng)包括:75bp、100bp、150bp、300bp多種模式;*2.11測(cè)序文庫(kù)直接用于測(cè)序儀上機(jī),整個(gè)測(cè)序過(guò)程只需操作一臺(tái)設(shè)備,有效降低操作復(fù)雜性,減少實(shí)驗(yàn)誤差;2.12數(shù)據(jù)準(zhǔn)確率高:讀長(zhǎng)300bp時(shí),Q30值≥75%;*2.13測(cè)序系統(tǒng)主機(jī)內(nèi)置服務(wù)器,主機(jī)同時(shí)具備樣本文庫(kù)克隆擴(kuò)增、測(cè)序和數(shù)據(jù)分析功能,無(wú)需再額外配置樣本文庫(kù)克隆擴(kuò)增設(shè)備;3小通量測(cè)序儀:3.1數(shù)據(jù)通量:每次反應(yīng)可生成1.2Gb(即12億個(gè)堿基);3.2每次運(yùn)行至少可生成可讀400萬(wàn)個(gè)片段標(biāo)簽序列;*3.3儀器主機(jī)內(nèi)不含液流流路,免日常沖洗維護(hù)工作;*3.4全封閉檢測(cè)室,集成式檢測(cè)卡盒(卡盒內(nèi)包括測(cè)序試劑、流路和廢液回收容器),防止生物污染;*3.5數(shù)據(jù)讀取不低于兩種模式:?jiǎn)味俗x取序列讀長(zhǎng):1×150個(gè)堿基;雙端讀取序列讀長(zhǎng):2×150個(gè)堿基;*3.6讀長(zhǎng)2×150bp時(shí),整個(gè)測(cè)序運(yùn)行完成時(shí)間:≤20小時(shí);*3.7便攜設(shè)計(jì),方便攜帶,測(cè)序開(kāi)始前儀器可任意搬動(dòng),搬動(dòng)后無(wú)需工程師上門(mén)進(jìn)行儀器維護(hù)與校準(zhǔn),經(jīng)過(guò)自檢即可正常開(kāi)展測(cè)序。(提供證明材料)3.8數(shù)據(jù)準(zhǔn)確率高:讀長(zhǎng)300bp時(shí),Q30≥75%;3.9設(shè)備支持讀長(zhǎng)包括:75bp、150bp、300bp多種模式;3.10測(cè)序文庫(kù)直接用于測(cè)序儀上機(jī),整個(gè)測(cè)序過(guò)程只需操作一臺(tái)設(shè)備,有效降低操作復(fù)雜性,減少實(shí)驗(yàn)誤差;*3.11測(cè)序系統(tǒng)主機(jī)內(nèi)置服務(wù)器,主機(jī)同時(shí)具備樣本文庫(kù)克隆擴(kuò)增、測(cè)序和數(shù)據(jù)分析功能,無(wú)需再額外配置樣本文庫(kù)克隆擴(kuò)增設(shè)備;4毛細(xì)管電泳儀:4.1功能:采用毛細(xì)管電泳原理,可應(yīng)用于DNA、RNA等核酸的電泳分析,能進(jìn)行全自動(dòng)的核酸片段大小測(cè)定,核酸質(zhì)控,濃度測(cè)定,微衛(wèi)星分析等;4.2光源:LED光源,高靈敏度的光電倍增管檢測(cè);4.3自動(dòng)化程度:采用預(yù)裝式卡夾,即插即用,無(wú)須人工制膠、灌膠、上樣,整個(gè)過(guò)程全部由儀器自動(dòng)來(lái)完成;每輪分析后,儀器自動(dòng)清洗毛細(xì)管,無(wú)須人工清洗;*4.4上樣形式:直接兼容0.2ml離心管、8聯(lián)管、12聯(lián)管、96孔微孔板等;可搭配專(zhuān)用微量管,樣品管中溶液需求量最低1ul;*4.5可以一次性完成4-100個(gè)個(gè)數(shù)樣品的檢測(cè)分析;4.6電泳時(shí)間:最快可達(dá)1-2分鐘/4個(gè)樣本;4.7檢測(cè)片段范圍:15bp-50kb,可檢測(cè)大于50kb的核酸,最大可分析到165kb;*4.8靈敏度:無(wú)需對(duì)樣品進(jìn)行純化,可以直接對(duì)PCR產(chǎn)物原液進(jìn)行檢測(cè)。DNA樣品的檢測(cè)靈敏度可達(dá)1pg/ul;4.9樣品上樣量:小于0.1ul;4.10卡夾:提供預(yù)制膠卡夾,適用于DNA高分辨率分析、DNA普通產(chǎn)物分析、DNA快速篩查分析、RNA質(zhì)量控制分析等應(yīng)用,RNA質(zhì)控分析時(shí)提供RNA完整性得分RQN值,DNA質(zhì)控可提供DNA完整性指數(shù)DQN值;*4.11分辨率:對(duì)<500bp的DNA片段,可達(dá)1-4bp的分辨率,200bp片段可達(dá)2bp的分辨率;4.12軟件功能:軟件可以自動(dòng)輸出電泳膠圖、峰圖、樣品濃度、片段大小等一系列數(shù)據(jù),并可以以報(bào)告形式完整打印輸出;PDF,WORD,JPG都可以輸出;4.13無(wú)污染:系統(tǒng)中儀器、耗材及檢測(cè)過(guò)程均為全封閉式,避免了核酸染色劑等有害物質(zhì)與操作人員的接觸;*4.14可選擇通卡夾配件,在儀器外部對(duì)卡夾進(jìn)行通膠,可以對(duì)卡夾中毛細(xì)管中的膠進(jìn)行更好的置換,對(duì)過(guò)期卡夾或者保存不當(dāng)卡夾進(jìn)行處

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